tìm kiếm trình tự sinh học qua ncbi

... giải trình tự 2.Công cụ tìm kiếm Kết Kết cần tìm cần tìm Lọc trình tự Tìm kiếm trình tự sinh học Tìm kiếm trình tự sinh học qua NCBI Click Tìm kiếm trình tự sinh học Tìm kiếm trình tự DNA Tìm kiếm ... U20068 Tìm kiếm trình tự sinh học TÌM KIẾM TRÌNH TỰ SINH HỌC QUA MÃ SỐ TRUY CẬP Tìm kiếm trình tự sinh học 10 Kết tìm trình tự DNA qua mã số truy cập Giới thiệu môn học 11 Tìm kiếm trình tự qua ... Mục tiêu học  Có khả tìm kiếm trình tự sinh học DNA, RNA, Protein  Đăng ký trình tự nghiên cứu lên Cơ sở liệu sinh học phần mềm Sequin Tìm kiếm trình tự sinh học Nguyên tắc giải trình tự  Phương...

Ngày tải lên: 20/10/2013, 03:15

... giải trình tự 2.Công cụ tìm kiếm Kết Kết cần tìm cần tìm Lọc trình tự Tìm kiếm trình tự sinh học Tìm kiếm trình tự sinh học qua NCBI Click Tìm kiếm trình tự sinh học Tìm kiếm trình tự DNA Tìm kiếm ... U20068 Tìm kiếm trình tự sinh học TÌM KIẾM TRÌNH TỰ SINH HỌC QUA MÃ SỐ TRUY CẬP Tìm kiếm trình tự sinh học 10 Kết tìm trình tự DNA qua mã số truy cập Giới thiệu môn học 11 Tìm kiếm trình tự qua ... Mục tiêu học  Có khả tìm kiếm trình tự sinh học DNA, RNA, Protein  Đăng ký trình tự nghiên cứu lên Cơ sở liệu sinh học phần mềm Sequin Tìm kiếm trình tự sinh học Nguyên tắc giải trình tự  Phương...

Ngày tải lên: 23/03/2014, 12:21

... hai trình tự Dự kiến kết đạt đƣợc − Về lý thuyết: Tài liệu vấn đề khai thác kiến trúc phân tán chia sẻ tìm tƣơng đồng trình tự sinh học − Về sản phẩm: Module chƣơng trình tƣơng đồng trình tự sinh ... bắt cặp trình tự nhằm giải toán tìm tƣơng đồng trình tự sinh học Giới thiệu song song hóa liệu môi trƣờng MPI công nghệ CUDA giải toán hàng trình tự Chƣơng 2: Các phƣơng pháp hàng trình tự Trong ... DNA [3] 12  Chuyển mã trình tự DNA sang RNA  Hiển thị cặp trình tự trình tự bắt cặp  Tìm vị trí enzyme giới hạn trình tự  Vẽ đồ plasmid, hỗ trợ thiết kế phân tử  Tìm kiếm đoạn mồi (primer)...

Ngày tải lên: 25/11/2014, 10:56

... hàng trình tự cục thuật toán Smith-Waterman khối lƣợng liệu trình tự lớn 1.2 Tổng quan sinh tin học Sinh tin học ngành khoa học mà có kết hợp sinh học, khoa học máy tính công nghệ thông tin Sinh ... trình tự, đo lƣờng giống chuỗi trình tự Nó so sánh hai hay nhiều trình tự dựa việc so sánh chuỗi thành phần trình tự để tìm điểm tƣơng đồng, giống trình tự Các trình tự chuỗi DNA, RNA trình tự amino ... 2.2 Bắt cặp hai trình tự [2] 23 2.3 Bắt cặp đa trình tự (Multiple Sequence Alignment-MSA) Cho k trình tự sinh học S1, S2, …, Sk Hãy tìm k trình tự S1‘, S2‘,…, Sk‘ cách thêm ký tự ‗-‘ cho: – |S1‘|...

Ngày tải lên: 25/11/2014, 11:44

... muốn, phân nhóm trình tự, dựa theo phân loài, tìm đoạn trình tự đặc trưng… - Gửi trình tự muốn tìm cho Client Công việc Client: - Nhận trình tự muốn tìm từ Server Nhập trình tự muốn tìm ACTGTAGTCGTAGCTGATGCTA ... trình tự toàn cục, bắt cặp hai đoạn trình tự với Đặt vấn đề Luận văn dựa vào thuật toán Smith – Waterman để bắt cặp trình tự cục  cụ thể tìm kiếm tương đồng đoạn trình tự đầu vào với trình tự ... 10000 trình tự có độ dài hỗn hợp Bao gồm trình tự có độ dài ngắn cách biệt lớn, từ 300 - 3000 ký tự - Nhóm gồm 10000 trình tự có độ dài lớn Độ dài trung bình 28 trình tự khoảng 2500 – 3000 ký tự...

Ngày tải lên: 25/11/2014, 11:46

... muốn, phân nhóm trình tự, dựa theo phân loài, tìm đoạn trình tự đặc trưng… - Gửi trình tự muốn tìm cho Client Công việc Client: - Nhận trình tự muốn tìm từ Server Nhập trình tự muốn tìm ACTGTAGTCGTAGCTGATGCTA ... trình tự toàn cục, bắt cặp hai đoạn trình tự với Đặt vấn đề Luận văn dựa vào thuật toán Smith – Waterman để bắt cặp trình tự cục  cụ thể tìm kiếm tương đồng đoạn trình tự đầu vào với trình tự ... 10000 trình tự có độ dài hỗn hợp Bao gồm trình tự có độ dài ngắn cách biệt lớn, từ 300 - 3000 ký tự - Nhóm gồm 10000 trình tự có độ dài lớn Độ dài trung bình 28 trình tự khoảng 2500 – 3000 ký tự...

Ngày tải lên: 27/11/2014, 08:06

... hàng trình tự cục thuật toán Smith-Waterman khối lƣợng liệu trình tự lớn 1.2 Tổng quan sinh tin học Sinh tin học ngành khoa học mà có kết hợp sinh học, khoa học máy tính công nghệ thông tin Sinh ... trình tự, đo lƣờng giống chuỗi trình tự Nó so sánh hai hay nhiều trình tự dựa việc so sánh chuỗi thành phần trình tự để tìm điểm tƣơng đồng, giống trình tự Các trình tự chuỗi DNA, RNA trình tự amino ... 2.2 Bắt cặp hai trình tự [2] 23 2.3 Bắt cặp đa trình tự (Multiple Sequence Alignment-MSA) Cho k trình tự sinh học S1, S2, …, Sk Hãy tìm k trình tự S1‘, S2‘,…, Sk‘ cách thêm ký tự ‗-‘ cho: – |S1‘|...

Ngày tải lên: 27/11/2014, 14:35

... đồng, nguồn gốc trình tự tương đồng,… Tìm kiếm trình tự sinh học Bắt cặp trình tự   Sắp xếp thẳng hàng trình tự phương pháp xếp hai nhiều trình tự nhằm đạt giống tối đa Các trình tự xen khoảng ... Mục tiêu học  Nắm nguyên tắc so sánh trình tự sinh học  Sử dụng chương trình BLAST giúp nhanh chóng tìm trình tự sinh học tương đồng (nếu có CSDL lớn NCBI, EMBL, DDPJ…) với trình tự yêu cầu ... pháp thường dùng để nghiên cứu tiến hóa trình tự từ tổ tiên chung, đặc biệt trình tự sinh học trình tự protein trình tự DNA Các bắt cặp không trình tự tương ứng với đột biến khoảng trống tương...

Ngày tải lên: 17/10/2013, 16:15

... cụ tìm kiếm trình tự sinh học .67 Giao diện chức tìm kiếm BLASTN 68 Giao diện công cụ hỗ trợ tìm kiếm virus cúm .68 Kết tìm kiếm trình tự có độ tương đồng 69 CHƯƠNG TỔNG QUAN ... hàng đa trình tự ThS Võ Hồng Bảo Châu đề cập đến số phương pháp giúp hàng trình tự từ hỗ trợ cho việc tìm kiếm mức độ tương đồng nhiều trình tự sinh học Đối với việc nghiên cứu trình tự sinh học ... giống chuỗi trình tự Là cách thức so sánh hay nhiều trình tự dựa việc so sánh chuỗi thành phần (ký tự) trình tự để tìm điểm tương đồng, giống trình tự Các trình tự chuỗi DNA, RNA trình tự amino...

Ngày tải lên: 18/12/2013, 14:28

... liệu y sinh học NIH sở nghiên cứu y sinh học lớn giới CSDL NCBI CHƯƠNG II TÌM KIẾM DỮ LIỆU SINH HỌC CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC 1.1 Khái quát chung sở liệu sinh học 1.2 Cơ sở liệu trình tự Trình tự DNA ... II TÌM KIẾM DỮ LIỆU SINH HỌC CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC 1.1 Khái quát chung sở liệu sinh học 1.2 Cơ sở liệu trình tự 1.2 Cơ sở liệu trình tự Năm sở liệu trình tự mạng Internet cung cấp thông tin trình ... II TÌM KIẾM DỮ LIỆU SINH HỌC CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC 1.1 Khái quát chung sở liệu sinh học Cơ sở liệu sinh học (CSDL) chương chủ yếu đề cập đến thông tin trình tự Axit nucleic (ADN, ARN), trình tự...

Ngày tải lên: 20/02/2014, 01:20

... đồng, nguồn gốc trình tự tương đồng,… Tìm kiếm trình tự sinh học Bắt cặp trình tự   Sắp xếp thẳng hàng trình tự phương pháp xếp hai nhiều trình tự nhằm đạt giống tối đa Các trình tự xen khoảng ... Mục tiêu học  Nắm nguyên tắc so sánh trình tự sinh học  Sử dụng chương trình BLAST giúp nhanh chóng tìm trình tự sinh học tương đồng (nếu có CSDL lớn NCBI, EMBL, DDPJ…) với trình tự yêu cầu ... pháp thường dùng để nghiên cứu tiến hóa trình tự từ tổ tiên chung, đặc biệt trình tự sinh học trình tự protein trình tự DNA Các bắt cặp không trình tự tương ứng với đột biến khoảng trống tương...

Ngày tải lên: 23/03/2014, 12:21

... CHƯƠNG II TÌM KIẾM DỮ LIỆU SINH HỌC CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC VÀ CÁC NGÂN HÀNG DLSH CÁC CÔNG CỤ TÌM KIẾM, PHÂN TÍCH CÁC CSDL THỰC HÀNH TÌM KIẾM CÁC DLSH Chương II TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC I Cơ ... II TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC I Cơ sở liệu sinh học ngân hàng liệu sinh học: 1.1 Khái quát chung sở liệu sinh học:  Các thông tin liệu DNA, protein chủ yếu trình tự nucleotit trình tự axit ... liệu sinh học ngân hàng liệu sinh học: 1.1 Khái quát chung sở liệu sinh học:  Cơ sở liệu sinh học (csdl) thông tin trình tự a.nu (ADN, ARN), trình tự a.a phân tử Protein, thông tin cấu trúc trình...

Ngày tải lên: 21/07/2014, 10:52

... tử giống Trong trình tiến hoá, trình tự thêm bớt số phần tử (thường ký hiệu InDel - insertions/deletions) trình tự, sinh vật có họ hàng gần trình tự khác phần thêm vào chen trình tự Bởi chuyển ... trí i toàn trình tự, s ( mij , mik ) điểm tương đồng cặp trình tự j k vị trí i Từ ta thấy mức độ đơn giản, so sánh hai trình tự với (PSA – hàng cặp trình tự) , ta ký hiệu hai chuỗi trình tự S1, S2 ... trình tự để có thông tin vùng tương tự, từ giảm thiểu trường hợp cần xét tới Để thực nhanh cho việc tìm kiếm, từ ban đầu (word, k-tuple: chuỗi trình tự con, khoảng 5-10 ký tự cho DNA 2-3 ký tự...

Ngày tải lên: 22/07/2014, 06:21

... triết học khoa học tự nhiên Triết học phương Tây Cận đại phát triển điều kiện gắn bó chặt chẽ với khoa học Sự phát triển triết học gắn kết chặt chẽ, hữu với phát triển khoa học tự nhiên, thể trình ... chất trình học xảy bên vật thể Nguyên tắc tương đối trở thành sở lý luận ngành vật lý, quan niệm không gian, thời gian khoa học tự nhiên kỷ XVII-XIX Tất thành tựu làm cho quan niệm thần học đề ... điển hình chủ nghĩa tâm chủ quan Ông sinh gia đình quý tộc miền Nam Ailen Năm 15 tuổi ông học Đại học Tổng hợp Đublin Ông say mê nghiên c ứu thần học, toán học, triết học cuối đời Ông có nhiều...

Ngày tải lên: 23/12/2013, 15:46

... cố để giành ý mọI người Quan hệ với anh em ruột Người thường tự so sánh thân với người anh chị liền trước Không đối đầu, thích chọn hướng ngược lại Nếu người lớn học sinh xuất sắc người lại trở ... đứng nhiều phương diện để quan sát học hỏi tình quan hệ cá nhân Bạn làm gì? Cưng chìu lớn nhỏ tội đứa xứng đáng chăm sóc yêu thương Bạn làm điều sau khuyến khích lòng tự trọng đứa  Nếu bạn rối ... lịch sử yếu tố khoa học cách mạng xã hội Tôi dám đánh đứa chẳng nghĩ chúng có ảnh hưởng quan trọng gia đình Một kết tất yếu khác cảm thấy bị thất gia đình ngườI thường có quan hệ vượt xa khỏI...

Ngày tải lên: 05/07/2014, 17:20

... thích nghi tương quan cá thể C Phân hoá khă sinh sản củă kiểu gen khác quần thể D A C Đáp Án C Câu Trong quần thể ( Đ: đa hình ;T :tự thụ) chọn lọc tự nhiên (CLTN) đảm bảo sống sót sinh sản ưu cá ... Chọn lọc quần thể không dẫn đến kết A Làm hình thành đặc điểm thích nghi tương quan cá thể mặt kiếm ăn, tự vệ, sinh sản B Đảm bảo tồn phát triển quần thể thích nghi nhất, không quy định phân ... hình cá thể qua nhiều hệ dẫn tới hệ chọn lọc (G: kiêu gen ;Q: quần thể) A A; L;G B T;Tr ;Q C Đ; L;Q D Đ; L;G Đáp Án D Câu Vai trò thường biến trình tiến hoá thể A Đảm bảo sống sót sinh sản ưu...

Ngày tải lên: 22/07/2014, 01:20

... thích nghi tương quan gi a cá th Phân hoá khă sinh s n c ă nh ng ki u gen khác qu n th A C ñúng C Trong m t qu n th ( ð: ña hình ;T:t th ) ch n l c t nhiên (CLTN) ñ m b o s s ng sót sinh s n ưu th ... hình c a cá th qua nhi u th h d n t i h qu ch n l c (G: kiêu gen ;Q: qu n th ) A; L;G T;Tr ;Q ð; L;Q ð; L;G D Vai trò c a thư ng bi n trình ti n hoá th hi n ð m b o s s ng sót sinh s n ưu th ... th ñó quan tr ng nh t c p ñ cá th qu n th CLTN nhân t quy ñ nh chi u hư ng nh p ñi u bi n ñ i thành ph n ki u gen c a qu n th , nhân t ñ nh hư ng trình ti n hoá C Chuyên ð Ôn thi ðH - Sinh H...

Ngày tải lên: 08/08/2014, 10:21

... THÀNH LOÀI NHỜ CƠ CHẾ LAI XA VÀ ĐA BỘI HÓA XA VÀ ĐA BỘI HÓA Các nhóm học sinh tự tìm hiểu nội dung sau Các nhóm học sinh tự tìm hiểu nội dung sau Nhóm 1: Phân tích hình 1, -> đường hình thành ... đặc điểm sinh thái nên… đặc điểm sinh thái nên… thể trên? thích? thể trên? thích? Sinh trưởng, hoa kết trước lũ HÌNH THÀNH LOÀI BẰNG CON HÌNH THÀNH LOÀI BẰNG CON ĐƯỜNG SINH THÁI ĐƯỜNG SINH THÁI ... Vui để học Vui để học 1/Hình thành loài đường sinh thái phương thức thường nhóm sinh vật: A Động vật giao phối B Thực vật, động vật di động xa C Động vật di động xa D Thực vật động vật kí sinh...

Ngày tải lên: 11/08/2014, 09:26

... TRA BÀI CŨ Chu kì tế bào gồm giai đoạn nào? Trình bày vận động nhiễm sắc thể qua kì trình nguyên phân Tiết 21, 19: Tiết 21, 19: GIẢM PHÂN Xem phim trình giảm phân tế bào, kết hợp SGK, hoàn thành ... mang NST đơn bội (n), thông qua thụ tinh mà NST (2n) loài khôi phục + Sự kết hợp trình nguyên phân, giảm phân thụ tinh mà NST loài sinh sản hữu tính trì, ổn định qua hệ thể -Về mặt thực tiễn: ... gì? Một loài có NST 2n = 8, hỏi số lượng NST tế bào sinh dục chín kì giảm phân bao nhiêu? Chúc quý thầy cô giáo sức khỏe! Chúc em học sinh học tập tốt! Sự vận động NST nguyên phân giảm phân Giảm...

Ngày tải lên: 11/08/2014, 12:22

... -Quỏ trỡnh sinh sn ( giao phi ) -Chn lc t nhiờn II Quá trình hình thành quần thể thích nghi 1.Cơ sở di truyền trình hình thành quần thể thích nghi Thí nghiệm chứng minh vai trò CLTN trình hình ... -Đối tượng TN? - Quan điểm nhà khoa học hoá đen loài bướm sâu đo Biston Betularia? - Vai trò CLTN trình hình thành quần thể thích nghi? 2 Thí nghiệm chứng minh vai trò CLTN trình hình thành ... Khái niệm c im thớch nghi l nhng c im giỳp sinh vt thớch nghi vi mụi trng lm tng kh nng sng sút v sinh sn ca chỳng Nhng c im ú cú ý ngha nh th no i vi sinh vt? =>Th no l c im thớch nghi? 2.c im...

Ngày tải lên: 11/08/2014, 12:22