Cấu trúc site được trình bày tóm tắt trong bảng 3.1:
Tập tin/Thư mục
Ý nghĩa
config.php Là tập tin cấu hình chứa các thông tin như: kiểu CSDL, tên CSDL kết nối đến, host chứa CSDL, tên người dùng và mật khẩu để kết nối CSDL, thư mục gốc của website trên server, thư mục data, nhà quản trị...
version.php Tập tin chỉ định phiên bản hiện tại của Moodle.
install.php Kịch bản này sẽ chạy để tạo file config.php.
index.php Trang đầu tiên của site.
admin/ Thư mục chứa mã lệnh để quản trị toàn server.
auth/ Thư mục chứa module hỗ trợ chứng thực tài khoản người dùng.
blocks/ Thêm các môđun đối với các khối site nhỏ trên nhiều trang.
calender/ Tất cả mã đối với quản lý và hiển thị các lịch biểu.
course/ Thư mục chứa mã lệnh để hiển thị và quản lý các khóa học
doc/ Thư mục chứa tài liệu hướng dẫn Moodle.
files/ Thư mục chứa mã lệnh để hiển thị và quản lý các file được tải lên.
lib/ Thư mục chứa thư viện cốt lõi của Moodle, đây được xem là nhân của Moodle.
login/ Thư mục chứa mã lệnh để điều khiển đăng nhập và tạo tài khoản người dùng.
mod/ Thư mục chứa tất cả các môđun phục vụ cho khóa học.
pix/ Thư mục chứa các biểu tượng, hình ảnh sử dụng trong site.
theme/ Thư mục chứa các thư mục giao diện site.
user/ Thư mục chứa mã lệnh để hiển thị và quản lý người dùng.
Lưu ý : Khi viết thêm module mới, phần nhân của Moodle được sử dụng lại, khi đó cần include tập tin config.php trong thư mục gốc của Moodle vào phần code. Trong tập tin config này có dòng require_once("$CFG- >dirroot/lib/setup.php");
Dòng này include tập tin setup.php trong lib/, đây là tập tin chỉ đường dẫn đến các file thư viện của Moodle.