Thời gian là khía cạnh chủ yếu khi đánh gía các dự án và so sánh giữa chúng. Những thay đổi theo hoàn cảnh có thể bao gồm chi phí và lợi ích xuất hiện xuyên suốt cả một thời gian dài, xảy ra ngay tức thời (sau đó thì chấm dứt), hoặc xuất hiện sau đó một thời gian. Vì vậy lợi ích của mỗi thời kì nên đƣợc cộng lại với nhau.
Xem xét một dự án có lợi ích tích lũy ở một tỷ lệ không đổi trên 30 năm, và chi phí xuất hiện trong 5 năm đầu tiên, rồi sau đó biến mất. Cách thức tốt nhất để cộng dồn vào những chi phí và lợi nhuận này là sẽ cộng phần lợi nhuận ở năm thứ 1vào lợi nhuận của năm 2, và tiếp tục cho đến năm 30, rồi so sánh tổng này với tổng chi phí của năm 1 đến năm 5. Điều này sẽ đúng nếu ngƣời ta không quan tâm đến khi nào lợi nhuận và chi phí xảy ra, nhƣng tất nhiên là họ có quan tâm. Con ngƣời có một khái niệm đƣợc gọi là
thế một số cá nhân muốn có lợi ích và chi phí ngay bây giờ hơn là trong tƣơng lai. Chính phủ hoạt động theo một cách thức hợp lý, đại diện cho công dân mình, cũng có quyền ƣu tiên thời gian xã hội. Chẳng hạn nhƣ, ở đâu họ mong muốn lợi tức tƣơng lai lớn hơn và ở đâu mà 1$ bây giờ có giá đối với xã hội hơn là cùng thời điểm trong tƣơng lai (Pearce 1983).
Từ khi việc thẩm định giá trị cơ bản của CBA là quyền ƣu tiên của ngƣời tiêu dùng tính đến, thì việc xem xét quyền ƣu tiên cho thời gian là cần thiết. Đây là thành quả thông qua chiết khấu điều chỉnh những món tiền tƣơng lai để đạt đến hiện giá của chúng. Tính chiết khấu là một phần không thể thiếu của CBA truyền thống.
Sự biện minh thứ hai cho việc tính chiết khấu là chi phí cơ hội của tiền vốn. Một khoảng tiền tại thời điểm hiện tại thì có giá hơn ở cùng thời điểm trong tƣơng lai bởi vì nó đƣợc sử dụng một cách hiệu quả (ví dụ: lợi nhuận từ đầu tƣ, cho vay lấy lãi). Các quỹ tài trợ đƣợc dùng vào dự án để tạo ra một khoảng tiền lời cho trƣớc trong tƣơng lai, có thể đƣợc sử dụng thay thế nhằm tạo ra khoản thu hồi ngay tức thời.
Nhƣ thƣờng lệ, chi phí và lợi ích nảy sinh trong tƣơng lai có giá trị thấp hơn ở hiện tại. Chúng xuất hiện trong thời gian càng lâu thì càng ít giá trị.
Sự so sánh chính xác giữa các dự án chỉ có thể đƣợc thực hiện nếu yếu tố thời gian cho phép. Các dự án với mức lãi ròng nhƣ nhau trong khoảng trên 20 năm sẽ không đủ sức thu hút so với khi nó có lãi ròng đƣợc gom lại trong 10 năm đầu, và phần còn lại trong 10 năm sau. Một vấn đề phổ biến là phải so sánh giữa một dự án với chi phí đầu vào cao nhƣng chi phí vận hành thì thấp và một dự án khác thay thế với chi phí đầu vào thấp hơn và chi phí vận hành cao hơn.