Trong thời gian qua, căn cứ chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn được giao và căn cứ vào tình hình triển khai thực hiện các chế độ, chính sách BHXH và hoạt động thực tiễn của ngành. Bảo hiểm xã hội Việt Nam đã chủ động xây dựng để trình Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ, các Bộ quản lý nhà nước và tự ban hành (trong phạm vi thẩm quyền) các văn bản để điều chỉnh mọi hoạt động của ngành nhằm đáp ứng được yêu cầu hoạt động của ngành vừa đảm bảo được nguyên tắc quản lý. Riêng về lĩnh vực quản lý tài chính có các văn bản đã được ban hành như sau:
- Thủ tướng Chính phủ ra Quyết định số 20/1998/QĐ-TTg ngày 26/01/1998 ban hành Quy chế quản lý tài chính đối với Bảo hiểm xã hội Việt Nam; Quyết định số 100/2001/QĐ-TTg sửa đổi, bổ sung một số điều của Quy chế quản lý tài chính đối với Bảo hiểm xã hội Việt Nam ban hành kèm theo Quyết định số 20/1998/QĐ-TTg.
- Bộ Tài chính ban hành Thông tư số 85/1998/TT-BTC ngày 25/06/1998 hướng dẫn Quy chế quản lý tài chính đối với Bảo hiểm xã hội Việt Nam; Thông tư số 66/2001/TT- BTC ngày 22/08/2001 hướng dẫn sửa đổi một số điều của Thông tư số 85/1998/TT- BTC hướng dẫn Quy chế quản lý tài chính đối với Bảo hiểm xã hội Việt Nam.
- Bộ Tài chính ban hành hệ thống chế độ kế toán BHXH áp dụng cho tất cả các đơn vị thuộc Bảo hiểm xã hội Việt Nam tại Quyết định số 1058a–TC/QĐ/KT ngày 29/09/1995; Quyết định số 1124-TC/QĐ/CĐKT ngày 12/12/1996 và Quyết định số 140/1999/QĐ- BTC ngày 15/11/1999.
- Bảo hiểm xã hội Việt Nam đã phối hợp với Tổng cục Đầu tư phát triển, Quỹ hỗ trợ đầu tư quốc gia, Kho bạc Nhà nước Trung ương, Ngân hàng Nông nghiệp và phát triển nông thôn Việt Nam hướng dẫn các đơn vị dự toán cấp 2 và cấp 3 mở các tài khoản để tiếp nhận kinh phí, thanh toán thu, chi BHXH, chi quản lý hoạt động bộ máy và chi đầu tư xây dựng cơ sở vật chất của hệ thống.