giải trình tự vùng dloop

Ngày tải lên: 19/03/2014, 18:20

... GIẢI TRÌNH TỰ AXIT NUCLEIC TRÊN MÁY TỰ ĐỘNG. Giảng viên hướng dẫn: LÊ XUÂN ĐẮC Sinh viên thực hiện: PHẠM THỊ THOA Lớp: K33C Sinh – KTNN Trường: Đại học sư phạm Hà Nội II. I. Giải trình tự ... ADN tự động. - Nguyên lí: Giải trình tự ADN tự động dựa theo nguyên lí của phương pháp dideoxy của F.Sanger (1977) được cải tiến dựa vào các thiết bị tự động hóa nhanh và chính xác hơn. Sự tự ... Phần mềm máy tính sẽ tự động giải trình tự giữ liệu từ gel điện di và cho hình ảnh kết quả giải trình ADN. - Các bước tiến hành: +, Giải trình tự ADN tự động bao gồm các thành phần chủ yếu sau: 1 ...

Ngày tải lên: 29/10/2012, 09:32

... dùng để đọc trình tự hầu hết các loại rDNA nhưng không đọc được trình tự vùng primer. NS2 và NS3, NS4 và NS5, NS6 và NS7 có trình tự bổ sung, được thiết kế để đọc được trình tự cả vùng primer ... nucleotide 475. Vì trình tự với primer ITS4 bị nhiễu nên trình tự cuối cùng được chọn dựa trên vùng đáng tin cậy của trình tự đọc được với primer ITS5. 4.5.2. Kết quả tìm trình tự đáng tin cậy ... (2002) đã giải trình tự hoàn toàn gene mã hóa 5.8 S rDNA và vùng ITS lân cận 2 dòng Beauveria bassiana. Sự giống trên toàn vùng trình tự giải được của hai dòng này là 96 %. Sự giống nhau ở vùng...

Ngày tải lên: 31/10/2012, 09:26

... định được trình tự vùng rDNA-ITS của dòng BV-62-03. 4.4.2. Đọc trình tự vùng rDNA-ITS của dòng SR-650 Với primer ITS1, vùng rDNA-ITS của dòng SR-650 đã đọc được là 602bp. Trình tự như sau: ... thành công vùng rDNA-ITS của nấm R. solani.  Bước đầu đã đọc được trình tự vùng rDNA-ITS của nấm R. solani . 5.2.Đề nghị  Hoàn thiện qui trình đọc trình tự để có kết quả đọc trình tự tốt hơn. ... vừa li trích trên vùng ITS của rDNA sử dụng hai mồi (primer) ITS4 và ITS5.  Đọc trình tự vùng rDNA – ITS với hai primer ITS1 và ITS4. 1.4. Giới hạn đề tài Việc đọc trình tự vùng rDNA – ITS...

Ngày tải lên: 01/11/2012, 10:59

... mềm Seqscape và BioEdit giúp xác định đƣợc trình tự đầy đủ của vùng D-Loop của các mẫu gà. Do mẫu gà Mông đọc trình tự gặp phải khó khăn nên trình tự D-Loop của gà Mông chƣa đầy đủ. Vì vậy chúng ... so sánh kết quả hai mẫu Da và RI. So sánh trình tự Da và RI với nhau và với trình tự D-Loop của gà đã đƣợc công bố Galuss galuss gốc Nhật lấy trình tự trong trên ngân hàng gen mang mã số AB114078 ... cứu vùng D-Loop của 3 loài gà lôi Việt Nam gồm: gà lôi đuôi trắng, trĩ bạc và gà lôi hông tía. Các kết quả thu đƣợc cho thấy sự sai khác về trình tự nhận biết các enzyme trong vùng trình tự...

Ngày tải lên: 01/11/2012, 15:32

... quả giải trình tự vùng ITS-rDNA và vùng Tef 43 4.6.1 So sánh trình tự nucleotid giữa vùng ITS – rDNA và vùng Tef 43 4.6.2 Kết quả giải trình tự vùng ITS1 – 5,8S – ITS2 48 4.6.3 Kết quả giải trình ... dòng Trichoderma trong tự nhiên, nhận diện các dòng nấm thu đƣợc là các dòng Trichoderma, tiến tới đọc trình tự vùng rDNA-ITS, trình tự đọc đƣợc này đối chiếu với trình tự có trong cơ sở dữ liệu ... 1997). Vùng ITS2 khám phá sau vùng ITS1, vùng ITS2 có tính bảo toàn cao hơn ở một vài vùng 18S (Hershkovitz và ctv., 1999).  Chiều dài và trình tự của những vùng ITS của rDNA đƣợc cho rằng vùng...

Ngày tải lên: 05/11/2012, 13:58

... vùng chức năng chính. Vùng mã hóa chiếm tới 93% hệ gen ty thể, vùng còn lại đƣợc gọi là vùng D-loop (vùng siêu biến hay vùng điều khiển) không đƣợc dịch mã, chứa trình tự khởi đầu cho quá trình ... Mỹ. Vùng điều khiển D-loop đƣợc xác định trình tự trên máy đọc trình tự tự động ABI PRISM  3100 Genetic Analyzer. 2.2.5. Phân tích dữ liệu bằng phần mềm chuyên dụng Dữ liệu về trình tự vùng ... sử dụng cả các marker vi vệ tinh và trình tự vùng D-loop ty thể gà. Các nhà khoa học cũng đã so sánh trình tự vùng D-loop của các loại gà này với 779 trình tự thu thập đƣợc từ GenBank. Các kết...

Ngày tải lên: 09/11/2012, 16:12

... vùng D-loop bằng kỹ thuật PCR…… …………………… 31 3.2. Xác định và so sánh trình tự nucleotide của các mẫu nghiên cứu với trình tự chuẩn trên GenBank…… …………… …….… 36 3.3. Sự đồng nhất về trình tự ... trong 5 phút ở 4 o C, sau đó giữ mẫu DNA tinh sạch ở -20 o C. 2.2.4. Giải trình tự vùng D-loop Nguyên tắc chung: Trình tự vùng D-loop đƣợc xác định dựa trên nguyên tắc chung của phƣơng pháp ... thành ba vùng chính là vùng ngoại biên I và III có khả năng biến đổi cao và vùng II là vùng trung tâm ít biến đổi [55]. Vùng I nằm ở đầu 5' vùng điều khiển, kích thƣớc khoảng 400 bp, vùng...

Ngày tải lên: 12/11/2012, 17:59

... Nhân đoạn trình tự của vùng D-loop của DNA ty thể 36 3.2.3. Tách dòng và xác định trình tự vùng D- loop của DNA ty thể 39 3.2.3.1. Tách dòng vùng D-loop 39 3.3.2.2. Xác định trình tự vùng D-loop ... tiếp theo. 3.2.3 Tách dòng và xác định trình tự vùng D-Loop của DNA ty thể 3.2.3.1. Tách dòng vùng D-Loop Để tạo điều kiện cho việc xác định trình tự vùng D-loop, chúng tôi tiến hành tách ... KS (-) để chuẩn bị cho việc đọc và so sánh trình tự nucleotide vùng D-Loop. Năm 2006 Địch Thị Kim Hương và cộng sự [3] đã xác định được trình tự vùng D-Loop gồm 1227 nucloetide của 2 mẫu giống...

Ngày tải lên: 12/11/2012, 18:01

... dạng di truyền 6 giống gà bản địa của trung Quốc. Họ giải trình tự 539 nucleotide vùng trình tự D-Loop của 6 giống gà, so sánh với trình tự nucleotide của các giống gà G. gallus, G.sonneratii, ... hoán Chúng tôi so sánh trình tự vùng D-Loop của 2 mẫu gà nghiên cứu với một số trình tự của các chủng gà đã đƣợc công bố: Giống Galuss galuss Murghi gốc Ấn Độ lấy trình tự trong ngân hàng gen ... mềm Seqscape và BioEdit giúp xác định đƣợc trình tự đầy đủ của vùng D-Loop của các mẫu gà. Do mẫu gà Mông đọc trình tự gặp phải khó khăn nên trình tự D-Loop của gà Mông chƣa đầy đủ. Vì vậy...

Ngày tải lên: 13/11/2012, 08:23

... đưc vng D-loop. Sn phẩm PCR sẽ đưc sử dụng ở cc thí nghiệm tip theo. 3.2.3 Xc đnh trnh tự vùng điều khiển D-loop của DNA ty thể Sau khi tinh sch sn phẩm PCR (thôi gel sn phẩm PCR), ... khỏe , ngăn ngừ a và hạ n chế cá c bệ nh về tim mạ ch . 3.2 Xc đnh trnh tự nucleotide của vùng D-loop và đnh gi đa dạng di truyền của 3 mẫu gà nghiên cứu Đ xc định trnh t ... trên chng tôi đ tin hnh đ ti : “ Xác định hàm lượng cholesterol trong trứng và so sánh trình tự vng điều khiển D- loop DNA ty thể của gà Ri, gà Tre, gà Ác nuôi tại Bắc Giang”. 2. Mục tiêu...

Ngày tải lên: 13/11/2012, 08:25

... hóa. Vùng II kích thƣớc khoảng 500 bp, vùng này có tốc độ tiến hóa chậm hơn so với vùng I và vùng III từ 10 - 20 lần [35]. Thông thƣờng, vùng thứ III là vùng biến đổi nhiều nhất và có trình tự ... sử dụng cả các marker vi vệ tinh và trình tự vùng D-loop ty thể gà. Các nhà khoa học cũng đã so sánh trình tự vùng D-loop của các loại gà này với 779 trình tự thu thập đƣợc từ GenBank. Các kết ... D-loop của 71 mẫu thuộc 3 giống gà Ri, Đông Tảo và Tre. - Xác định trình tự vùng D-loop. - So sánh trình tự vùng D-loop với trình tự chuẩn đã đƣợc công bố trên GenBank, phát hiện các vị trí đa...

Ngày tải lên: 13/11/2012, 16:59

... chính máy giải trình tự của Trugene) vào thư viện này, nhưng không thể lấy thư viện này ra bên ngoài cũng như không thể đăng nhập được một trình tự có được từ các máy giải trình tự khác để ... Có một số nhà nghiên cứu cho là nếu định genotype bằng giải trình tự vùng 5’-NC sẽ không cho kết quả chính xác mà phải giải trình tự vùng NS5B trên bộ gen của HCV. Sở dĩ các nhà nghiên cứu ... hữu dụng lâm sàng nhất vẫn là giải trình tự vùng 5’-NC. Mục tiêu nghiên cứu: Thực hiện xét nghiệm giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR khuếch đại một đoạn DNA trên vùng 5’-NC của HCV, phân tích...

Ngày tải lên: 16/11/2012, 09:22

... vùng Tef 43 4.6.1 So sánh trình tự nucleotid giữa vùng ITS – rDNA và vùng Tef 43 4.6.2 Kết quả giải trình tự vùng ITS1 – 5,8S – ITS2 48 4.6.3 Kết quả giải trình tự vùng Tef1fw – Tef2rev của ... dòng Trichoderma trong tự nhiên, nhận diện các dòng nấm thu đƣợc là các dòng Trichoderma, tiến tới đọc trình tự vùng rDNA-ITS, trình tự đọc đƣợc này đối chiếu với trình tự có trong cơ sở dữ liệu ... 1997). Vùng ITS2 khám phá sau vùng ITS1, vùng ITS2 có tính bảo toàn cao hơn ở một vài vùng 18S (Hershkovitz và ctv., 1999).  Chiều dài và trình tự của những vùng ITS của rDNA đƣợc cho rằng vùng...

Ngày tải lên: 19/11/2012, 15:13

... ng/µl được sử dụng để giải trình tự tại ADN Core, trường đại học tổng hợp Michigan (Mỹ) theo phương pháp giải trình của Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trên trang ... phương pháp điện di Kết quả giải trình tự Sản phẩm PCR, sau khi làm sạch được giải trình tự trực tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử. Kết quả được trình bầy ở hình 2 A và B. Gen ... ADN và protein A) Ở mức độ ADN Trình tự của toàn bộ gen HP1125 vừa được giải mã được so sánh với gen tương ứng của các chủng nước ngoài bằng chương trình Blast. Nhìn chung, gen của Việt...

Ngày tải lên: 30/01/2013, 14:43

Ngày tải lên: 15/03/2013, 17:19

Ngày tải lên: 19/03/2013, 09:34

Ngày tải lên: 19/03/2013, 09:34

Ngày tải lên: 19/03/2013, 09:34