Phát hiện và mô tả các gen mã hóa cassiicolin trên các chủng corynes pora cassiicola (berkcurt ) wei phân lập tại việt nam

ĐẠI HỌC QUỐC GIA TP HCM TRƯỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA VĂN THỊ MỸ LINH PHÁT HIỆN VÀ MƠ TẢ CÁC GEN MÃ HỐ cassiicolin TRÊN CÁC CHỦNG Corynespora cassiicola (Berk & Curt.) Wei PHÂN LẬP TẠI VIỆT NAM Chuyên ngành: Công nghệ sinh học Mã số: 60 42 02 01 LUẬN VĂN THẠC SĨ Tp Hồ Chí Minh, tháng năm 2018 CƠNG TRÌNH ĐƢỢC HỒN THÀNH TẠI TRƯỜNG ĐẠI HỌC NƠNG LÂM ĐẠI HỌC QUỐC GIA TP HỒ CHÍ MINH Cán hướng dẫn khoa học: TS Nguyễn Bảo Quốc Cán chấm nhận xét 1: PGS.TS Nguyễn Thuý Hƣơng Cán chấm nhận xét 2: TS Lƣơng Thị Mỹ Ngân Luận văn thạc sỹ bảo vệ Trường Đại học Bách Khoa, Đại học Quốc gia TP Hồ Chí Minh ngày 21 tháng năm 2018 Thành phần hội đồng đánh giá Luận văn thạc sỹ gồm: PGS.TS Nguyễn Đức Lượng PGS.TS Nguyễn Thuý Hương TS Lương Thị Mỹ Ngân TS Phan Thị Huyền TS Hoàng Mỹ Dung Xác nhận Chủ tịch Hội đồng đánh giá Luận văn Trưởng khoa quản lý chuyên ngành sau luận văn sửa chữa (nếu có) CHỦ TỊCH HỘI ĐỒNG TRƢỞNG KHOA KỸ THUẬT HĨA HỌC ĐẠI HỌC QUỐC GIA TP.HCM TRƢỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc lập - Tự - Hạnh phúc NHIỆM VỤ LUẬN VĂN THẠC SĨ Họ tên học viên: Văn Thị Mỹ Linh MSHV: 7140861 Ngày, tháng, năm sinh: 02/05/1991 Nơi sinh: Lâm Đồng Chuyên ngành: Công nghệ sinh học Mã số: 60420201 TÊN ĐỀ TÀI I Phát mô tả gen mã hoá Cassiicolin chủng Corynespora cassiicola (Berk & Curt.) Wei phân lập Việt Nam II NHIỆM VỤ VÀ NỘI DUNG Mục tiêu nghiên cứu - Xác định phân nhóm gen mã hố cassiicolin chủng phân lập Việt Nam - Đánh giá tính gây độc nấm Corynespora cassiicola có độc tố cassiicolin khơng có độc tố cassiicolin số dịng vơ tính (DVT) cao su nhóm cấu giống cao su 2015-2020 Việt Nam xác định tính kháng bệnh số dịng vơ tính cao su - Xác định khả lây nhiễm chéo mẫu nấm Corynespora cassiicola phân lập từ cao su có độc tố cassiicolin khơng có độc tố cassiicolin đu đủ, cà chua khoai mì Nội dung nghiên cứu - Ly trích DNA nấm Corynespora cassiicola - Nhận biết nhóm độc tố gen cassiicola qui trình chạy PCR phát gen cas - Phân nhóm gen mã hóa cassiicolin từ mẫu nấm phân lập vẽ phát sinh loài - Chủng bệnh mẫu nấm Corynespora cassiicola có độc tố cassiicolin khơng có độc tố cassiicolin phân lập từ cây cao su lên dịng vơ tính (DVT) cao su nhóm cấu giống cao su 2015-2020 Việt Nam ký chủ khác khoai mì, đu đủ, cà chua phương pháp tách rời III NGÀY GIAO NHIỆM VỤ: 26/02/2018 IV NGÀY HOÀN THÀNH NHIỆM VỤ: 17/06/2018 V CÁN BỘ HƢỚNG DẪN: TS Nguyễn Bảo Quốc Tp HCM, ngày 21 tháng năm CÁN BỘ HƯỚNG DẪN CHỦ NHIỆM BỘ MÔN ĐÀO TẠO TRƯỞNG KHOA LỜI CẢM ƠN Lời đầu tiên, tơi xin gửi lời cảm ơn đến Gia đình bên cạnh ủng hộ định trước sau Tôi xin cảm ơn sâu sắc chân thành đến TS Nguyễn Bảo Quốc ln hướng dẫn tận tụy, hết lịng bảo, giúp đỡ tạo điều kiện tốt cho tơi hồn thành luận văn Bên cạnh đó, tơi xin gửi lời cảm ơn đến thầy cô Bộ môn Công nghệ sinh học, trường Đại học Bách Khoa Tp HCM dạy dỗ, truyền đạt kiến thức suốt q trình học Cuối cùng, tơi xin cảm ơn bạn tơi nói riêng bạn thực luận văn suốt thời gian thực Luận văn Phịng thí nghiệm Bệnh học Người - Viện nghiên cứu Công nghệ Sinh học Môi trường, Trường Đại học Nơng Lâm Tp Hồ Chí Minh động viên, giúp đỡ tơi q trình thực đề tài Tp Hồ Chí Minh, ngày 21 tháng năm 2018 Văn Thị Mỹ Linh i TÓM TẮT Đề tài “Phát mơ tả gen mã hố Cassiicolin chủng Corynespora cassiicola (Berk & Curt.) Wei phân lập Việt Nam với mục tiêu nghiên cứu xác định phân nhóm gen mã hố cassiicolin chủng phân lập Việt Nam, đánh giá tính gây độc nấm Corynespora cassiicola có khơng có độc tố cassiicolin số dịng vơ tính (DVT) cao su Việt Nam xác định khả lây nhiễm chéo mẫu nấm Corynespora cassiicola phân lập từ cao su có khơng có độc tố cassiicolin đu đủ, cà chua khoai mì Kết nghiên cứu cho thấy có chủng phân lập CoryDC01, CoryKT01, CoryBT07, CoryDN22, CoryLK01, CoryQN01 mang gen cas mã hóa cho protein độc tố cassiicolin thuộc nhóm tương đồng gen cas2, 34 chủng phân lập cịn lại thuộc nhóm cas0 (khơng phát gen cas) Chủng phân lập C cassiicola đại diện cho nhóm có gen cas2 CoryQN01 nhóm khơng phát gen cas2 CoryLK10 đánh giá khả gây bệnh cao su, đu đủ, cà chua, khoai mì tách rời Ở thí nghiệm này, mẫu phân lập (MPL) gây bệnh DVT cao su mức độ khác tùy thuộc vào mức độ mẫn cảm DVT, hai MPL có khả gây bệnh mức nặng DVT RRIV124 Cả MPL có khả xâm nhiễm gây bệnh ký chủ khác đu đủ, cà chua khoa mì khoai mì nhiễm nặng đu đủ cà chua, có lẽ lây nhiễm chéo MPL cao su trồng khác phụ thuộc vào khả xâm nhiễm chủng nấm độ mẫn cảm ký chủ Mặt khác kết chủng bệnh mẫu phân lập CoryQN01 có diện tích vết bệnh (DTVB) cao so với mẫu phân lập CoryLK10 cho thấy mẫu phân lập CoryQN01 có có mức độ gây bệnh nặng CoryLK01 dịng vơ tính ký chủ khác kết luận khả xâm nhiễm gây bệnh MPL CoryQN01cao so với MPL CoryLK10 có liên quan đến diện độc tố cassiicolin, chủng chứa độc tố gây bệnh nặng chủng khơng có độc tố ii ABSTRACT A study entitled "Detection and characterization of cassiicolin encoding genes on Corynespora cassiicola strains (Berk & Curt.), Wei isolated in Vietnam" to identify and classify genes encoding cassiicolin on isolates in Vietnam as well as to evaluate fungal virulence from C.cassiicola isolates with and wothour cas2 gene on some rubber clones and non-hosts such as papaya, tomato and cassava The results of this study showed that there were C.cassiicola isolates including CoryDC01, CoryKT01, CoryBT07, CoryDN22, CoryLK01, CoryQN01 having cas2 gene but not in other maintaining fungal isolates (cas 0) by using PCR and phylogenetic analyses For the analysis of fungal virulence, two C.cassiicola isolates with and without cas2 were used for detached leaf assays on selected rubber clones and non-hosts (papaya, tomato and cassava) Although various levels of fungal virulence were observed on rubber clones and non-hosts, fungal isolate CoryQN01 was capable of causing disease index more than that of CoryLK10 Particularly, RRIV124 showed the most sensitive to both fungal isolates incicating that this clone was susceptible with C.cassiicola in comparison with other rubber clones Additionally, both fungal isolates can cause the disease on non-hosts of which the serious disease index was observed in cassava more than that in papaya and tomato indicating those fungal isolates were not specific in rubber trees and depending on other mechanisms of fungal infection The comparison of fungal virulence between CoryQN01 and CoryLK01 indicated that C.cassicola isolate with cas gene can cause the disease more than that of isolate without cas indicating an important role of cassiicolin gene in the fungal pathogenicity of C.cassiicola isolates in the rubber tree iii LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi Các số liệu kết nghiên cứu luận văn trung thực chưa công bố cơng trình nghiên cứu khác Tác giả Văn Thị Mỹ Linh iv MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN i TÓM TẮT ii ABSTRACT iii LỜI CAM ĐOAN iv MỤC LỤC v DANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT vii DANH MỤC HÌNH viii DANH MỤC BIỂU ĐỒ x DANH MỤC BẢNG .xi MỞ ĐẦU Mục tiêu nghiên cứu Nội dung nghiên cứu CHƢƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Giới thiệu cao su (Hevea Brasiliensis Mull Arg.) 1.1.1 Cây cao su tầm quan trọng 1.1.2 Tình hình sâu bệnh hại cao su 1.2 Bệnh rụng cao su nấm Corynespora cassiicola giới Việt Nam 1.3 Sơ lược nấm Corynespora cassiicola (Berk & Curt.) C.T Wei 1950 1.3.1 Triệu chứng bệnh 1.3.2 Phân loại 10 1.3.3 Đặc điểm nấm Corynespora cassiicola 11 1.4 Độc tố cassiicolin Corynespora cassiicola tiết 15 1.5 Tình hình nghiên cứu C cassiicola nước 18 1.5.1 Những nghiên cứu vế C cassiicola nước 18 1.5.2 Những nghiên cứu C cassiicola nước 19 1.6 Phương pháp RT-PCR 20 1.7 Vai trò vùng rDNA-ITS nghiên cứu đa dạng di truyền 20 CHƢƠNG VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 22 2.1 Địa điểm nghiên cứu 22 2.2 Vật liệu nghiên cứu 22 v 2.2.1 Mẫu nghiên cứu 22 2.2.2 Hóa chất thiết bị 25 2.3 Phương pháp nghiên cứu 27 2.3.1 Phương pháp ly trích DNA 27 2.3.2 Phương pháp PCR phát gen cas 29 2.3.3 Phương pháp chủng bệnh Corynespora cassiicola cao su, đu đủ, khoai mì, cà chua tách rời 31 CHƢƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 35 3.1 Kết ly trích DNA từ mẫu nấm 35 3.2 Kết PCR phát gen cas chủng nấm Corynespora cassiicola 36 3.3 Kết chủng bệnh corynespora cassiicola cao su, đu đủ, cà chua, khoai mì tách rời 45 CHƢƠNG KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 54 4.1 Kết luận 54 4.2 Đề nghị 54 TÀI LIỆU THAM KHẢO 55 PHỤ LỤC 63 vi Variable MẪU LÁ Mean SE Mean StDev Variance CoefVar tỉ lệ CÀ CHUA 5.5367 0.0384 0.0666 0.0044 1.20 ĐU ĐỦ 14.327 0.0441 0.0764 0.0058 0.53 KHOAI MÌ 28.550 0.0850 0.147 0.0217 0.52 PB255 25.563 0.0418 0.0723 0.0052 0.28 RRIV1 15.033 0.0376 0.0651 0.0042 0.43 RRIV103 20.140 0.0624 0.108 0.0117 0.54 RRIV106 31.873 0.0780 0.135 0.0182 0.42 RRIV114 24.347 0.0273 0.0473 0.0022 0.19 RRIV124 39.560 0.0462 0.0800 0.0064 0.20 RRIV209 33.827 0.0260 0.0451 0.0020 0.13 MẪU LÁ N Mean Grouping RRIV124 39.5600 A RRIV209 33.8267 B RRIV106 31.8733 C KHOAI MÌ 28.5500 D PB255 25.5633 E RRIV114 24.3467 F RRIV103 20.1400 G RRIV1 15.0333 H ĐU ĐỦ 14.3267 I CÀ CHUA 5.5367 J Level N Mean StDev -+ -+ -+ -+ -CÀ CHUA 5.5367 0.0666 (* ĐU ĐỦ 14.3267 0.0764 * KHOAI MÌ 28.5500 0.1473 (* PB255 25.5633 0.0723 (* RRIV1 15.0333 0.0651 * RRIV103 20.1400 0.1082 * RRIV106 31.8733 0.1350 * RRIV114 24.3467 0.0473 * RRIV124 39.5600 0.0800 (* RRIV209 33.8267 0.0451 69 QN01 Ngày RV103 SD RV209 SD RV106 SD RV01 SD RV114 SD RV124 SD PB255 SD 2,48 0,02 2,29 0,10 2,35 0,02 2,24 0,10 2,37 0,04 2,47 0,03 2,32 0,07 4,19 0,06 3,24 0,04 3,15 0,04 3,16 0,15 3,85 0,09 5,73 0,02 3,47 0,03 10,50 0,06 22,53 0,09 18,54 0,08 9,67 0,03 9,71 0,07 24,37 0,16 11,92 0,10 20,14 0,11 33,83 0,05 31,87 0,14 15,03 0,07 24,35 0,05 39,56 0,08 25,56 0,07 QN01 Ngày Cà chua SD Đu đủ SD Khoai mì 1,26 0,03 2,32 0,07 1,47 2,17 0,03 3,47 0,03 3,31 4,08 0,08 5,21 0,04 6,46 5,54 0,07 14,33 0,08 28,55 70 Kết xử lý thông kê chủng bệnh tách rời chủng CoryLK10 diện tích vết bệnh ngày 1,3,5,7 Variable MẪU LÁ Mean SE Mean StDev Variance CoefVar tỉ lệ CÀ CHUA 1.2567 0.0219 0.0379 0.0014 3.01 ĐU ĐỦ 2.2900 0.0265 0.0458 0.0021 2.00 KHOAI MÌ 1.4267 0.0296 0.0513 0.0026 3.60 PB255 2.2767 0.0186 0.0321 0.0010 1.41 RRIV1 2.1267 0.0481 0.0833 0.0069 3.92 RRIV103 2.4667 0.00333 0.00577 0.00003 0.23 RRIV106 2.3500 0.0100 0.0173 0.0003 0.74 RRIV114 2.3433 0.0285 0.0493 0.0024 2.11 RRIV124 2.3467 0.0186 0.0321 0.0010 1.37 RRIV209 2.1767 0.0186 0.0321 0.0010 1.48 MẪU LÁ N Mean Grouping RRIV103 2.4667 A RRIV106 2.3500 A B RRIV124 2.3467 A B RRIV114 2.3433 A B ĐU ĐỦ 2.2900 B C PB255 2.2767 B C RRIV209 2.1767 CD RRIV1 2.1267 D KHOAI MÌ 1.4267 E CÀ CHUA 1.2567 F Level N Mean StDev + -+ -+ -+ CÀ CHUA 1.2567 0.0379 (-*) ĐU ĐỦ 2.2900 0.0458 (*-) KHOAI MÌ 1.4267 0.0513 (-*) PB255 2.2767 0.0321 (*-) RRIV1 2.1267 0.0833 (-*) RRIV103 2.4667 0.0058 (*-) RRIV106 2.3500 0.0173 (*-) RRIV114 2.3433 0.0493 (-*) RRIV124 2.3467 0.0321 (*-) RRIV209 2.1767 0.0321 71 Variable MẪU LÁ Mean SE Mean StDev Variance CoefVar tỉ lệ CÀ CHUA 2.0533 0.0296 0.0513 0.0026 2.50 ĐU ĐỦ 3.3867 0.0145 0.0252 0.0006 0.74 KHOAI MÌ 3.1800 0.0153 0.0265 0.0007 0.83 PB255 3.2200 0.0200 0.0346 0.0012 1.08 RRIV1 3.0867 0.0376 0.0651 0.0042 2.11 RRIV103 3.550 0.540 0.935 0.875 26.35 RRIV106 3.1900 0.0611 0.1058 0.0112 3.32 RRIV114 4.4600 0.0208 0.0361 0.0013 0.81 RRIV124 5.2567 0.0273 0.0473 0.0022 0.90 RRIV209 3.1967 0.0371 0.0643 0.0041 2.01 MẪU LÁ N Mean Grouping RRIV124 5.2567 A RRIV114 4.4600 A RRIV103 3.5500 B ĐU ĐỦ 3.3867 B PB255 3.2200 B RRIV209 3.1967 B RRIV106 3.1900 B KHOAI MÌ 3.1800 B RRIV1 3.0867 B CÀ CHUA 2.0533 C Level N Mean StDev -+ -+ -+ -+ -CÀ CHUA 2.0533 0.0513 ( -* ) ĐU ĐỦ 3.3867 0.0252 ( -* ) KHOAI MÌ 3.1800 0.0265 ( -* ) PB255 3.2200 0.0346 ( * -) RRIV1 3.0867 0.0651 ( -* ) RRIV103 3.5500 0.9354 ( -* ) RRIV106 3.1900 0.1058 ( -* -) RRIV114 4.4600 0.0361 ( -* ) RRIV124 5.2567 0.0473 ( -* ) RRIV209 3.1967 0.0643 72 Variable MẪU LÁ Mean SE Mean StDev Variance CoefVar tỉ lệ CÀ CHUA 4.0033 0.0677 0.1172 0.0137 2.93 ĐU ĐỦ 5.1633 0.0484 0.0839 0.0070 1.62 KHOAI MÌ 6.1367 0.0590 0.1021 0.0104 1.66 PB255 10.147 0.0376 0.0651 0.0042 0.64 RRIV1 7.2833 0.0145 0.0252 0.0006 0.35 RRIV103 9.5833 0.0145 0.0252 0.0006 0.26 RRIV106 14.567 0.0240 0.0416 0.0017 0.29 RRIV114 8.3467 0.0285 0.0493 0.0024 0.59 RRIV124 18.227 0.0498 0.0862 0.0074 0.47 RRIV209 17.577 0.0167 0.0289 0.0008 0.16 MẪU LÁ N Mean Grouping RRIV124 18.2267 A RRIV209 17.5767 B RRIV106 14.5667 C PB255 10.1467 D RRIV103 9.5833 E RRIV114 8.3467 F RRIV1 7.2833 G KHOAI MÌ 6.1367 H ĐU ĐỦ 5.1633 I CÀ CHUA 4.0033 J Level N Mean StDev + -+ -+ -+ CÀ CHUA 4.0033 0.1172 * ĐU ĐỦ 5.1633 0.0839 * KHOAI MÌ 6.1367 0.1021 *) PB255 10.1467 0.0651 *) RRIV1 7.2833 0.0252 * RRIV103 9.5833 0.0252 * RRIV106 14.5667 0.0416 *) RRIV114 8.3467 0.0493 * RRIV124 18.2267 0.0862 (* RRIV209 17.5767 0.0289 73 Variable MẪU LÁ Mean SE Mean StDev Variance CoefVar tỉ lệ CÀ CHUA 5.2567 0.00882 0.0153 0.00023 0.29 ĐU ĐỦ 13.103 0.0555 0.0961 0.0092 0.73 KHOAI MÌ 26.013 0.0203 0.0351 0.0012 0.14 PB255 16.203 0.103 0.178 0.032 1.10 RRIV1 10.350 0.0379 0.0656 0.0043 0.63 RRIV103 20.140 0.0624 0.108 0.0117 0.54 RRIV106 17.413 0.0353 0.0611 0.0037 0.35 RRIV114 13.760 0.0458 0.0794 0.0063 0.58 RRIV124 26.513 0.0186 0.0321 0.0010 0.12 RRIV209 20.667 0.0120 0.0208 0.0004 0.10 MẪU LÁ N Mean Grouping RRIV124 26.5133 A KHOAI MÌ 26.0133 B RRIV209 20.6667 C RRIV103 20.1400 D RRIV106 17.4133 E PB255 16.2033 F RRIV114 13.7600 G ĐU ĐỦ 13.1033 H RRIV1 10.3500 I CÀ CHUA 5.2567 J Level N Mean StDev -+ -+ -+ -+ -CÀ CHUA 5.2567 0.0153 * ĐU ĐỦ 13.1033 0.0961 * KHOAI MÌ 26.0133 0.0351 *) PB255 16.2033 0.1779 * RRIV1 10.3500 0.0656 * RRIV103 20.1400 0.1082 (* RRIV106 17.4133 0.0611 * RRIV114 13.7600 0.0794 * RRIV124 26.5133 0.0321 * RRIV209 20.6667 0.0208 74 LK10 NGÀY RV103 SD RV209 SD RV106 SD RV01 SD RV114 SD RV124 SD PB255 SD 2,47 0,01 2,18 0,03 2,35 0,02 2,13 0,08 2,34 0,05 2,35 0,03 2,28 0,03 4,05 0,08 3,20 0,06 3,19 0,11 3,09 0,07 4,46 0,04 5,26 0,05 3,22 0,03 9,58 0,03 17,58 0,03 14,57 0,04 7,28 0,03 8,35 0,05 18,23 0,09 10,15 0,07 20,14 0,11 20,67 0,02 17,41 0,06 10,35 0,07 13,76 0,08 26,51 0,03 16,20 0,18 LK10 Ngày cà chua sd đu đủ sd khoai mì 1,26 2,05 4,00 5,26 0,04 0,05 0,12 0,02 2,29 3,39 5,16 13,10 0,05 0,03 0,08 0,10 1,43 3,18 6,14 26,01 75 Phụ lục Kết xử lý thông kê chủng bệnh tách rời đánh giá cấp bệnh ngày 1,3,5,7 Kết xử lý thông kê chủng bệnh tách rời chủng CoryLK10 đánh giá cấp bệnh ngày 1,3,5,7 Level N Mean StDev CÀ CHUA 36 2.0833 0.2803 ĐU ĐỦ 36 2.1389 0.3507 KHOAI MÌ 36 2.4167 0.5000 PB255 36 2.5833 0.5000 RRIV1 36 2.1667 0.3780 RRIV103 36 2.3056 0.4672 RRIV106 36 2.0833 0.2803 RRIV114 36 2.1389 0.3507 RRIV124 36 2.3056 0.4672 RRIV209 36 2.0833 0.2803 MẪU LÁ N Mean Grouping PB255 36 2.5833 A KHOAI MÌ 36 2.4167 A B RRIV124 36 2.3056 A B C RRIV103 36 2.3056 A B C RRIV1 36 2.1667 B C RRIV114 36 2.1389 B C ĐU ĐỦ 36 2.1389 B C RRIV209 36 2.0833 C RRIV106 36 2.0833 C CÀ CHUA 36 2.0833 C Variable MẪU LÁ Percent Mean SE Mean StDev Variance CoefVar KÍCH THƯỚC CÀ CHUA 10 2.0833 0.0467 0.2803 0.0786 13.45 ĐU ĐỦ 10 2.1389 0.0585 0.3507 0.1230 16.40 KHOAI MÌ 10 2.4167 0.0833 0.5000 0.2500 20.69 PB255 10 2.5833 0.0833 0.5000 0.2500 19.35 RRIV1 10 2.1667 0.0630 0.3780 0.1429 17.44 RRIV103 10 2.3056 0.0779 0.4672 0.2183 20.26 RRIV106 10 2.0833 0.0467 0.2803 0.0786 13.45 RRIV114 10 2.1389 0.0585 0.3507 0.1230 16.40 RRIV124 10 2.3056 0.0779 0.4672 0.2183 20.26 RRIV209 10 2.0833 0.0467 0.2803 0.0786 13.45 76 Level N Mean StDev CÀ CHUA 36 2.6389 0.4871 ĐU ĐỦ 36 3.3889 0.5492 KHOAI MÌ 36 4.3056 0.4672 PB255 36 4.1667 0.3780 RRIV1 36 3.3056 0.4672 RRIV103 36 3.6111 0.5492 RRIV106 36 3.7778 0.4216 RRIV114 36 3.2500 0.4392 RRIV124 36 4.1944 0.6684 RRIV209 36 4.0556 0.4748 MẪU LÁ N Mean Grouping KHOAI MÌ 36 4.3056 A RRIV124 36 4.1944 A PB255 36 4.1667 A RRIV209 36 4.0556 A B RRIV106 36 3.7778 B C RRIV103 36 3.6111 CD ĐU ĐỦ 36 3.3889 D RRIV1 36 3.3056 D RRIV114 36 3.2500 D CÀ CHUA 36 2.6389 E Variable MẪU LÁ Percent Mean SE Mean StDev Variance CoefVar KÍCH THƯỚC CÀ CHUA 10 2.6389 0.0812 0.4871 0.2373 18.46 ĐU ĐỦ 10 3.3889 0.0915 0.5492 0.3016 16.21 KHOAI MÌ 10 4.3056 0.0779 0.4672 0.2183 10.85 PB255 10 4.1667 0.0630 0.3780 0.1429 9.07 RRIV1 10 3.3056 0.0779 0.4672 0.2183 14.13 RRIV103 10 3.6111 0.0915 0.5492 0.3016 15.21 RRIV106 10 3.7778 0.0703 0.4216 0.1778 11.16 RRIV114 10 3.2500 0.0732 0.4392 0.1929 13.51 RRIV124 10 4.194 0.111 0.668 0.447 15.94 RRIV209 10 4.0556 0.0791 0.4748 0.2254 11.71 77 Level N Mean StDev CÀ CHUA 36 3.7222 0.4543 ĐU ĐỦ 36 8.4444 0.5040 KHOAI MÌ 36 8.6944 0.5767 PB255 36 6.2778 0.7015 RRIV1 36 5.5000 0.6547 RRIV103 36 4.6944 0.4672 RRIV106 36 7.9167 0.9063 RRIV114 36 6.1389 0.6825 RRIV124 36 8.0833 0.6492 RRIV209 36 6.1389 0.4245 MẪU LÁ N Mean Grouping KHOAI MÌ 36 8.6944 A ĐU ĐỦ 36 8.4444 A B RRIV124 36 8.0833 B C RRIV106 36 7.9167 C PB255 36 6.2778 D RRIV209 36 6.1389 D RRIV114 36 6.1389 D RRIV1 36 5.5000 E RRIV103 36 4.6944 F CÀ CHUA 36 3.7222 G Variable MẪU LÁ Percent Mean SE Mean StDev Variance CoefVar KÍCH THƯỚC CÀ CHUA 10 3.7222 0.0757 0.4543 0.2063 12.20 ĐU ĐỦ 10 8.4444 0.0840 0.5040 0.2540 5.97 KHOAI MÌ 10 8.6944 0.0961 0.5767 0.3325 6.63 PB255 10 6.278 0.117 0.701 0.492 11.17 RRIV1 10 5.500 0.109 0.655 0.429 11.90 RRIV103 10 4.6944 0.0779 0.4672 0.2183 9.95 RRIV106 10 7.917 0.151 0.906 0.821 11.45 RRIV114 10 6.139 0.114 0.683 0.466 11.12 RRIV124 10 8.083 0.108 0.649 0.421 8.03 RRIV209 10 6.1389 0.0707 0.4245 0.1802 6.91 78 Level N Mean StDev CÀ CHUA 36 6.667 0.478 ĐU ĐỦ 36 13.111 0.319 KHOAI MÌ 36 13.889 2.866 PB255 36 13.444 0.607 RRIV1 36 5.917 0.554 RRIV103 36 8.889 0.785 RRIV106 36 10.917 0.770 RRIV114 36 10.306 0.525 RRIV124 36 16.861 0.762 RRIV209 36 12.917 0.692 MẪU LÁ N Mean Grouping RRIV124 36 16.861 A KHOAI MÌ 36 13.889 B PB255 36 13.444 B C ĐU ĐỦ 36 13.111 B C RRIV209 36 12.917 C RRIV106 36 10.917 D RRIV114 36 10.306 D RRIV103 36 8.889 E CÀ CHUA 36 6.667 F RRIV1 36 5.917 F Variable MẪU LÁ Percent Mean SE Mean StDev Variance CoefVar KÍCH THƯỚC CÀ CHUA 10 6.6667 0.0797 0.4781 0.2286 7.17 ĐU ĐỦ 10 13.111 0.0531 0.319 0.102 2.43 KHOAI MÌ 10 13.889 0.478 2.866 8.216 20.64 PB255 10 13.444 0.101 0.607 0.368 4.51 RRIV1 10 5.9167 0.0924 0.5542 0.3071 9.37 RRIV103 10 8.889 0.131 0.785 0.616 8.83 RRIV106 10 10.917 0.128 0.770 0.593 7.05 RRIV114 10 10.306 0.0875 0.525 0.275 5.09 RRIV124 10 16.861 0.127 0.762 0.580 4.52 RRIV209 10 12.917 0.115 0.692 0.479 5.36 79 Kết xử lý thông kê chủng bệnh tách rời chủng CoryLK10 đánh giá cấp bệnh ngày 1,3,5,7 Level N Mean StDev CÀ CHUA 36 1.2500 0.4392 ĐU ĐỦ 36 2.3611 0.5426 KHOAI MÌ 36 1.6389 0.4871 PB255 36 2.3056 0.4672 RRIV1 36 2.0556 0.2323 RRIV103 36 2.1944 0.4014 RRIV106 36 2.0556 0.2323 RRIV114 36 2.0278 0.1667 RRIV124 36 2.1667 0.3780 RRIV209 36 2.0556 0.2323 MẪU LÁ N Mean Grouping ĐU ĐỦ 36 2.3611 A PB255 36 2.3056 A B RRIV103 36 2.1944 A B RRIV124 36 2.1667 A B RRIV209 36 2.0556 B RRIV106 36 2.0556 B RRIV1 36 2.0556 B RRIV114 36 2.0278 B KHOAI MÌ 36 1.6389 C CÀ CHUA 36 1.2500 D Variable MẪU LÁ Mean SE Mean StDev Variance CoefVar KÍCH THƯỚC CÀ CHUA 1.2500 0.0732 0.4392 0.1929 35.13 ĐU ĐỦ 2.3611 0.0904 0.5426 0.2944 22.98 KHOAI MÌ 1.6389 0.0812 0.4871 0.2373 29.72 PB255 2.3056 0.0779 0.4672 0.2183 20.26 RRIV1 2.0556 0.0387 0.2323 0.0540 11.30 RRIV103 2.1944 0.0669 0.4014 0.1611 18.29 RRIV106 2.0556 0.0387 0.2323 0.0540 11.30 RRIV114 2.0278 0.0278 0.1667 0.0278 8.22 RRIV124 2.1667 0.0630 0.3780 0.1429 17.44 RRIV209 2.0556 0.0387 0.2323 0.0540 11.30 80 Level N Mean StDev CÀ CHUA 36 2.6389 0.4871 ĐU ĐỦ 36 3.0278 0.1667 KHOAI MÌ 36 4.3056 0.4672 PB255 36 4.0833 0.2803 RRIV1 36 3.1667 0.3780 RRIV103 36 3.2222 0.4216 RRIV106 36 3.3611 0.4871 RRIV114 36 3.1389 0.3507 RRIV124 36 4.0278 0.1667 RRIV209 36 4.1667 0.3780 MẪU LÁ N Mean Grouping KHOAI MÌ 36 4.3056 A RRIV209 36 4.1667 A PB255 36 4.0833 A RRIV124 36 4.0278 A RRIV106 36 3.3611 B RRIV103 36 3.2222 B C RRIV1 36 3.1667 B C RRIV114 36 3.1389 B C ĐU ĐỦ 36 3.0278 C CÀ CHUA 36 2.6389 D Variable MẪU LÁ Mean SE Mean StDev Variance CoefVar KÍCH THƯỚC CÀ CHUA 2.6389 0.0812 0.4871 0.2373 18.46 ĐU ĐỦ 3.0278 0.0278 0.1667 0.0278 5.50 KHOAI MÌ 4.3056 0.0779 0.4672 0.2183 10.85 PB255 4.0833 0.0467 0.2803 0.0786 6.86 RRIV1 3.1667 0.0630 0.3780 0.1429 11.94 RRIV103 3.2222 0.0703 0.4216 0.1778 13.09 RRIV106 3.3611 0.0812 0.4871 0.2373 14.49 RRIV114 3.1389 0.0585 0.3507 0.1230 11.17 RRIV124 4.0278 0.0278 0.1667 0.0278 4.14 RRIV209 4.1667 0.0630 0.3780 0.1429 9.07 81 Level N Mean StDev CÀ CHUA 36 2.8056 0.5767 ĐU ĐỦ 36 5.6667 0.5345 KHOAI MÌ 36 5.6111 0.4944 PB255 36 5.6111 0.4944 RRIV1 36 4.1111 0.3187 RRIV103 36 5.5000 0.5071 RRIV106 36 5.5556 0.6522 RRIV114 36 3.7500 0.4392 RRIV124 36 5.2778 0.4543 RRIV209 36 5.5000 0.5071 MẪU LÁ N Mean Grouping ĐU ĐỦ 36 5.6667 A PB255 36 5.6111 A B KHOAI MÌ 36 5.6111 A B RRIV106 36 5.5556 A B RRIV209 36 5.5000 A B RRIV103 36 5.5000 A B RRIV124 36 5.2778 B RRIV1 36 4.1111 C RRIV114 36 3.7500 C CÀ CHUA 36 2.8056 D Variable MẪU LÁ Mean SE Mean StDev Variance CoefVar KÍCH THƯỚC CÀ CHUA 2.8056 0.0961 0.5767 0.3325 20.55 ĐU ĐỦ 5.6667 0.0891 0.5345 0.2857 9.43 KHOAI MÌ 5.6111 0.0824 0.4944 0.2444 8.81 PB255 5.6111 0.0824 0.4944 0.2444 8.81 RRIV1 4.1111 0.0531 0.3187 0.1016 7.75 RRIV103 5.5000 0.0845 0.5071 0.2571 9.22 RRIV106 5.556 0.109 0.652 0.425 11.74 RRIV114 3.7500 0.0732 0.4392 0.1929 11.71 RRIV124 5.2778 0.0757 0.4543 0.2063 8.61 RRIV209 5.5000 0.0845 0.5071 0.2571 9.22 82 Level N Mean StDev CÀ CHUA 36 3.639 0.639 ĐU ĐỦ 36 12.278 0.454 KHOAI MÌ 36 7.722 0.454 PB255 36 7.278 0.513 RRIV1 36 5.306 0.467 RRIV103 36 9.361 0.487 RRIV106 36 12.083 0.280 RRIV114 36 5.111 0.319 RRIV124 36 10.472 0.506 RRIV209 36 11.167 0.378 MẪU LÁ N Mean Grouping ĐU ĐỦ 36 12.2778 A RRIV106 36 12.0833 A RRIV209 36 11.1667 B RRIV124 36 10.4722 C RRIV103 36 9.3611 D KHOAI MÌ 36 7.7222 E PB255 36 7.2778 F RRIV1 36 5.3056 G RRIV114 36 5.1111 G CÀ CHUA 36 3.6389 H Variable MẪU LÁ Mean SE Mean StDev Variance CoefVar KÍCH THƯỚC CÀ CHUA 3.639 0.107 0.639 0.409 17.57 ĐU ĐỦ 12.278 0.0757 0.454 0.206 3.70 KHOAI MÌ 7.7222 0.0757 0.4543 0.2063 5.88 PB255 7.2778 0.0856 0.5133 0.2635 7.05 RRIV1 5.3056 0.0779 0.4672 0.2183 8.81 RRIV103 9.3611 0.0812 0.4871 0.2373 5.20 RRIV106 12.083 0.0467 0.280 0.0786 2.32 RRIV114 5.1111 0.0531 0.3187 0.1016 6.24 RRIV124 10.472 0.0844 0.506 0.256 4.83 RRIV209 11.167 0.0630 0.378 0.143 3.38 83 ... Cassiicolin chủng Corynespora cassiicola (Berk & Curt .) Wei phân lập Việt Nam với mục tiêu nghiên cứu xác định phân nhóm gen mã hố cassiicolin chủng phân lập Việt Nam, đánh giá tính gây độc nấm Corynespora... học Mã số: 60420201 TÊN ĐỀ TÀI I Phát mô tả gen mã hoá Cassiicolin chủng Corynespora cassiicola (Berk & Curt .) Wei phân lập Việt Nam II NHIỆM VỤ VÀ NỘI DUNG Mục tiêu nghiên cứu - Xác định phân. .. nấm Corynespora cassiicola - Nhận biết nhóm độc tố gen cassiicola qui trình chạy PCR phát gen cas - Phân nhóm gen mã hóa cassiicolin từ mẫu nấm phân lập vẽ phát sinh loài - Chủng bệnh mẫu nấm Corynespora