Hoạt đ ng M&A ngân hàng ở nước ta thời gian qua đã có những tác dụng tích cực đối với sự phát triển và bền vững của hệ thống ngân hàng, nhưng bên cạnh đó cũng tồn tại không ít những mặt hạn chế cần được khắc phục:
- Các vụ mua lại sáp nhập ở nước ta còn khá khiêm tốn so với các nước trong khu vực về giá trị cũng như số lượng các thương vụ mua lại. Bên cạnh đó hoạt đ ng mua lại của các NHTM trong nước diễn ra trong theo xu hướng các ngân hàng lành mạnh phát triển tốt dưới sự chỉ đạo của NHNN sáp nhập hoặc hợp nhất với các ngân hàng có nguy cơ phá sản nhằm tránh sự đổ vỡ hệ thống. Những thương vụ M&A này là bắt bu c để khắc phục hậu quả của việc hoạt đ ng không hiệu quả của các ngân hàng chứ không phải là tự nguyện trên nền tảng chiến lược kinh doanh nhằm tạo ra ngân hàng lớn hơn với năng lực tài chính và năng lực cạnh tranh tốt hơn. Vì vậy vẫn chưa tận dụng được hết những lợi ích từ hoạt đ ng M&A.
- Hoạt đ ng sở hữu chéo cổ phần giữa các NHTM với nhau bên cạnh mặt tích cực là các ngân hàng có thể hỗ trợ cho nhau, giúp các ngân hàng nhỏ mở r ng được quy mô, nâng cao được năng lực về tài chính, công nghệ, nhân sự,… thì cũng có không ít những hạn chế như hình thành những liên minh đan xen về lợi ích nhằng nhịt, khiến cho các quan hệ tín dụng có thể trở nên không minh bạch rõ ràng, không mang tính thị trường. Việc thu hồi vốn trở nên khó khăn và nợ xấu có thể phát sinh và tăng cao đến không ngờ. Và các quy định về phân loại nợ và trích lập dự phòng rủi ro cùa NHNN có thể bị làm sai lệch tinh thần bởi sở hữu chéo. Khi khách hàng không trả được nợ cho ngân hàng A, thay vì xếp khoản vay thành nợ xấu và trích dự phòng rủi ro theo quy định, ngân hàng B có thể cho vay đảo nợ… Ngoài ra việc sở hữu chéo nhằng nhịt này khiến cho nhiều đại gia có thể dễ dàng lách luật để sở hưu tỷ lệ cổ phần tại các ngân hàng lớn hơn quy định.
- M t trong những hạn chế của hoạt đ ng hậu M&A là giải quyết quyền lợi của các nhóm cổ đông. Các cổ đông lớn có thể giảm quyền kiểm soát nên tạo ra mâu thuẫn, còn ý kiến của cổ đông nhỏ đôi khi bị bỏ qua nên có thể dẫn đến việc bán cổ phiếu gây ảnh hưởng không tốt đến giá trị của cổ phiếu trên thị trường chứng khoán.
- Vấn đề hòa hợp văn hóa cũng là mâu thuẫn rất lớn ở hầu hết các hoạt đ ng M&A. Do chưa có sự hòa hợp văn hóa của các ngân hàng với nhau nên chưa có sự hợp tác ăn ý giữa các nhà quản trị, nặng hơn có thể là đối đầu dẫn tới giảm hiệu quả hoạt đ ng kinh doanh của các ngân hàng sau khi thực hiện M&A. M t số trường hợp dẫn đến việc chảy máu chất xám, đặc biệt là ở các cấp quản lý. Vì vậy, việc dung hòa cách quản lý, hòa nhập các hoạt đ ng kinh doanh, các b phận chức năng cũng phải được Ban lãnh đạo ngân hàng tính đến, nếu không sẽ dẫn đến sự ra đi của nhân sự nhất là các lãnh đạo cấp cao của ngân hàng được sáp nhập.