Yếu tố sau cùng quyết định hiệu quả kinh doanh và sự an toàn trong hoạt động của ngân hàng là năng lực và chất lượng quản lý. Quản lý ngân hàng là tạo ra hệ thống các hoạt động thống nhất, phối hợp và liên kết các quá trình lao động của các cán bộ nhân viên từ các phòng ban đến hội đồng quản trị trong ngân hàng, nhằm đạt được mục tiêu kinh doanh ở mỗi thời kỳ, trên cơ sở giảm thiểu các chi phí về nguồn lực. Nói đến chất lượng và năng lực quản lý là nói đến yếu tố con người trong bộ máy quản lý, nói đến việc đề ra các chính sách kinh doanh đúng đắn và có hiệu quả, nói đến xây dựng các thủ tục quản lý, điều hành các quy trình nghiệp vụ hợp lý, sát thực và đúng pháp luật, nói đến tạo lập được cơ cấu tổ chức hợp lý, vận hành hiệu quả và giảm thiểu rủi ro về đạo đức trong hệ thống quản lý.
Bên cạnh đó, chất lượng và năng lực quản lý còn thể hiện ở khả năng nắm bắt kịp thời những tình huống bất lợi, nhận biết sớm các nguy cơ rủi ro tiềm ẩn đe doạ sự an toàn trong hoạt động của ngân hàng để đưa ra những biện pháp đối phó kịp thời. Chất lượng và năng lực quản lý cuối cùng được phản ánh ở tình hình tuân thủ đầy đủ luật pháp cũng như các quy chế hoạt động, hiệu quả kinh doanh và mức lợi nhuận thu được tăng lên, ngân hàng duy trì được khả năng thanh toán, sức cạnh tranh và vị thế của mình trên thị trường và luôn phát triển bền vững trước những biến động trong và ngoài nước.
Tóm lại, trong phân tích hoạt động kinh doanh của các ngân hàng thương mại hiện nay, các tỷ số tài chính vẫn được sử dụng khá phổ biến bởi tính toán khá đơn giản, tuy nhiên các nhà quản lý khó có thể có cái nhìn tổng thể để đánh giá mọi khía cạnh hoạt động của ngân hàng thương mại. Để bổ sung vào phân tích hiệu quả hoạt động kinh doanh của ngân hàng bên cạnh phương pháp phân tích chỉ số tài chính, hiện nay các nhà quản trị đã ứng dụng phương pháp phân tích hiệu quả biên để đánh giá hiệu quả hoạt động của các ngân hàng thương mại, đây là một phương pháp mới giúp các nhà quản trị có cài nhìn tổng thể về hoạt động của ngân hàng.
1.4.2. Phương pháp phân tích bao dữ liệu theo hướng tiếp cận phi tham số.