Thẩm định tổng mức vốn đầu tư: Ở nội dung này Chi nhánh đã có sự cẩn thận và kỹ lưỡng trong khâu thẩm định, không dựa hoàn toàn vào kết quả mà khách hàng đưa ra, tuy vậy vẫn không tránh khỏi những hạn chế. Khi dự án vay vốn là những dự án lớn thì điều này càng gây khó khăn. Bởi lẽ khi tính tổng dự toán sẽ bao gồm rất nhiều hạng mục, phải liệt kê đầy đủ, điều này phải thông qua một tổ chức, cơ quan chuyên về xây dựng mới có thể đưa ra những con số chính xác. Vì thế, rất khó để tính toán đầy đủ, chính xác tất cả các hạng mục cấu thành tổng mức đầu tư.
Thẩm định dòng thu- chi: Ở nội dung này, mặc dù Chi nhánh đã có sự xem xét và tính toán lại các số liệu mà chủ đầu tư cung cấp nhưng những tính toán đó còn mang tính chủ quan và thiếu cơ sở. Vì thông tin thị trường có ảnh hưởng rất lớn đến việc tính toán doanh thu, chi phí của dự án. Tuy vậy, ở NHCT Bỉm Sơn, hoạt động dự báo trong công tác thẩm định tài chính còn hạn chế, những dự báo về biến động cung cầu, giá cả thị trường, chính sách của Nhà nước...không được chú trọng đứng mức, đôi khi còn mang ý kiến chủ quan của CBTĐ. Sử dụng tôt phương pháp dự báo sẽ giúp ích rất nhiều trong tính toán chính xác doanh thu và chi phí dự án. Nhưng Chi nhánh Ngân Hàng TMCP công thương Bỉm Sơn chưa thực hiện tốt phương pháp dự báo vì thế ảnh hưởng rất lớn đến tính chính xác khi thẩm định doanh thu, chi phí của dự án. Dẫn đến sai sót trong tính toán dòng tiền, tính chính xác của các chỉ tiêu hiệu quả tài chính dự án không cao.
Thẩm định các chỉ tiêu hiệu quả tài chính: Hiện tại, NHCT Bỉm Sơn khi tính toán các chỉ tiêu hiệu quả tài chính dự án hầu như chỉ dừng lại ở chỉ tiêu NPV, IRR, thời gian hoàn vốn, điểm hòa vốn- đây chỉ là những chỉ tiêu cơ bản. Mặt khác khi tính toán các chỉ tiêu hiệu quả tài chính dự án, CBTĐ chưa đưa ra sự so sánh, liên hệ giữa các chỉ tiêu với nhau, giữa các dự án với nhau để kết quả thẩm định mang tính chính xác và thuyết phục hơn.
Trên thực tế, nhiều tờ trình thẩm định còn sơ sài, không khoa học vì thế gây khó khăn cho lãnh đạo khi tiếp nhận tờ trình, việc thẩm định chưa đi sâu vào từng nội dung, chưa đánh giá dự án một cách khách quan và toàn diện. Tất cả những điều trên đều ảnh hưởng rất nhiều đến quyết định cho vay của Ngân hàng thông qua kết quả thẩm định tài chính của CBTĐ.