Xác định tương quan giữa điều kiện môi trường sống và haplotype của chó hmông cộc đuôi và chó nhà ở việt nam

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH Nguyễn Thị Thanh Thảo XÁC ĐỊNH TƯƠNG QUAN GIỮA ĐIỀU KIỆN MÔI TRƯỜNG SỐNG VÀ HAPLOTYPE CỦA CHĨ H’MƠNG CỘC ĐI VÀ CHĨ NHÀ Ở VIỆT NAM LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC Thành phố Hồ Chí Minh –2020 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH Nguyễn Thị Thanh Thảo XÁC ĐỊNH TƯƠNG QUAN GIỮA ĐIỀU KIỆN MƠI TRƯỜNG SỐNG VÀ HAPLOTYPE CỦA CHĨ H’MƠNG CỘC ĐI VÀ CHĨ NHÀ Ở VIỆT NAM Chun ngành : Sinh thái học Mã số : 8420120 LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS.TS TRẦN HỒNG DŨNG Thành phố Hồ Chí Minh – 2020 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan công trình nghiên cứu riêng tơi định hướng, góp ý thầy hướng dẫn, giúp đỡ ông Nguyễn Thành Công trình thu mẫu thành viên nhóm nghiên cứu Các số liệu kết luận văn trung trực chưa công bố công bố cơng trình khác TP Hồ Chí Minh, ngày tháng năm 2020 TÁC GIẢ LUẬN VĂN Nguyễn Thị Thanh Thảo LỜI CẢM ƠN Tôi xin chân thành cảm ơn PGS TS Trần Hoàng Dũng - người tận tình giúp đỡ hướng dẫn tơi q trình học tập, nghiên cứu hoàn thiện luận văn Tôi xin chân thành cảm ơn Quý thầy cô Khoa học Sư phạm sinh học, Phòng Sau đại học - Trường Đại học Sư phạm TP.Hồ Chí Minh giúp đỡ, tận tình dạy truyền đạt kiến thức quý giá suốt thời gian học tập trường Khoa Công nghệ sinh học - Trường Đại học Nguyễn Tất Thành tạo điều kiện thuận lợi cho thực luận văn Cảm ơn đồng nghiệp, thành viên nhóm nghiên cứu: Nguyễn Thành Cơng, Trần Thị Bích Huy, Ơng Bỉnh Ngun hỗ trợ tơi nhiều q trình thực hồn thành luận văn Qua đây, tơi xin bày tỏ lịng cảm ơn sâu sắc đến gia đình, người thân bạn bè giúp đỡ suốt thời gian thực luận văn TP Hồ Chí Minh, ngày tháng năm 2020 TÁC GIẢ LUẬN VĂN Nguyễn Thị Thanh Thảo MỤC LỤC Lời cam đoan Lời cảm ơn Mục lục Danh mục chữ viết Danh mục bảng Danh mục hình MỞ ĐẦU Chương TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan giống chó H’Mơng cộc 1.1.1 Phân loại chó H’Mơng cộc đuôi 1.1.2 Đặc điểm hình thái tập tính giống chó H’Mơng cộc 1.2 Hệ gen ty thể động vật có vú 1.3 Các nghiên cứu đánh giá đa dạng di truyền chó nhà dựa vào trình tự HV1 vùng CR mtDNA 1.3.1 Các nghiên cứu giới 1.3.2 Các nghiên cứu chó nhà Việt Nam 13 Chương VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP 17 2.1 Vật liệu 17 2.1.1 Nguyên liệu 17 2.1.2 Dụng cụ, thiết bị hóa chất sử dụng nghiên cứu 17 2.1.3 Địa điểm nghiên cứu 17 2.2 Phương pháp nghiên cứu 17 2.2.1 Thu thập xử lý mẫu chó 18 2.2.2 Phương pháp tách chiết DNA tổng số 20 2.2.3 Kiểm tra độ tinh DNA quang phổ kế 21 2.2.4 Kỹ thuật điện di DNA gel agarose 22 2.2.5 Khuếch đại trình trự vùng HV1 kỹ thuật PCR 23 2.2.6 Phương pháp giải hiệu chỉnh trình tự 24 2.2.7 Phương pháp xử lý phân tích kết 25 Chương KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN 29 3.1 Định loại loại haplotype có 138 cá thể chó nghiên cứu đăng ký Genbank cho trình tự .29 3.1.1 Thu thập mẫu xử lý mẫu 29 3.1.2 Kết tách chiết DNA tổng số: 29 3.1.3 Kết khuếch đại vùng HV1 31 3.1.4 Kết giải trình tự hiệu chỉnh trình tự vùng HV1 31 3.1.5 Xác định haplotype 138 mẫu chó 34 3.2 Đánh giá mức độ đa dạng di truyền quần thể chó nhà H’Mơng cộc dựa vào vùng HV1 gen ty thể 37 3.2.1 Sự đa dạng cấp độ nucleotide 37 3.2.2 Sự đa dạng cấp độ haplotype 40 3.3 So sánh đa dạng di truyền giống chó H’Mơng cộc với giống quần chó khác Việt Nam 43 3.4 Sự khác biệt haplotype quần thể chó nhà miền Bắc với quần thể chó nhà miền Trung miền Nam 45 3.5 So sánh đa dạng di truyền quần thể chó nhà miền Bắc với quần thể chó nhà miền Trung quần thể chó nhà miền Nam .47 3.6 So sánh đa dạng di truyền giống chó H’Mơng cộc với số giống chó nhà khác giới .50 3.7 Nhận định mức độ tương quan yếu tố môi trường haplotype quần thể chó nhà H’Mơng cộc quần thể chó nhà Việt Nam 52 3.7.1 Tương quan yếu tố môi trường đến tỷ lệ haplogroup giống chó H’Mơng cộc giống chó khác 53 3.7.2 Tương quan nhiệt độ môi trường đến tỷ lệ haplogroup quần thể chó nhà Việt Nam theo khu vực địa lý 54 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 56 TÀI LIỆU THAM KHẢO 58 PHỤ LỤC DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT µg : Microgram µL : Microlit Bp : Base pair CR : Control Region D-loop DNA : Displacement – loop : Deoxyribonucleic acid Etbr : Ethidium bromide HV1 : Hypervariable region HV2 : Hypervariable region mg : Miligram ml : Minilit mtDNA OD : Mitochonrial DNA : Optical Density PCR : Polymerase Chain Reaction SNP : Single Nucleotide Polymorphism UV VNTR : Ultraviolet : Variable number tandem repeat DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 2.1 Cặp mồi đặc hiệu cho sử dụng phản ứng khuếch đại vùng HV1 23 Bảng 2.2 Các thành phần tỷ lệ phản ứng khuếch đại vùng HV1 23 Bảng 2.3 Chu trình nhiệt khuếch đại vùng HV1 24 Bảng 2.4 Cặp mồi sử dụng phản ứng giải trình tự vùng HV1 24 Bảng 3.1 Kết OD nồng độ DNA thu 10/138 mẫu nghiên cứu 30 Bảng 3.2 Kết định loại Haplotype 55 mẫu chó H’Mơng cộc 34 Bảng 3.3 Kết định loại Haplotype 28 mẫu chó nhà Huế 35 Bảng 3.4 Kết định loại Haplotype 19 mẫu chó nhà Long An-Tây Ninh 36 Bảng 3.5 Kết định loại Haplotype 15 mẫu chó nhà Hà Tiên 36 Bảng 3.6 Kết định loại Haplotype 21 mẫu chó nhà tỉnh Sóc Trăng 36 Bảng 3.8 Thơng tin số lượng tỷ lệ phần trăm loại haplotype có 55 mẫu chó H’Mơng cộc 41 Bảng 3.9 Tỷ lệ phân bố haplogroup số đa dạng di truyền quần thể chó nhà H’Mơng cộc đuôi 42 Bảng 3.10 Tỷ lệ phân bố haplogroup số đa dạng di truyền 43 Bảng 3.11 Chỉ số Fst cặp giống chó địa Việt Nam 45 Bảng 3.12 Tỷ lệ phần trăm halogroup quần thể 48 Bảng 3.13 Chỉ số đa dạng di truyền quần thể chó nhà theo vùng địa lý 49 Bảng 3.14 Chỉ số Fst cặp quần thể chó nhà Việt Nam 49 Bảng 3.15 Mức độ đa dạng nucleotide số giống chó giới 50 Bảng 3.16 Mức độ đa dạng haplotype số giống chó giới 51 DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 1.1 Chó H’Mơng cộc Hình 1.2 Vị trí thành phần vùng CR gen ty thể chó Hình 2.1 Vị trí thu mẫu số lượng mẫu thu 19 Hình 2.2 Vị trí bắt cặp mồi 15412F 16625R 23 Hình 2.3 Giao diện trang web định loại haplotype 26 Hình 3.1 Kết điện di DNA tổng số 10/138 mẫu 29 Hình 3.2 Kết điện di sản phẩm trình PCR gel agarose 1% 31 Hình 3.3 Biểu đồ huỳnh quang 01 đoạn trình tự vùng HV1 có tín hiệu tốt 32 Hình 3.4 Biểu đồ huỳnh quang 01 đoạn trình tự vùng HV1 có tín hiệu xấu 32 Hình 3.5 Một đoạn trình tự đồng (consensus sequence) vùng HV1 mẫu CH5 33 Hình 3.6 Đại diện đoạn trình tự đồng vùng HVI 55 mẫu H’Mông cộc đuôi 33 Hình 3.7 Kết so sánh trình tự mẫu với trình tự tham khảo Genbank 33 Hình 3.8 Sự phân bổ haplotype quần thể chó nhà theo vùng địa lý 47 Hình 3.9 Tỷ lệ haplogroup quần thể chó nhà phân bố theo vĩ độ 55 MỞ ĐẦU Lí chọn đề tài Chó (Canis lupus familiaris) vật nuôi phổ biến giới Chúng lồi động vật người hóa khoảng 15.000 năm trước với mục đích hỗ trợ người trình săn bắt tìm kiếm thức ăn, sử dụng với mục đích chăn ni gia súc hay xua đuổi mối nguy hiểm Ở Việt Nam việc sở hữu chó lai chó cỏ làm thú cưng với mục đích giữ nhà phổ biến Tuy nhiên, nhắc đến việc sở hữu chó mang nét đặc trưng Việt người ta nhắc tới bốn tên: chó Phú Quốc, chó Bắc Hà, chó H’Mơng cộc chó Dingo Đơng Dương (chó Lài) lên sóng đài truyền hình VTV Việt Nam vào dịp tết cổ truyền năm 2018 với danh hiệu “Tứ Đại Quốc Khuyển’’ nước Việt Vì giống chó mang tính chất Việt, có nét đặc trưng thơng minh, nhanh nhẹn, dũng mảnh tính cách trung thành với chủ nhân Ngồi mục đích sử dụng để làm thú cưng hay trơng nhà, chúng cịn huấn luyện để phục vụ lĩnh vực An ninh – Quốc phịng Vì có nhiều cơng trình nghiên cứu liên quan đến giống chó Việt Nam nhiên nghiên cứu hình cái, cấu tạo bệnh lý để đưa chế độ chăm sóc hợp lý Đến năm 2012, Khoa Sinh học trường Đại học Nguyễn Tất Thành tiến hành nghiên cứu sâu đánh giá đa dạng di truyền nguồn gốc giống chó lưng xốy Phú Quốc cơng nghệ sinh học phân tử, thơng qua giải mã trình tự DNA vùng HV1 (Hypervariable region 1) Vào năm 2019, nhóm nghiên cứu đưa kết luận giống chó có nguồn gốc từ chó nhà Việt Nam khu vực đất liền tỉnh Kiên Giang di cư bát bỏ ý kiến chó lưng xốy Phú Quốc có nguồn gốc từ chó lưng xốy Thái Lan [1] Thế thơng tin khoa học ba “Danh Khuyển’’ cịn lại có giống chó H’Mơng cộc đuôi Năm 2013 nghiên cứu Trần Hữu Côi thuộc Viện Hàn Lâm Khoa học công nghệ Việt Nam “Nghiên cứu đặc tính sinh học giống chó H’Mông cộc đuôi phục vụ công tác huấn luyện nghiệp vụ” nghiên cứu tập trung vào hình thái, đặc điểm giác quan tập tính trội giống chó H’Mơng 60 of mitochondrial DNA", Proceedings of the National Academy of Sciences, Vol 101, No 33, pp 12387-12390, Aug 2004 [18] M.C Oskarsson, C.F Klütsch, U Boonyaprakob, A Wilton, Y Tanabe, P Savolainen, "Mitochondrial DNA data indicate an introduction through Mainland Southeast Asia for Australian dingoes and Polynesian domestic dogs", Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Vol 279, No 1730, pp 967-974, Sep 2011 [19] J.-F Pang, C Kluetsch, X.-J Zou, A.-B Zhang, L.-Y Luo, H Angleby, A Ardalan, C Ekström, A Sköllermo, J Lundeberg, S Matsumura, T Leitner, Y.-P Zhang, P Savolainen, "mtDNA data indicate a single origin for dogs south of Yangtze River, less than 16,300 years ago, from numerous wolves", Molecular biology and evolution, Vol 26, No 12, pp 2849-2864, Dec 2009 [20] E Koban, ầ G Saraỗ, S C Aỗan, P Savolainen, Togan, "Genetic relationship between Kangal, Akbash and other dog populations", Discrete Atrlied Mathematics, Vol 157, No 10, pp 2335-2340, May 2009 [21] C Klütsch, E.H Seppälä, T Fall, M Uhlén, A Hedhammar, H Lohi, P Savolainen, "Regional occurrence, high frequency but low diversity of mitochondrial DNA haplogroup d1 suggests a recent dog‐wolf hybridization in Scandinavia", Animal genetics, Vol 42, No 1, pp 100-103, Feb 2011 [22] A Ardalan, M.C.R Oskarsson, B van Asch, E Rabakonandriania, P Savolainen, "Comprehensive study of mtDNA among Southwest Asian dogs contradicts independent domestication of wolf, but implies dog–wolf hybridization", Ecology and evolution, Vol 1, No 3, tr 373-385, May 2011 [23] Y Li, Y Zhang, "High genetic diversity of Tibetan Mastiffs revealed by mtDNA sequences", Chinese science bulletin, Vol 57, No 13, pp 14831487, Feb 2012 [24] A Ardalan, M.C Oskarsson, B Van Asch, E Rabakonandriania, P Savolainen, "African origin for Madagascan dogs revealed by mtDNA analysis", Royal Society open science, Vol 2, No 5, 140552, May 2015 61 [25] Nguyễn Hữu Chiếm et al., "Điều tra nghiên cứu bảo tồn gen động vật: chó Phú Quốc, tỉnh Kiên Giang", Báo cáo Tổng kết, Trường Đại học Cần Thơ, 2004 [26] Hoàng Tuấn Thanh, Nguyễn Quốc Đạt, Võ Văn Sự, Hoàng Văn Tiệu, "Khả sinh trưởng sinh sản chó Phú Quốc ni Thành phố Hồ Chí Minh", Báo cáo khoa học, Viện chăn ni, 2009 [27] Trương Nguyễn Thị Như Mai, "Định loại haplotype truy tìm nguồn gốc chó Phú Quốc trình tự kiểm soát gen ty thể", Luận văn thạc sĩ sinh học Trường Đại học Khoa học tự nhiên - Đại học Quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh, Thành phố Hồ Chí Minh, 2013 [28] Huỳnh Thị Bích Liễu, "Nghiên cứu xác định mối quan hệ di truyền hai nịi chó lưng xốy Phú Quốc Thái Lan dựa trình tự hệ gen ty thể", Luận văn thạc sĩ sinh học Ttrường Đại học Sư phạm Thành phố Hồ Chí Minh, Thành phố Hồ Chí Minh, 2014 [29] Hà Thị Cầm, "Bước đầu khảo sát nguồn gốc chó Phú Quốc dựa vùng nhiễm sắc thể Y", Luận văn thạc sĩ sinh học Trường Đại học Sư phạm Thành phố Hồ Chí Minh, Thành phố Hồ Chí Minh, 2015 [30] Nguyễn Văn Tú, "Đánh giá đa dạng di truyền quần thể chó nhà lưng xoáy huyện đảo Phú Quốc tỉnh Kiên Giang dựa vào trìn tự vùng Hypervariable region gen ty thể", Luận văn thạc sĩ sinh học Trường Đại học Khoa học tự nhiên -Đại học quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh, Thành phố Hồ Chí Minh 2015 [31] Trần Hồng Dũng, Thái Kế Qn, Nguyễn Thành Cơng, Huỳnh Văn Hiếu, Chung Anh Dũng, "Origin of Phu Quoc ridgeback dog by using mitochondrial d-loop sequences", Academia Journal of Biology, Vol 38, No 2, pp 269-278, 2016 [32] Nguyễn Thành Công, "Đánh giá đa dạng di truyền quần chó nhà huyện đảo Phú Quốc Thành phố Rạch Giá tỉnh Kiên Giang dựa vào vùng trình tự Hypervariable Region gen ty thể," Trường Đại Học Khoa học Tự Nhiên, Thành phố Hồ Chí Minh, 2017 62 [33] Bùi Xuân Phương, Phạm Thanh Hả, Đinh Thế Dũng, Hồ Thị Loan, Đặng Tất Thế, "Nghiên cứu đa hình vùng D-loop giống chó H’ mơng cộc ứng dụng cơng tác chọn giống", Tạp chí Khoa học Cơng nghệ nhiệt đới, 9, 2015 [34] F Sanger, S Nicklen, A.R Coulson, "DNA sequencing with chainterminating inhibitors", Proceedings of the national academy of sciences, Vol 74, No 12, pp 5463-5467, Dec.1977 [35] Thái Kế Quân, Chung Anh Dũng, Trần Hoàng Dũng, "Canis mtDNA HV1 database: a web-based tool for collecting and surveying Canis mtDNA HV1 haplotype in public database", BMC genetics, Vol 18, No 1, 60, Jun 2017 [36] M Nei, Molecular evolutionary genetics NY: Columbia University Press, 1987 [37] F Tajima, "Evolutionary relationship of DNA sequences in finite populations", Genetics, Vol 105, No 2, pp 437-460, Oct 1983 [38] L Excoffier, H.E Lischer, "Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows", Molecular ecology resources, Vol 10, No 3, pp 564-567, May 2010 [39] S Wright, "The genetical structure of populations", Annals of eugenics, Vol 15, No 1, pp 323-354, Jan 1949 [40] M Gouy, S Guindon, O Gascuel, "SeaView version 4: a multiplatform graphical user interface for sequence alignment and phylogenetic tree building", Molecular biology and evolution, Vol 27, No 2, pp 221-224, Feb 2010 [41] S Kumar, G Stecher, M Li, C Knyaz, K Tamura, "MEGA X: molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms", Molecular biology and evolution, Vol 35, No 6, pp 1547-1549, Jun 2018 [42] B van Asch, L Pereira, F Pereira, P Santa-Rita, M Lima, A Amorim, "MtDNA diversity among four Portuguese autochthonous dog breeds: a finescale characterisation", BMC genetics, Vol 6, No 1, pp 1-8, Jun 2005 63 [43] K.S Kim, S.E Lee, H.W Jeong, J.H Ha, "The Complete Nucleotide Sequence of the Domestic Dog (Canis familiaris) Mitochondrial Genome", Molecular Phylogenetics and Evolution, Vol 10, No 2, pp 210-220, Oct 1998 [44] Trần Thị Bích Huy, Nguyễn Thành Cơng, Lê Tuấn Lộc, Trần Hồng Dũng, "Sự đa dạng di truyền chó Bắc Hà dựa vào đoạn trình tự 582bp vùng HV1 gen ti thể", Tạp chí Khoa học Cơng nghệ - Đại học Nguyễn Tất Thành, tập 8, 2019 PL1 PHỤ LỤC Phụ lục 1: Các hóa chất, dụng cụ, thiết bị sử dụng nghiên cứu Dụng cụ thiết bị Tên Hãng sản xuất Nước sản xuất Tủ đông lạnh -30 oC BD – 400 oC Trung Quốc Tủ mát oC LC – 633B Trung Quốc Tủ đông – 80 0C Panasonic Nhật Bản Máy ly tâm Panasonic Beckmancouter Bể điều nhiệt MB – 48P Daiqan – Hàn Quốc Nồi hấp vô trùng SA – 300 VF0 Sturdy – Đài Loan Máy đo pH HI 2211 Itanna – Roman Máy PCR Prime – Techne UK Bể điện di nguồn điện ESH 3300 Cosrort – Bỉ Bàn soi gel E2103 Cosrort – Bỉ Lò vi sóng nấu gel CMCV20-LMVIE Candy – Trung Quốc Máy vortex SA8 Bibby – Anh Cân phân tích 1281080347 oHaus – Mỹ Máy nước cất lần AQUA – ON4D LABSILL - Ấn độ Tủ cấy vơ trùng HUY HỒNG Việt Nam Tủ cấy HUY HOÀNG Trung Quốc Eppendorf Đức Micropipette (100 - 1,000 µL; 10 – 100 µL; – 20 µL; 0,5 – 10 µL) Đầu típ (1,000 µL; 100 µL;10 µL) Tube (2 ml; 1,5 ml; 0,2 ml) Axygen Mỹ PL2 2.Hóa chất tách chiết DNA Tên Mã hàng hóa Kit isolate DNA Hãng sản xuất BIO - 52066 BIOLINE – Anh Quốc 3.Hóa chất dùng kĩ thuật PCR Tên Mã hàng hóa Hãng sản xuất My Taq TM Mix BIO - 25041 Mồi 15412F Lot #: 070418_A01_E1 PHUSA – Việt Nam Mồi 16625R Lot #: 070418_A01_F1 PHUSA – Việt Nam Mồi 16114R Lot #: 070418_A01_G2 PHUSA – Việt Nam BIOLINE – Anh Quốc 4.Hóa chất điện di Tên Mã hàng hóa Hãng sản xuất Agarose 1168020025 Merck KGaA – Đức 1001899819 Sigma – Mỹ APOD007102 GenOn – Đức 612-278-00-6 Merck KGaA – Đức BIO - 33053 BIOLINE – Anh Quốc BIO - 33054 BIOLINE – Anh Quốc Đệm TBE 1X (Tris – Borate – EDTA) Đệm nạp mẫu DNA: loading buffer 6X Ethidium Bromide Kb DNA Ladder Marker 50 bp DNA Ladder Marker PL3 Phụ lục 2: Danh sách mẫu chó H’Mơng cộc sử dụng đề tài Mẫu Địa điểm Quận Màu lông Giới tính CH1 Hà Nội Ba Vì Trắng Cái CH2 Hà Nội Ba Vì Vện đỏ Cái CH3 Hà Nội Ba Vì Vện đỏ Cái CH4 Hà Nội Ba Vì Đỏ Đực CH5 Hà Nội Ba Vì Đỏ Cái CH6 Hà Nội Ba Vì Đỏ Cái CH7 Hà Nội Ba Vì Đỏ Đực CH8 Hà Nội Ba Vì Đỏ Cái CH9 Hà Nội Ba Vì Vàng Cái CH10 Hà Nội Ba Vì Đỏ Cái CH11 Hà Nội Ba Vì Đen Đực CH12 Hà Nội Ba Vì Đen Đực CH13 Hà Nội Ba Vì Vàng Đực CH14 Hà Nội Ba Vì Đen Đực CH15 Hà Nội Ba Vì Vàng Đực CH16 Hà Nội Ba Vì Vện Cái CH17 Hà Nội Ba Vì Đỏ Cái CH18 Hà Nội Ba Vì Vện Cái CH19 Hà Nội Ba Vì Vàng Cái CH20 Hà Nội Ba Vì Đen Cái CH21 Hà Nội Ba Vì Vện Cái CH22 Hà Nội Long Biên Đỏ Cái CH23 Hà Nội Đống Đa Đỏ Cái CH24 Hà Nội Đống Đa Đen Cái CH25 Hà Nội Đống Đa Đen Cái CH26 Hà Nội Đống Đa Vàng Cái CH27 Hà Nội Đống Đa Đen Cái CH28 Hà Nội Đống Đa Vàng Cái CH29 Hà Nội Đống Đa Đỏ Cái CH30 Hà Nội Cầu Giấy Đỏ Cái CH31 Hà Nội Long Biên Vàng Cái CH32 Hà Nội Đông Anh Đỏ Cái PL4 CH33 Hà Nội Đông Anh Đỏ Cái CH34 Hà Nội Đông Anh Đỏ Cái CH35 Hà Nội Tây Hồ Vàng Cái CH36 Hà Nội Bắc Từ Liêm Vện Đực CH37 Hà Nội Bắc Từ Liêm Vện Đực CH38 Hà Nội Bắc Từ Liêm Vện Cái CH39 Hà Nội Bắc Từ Liêm Vện Cái CH40 Hà Nội Bắc Từ Liêm Đỏ Đực CH41 Hà Nội Gia Lâm Đen Cái CH42 Hà Nội Gia Lâm Vàng Cái CH43 Hà Nội Gia Lâm Vàng Cái CH44 Hà Nội Gia Lâm Đen Cái CH45 Hà Nội Gia Lâm Vện Cái CH46 Hà Nội Gia Lâm Đen Cái CH47 Hà Nội Gia Lâm Vàng Cái CH48 Hồ Chí Minh Trắng Đực CH49 Hồ Chí Minh Trắng Cái CH50 Hồ Chí Minh Đen Đực CH51 Hồ Chí Minh Vện Cái CH52 Hồ Chí Minh Đen Đực CH53 Hồ Chí Minh Vện Cái CH54 Hồ Chí Minh Đen Đực CH55 Hồ Chí Minh Đen Đực PL5 Phụ lục 3: Danh sách mẫu chó H’Mơng cộc thu thập sử dụng đề tài Giới Màu Loại tính sắc mẫu STT Kí hiệu VH00 Đực VH01 Cái Vàng Lông VH06 Đực Đen Lông VH07 Cái VH08 Đực Nâu Lông VH09 Cái Đen Lông VH10 Cái Vàng Lông VH13 Đực Trắng vàng Trắng đen Vàng đen Lông Lông Lông Đen VH14 Đực đốm Lông trắng 10 VH15 Đực Đen Lông Trắng11 VH16 Đực đốm Lông đen 12 TN06 Đực Vện Lông Địa Xã Vĩnh Thuận, huyện Tân Hưng, Long An Xã Bình Châu, huyện Vĩnh Hưng, Long An Xã Thái Trị, Huyện Vĩnh Hưng, Long An Xã Vĩnh Thuận, huyện Tân Hưng, Long An Xã Vĩnh Thuận, huyện Tân Hưng, Long An Xã Thái Trị, huyện Vĩnh Hưng, Long An Xã Vĩnh Thuận, huyện Tân Hưng, Long An Xã Vĩnh Thuận, huyện Tân Hưng, Long An Xã Vĩnh Thuận, huyện Tân Hưng, Long An Xã Bình Châu, huyện Vĩnh Hưng, Long An Xã Bình Châu, huyện Vĩnh Hưng, Long An Huyện Tân Châu, tỉnh PL6 Tây Ninh 13 TN11 Cái Vàng Lông 14 TN12 Cái Vàng Lông 15 TN16 Đực Vện Lông Đen16 TN17 Cái đốm Lông vàng 17 TN18 Đực 18 TN19 Đực 19 TN20 Cái Vàng đen Đen Trắng đen Lông Huyện Tân Châu, tỉnh Tây Ninh Huyện Dương Minh Châu, Tây Ninh Huyện Tân Châu, tỉnh Tây Ninh Huyện Tân Châu, tỉnh Tây Ninh Huyện Tân Châu, tỉnh Tây Ninh Lông Tây Ninh Lông Tây Ninh PL7 Phụ lục 4: Kết quang 55 mẫu chó H’Mơng cộc đề tài STT Mẫu CH1 Nồng độ DNA OD 260/280 OD 260/230