- Kiểm toán đối chiếu logic: Xem xét sự tăng giảm các khoản mục có liên quan tới nhau, đặc biệt khoản mục nguyên vật liệu, hàng tồn kho, doanh thu…
3.Phương hướng hoàn thiện
Trước những yêu cầu cấp bách trên, thực hiện kiểm toán hoạt động chuyển giá của tất cả các loại giao dịch, như giao dịch qua biên giới và giao dịch nội địa. Tuy phần lớn hoạt động chuyển giá diễn ra qua giao dịch biên giới nhưng cũng không vì thế mà lơ là các giao dịch nội địa bởi chính sách ưu đãi thuế ở một số địa phương, khu vực vẫn được duy trì, do đó mở rộng phạm vi kiểm toán hoạt động chuyển giá của giao dịch nội địa là điều cần thiết.
Kiểm toán hoạt động chuyển giá cũng phải chú trọng về mặt phạm vi và chất lượng. Số lượng các doanh nghiệp bị điều tra phát hiện hành vi chuyển giá còn ít so với thực tế các doanh nghiệp có hành vi chuyển giá, và tập trung vào một số địa phương. Một số doanh nghiệp có hành vi chuyển giá nhưng thực hiện một cách tinh vi, có nhiều lý do bao biện cũng như việc các doanh nghiệp đó liên kết với công ty kiểm toán, làm mất đi tính độc lập của cuộc kiểm toán.
Hoàn thiện hệ thống nguyên tắc và chuẩn mực kế toán kiểm toán có liên quan đến việc chuyển giá cũng là một trong những phương hướng tốt để các cuộc kiểm toán hoạt động chuyển giá hiệu quả hơn.
Chú trọng vào nhiều tác động xấu của hoạt động chuyển giá đối với nền kinh tế, không chỉ tác động về giảm thu ngân sách nhà nước, do đó mở rộng ra kiểm toán tất cả các tác động là cần thiết.
Phát huy sức mạnh cộng đồng, các cuộc kiểm toán hoạt động chuyển giá liên kết với các cơ quan chức năng, các công ty thẩm định giá hay sức mạnh của dư luận.
Hoạt động chuyển giá xét về bản chất là hành vi gian lận để trốn thuế và đạt được mục tiêu lợi nhuận của doanh nghiệp, nó đã được che đậy, được hợp lý hóa và rất khó phát hiện và thu thập bằng chứng để quy kết. Chính vì vậy, trách nhiệm của kiểm toán đối với các giao dịch này là phải thu thập đủ bằng chứng có hiệu lực để có thể quy kết hành vi chuyển giá.