Hàng năm, nhà trường đều tổ chức Đại hội cán bộ viên chức và người lao động toàn trường. Qua đó ban hành quy chế áp dụng cho từng năm để phù hợp với tình hình hoạt động thực tiễn của nhà trường. Năm học 2012 – 2013, nhà trường đã ban hành 4 quy chế bao gồm:
- Quy chế tổ chức và làm việc - Quy chế chi tiêu nội bộ
- Quy chế thực hiện dân chủ trong hoạt động (trong đo có quy định chế độ công tác giáo viên)
- Quy chế thi đua khen thưởng
Trong quy chế tổ chức và làm việc, đã quy định rất chi tiết và cụ thể chức năng và nhiệm vụ và quan hệ làm việc của các bộ phận, có thể vắn tắt như sau:
- Tổ chức Đảng trong nhà trường: Đảng bộ, các chi bộ Đảng Cộng sản Việt Nam trong nhà trường lãnh đạo nhà trường, các Phòng, Khoa, Tổ trực thuộc trên các mặt công tác theo quy định của điều lệ Đảng và pháp luật.
- Các tổ chức đoàn thể: các tổ chức Công đoàn, Đoàn thanh niên Cộng sản Hồ Chí Minh, nữ công…hoạt động theo điều lệ của tổ chức mình trong khuôn khổ pháp luật và có trách nhiệm góp phần thực hiện nhiệm vụ của trường. Mối quan hệ giữa các cấp tổ chức chính quyền và đoàn thể trong trường là mối quan hệ phối hợp công tác dưới sự lãnh đạo của Đảng ủy.
- BGH: gồm một Hiệu trưởng và một Phó Hiệu trưởng phụ trách đào tạo.
o Hiệu trưởng là chủ tài khoản của nhà trường, là người chịu trách nhiệm trước Nhà nước và cấp trên về toàn bộ công việc thuộc chức năng, nhiệm vụ và quyền hạn quản lý Nhà nước theo quy định của pháp luật và theo quyết định số 43/1999/QĐ - BNN – TCCB ngày 25/02/1999 của Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức bộ máy của trường Trung học Công Nghệ Lương Thực Thực Phẩm. o Phó Hiệu trưởng phụ trách đào tạo: giúp việc cho Hiệu trưởng trong việc chỉ
- Các hội đồng tư vấn cho Hiệu trưởng: Hội đồng trường, Hội đồng đào tạo, Hội đồng thi đua khen thưởng, Hội đồng kỷ luật và các hội đồng khác có trách nhiệm tư vấn cho Hiệu trưởng các vấn đề liên quan đến đào tạo, thi đua, khen thưởng….Các hội đồng này làm việc theo chế độ tập thể, quyết định theo đa số, Hiệu trưởng là người quyết định cuối cùng.
- Các phòng chức năng: gồm 6 phòng chức năng, thực hiện các chức năng chính và các chức năng khác do BGH phân công.
o Phòng Đào tạo: tham mưu giúp việc cho BGH trong việc hoạch định chiến lược đào tạo, chịu trách nhiệm trong công tác quản lý đào tạo các hệ chính quy, hệ vừa học vừa làm…đặt trong và ngoài trường; xây dựng và tổ chức thực hiện kế hoạch, chương trình đào tạo, thực hiện công tác tuyển sinh, liên kết đào tạo, phụ trách công tác thư viện.
o Phòng Hành chính tổ chức: thực hiện công tác hành chính, tổng hợp; công tác văn thư, lễ tân, khánh tiết, quản lý con dấu của nhà trường; tham mưu giúp lãnh đạo trong việc sắp xếp, tổ chức thực hiện chế độ chính sách đối với giáo viên, cán bộ, nhân viên.
o Phòng Tài chính – kế toán: giúp Hiệu trưởng quản lý công tác tài chính, lập kế hoạch thu – chi và quyết toán hàng quý, hàng năm của trường theo chế độ Nhà nước quy định; tham mưu giúp lãnh đạo trong chế độ chi tiêu tài chính. o Phòng Khảo thí và đảm bảo chất lượng: tham mưu, đề xuất giúp Hiệu
trưởng trong công tác khảo thí và đảm bảo chất lượng giáo dục đào tạo; triển khai tổ chức thực hiện nhiệm vụ về công tác khảo thí và đảm bảo chất lượng giáo dục đào tạo của nhà trường.
o Phòng Công tác học sinh: giúp Hiệu trưởng xây dựng và tổ chức thực hiện kế hoạch quản lý giáo dục HS trong suốt quá trình học tập, rèn luyện ở trường; tham mưu giúp BGH về công tác khen thưởng và kỷ luật HS; tổ chức và quản lý HS trong ký túc xá, chủ trì tổ chức hoạt động giáo dục, sinh hoạt tư tưởng, văn hóa nghệ thuật, các hoạt động ngoại khóa về thể dục thể thao, lao động sản xuất.
o Phòng Quản trị đời sống: lập kế hoạch và thực hiện quyết định của Hiệu trưởng về quản lý, sửa chữa, bảo quản, điều chuyển sử dụng cơ sở vật chất của trường; quản lý điều hành công tác phục vụ điện, nước, y tế; tổng hợp đề xuất và thực hiện mua sắm các trang thiết bị phục vụ điều kiện hoạt động và làm việc công vụ cơ quan.
- Các Khoa và Tổ bộ môn trực thuộc gồm: Khoa Công nghệ lương thực thực phẩm, Khoa Cơ điện, Khoa Kinh tế và Tổ Khoa học cơ bản với chức năng, nhiệm vụ chung là tổ chức quá trình đào tạo theo chương trình kế hoạch giảng dạy của trường; tổ chức thực hiện biên soạn chương trình, tài liệu, giáo trình, nghiên cứu đổi mới nội dung, phương pháp giảng dạy và học tập nhằm nâng cao chất lượng đào tạo; xây dựng và tổ chức thực hiện thời khóa biểu cho ngành học, môn học thuộc đơn vị mình phụ trách theo kế hoạch chung của Phòng Đào tạo; quản lý giáo viên, giáo viên chủ nhiệm lớp, nhân viên và HS thuộc bộ phận mình.
- Các Phòng, Khoa, Tổ trực thuộc làm việc theo chế độ thủ trưởng. Trưởng Phòng, trưởng Khoa, Tổ trưởng trực thuộc chịu trách nhiệm trước Hiệu trưởng về toàn bộ hoạt động của bộ phận mình theo chức năng được phân công. Mối quan hệ giữa các Phòng, Khoa, Tổ trực thuộc trong nhà trường là mối quan hệ phối hợp, những vấn đề có ý kiến khác nhau giữa các đơn vị thì báo cáo kịp thời với BGH kết quả công tác và kiến nghị, đề xuất những vấn đề cần giải quyết.