Xử lí số liệu

Một phần của tài liệu Nghiên cứu cấu trúc di truyền một số dòng Citrus Tristeza Virus gây bệnh trên cây ăn quả chi Citrus ở Việt Nam (Trang 32 - 33)

Công nghệ thông tin đã phát triển mạnh mẽ và được ứng dụng vào nhiều lĩnh vực khác nhau trong đó có sinh học, các ứng dụng này được gọi chung là tin sinh học (Bioinformatics). Hiện nay, có nhiều phần mềm máy tính chuyên dụng xử lí trình tự gen như: BLAST, DNAstar, Bioedit… để kiểm tra độ chính xác của trình tự sau khi đọc. Trong đó, phần mềm Bioedit là hệ thống phần mềm tiện dụng nhất.

Một bước tiến nhảy vọt trong lĩnh vực công nghệ thông tin là sự hình thành hệ thống internet, đó là một mạng kết nối nhiều triệu máy tính ở khắp nơi trên thế giới với nhau từ các máy tính đơn lẻ có thể truy cập, khai thác dữ liệu từ các máy tính khác nhờ đường truyền cáp quang hoặc điện thoại. Do vậy, internet là kho dữ liệu khổng lồ.

Các nhà sinh học cũng đã sử dụng internet để tạo ra các trang web về sinh học (ví dụ như trang web: www.eib.ucv.cl của tạp chí Electrolic Journal of Biotechnology, www.emboj.org của tạp chí EMBO Journal, www.pubmed.com ...) chứa đựng thông tin về các công trình khoa học đã được công bố. Từ các máy tính nối mạng internet, ta có thể có được các tài

33

liệu quan tâm đã được xuất bản khi truy cập và tìm kiếm bằng những từ khoa như tên tạp chí, tên tác giả hay chủ đề quan tâm. Đặc biệt các nhà sinh học phân tử còn thành lập nên các ngân hàng dữ liệu lưu giữ toàn bộ các trình tự của các gen đã được xác định và trình tự các protein với cấu trúc không gian của nó. Khi truy cập các trang wed này chúng ta sẽ có được trình tự của gen hoặc có thể so sánh các trình tự gen mình đang nghiên cứu với các trình tự khác đã được công bố hoặc ta cũng có thể đăng ký và đưa các trình tự của mình vào các ngân hàng này. Hiện nay, có ba ngân hàng dữ liệu chính lưu trữ khoảng hơn hai triệu trình tự được kết nối với nhau theo sơ đồ:

 EMBL là Phòng Sinh học phân tử Châu Âu thuộc Viện Thông tin Sinh học Châu Âu có địa chỉ truy cập: www.ebi.ac.uk

 NCBI là Trung tâm Thông tin công nghệ sinh học quốc gia của Hoa Kỳ có địa chỉ truy cập: www.NCBI.nlm.nih.gov

 DDBJ là Ngân hàng dữ liệu gen Nhật Bản thuộc Trung tâm thông tin sinh học có địa chỉ truy cập: www.ddbj.nig.ac.jp

Một phần của tài liệu Nghiên cứu cấu trúc di truyền một số dòng Citrus Tristeza Virus gây bệnh trên cây ăn quả chi Citrus ở Việt Nam (Trang 32 - 33)