1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus

76 10 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Tiêu đề Tối Ưu Hóa Các Cặp Mồi Microsatellite Trong Phân Tích Đa Dạng Di Truyền Cá Tra (Pangasianodon Hypophthamus)
Tác giả Tạ Thanh Thế
Người hướng dẫn ThS. Bùi Thị Liên Hà
Trường học Trường Đại Học Công Nghệ TP. Hồ Chí Minh
Chuyên ngành Công Nghệ Sinh Học
Thể loại đồ án tốt nghiệp
Năm xuất bản 2015
Thành phố TP. Hồ Chí Minh
Định dạng
Số trang 76
Dung lượng 1,41 MB

Nội dung

Ngày đăng: 11/07/2021, 17:51

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
1. Bùi Chí Bửu, Nguyễn Thị Lang (1999). Di truyền phân tử - Những nguyên tắc căn bản trong chọn giống cây trồng. Nhà xuất bản Nông nghiệp, TP. Hồ Chí Minh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Di truyền phân tử - Những nguyên tắc căn bản trong chọn giống cây trồng
Tác giả: Bùi Chí Bửu, Nguyễn Thị Lang
Nhà XB: Nhà xuất bản Nông nghiệp
Năm: 1999
2. Bùi Chí Bửu, Nguyễn Thị Lang (2005). Sinh học phân tử: Giới thiệu phương pháp và ứng dụng. Nhà xuất bản Nông nghiệp, TP. Hồ Chí Minh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Sinh học phân tử: Giới thiệu phương pháp và ứng dụng
Tác giả: Bùi Chí Bửu, Nguyễn Thị Lang
Nhà XB: Nhà xuất bản Nông nghiệp
Năm: 2005
3. Bùi Thị Liên Hà (2004). Bước đầu thăm dò ứng dụng một số chỉ thị DNA phân tích đa dạng di truyền cá tra (Pangasianodon hypophthalmus). Đề tài tập sự, Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II Sách, tạp chí
Tiêu đề: Bước đầu thăm dò ứng dụng một số chỉ thị DNA phân tích đa dạng di truyền cá tra (Pangasianodon hypophthalmus)
Tác giả: Bùi Thị Liên Hà
Năm: 2004
4. Hồ Huỳnh Thùy Dương (2003). Sinh học phân tử. Nhà xuất bản Giáo Dục, TP. Hồ Chí Minh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Sinh học phân tử
Tác giả: Hồ Huỳnh Thùy Dương
Nhà XB: Nhà xuất bản Giáo Dục
Năm: 2003
5. Huỳnh Quốc Khanh (2009). Thực nghiệm ương cá Tra giống (Pangasianodon Hypophthalmus) tại trung tâm giống thủy sản tỉnh An Giang. Trường Đại Học Thủy Sản Cần Thơ Sách, tạp chí
Tiêu đề: Thực nghiệm ương cá Tra giống (Pangasianodon Hypophthalmus) tại trung tâm giống thủy sản tỉnh An Giang
Tác giả: Huỳnh Quốc Khanh
Năm: 2009
6. Nguyễn Thị Lang (2002). Phương pháp cơ bản trong nghiên cứu công nghệ sinh học. Nhà xuất bản Nông nghiệp, TP. Hồ Chí Minh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Phương pháp cơ bản trong nghiên cứu công nghệ sinh học
Tác giả: Nguyễn Thị Lang
Nhà XB: Nhà xuất bản Nông nghiệp
Năm: 2002
7. Nguyễn Văn Hảo, Nguyễn Văn Sáng, Phạm Đình Khôi, Đinh Hùng, Vũ Hải Định (2005). Chọn giống cá tra nhằm nâng cao tỷ lệ philê: Các thông số di truyền. Tuyển tập báo cáo hội thảo toàn quốc về nghiên cứu và ứng dụng khoa học công nghệ vào nuôi trồng thủy sản, Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thuỷ sản II: 359 – 368 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Tuyển tập báo cáo hội thảo toàn quốc về nghiên cứu và ứng dụng khoa học công nghệ vào nuôi trồng thủy sản, Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thuỷ sản II
Tác giả: Nguyễn Văn Hảo, Nguyễn Văn Sáng, Phạm Đình Khôi, Đinh Hùng, Vũ Hải Định
Năm: 2005
8. Nguyễn Văn Thường (2008). Tổng quan dẫn liệu về định loài cá Tra (Pangasianodon hypophthalmus) phân bố ở vùng hạ lưu sông Mê Kong, Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ(1): 84 – 89 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Pangasianodon hypophthalmus") phân bố ở vùng hạ lưu sông Mê Kong, "Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ
Tác giả: Nguyễn Văn Thường
Năm: 2008
9. Phạm Thành Hổ (2005). Di truyền học. Nhà xuất bản Giáo Dục, TP. Hồ Chí Minh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Di truyền học
Tác giả: Phạm Thành Hổ
Nhà XB: Nhà xuất bản Giáo Dục
Năm: 2005
10. Phạm Thành Hổ (2005). Nhập môn Công nghệ sinh học. Nhà xuất bản Giáo Dục, TP. Hồ Chí Minh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nhập môn Công nghệ sinh học
Tác giả: Phạm Thành Hổ
Nhà XB: Nhà xuất bản Giáo Dục
Năm: 2005
11. Trịnh Đình Đạt (2006). Công nghệ sinh học tập 4: “Công nghệ Di truyền”. Nhà xuất bản Giáo dục, TP. Hồ Chí Minh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Công nghệ sinh học tập 4: “Công nghệ Di truyền”
Tác giả: Trịnh Đình Đạt
Nhà XB: Nhà xuất bản Giáo dục
Năm: 2006
12. Trương Thủ Khoa, Trần Thị Thu Hương (1993). Định loại cá nước ngọt vùng đồng bằng sông Cửu Long. Khoa thủy sản trường đại học Cần Thơ.TÀI LIỆU TIẾNG ANH Sách, tạp chí
Tiêu đề: Định loại cá nước ngọt vùng đồng bằng sông Cửu Long
Tác giả: Trương Thủ Khoa, Trần Thị Thu Hương
Năm: 1993
14. Hayden M.J., Sharp P.J. (2001). Targeted development of informative microsatellite (SSR) marker, Nucleic Acid Research, 29: e44 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nucleic Acid Research
Tác giả: Hayden M.J., Sharp P.J
Năm: 2001
15. Hung L.T., Lazard J., Mariojoul C., Moreau Y. (2003). Comparison of starch utilization in fingerlings of two Asian catfishes from the Mekong River (Pangasius bocourti) Sauvage, 1980,( Pangasius hypophthalmus) Sauvage, 1878. Aquaculture Nutrition 9: 215 – 222 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Pangasius bocourti") Sauvage, 1980,( "Pangasius hypophthalmus") Sauvage, 1878. "Aquaculture Nutrition
Tác giả: Hung L.T., Lazard J., Mariojoul C., Moreau Y
Năm: 2003
16. Kashi Y., Hallerman E. M., Soller M. (1990). Marker-assisted selection of candidate bulls for progeny testing programs. Animal Production 51: 63 – 74 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Animal Production
Tác giả: Kashi Y., Hallerman E. M., Soller M
Năm: 1990
17. Kottelat M., Vidthayanon C. (1993). Boraras micros, a new genus and species of minute freshwater fish from Thailand (Teleostei: Cyprinidae).Ichthyological Exploration Freshwater 4 (2): 161 – 176 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Ichthyological Exploration Freshwater
Tác giả: Kottelat M., Vidthayanon C
Năm: 1993
18. Murray P.R., Jones R.N., Allen S.D. (1993). Multilaboratoey evaluation of the in vitro activity of 13 beta-lactam antibioties against 1471 clinical isolatoes of aerobic and anaerobic bacteria. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 16: 191 – 203 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Diagnostic Microbiology and Infectious Disease
Tác giả: Murray P.R., Jones R.N., Allen S.D
Năm: 1993
19. Poulsen A.F., Hortle K. G., Valbo-Jorgensen, Chan J.S., Chhuon C.K., Viravong S., Bouakhamvongsa K., Suntornratana U., Yoorong N., Nguyen T.T., Tran B.Q. (2004). Distribution and ecology of some important riverine fish species of the Mekong River Basin. MRC Technical Paper No. 10 Sách, tạp chí
Tiêu đề: MRC Technical Paper
Tác giả: Poulsen A.F., Hortle K. G., Valbo-Jorgensen, Chan J.S., Chhuon C.K., Viravong S., Bouakhamvongsa K., Suntornratana U., Yoorong N., Nguyen T.T., Tran B.Q
Năm: 2004
13. Ferraris C.J. (2007). Checklist of Catfishes, recent and fossil (Osteichthyes, Siluriformes), andcatalogue of siluriform primary types. Zootaxa 1418 © 2007 Magnolis Press Khác

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Hình 1.2. Cá Tra (Pangasianodon hypophthalmus). - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 1.2. Cá Tra (Pangasianodon hypophthalmus) (Trang 17)
Hình 1.5. Cấu tạo bong bóng khí của cá Tra (Pangasianodon hypophthalmus). - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 1.5. Cấu tạo bong bóng khí của cá Tra (Pangasianodon hypophthalmus) (Trang 18)
Hình 1.4. Vị trí và hình dạng bong bóng khí của cá Tra. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 1.4. Vị trí và hình dạng bong bóng khí của cá Tra (Trang 18)
1.4.6. Cơ chế hình thành microsatellite - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
1.4.6. Cơ chế hình thành microsatellite (Trang 30)
Hình 1.7. Cơ chế trượt lỗi trong quá trình sao mã. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 1.7. Cơ chế trượt lỗi trong quá trình sao mã (Trang 31)
Hình 1.8. Phát hiện microsatellite từ DNA tổng số. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 1.8. Phát hiện microsatellite từ DNA tổng số (Trang 32)
Hình 2.2. Quy trình tách chiết DNA Salt extraction (Miller và ctv, 1988). - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 2.2. Quy trình tách chiết DNA Salt extraction (Miller và ctv, 1988) (Trang 40)
Hình 2.3. Các bước cơ bản của phàn ứng PCR. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 2.3. Các bước cơ bản của phàn ứng PCR (Trang 42)
Hình 2.4. Sơ đồ minh họa các bước trong quá trình điện di agarose gel. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 2.4. Sơ đồ minh họa các bước trong quá trình điện di agarose gel (Trang 47)
 Cấu hình DNA - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
u hình DNA (Trang 48)
Hình 2.6. Sơ đồ bố trí thí nghiệm.Nguồn mẫu  - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 2.6. Sơ đồ bố trí thí nghiệm.Nguồn mẫu (Trang 49)
Bảng 2.4. Chu trình nhiệt của các mồi CB12, CB13, CB14, CB15, CB18, CB19. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Bảng 2.4. Chu trình nhiệt của các mồi CB12, CB13, CB14, CB15, CB18, CB19 (Trang 52)
Bảng 2.5. Chu trình nhiệt của mồi Pg–13, PSP– G565, PSP–G579, PSP– G593. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Bảng 2.5. Chu trình nhiệt của mồi Pg–13, PSP– G565, PSP–G579, PSP– G593 (Trang 53)
Bảng 2.6. Chu trình nhiệt của mồi Ph–7, Ph–9, Ph–21, Ph–25. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Bảng 2.6. Chu trình nhiệt của mồi Ph–7, Ph–9, Ph–21, Ph–25 (Trang 53)
2.4.3. Thí nghiệm 3: Khảo sát tính hoạt động của các cặp mồi microsatellite - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
2.4.3. Thí nghiệm 3: Khảo sát tính hoạt động của các cặp mồi microsatellite (Trang 55)
Hình 2.7. Chu trình nhiệt của máy PCR sau khi tối ưu nhiệt độ bắt cặp mồi - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 2.7. Chu trình nhiệt của máy PCR sau khi tối ưu nhiệt độ bắt cặp mồi (Trang 56)
Hình 3.1. Kết quả tách chiết DNA 15 mẫu vây đuôi cá tra ngẫu nhiên cho 4 quần - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 3.1. Kết quả tách chiết DNA 15 mẫu vây đuôi cá tra ngẫu nhiên cho 4 quần (Trang 57)
Hình 3.2. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi CB12. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 3.2. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi CB12 (Trang 58)
Hình 3.3. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi CB13. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 3.3. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi CB13 (Trang 59)
Hình 3.5. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi CB15. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 3.5. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi CB15 (Trang 60)
Hình 3.7. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi CB19. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 3.7. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi CB19 (Trang 61)
Hình 3.8. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi Phy01. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 3.8. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi Phy01 (Trang 62)
Hình 3.10. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi Ph–7. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 3.10. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi Ph–7 (Trang 63)
Hình 3.12. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi PSP–G579. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 3.12. Phản ứng PCR gradian nhiệt độ của cặp mồi PSP–G579 (Trang 64)
Dựa trên kết quả nhiệt độ bắt cặp tối ưu đã được xác địn hở bảng 3.1 (Bảng nhiệt độ bắt cặp của các mồi sau khảo sát nhiệt độ tối ưu), tiếp tục tối ưu hóa nồng  độ MgCl 2 cho 12 cặp mồi microsatellite - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
a trên kết quả nhiệt độ bắt cặp tối ưu đã được xác địn hở bảng 3.1 (Bảng nhiệt độ bắt cặp của các mồi sau khảo sát nhiệt độ tối ưu), tiếp tục tối ưu hóa nồng độ MgCl 2 cho 12 cặp mồi microsatellite (Trang 65)
Hình 3.19. Phản ứng tối ưu nồng độ - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 3.19. Phản ứng tối ưu nồng độ (Trang 67)
Hình 3.21. Phản ứng tối ưu nồng độ MgCl 2 của cặp mồi Phy03.  - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 3.21. Phản ứng tối ưu nồng độ MgCl 2 của cặp mồi Phy03. (Trang 68)
Dựa trên kết quả nhiệt độ bắt cặp tối ưu đã được xác địn hở bảng 3.1 (Bảng nhiệt độ bắt cặp của các mồi sau khảo sát nhiệt độ tối ưu) và kết quả nồng độ MgCl 2 tối ưu đã được xác định ở bảng 3.2 (Bảng kết quả tối ưu nồng độ MgCl 2  của 12 cặp  mồi), tiếp  - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
a trên kết quả nhiệt độ bắt cặp tối ưu đã được xác địn hở bảng 3.1 (Bảng nhiệt độ bắt cặp của các mồi sau khảo sát nhiệt độ tối ưu) và kết quả nồng độ MgCl 2 tối ưu đã được xác định ở bảng 3.2 (Bảng kết quả tối ưu nồng độ MgCl 2 của 12 cặp mồi), tiếp (Trang 69)
Hình 3.27. Sản phẩm khuếch đại của mồi CB19 trên 12 mẫu cá tra. - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
Hình 3.27. Sản phẩm khuếch đại của mồi CB19 trên 12 mẫu cá tra (Trang 71)
cho kết quả phản ứng PCR kiểm tra tính ổn định và đa hình của 4 mẫu cá tra đại diện của các cặp mồi - Tối ưu hóa các cặp mồi microsatellite trong phân tích đa dạng di truyền cá tra pangasianodon hypophthamus
cho kết quả phản ứng PCR kiểm tra tính ổn định và đa hình của 4 mẫu cá tra đại diện của các cặp mồi (Trang 71)

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w