Bên cạnh những mặt tích cực nêu trên, công tác kế toán nói chung và kế toán tiêu thụ sản phẩm nói riêng tại Công ty cổ phẩn Cồn Rượu Hà Nội còn có những mặt hạn chế sau:
* Về hệ thống tài khoản
Hệ thống tài khoản kế toán của Công ty hiện nay vẫn sử dụng theo quyết định cũ. Do vậy hiện nay Công ty vẫn chưa tiến hành hạch toán một số nghiệp vụ theo quy định mới và vẫn chưa đưa vào sử dụng một số tài khoản mới.
Trong các tài khoản mà Công ty sử dụng không có tài khoản 156- Hang hóa. Đối với một số mặt hàng Công ty nhập về cho vào kho nhưng Công ty vẫn cho vào tài khoản 155- Thành phẩm, điều này là không đúng
Ngoài ra Công ty mặc dù sử dụng tài khoản 531- Hàng bán bị trả lại, nhưng đối với các hàng bán bị trả lại hiện nay, Công ty vẫn hạch toán vào tài khoản 511- Doanh thu bán hàng và cung cấp dịch vụ để giảm trừ doanh thu. Điều này không ảnh hưởng đến kết quả kinh doanh nhưng ta sẽ không biết được tình hình tiêu thụ thực tế của Công ty.
* Về tổ chức hệ thống kế toán
Để giảm bớt công tác kế toán hiện nay các phòng đều được trang bị máy tính khá đầy đủ nhưng công tác kế toán về cơ bản vẫn mang tính chất thủ công. Vì thế công tác kế toán tốn nhiều công sức của con người mà độ chính xác lai không cao.
Công ty đang áp dụng trình tự ghi sổ theo hình thức “Nhật ký chứng từ”. Nhược điểm của hình thức này là mẫu sổ các kiểu bàn cờ không thuận tiện cho việc xử lý thông tin trên máy vi tính.
* Về xác định giá vốn hàng bán
Công ty sử dụng phương pháp bình quân gia quyền để xác định giá vốn hàng bán. Trong đó sử dụng giá đơn vị bình quân cuối kỳ trước, cách tính này cho phép giảm nhẹ khối lượng tính toán của kế toán nhưng độ chính xác của công việc tính giá phụ thuộc vào tình hình biến động của giá cả hàng hóa. Nếu giá cả thị trường hàng hóa có sự biến động lớn thì sẽ ảnh hưởng lớn tới độ chính xác của việc tính giá này, có những trường hợp khiến cho giá trị hàng hóa tồn kho bị âm.
* Một số vấn đề khác
Việc hạch toán chi phí bán hàng và chi phí quản lý doanh nghiệp được chi tiết từng khoản chi phí phát sinh, từ đó có thể đối chiếu dễ dàng giữa các kỳ và có biện pháp sử dụng chi phí hợp lý. Tuy nhiên, nhiều khoản mục chi
phí chung như tiền điện, nước, tiền điện thoại, công tác phí nhân viên kế toán vẫn để xảy ra tình trạng hạch toán lẫn giữa 2 loại chi phí này. Công ty nên phân bổ rõ ràng 2 loại chi phí nêu trên để xác định đúng lợi nhuận.
Việc trả lương cho công nhân sản xuất và nhân viên làm việc thêm vào những ngày nghỉ, ngày lễ hoặc làm thêm giờ vào ngày thường: hiện nay Công ty vẫn trả lương cho người làm vào những ngày này như những ngày thường. như vậy là không đúng chế độ, chưa đảm bảo công bằng cho công nhân và chưa khuyến khích được nhân viên hăng hái làm việc, nâng cao hiệu quả lao động.