Đầu tư đổi mới cơng nghệ là vấn đề sống cịn trong việc nâng cao năng lực cạnh tranh của bất kỳ ngân hàng thương mại nào và SCB cũng khơng là một trường hợp ngoại lệ. Theo tính tốn và kinh nghiệm hoạt động thực tế của các ngân hàng nước ngồi, cơng nghệ thơng tin cĩ thể làm giảm 76% chi phí hoạt động của ngân hàng. Đây cũng là lĩnh vực đầu tư cần một lượng vốn tương đối lớn.
Ngay từ những ngày đầu khi tái lập tồn bộ hoạt động của SCB, ban lãnh đạo ngân hàng đã ý thức được tầm quan trọng và ý nghĩa sống cịn của hệ thống cơng nghệ thơng tin và cơng nghệ ngân hàng đối với sự tồn tại và phát triển của ngân hàng. Từ đầu năm 2003, SCB đã từng bước hiện đại hĩa hệ thống cơng nghệ thơng tin nhằm đáp ứng được yêu cầu phát triển của mình.
Về phần cứng: hiện tại, SCB đã trang bị hệ thống máy chủ của hãng IBM (Hoa Kỳ) và tồn bộ hệ thống máy tính trong ngân hàng đều được trang bị bởi những thương hiệu nổi tiếng như IBM, HP. Trong 3 năm gần đây, hệ thống phần cứng của ngân hàng đã từng bước được hiện đại hĩa, nâng cấp, nâng cao cơng suất và đã đáp ứng được yêu cầu cơ bản để xử lý các mảng nghiệp vụ hàng ngày của ngân hàng.
Về phần mềm: từ năm 2003 đến nay, SCB đang vận hành hệ thống ngân hàng lõi trên nền tảng chương trình Smart Bank do cơng ty FPT cung cấp. Về cơ bản, hệ thống ngân hàng lõi này đáp ứng được những yêu cầu cần thiết để xử lý dữ liệu, đảm bảo khả năng vận hành bình thường hàng ngày của ngân hàng. Tuy nhiên, với quy mơ hoạt động ngày một mở rộng và số lượng giao dịch cần phải xử lý hàng ngày đã
tăng lên rất nhiều nên đã xảy ra tình trạng quá tải cơng suất hoạt động của chương trình, biểu hiện như tốc độ xử lý một giao dịch chậm hơn bình thường rất nhiều đã kéo dài thời gian hồn tất một giao dịch nên buộc khách hàng phải chờ lâu, gây nên tâm lý khĩ chịu nơi khách hàng.
Từ giữa năm 2007, SCB đã bắt đầu triển khai nghiên cứu hệ thống ngân hàng lõi (core banking system) T24 của hãng Temanos. Theo dự kiến, cuối năm 2008 hệ thống ngân hàng lõi này sẽ chính thức đi vào hoạt động, thay thế và khắc phuc được hầu hết các nhược điểm của chương trình Smart Bank hiện tại. Chi phí cho việc đầu tư và hiện đại hĩa hệ thống cơng nghệ thơng tin và cơng nghệ ngân hàng này lên đến hàng triệu đơ-la.