Nghiên cứu xác định marker phân tử SSR liên kết với tính trạng khoảng cách trổ cờ phun râu (ASI) của cây ngô

Đại Học Quốc Gia TP Hồ Chí Minh TRƯỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA ********************** NGÔ TRẦN VŨ NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH MARKER PHÂN TỬ SSR LIÊN KẾT VỚI TÍNH TRẠNG KHOẢNG CÁCH TRỔ CỜ VÀ PHUN RÂU (ASI) CỦA CÂY NGƠ Chun ngành: Cơng nghệ sinh học LUẬN VĂN THẠC SĨ TP HỒ CHÍ MINH, tháng 08 năm 2011 CƠNG TRÌNH ĐƯỢC HỒN THÀNH TẠI TRƯỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA ĐẠI HỌC QUỐC GIA TP HỒ CHÍ MINH Cán hướng dẫn khoa học: GS.TS Nguyễn Đức Lượng ThS Trương Quốc Ánh Cán chấm nhận xét 1: PGS.TS Nguyễn Thúy Hương Cán chấm nhận xét 2: TS Phạm S Luận văn thạc sĩ bảo vệ HỘI ĐỒNG CHẤM BẢO VỆ LUẬN VĂN THẠC SĨ Ngày 03 tháng 08 năm 2011 Thành phần Hội đồng đánh giá luận văn thạc sĩ GS.TS Nguyễn Đức Lượng PGS.TS Nguyễn Thúy Hương TS Phạm S TS Huỳnh Ngọc Anh TS Lê Thị Thủy Tiên Chủ tịch Hội đồng đánh giá LV Bộ môn quản lý chuyên ngành ĐẠI HỌC QUỐC GIA TP HCM CỘNG HOÀ XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM TRƯỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA Độc Lập - Tự Do - Hạnh Phúc -oOo TP HCM, ngày 06 tháng 08 năm 2011 NHIỆM VỤ LUẬN VĂN THẠC SĨ Họ tên học viên: NGÔ TRẦN VŨ Giới tính: NAM Ngày, tháng, năm sinh: 09/04/1985 Nơi sinh: Quảng Ngãi Chuyên ngành: Công nghệ sinh học Khoá (Năm trúng tuyển): 2009 1- TÊN ĐỀ TÀI: Nghiên cứu xác định marker phân tử SSR liên kết với tính trạng khoảng cách trổ cờ phun râu (ASI) ngô 2- NHIỆM VỤ LUẬN VĂN Nghiên cứu marker phân tử SSR liên kết với tính trạng khoảng cách trổ cờ phun râu (ASI) có liên quan tới suất hạt điều kiện khô hạn, nhằm cải thiện suất 3- NGÀY GIAO NHIỆM VỤ: tháng năm 2011 4- NGÀY HOÀN THÀNH NHIỆM VỤ: tháng 07 năm 2011 5- HỌ VÀ TÊN CÁN BỘ HƯỚNG DẪN: - GS.TS Nguyễn Đức Lượng - ThS Trương Quốc Ánh Nội dung đề cương Luận văn thạc sĩ Hội đồng chuyên ngành thông qua CÁN BỘ HƯỚNG DẪN CHỦ NHIỆM BỘ MÔN QUẢN LÝ CHUYÊN NGÀNH GS.TS Nguyễn Đức Lượng KHOA QL CHUYÊN NGÀNH LỜI CẢM ƠN Thành kính ghi nhớ cơng ơn ba mẹ người thân gia đình ln chỗ dựa vững cho con, động viên, khuyến khích tạo điều kiện cho học tập tốt Xin chân thành cảm ơn: Ban Giám Hiệu trường Đại học Bách Khoa TP Hồ Chí Minh tạo điều kiện cho suốt thời gian học tập trường Quý Thầy, Cô Bộ môn Công nghệ sinh học quý thầy cô trực tiếp giảng dạy tơi suốt khóa học GS.TS Nguyễn Đức Lượng, ThS Trương Quốc Ánh tận tình hướng dẫn động viên thời gian thực luận văn tốt nghiệp Anh Lý Hậu Giang Anh, Chị thuộc Viện Khoa Học Kỹ Thuật Nông Nghiệp Miền Nam quan tâm giúp đỡ suốt thời gian thực đề tài Toàn thể bạn lớp Cao học khóa 09 hỗ trợ, giúp đỡ động viên suốt hai năm qua TP Hồ Chí Minh, ngày 06 Tháng 08 năm 2011 NGÔ TRẦN VŨ i NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH MARKER PHÂN TỬ SSR LIÊN KẾT VỚI TÍNH TRẠNG KHOẢNG CÁCH TRỔ CỜ PHUN RÂU (ASI) CỦA CÂY NGƠ TĨM TẮT Hạn hán yếu tố hạn chế sản xuất ngơ bền vững tồn giới Tính trạng suất thường không ổn định tác động yếu tố mơi trường mức độ di truyền tính trạng thấp Trong lựa chọn tính trạng thứ cấp có liên quan đến suất có mức độ di truyền cao làm tăng ảnh hưởng chọn giống để cải thiện suất Nhiều nghiên cứu cho tính trạng khoảng cách trổ cờ phun râu (ASI) xem tính trạng thứ cấp giúp cho cải thiện suất Trong nghiên cứu này, xây dựng quần thể phân ly F2 với 192 dòng lai bắt nguồn từ bố mẹ B10 B20 Khảo sát 42 marker SSR nhiễm sắc thể số có 11 marker đa hình Chọn marker SSR phân tích quần thể F2 cho thấy tỷ lệ tương đối phân ly theo định luật Mendel Xác định marker bnlg1811 liên kết với tính trạng khoảng cách trổ cờ phun râu với giá trị ảnh hưởng kiểu hình 6.1%, kích thước marker 200bp Marker bnlg1811 dùng cho chiến lược chọn giống cải thiện suất điều kiện khô hạn ii RESEARCH FOR IDENTIFICATION OF MOLECULAR MARKER SSR LINKED TO ANTHESIS SILKING INTERVAL (ASI) TRAIT OF MAIZE ABSTRACT Drought is one of the major limited factors in sustainable maize production all over the world Selection for grain yield under drought condition has often been considered inefficient because of the low heritability especially as yield decrease while selection for secondary traits correlated to grain yield and having relatively high heritabilities, may increase selection efficiency Many studies suggest that anthesis silking interval have been considered as precise secondary traits In this study, population was built with 192 individual F2 derived from parent of B10 and B20 Resutls of survey 42 SSR marker on chromosome with 11 polymorphic markers SSR marker analysis showed that polulation of F2 segregation ratio for the Mendelian Identified a marker bnlg1811 linked to anthesis silking interval trait, explaining about 6.1% of the phenotypic variance, size marker is 200 bp This marker may be useful for maize molecular marker-assisted breeding for drought tolerance iii MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN TÓM TẮT i ABSTRACT ii MỤC LỤC iii DANH MỤC CÁC BẢNG .vi DANH MỤC CÁC HÌNH vii DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT ix Chương I MỞ ĐẦU 1.1 Đặt vấn đề 1.2 Mục tiêu 1.3 Nội dung Chương II TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1 Tổng quan ngô 2.1.1 Phân loại thực vật ngô 2.1.2 Hình thái ngơ 2.1.2.1 Rễ ngô 2.1.2.2 Thân ngô 2.1.2.3 Lá ngô 2.1.2.4 Bông cờ bắp ngô 2.1.2.5 Hạt ngô .10 2.1.3 Các gia đoạn sinh trưởng phát triển ngô 10 2.1.3.1 Các giai đoạn sinh trưởng phát triển 11 2.1.3.2 Các giai đoạn sinh thực phát triển hạt 14 2.2 Vai trò ngô 15 2.2.1 Ngô làm lương thực cho người 15 2.2.2 Ngô làm thức ăn chăn nuôi 16 2.2.3 Ngô làm thực phẩm .17 2.2.4 Ngô cung cấp nguyên liệu công nghiệp 17 2.2.5 Ngô nguồn hàng hóa xuất .18 2.3 Tình hình sản xuất ngơ giới .18 2.4 Tình hình sản xuất ngơ việt nam 21 2.5 Cơ sở di truyền chịu hạn ngô 23 2.6 Giới thiệu QTL 25 2.6.1 Marker di truyền 26 2.6.2 Xây dựng đồ liên kết 29 2.6.2.1 Xây dựng đồ quần thể 30 2.6.2.2 Xác định đa hình 31 2.6.2.3 Phân tích liên kết marker 32 2.6.2.4 Khoảng cách di truyền chức đồ 34 2.6.3 Phân tích QTL .34 2.6.3.1 Nguồn gốc phân tích QTL 34 2.6.3.2 Single marker analyses 35 iv 2.6.3.3 Single interval mapping 37 2.7 Các kỹ thuật tách chiết DNA 37 2.7.1 Các thông tin di truyền 37 2.7.2 Phương pháp tách chiết DNA 38 2.7.3 Đánh giá chất lượng DNA 39 2.7.3.1 Định lượng DNA quang phổ kế 39 2.7.3.2 Định tính DNA phương pháp điện di 40 2.8 PCR 40 2.8.1 Nguyên tắc 40 2.9 Một số thị phân tử nghiên cứu đa dạng di truyền .43 2.9.1 Chỉ thị RFLP .43 2.9.2 Chỉ thị RAPD 44 2.9.3 Chỉ thị AFLP .46 2.9.4 Giới thiệu microsatellite 48 2.9.4.1 Khái niệm microsatellite 48 2.9.4.2 Các loại microsatellite 48 2.9.4.3 Vai trò microsatellite 49 2.9.4.4 Nguyên tắc phát microsatellite primer PCR 51 2.9.4.5 Ưu, khuyết điểm phương pháp microsatellite 54 2.9.4.6 Ứng dụng microsatellite 55 2.10 Các nghiên cứu nước nước 55 2.10.1 Các nghiên cứu nước .55 2.10.2 Các nghiên cứu nước .58 Chương III VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP 62 3.1 Thời gian địa điểm .62 3.2 Đối tượng nghiên cứu .62 3.3 Xây dựng quần thể F2 .62 3.4 Đánh giá kiểu hình 62 3.5 Ly trích DNA 63 3.6 Thực phản ứng PCR .65 3.6.1 Điều tra bố mẹ .65 3.6.2 PCR cho quần thể F2 65 3.7 Mã hóa liệu marker SSR quần thể F2 66 3.8 Phân tích phần mềm Mapmaker/QTL 3.0 .67 3.9 Phân tích phần mềm Cartographer 1.17 67 3.10 Dụng cụ 67 Chương IV KẾT QUẢ VÀ BIỆN LUẬN 68 4.1.Đánh giá kiểu hình 68 4.2 Ly trích DNA 70 4.3 Kết điều tra bố mẹ 704 4.4 Kết PCR F2 mã hóa liệu 766 4.5 Phân tích phần mềm sinh học 777 Chương V KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 80 v 5.1 Kết luận 80 5.2 Kiến nghị 80 TÀI LIỆU THAM KHẢO .82 PHỤ LỤC 84 vi DANH MỤC BẢNG Bảng 2.1 Các giai đoạn phát triển ngô 10 Bảng 2.2 Thành phần hóa học gần hạt ngô (%) .16 Bảng 2.3 Thành phần hóa học (%) ngơ xanh thân, ủ chua 16 Bảng 2.4 Giá trị dinh dưỡng ngơ phân tích từ 100 g hạt 17 Bảng 2.5 Dự báo nhu câu ngô giới đến năm 2020 .18 Bảng 2.6 Tình hình sản xuất giới 1985 – 2005 19 Bảng 2.7 Diện tích, suất sản lượng ngơ, lúa mì lúa nước giới 1961-2007 20 Bảng 2.8 Sản xuất ngô Việt Nam giai đoạn 1961 – 2007 22 Bảng 3.1 Chu trình nhiệt cho PCR 65 Bảng 3.2 Trình tự marker cho PCR quần thể F2 .66 Bảng 4.1 Thống kê khác biệt chế độ WW WS ASI (*) khác biệt có ý nghĩa 68 Bảng 4.2 Thống kê khác biệt chế độ WW WS KNE (*) khác biệt có ý nghĩa 69 Bảng 4.3 Thống kê khác biệt chế độ WW WS GY (*) khác biệt có ý nghĩa 69 Bảng 4.4 Thống kê cho tính trạng 69 Bảng 4.5 Ảnh hưởng tương tác tính trạng 70 Bảng 4.6 Bảng OD mẫu nghiền theo qui trình cải tiến 72 Bảng 4.6 Thống kê phân tích QTL 77 107 37 12 2842 237 1568 196 1785 223 219 38 13 3159 243 1502 188 1565 224 218 39 11 2408 219 1582 198 10 2412 241 219 40 11 2352 214 10 2467 247 2416 268 243 41 11 2592 236 10 2546 255 10 2614 261 251 42 2055 257 10 2541 254 2019 252 254 43 2165 241 10 2645 265 2321 258 254 44 1594 177 12 2469 206 1653 184 189 45 12 2354 196 1717 191 1811 201 196 46 1602 200 10 2758 276 10 3145 315 264 47 10 1986 199 11 2314 210 2011 223 211 48 11 1865 170 12 1953 163 10 1897 190 174 49 11 2604 237 11 2849 259 10 2620 262 253 50 11 2658 242 12 2987 249 10 2621 262 251 51 13 2658 204 12 2512 209 12 2413 201 205 52 11 2382 217 10 2269 227 11 2411 219 221 53 12 2801 233 12 3025 252 11 2698 245 244 54 1574 225 11 2654 241 1723 215 227 55 12 2410 201 1857 206 10 2130 213 207 56 11 3096 281 11 3038 276 10 2795 280 279 57 2560 284 1583 226 2489 277 262 58 2318 290 1511 216 2452 307 271 59 12 2686 224 2349 261 12 2712 226 237 60 2030 254 12 3018 252 2212 246 250 61 1944 216 12 2450 204 10 2056 206 209 62 11 2357 214 12 2656 221 10 2254 225 220 63 2055 257 11 2502 227 2214 246 243 64 1270 181 12 3052 254 1566 196 211 65 11 2687 244 13 3215 247 10 2412 241 244 66 10 2117 212 13 2788 214 10 2152 215 214 67 1350 169 1808 226 1624 180 192 68 13 3369 259 2049 256 12 3110 259 258 69 1929 214 12 2982 249 2011 223 229 70 2040 227 1759 251 2110 234 237 71 11 2482 226 11 2958 269 10 2356 236 243 72 10 1698 170 12 2241 187 10 1812 181 179 73 10 2400 240 1710 190 1811 201 210 74 11 2457 223 10 2288 229 10 2214 221 225 75 11 2596 236 10 2142 214 10 2268 227 226 108 76 13 3207 247 1522 190 12 3021 252 230 77 11 2547 232 11 2653 241 10 2412 241 238 78 13 2982 229 2214 246 2220 247 241 79 13 3245 250 12 3213 268 12 3110 259 259 80 12 2613 218 11 2654 241 11 2441 222 227 81 13 2846 219 12 2528 211 12 2662 222 217 82 11 3254 296 10 2621 262 10 3010 301 286 83 2214 246 11 3056 278 10 2515 252 258 84 1421 203 13 2841 219 1415 177 199 85 1626 232 1809 226 2001 222 227 86 11 2255 205 12 3214 268 10 2546 255 242 87 13 2762 212 1385 173 12 2469 206 197 88 12 3013 251 1354 193 1612 202 215 89 11 2211 201 12 2696 225 10 2223 222 216 90 10 2146 215 13 3469 267 2118 235 239 91 10 2076 208 1958 218 1894 210 212 92 10 2247 225 10 2658 266 10 2311 231 241 93 11 2496 227 10 2516 252 10 2297 230 236 94 1623 203 12 3214 268 1912 212 228 95 10 2135 214 13 2789 215 1920 213 214 96 1480 211 12 3150 263 10 2541 254 243 97 2348 261 2009 287 10 2784 278 275 98 1789 199 10 2877 288 1987 221 236 99 2322 258 1789 199 10 2556 256 237 100 10 2526 253 10 2411 241 11 2714 247 247 101 2302 256 10 2641 264 10 2610 261 260 102 10 2240 224 13 3064 236 2036 226 229 103 10 2033 203 11 2566 233 2011 223 220 104 11 2864 260 10 2405 241 11 2745 250 250 105 1667 208 12 3254 271 1985 221 233 106 10 2273 227 10 2331 233 10 2279 228 229 107 10 1983 198 10 2785 279 2141 238 238 108 1576 225 1768 196 1814 202 208 109 10 2075 208 10 2424 242 2011 223 224 110 10 2030 203 1713 190 10 2088 209 201 111 1690 211 12 2433 203 1942 216 210 112 13 2851 219 2240 249 2047 227 232 113 11 3571 325 1655 236 11 3456 314 292 114 10 2470 247 10 2348 235 11 2621 238 240 109 115 2085 261 1776 222 2211 246 243 116 11 2751 250 11 2691 245 11 2781 253 249 117 10 2240 224 1899 237 10 2289 229 230 118 12 3185 265 11 2856 260 12 3199 267 264 119 13 4012 309 12 3541 295 12 3799 317 307 120 10 2124 212 12 2965 247 10 2245 225 228 121 11 2389 217 1978 220 11 2410 219 219 122 12 2568 214 1975 247 12 2668 222 228 123 10 2905 291 10 2127 213 10 2841 284 262 124 13 2751 212 10 2476 248 12 2611 218 226 125 1753 250 11 3251 296 2311 257 268 126 11 2546 231 13 3546 273 10 2654 265 257 127 11 2256 205 2111 235 11 2331 212 217 128 1742 218 12 2887 241 1987 221 226 129 11 2854 259 10 2324 232 11 2779 253 248 130 11 2379 216 2203 245 10 2253 225 229 131 1351 169 12 2186 182 1611 179 177 132 13 3325 256 1664 208 12 3125 260 241 133 12 2357 196 1725 192 12 2388 199 196 134 10 2343 234 2340 260 10 2448 245 246 135 2210 246 13 2681 206 10 2514 251 234 136 12 2646 221 10 2300 230 12 2669 222 224 137 12 2706 226 11 2760 251 11 2655 241 239 138 2150 239 10 2585 259 2211 246 248 139 10 2257 226 12 3112 259 10 2551 255 247 140 12 2471 206 12 2884 240 12 2599 217 221 141 11 2046 186 1325 189 11 2087 190 188 142 12 3125 260 12 3136 261 12 3155 263 262 143 13 3452 266 1752 219 11 2810 255 247 144 12 2419 202 2025 225 10 2115 212 213 145 1162 166 12 3034 253 10 2245 225 214 146 10 2710 271 1119 160 2410 268 233 147 13 2789 215 12 2656 221 12 2510 209 215 148 1962 280 11 2604 237 2510 279 265 149 12 2980 248 13 3799 292 12 3011 251 264 150 10 2231 223 2348 261 10 2512 251 245 151 12 2968 247 2177 242 12 2988 249 246 152 12 2846 237 2222 247 11 2689 244 243 153 11 2861 260 12 3542 295 10 2745 275 277 110 154 12 2785 232 2057 257 2297 255 248 155 12 2564 214 11 2489 226 2014 224 221 156 11 2875 261 11 3025 275 10 2669 267 268 157 13 2789 215 11 2658 242 12 2599 217 224 158 10 1981 198 1715 214 1889 210 207 159 2221 247 10 2436 244 2217 246 246 160 10 2508 251 1831 262 10 2544 254 256 161 11 2472 225 12 2789 232 11 2499 227 228 162 1813 227 12 2785 232 2011 223 227 163 1785 223 10 2572 257 2017 224 235 164 1688 241 1906 238 1944 243 241 165 10 1934 193 11 2647 241 10 2211 221 218 166 11 2754 250 10 2470 247 11 2771 252 250 167 12 3013 251 13 3687 284 11 3014 274 270 168 11 3278 298 13 3049 235 10 2579 258 263 169 11 3528 321 11 2926 266 12 3651 304 297 170 12 2853 238 11 3102 282 2515 279 266 171 1887 270 10 1929 193 1875 234 232 172 12 3298 275 11 2658 242 10 2588 259 258 173 2337 260 11 2970 270 2346 261 263 174 11 2894 263 12 3124 260 10 2620 262 262 175 2754 306 10 2232 223 2664 296 275 176 12 3125 260 2282 254 12 3112 259 258 177 13 3025 233 12 3202 267 12 2988 249 250 178 13 3874 298 11 2851 259 10 2661 266 274 179 12 3189 266 2002 250 2289 254 257 180 12 3259 272 2412 268 11 2998 273 271 181 12 2852 238 13 3029 233 12 2881 240 237 182 13 3489 268 1861 233 2187 243 248 183 1470 210 11 2442 222 2009 223 218 184 12 3184 265 11 3021 275 12 3188 266 269 185 11 2756 251 1727 216 1982 220 229 186 11 3261 296 1652 236 11 3115 283 272 187 11 2137 194 10 2220 222 10 2118 212 209 188 12 2895 241 12 3168 264 11 2667 242 249 189 11 2752 250 11 2499 227 2213 246 241 190 13 3215 247 1764 221 2088 232 233 191 12 2865 239 12 3021 252 12 2899 242 244 192 12 3356 280 12 2874 240 10 2556 256 258 111 193 12 2354 196 1810 201 10 2011 201 199 194 12 2698 225 10 2501 250 10 2369 237 237 195 12 3884 324 12 3676 306 10 3014 301 310 196 11 2173 198 1625 232 2017 224 218 240 236 trung bình 230 237 Phụ lục 4.3.A Phụ lục 4.3.B Năng suất hạt (GY/P) 196 dòng F2- tưới đủ Năng suất hạt (GY/P-gr) 196 dòng F2-Tạo hạn No RI RII RIII TB No RI RII RIII TB 940 720 760 806,67 385 560 420 455,00 600 1040 810 816,67 555 780 650 661,67 990 960 980 976,67 495 750 610 618,33 990 1010 970 990,00 790 820 785 798,33 620 1080 820 840,00 640 535 580 585,00 470 620 510 533,33 510 495 480 495,00 610 930 710 750,00 590 650 615 618,33 720 770 690 726,67 445 640 550 545,00 900 710 830 813,33 460 415 390 421,67 10 570 550 510 543,33 10 390 420 385 398,33 11 710 1030 850 863,33 11 360 455 460 425,00 12 590 850 680 706,67 12 480 680 560 573,33 13 510 800 620 643,33 13 450 520 515 495,00 14 680 770 730 726,67 14 415 550 450 471,67 15 600 540 580 573,33 15 440 420 425 428,33 16 840 1040 860 913,33 16 500 540 510 516,67 17 530 760 610 633,33 17 570 615 570 585,00 18 660 660 680 666,67 18 630 470 540 546,67 19 820 620 710 716,67 19 720 600 640 653,33 20 670 640 660 656,67 20 425 395 420 413,33 21 680 510 650 613,33 21 450 520 480 483,33 22 800 750 740 763,33 22 625 530 570 575,00 23 530 680 590 600,00 23 515 580 535 543,33 24 890 1040 910 946,67 24 420 560 450 476,67 25 760 910 790 820,00 25 450 660 490 533,33 26 620 910 830 786,67 26 480 700 620 600,00 27 780 570 670 673,33 27 580 495 540 538,33 28 450 650 520 540,00 28 415 440 420 425,00 29 910 790 720 806,67 29 780 700 715 731,67 30 780 920 820 840,00 30 490 660 520 556,67 31 850 630 710 730,00 31 560 550 560 556,67 112 32 660 720 690 690,00 32 570 600 560 576,67 33 620 910 750 760,00 33 455 600 525 526,67 34 630 870 740 746,67 34 480 640 510 543,33 35 640 820 690 716,67 35 510 620 540 556,67 36 920 670 710 766,67 36 670 600 620 630,00 37 720 670 690 693,33 37 640 430 530 533,33 38 840 670 710 740,00 38 710 540 615 621,67 39 830 730 750 770,00 39 560 515 530 535,00 40 920 690 720 776,67 40 550 620 610 593,33 41 970 730 810 836,67 41 630 770 640 680,00 42 1010 750 800 853,33 42 540 650 590 593,33 43 710 880 720 770,00 43 550 660 560 590,00 44 570 670 620 620,00 44 430 410 390 410,00 45 580 560 550 563,33 45 560 425 450 478,33 46 960 750 820 843,33 46 530 700 620 616,67 47 790 930 810 843,33 47 460 570 495 508,33 48 460 480 480 473,33 48 415 430 420 421,67 49 700 880 750 776,67 49 620 630 620 623,33 50 780 580 650 670,00 50 620 510 580 570,00 51 830 650 730 736,67 51 650 540 560 583,33 52 890 720 750 786,67 52 600 570 590 586,67 53 530 560 550 546,67 53 450 500 470 473,33 54 1040 930 960 976,67 54 515 650 530 565,00 55 740 790 750 760,00 55 560 430 440 476,67 56 830 890 840 853,33 56 760 720 710 730,00 57 810 870 780 820,00 57 620 540 590 583,33 58 890 880 900 890,00 58 580 435 520 511,67 59 590 750 610 650,00 59 520 570 550 546,67 60 990 680 740 803,33 60 540 680 590 603,33 61 700 710 690 700,00 61 480 420 440 446,67 62 720 800 740 753,33 62 560 690 610 620,00 63 700 590 640 643,33 63 515 540 520 525,00 64 990 830 840 886,67 64 550 740 615 635,00 65 590 500 560 550,00 65 460 460 480 466,67 66 670 780 730 726,67 66 550 690 610 616,67 67 790 910 830 843,33 67 420 490 450 453,33 68 770 740 710 740,00 68 680 565 590 611,67 69 690 910 820 806,67 69 530 730 620 626,67 70 670 590 620 626,67 70 520 450 480 483,33 113 71 810 950 850 870,00 71 630 740 650 673,33 72 650 810 720 726,67 72 470 480 460 470,00 73 750 940 840 843,33 73 630 450 480 520,00 74 680 920 790 796,67 74 650 550 610 603,33 75 670 860 750 760,00 75 660 525 570 585,00 76 620 550 580 583,33 76 480 460 470 470,00 77 940 660 780 793,33 77 640 670 650 653,33 78 980 700 810 830,00 78 710 570 620 633,33 79 970 960 970 966,67 79 790 750 750 763,33 80 880 780 810 823,33 80 710 730 715 718,33 81 850 870 840 853,33 81 780 640 660 693,33 82 690 680 730 700,00 82 590 520 530 546,67 83 750 890 810 816,67 83 630 710 650 663,33 84 880 730 760 790,00 84 435 650 450 511,67 85 770 600 650 673,33 85 450 470 450 456,67 86 850 1100 890 946,67 86 650 790 670 703,33 87 880 660 780 773,33 87 620 610 620 616,67 88 840 1100 860 933,33 88 670 720 680 690,00 89 630 810 780 740,00 89 540 520 550 536,67 90 660 860 760 760,00 90 560 680 570 603,33 91 820 660 690 723,33 91 585 690 625 633,33 92 710 890 750 783,33 92 680 670 660 670,00 93 950 790 820 853,33 93 600 545 560 568,33 94 550 660 580 596,67 94 425 510 460 465,00 95 660 810 690 720,00 95 580 640 610 610,00 96 850 920 870 880,00 96 590 570 580 580,00 97 1020 970 940 976,67 97 570 490 510 523,33 98 620 750 640 670,00 98 440 640 560 546,67 99 820 630 710 720,00 99 600 490 520 536,67 100 820 910 850 860,00 100 630 620 610 620,00 101 840 920 860 873,33 101 570 620 580 590,00 102 770 660 690 706,67 102 570 650 590 603,33 103 650 600 640 630,00 103 495 610 530 545,00 104 620 750 730 700,00 104 610 620 600 610,00 105 710 760 720 730,00 105 420 680 510 536,67 106 780 890 810 826,67 106 530 570 550 550,00 107 890 760 820 823,33 107 510 640 615 588,33 108 750 900 790 813,33 108 400 540 420 453,33 109 580 640 610 610,00 109 515 520 520 518,33 114 110 880 680 720 760,00 110 520 525 500 515,00 111 510 620 550 560,00 111 490 520 510 506,67 112 1030 1010 980 1006,67 112 790 680 690 720,00 113 940 780 810 843,33 113 750 680 710 713,33 114 860 880 860 866,67 114 610 630 615 618,33 115 750 760 770 760,00 115 520 470 490 493,33 116 900 710 780 796,67 116 710 695 680 695,00 117 780 860 830 823,33 117 500 460 480 480,00 118 670 650 670 663,33 118 470 650 560 560,00 119 1190 1220 1100 1170,00 119 820 790 810 806,67 120 550 660 570 593,33 120 465 470 490 475,00 121 790 580 670 680,00 121 510 520 520 516,67 122 690 850 720 753,33 122 580 500 540 540,00 123 960 1050 980 996,67 123 640 540 590 590,00 124 950 970 930 950,00 124 710 650 670 676,67 125 600 510 550 553,33 125 470 460 480 470,00 126 800 620 710 710,00 126 680 590 630 633,33 127 540 680 560 593,33 127 490 480 510 493,33 128 720 890 730 780,00 128 475 670 575 573,33 129 830 750 760 780,00 129 660 610 630 633,33 130 770 570 690 676,67 130 610 540 580 576,67 131 460 550 470 493,33 131 350 470 360 393,33 132 870 830 860 853,33 132 740 710 720 723,33 133 450 560 460 490,00 133 410 450 420 426,67 134 880 850 870 866,67 134 630 600 610 613,33 135 720 670 690 693,33 135 520 610 540 556,67 136 610 600 610 606,67 136 540 510 550 533,33 137 780 570 770 706,67 137 640 680 630 650,00 138 810 930 850 863,33 138 590 640 610 613,33 139 800 650 680 710,00 139 570 620 600 596,67 140 850 810 840 833,33 140 545 700 580 608,33 141 430 410 420 420,00 141 380 360 360 366,67 142 650 790 670 703,33 142 580 510 550 546,67 143 850 1010 910 923,33 143 840 625 710 725,00 144 530 530 510 523,33 144 480 510 490 493,33 145 760 890 780 810,00 145 560 610 580 583,33 146 970 890 960 940,00 146 680 600 630 636,67 147 860 740 850 816,67 147 750 670 690 703,33 148 570 480 550 533,33 148 450 460 455 455,00 115 149 850 780 840 823,33 149 690 680 690 686,67 150 940 830 930 900,00 150 670 595 630 631,67 151 550 570 540 553,33 151 470 460 430 453,33 152 720 780 740 746,67 152 620 550 580 583,33 153 700 920 760 793,33 153 680 670 650 666,67 154 790 980 810 860,00 154 690 630 650 656,67 155 670 880 690 746,67 155 455 660 570 561,67 156 690 840 720 750,00 156 600 610 610 606,67 157 830 920 820 856,67 157 730 740 735 735,00 158 980 930 950 953,33 158 560 540 550 550,00 159 720 810 740 756,67 159 610 580 600 596,67 160 980 970 960 970,00 160 660 720 680 686,67 161 600 610 590 600,00 161 550 520 530 533,33 162 920 840 910 890,00 162 540 550 540 543,33 163 620 740 650 670,00 163 430 560 490 493,33 164 760 720 750 743,33 164 460 490 470 473,33 165 420 580 440 480,00 165 380 445 460 428,33 166 710 730 690 710,00 166 650 580 610 613,33 167 740 920 730 796,67 167 680 720 715 705,00 168 1080 910 1020 1003,33 168 820 740 730 763,33 169 990 870 880 913,33 169 840 770 780 796,67 170 820 1000 840 886,67 170 635 620 640 631,67 171 910 720 740 790,00 171 610 480 540 543,33 172 750 700 760 736,67 172 650 680 660 663,33 173 680 890 720 763,33 173 580 750 630 653,33 174 590 750 610 650,00 174 530 540 535 535,00 175 850 690 840 793,33 175 680 615 650 648,33 176 770 700 760 743,33 176 670 550 610 610,00 177 660 720 680 686,67 177 610 580 590 593,33 178 750 640 730 706,67 178 670 670 690 676,67 179 840 690 820 783,33 179 690 520 580 596,67 180 760 590 710 686,67 180 610 600 610 606,67 181 710 910 750 790,00 181 665 740 715 706,67 182 1100 1070 1020 1063,33 182 950 810 820 860,00 183 730 850 750 776,67 183 550 690 610 616,67 184 810 920 820 850,00 184 740 740 750 743,33 185 750 590 610 650,00 185 610 560 580 583,33 186 1200 860 870 976,67 186 730 710 715 718,33 187 590 710 620 640,00 187 510 550 550 536,67 116 188 870 920 860 883,33 188 750 790 760 766,67 189 1150 1040 1100 1096,67 189 660 670 650 660,00 190 800 890 810 833,33 190 750 680 690 706,67 191 620 560 610 596,67 191 570 560 560 563,33 192 740 640 720 700,00 192 655 710 665 676,67 193 840 630 820 763,33 193 700 540 580 606,67 194 680 820 690 730,00 194 640 630 640 636,67 195 910 960 920 930,00 195 740 810 760 770,00 196 610 670 620 633,33 196 520 425 450 465,00 Trung bình 761,63 776,12 746,89 761,55 Trung bình 578,44 592,24 574,06 581,58 A H H B H H A B H A B B H H A A B H H B H B H A B A B B A H B B H B B A A B H H B H A B A H H A B B H A H A A B B H A H H A A A A H A H H H A A H B A A A B H H H A B B B A A A A H B B A A H H H A H B H H B A B H A H H H H H H H H H H A H H H H H B B B B H H H A A A H H H H B B B H H H H H A H B H H H A H H B H A H B B H A A H A H B B H H H H A A H A H B H H H A B A B H A H H A A B H H H H H A B H A B B H H A A B H H H H H H A B A A B A H B B H B B Phụ lục 4.2 -TranslationTable AA B Aa H aa A A- 12 D a- 10 C -1 -start markers umc1144 B bnlg1429 117 A A H H H B B A H H H H A B B H A H A B B B H A H H A B A B H A H H H A A H B A A A B H H H A B B B A B A B H B B A A H H H A H B H H B A H B A H H H H A H H H H H A H H H - H H H B B H H H B A H H H H H H H B H H H H H A H B H H H A H H B H A H B B H A A H A H B B H H H H A A H A H B H H H A H A B H A H H H H B H H A H H A B H A B B H H A A B H H B H B H A B A B A A H A B H B B A A B H H B H A H A H H A B H H A H A A B B H A H H A B A A H A H H H A A H A A A A A H H H A B B B A B A B H B B A A H B H A H B H H B A B H A H H H H A H H H H H A H H H H H H H B B H H H B A A H H H H B B B H H H H H A H B H H H A H H B H A H H B H H A H A H B B H H H H A A H A H B H H H A H A B H A A A H H B H H A H H A B B A B B H H B A B H H B H B H A B A B A H H A B B B B A A H H H B H A H A H H A B H H A H A A B B H - H H A B A A H A H H H A A H A A A A A A H H A A B B B B A B H B B B B H B bnlg1811 B umc2228 118 B H A H B H H B A B H A H H H H A H H H H H A H H H H H H H B B H H H B A A H H H H B B B H H H H H A A A A H H A H H B B B H H B H H A H B H B B H H H H A A B A H H H H B H B A B H A H H H H B H H H H H A B B A B B H H A A B H H B H H H A B A A B A H B B H B B A A H H H B B A H H H H A B B H A H A B B B H A A A A B A B H A H H H A A H B A A A B H H H A B B B A B A B H B B A A H H H A H B H H B A H B A H H H H A A A A A A A H H H - H H H B B H H H B A H H H H H H H B H H H H H A H B H H H A H H B H A H B B H A A H A H B B H H H H A A H A H B H H H A H A B H A H H H H B H H B H H A B B A B B H H A A B H H B H B H A A A B B A H B B H B B A A B H H B H A B A H H A B B H A H A A B B H A H H A A A A H A H H H A A H B A A A B H H H A B B B A A A A H B B A A H H H A H B H H B A B H A H H H H H H H H H H A H H H H H B B B B H H H A A A H H H H B B B H H H H H A H B H H H A H H B B umc2390 H umc1166 119 H A H B B H A A H A H B B H H H H A A H A H B H H H A B A B H A H H A A A H H A H H A B H A A B H H A A B H H B H B H A A A B A A H A B H B B A A B H H B H A H A H H A B H H A H A A B B H A H H A B A A H A H H H A A H A A A A A H H H A B B B A B A B H B B A A H B H A H B H H B A B H A H H H H A H H H H H A H H H H H H H B B H H H B A A H H H B B B B H H H H H A H B H H H A A A B H A H H B H H A H A H B B H H H H A A H A H B H H H A H A B H A H H H H A B H A H H A B H A H B H H A A B B H B H B H A A A B A A H A B H A B A A B H H B H A H A H H A B H H A H A A B B H A H H A B A A H A H H H A A H A A A A A H H H A B B B A B A B H B B A A H B H A H B H H B A B H A H H H H A H H H H H A H H H H H H H B B H H H B A A B H H B B B B A H H H H A H B H H H A B H B H A H H B H H A H A H B B H H H H A A H A H B H H H A H A B H A H H H H H umc1917 H umc1742 B 120 umc1976 B H H A - H A B H A H B H H A A B B H B H B H A A A B A A H A B H A B A A B H H B H A H A H H A B H H A H A A B B H A H H A B A A H A H H A A H H H B H A H A H H A B H H A H A A B B H - H H A B A A H A H H H A A H A A A A A H H H A B B B A H H H H H H H H H H A H H B H H B B B B H H H A A A H H H H B B B H H H H H A H H B H A H B B H A A H A H B B H H H H A A H A H B H H H B H B A -stop markers 121 LÝ LỊCH TRÍCH NGANG ********************** THƠNG TIN CÁ NHÂN Họ tên: Ngô Trần Vũ Ngày, tháng, năm sinh: 09/04/1985 Nơi sinh: Quảng Ngãi Điện thoại: 0908290446 Địa liên lạc: Nghĩa Phương – Tư Nghĩa – Quảng Ngãi QUÁ TRÌNH ĐÀO TẠO 2003 – 2007: Sinh viên trường Đại học Nông Lâm – Tp Hồ Chí Minh Chun ngành: Cơng nghệ sinh học Hệ đào tạo: Chính quy 2009 – 2011: Học viên cao học, trường Đại học Bách Khoa – ĐHQG Tp HCM Chuyên ngành: Công nghệ sinh học Mã số học viên: 09310594 ... SSR liên kết với tính trạng khoảng cách trổ cờ phun râu (ASI) ngô 2- NHIỆM VỤ LUẬN VĂN Nghiên cứu marker phân tử SSR liên kết với tính trạng khoảng cách trổ cờ phun râu (ASI) có liên quan tới suất... NGÔ TRẦN VŨ i NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH MARKER PHÂN TỬ SSR LIÊN KẾT VỚI TÍNH TRẠNG KHOẢNG CÁCH TRỔ CỜ PHUN RÂU (ASI) CỦA CÂY NGƠ TĨM TẮT Hạn hán yếu tố hạn chế sản xuất ngơ bền vững tồn giới Tính trạng. .. cho chọn suất điều kiện khô hạn Với yêu cầu thực tiễn trên, đề tài “ Nghiên cứu xác định marker phân tử SSR liên kết với tính trạng khoảng cách trổ cờ phun râu (ASI) ngơ” cần thiết có ý nghĩa