Phân tích di truyền tính chịu hạn của quần thể lúa f2 của tổ hộp lai khẩu noong mó x q5

BỘ GIÁO DỤC VÀ ðÀO TẠO TRƯỜNG ðẠI HỌC NÔNG NGHIỆP HÀ NỘI  CHU ðỨC HÀ PHÂN TÍCH DI TRUYỀN TÍNH CHỊU HẠN CỦA QUẦN THỂ LÚA F2 CỦA TỔ HỢP LAI KHẨU NOONG MĨ × Q5 LUẬN VĂN THẠC SĨ HÀ NỘI - 2013 BỘ GIÁO DỤC VÀ ðÀO TẠO TRƯỜNG ðẠI HỌC NÔNG NGHIỆP HÀ NỘI  CHU ðỨC HÀ PHÂN TÍCH DI TRUYỀN TÍNH CHỊU HẠN CỦA QUẦN THỂ LÚA F2 CỦA TỔ HỢP LAI KHẨU NOONG MĨ × Q5 CHUYÊN NGÀNH : CÔNG NGHỆ SINH HỌC Mà SỐ : 60.42.02.01 NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC TS NGUYỄN THỊ THANH THỦY TS NGUYỄN VĂN GIANG HÀ NỘI - 2013 LỜI CAM ðOAN Tơi xin cam đoan trực tiếp thực hầu hết nghiên cứu luận văn Mọi kết thu ngun bản, khơng chỉnh sửa chép từ nghiên cứu khác Các số liệu, sơ ñồ kết luận văn chưa cơng bố Tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm với lời cam ñoan trên! Tác giải luận văn Chu ðức Hà Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… i LỜI CẢM ƠN ðể hoàn thành luận văn thạc sỹ nông nghiệp này, xin bày tỏ biết ơn vô sâu sắc tới cô TS Nguyễn Thị Thanh Thủy – Vụ Khoa học, công nghệ môi trường, Bộ Nông nghiệp Phát triển nông thôn thầy TS Nguyễn Văn Giang – Khoa Công nghệ sinh học, ðại học Nông nghiệp Hà Nội hướng dẫn tận tình, chu đáo bên cạnh kiến thức xã hội bổ ích khác Bên cạnh đó, tơi xin chân thành cảm ơn hướng dẫn, giúp ñỡ quý báu, nhiệt tình tập thể cán thuộc: Phịng thí nghiệm Sinh học phân tử - Viện Di truyền Nông nghiệp Nhà lưới công nghệ cao thuộc Trung tâm Chuyển giao công nghệ Khuyến nông Khoa Công nghệ Sinh học, ðại học Nông nghiệp Hà Nội nơi tơi tiến hành luận văn thạc sỹ nơng nghiệp Luận văn thực với nguồn kinh phí từ Quỹ phát triển Khoa học Công nghệ Quốc gia Hà Nội, ngày tháng năm 2013 Tác giả luận văn Chu ðức Hà Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… ii MỤC LỤC Lời cam ñoan i Lời cảm ơn ii Mục lục iii Danh mục ký hiệu, chữ viết tắt vii Danh mục bảng ix Danh mục hình x MỞ ðẦU 1 Tính cấp thiết đề tài Mục đích u cầu đề tài Chương TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Tổng quan lúa 1.1.1 Nguồn gốc lúa 1.1.2 Hệ thống phân loại lúa 1.2 Hạn tượng hạn hán – Cơ chế chống, chịu hạn thực vật lúa 1.2.1 Tổng quan hạn tượng hạn hán 1.2.2 Cơ chế sinh lý, hóa sinh tính chống, chịu hạn thực vật 1.2.3 Cơ chế sinh lý, hóa sinh tính chống, chịu hạn lúa 1.3 Bản ñồ QTL 10 1.3.1 Các loại thị di truyền 11 1.3.2 Xây dựng đồ liên kết 17 1.3.3 Phân tích QTL 23 1.4 Tình hình nghiên cứu đánh giá đặc tính chống, chịu hạn lúa 26 1.4.1 Trên giới 26 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… iii 1.4.2 Trong nước Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 29 iv Chương VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 33 2.1 Vật liệu nghiên cứu 33 2.1.1 Các giống lúa nghiên cứu 33 2.1.2 Hóa chất thiết bị sử dụng 33 2.2 Phương pháp nghiên cứu 33 2.2.1 Phương pháp lai tạo quần thể nghiên cứu 33 2.2.2 Phương pháp đánh giá kiểu hình chịu hạn quần thể lúa nghiên cứu thông qua tiêu hình thái 34 2.2.3 Phương pháp phân tích đa hình di truyền thị phân tử SSR 35 2.2.4 Phương pháp phân tích số liệu 37 Chương KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 39 3.1 Kết tạo lập quần thể nghiên cứu từ tổ hợp lai Khẩu noong mó × Q5 39 3.2 Kết đánh giá kiểu hình chịu hạn quần thể F2:3 điều kiện khơ hạn nhân tạo 3.3 Kết phân tích phân ly kiểu gen quần thể F2 thị phân tử SSR 3.3.1 47 Kết phân tích phân ly kiểu gen quần thể F2 tổ hợp lai Khẩu noong mó × Q5 3.4 47 Kết khảo sát đa hình di truyền hai giống bố mẹ nghiên cứu 3.3.2 40 51 Kết nghiên cứu thị phân tử liên quan ñến ñặc tính chịu hạn lúa 68 KẾT LUẬN VÀ ðỀ NGHỊ 74 Kết luận 74 ðề nghị 74 TÀI LIỆU THAM KHẢO 75 PHỤ LỤC 81 v Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… vi DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT ABA : Axit Abscisis ADN : Axit Deoxyribonucleic AFLP : Amplified Fragment Length Polymorphism - ða hình chiều dài đoạn nhân chọn lọc ARN : Axit Ribonucleic Bp : Base pair – Cặp bazơ nitơ cDNA : Complementary DNA – Thư viện ADN bổ trợ cs : Cộng DAMD : Direct Amplification of Minisatellite DNA markers – Khuếch ñại trực tiếp thị DNA vi vệ tinh DH : Doubled Haploid – ðơn bội kép dNTP : Deoxynucleotide triphosphate ISSR : Inter-Simple Sequence Repeat – Trình tự lặp đơn liên tục LEA : Late Embryogenesis Abundant – Protein sinh vào giai đoạn muộn q trình hình thành phơi MAS : Marker Assisted Selection – Chọn lọc nhờ thị phân tử NST : Nhiễm sắc thể OA : Osmotic Adjustment – ðiều chỉnh áp suất thẩm thấu PCR : Polymerase Chain Reaction - Phản ứng chuỗi trùng hợp QTL/ QTLs : Quantitative Trait Loci(s) - Locus kiểm soát tính trạng số lượng RAPD : Random Amplification of Polymorphic DNA - ða hình ADN nhân ngẫu nhiên RCBD : Randomized Complete Block Design Kiểu khối ñầy ñủ Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nơng nghiệp ……………………… vii hồn tồn ngẫu nhiên RFLP : Restriction Fragment Length Polymorphism – ða hình chiều dài mảnh phân cắt giới hạn RIL : Dòng cận giao tái tổ hợp Rps : Round per second – Vòng giây SFR : Super Fine Resolution – ðộ phân giải siêu tốt SNP : Single Nucleotide Polymorphisms – ða hình nucleotide đơn SSR : Simple Sequence Repeat - Sự lặp lại trình tự đơn giản STMS : Sequence-Tagged Microsatellites Site Marker – Trình tự gắn thị vi vệ tinh TBE : Tris-Boric Acid-EDTA Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… viii TÀI LIỆU THAM KHẢO Tài liệu Tiếng Việt Trịnh ðình ðạt, (2006), Công nghệ sinh học tập 4, Chương 2, Nhà xuất Giáo dục Trần Văn ðạt (2005), “Sản xuất lúa gạo giới: Hiện trạng khuynh hướng phát triển kỷ 21”, NXB Nông nghiệp, Thành phố Hồ Chí Minh Nguyễn Thị Hảo, ðàm Văn Hưng, Phạm Mỹ Linh, Vũ Quốc ðại, Lê Thị Hậu, ðồng Huy Giới, Vũ Văn Liết, (2013), “Nhận biết khả chịu hạn số dịng, giống lúa địa phương làm vật liệu di truyền cho chọn tạo giống lúa thích ứng với điều kiện khó khăn nước tưới”, Tạp chí Khoa học Phát triển 2013: Tập 11, số 2: trang 145 – 153 Vũ Thị Bích Hạnh, Vũ Văn Liết, (2004), “ðánh giá ñặc ñiểm số giống lúa chịu hạn điều kiện mơi trường ñủ nước canh tác nhờ nước trời” Phạm Thị Hoa, (2011), “ðánh giá đa hình di truyền nguồn gen chịu hạn phục vụ cơng tác lập đồ QTL số giống lúa ñịa phương Việt Nam”, Luận văn Thạc sỹ khoa học – ðại học Bách Khoa Hà Nội Lê Thị Hiệu (2012), “Nghiên cứu ñánh giá hạn hán vùng ñồng Sông Hồng”, luận văn thạc sỹ khoa học, ðại học Khoa học tự nhiên – ðại học Quốc gia Hà Nội Nguyễn Văn Khoa, Nguyễn Thị Kim Thanh, (2012), “Nghiên cứu số ñặc ñiểm chịu hạn suất mẫu giống lúa nương huyện Thuận Châu, tỉnh Sơn La” Tạp chí Khoa học Phát triển nơng thơn 2012: Tập 10, số 1: trang 58 – 65 Lã Tuấn Nghĩa (2000), “ðánh giá tính kháng QTL bệnh ñạo ôn lúa”, Kết nghiên cứu khoa học 1999-2000, Viện Di truyền Nông nghiệp, NXB Nông nghiệp, Hà Nội Lã Tuấn Nghĩa, Vũ ðức Quang, Trần Duy Quý, (2004), “Cơ sở lý thuyết ứng dụng công nghệ gen chọn tạo giống trồng”, NXB Nông nghiệp, Hà Nội 10 Lê Duy Thành, Tạ Toàn, ðỗ Lê Thăng Trần Văn Diễn (1995), Di truyền học, NXB Khoa học kỹ thuật 11 Nguyễn Thị Minh Nguyệt, Khuất Hữu Trung, Nguyễn Thị Nhài, Nguyễn Thúy ðiệp, Kiều Thị Dung, Nguyễn Thị Thảo, Nguyễn Thị Thanh Thủy, (2013), “ðánh giá đa dạng di truyền tập đồn lúa chịu hạn Việt Nam thị phân tử SSR”, Tạp chí Nơng nghiệp & Phát triển nơng thơn 2013: Tập – trang 12 – 18 12 Nguyễn Kim Thanh, Nguyễn Thuận Châu (2005), Giáo trình Sinh lý thực vật, NXB Hà Nội 13 Phạm Anh Tuấn, Nguyễn Thị Minh Nguyệt, Nguyễn Bá Ngọc, Nguyễn Thị Kim Dung, Nguyễn Thị Thanh Thủy, (2008), “ðánh giá đặc tính chịu hạn số giống lúa ñịa phương Việt Nam”, Tạp chí Khoa học Phát triển Nơng thơn 2008: Tập 14 Lê Anh Tuấn (2009), giáo trình Hệ thống tưới – tiêu NXB ðại học Cần Thơ, Cần Thơ 15 Vũ Văn Vụ (1996), giáo trình đại học Sinh lý học thực vật NXB Giáo dục Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 75 Tài liệu Tiếng Anh 16 Babu C., Beum A., Nguyen H T., (1997), “Breeding for drought in rice”, Physiology and Molecular Genetic Consideration, Crop sci (37), pg 1426 – 1434., 17 Babu C., Bay D Nguyen, et al (2003), “Genetic analysis of drought resistance in rice by molecular markers: Association between Secondary Traits and Field performance”, Crop Science: Jul/ Aug 2003; 43, 4; ProQuest Biology Journals, pg 1457 – 1473 18 Basten C., Weir B., Zeng B., (2001), “QTL Cartographer”, Department of Statistics, North Carolina State University, Raleigh, NC Beattle, A J., Larsen, T Michaels & K Pauls, (2003), “Mapping quantritative trait loci for a common bean (Phaseolus vulgaris L) ideotype Genome 46, pg 411 -422 19 Bohnert H., Jensen R., (1996), “Strategies for engineering water stress tolerance in plants” Tibtech (14), pg 89 – 97 20 Brant W., Laura R L., Gwendolyn E T., Adam R F., (2007), “Drought tolerance versus drought avoidance: A comparison of plant – water relations in herbaceous wetland plants subjected to water withdrawal and repletion” Wetlands 27(3), pg 656-667 21 Bray E., (1993), “Molecular responses to water deficit”, Plant Physiol 103,pg 1035 – 1040 22 Castiglioni P., Pozzi C., Heun M, Terzi V, Mueller KJ, Rohde W, and Salamini F, (1998), “An AFLP – based procedure for the efficient mapping of mutations and DNA probes in barley”, Genetics 149, pg 2039 – 2056 23 Collard, et al (2005) “An introduction to markers, quantitative trait loci (QTL) mapping and markerassisted selection for crop improvement: The basis concepts”, Euphytica 142, pg 169 – 196 24 Chaleff R., (1983) “Consideration of developmental biology for plant cellulose genetic”, Genetic Engineering of plant, pg 257-270 25 Champoux M C., Wang G Sarkarung S Mackill D J., O’Toole J C., Huang N McCouch S R., (1995), “Locating genes associated with root morphology and drought avoidance in rice via linkage to molecular markers” Theor Appl Genet 90,pg 969 – 981 26 Courtois B., McLaren G., Sinha P., Prasad K., Yadav R., Shen L., (2000), “Mapping QTLs associated with drought avoidance in upland rice”, Molecular Breeding 6, pg 55 – 66 27 Cui M., Zhang W., Zhang Q., Xu Z., Zhu Z., Duan F., We R., (2011), “Induced overexpression of the transcription factor OsDREB2A improves drought tolerance in rice” Plant Physiol Biochem 49, pg 1384 – 1392 28 Eagles H., Bariana H., Ogbonnaya F., Rebetzke G., Hollamby G., Henry R., Henschke P.,Carter M., (2001), “Implementation of markers in Australian wheat breeding”, Aust J Agric Res 52, pg 1349 – 1356 29 Evans D., (1989), “Somalclonal variation , Genetic basis and breeding applications” ,Trend Genet ( 5), pg 46-50 30 Farooq M., Wahid A., Kobayashi N., Fujita D., Basra S M A., (2009), “Plant drought stress: Effects, mechanisms and management” Agron Sustain Dev 29(1), pg 185 – 212 31 Garcia A., Benchimol L., et al., (2004), “Comparison of RAPD, RFLP and SSR markers for diversity studies in tropical maize inbred lines”, Genetics and Molecular Biology, 27 (4), pg 579 – 588 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 76 32 Gomez S., Satheesh Kumar S., et al., (2006), “Mapping QTLs Linked to Physio-Morphological and Plant Production Traits under Drought Stress in Rice (Oryza sativa L.) in the Target Enviroment”, American Journal of Biochemistry and Biotechnology, (4), pg 161 – 169 33 Hackett C., (2002), “Statistical methods for QTL mapping in cereals”, Plant Mol Biol 48, pg 585 – 599 34 Jansen R., Stam P., (1994), “High resolution of quantitative traits into multiple loci via interval mapping”, Genetics 136, pg 1447 – 1455 35 Jansen R (1993), “Interval mapping of multiple quantitative trait loci”, Genetics 135, pg 205 – 211 36 Jones N., Ougham H., Thomas H., (1997), “Markers and mapping: We are all geneticists now”, New Phytol 137, pg 165 – 177 37 Jones A., (1986), “Sweetpotato heritability estimates and their use in plant breeding” HortSci 21, pg 14 – 17 38 Kramer P ,(1983), “Drought tolerance and water use efficiency” Academic Press 13, pg 390 – 415 39 Krauss S., (1999), “Complete exclusion of nonsires in an analysis of paternity in a natural plant population using amplified fragment length polymorphism (AFLP)”, Mol Ecol 8, pg 217 – 226 40 Lander E., Botstein D., (1989), “Mapping Mendelian factors underlying quantitative traits using RFLP linkage maps”, Genetics 121, pg 185 – 199 41 Li Z., Mu P., Li C., Zhang H., Gao Y., Wang X., (2005), “QTL mapping of root traits in a doubled haploid population from a cross between upland and lowland japonica rice in three enviroments » Theor Appl Genet 110, pg 1244 – 1254 42 Lilley J., Ludlow M., (1996), “Expression of osmotic adjustment and dehydration tolerance in diverse rice lines” Field Crops Research 48, pg 185 – 197 43 Lilley J., Ludlow M., McCouch S., O’Toole J., (1996), “Locating QTL for osmotic adjustment and dehydration tolerance in rice” Journal of Experimental Botany 47, pg 1427 – 1436 44 Lincoln S., Daly M,, Lander E., (1993), “Constructing genetic linkage maps with MAPMAKER/EXP Version 3.0.”, Whitehead Institute for Biomedical Research Technical Report, 3rd Edn 45 Lincoln S., Daly M., Lander E., (1993), “Mapping genes controlling quantitative traits using MAPMAKER/QTL, version 1.1”, Whitehead Institute for Biomedical Research Technical Report, 2nd Edn 46 Liu, Jinmei Y., et al (2011), “Genetic Analysis of Segregation Distortion of SSR Markers in F2 Population of Barley”; Journal of Agricultural Science, Vol 3, No 2; June 2011 47 Manly, et al., (2001), “Map Manager QTX, cross-platform software for genetic mapping”, MammGenome 12, pg 930 – 932 48 Marilyn Warburton and Jose Crossa, (2000), “Data Analysis in the CIMMYT Applied Biotechnology Center For Fingerprinting and Genetic Diversity Studies” CIMMYT 49 McCough, et al (1995), “QTL mapping in rice”, Trends Genet 11, pg 482 – 487 50 Morgan J., Tan M., (1996), “Chromosomal location of a wheat osmoregulation gen using RFLP analysis” Australian Journal of Plant Physiology 23(6), pg 803 – 806 51 Morgan J., (1992), “Osmotic components and properties associated with genotypic differences in Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 77 osmoregulation in wheat”, Aust J., Plant Physiol, 19: pg 67 – 76 52 Mohan M., Nair S., et al (1997), “ Genome mapping, molecular markers and marker assisted selection in crop plants”, Mol Breed 3, pg 87 – 103 53 Nelson, et al., (1997), “Qgene-software for marker based genomic analysis and breeding”, Mol Breed 3, pg 239 – 245 54 Nguyet M T Nguyen, Long H Hoang, Naruto Furuya, Kenichi Tsuchiya, Thuy T.T Nguyen, (2013), “Quantitative trait loci (QTLs) associated with Drought tolerance in Vietnamese local rice (Oryza sativa L.)”, J Fac Agr., Kyushu Univ., 58 (1), pg – 55 Powell W., Morgante M., (1996), “The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis”, Molecular breeding, 2, pg 225 – 238 56 Price A., Tomos A., (1997), “Genetic dissection of root growth in rice (Oryza sativa L.) II Mapping quantitative trait loci using molecular markers” Theoretical and Applied Genetics 95, pg 143 – 152 57 Price A., Steele K., Moore B., Barraclough P., Clark L., (2000) “A combined RFLP and AFLP linkage map of upland rice (Oryza sativa L.) used to identify QTLs for root penetration ability” Theoretical and Applied Genetics 100, pg 49 – 56 58 Price A., Cairns J., Horton P., Jones H., and Gri H., (2002), “ Linking drought-resistance mechanisms to drought avoidance in upland rice using a QTL approach: Progress and new opportunities to intergrate stomatal and mesophyll responses”, J Exp Bot (53), pg 989–1004 59 Quarrie S., (1993), “Understanding plant responses to stress and breeding for improved stress tolerance – The generation gap”, In: T J Close and E A Bray (eds.) Plant responses to cellular dehydration during environmental stress Proc 16th Ann Riverside Symp Plant Physiol., pg 28 – 30 Quarrie S A., Lazic Jancic V., Ivanovic M., Pekic S., Heyl A., Landi P., Lebreton C., Steed A., (1997), “Molecular marker methods to dissect drought resistance in maize” In: Tsaftaris AS, ed Biotechnology and breeding of maize and sorgum Proceedings of the XVIIth Conference on Genetics, Maize and Sorghum Section of EUCARPIA, Thessaloniki, October 1996 Cambridge: The Royal Society of Chemistry, pg 52 – 58 60 Rafalski, Tingey S., (1993), “Genetic diagnostics in Plant Breed: RAPDs, microsatellites and machines”, Trends Genet 9, pg 25 – 280 61 Ray J., Yu L., McCouch S., Champoux M., Wang G and Nguyen H T (1996), “Mapping quantitative trait loci associated with root penetration ability in rice” Theor Appl Genet 92, pg 627 – 636 62 Redona E., Mackill D., (1996), “Mapping quantitative trait loci for seedling vigor in rice using RFLPs” Theor Appl Genet 92, pg 395 – 402 63 Robin S., Pathan M., Courtois B., Lafitte R., Caradang S., Lanceras S., Amante M., H T Nguyen, Li Z., (2003), ”Mapping osomotic adjustment in an advanced back-cross inbred population of rice” Theor Appl Genet 107, pg 1288 – 1296 64 Saiki R., Gelfand D., Stoffel S., Scharf S., Higuchi R., Horn G., Mullis K., Erlich H., (1983),”Primer – directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase”, Science, Vol 239, no 4839, pg 487 – 491 65 Sayed H., Kayyal H., Ramsey L., Ceccarelli S., Baum M., (2002), “Segregation distortion in doubled haploid lines of barley (Hordeum vulgare L.) detected by simple sequence repeat markers”, Euphytica Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 78 225, pg 265 – 272 66 Srividhya A., Lakshminarayana R Vemireddy, Puram Venkata Ramanarao, Sakile Sridhar, Mudduluru Jayaprada, Ghanta Anuradha, Battiprolu Srilakshmi, Hariprasad K Reddy, Arramsetty Subramanyam Hariprasad, Ebrahimali Abubackar Siddiq, (2011), “Molecular Mapping of QTLs for Drought related traits at seedling stage under PEG induced stress conditions in Rice” American Journal of Plant Sciences, 2011, 2, pg 190 – 201 67 Stam P., (1993), “Construction of intergrated genetic linkage maps by means of a new computer package: Join map” Plant J 3, pg 739 – 744 68 Tanksley S., (1993), “Mapping polygenes” Annu Rev Genet 27, pg 205 – 233 69 Tanksley S., Ganal M., Prince J., De Vicente M., Bonierbale M., Broun P., Fulton T., Giovannoni J., (1992), “High density molecular linkage maps of the tomato and potato genomes”, Genetics 132, pg 1141 – 1160 70 Teulat B., Monneveux P., Wery J., Borries C., Souyris I., Charrier A., and This D., (1997), “Relationships between relative water content and growth parameters under water stress in barley: A QTL study” New Phytol., 137, pg 99 – 107 71 Teulat B., This D., Khairallah M., Borries C., Ragot C., Sourdille P., Leroy P., Monneveux P., and Charrier A., (1998), “Several QTLs involved in osmotic-adjustment trait variation in barley (Hordeum vulgare L.)” Theor Appl Genet., 96, pg 688 – 698 72 Thanh N D., Lien K T Nguyen, Lien T Q., Thuy B T Le, Trong Q T., (2000), “Comparative study of genetic diversity of Vietnamese upland Rice using RAPD, SSR and AFLP markers” Advances in Natural Sciences 12 (3), pg 229-235 73 Thuy T.T Nguyen, Nguyet M T Nguyen, Long H Hoang, Naruto Furuya, Kenichi Tsuchiya, (2012), “Genetic Diversity in Vietnamese upland rice germplasm revealed by SSR markers” J Fac Agr., Kyushu Univ., 57 (2), pg 383 – 391 74 Trojanowska M R., Bolibok H., (2004), “Characteristics and comparison of three classes of microsatellite-based markers and their application in plants”, Cellular & molecular biology letter, 9, pg 221 – 238 75 Utz H., Melchinger A., (1996), PLABQTL: A program for composite interval mapping of QTL J Quant Trait Loci 2(1) Genetics 154: 1839 – 1849 76 Wang H., et al., (1993), “A simple method of preparing plant samples for PCR” Nucleic Acids Res 21, pg 4153 – 4154 77 Weising K., Nybom H., et al., (2005), “DNA Fingerprinting in plant: Principles, methods and application” – 2nd Edition, CRC Press – Taylor & Francis Group 78 Xu P., Rogers S J., Roossinck M J., (2004), “Expression of antiapoptotic gens bcl-xL and ced-9 in rice enhances tolerance to virus-induced necrosis and abiotic stress” Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 101, pg 15805 – 15810 79 Yadav R., Courtois B., Huang N McLaren G., (1997), “Mapping genes controlling root morphology and root distribution on a double haploid population of rice” Theor Appl Genet 94, pg 619 – 632 80 Yambao E B., Ingram K.T., Real J.G., (1992), “Root xylem influence on the water relations and drought resistance of rice”, J Exp Bot, (43), pg 925-932 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 79 81 Yang W., de Oliveira A C., Godwin I., Schertz K., and Bennetzen J L., (1996), “Comparison of DNA marker technologies in characterizing plant genome diversity: Variability in Chinese sorghums”, Crop Sci 36, pg 1669 – 1676 82 Zhang J., Zheng H G , Aarti A., Pantuwan G., T T Nguyen, J N Tripathy, A K Sarial, S Robin, R C Babu, Bay D Nguyen, S Sarkarung, A Blum, Henry T Nguyen, (2001), “Locating genomic regions associated with components of drought resistance in rice: comparative mapping within and across species”,Theor Appl Genet 103, pg 19 – 29 83 Zhang J., Zheng H G., Ali M L., Tripathy J N , Aarti A, Pathan M S , Sarial A K., Robin S., Nguyen T Thuy, Babu RC, Nguyen BD, Sarkarung S, Blum A, Nguyen HT (1999), “ Progress on the molecular mapping of osmotic adjustment and root traits” In: O’Toole, JC, Ito O, Hardy B (Eds.) Genetic Improvement of Rice for Water-limited Environments, International Rice Research Institute, Los Bannos, Philippines 84 Zhao Bing, Deng Qi-Ming, et al., (2006), Analysis of Segregation Distortion of Molecular Markers in F2 Population of Rice, Acta Genetica Sinica 33 (5), pg 449 – 457 85 Zheng, Da-Li, et al., (2003), “Development of isogenic lines of morphological marker in Indica rice”, Acta Botanica Sinica, 45, (9), pg 1116-1120 86 Zheng H., Babu R., Pathan M., Ali L Huang N., Courtois B., Nguyen H T., (2000), “Quantitative trait loci for root penetration ability and root thickness in rice: comparison of genetic backgrounds” Genome 43, pg 53 – 61 87 Zietkiewicz, E., Rafalski, A., and Labuda, D., (1994), “Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR) – anchored polymerase chain reaction amplification”, Genomics 20, pg 176 – 183 Tài liệu trực tuyến 88 Viện nghiên cứu lúa Quốc tế: http://www.knowledgebank.irri.org/extension/index.php/drought/drought-sensitivity-drs 89 Trung tâm khí tượng thủy văn quốc gia – trung tâm dự báo khí tượng thủy văn trung ương: http://www.nchmf.gov.vn/web/vi-VN/71/38/47/Default.aspx 90 http://www.leanhtuan.com/waterResources.html 91 http://www.methodbook.net/dna/agarogel.html Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 80 PHỤ LỤC Phụ lục 1: Danh mục hóa chất thiết bị sử dụng nghiên cứu Hóa chất: Hóa chất tách chiết ADN: STT Hóa chất Nồng độ gốc Nồng độ làm việc NaOH 1M 0,25M TrisHCl 1M 0,1 M Nước cất Hóa chất thực phản ứng PCR: STT Hóa chất Nồng độ làm việc Buffer 10X MgCl2 25 mM dNTPs 2,5 mM Taq Takara : 50 Primer 15 ng/µl Nước cất Hóa chất điện di agarose - Hóa chất pha TBE 10X (V = 1000 ml): STT Hóa chất Tris base Khối lượng 108 gram Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 81 EDTA 0,5 M pH 8,0 20 ml Axit boric 55 gram Nước cất ðong ñủ 1000 ml - Agarose SFR - Ethidium bromide 10 mg/ ml - Nước cất - Thang ADN chuẩn (50 bp ϕX174HindIII) Dụng cụ thiết bị: - Máy nghiền mẫu Retsch Mixer mill MM200 - Máy ly tâm lạnh Mikro Zentrifugen - Máy khuấy từ gia nhiệt Fisher Scientific- Mỹ - Máy vortex Julabo Paramix - Máy PCR Vertiti 96 wells Applied Biosystems - Bộ ñiện di ngang Owl A2-BP Large Gel Electrophoresis System - Bộ nguồn Power Supply Thermo Scientific EC 3000XL - Hệ thống ñèn UV soi gel - Tủ sấy Memmert Paraffin Oven UNE 500PA - Pipet loại (1 kênh, kênh, 12 kênh, pipet điện tử) - Các thiết bị khác (lị vi sóng, nồi khử trùng, máy cất nước ) Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 82 Phụ lục 2: Danh sách mồi sử dụng nghiên cứu TT Tên mồi Trình tự lặp Kích thước alen Mồi xi Mồi ngược NST RM13101 (TA)32 289 CCTAACATCAGCATTGTGACTTCG CGTTGCTTCACAAATCAAGTAGGC 2 RM13046 (AG)13 173 GCCATAACAGAAAGGTCACATGG CACCTACCATGACTTGTCACATGC RM13263 (CT)14 277 CCCATGTATACCTGACTGTAAGAGG ATACTCATCTATGGCGGTTTCC RM13871 (GA)10 226 CAAGCGCACGGAGAAGAATCG AAGCAGAAACAGCAGCAGCAACG RM13910 (AG)29 188 GAGCGAGCTATACCACCGTGACC ATCGCGTCCAAGAAAGGTGTCG RM14178 (CGG)7 186 GAGAAGGTTTGCTTGCCTTTCG GGATTGGATAAGGCCCATTTAGAGC RM16284 (AT)28 291 ACACTGCTCGGGAGTTACTGACC CAATAAGCAGGGCTACAACATGC RM16408 (AG)10 170 CGTCGAATCGATAGAGCGACTTAGG CTTGCATGGTCAGACAACATCTCC RM16474 (CCG)8 208 GGAGCCTGGATCTTTACCTCTCC CGTGGCGTTCTCTGTCAAGG 10 RM16626 (TC)12 181 ACATGATTGCTGGCTTGCTTACC GCCACGCAGTGTTGTTTCAGC 11 RM16773 (CA)19 318 CCCTCCCTCAACCCAATACTTCC TGTGAGCTCTGCCTCAGTCACC 12 RM16907 (CGG)7 251 GTCGTCGTCGAAGAAGAAAGAGG GATGGCGCTAGATGTTGTTTGG 13 RM17305 (GA)12 145 GAGATCGAAGACGATCGAGATGC GGGATTTGTCCAGTACTCCTCTTCC 14 RM22257 (TA)20 273 ACGAGTGTACTAGAGATGAACTGG ACGACTTCCTTTACGAGTAGG 15 RM22442 (GAA)16 199 ATCGATTGGACATCTCTCCTTCC CCTACCTGCATTGCGTTTGC 16 RM22516 (TC)11 164 TTACCGGTTGATGCAAGTTAGGC AGTAGTGGCGCAGTTCATGATGG 17 RM22654 (CGG)7 189 GAAGGAAGGGCGGGTTAGTACGG CACCGCGGATATTACCACCTTCC 18 RM22674 (AC)22 124 TCAATCAATGGCATGTCAGACC GTGTTACAGTCTGCATTAACCACACC 19 RM22739 (CATA)5 158 TGTTCGGCTGAAAGCATTCTCG GGCATATGCATTCGGTAGCTTGC 20 RM22774 (GAA)7 168 CGCTGGAGAAGACAAGAAACG TAGAATCGGATCTACGGTTCAGG 21 RM22806 (CACG)5 198 TACACGTGACACACGTCGAAGC GACTCTAGGAGGCGACAGGTACGG 22 RM22943 (AT)11 316 TATCGTTGGGTGGAGTTCTTCG GCATATTGTGTTAGCCTTGTGTGC Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nơng nghiệp ……………………… 83 TT Tên mồi Trình tự lặp Kích thước alen 23 RM23022 (TA)29 320 ACGGGACCAAACCTTATAGTGC AAGGCCTCCTCACATCATAAGC 24 RM23083 (GAA)27 233 AATGCACAGTTGCGAATCTTCAGG ACCAAGGCGAAAGCTCAAAGC 25 RM23126 (AT)19 185 CTTCTCAGTTCTCCACATTTCTCC CGGTTAGCCTTGAAGAGTGAGG 26 RM23251 (AT)33 259 TCCGATACTCCCATAGTTAGACC ATGTGGGTTGGCTATAGTCTAGG 27 RM23364 (CT)10 272 CGCGTTGACTCTATACGTTTGCATGG GTTCGTCGGCCATCGTGAGG 28 RM23460 GAGAGGGCAGGTGGAGATGAGG AGCATTGACTTTTAAGTCAC 29 RM23654 (CTT)9 CTCCGATGCCTTCTTCCTCTTGC AAAGGGAGTAGCAAGCCGAGTGG 30 RM152 (GGC)10 151 AACCTAGATCTAATCCGTGG GCCACATGGACATACCATGTTACCC 31 RM23793 (ATT)19 199 GCATCTCAGCAAACAAGAACAACC GAGGCCATCAAGCAGTTCTCC 32 RM23823 (TA)27 148 AACTTGGACGTGACACTAACAAGAGC GCGATACGGGAGCGTGTATAGG 33 RM24004 (CAT)7 430 GCTTTCCCTTGAGTTATCAGTTGG TCATCAACGATGAGCAGAAAGC 34 RM24254 (GAC)7 184 TGCTACTTCGTGCCTCGCTACC AATTGATTAGCGCACGCATCC 35 RM24309 (AG)10 195 CTTTCACCAGACTCCTCCTCACC CTGTAACCACATGCACCATCAGG 36 RM24353 (TC)31 194 GTTCTTCCCTACTGTGAACATGG GTGAAATATCCCTATGCTCTCACC 37 RM24537 (CT)18 176 GGTTTGCATGACCTTGTAGATTGC GTAATCTGCTTTCCCGTCATCG 38 RM24763 (CT)10 139 AATTTCAGCCACAATGGAGTGTCC CTTCAATGACAGGCACTTTGACG 39 RM24824 (CT)10 151 GGATGAACACAAACACGTATGC GGTAACTGTTGGATGCAAAGAGC 40 RM24844 (TA)10 283 CCACTACACCAAATCGTCATTGC ATGGATCTCCAAGTGATGGATGG 41 RM26119 (CCG)7 199 CAGCAGAACAAGGCGTTGAAGG ATGTTCGGCTTGGTGTCTCTGG 11 42 RM26227 (GGC)7 219 CACCGGAGACCAGAGTAGAACG CTCAAACTGATCGAGGCTGACC 11 43 RM26428 (GA)10 192 AGTCACAAGAAAGACGAGCAAGC AGACCTGGCTCTTTGTGACTTCC 11 44 RM26622 (AAG)7 186 CAACATCGTGCGCACACTATATCAGC GACCGAAGTCAGATCGTCCAAGC 11 45 RM26952 (TC)10 257 TGCAGAGCCTCTTCTCTGGTTCC CTCCGGTTGACAGCGACTACGG 11 186 Mồi xuôi Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… Mồi ngược NST 84 TT Tên mồi Trình tự lặp Kích thước alen Mồi xi Mồi ngược NST 46 RM27027 (GCC)7 182 GTTGTCGCTGCACTCCACAATGG GATCCGGCCTCGTGATTACCG 11 47 RM27150 (AG)10 131 ATTCAGGCTCGCTTACCATCTCC CCTCTGCTTGTCCCAAATCACC 11 48 RM27389 (TTC)7 154 ACCGACACCGTCTCCATTATCC TTGTTTGCCTCCTCTGCAACG 11 Ghi chú: Các thị in ñậm 26 thị đa hình rõ nét sử dụng phân tích phân li di truyền quần thể F2 nghiên cứu Phụ lục 3: Kết ñánh giá tiêu ñộ quần thể F2:3 ñiều kiện gây hạn nhân tạo STT 5011 Q5 F2:3_1 ðiểm 1,22 ± 0,67 8,33 ± 1,00 8,56 ± 0,88 STT F2:3_21 F2:3_22 F2:3_23 ðiểm 6,78 ± 1,86 5,67 ± 1,00 3,00 ± 4,50 STT F2:3_43 F2:3_44 F2:3_45 ðiểm 5,67 ± 1,00 4,78 ± 2,54 1,22 ± 0,67 STT F2:3_65 F2:3_66 F2:3_67 ðiểm 5,67 ± 1,00 5,67 ± 1,00 3,22 ± 0,67 STT F2:3_87 F2:3_88 F2:3_89 ðiểm 7,22 ± 1,20 7,67 ± 1,00 7,89 ± 1,76 STT F2:3_109 F2:3_110 F2:3_111 ðiểm 5,00 ± 3,00 7,67 ± 2,00 9,00 ± 0,00 F2:3_2 7,44 ± 1,67 F2:3_24 9,00 ± 0,00 F2:3_46 3,78 ± 0,94 F2:3_68 4,78 ± 4,06 F2:3_90 1,67 ± 1,00 F2:3_112 7,22 ± 2,11 F2:3_3 2,22 ± 2,49 F2:3_25 8,33 ± 1,00 F2:3_47 5,67 ± 1,00 F2:3_69 5,67 ± 1,00 F2:3_91 3,00 ± 0,00 F2:3_113 0,44 ± 0,53 F2:3_4 1,00 ± 0,00 F2:3_26 5,00 ± 2,24 F2:3_48 6,33 ± 4,00 F2:3_70 2,56 ± 1,94 F2:3_92 5,67 ± 1,00 F2:3_114 5,67 ± 1,00 F2:3_5 4,78 ± 3,38 F2:3_27 5,67 ± 1,00 F2:3_49 6,56 ± 1,33 F2:3_71 6,78 ± 0,67 F2:3_93 4,33 ± 2,00 F2:3_115 5,67 ± 1,00 F2:3_6 6,71 ± 2,14 F2:3_28 7,00 ± 0,00 F2:3_50 8,33 ± 1,00 F2:3_72 6,78 ± 1,56 F2:3_94 7,67 ± 1,00 F2:3_116 5,67 ± 1,00 F2:3_7 2,44 ± 1,81 F2:3_29 0,00 ± 0,00 F2:3_51 5,67 ± 1,00 F2:3_73 5,67 ± 1,00 F2:3_95 5,67 ± 1,00 F2:3_117 9,00 ± 0,00 F2:3_8 0,67 ± 1,00 F2:3_30 1,89 ± 1,45 F2:3_52 3,00 ± 0,00 F2:3_74 5,67 ± 1,00 F2:3_96 3,67 ± 2,45 F2:3_118 3,00 ± 1,73 F2:3_9 2,11 ± 1,45 F2:3_31 1,00 ± 0,00 F2:3_53 5,67 ± 1,00 F2:3_75 5,00 ± 0,00 F2:3_97 2,33 ± 1,73 F2:3_119 5,67 ± 1,00 F2:3_10 5,44 ± 1,67 F2:3_32 1,89 ± 1,45 F2:3_54 7,00 ± 0,00 F2:3_76 6,78 ± 2,33 F2:3_98 6,11 ± 2,26 F2:3_120 3,89 ± 2,03 F2:3_11 2,78 ± 2,11 F2:3_33 3,22 ± 0,67 F2:3_55 1,00 ± 0,00 F2:3_77 2,78 ± 0,67 F2:3_99 7,00 ± 0,00 F2:3_121 5,67 ± 1,00 3,33 ± 3,91 2,33 ± 1,41 1,22 ± 0,67 3,67 ± 1,00 F2:3_12 F2:3_34 F2:3_56 F2:3_78 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… F2:3_100 4,33 ± 2,00 F2:3_122 4,11 ± 1,05 85 F2:3_13 0,89 ± 0,93 F2:3_35 1,67 ± 2,00 F2:3_57 3,00 ± 1,41 F2:3_79 5,22 ± 1,86 F2:3_101 4,11 ± 1,76 F2:3_123 4,11 ± 3,02 F2:3_14 7,00 ± 1,00 F2:3_36 6,56 ± 0,88 F2:3_58 5,67 ± 1,00 F2:3_80 9,00 ± 0,00 F2:3_102 7,00 ± 2,00 F2:3_124 5,67 ± 1,00 F2:3_15 7,44 ± 2,60 F2:3_37 5,00 ± 3,00 F2:3_59 5,67 ± 1,00 F2:3_81 4,78 ± 3,23 F2:3_103 5,22 ± 1,86 F2:3_125 5,67 ± 1,00 F2:3_16 5,44 ± 2,19 F2:3_38 4,78 ± 1,56 F2:3_60 6,78 ± 1,20 F2:3_82 1,00 ± 1,22 F2:3_104 9,00 ± 0,00 F2:3_126 5,44 ± 2,40 F2:3_17 5,67 ± 1,00 F2:3_39 5,22 ± 1,56 F2:3_61 3,22 ± 1,86 F2:3_83 7,00 ± 1,00 F2:3_105 9,00 ± 0,00 F2:3_127 7,44 ± 9,79 F2:3_18 4,33 ± 1,00 F2:3_40 3,67 ± 1,00 F2:3_62 3,00 ± 1,73 F2:3_84 5,89 ± 1,45 F2:3_106 7,67 ± 2,00 F2:3_128 5,67 ± 1,00 F2:3_19 3,00 ± 1,73 F2:3_41 1,67 ± 1,41 F2:3_63 5,67 ± 1,00 F2:3_85 2,78 ± 2,54 F2:3_107 5,00 ± 0,00 F2:3_129 6,78 ± 1,86 F2:3_20 8,14 ± 1,07 F2:3_42 2,78 ± 2,33 F2:3_64 2,78 ± 0,67 F2:3_86 5,67 ± 1,00 F2:3_108 6,78 ± 1,56 F2:3_130 5,22 ± 1,20 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 86 Phụ lục Kết đánh giá tiêu độ khơ quần thể F2:3 ñiều kiện gây hạn nhân tạo STT ðiểm STT ðiểm STT ðiểm STT ðiểm STT ðiểm STT ðiểm 5011 1,00 ± 0,87 F2:3_21 6,33 ± 1,00 F2:3_43 5,67 ± 1,41 F2:3_65 2,78 ± 0,44 F2:3_87 7,67 ± 1,73 F2:3_109 5,67 ± 1,00 Q5 8,56 ± 0,88 F2:3_22 2,78 ± 0,44 F2:3_44 5,44 ± 3,94 F2:3_66 8,33 ± 1,00 F2:3_88 1,00 ± 0,00 F2:3_110 5,44 ± 1,33 F2:3_1 6,11 ± 1,05 F2:3_23 5,89 ± 1,76 F2:3_45 1,22 ± 0,67 F2:3_67 2,78 ± 0,44 F2:3_89 6,11 ± 2,67 F2:3_111 5,67 ± 1,41 F2:3_2 5,67 ± 2,00 F2:3_24 5,89 ± 1,05 F2:3_46 6,33 ± 1,41 F2:3_68 2,78 ± 0,44 F2:3_90 9,00 ± 0,00 F2:3_112 8,56 ± 0,88 F2:3_3 2,44 ± 3,17 F2:3_25 5,00 ± 2,00 F2:3_47 5,67 ± 1,00 F2:3_69 6,11 ± 1,05 F2:3_91 8,78 ± 0,67 F2:3_113 8,33 ± 1,00 F2:3_4 1,33 ± 1,32 F2:3_26 4,78 ± 1,20 F2:3_48 7,67 ± 1,00 F2:3_70 6,33 ± 4,00 F2:3_92 8,56 ± 0,88 F2:3_114 8,33 ± 1,41 F2:3_5 4,56 ± 3,57 F2:3_27 3,22 ± 0,67 F2:3_49 3,00 ± 0,00 F2:3_71 1,00 ± 0,00 F2:3_93 6,33 ± 1,00 F2:3_115 0,67 ± 0,50 F2:3_6 5,78 + 1,99 F2:3_28 4,78 ± 1,20 F2:3_50 5,33 ± 2,83 F2:3_72 3,44 ± 2,19 F2:3_94 1,00 ± 0,00 F2:3_116 3,00 ± 0,00 F2:3_7 5,44 ± 1,67 F2:3_29 3,22 ± 0,93 F2:3_51 6,33 ± 1,00 F2:3_73 8,78 ± 0,67 F2:3_95 8,56 ± 0,88 F2:3_117 6,33 ± 1,00 F2:3_8 4,11 ± 2,26 F2:3_30 4,78 ± 2,91 F2:3_52 7,67 ± 1,00 F2:3_74 8,56 ± 0,88 F2:3_96 8,33 ± 1,00 F2:3_118 5,67 ± 2,45 F2:3_9 2,78 ± 1,86 F2:3_31 0,89 ± 0,93 F2:3_53 1,22 ± 0,67 F2:3_75 3,67 ± 1,00 F2:3_97 1,00 ± 0,00 F2:3_119 4,11 ± 1,05 F2:3_10 6,33 ± 1,00 F2:3_32 4,78 ± 2,91 F2:3_54 0,00 ± 0,00 F2:3_76 1,00 ± 0,00 F2:3_98 7,67 ± 2,00 F2:3_120 8,56 ± 0,88 F2:3_11 4,11 ± 4,23 F2:3_33 3,22 ± 1,56 F2:3_55 0,00 ± 0,00 F2:3_77 8,78 ± 0,67 F2:3_99 8,33 ± 1,41 F2:3_121 0,67 ± 0,50 F2:3_12 5,33 ± 4,44 F2:3_34 3,67 ± 2,00 F2:3_56 5,22 ± 0,67 F2:3_78 8,11 ± 1,76 F2:3_100 7,67 ± 2,00 F2:3_122 5,67 ± 3.32 F2:3_13 2,33 ± 1,41 F2:3_35 5,11 ± 3,92 F2:3_57 3,00 ± 1,00 F2:3_79 3,44 ± 1,67 F2:3_101 8,33 ± 2,00 F2:3_123 8,33 ± 1,00 F2:3_14 7,67 ± 1,41 F2:3_36 3,44 ± 1,33 F2:3_58 4,11 ± 2,26 F2:3_80 6,11 ± 3,02 F2:3_102 8,56 ± 0,88 F2:3_124 1,00 ± 0,00 F2:3_15 8,78 ± 0,67 F2:3_37 6,11 ± 1,76 F2:3_59 3,00 ± 2,65 F2:3_81 4,89 ± 3,99 F2:3_103 8,56 ± 0,88 F2:3_125 3,00 ± 0,00 F2:3_16 9,00 ± 0,00 F2:3_38 8,33 ± 1,00 F2:3_60 0,00 ± 0,00 F2:3_82 7,67 ± 1,00 F2:3_104 8,11 ± 1,45 F2:3_126 6,33 ± 1,41 F2:3_17 5,44 ± 0,88 F2:3_39 4,44 ± 3,54 F2:3_61 1,22 ± 0,67 F2:3_83 3,67 ± 1,00 F2:3_105 7,89 ± 1,45 F2:3_127 6,33 ± 3,16 F2:3_18 5,67 ± 2,65 F2:3_40 3,00 ± 1,00 F2:3_62 6,33 ± 1,00 F2:3_84 3,67 ± 2,83 F2:3_106 9,00 ± 0,00 F2:3_128 4,11 + 1,05 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 87 F2:3_19 4,11 ± 2,47 F2:3_41 7,89 ± 2,03 F2:3_63 8,11 ± 1,45 F2:3_85 6,33 ± 2,24 F2:3_107 6,11 ± 1,05 F2:3_129 6,33 ± 1,00 F2:3_20 8,78 + 0,67 F2:3_42 6,33 ± 2,65 F2:3_64 8,33 ± 1,00 F2:3_86 6,33 ± 1,41 F2:3_108 5,89 ± 1,05 F2:3_130 7,89 + 1,76 Phụ lục Kết ñánh giá khả phục hồi quần thể F2:3 ñiều kiện gây hạn nhân tạo STT ðiểm STT ðiểm STT ðiểm STT ðiểm STT ðiểm STT ðiểm 5011 83,33 ± 10,00 F2:3_21 43,33 ± 17,32 F2:3_43 76,67 ± 10,00 F2:3_65 76,67 ± 10,00 F2:3_87 41,11 ± 10,54 F2:3_109 70,00 ± 0,00 Q5 14,44 ± 8,82 F2:3_22 81,11 ± 10,54 F2:3_44 14,44 ± 13,33 F2:3_66 72,22 ± 6,67 F2:3_88 10,00 ± 0,00 F2:3_110 41,11 ± 10,54 F2:3_1 40,00 ± 15,81 F2:3_23 41,11 ± 33,33 F2:3_45 41,11 ± 12,69 F2:3_67 41,11 ± 10,54 F2:3_89 10,00 ± 0,00 F2:3_111 40,00 ± 0,00 F2:3_2 10,00 ± 0,00 F2:3_24 10,00 ± 0,00 F2:346 10,00 ± 0,00 F2:3_68 41,11 ± 17,64 F2:3_90 10,00 ± 0,00 F2:3_112 10,00 ± 0,00 F2:3_3 70,00 ± 17,32 F2:3_25 41,11 ± 7,82 F2:3_47 81,11 ± 10,54 F2:3_69 45,56 ± 8,82 F2:3_91 10,00 ± 0,00 F2:3_113 76,67 ± 17,32 F2:3_4 72,22 ± 18,56 F2:3_26 41,11 ± 10,54 F2:3_48 72,22 ± 6,67 F2:3_70 40,00 ± 22,91 F2:3_92 76,67 ± 10,00 F2:3_114 45,56 ± 8,82 F2:3_5 43,33 ± 29,58 F2:3_27 52,22 ± 6,67 F2:3_49 16,67 ± 14,14 F2:3_71 10,00 ± 0,00 F2:3_93 10,00 ± 0,00 F2:3_115 45,56 ± 8,82 F2:3_6 10,00 ± 0,00 F2:3_28 41,11 ± 22,61 F2:3_50 70,00 ±0,00 F2:3_72 10,00 ± 0,00 F2:3_94 10,00 ± 0,00 F2:3_116 76,67 ± 10,00 F2:3_7 43,33 ± 31,62 F2:3_29 70,00 ± 0,00 F2:3_51 76,67 ± 10,00 F2:3_73 72,22 ± 6,67 F2:3_95 76,67 ± 10,00 F2:3_117 13,33 ± 5,00 F2:3_8 47,78 ± 18,56 F2:3_30 43,33 ± 14,14 F2:3_52 81,11 ± 14,53 F2:3_74 45,56 ±8,82 F2:3_96 14,44 ± 8,82 F2:3_118 41,11 ± 14,53 F2:3_9 72,22 ± 15,63 F2:3_31 43,33 ± 27,84 F2:3_53 76,67 ± 10,00 F2:3_75 10,00 ± 0,00 F2:3_97 14,44 ± 13,33 F2:3_119 36,67 ± 10,00 F2:3_10 40,00 ± 0,00 F2:3_32 43,33 ± 14,14 F2:3_54 76,67 ± 14,14 F2:3_76 14,44 ± 8,82 F2:3_98 10,00 ± 0,00 F2:3_120 10,00 ± 0,00 F2:3_11 41,11 ± 24,72 F2:3_33 41,11 ± 9,28 F2:3_55 70,00 ± 0,00 F2:3_77 43,33 ± 13,23 F2:3_99 43,33 ± 10,00 F2:3_121 76,67 ± 10,00 F2:3_12 41,11 ± 28,48 F2:3_34 41,11 ± 14,53 F2:3_56 41,11 ± 17,64 F2:3_78 43,33 ± 10,00 F2:3_100 10,00 ± 0,00 F2:3_122 42,22 ± 26,82 F2:3_13 70,00 ± 14,14 F2:3_35 40,00 ± 13,23 F2:3_57 41,11 ± 10,54 F2:3_79 40,00 ±37,75 F2:3_101 16,67 ± 10,00 F2:3_123 10,00 ± 0,00 F2:3_14 10,00 ± 0,00 F2:3_36 10,00 ± 0,00 F2:3_58 76,67 ± 10,00 F2:3_80 13,33 ± 5,00 F2:3_102 13,33 ± 5,00 F2:3_124 36,67 ± 10,00 F2:3_15 10,00 ± 0,00 F2:3_37 72,22 ± 12,02 F2:3_59 72,22 ± 10,00 F2:3_81 41,11 ± 6,01 F2:3_103 10,00 ± 0,00 F2:3_125 45,56 ± 8,82 F2:3_16 10,00 ± 0,00 F2:3_38 20,00 ±17,32 F2:3_60 13,33 ± 7,07 F2:3_82 70,00 ± 0,00 F2:3_104 10,00 ± 0,00 F2:3_126 40,00 ± 0,00 F2:3_17 76,67 ± 10,00 F2:3_39 40,00 ± 12,25 F2:3_61 41,11 ± 3,33 F2:3_83 41,11 ± 10,54 F2:3_105 10,00 ± 0,00 F2:3_127 41,11 ± 14,53 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 88 F2:3_18 41,11 ± 22,61 F2:3_40 13,33 ± 5,00 F2:3_62 10,00 ± 0,00 F2:3_84 41,11 ± 3,33 F2:3_106 40,00 ± 0,00 F2:3_128 38,89 ± 10,54 F2:3_19 40,00 ± 14,14 F2:3_41 41,11 ± 12,69 F2:3_63 76,67 ± 10,00 F2:3_85 10,00 ± 0,00 F2:3_107 42,22 ± 6,67 F2:3_129 43,33 ± 14,14 F2:3_20 10,00 ± 0,00 F2:3_42 43,33 ± 36,05 F2:3_64 10,00 ±0,00 F2:3_86 76,67 ± 10,00 F2:3_108 41,11 ± 14,53 F2:3_130 40,00 ± 5,00 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……………………… 89 ... hình chịu hạn quần thể F2: 3 điều kiện khơ hạn nhân tạo 3.3 Kết phân tích phân ly kiểu gen quần thể F2 thị phân tử SSR 3.3.1 47 Kết phân tích phân ly kiểu gen quần thể F2 tổ hợp lai Khẩu noong mó. .. trạng chịu hạn lúa Việt Nam vơ cấp thiết mang tính chiến lược Xuất phát từ lý trên, chúng tơi thực đề tài: ? ?Phân tích di truyền tính chịu hạn quần thể lúa F2 tổ hợp lai Khẩu noong mó × Q5? ?? ðề... lúa ñịa phương Việt Nam 2.2 Yêu cầu ñề tài - Tạo lập quần thể nghiên cứu từ tổ hợp lai Khẩu noong mó x Q5 - Phân tích kiểu hình chịu hạn quần thể F2: 3 ñiều kiện gây hạn nhân tạo - Phân tích phân