Đặc điểm kiểu gen và đột biến kháng thuốc của hbv ở bệnh nhân nhiễm hbv mạn tính chưa điều trị

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH NGUYỄN THỊ HẢI YẾN ĐẶC ĐIỂM KIỂU GEN VÀ ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC CỦA HBV Ở BỆNH NHÂN NHIỄM HBV MẠN TÍNH CHƯA ĐIỀU TRỊ LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC TP HỒ CHÍ MINH - NĂM 2016 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH NGUYỄN THỊ HẢI YẾN ĐẶC ĐIỂM KIỂU GEN VÀ ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC CỦA HBV Ở BỆNH NHÂN NHIỄM HBV MẠN TÍNH CHƯA ĐIỀU TRỊ LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC Chuyên ngành: Vi sinh y học Mã số: 62720115 Người hướng dẫn khoa học: GS TS NGUYỄN THANH BẢO PGS TS CAO MINH NGA TP HỒ CHÍ MINH - NĂM 2016 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi Các số liệu, kết nêu luận án trung thực chưa công bố công trình khác Tác giả luận án Nguyễn Thị Hải Yến MỤC LỤC Trang Trang phụ bìa Lời cam đoan Mục lục Danh mục chữ viết tắt Danh mục bảng Danh mục biểu đồ-sơ đồ Danh mục hình ĐẶT VẤN ĐỀ Chương TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1.Virus viêm gan B (HBV) 1.2.Dịch tễ học nhiễm HBV 11 1.3.Diễn tiến nhiễm HBV 17 1.4.Điều trị HBV .19 1.5.GTT gen xđ kiểu gen, kiểu gen đột biến ng thuốc HBV 26 1.6.Tình hình nghiên cứu nước 28 Chương ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 33 2.1.Đối tượng nghiên cứu 33 2.2.Phương pháp nghiên cứu 33 2.3.Các bước tiến hành nghiên cứu 36 2.4.Xử lý số liệu 50 2.5 Hạn chế sai số .50 2.6 Đạo đức nghiên cứu 51 Chương KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 54 3.1 Đặc điểm mẫu nghiên cứu 54 3.2 Sự phân bố kiểu gen, ki ểu gen HBV số đặc điểm sinh học 57 3.3 Đột biến kháng thuốc 75 Chương BÀN LUẬN 79 4.1 Đặc điểm mẫu nghiên cứu 79 4.2 Sự phân bố kiểu gen, kiểu gen HBV số đặc điểm sinh học 80 4.3 Đột biến kháng thuốc 95 KẾT LUẬN 104 KIẾN NGHỊ 106 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH LIÊN QUAN ĐẾN ĐỀ TÀI ĐÃ CƠNG BỐ TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC Bảng thu thập số liệu Danh sách bệnh nhân DANH MỤC CÁC C HỮ VIẾT TẮT AFP alpha feto protein ALT alanin aminotranferase Anti HBc IgM anti hepatitis B core immunoglobulin M (kháng thể IgM kháng kháng nguyên lõi virus viêm gan B ) Anti HBc IgG anti hepatitis B core immunoglobulin G (kháng thể IgG kháng kháng nguyên lõi virus viên gan B ) ccc DNA covalently closed circular DNA ddNTP didesoxynucleotide triphosphate dNTP desoxynucleotide triphosphate DNA deoxyribonucleotic acid HBeAg hepatitis B e antigen (kháng nguyên e virus viêm gan B) HBsAg hepatitis B surface antigen (kháng nguyên bề mặt virus viêm gan B) HBV hepatitis B virus ( virus viêm gan B) HBV DNA Deoxyribonucleic acid of hepatitis B virus ( ADN virus viêm gan B HIV human immunodeficiency virus (virus suy giảm miễn dịch mắc phải người) Kb kilobase, kilobase pair PCR polymerase chain reaction (phản ứng chuỗi với men polymerase) Restriction Fragment Melting Polymorphism (tính đa hình RFMP nóng chảy đoạn cắt giới hạn) RFLP Restriction Fragment Length Polymorphism (tính đa hình chiều dài đoạn cắt giới hạn) RNA ribonucleoti acid RT reverse transcription (sao chép ngược) RT-PCR reverse transcriptase polymerase chain reaction (phản ứng chuỗi với men polymerase chép ngược) YMDD tyrosine-methionine-aspartate-aspertate DANH MỤC CÁC BẢNG Trang Bảng 3.1 Sự phân bố nhóm tuổi 55 Bảng 3.2: Phân bố kiểu gen HBV theo nơi cư trú 64 Bảng 3.3: Liên quan kiểu gen HBV giới, tuổi 64 Bảng 3.4 : Liên quan kiểu gen HBV số đặc điểm sinh học 65 Bảng 3.5 : Liên quan kiểu gen HBV tuổi theo giới 66 Bảng 3.6 : Liên quan kiểu gen HBV HBeAg theo giới 66 Bảng 3.7: Liên quan kiểu gen HBV HBV DNA theo giới 67 Bảng 3.8 : Liên quan kiểu gen HBV men gan (ALT) theo giớ i 68 Bảng 3.9: Liên quan kiểu gen HBV HBeAg theo tuổi 68 Bảng 3.10: Liên quan kiểu gen HBV HBV DNA theo tuổi 69 Bảng 3.11: Liên quan kiểu gen HBV men gan (ALT) theo tuổi 70 Bảng 3.12: Liên quan kiểu gen HBeAg theo HBV DNA 70 Bảng 3.13: Liên quan kiểu gen HBeAg theo men gan 71 Bảng 3.14: Phân bố kiểu gen HBV theo tuổi, giới 72 Bảng 3.15: Phân bố kiểu gen HBV theo nơi cư trú 73 Bảng 3.16: Phân bố kiểu gen HBV theo số đặc điểm sinh học 74 Bảng 3.17: Liên quan đột biến rtV207M tuổi, giới, kiểu gen 77 Bảng 3.18: Liên quan đột biến rtV207M đặc điểm sinh học 78 Bảng 4.1: Kiểu gen HBV Việt Nam qua nghiên cứu nước 82 Bảng 4.2: Kiểu gen HBV VN xác định KT GTT RFLP PCR 84 Bảng 4.3: Phân bố kiểu gen B, C BN VN nhiễm HBV mạn VG mạn 87 Bảng 4.4: Các kiểu gen HBV Việt Nam qua nghiên cứu 93 Bảng 4.5: So sánh tỷ lệ đột biến kháng Lamivudine HBV thời điểm khác 99 DANH MỤC CÁC BIỂU ĐỒ - SƠ ĐỒ Trang Biểu đồ 3.1 : Phân bố giới mẫu nghiên cứu 54 Biểu đồ 3.2 : Phân bố tuổi mẫu nghiên cứu 55 Biểu đồ 3.3 : Phân bố nơi cư trú mẫu nghiên cứu 56 Biểu đồ 3.4 : Sự phân bố kiểu gen HBV 57 Biểu đồ 3.5 : Sự phân bố kiểu gen HBV 57 Biểu đồ 3.6 : Tình trạng mang HBeAg 61 Biểu đồ 3.7 : Tải lượng HBV DNA máu 61 Biểu đồ 3.8 : Tình trạng tăng men gan (ALT) 63 Biểu đồ 3.9 : Tỷ lệ đột biến rtV207M 75 Sơ đồ 2.1 : Qui trình xử lý bảo quản mẫu 38 Sơ đồ 2.2 : Qui trình nghiên cứu 53 DANH MỤC CÁC HÌNH Trang Hình 1.1.Cấu trúc HBV Hình 1.2 Cấu trúc gen HBV Hình 1.3 Chu kỳ nhân lên HBV Hình 1.4 Bản đồ phân bố nhiễm HBV giới 13 Hình 1.5 Phân bố kiểu gen HBV t hế giới 16 Hình 3.1 Một vùng trình tự chủng virus HBV với kiểu gen B1 58 Hình 3.2 Một vùng trình tự chủng virus HBV với kiểu gen B2 58 Hình 3.3 Một vùng trình tự chủng virus HBV với kiểu gen B3 58 Hình 3.4 Một vùng trình tự chủng virus HBV với kiểu gen C2 59 Hình 3.5 Cây phân loài kiểu gen HBV số mẫu nghiên cứu(1) 59 Hình 3.6 Cây phân lồi kiểu gen HBV số mẫu nghiên cứu(2) 60 Hình 3.7 Hình ảnh điện di sản phẩm PCR giải trình tự 60 Hình 3.8 Đường biểu diễn mẫu có kết định lượng 1,4x 109 copies/ml 62 Hình 3.9 Đường biểu diễn mẫu có kết định lượng 1,4x10 copies/ml 62 Hình 3.10 Đột biến rtV207M 76 Hình 3.11 Genotype C hoang dại 76 Hình 3.12 Genotype B hoang dại 77 Hình 4.1 Các vị trí đột biến kháng thuốc công nhận 96 pp 1-18 50 EASL Clinical Practice Guidelines (2009), “Management of chronic hepatitis B” Journal of Hepatology Volume 50, pp 3-12 51 Eleftherios Michailidis, Karen A Kirby, Atsuko Hachiya, Wangdon Yoo, Sun Pyo Hong, Soo-Ok Kim, William R Folk, Stefan G Sarafianos.(2012) “Antiviral therapies : Focus on hepatitis B reverse transcriptase” The International Journal of Biochemistry and Cell Biology Volume 44, pp.1060-1071 52.Elizabeth W Hwang, Ramsey Cheung (2011) “ Global epidermiology of hepatitis B virus (HBV) infection” North American Journal of medicine and Science Volume 4(1), pp 7-13 53 Elizabeth C Reuman, Severine Margeridon-Thermet, Harrison B Caudill, Tommy Liu, Katyna Borroto-Esoda, Evguenia S Svarovskaia, Susan P Holmes, Robert W Shafer (2010).”A classification model for G to A hypermutation in hepatitis B virus ultra-deep pyrosequencing reads” Bioinformatics discovery note Volume 26(23), pp 2929-2932 54 Erwin Sablon, Fred Shapiro (2005).”Advances in Molecular diagnosis of HBV infection and drug resistance” Int J Med Sci Volume 2(1), pp 8-16 55 Fabien Zoulim (2011) “ Hepatitis B virus resistance to antiviral drugs: where arewe going?”.Liver International , pp.1478-3223 56 Francisco C A Mello, Barbara V Lago, Lia L Lewis Ximene, Carlos A.Fernandes, Selma A Gomes (2012) “Detection of mixed populations of wild-type and YMDD hepatitis B variants by pyrosequencing in acutely and chronically infected patients” BMC Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Microbilogy Volume 12,pp 96-112 57 Guan Huei Lee, Masafumi Inoue, Jimmy K P Toh, Roxanne H-H Chong, Myat-Oo Aung, Evelyn S-C Koay, Seng Gee Lim (2013) “Two step evolution of the hepatitis B drug resistant mutations in a patient who developed primary entecavir resistance” Liver International, pp 642-646 58 Fanjun Wang, Lili Lu, Changshun Yu, Zhanwu Lv, Xuelian Luo, Chao Wan, Zhaohui Hu, Qinyi Zhu, Youping Deng, Chuyu Zhang.(2013).” Development of a novel DNA sequencing method not only for hepatitis B virus genotyping but also for drug resistant mutation detaction” BMC Medical Genomics Volume 6(1), pp 201-215 59 Fung J, Lai C L, Seto W K, et al.(2011) “ Nucleoside/nucleotide analogues in the treatment of chronic hepatitis B” J Antimicrob Chemother.Volume 66, pp 2715-2725 60 Hai Ding, Baoming Liu, Chengyu hao, Jingxian Yang, Chunhui Yan, Ling Yan (2014) “Amino acid similarities and divergences in the small surface proteins of genotype C hepatitis B virus between necleos(t)ide analogue naïve and lamivudine-treated patients with chronic hepatitis B”.Volume 102, pp 29-34 61 Han Jak Ryu, Do Young Kim, Jun Yong Park, Hye Young Chang, Myoung Ha Lee, Kwang-Hyub Han, Chae Yoon Chon, Sang Hoon Ahn (2011) “ Clinical features and prognosis of hepatocallular carcinoma with respect to Pre-S deletion and Basal core promoter mutations of hepatitis b virus genotypes C2” Journal of Medical Virology Volume 83, pp 2088-2095 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 62.Hellan Kwon, Anna S Lok (2011) “Hepatitis B therapy” Gastroenterology and Hepatology J Volume 8, pp 275-284 63.Horvat RT.(2011) “Diagnostic and clinical relevance of HBV mutations” Lab Med Volume 42(8), pp 488-496 64 Kanako Tatematsu, Yasuhito Tanaka, Fuat Kurbanov, Fuminaka Sugauchi, Shuhei Mano, Tatsuji Maeshiro, Tomokuni Naayoshi, Moriaki Wakuta, Yuzo Miyakawa and Masashi Mizokami (2009) A genetic of Hepatitis B virus divergrent from known human and ape genotypes isolated from a Japanese patient and provisionally assigned to new gentype J” Journal of Virology.Vol 83 No 20, pp 10538-10547 65.Kenji Abe (2010) “Molecular-based epidemiology and pathology of hepatitis B virus infection” Kỷ yếu Hội nghị Sinh học phân tử Hóa sinh y học tịan quốc lần thứ 2, tr.19-20 66.Kenneth L Muldrew (2009) “Molecular diagnostics of infectious disease” Current Opinion Pediatrics Volume 21, pp 102-111 67.Khedive A, Sanei-Moghaddam E, Alavian S M et al (2013), “Hepatitis B virus surface antigen (HBsAg) mutations are but clustrered in immune epitopes in chronic carriers from SistanBalouchestan province, Iran” Archives of Iranian Medicine Volume 16 (7), pp 385-389 68.Kim SS, Cho SW, Kim SO, Hong SP, and Cheong JY.(2013) “ Multidrug-resistance hepatitis B virus resulting from sequential monotherapy with lamivudine, adefovir, and entecavir: clonal evolution during lamivudine plus adefovir therapy” J Med Vir Volume 85, pp 55-64 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 69.Ko S Y, Oh H B, Park C W, Lee H C, Lee J E (2012).”Analysis of hepatitis B virus drug resistant mutant halotypes by ultra-deep pyrosequencing” Clinical Microbiology and Infection Volume 18, pp 404-411 70.Kyun Hwan Kim, Nam Doo Kim, Baik Lin Seong (2010) “ Discovery and development of anti-HBV agents and their resistance” Molcules Volume 15, pp 5878- 5908 71.Isfahan Tauseef, Furhan Iqbal, Wajid Rehman, Muhammad Ali, Javed Anver Qureshi, Muhammad Assad Aslam (2012) “ A PCR-RFLP based protocol for the detection of hepatitis B virus variant in some lamivudine untreated chronic hepatitis B virs carriers in Pakistan” Pak J Pharm Sci Volume 2, pp 349-352 72.Ismail A M, P Samuel, C E Eapen, R Kannangai, P Abraham.(2012).”Antiviral resistance mutations and genotype associated amino acid substitutions in treatment naïve hepatitis B virus infected individuals from the Indian Subcontinent” Intervirology Volume 55, pp 36-44 73.Jie Ma, Yingchun Zhang, Xinyue Chen, Yi Jin, Dexi Chen, Yun Wu, Jing Cui, Haitao Wang, Jia Liu, Ning Li, Feng Gao (2013).”Association of preexisting drug resistance mutations and treatment failure in hepatitis B patients” Plos one Volume 8(7), pp 6766-6776 74.Jia Horng Kao, Chun-Jen Liu, Guey-mei Jow, Pei-Jer Chen, Ding Shinn Chen, Bing-Fang Chen (2012).” Fine mapping of hepatitis B virus pre-S deletion and association with hepatocellular carcinoma” Liver International, pp 1373-2095 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 75.Jinxin Zheng, Zheng heng, Duyi Zhang, Yanyan Yu, Fang Wang, Calvin Q Pan (2012).”Prevalance and significance of hepatitis B reverse transcriptase mutants in different disease stages of untreated patients” Liver Int Volume 32(10), pp 1535-1542 76.Lapinski TW, Pogorzelska J, Flisiak R (2012) “HBV mutations and their clinical significance” Advances in Medical Science Volume 57(1), pp.18-22 77.Liana Carballo Menezes, Talita Trevizani Rocchetti, Karen de Castro Bauab, Paola Cappellano, Milene Goncalves Quiles, Febianne Carlesse, Jose Salvador Rodrigues de Oliveira, Antonio Carlos Campos Pignatari (2013) “Diagnosis by real-time polymerase chain reaction of pathogens and antimicrobial resistance genes in bone marrow transplant patients with bloodstream infections” BMC Infection disease Volume 13, pp 166-176 78 Lin Liu, Yinhu Li, Siliang Li, Ni Hu, Yimin He, Ray Pong, Danni Lin, Lihua Lu, Maggie Law.(2012) “Comparison of next generation sequencing systems” Journal of Biomedicine and Biotechnology Volume 2012, pp 156-164 79 Long H Nguyen, Nghiem B Ha, Philip Vutien, Nghi B Ha, Ruel T Garcia, Huy N Trinh, Brian S Levitt, Huy A Nguyen , Khanh K Nguyen, Emmet B Keeffe, Mindie H Nguyen (2009).” Prevalence of hepatitis B virus genotype B in Vietnamese patients with chronic hepatitis B”.Hepatol Int Volume 3, pp 461–467 80 Ma Ying, Ding Yang, Feng Juan, Dou Xiao Guang (2011), “Genotyping the hepatitis B virus with a fragment of the HBV Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn DNA polymerase gene in Shenyang, China”, Virology Journal; v.8, pp 315-318 81.Mahmoud Reza Pourkarim, Samad Amini-Bavil-Olyaee, Fuat Kurbanov, Marc Van Rants, Frank Tacke (2014).”Molecular identification of hepatitis B virus genotypes/subgenotypes : revised classification hurdles and updated resolutions” World J Gastroenterol Volume 20(23), pp 7152-7168 82 Margeridon-ThermetSeverine, ShulmanNancy S., AhmedAijaz et al Ultra-(2009) “Deep Pyrosequencing of Hepatitis B Virus Quasispeciesfrom Nucleoside and Nucleotide Reverse- Transcriptase Inhibitor (NRTI)–Treated Patients and NRTI-Naive Patients”.JInfect Dis Volume 199(9), pp 1275–1285 83.Martin Moehlen, Maria De Meina, Mary Hill, Lennox Jeffers, Eugene R Schiff, Paul Martin (2013) “Absence of hepatitis B resistance mutants before introduction of oral antivit\ral therapy” Hepatology.Volume 2013 Article ID 130384, pages 84 Milan J Sonneveld, Vincent Rijckborst, Louwerens Zwang, Stefan Zeuzem,E.Jenny Heathcote,Krzysztof Simon, Roeland Zoutendijk, Ulus S Akarca, Suzan D Pas, Bettina E Hansen (2013) “Hepatitis B e antigen levels and respond to peginterferon: influence of precore and basal core promoter mutants” Antiviral Research Volume 97, pp 312-317 85 Michael O Baclig, May R Alvarez, Juliet Gopez-Cervantes, Flipinas F Natividad (2014) “Unique surface gene variants of hepatitis B virus isolated from patiants in the Philippines”.Volume 86, pp 209-216 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 86.Michael L Metzker (2010) “Sequencing technologies -the next generation” Nature Reviews – Genetics Volume 11, pp 31-46 87 Mirandola S., Campagnolo D., Bortoletto G et al (2011) “Largescale survey of naturally occurring HBV polymerasemutations associated with anti-HBV drug resistancein untreated patients with chronic hepatitis B” Journal of Viral Hepatitis Volume 18, pp 212-216 88 Monica V Alvarado, Joao R Robello Pinho (2013) “Review distribution of HBV genotypes in Latin America” Antiviral Therapy Vol 18, pp 459-465 89 Mustafa Sunbul (2014) “Hepatitis B virus genotypes: Global distribution and clinical importance”, World J Gastroenterol; 20(18), pp 5427–5434 90 Murat Sayan, Caner Cavdar, Cengiz Dogan.(2012) “Naturally occurring polymerase and surface gene variants of hepatitis B virus in Turkish Hemodialysis patients with chronic hepatitis B”.Jpn J Infect Dis Volume 65, pp 495-501 91.Natalie H Bzowej (2010).”Hepatitis B therapy in pregnancy” Curr Hepatitis Rep Volume 9, pp 197-204 92 Nguyen L Toan, Le H Song, Peter G Kremsner, Dinh N Duy, Vu Q Binh, Bernd Koeberlein, Stefan Kaiser, Reinhard Kandolf, Joseph Torresi and Thomas C Bock (2006) “Impact of Hepatitis B virus genotype and genotype mixtures on the course of liver disease in VietNam” Hepatology; Vol.43 No 6, pp 1375-1384 93.Nguyen M H., Garcia R T., Trinh H N., Nguyen H A., Nguyen K K., Nguyen L H.&Levitt B (2009) “Prevalence of hepatitis B Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn virus DNA polymerase mutations intreatment-naı v̈ e patients with chronic hepatitis” Aliment Pharmacol Ther Volume 30, pp 11501158 94 Nie Jing-Jing, Sun Kui-Xia, Li Jie (2012) “A type-specific nested PCR assay established and applied for investigation of HBV genotype and subgenotype in Chinese patients with chronic HBV infection”, Virology Journal; v.9, pp 121 95.Pattaratida Sa-nguanmoo, Tharmaphornpilas, Aim-orn Pisit Tangkijvanich, Rasdjarmrearnsook, Piyanit Saowanee Plianpanich, Nutchanart Thawornsuk, Apiradee Theamboonlers, Yong Poovorawan (2012) “Molecular analysis of hepatitis b virus associated with vaccine failure in infants and mothers : acase-con troll study in Thai land” Journal of Medical Virology Volume 84, pp 1177-1185 96.Perumal Vivekanandan, Om Vir Singh (2010).”Molecular Methods in the Diagnosis and Management of Chronic Hepatitis B” Expert Rev Mol Diagn.Volume 10(7), pp 921-935 97 Peveling-Oberhag J, Herrmann E, Kronenberger B, Farnik H, Susser S, Sarrazin C, Euzem S, Hofmannn W B (2013) “Dynamics of hepatitis B virus quasispecies heterogeneity and virologic in patients receiving lo-to-moderate genetic barrier nucleoside analogs”.Journal of Viral Hepatitis Volume 20.pp 234-239 98 Philip Vutien, Huy N Trinh, Ruel T Garcia, Huy A Nguyen, Brian S Levitt, Khanh Nguyen, Eduardo da Silveira, Tami Daugherty, Aijaz Ahmed, Gabriel Garcia, Glen A Lutchman, Mindie H Nguyen (2014).”Mutations in HBV DNA polymerase associated Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn with nucleos(t)ide resistance are rare in treatment-naïve patients”.Clinical gastroenterology and hepatology Volume 20 pp 834-834 99 Phung Thi Bich Thuy, Erik Alestig, Nguyen Thanh Liem, Charles Hannoun, Magnus Lindh (2010) “Genotype X/C Recombinant (Putative Genotype I) of Hepatitis B Virus is Rare in Hanoi,Vietnam—Genotypes B4 and C1 Predominate” Journal of Medical Virology Volume 82, pp.1327–1333 100.Rim Ouneissa, Olfa Bahri, Nissaf Ben Alaya-Bounafif, Sofiene Chouaieb, Ahlem Ben Hammami, Noureddine Filali, Yahia, amel Mohamed Sadraoui, Msaddak Walid Azzouz, Nabyl Ben Mami, Henda Triki (2012) “Frequency and clinical significance of core promoter and precore region mutations in Tunisian patients infected chronically with hepatitis B” Journal of Medical Virology Volume 84, pp 1719-1726 101.RybickaMagda, StalkePiotr, Dreczewski Marcin et al HighThroughput (2014).“Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization– Timeof FlightMass Spectrometry as an Alternative Approach to Monitoring Drug Resistance of Hepatitis B Virus” Journal of Clinical Microbiology Volume 52(1), pp -14 102.Salpini R., SvicherV , CentoV et al (2011) “Characterization of drug-resistance mutations in HBV D-genotype chronicallyinfected patients, naïve to antiviral drugs Antiviral Research Volume 92, pp 382-385 103 SebastianMalmstroăm, Ida Berglin-Enquist,Magnus Lindh (2010).” Novel Method for Genotyping Hepatitis B Virus on the Basis of Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn TaqMan Real-Time PCR” Journal of Cclinical Microbiology Volume 48(4), pp 1105-1111 104 Shi Weifeng, Zhu Chaodong , Zheng Wei (2012) “Subgenotype reclassification of genotype B hepatitis B virus”, BMC Gastroenterology ; 12, pp.116 105 Shi, Feili Wei, Dongmei Hu, Qing Li, Davey Smith, Ning Li, Dexi Chen (2012) “Mutations in the major hydrophilic region (MHR) of hepatitis B virus genotype C in North China” Journal of Medical Virology Volume 84, pp 1901- 1906 106 Singla Bhupesh, Chakraborti Anuradha, Sharma Bal Krishan et al (2013) “Hepatitis B Virus Reverse Transcriptase Mutationsin Treatment Naïve Chronic Hepatitis B” J Med Virol.Volune 85, pp 1155-1162 107 Soo-Yon Rhee, Severine Margeridon-Thermet, Mindie H Nguyen, Tommy F Liu, Ron M Kagan, Bastian Beggel, Jens Verheyen, Rolf Kaiser, Robert W Shafer (2010).”Hepatitis B virus reverse transcriptase sequence variant database for sequence analysis and mutation discovery” Antivirus Research Volume 88, pp 269-275 108 Soon Sun Kim, Jae Youn Cheong, Sung Won Cho (2011).” Current nucleos(t)ide analogue therapy for chronic hepatitis B” Gut and Liver Volume 5(3), pp 278-287 109 Stephen Locarnini, Fabien Zoulim (2010) “Molecular genetics of HBV infection” Gut and Liver Volume 15(3), pp 3-14 110 Stephen Locarnini (2008).” Primary resistance, multidrug resistance, and cross-resistance pathways in HBV as a consequence of treatment failure” Hepatol Int Volume 2, pp 147–151 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 111.Stephen Locarnini (2003) “Hepatitis B viral resistance : mechenisms and diagnosis” Journal of Hepatology Volume 39, pp 124-132 112 Takako Utsumi, Yoshihiko Yano, Hak Hotta (2014) “Molecular epidemiology of hepatitis B virus in Asia”, World J Med Genet ; 4(2): pp 19-26 113.The Pink Book (2012).Hepatitis B : Epidermiology and Preventio of vaccine Preventable diseases 12th Edition, pp 1322-1344 114 Tong Shuping, Li Jisu, Wands Jack R, Wen Yu-mei (2013) “Hepatitis B virus genetic variants: biological properties and clinical implications”, Emerging Microbes & Infections; v.2(3): e10 115.Valentina Svicher, Valeria Cento, Romina Salpini, Fabio Mercurio, Maria Fraune, Bastian Beggel, Yue Han, Caterina Giri, Linda Wittkop, Ada Bertili, Valeria Miceli, Guido Gubertini, Roberta Longo, Sara Romano, Michela Visca, Valentina Gallinaro (2011) “Role of hepatitis B virus genetic barrier in drug-resistance and immune-escape development”.Digestive and Liver disease Volume 43, pp.975-983 116 Wang Fanjun, Lu Lili, Yu Changshun, et al (2013) “Development of a novel DNA sequencing method not only for hepatitis B virus Genotyping but also for drug resistant mutation detection”, BMC Medical Genomics; 6(Suppl 1):S15 117.Weiwei Liu, Tingting Hu, Xinyu Wang, Yuming Chen, Minying Huang, Chao Yuan, Ming Guan (2012) “Coexistence of hepatitis B surface antigen and anti -HBs in Chinese Chronic hepatitis B Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn virus patients relating to genotype C and mutations in the S and P genereverse trscriptase region” Arch Virol Volume 157, pp 627-634 118.WHO (2010) “ Hepatitis B vaccines: WHO position paperrecommendation” Vaccine Volume 28, pp 589-590 119 William M Lee (2014) “Hepatitis B virus infection” The New England Journal of Medicine Volume 337 (24), pp 1733-1745 120 Xian-Hua Xu, Gai-Li li, yang qin, Qiang Li, Fa-Qun He, Jin-Ye Li, Quan- Rong Pan, Jie-Yin Deng (2013).”Entecavir plus adefovir rescue therapy for chronic hepatitis B patients efter multiple treatment failures in real-life practice”.Virology Journal Volume 10, pp 162-1167 121.Xiaodong Li, Lin Wang, Yanwei Zhong, Vincent Wai-Sun Wong, Zhihui Xu, Yan Liu, Qinghong Li, Shaojie Xin, Jingmin Hao, Dongpng Xu (2010) “ Hepatitis B virus (HBV) subgenotypes C2 and B2 differ in Lamivudine-and Adefovir resistance associated mutational patterns in HBV infected Chinese patients” Journal of clinical microbiology Volume 48 (12), pp 4363-4369 122.Xu XH, Li GL, Qin Y, Li Q, He FQ, Li JY, Pan QR and Deng JY (2013) “Entecavir plus adefovir therapy for chronic hepatitis B patients after multiple treatment failures in real-life practice” Vir J.Volume 10 pp 162-167 123.Yog esh Chawla, Bhupesh Singla, Balkrishan Sharma (2011) “Managing drug resistance in HBV” Medicine update, pp.369-374 124.Yueming Chen, Daojun Yu, Zhang Weiying (2012) “HBV Subgenotype C2 Infection, A1762T/G1764A Mutations May Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Contribute To Hepatocellular Carcinoma with Cirrhosis in Southeast China”, Iranian J Publ Health; v.41(11): pp.10-18 125 Yun-Fan Liaw, Jia-Horng Kao, Teerha Piratvisuth, Henry Lik Yuen Chan, Rong-Nan Chien, Chun-Jen Liu, Ed Gane, Stephen Locarnini,Seng-Gee Lim, Kwang-Hyub Han, Deepak Amarapurkar, Graham Cooksley, Wasim Jafri, Rosmawati Mohamed, Jin-Lin Hou, Wan-Long Chuang, Laurentius A Lesmana, Jose D Sollano, Dong-Jin Suh, Masao Omata (2012) “Asian-Pacific consensus statement on the management of chronic hepatitis B: a 2012 update” Hepatol Int Volume 6, pp 531–561 126 Zeinab N Said, Koula S Abdelwahab (2013) “Antivirus replication agents” Intech, pp 127-144 127 Zhong Jun, Gao Yue-qiu , Sun Xue-hua, Zhu Xiao-jun, Li Man (2012) “High prevalence of the B2+C2 subgenotype mixture in patients with chronic hepatitis B in Eastern China”, Acta Pharmacologica Sinica ; 33: pp 1271–1276 128 Zhuo-Lung Song, Yu-Jun Cui, Wei-Ping Zheng, Da-Hong Teng, Hong Zheng (2012) “Dianostic and therapeutic progress of multidrud resistance with anti-HBV nucleos(t)ide analogues” World Gastroenterol Volume18(48), pp 7149-7157 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn BẢNG THU THẬP SỐ LIỆU Mã số NC : ………… (ghi chữ số) Mã số khám bệnh : ………… Họ tên bệnh nhân : ………………………………… Nam □ Nữ □ Tuổi : …… Nghề nghiệp :………………………………………… Địa : số nhà : …………… Đường : ………………………………… Quận /Huyện : ………………………… Tỉnh/TP : …………………… Số điện thoại : Nhà riêng : ……………………… Di động : …………………… Ngày vào viện (khám) : …………………………… Chẩn đoán lâm sàng : ……………………………… Ngày lấy bệnh phẩm : ……………… Đã biết bị nhiễm HBV : Có □ Khơng □ Đã bị nhiễm HBV cách ? , > tháng □ < tháng □ , Nhiễm từ lúc sinh □ Ghi rõ thời gian : ……… (bao nhiêu tháng) 10 Làm cách bệnh nhân biết bị nhiễm HBV ? Thử máu để tiêm ngừa □ XN trước hiến máu □ Đi khám bệnh □ Khác :……………………… 11 Bệnh nhân giữ phiếu XN chứng minh nhiễm HBV ? Có □ Khơng □ Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 12 Có định điều trị viêm gan B m ạn tính ? Có □ Khơng □ 13 Ngày bắt đ iều điều trị Ngày ……… tháng ……… năm……… 14 Thuốc điều trị Lamivudine □ Adefovir □ Entecavir □ Thuốc c (ghi rõ tên thuốc ) : Kết XN : 15 HBeAg : âm tính □ dương tính □ ………… UI 16 ALT : ………… UI 17 HBV DNA định lượng : ……………… copies/ml 18 Genotype : A□ B □ C □ Khác : ………… 19 Subgenotype : …………… 20 Đột biến : Có □ Khơng □ 21 Loại đột biến :…………… …………………… -HẾT Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn D □ ... điểm kiểu gen đột biến kháng thuốc HBV bệnh nhân nhiễm HBV mạn tính chưa điều trị ” với mục tiêu sau: Mô tả phân bố kiểu gen, kiểu gen HBV số đặc điểm sinh học bệnh nhân nhiễm HBV mạn tính chưa điều. .. nghiên cứu nước - Đột biến kháng thuốc HBV bệnh nhân điều trị Các nghiên cứu đột biến kháng thuốc bệnh nhân viêm gan B điều trị thực nhiều nhằm khảo sát kiểu đột biến kháng thuốc làm sở cho việc lựa... BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH NGUYỄN THỊ HẢI YẾN ĐẶC ĐIỂM KIỂU GEN VÀ ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC CỦA HBV Ở BỆNH NHÂN NHIỄM HBV MẠN TÍNH CHƯA ĐIỀU TRỊ LUẬN ÁN TIẾN