giải trình tự adn

... nghiên cứu Kết xác định trình tự ADN cho phép xác định mối liên hệ tiến hoá dịch tễ học chủng vi sinh vật - Đôi nét phản ứng chuỗi PCR: Phản ứng chuỗi PCR nhằm khuyếch đại ADN lần Saki (1985) giới ... tỏ có mặt ADN đích mẫu nghiên cứu Có thể nhận tính đặc hiệu độ nhạy cao sử dụng kỹ thuật RFLP với sản phẩm PCR lai với mẫu dò đặc hiệu Tuy nhiên, thông tin đầy đủ kết xác định trình tự ADN sản ... PCR toàn quy trình phát vài (đối với nguồn ADN hay RNA) Lợi kỹ thuật PCR tận dụng cho việc chuẩn bị ADN làm mẫu dò với số lượng lớn cho phép lai ADN trình bày Các mẫu dò đánh dấu phóng xạ hay...

Ngày tải lên: 30/07/2014, 03:20

... pháp chỗ đoạn ADN cần tách dòng trước tiến hành giải trình tự ADN Tuy nhiên người ta cải tiến phương pháp để giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR + Giới thiệu kỹ thuật giải trình tự ADN theo Sanger: ... pháp giải trình tự truyền thống đọc kết gel (đánh dấu phóng xạ chủ yếu) phương pháp giải trình tự đọc kết tự động (đánh dấu hóa chất huỳnh quang) - Phương pháp truyền thống: Các bước cho giải trình ... trình tự ADN sau: Chuẩn bị ADN khuôn Bắt cặp ADN khuôn mồi Tiến hành phản ứng giải trình tự ADN Tách sản phẩm gel polyacrylamid biến tính với urea Đọc kết Tuy nhiên cần ý số điểm sau: Chuẩn bị ADN...

Ngày tải lên: 30/07/2014, 03:20

... Chuẩn bị ADN dùng cột Qiagene: Các cột Qiagene chuẩn bị dễ dàng nhanh để tinh ADN không cần dùng gradient CsCl ADN chuẩn bị theo phương pháp đạt kết tốt cho việc biến nạp giải trình tự gene Có ... phòng) Ly tâm 15000 v/phút 4oC 10 Rửa ADN thu với ethanol 70%, để khô phút hoà tan lại thể tích đệm thích hợp (25ml) Chú ý trường hợp mẫu dùng cho giải trình tự ADN tự động huỳnh quang hoà tan mẫu ... Qiagene-tip 20 với 1ml QBT đệm chảy hết tự Đưa phần dịch thu bước lên cột để tự chảy qua cột 7 Rửa cột lần, lần ml đệm QC Thu ADN với 0.8 ml đệm QF Kết tủa ADN với 0.7 thể tích isopropanol (trước...

Ngày tải lên: 30/07/2014, 03:20

... b Kỹ thuật giải trình tự ADN thiết bị giải trình tự ADN tự động: Hình 1.12 Thiết bị giải trình tự ADN tự độngg (3100-Avant Genetic Analyzer) Trong phần đề cập phản ứng giải trình tự ADN loại thiết ... glycerol, sau kết tủa ADN bắt cặp với ADN mồi dùng để giải trình tự Phương pháp giải trình tự ADN với sợi đôi cần lượng ADN mồi cao gấp 10-20 lần so với sợi đơn Việc giải trình tự gồm hai phản ứng: ... việc giải trình tự ADN plasmid nên tái tinh với Genee-Clean sắc ký trao đổi ion Hình 1.11 Tra mẫu thiết bị chạy gel Các phần đề cập đến số vấn đề nảy sinh cách giải tiến hành giải trình tự ADN...

Ngày tải lên: 30/07/2014, 03:20

... thuật giải trình tự ADN Kỹ thuật giải trình tự ADN thiết bị giải trình tự ADN tự động: Hình 1.12 Thiết bị giải trình tự ADN tự độngg (3100-Avant Genetic Analyzer) Trong phần đề cập phản ứng giải trình ... glycerol, sau kết tủa ADN bắt cặp với ADN mồi dùng để giải trình tự Phương pháp giải trình tự ADN với sợi đôi cần lượng ADN mồi cao gấp 10-20 lần so với sợi đơn Việc giải trình tự gồm hai phản ứng: ... thích hợp để giải trình tự ADN nhanh, xác kinh tế điều cần quan tâm đến Một số phương pháp cụ thể thường dùng cho kỹ thuật giải trình tự ADN Phương pháp 1: Tinh Plasmid cho giải trình tự ADN Hiện...

Ngày tải lên: 05/12/2014, 08:38

... thực chất đoạn trình tự ngắn trích từ trình tự cADN biết Các trình tự cADN ngẫu nhiên (có thể trình tự đầy đủ hay trình tự phần EST) xác định sử dụng phương pháp giải mã trình tự ngẫu nhiên đối ... lượng trình tự gấp khoảng 10 lần lượng ADN thực cần giải mã trình tự đảm bảo phần NST phân tích Quá trình tạo thư viện tái tổ hợp mang trình tự ngẫu nhiên lượng lớn ADN cần phải giải mã trình tự ... trình tự phân đoạn ADN ngắn cuối có trình tự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giải mã trình tự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giải mã đoạn trình tự ADN kích...

Ngày tải lên: 24/10/2013, 12:15

... thực chất đoạn trình tự ngắn trích từ trình tự cADN biết Các trình tự cADN ngẫu nhiên (có thể trình tự đầy đủ hay trình tự phần EST) xác định sử dụng phương pháp giải mã trình tự ngẫu nhiên đối ... lượng trình tự gấp khoảng 10 lần lượng ADN thực cần giải mã trình tự đảm bảo phần NST phân tích Quá trình tạo thư viện tái tổ hợp mang trình tự ngẫu nhiên lượng lớn ADN cần phải giải mã trình tự ... trình tự ADN giải mã trình tự ngẫu nhiên trực tiếp nhập vào phần mềm máy tính Nhiều phần mềm máy tính chuyên dụng xếp đoạn trình tự theo thứ tự dựa trình tự gối lên chúng Sự ”lắp ráp” thành trình...

Ngày tải lên: 25/03/2014, 22:20

... thực chất đoạn trình tự ngắn trích từ trình tự cADN biết Các trình tự cADN ngẫu nhiên (có thể trình tự đầy đủ hay trình tự phần EST) xác định sử dụng phương pháp giải mã trình tự ngẫu nhiên đối ... lượng trình tự gấp khoảng 10 lần lượng ADN thực cần giải mã trình tự đảm bảo phần NST phân tích Quá trình tạo thư viện tái tổ hợp mang trình tự ngẫu nhiên lượng lớn ADN cần phải giải mã trình tự ... trình tự ADN giải mã trình tự ngẫu nhiên trực tiếp nhập vào phần mềm máy tính Nhiều phần mềm máy tính chuyên dụng xếp đoạn trình tự theo thứ tự dựa trình tự gối lên chúng Sự ”lắp ráp” thành trình...

Ngày tải lên: 12/07/2014, 04:21

... đọc trình tự Tuy nhiên, với hai cặp mồi F11&R16 LM637 & LM638, cặp mồi F11&R16 không tơng đồng với trình tự NBS- LRR sau đọc trình tự đem so sánh BLAST Trình tự chúng giả thiết nh trình tự mã ... pháp điện di Giải trình tự gen máy giải trình tự gen tự động : Máy hoạt động dựa sở phơng pháp dideoxy, chùm tia laser máy đánh dấu vị trí thời gian qua nucleotit, từ cho biết kết trình tự gen Ngoài ... (Nguyễn Công Thuật cs, 1996) Nghiên cứu đa dạng ADN qua giải trình tự nucleotit 4.1 Các phơng pháp xác định trình tự nucleotit Việc giải trình tự nucleotit đợc xác định từ năm 70 nhờ đời hai...

Ngày tải lên: 22/12/2014, 22:25

... chất thừa Kết tủa ADN Ethanol/EDTA • Hòa tan kết tủa 15ml HiDiFormamide hãng sản xuất cung cấp • Sau hòa tan kết tủa tiến hành điện di gel polyacrylamid Kết thu nhờ máy đọc trình tự sử lí phần mềm ... nhân Thể tích chung cho phản ứng 20ml +, Tiến hành chạy PCR theo bước chính: • Biến tính ADN 960C làm cho ADN kép thành mạch đơn • Gắn mồi 500C Có thể dùng riêng dùng chung mồi xuôi mồi ngược • ... • ADN mẫu chứa khoảng 1010 phân tử, 1010 đoạn ADN dài khoảng 103 -104 bp • Các deoxynucleotit (dNTP) • Bốn loại dideoxynucleotit...

Ngày tải lên: 29/10/2012, 09:32

... dng húa cht phõn hy ADN cỏc v trớ base c hiu to cỏc on cú chiu di khỏc nucleotid Điện di đoạn ADN nhận biết vị trí chúng nhờ đánh dấu phóng xạ Dựa vào để đọc trình tự ADN I.Phng phỏp Maxam-Gilbert ... method III.Xỏc nh trỡnh t bng phng phỏp t ng Nguyên tắc chung giải trình tự gen tự động dựa theo sở phương pháp Sanger Nhưng : Quá trình tổng hợp AND thực nhờ kỳ thuật PCR Mỗi ddNTP đánh dấu ... Sanger 2.Cỏch tin hnh: Cắt ADN enzym cắt giới hạn, tách đoạn ADN cắt thành sợi đơn nhân dòng ( cloning ) chúng ( lượng ADN > àg ) vetơ mạch đơn: phage M13 để tạo đủ ADN làm nguyên liệu nghiên...

Ngày tải lên: 29/10/2012, 14:02

... dựng sẵn người dùng cập nhật thêm kết (thực máy giải trình tự Trugene) vào thư viện này, lấy thư viện bên đăng nhập trình tự có từ máy giải trình tự khác để search thư viện Đây bất tiện đặc biệt ... thêm HCV genotype kết có từ nguồn khác Phương pháp giải trình tự để định genotype HCV phát triển trình bày công trình nghiên cứu thực trình tự dài không 200bp sản phẩm PCR dài khoảng 240-250bp, ... tương tự Trugene InoLIPA vùng 5’-NC Chính điều đảm bảo tính xác kết định genotype HCV phát triển không khác kết định genotype kỹ thuật giải trình tự Trugene đoạn trình tự đích phương pháp đoạn trình...

Ngày tải lên: 16/11/2012, 09:22

... Kết giải trình tự Sản phẩm PCR, sau làm giải trình tự trực tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trình ... phân giải gel agarose 0.8% làm khỏi mồi thừa sau phản ứng Gene clean Kit ADN với nồng độ 10 ng/µl sử dụng để giải trình tự ADN Core, trường đại học tổng hợp Michigan (Mỹ) theo phương pháp giải trình ... Michigan (Mỹ) theo phương pháp giải trình Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125...

Ngày tải lên: 30/01/2013, 14:43

... giải trình tự Sản phẩm PCR, sau làm giải trình tự trực tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trình tự ... dụng điện di Giải trình tự gel: Sản phảm PCR gen HP1125 phân giải gel agarose 0.8% làm khỏi mồi thừa sau phản ứng Gene clean Kit ADN với nồng độ 10 ng/l sử dụng để giải trình tự ADN Core, trường ... học tổng hợp Michigan (Mỹ) theo phương pháp giải trình Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch...

Ngày tải lên: 15/03/2013, 17:19

... thực giải trình tự, sau so sánh ngân hàng gen để có kết luận cuối 34 4.4 Kết giải trình tự trực tiếp sản phẩm RT-PCR Kết giải trình tự cho ta trình tự dạng chữ (A, G, T, C) trình tự dạng peak Trình ... vào máy giải trình tự Bƣớc 4: Đọc kết Kết giải trình tự dạng peak (mỗi peak đại diện cho nucleotide) dạng ký tự (A, T, G, C) Sau có trình tự ta tiến hành kiểm tra cách so sánh trình tự giải đƣợc ... hợp với trình tự dạng peak để hoàn chỉnh đoạn gen mong muốn Dƣới kết so sánh trình tự giải đƣợc từ primer Hình 4.4 So sánh kết giải trình tự từ primer *: Trình tự tƣơng đồng -: Trình tự không...

Ngày tải lên: 20/03/2013, 11:00

Ngày tải lên: 01/04/2013, 14:04

... [33] SeqEd chương trình cung c p riêng bi t ho c v i chương trình AssemblyLIGN t ng h chương trình MacVector (Accelrys Inc) - H chương trình MacVector m t h t ng h p chương trình hãng MacVector ... chương trình tin – sinh h c ng d ng nghiên c u x lý, phân tích so sánh chu i gen thu nh n - Chương trình so sánh phân tích chu i gen GeneDoc m t chương trình Nicholas Nicholas (1997) [48] l p trình ... vector hay không b ng ph n ng c t v i enzyme gi i h n ti n hành gi i trình t [4] 1.3.4 K thu t gi i trình t Gi i trình t trình xác l p thu nh n thành ph n nucleotide c a m t phân ño n DNA c n...

Ngày tải lên: 14/12/2013, 16:10

... di ADN Buffer loading, c cung cp bi cụng ty húa cht dựng chy in di ADN 2.2 Mt s thit b, mỏy múc s dng nghiờn cu Mỏy nhõn gen PCR dựng nhõn gen Mỏy chy in di ADN dựng chy in di ADN Mỏy soi ADN ... (RNA thụng tin) Nhúm quinolone c ch tỏc dng ca enzyme ADN gyrase lm cho hai mch n ca ADN khụng th dui xon lm ngn cn quỏ trỡnh nhõn ụi ca ADN Nhúm sulfamide cú cu trỳc ging PABA (p aminobenzonic ... cú kh nng kỡm hóm quỏ trỡnh tng hp ADN ca vi khun bi s tng tỏc ca thuc vi tiu phn B ca enzim ADN gyrase (GyrB), enzim ny cú tỏc dng tham gia quỏ trỡnh ct v ni ADN vũng hỡnh thnh siờu xon (suppercoils)...

Ngày tải lên: 23/12/2013, 15:31

... mang gen novS 2.2.7 Giải trình tự gen Để giải trình tự gen ta tiến hành tách plasmid tái tổ hợp pGEMnovS tế bào vi khuẩn E.coli XL1 Blue biến nạp trên, sau gửi giải trình tự 2.2.8 Tạo vector ... trí vẽ vòng tròn vector Giới hạn trình tự pET-32a(+) gồm : promoter T7 764-780 T7 transcription start 763 Trình tự coding His•Tag 327-344 Trình tự Msc I 351 Trình tự Amp 4445-5302 Vị trí clonning ... Nghiệp K13 Viện Đại Học Mở Hà Nội 3.1.3 Kết xác định trình tự đoạn gen NovS Đoạn gen novS plasmid pGEM -3Z đuợc giải trình tự Kết giải trình tự gen novS sau: ATTGGAGCTCACCGCGGTGGCGGCCGCTCTAGAACTAGTGGATCCCCCGGGCTGCAG...

Ngày tải lên: 25/12/2013, 12:42

... đến cấu trúc phân tử protein trình giải mã nhờ mà tổng hợp protein đặc thù cho gene Còn trình dịch mã, tế bào phải “phiên dịch” trình tự bazơ phân tử mARN thành trình tự axit amin chuỗi polypeptit ... trình hoạt động gen bao gồm giai đoạn phiên mã giải mã Phiên mã trình chép thông tin di truyền mã hoá dạng trình tự nucleotide gen thành dạng trình tự ribonucleotide ARN thông tin (mARN) để mARN ... để giải toán, phương pháp có ưu điểm, nhược điểm riêng Luận văn tập trung nghiên cứu nhóm phương pháp sử dụng máy vector hỗ trợ định SVM để xác định vùng tăng cường (enhancer) từ trình tự ADN...

Ngày tải lên: 17/02/2014, 09:46