Khảo sát tác dụng phối hợp của colistin với meropenem trên acinetobacter baumannii mang nhóm gene đề kháng carbapenem

ĐẠI HỌC QUỐC GIA TP.HCM TRƢỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA - - PHAN THỊ VÂN ANH KHẢO SÁT TÁC DỤNG PHỐI HỢP CỦA COLISTIN VỚI MEROPENEM TRÊN ACINETOBACTER BAUMANNII MANG NHÓM GENE ĐỀ KHÁNG CARBAPENEM Chuyên ngành: Công Nghệ Sinh Học Mã số: 60420201 LUẬN VĂN THẠC SĨ TP HỒ CHÍ MINH, tháng năm 2018 Cơng trình hồn thành tại: Trƣờng Đại học Bách Khoa – ĐHQG-HCM Cán hướng dẫn khoa học : PGS.TS Nguyễn Thúy Hương Chữ ký : ………………………………………… Cán chấm nhận xét 1: PGS.TS Nguyễn Tiến Thắng Chữ ký : ………………………………… Cán chấm nhận xét : TS Hoàng Anh Hoàng Chữ ký : ……………………………………… Luận văn thạc sĩ bảo vệ Trường Đại học Bách Khoa, ĐHQG Tp HCM ngày 12 tháng 01 năm 2018 Thành phần Hội đồng đánh giá luận văn thạc sĩ gồm: (ghi rõ họ, tên, học hàm, học vị Hội đồng chấm bảo vệ luận văn thạc sĩ) PGS.TS Lê Thị Thủy Tiên - Chủ tịch PGS.TS Nguyễn Tiến Thắng - Phản biện TS Hoàng Anh Hoàng - Phản biện TS Võ Đình Lệ Tâm - Uỷ viên TS Huỳnh Ngọc Oanh - Uỷ viên, Thư ký Xác nhận Chủ tịch Hội đồng đánh giá LV Trưởng Khoa quản lý chuyên ngành sau luận văn sửa chữa (nếu có) CHỦ TỊCH HỘI ĐỒNG TRƯỞNG KHOA KỸ THUẬT HÓA HỌC ĐẠI HỌC QUỐC GIA TP.HCM TRƢỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc lập - Tự - Hạnh phúc NHIỆM VỤ LUẬN VĂN THẠC SĨ Họ tên học viên: Phan Thị Vân Anh MSHV: 7140281 Ngày, tháng, năm sinh: 07-10-1988 Nơi sinh: Đồng Tháp Chuyên ngành: Công nghệ sinh học Mã số: 60420201 I TÊN ĐỀ TÀI: Khảo sát tác dụng phối hợp Colistin với Meropenem Acinetobacter baumannii mang nhóm gene đề kháng carbapenem II NHIỆM VỤ VÀ NỘI DUNG: Xác định tỷ lệ gene mã hóa enzyme thủy phân carbapenem nhóm B nhóm D A.baumannii ; Đánh giá tình hình đề kháng kháng sinh A.baumannii Khảo sát tác dụng việc phối hợp kháng sinh Meropenem với Colistin A.baumannii mang nhóm gene đề kháng carbapenem Bệnh viện Đa Khoa Thống Nhất, Đồng Nai III NGÀY GIAO NHIỆM VỤ: 11/12/2016 IV NGÀY HOÀN THIỆN NHIỆM VỤ: 05/12/2017 V CÁN BỘ HƢỚNG DẪN: PGS.TS Nguyễn Thúy Hương Tp HCM, ngày 12 tháng 01 năm 2018 CÁN BỘ HƯỚNG DẪN CHỦ NHIỆM BỘ MƠN ĐÀO TẠO TRƯỞNG KHOA KỸ THUẬT HĨA HỌC Lời cảm ơn Em xin bày tỏ lịng kính trọng biết ơn sâu sắc đến gia đình ba mẹ hai bên, gửi đến anh Vĩnh đồng hành, động viên ủng hộ em, tạo điều kiện thật tốt cho em học hành, bên em chỗ dựa tinh thần quí giá em Em xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành sâu sắc đến cô PGS.TS Nguyễn Thúy Hương, người tận tụy hướng dẫn khoa học , giúp đỡ tạo điều kiện tốt để em hồn thành luận văn Em xin chân thành gởi lời cảm ơn đến - Ban giám hiệu, Phòng Đào tạo Sau Đại học, Khoa Kỹ Thuật Hóa Học thầy môn Công Nghệ Sinh Học - Trường Đại học Bách Khoa TPHCM tạo điều kiện hỗ trrợ em suốt q trình học tập hồn thành luận văn - Ban giám đốc, Phòng Tổ chức cán bộ, Khoa Vi Sinh - Bệnh viện Đa khoa Thống Nhất, Đồng Nai, gởi lời cảm ơn đến anh Nguyễn Sĩ Tuấn - cảm ơn anh tạo điều kiện, hướng dẫn tận tình để có kết thành công luận văn Cuối em xin chân thành cảm ơn người thân, bạn bè đồng nghiệp động viên em nhiều trình học tập nghiên cứu TPHCM, ngày 23 tháng 11 năm 2017 Phan Thị Vân Anh TÓM TẮT LUẬN VĂN Hiện nay, nhiễm khuẩn bệnh viện nguyên nhân gây tỷ lệ mắc, tử vong cao cho bệnh nhân bệnh viện vi khuẩn kháng đa kháng sinh gây nên Trong Acinetobacter baumannii xem vi khuẩn gây bệnh hội chủ yếu chúng có khả thích ứng với mơi trường sống đa dạng Vài năm gần đây, carbapenem định điều trị trường hợp nhiễm khuẩn nặng gây vi khuẩn Gram âm làm bùng phát mạnh khả gây nhiễm khuẩn bệnh viện kháng đa kháng sinh, A.baumannii sử dụng nhiều chế đề kháng carbapenem, có khả hình thành emzyme carbapenemase thủy phân carbapenem Enzyme carbapenemase tổng hợp A.baumannii chủ yếu gen OXA 23, OXA 51, OXA 58 thuộc nhóm D gen NDM-1 (New delhi metallo β-lactamase 1) thuộc nhóm B Việc sử dụng colistin phối hợp meropenem hay imipenem điều trị Việt Nam bác sĩ định có dấu hiệu nhiễm trùng nặng, nhiễm trùng tác nhân vi khuẩn kháng diện rộng hay kháng tồn Vì colistin có khả gây rối loạn chức màng bào tương kháng sinh nhóm β-lactama gây ức chế tổng hợp vách tế bào vi khuẩn tạo điều kiện thuận lợi cho kháng sinh khác tiếp cận đích tác dụng Từ nhóm chúng tơi đưa mục tiêu xác định tỷ lệ gene mã hóa enzyme thủy phân carbapenem nhóm B nhóm D đánh giá tình hình đề kháng kháng sinh A.baumannii, làm tiền đề khảo sát tác dụng việc phối hợp kháng sinh Meropenem với Colistin A.baumannii mang nhóm gene đề kháng carbapenem Bệnh viện Đa Khoa Thống Nhất, Đồng Nai Kết thu được: gene blaOXA-23 chiếm 70,20%; gene blaOXA-51 chiếm 95,91%; gene blaOXA-58 chiếm 8,57%; gene blaNDM-1 chiếm 2,45% Với 245 chủng A.baumannii khảo sát kháng hầu hết 90% kể IMP (94,40%), MEM (93,20%), ngoại trừ NET (74%), Colistin nhạy 100% Trong 15 kháng sinh sử dụng A baumannii kháng với 13 kháng sinh mức 90% tất kháng sinh nhóm β-lactam thử nghiệm bị kháng 90% Mức độ tác động A baumannii mang gen kháng carbapenem khảo sát tác dụng phối hợp kháng sinh Meropenem/Colistin thu kết sau cộng hợp (42,5%), hiệp đồng (55%) độc lập (2,5%) SUMMARY At present, hospital infections are one of the causes of high morbidity and mortality among patients at hospitals caused by multidrug-resistant bacteria Whereas Acinetobacter baumannii are considered opportunistic pathogens due to their ability to adapt to diverse habitats In the last few years, carbapenem has been prescribed for the treatment of severe infections caused by Gram-negative bacteria, which have led to widespread outbreaks of nosocomial infection and multi-antibiotic resistance, which has been widely used by A.baumannii The carbapenem-resistant mechanism, which has the potential to form carbohydrate carbapenemase-mediated carbamate The carbapenemase enzyme synthesized in A.baumannii is mainly composed of the OXA 23, OXA 51, OXA 58 genes in group D and the NDM-1 gene (New delhi metallo β-lactamase 1) in group B The use of meristem plus meropenem or imipenem in treatment in Vietnam is currently prescribed by your doctor for signs such as severe infection, infection by a broad-spectrum antibiotic or complete resistance Because colistin is capable of causing plasma membrane dysfunction and β-lactama antibiotics to inhibit the synthesis of bacterial cell walls, it is advantageous for other antibiotics to reach the target The team then set out to determine the percentage of genes that encode carbapenem groups B and D, and to assess the antibiotic resistance of A.baumannii Antibiotics between Meropenem and Colistin on A.baumannii carry carbapenem resistance gene at Thong Nhat General Hospital, Dong Nai Results obtained: gene blaOXA-23 accounted for 70,20%; gene blaOXA-51 accounts for 95,91%; gene blaOXA-58 accounts for 8,57%; The blaNDM-1 gene accounts for 2,45% 245 strains of A.baumannii were tested for resistance of almost 90%, including IMP (94,40%), MEM (93,20%), except NET (74%), Colistin was 100% sensitive Of the 15 antibiotics used, A baumannii was resistant to 13 antibiotics at levels above 90% and all tested βlactam antibiotics were more than 90% resistant The effect of A baumannii on the carbapenem resistance gene in combining the effects of Meropenem / Colistin combination (42,5%), synergistic (55%) and independence 2,5%) LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu tơi thực hướng dẫn khoa học, hướng dẫn thực nghiệm PGS.TS Nguyễn Thúy Hương TS Nguyễn Sĩ Tuấn Các số liệu, hình ảnh kết nghiên cứu luận văn trung thực chưa công bố cơng trình khác Tác giả Phan Thị Vân Anh MỤC LỤC Danh mục bảng i Danh mục biểu đồ ii Danh mục hình ảnh iii Danh mục viết tắt iv Chƣơng ĐẶT VẤN ĐỀ Chƣơng TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1 Giới thiệu chung Acinetobacter baumannii 2.1.1 Đặc điểm chung 2.1.2 Đặc điểm sinh học Acinetobacter baumannii 2.1.3 Nguồn lây đường lây Acinetobacter baumannii 2.2 Kháng sinh nhóm carbapenem colistin đƣợc sử dụng điều trị Acinetobacter baumannii 2.2.1 Giới thiệu nhóm carbapenem 2.2.1.1 Cấu tạo hóa học 2.2.1.2 Cơ chế tác dụng 10 2.2.1.3 Các enzyme phân giải nhóm carbapenem 11 2.2.1.4 Cơ chế đề kháng carbapenem Acinetobacter baumannii 13 2.2.2 Giới thiệu colistin 16 2.2.2.1 Cấu trúc hóa học 16 2.2.2.2 Phổ tác dụng 17 2.2.2.3 Cơ chế tác dụng 17 2.2.2.4 Cơ chế đề kháng 18 2.2.3 Phối hợp điều trị 19 2.3 Tình hình đề kháng carbapenem Acinetobacter baumannii giới nƣớc 20 Chƣơng ĐỐI TƢỢNG, VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 26 3.1 Đối tƣợng nghiên cứu 26 3.2.Địa điểm thời gian nghiên cứu 26 3.3 Vật liệu nghiên cứu 26 3.4 Phƣơng pháp nghiên cứu 26 3.4.1 Sơ đồ nghiên cứu tổng quát 26 3.4.2 Thuyết minh sơ đồ 28 3.4.2.1 Phân lập định danh 28 3.4.2.2 Định danh hệ thống tự động BD PheonixTM 28 3.4.2.3 Định danh Acinetobacter baumannii sinh học phân tử 29 3.4.2.4 Xác định tỷ lệ gen mã hóa enzyme thủy phân carbapenem nhóm D gen New-Delhi Metallo-beta lactamase 32 3.4.2.5 Đánh giá tình hình đề kháng kháng sinh Acinetobacter baumannii 33 3.4.2.6 Khảo sát tác dụng việc phối hợp kháng sinh Meropenem Colistin Acinetobacter baumannii mang gen kháng carbapenem phương pháp vi pha loãng 33 3.5 Phƣơng pháp xử lý số liệu 34 Chƣơng KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BIỆN LUẬN 35 4.1 Kết phân lập, định danh chủng Acinetobacter baumannii 35 4.2 Định danh 16S sinh học phân tử 37 4.3 Đánh giá tình hình đề kháng kháng sinh Acinetobacter baumannii 40 4.3.1 Tỷ lệ kháng kháng sinh Acinetobacter baumannii hệ thống tự động 40 4.3.2 Tỷ lệ gen mã hóa enzyme thủy phân carbapenem nhóm D gen NewDelhi Metallo-beta lactamase 44 4.4 Khảo sát tác dụng việc phối hợp kháng sinh Meropenem Colistin Acinetobacter baumannii mang gen kháng carbapenem phương pháp vi pha loãng 46 Chƣơng KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 50 5.1 Kết luận 50 5.2 Kiến nghị 50 TÀI LIỆU THAM KHẢO 52 PHỤ LỤC 60 11 Trần Thị Thu Hằng, Dược Lực Học (tái lần thứ 18), TPHCM, Nxb Phương Đông, 2014, tr 740 – 741 12 Tống Văn Khải cộng sự, “Xác định tỷ lệ nhiễm khuẩn bệnh viện yếu tố liên quan bệnh nhân năm điều trị khoa Hồi Sức Tích Cực - Chống Độc Bệnh viện Đa Khoa Thống Nhất năm 2014,” Kỹ yếu nghiên cứu khoa học bệnh viện đa khoa Thống Nhất Đồng Nai, pp.2–13, 2014 Tài liệu tiếng Anh 13 A K Churchman, “Book Reviews,” Society, vol 43, no 4, pp 709–749, 2001 14 Anton Y Peleg et al, “Acinetobacter baumannii: Emergence of a Successful Pathogen”, Clin Microbiol Rev, vol 21(3), pp 538–582, 2008 15 Adrian Streinu-Cercel, Editor-in-Chief, “Colistin in the management of severe infections with multidrug resistant Gram-negative bacilli”, Germs, vol 4(1): 7–8, 2014 16 Benjamin A Evans and Sebastian G B Amyes, “OXA β - Lactamases”, Clin Microbiol Rev, vol 27(2), pp 241-263, 2014 17 Briana R Wilson et al, “Siderophores in Iron Metabolism: From Mechanism to Therapy Potential”, Trends in Molecular Medicine, vol 22, p1077-1090, 2016 18 Bergen P J., Bulman Z P et al, "(Polymyxin combinations: pharmacokinetics and pharmacodynamics for rationale use", Pharmacotherapy, 35(1), pp 34-42, 2015 19 K Buildings et al ,“BBUHEH ~ UAL lLETTER,” Biochem J., vol 276, no December 1990, pp 1990–1991,1991 20 C Wendt et al, “Survival of on dry surfaces”, J Clin Microbiol, vol 35, no 6, pp 1394-1397, June 1997 21 Dongeun Yong et al, “Characterization of a New Metallo-β-Lactamase Gene, blaNDM-1, and a Novel Erythromycin Esterase Gene Carried on a Unique Genetic Structure in Klebsiella pneumoniae Sequence Type 14 from India”, Antimicrob Agents Chemother, vol 53 no 12, 2009 53 22 Dinobandhu Nandi and Anania , “Acinetobacter main cause of hospital acquired infections: a review”, Asian J Pharm Clin Res, Vol 10, Issue 5, p 53-56, 2017, 23 Dorsey CW et al, “The siderophore-mediated iron acquisition systems of Acinetobacter baumannii ATCC 19606 and Vibrio anguillarum 775 are structurally and functionally related”, Microbiology, vol 150, pp3657-3667, 2004 24 E Bergogne-Bérézin and K J Towner, “Acinetobacter spp as nosocomial pathogens: Microbiological, clinical, and epidemiological features,” Clin Microbiol Rev., vol 9, no 2, pp 148–165, 1996 25 for Falagas M E., Kasiakou S K, "Colistin: the revival of polymyxins the management of multidrug-resistant gram-negative bacterial infections", Clin Infect Dis, vol 40(9), pp 1333-41, 2005 26 F R Grupper M et al, “Attributable Mortality of Nosocomial Acinetobacter Bacteremia,” Infect Control Hosp Epidemiol., p 28 (3), p.293–299., 2007 27 Federico Perez et al, “Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii and Klebsiella pneumoniae across a hospital system: impact of postacute care facilities on dissemination”, J Antimicrob Chemother; vol 65(8): 1807–1818, 2010 28 Gales A C., Reis A O., et al, "Contemporary assessment of antimicrobial susceptibility testing methods for polymyxin B and colistin: review of available interpretative criteria and quality control guidelines", J Clin Microbiol, 39(1), pp 183-90, 2001 29 Goldstein, F W et al, “Transferable plasmid-mediated antibiotic resistance in Acinetobacter”, Plasmid, vol 10, pp 138-147, 1983 30 Gupta S., Govil D., et al Colistin and polymyxin B: A re-emergence, Indian J Crit Care Med,vol 13(2), pp.49-53, 2009 31 Harald Seifert Anton Y Peleg, David L Paterson, “Acinetobacter baumannii: Emergence of a Successful Pathogen”, Clinical Biology Review, vol 21, pp 538-582, 2008 54 32 Holly Hoffman-Roberts et al, “National Prevalence of Multidrug- Resistant Acinetobacter baumannii Infections in the Ambulatory and Acute Care Settings, Including Carbapenem-Resistant Acinetobacter Infections, in the United States in 2015”, Open Forum Infectious Diseases, Volume 3, December 2016, 33 Hogardt M., Schmoldt S., et al, "Pitfalls of polymyxin antimicrobial susceptibility testing of Pseudomonas aeruginosa isolated from cystic fibrosis patients", J Antimicrob Chemother, 54(6), pp 1057-61, 2004 34 Iain Abbott and Anton Y Peleg, “Acinetobacter baumannii and J hospital infections”, Microbiology Australia, march 2014 35 O Investigation, “Rapid Spread of Carbapenem-Resistant,” vol 165, pp.1430– 1435, 2006 36 J W Decousser et al, “Outbreak of NDM-1-producing Acinetobacter baumannii in France, January to May 2013”, Europe’s journal on infectious disease epidemiology, prevention and control; Vol 18; pp 2-5, 2013 37 Jennifer A Gaddy and Luis A Actis, “Regulation of Acinetobacter baumannii biofilm formation”, Future Microbiol, vol 4: 273–278, 2009 38 Jennifer H Moffatt et al, “Colistin Resistance in Acinetobacter baumannii Is Mediated by Complete Loss of Lipopolysaccharide Production”, Antimicrobial Agents And Chemotherapy, p.4971–4977, 2010 39 Jessica M Breslow et al, “Innate Immune Responses to Systemic Acinetobacter baumannii Infection in Mice: Neutrophils, but Not Interleukin-17, Mediate Host Resistance”, Infection and immunity, p.3317–3327, 2011 40 Jeong Ho Jeon et al, « Structural Basis for Carbapenem-Hydrolyzing Mechanisms of Carbapenemases Conferring Antibiotic Resistance”, Int J Mol Sci, vol 16(5), pp 9654–9692, 2015 May; 41 K Prashanth et al, “Antibiotic Resistance, Biofilms and Quorum Sensing in Acinetobacter Species,” Antibiot Resist Bact - A Contin Chall New Millenn, pp.180–212, 2012 55 42 S D Kotsakis et al,“Comparative biochemical and computational study of the role of naturallyoccurring mutations at ambler positions 104 and 170 in GES ??-lactamases,”Antimicrob Agents Chemother., vol 54, no 11, pp 4864– 4871, 2010 43 Levin AS, Barone AA, Penỗo J, et al Intravenous colistin as therapy for nosocomial infections caused by multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii Clin Infect Dis, vol 28, 1999 44 Lisa L Maragakis and Trish M Perl,” Acinetobacter baumannii: Epidemiology, Antimicrobial Resistance and Treatment Options”, Antimicrobial Resistance; vol 46, pp 1254 – 1263, 2008 45 Lihua Qi et al “Relationship between Antibiotic Resistance, Biofilm Formation, and Biofilm-Specific Resistance in Acinetobacter baumanni”, Front Microbiol, vol 12, April 2016 46 Maryam Mohammadi et ai, “Synergistic Effect of Colistin and Rifampin Against Multidrug Resistant Acinetobacter baumannii: A Systematic Review and MetaAnalysis”, The Open Microbiology Journal, vol 11, pp 63-71, 2017 47 Michalopoulos AS, Tsiodras S, Rellos K, et al Colistin treatment in patients with ICU-acquired infections caused by multiresistant Gram-negative bacteria: the renaissance of an old antibiotic Clin Microbiol Infect, vol 11, 2005 48 Micheli Medeiros; Nilton Lincopan,”Oxacillinase (OXA)-producing Acinetobacter baumannii in Brazil: clinical and environmental impact and therapeutic options”, J Bras Patol Med Lab, vol.49, pp 391-405, 2013 49 Micheline A H Soudeiha1 et al, “In vitro Evaluation of the Colistin- Carbapenem Combination in Clinical Isolates of A baumannii Using the Checkerboard, Etest, and Time-Kill Curve Techniques”, Front Cell Infect Microbiol, Vol 7, pp 1-10, May 2017, 50 MM Kock et al, “Prevalence of carbapenem resistance genes in Acinetobacter baumannii isolated from clinical specimens obtained from an academic hospital in South Africa”, South Afr J Epidemiol Infect, vol 28, pp 2832, 2013 56 51 S Marqué, L Poirel, C Héritier, S Brisse, M D Blasco, R Filip, G Coman, T Naas, and P Nordmann, “Regional occurrence of plasmidmediated carbapenem-hydrolyzing oxacillinase OXA-58 in Acinetobacter spp in Europe,” J Clin Microbiol., vol 43, no 9, pp 4885–4888, 2005 52 D.L.A.P.L.Nordmann P, “Carbapenem resistance in Enterobacteriaceae:here is the storm,” Trends Mol Med., pp 263–272, 2012 53 Nordmann P et al, “Global Spread of Carbapenemase- producing Enterobacteriaceae”, Emer Infect Dis, vol.17, pp 1791-1797, 2011, 54 Nordmann and L Poirel, “Emerging carbapenemases in Gram negative aerobes”, Clin Microbiol Infect, vol.8, pp 321-331, 2002 55 Ntobeko B.A Ntusi et al, “ICU-Associated Acinetobacter baumannii Colonisation / Infection in a High HIV - Prevalence Resource -Poor Setting”, Plos One, Vol 7, Issue 12, December 2012 56 Parviz Vahdani et al, “Hospital acquired antibiotic-resistant Acinetobacter baumannii infections in a 400-bed hospital in Tehran, Iran”, International Journal of Preventive Medicine, vol 2(3), pp 127-130, 2011 57 Pawel Nowak et al, “Distribution of blaOXA genes among carbapenem- resistant Acinetobacter baumannii nosocomial strain in Poland”, New Microbiologica, vol 35, pp 317-325, 2012 58 Pilar Villalo´n et al, “Epidemiology of the Acinetobacter-derived cephalosporinase, carbapenem-hydrolysing oxacillinase and metallo-β- lactamase genes and of common insertion sequences, in epidemic clones of Acinetobacter baumannii from Spain”, J Antimicrob Chemother, vol 68, pp 550– 553; 2013 59 Pintip Pongpech et al, “Antibacterial Activity of Carbapenem-Based Combinations Againts Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii”, Journal of the medical association of Thailand, Vol 93, No 2, 2010 60 Poirel L, Nordmann P, “Carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii: mechanisms and epidemiology”, Clin Microbiol Infect, vol 12(9), pp 826-36, 2006 57 61 A M Queenan et al, “SME-3, a novel member of the Serratia marcescens SME family of carbapenem-hydrolyzing ??-lactamases,” Antimicrob Agents Chemother.,vol 50, no 10, pp 3485–3487, 2006, 62 Rémy A Bonnin et al, “Wide Dissemination of GES-Type Carbapenemases in Acinetobacter baumannii Isolates in Kuwait”, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, vol 57, pp 183–188, 2013 63 Rice LB, “The clinical consequences of antimicrobial resistance”, Curr Opin Microbiol, vol 12, pp 476–481, 2009 64 Roger L Nation and Jian Li, “Colistin in the 21st Century”, Curr Opin Infect Dis, vol 22(6), pp 535–543, 2009 65 Silpak Biswas, Jean-Michel Brunel, et al (2012), "Colistin: An Update on the Antibiotic of the 21st Century", Expert Rev Anti Infect Ther, vol 10(8), pp 917-934, 2012 66 Suresh G Joshi, Geetanjali M Litake, “Acinetobacter baumannii: An emerging pathogenic threat to public health”, World J Clin Infect Dis, vol.3, pp 25-36, 2013 67 Susan Brown Sebastian Amyes, “OXA β-lactamases in Acinetobacter: the story so far”,Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Volume 57, Issue 1, Pages 1–3,January 2006, 68 Tjernberg I, Ursing J, “Clinical strains of Acinetobacter classified by DNA- DNA hybridization”, APMIS, vol 97(7), pp 595-605, Jul 1989 69 Vikas Manchanda, Sinha Sanchaita and NP Sing, “Multidrug Resistant Acinetobacter”, J Glob Infect Dis, vol 2(3), pp 291–304, 2010 70 World Health Organization, Prevention of hospital-acquired infections, Practise Guide, 2002 71 Y Lee et al, “Role of OXA-23 and AdeABC efflux pump for acquiring carbapenem resistance in an Acinetobacter baumannii strain carrying the blaOXA-66 gene,” Ann Clin Lab Sci., vol 40, no 1, pp 43–48, 2010 58 72 Yvonne Pfeifer et al, “Molecular characterization of blaNDM-1 in an Acinetobacter baumannii strain isolated in Germany in 2007”, Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 66(9), pp 1998-2001, 2011 73 H Yigit et al, “Novel Carbapenem-Hydrolyzing ␤ -Lactamase , KPC-1 , from aCarbapenem-Resistant Strain of Klebsiella pneumoniae,” vol 45, no 4, pp.1151–1161, 2001 74 D Yong, M A Toleman, C G Giske, H S Cho, K Sundman, K Lee, and T R Walsh, “Characterization of a new metallo-beta-lactamase gene, bla NDM-1, and a novel erythromycin esterase gene carried on a unique genetic structure in Klebsiella pneumoniae sequence type 14 from India,”Antimicrob Agents Chemother., vol 53, no 12, pp 5046–5054, 2009 75 Xinlong He et al, “Biofilm Formation Caused by ClinicalAcinetobacter baumannii Isolates Is Associated with Overexpression of the AdeFGH Efflux Pump”, Antimicrob Agents Chemother, vol 59 no 4817-4825, August 2015 76 Z.Zhao, W.H.,and Hu, “IMP-type metallo-blactamases in Gram-negative bacilli: distribution, phylogeny, and association with integrons,” Crit Rev.Microbiol, vol 37, p 214–226., 2011 77 N Woodford and H K Young, “Letters to the Editor,” Society, vol 50, no.1, pp 399–400, 2006 78 Vien Le Minh et al, “In vitro activity of colistin in antimicrobial combination against carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolated from patients with ventilator-associated pneumonia in Vietnam”, J Med Microbiol ; vol 64, pp 1162–1169, 2015 Nguồn từ Internet 79 http://tmedweb.tulane.edu/pharmwiki/doku.php/glycopeptide_pharm 80 http://www.drugfuture.com/pharmacopoeia/usp32/pub/data/v32270/usp32nf 27s0_m19920.html 59 Phụ lục - Kết Quả Xác Định Mức Độ Mang Gene 16S OXA OXA OXA NDM 51 58 23 16S OXA OXA OXA NDM 51 58 23 - + - A001 + + - + - A027 + + A002 + + + - + A028 + + - A003 + + - + - A029 + + - + - A004 + + - + - A030 + + - + - A005 + + - + - A031 + + - - - A006 + + - + - A032 + + - - - A007 + + - + - A033 + + - + - A008 + + - + - A034 + + - + - A009 + + - + - A035 + + - A010 + - - - - A036 + + - + - A011 + + - - - A037 + + - + - A012 + + - + - A038 + + - - A013 + + - + - A039 + + - - - A014 + + - + - A040 + + - + - A015 + + - + - A041 + + - + - A016 + + - + - A042 + + - + - A017 + + - - - A043 + + - + - A018 + + - + - A044 + + - + - A019 + + - - - A045 + + - + - A020 + + - + - A046 + + - + - A021 + + - + - A047 + + - + - A022 + + - - + A048 + + - A023 + + - + - A049 + + - + - A024 + + - - - A050 + + - + - A025 + + - + - A051 + + - + - A026 + + - + - A052 + + + - 60 + - + - + - - - 16S OXA OXA OXA NDM 51 58 23 16S OXA OXA OXA NDM 51 58 23 A053 + + - + - A080 + + + - - A054 + + - - - A081 + + + - - A055 + + + - - A082 + + - + - A056 + + + - - A083 + + - + - A057 + + + - - A084 + + - + - A058 + + - + - A085 + + - + - A059 + + - - - A086 + + - + - A060 + + - - - A087 + + - - - A061 + + - - - A088 + + - + - A062 + + - - - A089 + + + - - A063 + + - - - A090 + + - + - A064 + + + - - A091 + + - + - A065 + + - + - A092 + + - - - A066 + + - + - A093 + + - + - A067 + + - + - A094 + + - + - A068 + + - - - A095 + + - + - A069 + + - - - A096 + + - + - A070 + + - - - A097 + + - + - A071 + + - + - A098 + + - + - A072 + + - - - A099 + + - + - A073 + + - - - A100 + + - + - A074 + + - - - A101 + + - + - A075 + + - - - A102 + + - + - A076 + + - - - A103 + + - + - A077 + + - - - A104 + + - + - A078 + + - - - A105 + + - + - A079 + + - - - A106 + + - + - 61 16S OXA OXA OXA NDM 51 58 23 16S OXA OXA OXA NDM 51 58 23 A107 + + - - - A134 + + - + - A108 + + - - - A135 + + - + - A109 + + - - - A136 + + - + - A110 - A137 + + - + - A111 + + - + - A138 + + - + - A112 + + - + - A139 + + - - - A113 + + - + - A140 + + - + - A114 + + - + - A141 + + + - - A115 + + - + - A142 + + - + - A116 + + - + - A143 + + - + - A117 + + - + - A144 + + - + - A118 + + - + - A145 + + - - - A119 + + - + - A146 + + - + - A120 + + - + - A147 + + - + - A121 + + - + - A148 + + - + - A122 + + - + - A149 + - - - - A123 + + - + - A150 + + - + - A124 + + - + - A151 + + - + - A125 + + - + - A152 + + - + - A126 + + - - - A153 + + - + - A127 + + - + - A154 + + + - - A128 + + - + - A155 + + - - - A129 + + - + - A156 + + - - - A130 + + - + - A157 + + - + - A131 + + - - - A158 + + - + - A132 + + - + - A159 + + - + - A133 + + - + - A160 + + - - - - 62 16S OXA OXA OXA NDM 51 58 23 Â161 - A162 + + - + A163 + + - A164 + + A165 + A166 16S OXA OXA OXA NDM 51 58 23 A188 + + - + - - A189 + + - + - + - A190 + + - + - - + - A191 + + - + - + - + - A192 + + - + - + + - + - A193 + + - - - A167 + - + + - Á194 - A168 + + - + - A195 - A169 + + - + - A196 + + - + - A170 + + - + - A197 + + - + - A171 + - - - - A199 + + - + - A172 + + - - + A200 - A173 + + - - - A201 + + - + - A174 + + - + - A202 + + - + - A175 + + + - - A203 + + - + - A176 + + - + - A204 + + - + - A177 + + + - - A205 + + + + - A178 + + - - - A206 + + + + - A179 + - - - - A207 + + + + - A180 + + - + - A208 + + - + - A181 + + + + - A209 + + - + - A182 + + - + - A210 + + - + - A183 + + - + - A211 + + - + - A184 + + - + - A212 + + - + - A185 + - - - - A214 + + - + - A186 + + - + - A215 + + - + - A187 + + - - + A216 + + - + - 63 + 16S OXA OXA OXA NDM 51 58 23 16S OXA OXA OXA NDM 51 58 23 A217 + + - + - A234 + + - + - A218 + + - + - A235 + + - + - A219 + + - + - A236 + + - + - A220 + + - + - A237 + + - + - A221 + + - + - A238 + + - - - A222 + + - + - A239 + - - - - A223 + + - + - A240 + + - + - A224 + + - - + A241 + + - - - A225 + + - - + A242 + + - + - A226 + + - + - A243 + + - + - A227 + + - + - A244 + + - - - A228 + + - - - A245 + + - + - A229 + + - - - A246 + - - - - A230 + + - + - A247 + + - + - A231 + + - + - A248 + + - + - A232 + + + + - A249 + + - - - A233 + + - + - A250 + + + - - 64 Phụ Lục – Giá Trị FIC phối hợp Colistin Meropenem A.baumannii mang nhóm gene đề kháng carbapenem A001 KẾT LUẬN 0,75 Cộng hợp 26 A051 KẾT LUẬN 0,75 Cộng hợp A002 0,75 Cộng hợp 27 A052 0,375 Hiệp đồng A003 0,75 Cộng hợp 28 A053 0,375 Hiệp đồng A004 Cộng hợp 29 A057 0,25 Hiệp đồng A005 0,75 Cộng hợp 30 A064 Hiệp đồng A006 0,75 Cộng hợp 31 A065 0,75 Cộng hợp A007 Cộng hợp 32 A066 0,375 Hiệp đồng A008 0,75 Cộng hợp 33 A067 0,31 Hiệp đồng A009 Cộng hợp 34 A068 Hiệp đồng 10 A010 Cộng hợp 35 A081 Cộng hợp 11 A011 0,625 Cộng hợp 36 A087 Cộng hợp 12 A012 0,625 Cộng hợp 37 A089 Cộng hợp 13 A013 0,53 Cộng hợp 38 A101 Cộng hợp 14 A014 Cộng hợp 39 A102 0,5 Hiệp đồng 15 A015 0,5 Hiệp đồng 40 A103 0,625 Cộng hợp 16 A016 0,5 Hiệp đồng 41 A104 Cộng hợp 17 A018 0,5 Hiệp đồng 42 A105 Cộng hợp 18 A019 Cộng hợp 43 A106 1,25 Độc lập 19 A020 0,75 Cộng hợp 44 A107 0,375 Hiệp đồng 20 A022 1,5 Cộng hợp 45 A108 0,625 Cộng hợp 21 A028 0,31 Hiệp đồng 46 A109 0,5 Hiệp đồng 22 A029 0,375 Hiệp đồng 47 A111 0,375 Hiệp đồng 23 A030 0,375 Hiệp đồng 48 A112 Cộng hợp 24 A031 0,0375 Hiệp đồng 49 A113 0,75 Cộng hợp 25 A038 0,5 Hiệp đồng 50 A114 0,26 Hiệp đồng STT CODE FIC STT 65 CODE FIC 51 A115 KẾT LUẬN 1,25 Độc lập 52 A116 Cộng hợp STT CODE FIC STT CODE FIC KẾT LUẬN 77 A146 0,5 Hiệp đồng 78 A147 0,375 Hiệp đồng 53 A117 0,75 Cộng hợp 79 A148 0,75 Cộng hợp 54 A119 0,5 Hiệp đồng 80 A149 0,31 Hiệp đồng 55 A120 0,5 Hiệp đồng 81 A150 0,5 Hiệp đồng 56 A125 0,5 Hiệp đồng 82 A151 0,375 Hiệp đồng 57 A126 0,75 Cộng hợp 83 A152 0,75 Cộng hợp 58 A127 0,5 Hiệp đồng 84 A153 Hiệp đồng 59 A128 0,375 Hiệp đồng 85 A154 0,5 Hiệp đồng 60 A129 0,5 Hiệp đồng 86 A155 0,75 Cộng hợp 61 A130 0,75 Cộng hợp 87 A156 0,5 Hiệp đồng 62 A131 0,5 Hiệp đồng 88 A157 0,75 Cộng hợp 63 A132 0,5 Hiệp đồng 89 A158 0,5 Hiệp đồng 64 A133 0,5 Hiệp đồng 90 A159 0,5 Hiệp đồng 65 A134 0,75 Cộng hợp 91 A160 0,75 Cộng hợp 66 A135 0,5 Hiệp đồng 92 A162 Cộng hợp 67 A136 0,5 Hiệp đồng 93 A163 0,375 Hiệp đồng 68 A137 0,375 Hiệp đồng 94 A164 0,5 Hiệp đồng 69 A138 0,75 Cộng hợp 95 A165 0,5 Hiệp đồng 70 A139 0,5 Hiệp đồng 96 A166 0,5 Hiệp đồng 71 A140 0,375 Hiệp đồng 97 A167 0,75 Cộng hợp 72 A141 1,25 Độc lập 98 A168 0,75 Cộng hợp 73 A142 0,375 Hiệp đồng 99 A169 0,56 Cộng hợp 74 A143 Cộng hợp 100 A170 0,5 Hiệp đồng 75 A144 0,75 Cộng hợp 101 A171 0,31 Hiệp đồng 76 A145 0,75 Cộng hợp 102 A172 0,75 Cộng hợp 66 STT 103 104 105 106 107 108 109 110 111 CODE FIC A174 A175 A176 A177 A178 A179 A180 A181 A182 0,56 0,5 0,5 0,5 0,5 0,375 0,5 0,75 KẾT LUẬN STT Cộng hợp Hiệp đồng Hiệp đồng Hiệp đồng Hiệp đồng Hiệp đồng Hiệp đồng Hiệp đồng Cộng hợp 112 113 114 115 116 117 118 119 120 67 CODE FIC A183 A184 A185 A186 A187 A204 A207 A224 A225 0,75 0,5 0,5 0,5 0,375 0,5 0,375 0,5 0,28 KẾT LUẬN Cộng hợp Hiệp đồng Hiệp đồng Hiệp đồng Hiệp đồng Hiệp đồng Hiệp đồng Hiệp đồng Hiệp đồng ... carbapenem nhóm B nhóm D A .baumannii ; Đánh giá tình hình đề kháng kháng sinh A .baumannii Khảo sát tác dụng việc phối hợp kháng sinh Meropenem với Colistin A .baumannii mang nhóm gene đề kháng carbapenem. .. nêu,từ nhóm chúng tơi tiến hành nghiên cứu ? ?Khảo sát tác dụng phối hợp Colistin với Meropenem Acinetobacter baumannii mang nhóm gene đề kháng carbapenem? ?? -2- Với mục tiêu đề tài xác định tác dụng. .. TÊN ĐỀ TÀI: Khảo sát tác dụng phối hợp Colistin với Meropenem Acinetobacter baumannii mang nhóm gene đề kháng carbapenem II NHIỆM VỤ VÀ NỘI DUNG: Xác định tỷ lệ gene mã hóa enzyme thủy phân carbapenem