Thực hiện chủ trương đẩy mạnh cải cách chính sách tài chính công trong các cơ sở y tế công lập, Ủy ban Nhân dân Tỉnh đã quyết định giao quyền tự chủ về tài chính theo Nghị định 43/2006/NĐ-CP ngày 25/4/2006 của Chính phủ cho 37 đơn vị sự nghiệp y tế công lập từ đầu năm 2007. Để tạo điều kiện cho các đơn vị chủ động trong công tác chăm sóc, bảo vệ và nâng cao sức khỏe nhân dân, sử dụng tiết kiệm và có hiệu quả các nguồn tài chính, tăng thu nhập cho cán bộ, công chức, viên chức. Nguồn thu viện phí (bao gồm cả nguồn bảo hiểm y tế) tăng lên đáng kể do mở rộng các dịch vụ khám, chữa bệnh, do các cơ sở y tế đưa trang thiết bị hiện đại, tiên tiến vào sử dụng, triển khai các kỹ thuật mới, hiệu quả trong khám, chuẩn đoán và điều trị bệnh. Hiện nay đang thí điểm thực hiện giao quyền tự chủ về tài chính đi đôi với quyền tự chủ về biên chế.
Bảo hiểm y tế ngày càng được mở rộng, số người tham gia bảo hiểm y tế không ngừng tăng lên, quyền lợi của người tham gia bảo hiểm y tế được đảm bảo, góp phần tích cực phát triển sự nghiệp y tế và làm thay đổi nhận thức của người dân trong việc lựa chọn các giải pháp tài chính để chăm lo sức khỏe cho bản thân. Các loại hình tham gia bảo hiểm y tế bắt buộc, tự nguyện, bảo hiểm học sinh, thẻ khám chữa bệnh 139…được triển khai rộng rãi, do đó đã tăng dần tỷ lệ thu viện phí thông qua bảo hiểm y tế, giảm dần tỷ lệ thanh toán viện phí trực tiếp từ người bệnh. Đến cuối năm 2007, toàn tỉnh đã cấp 300.309 thẻ khám chữa bệnh cho người nghèo từ nguồn ngân sách Nhà nước. Trẻ em dưới 06 tuổi được khám chữa bệnh miễn phí tại các cơ sở y tế Nhà nước từ tuyến xã đến tuyến Trung ương. Ủy ban Nhân dân Tỉnh đã 02 lần ban
quyết định bổ sung giá thu viện phí trên địa bàn tỉnh cho phù hợp với sự phát triển chuyên môn kỹ thuật và tình hình kinh tế - xã hội theo nguyên tắc giá viện phí được tính gần đủ chi phí trực tiếp phục vụ người bệnh.