Bên cạnh những thành tựu đã đạt được, Chi nhánh vẫn còn tồn tại những vấn đề sau:
Về doanh thu:
Đối với thu từ lãi thì thu lãi cho vay là khoản mục mang lại lợi nhuận rất cao, song Chi nhánh vẫn còn hạn chế trong việc mở rộng phát triển khoản thu này, cần nâng cao tỷ trọng của khoản thu này cho hợp lý để hướng tới mục tiêu trở thành một trong ba ngân hàng TMCP tại Việt Nam . Thu lãi tiền gửi cũng vậy, không những nó mang về cho Chi nhánh thu nhập mà còn góp phần khẳng định uy tín, thương hiệu ngân hàng. Tuy nhiên, trong những năm qua tốc độ tăng trưởng của khoản thu này đã giảm và tỷ trọng cũng còn rất khiêm tốn. Vì thế Chi nhánh cần phải quan tâm đến khoản mục này nhiều hơn trong tương lai.
Về chi phí:
Cùng với việc tăng doanh thu thì chi phí của Chi nhánh cũng tăng nhưng tốc độ tăng của chi phí trong năm 2012 lại lớn hơn tốc độ tăng của doanh thu dẫn đến lợi nhuận trước thuế tăng chậm hơn năm 2011. Ngoài ra việc kiểm soát chi phí trong năm 2012 cũng chưa được chặt chẽ nên đã dẫn đến bội chi. Khoảng chênh lệch giữa lãi suất bình quân đầu ra và đầu vào được mở rộng trong năm 2011 thì lại bị thu hẹp vào năm 2012, cho thấy chi phí đầu vào bình quân còn lớn. Đó là bởi vì Chi nhánh phải trả lãi cho lượng vốn huy động nhiều trong khi hoạt động cho vay không tăng lên mấy. Nếu cứ tiếp tục như
thế, điều này có thể sẽ làm giảm vị thế cạnh tranh của Chi nhánh.