ỨNG DỤNG PHƯƠNG PHÁP BLUP (BESTLINEAR UNBIASED PREDICTION) TRONGCHỌN LỌC GIỐNG HEO

VIỆN CHĂN NUÔI PHÂN VIỆN CHĂN NUÔI NAM BỘ *** ỨNG DỤNG PHƯƠNG PHÁP BLUP (BEST LINEAR UNBIASED PREDICTION) TRONG CHỌN LỌC GIỐNG HEO Năm Năm Thành phố Hồ Chí Minh, năm 2018 I GIỚI THIỆU TỔNG QUAN Phạm vi điều chỉnh đối tượng áp dụng 1.1 Phạm vi điều chỉnh: Quy trình khuyến cáo áp dụng sở nhân giống heo Việt Nam, bao gồm: - Các trại giống Quốc gia, - Các Trung tâm giống vật nuôi địa phương, - Các Tập đồn, Cơng ty, sơ sở nhân giống heo 1.2 Đối tượng áp dụng: Quy trình áp dụng để chọn lọc đẩy nhanh tiến bố di truyền đàn heo giống sở nhân giống tính trạng sinh trưởng, sinh sản heo 1.3 Đặc điểm, đặc tính mơ hình: Trong năm qua, quốc gia chăn nuôi phát triển, tiến di truyền tính trạng số lượng đạt chủ yếu chọn lọc dựa giá trị giống dự đoán phương pháp BLUP Vấn đề mấu chốt việc dự đoán giá trị giống từ giá trị kiểu hình quan sát tách phần ảnh hưởng di truyền khỏi ảnh hưởng ngoại cảnh Theo ngôn ngữ thống kê học, việc ước tính đồng thời giá trị yếu tố ảnh hưởng cố định (ngoại cảnh) dự đoán giá trị yếu tố ảnh hưởng ngẫu nhiên (giá trị di truyền cộng gộp) Để giải vấn đề này, phương pháp BLUP (Best Linear Unbiased Prediction) phương pháp tiên tiến cho phép hiệu chỉnh giá trị di truyền cộng gộp vật theo ảnh hưởng ngoại cảnh cố định mùa vụ, chăm sóc ni dưỡng, giới tính, lứa đẻ yếu tố khác Chính vậy, phương pháp BLUP dự đốn giá trị giống xác nhiều so với phương pháp chọn lọc kiểu hình trước Mặt khác, phương pháp BLUP sử dụng tất nguồn thông tin hệ phả nên thân giá trị giống dự đoán số kết hợp nhiều nguồn thông tin suất tổ tiên, anh chị em thân cá thể Hơn nữa, phương pháp BLUP ước tính giá trị giống cho cá thể khơng có số liệu hay tính trạng khơng thể đo lường trực tiếp vật, phương pháp sử dụng thông tin từ vật hệ phả ma trận tương quan di truyền tính trạng Cho đến thời điểm tại, phương pháp áp dụng phổ biến tất quốc gia phát triển có chi phí thấp, độ xác cao 1.4 Các yêu cầu mơ hình: Cơ sở chăn ni cần có thiết bị cân đo tiêu khối lượng, độ dày mỡ lưng, hệ thống sổ sách theo dõi, ghi chép Các cá thể cần đánh số tai phân biệt giống, nguồn gốc 1.5 Tổng quan mơ hình giới, Việt Nam 1.5.1 Tổng quan mơ hình giới Từ đầu năm 1990, phương pháp BLUP phát triển, số chọn lọc kết hợp giá trị giống ước tính tính trạng bắt đầu trở nên phổ biến chương trình giống heo nhiều quốc gia Ở Mỹ, số chọn lọc thiết lập khuyến cáo cho mục tiêu nhân giống khác (NSIF, 2002) bao gồm: Chỉ số nái sinh sản: SPI (Sow Productivity Index), kết hợp giá trị giống giá trị kinh tế hai tính trạng số sơ sinh sống/ổ (NBA) khối lượng 21 ngày tuổi/ổ (LW21) SPI = 100 + 6,5.EPDNBA + EPDLW21 Chỉ số đực cuối cùng: TSI (Terminal Sire Index), kết hợp giá trị giống giá trị kinh tế hai tính trạng tuổi đạt khối lượng khoảng 114kg (D) dày mỡ lưng lúc 114kg (BF) TSI = 100 – 1,7.EPDD – 168,0.EPDBF Chỉ số dòng mẹ: MLI (Maternal Line Index), kết hợp giá trị giống giá trị kinh tế tính trạng số sơ sinh sống/ổ, khối lượng 21 ngày tuổi/ổ, tuổi đạt khối lượng khoảng 110kg dày mỡ lưng lúc 110kg MLI = 100 + 6,0.EPDNBA + 0,4.EPDLW21 – 1,6.EPDD – 81,0.EPDBF Khác với chương trình giống Mỹ, chương trình cải thiện giống heo Canada (SIP, 2001) khuyến cáo hai số chính, là: Chỉ số dịng cha: SLI (Sire Line Index), kết hợp giá trị giống hai tính trạng tuổi đạt khối lượng 100 kg (age) dày mỡ lưng lúc 100 kg (fat) SLI = 100 – 25 SD x (0,45 EBVage + 1,83 EBVfat) Chỉ số dòng mẹ: DLI (Dam Line Index), kết hợp giá trị giống tính trạng số sơ sinh sống/ổ (nborn), tuổi đạt khối lượng 100 kg (age) dày mỡ lưng lúc 100 kg (fat) DLI = 100 + 25 SD x (6,18 EBVnborn – 0,45 EBVage – 1,83 EBVfat) Trong đó, SD độ lệch chuẩn di truyền đặc trưng cho giống, EBV nborn giá trị giống số sơ sinh sống/ổ, EBV age giá trị giống tuổi đạt 100kg EBVfat giá trị giống dày mỡ lưng lúc 100 kg Gần đây, với đòi hỏi ngày tăng chất lượng thịt thị trường, mục tiêu nhân giống dần thay đổi để đáp ứng địi hỏi người tiêu dùng Chính số tính trạng chất lượng thịt dày thăn, tỷ lệ nạc đặc biệt tỷ lệ mỡ giắt thịt nạc đưa thêm vào số chọn lọc Theo Fortin (2007), chương trình đánh giá di truyền giống heo quốc gia Canada thiết lập mục tiêu nhân giống cho năm tới Ngoài tính trạng sản xuất bao gồm số chọn lọc, tính trạng tỷ lệ nuôi sống heo sơ sinh, sức đề kháng với bệnh tật, ngoại hình thể chất heo hậu bị, tỷ lệ mỡ giắt, màu sắc, độ mềm độ axit thịt quan tâm chọn lọc mục tiêu ngắn hạn trung hạn Ở Úc, chương trình đánh giá di truyền BLUP áp dụng từ lâu đáp ứng chọn lọc cải thiện rõ rệt so sánh với số chọn lọc dựa giá trị kiểu hình (Long, 1990) Đặc biệt tính trạng có khả di truyền thấp, phương pháp số chọn lọc dựa giá trị giống đem lại hiệu chọn lọc cao so với phương pháp chọn lọc theo kiểu hình 50% với tính trạng có h = 0,1 sau 10 năm chọn lọc (Keele ctv, 1988) Tiến di truyền hàng năm tính trạng số sơ sinh sống/ổ tăng từ 0,1 – 0,3 con/ổ/năm Ở Mỹ, Stewart ctv (1991) cho biết hệ thống kiểm tra suất đánh giá di truyền giống heo (Swine Testing and Genetic Evaluation System – STAGES) phương pháp BLUP bắt đầu khởi động từ năm 1985 Lúc đầu chương trình đánh giá di truyền áp trại giống, sau đến năm 1990 chương trình mở rộng với hệ thống đánh giá liên kết nguồn gen trại giống Sau 10 năm ứng dụng phương pháp BLUP đánh giá di truyền giống heo, số sơ sinh sống tăng 0,5 con/ổ, dày mỡ lưng giảm 3,6 mm tuổi đạt khối lượng 114 kg rút ngắn ngày/con (trích dẫn Nguyễn Văn Thiện, 1998) Ở Canada, năm đầu chương trình cải tiến giống heo quốc gia (1989-1994) với việc áp dụng số chọn lọc dòng đực bao gồm tính trạng tuổi đạt khối lượng 100kg dày mỡ lưng đem lại tiến di truyền vượt trội hai giống Duroc Hampshire Mặc dù năm đầu áp dụng hệ thống đánh giá di truyền trại, tuổi đạt khối lượng 100kg giảm 0,4-1,4 ngày/năm dày mỡ lưng giảm 0,3-0,5 mm/năm (Gibson ctv, 2001) Sau giai đoạn này, chương trình đánh giá di truyền giống heo quốc gia Canada mở rộng thành hệ thống đánh giá liên kết trại giống sau 10 năm, tuổi đạt khối lượng 100 kg giảm 20 ngày dày mỡ lưng giảm 4,4 mm (SIP, 2002) Ở Pháp, từ năm 1989 Công ty VIAPORC áp dụng số chọn lọc dựa theo phương pháp BLUP đánh giá di truyền liên kết trại giống tồn Cơng ty nhằm cải thiện suất sinh sản dòng mẹ Large White Landrace (Pháp) Sau 10 năm chọn lọc, tiến di truyền hai đàn giống cải thiện nhanh chóng, đặc biệt với số sơ sinh sống/ổ tăng cao so với trung bình tồn đàn giống khắp quốc gia 0,75 con/ổ giống Large White 0,70 giống Landrace (trích dẫn Võ Văn Sự, 2000) Trong Anh, song song với việc cải thiện điều kiện chăn nuôi, quản lý, kết áp dụng phương pháp đánh giá di truyền liên kết trại giống heo mang lại bước cải thiện chưa có 10 năm: số sơ sinh sống/ổ tăng con/ổ hay con/nái/năm Gần nhất, công ty PIC (Pig Improvement Company, 2004) cho biết kết áp dụng số chọn lọc BLUP đàn heo sau năm cải thiện tuổi đạt khối lượng xuất bán giảm 6,3 ngày, dày mỡ lưng giảm 0,78 mm, dày thăn tăng 1,65 mm, tỷ lệ nạc tăng 0,9%, số sơ sinh sống/ổ tăng 0,42 khối lượng cai sữa tăng 0,48 kg/con Tương tự Cộng hòa Czech, hệ thống chọn lọc đánh giá di truyền giống heo quốc gia cho biết tiến di truyền tính trạng có tầm quan trọng mặt kinh tế tăng liên tục 10 năm từ 1988 đến 1997 (Wolf ctv, 1998) Tiến di truyền hàng năm đạt tính trạng tăng khối lượng bình quân/ngày heo sinh trưởng từ 30 – 100kg 9,29 g/ngày tỷ lệ nạc 0,39% Tại Đan Mạch (Danbred International, 2013), quốc gia sản xuất heo lớn giới với quần thể vào khoảng 27 triệu con, có 1,1 triệu heo nái (2013) 98% số lượng trang trại chăn nuôi heo tham gia vào hiệp hội Danbred Hệ thống nhân giống heo Danbred tổ chức theo tháp giống cấp độ: (1) cấp giống GGP bao gồm 32 trại giống với tổng số 6.712 nái cụ kị hạt nhân; (2) cấp GP bao gồm 153 trại giống với tổng số 69.700 nái ông bà (3) cấp PS bao gồm 2.601 trang trại với tổng số 1,1 triệu nái bố mẹ Các sở giống cụ kỵ chọn lọc thiết lập đàn hạt nhân trao đổi nguồn gen với đàn hạt nhân sở cụ kỵ khác (không cho phép nhập nguồn giống từ sở giống thấp cấp – GP PS) thông qua trạm kiểm tra suất (quy mô kiểm tra 6.000 đực/năm) trạm thụ tinh nhân tạo hệ thống hiệp hội Danbred Hàng năm, khoảng 1% đực 16 – 25% hậu bị sản xuất từ sở giống cụ kị (GGP) đưa trạm kiểm tra suất Quốc gia để kiểm tra, đánh giá kiểm định Toàn hệ thống đánh số, quản lý hệ phả, thu thập ghi chép số liệu suất cá thể thống từ trạm kiểm tra suất Quốc gia đến trại nhân giống cụ kị, trại ơng bà trại bố mẹ Tồn hệ thống liệu cập nhật hàng ngày truyền Trung tâm nghiên cứu heo thuộc ủy ban nông nghiệp thực phẩm Đan Mạch để xử lý theo mạng trực tuyến Các công tác chuyên môn đánh giá giá trị giống BLUP, chọn lọc, ghép phối, chứng nhận hệ phả thực chuyên gia di truyền giống Bất sở chăn nuôi heo nào, vào thời điểm truy cập lấy thơng tin cập nhật đàn giống sở khác Hệ thống quản lý đánh giá chất lượng giống heo Đan Mạch khởi đầu từ năm 1976 đến thành tựu mang lại cho quốc gia lĩnh vực giống heo đàn heo giống có chất lượng di truyền đứng hàng đầu giới Năm 2013, số sơ sinh sống đạt 15,3/ổ với giống Yorkshire Landrace 9,8 con/ổ với giống Duroc Số cai sữa đạt 35,2 con/nái/năm với nhóm trại tốt đạt 28,9 con/nái/năm với trung bình tồn hiệp hội Danbred Như vậy, công tác chọn lọc giống suốt vài thập kỷ qua, phương pháp đánh giá di truyền BLUP áp dụng phổ biến chọn lọc giống heo tất quốc gia phát triển Giai đoạn trước năm 1995, chương trình đánh giá di truyền áp dụng trại riêng biệt, sau nhanh chóng phát triển mở rộng thành hệ thống đánh giá liên kết trại giống Các kết chọn lọc giống heo quốc gia phát triển khẳng định tính hiệu phương pháp đánh giá di truyền BLUP so với phương pháp chọn lọc trước đây, đặc biệt với ưu điểm chi phí thấp độ xác cao tính trạng số lượng 1.5.2 Tổng quan mơ hình nghiên cứu Việt Nam Ở Việt Nam, từ đầu năm 90 trở lại đây, Bộ NN PTNT trọng đầu tư cho công tác cải tạo nâng cấp đàn giống thơng qua chương trình giống heo quốc gia Các giống heo cao sản Yorkshire (YY), Landrace (LL), Duroc (DD) Pietrain (PP) nhập vào Việt Nam từ nước Mỹ, Úc, Bỉ, Canada, Hà Lan, Pháp, Thái Lan số nước khác Đồng thời loạt dự án hợp tác quốc tế Việt Nam nước thực Dự án cải thiện giống Pháp (1985 - 1992), Dự án ACIAR –Úc cải thiện giống thức ăn heo Úc Việt Nam (1995-2000) Ngoài giống heo cao sản nhập nội, giống heo nội đầu tư nghiên cứu sử dụng dựa ưu điểm đẻ nhiều, nuôi khéo, chịu đựng kham khổ điều kiện chăn nuôi khó khăn Tuy nhiên, sinh trưởng chậm, tiêu tốn thức ăn cao tỷ lệ thấp, nên giống heo nội ngày dần nhường chỗ cho giống heo ngoại cao sản Yorkshire, Landrace, Duroc, Pietrain Trong công tác nhân giống chọn lọc, việc xây dựng áp dụng số chọn lọc chương trình chọn lọc cải thiện di truyền giống heo quan tâm nghiên cứu từ năm 1980 Cũng giống quốc gia phát triển, lúc đầu số chọn lọc áp dụng đàn heo giống xây dựng dựa việc kết hợp giá trị kiểu hình số tính trạng sản xuất quan trọng, sau tiếp tục phát triển cao với việc tiếp cận phương pháp đánh giá giá trị giống BLUP Một nghiên cứu chọn lọc kiểu hình Trần Thế Thông Lê Thanh Hải (1982) xây dựng áp dụng đàn heo đực Móng Cái hậu bị kết hợp tính trạng tăng khối lượng tiêu tốn thức ăn sau: I = 100 + 0,16 (X1 – X1 ) – 12,01(X2 – X2 ) Trong đó, X1 X2: Tăng khối lượng tiêu tốn thức ăn bình quân cá thể X1 X2 : Tăng khối lượng tiêu tốn thức ăn bình quân quần thể Đối với đàn heo nái Móng Cái, Đặng Vũ Bình (1992) sử dụng phương pháp Cunningham (1969) để xây dựng số chọn lọc kết hợp bốn tính trạng với mục tiêu nâng cao sức sinh sản Chỉ số có cơng thức sau: I = X1 + 0,84.X2 + 0,52.X3 – 0,02X4 Trong đó, I: Chỉ số chọn lọc sức sinh sản heo nái X1: Số đẻ sống/lứa (con) X2: Khối lượng toàn ổ 21 ngày tuổi (kg) X3: Khối lượng toàn ổ 60 ngày tuổi (kg) X4: Khoảng cách lứa đẻ (ngày) Đối với hai giống heo ngoại Yorkshire Landrace, Nguyễn Văn Thiện ctv (1995) khuyến cáo áp dụng số chọn lọc kết hợp hai tính trạng tăng khối lượng tiêu tốn thức ăn cho giống có cơng thức sau: I = 100 + 0,27(X1 – X1 ) – 28,8 (X2 – X2 ) (cho giống Yorkshire) I = 100 + (X1 – X1 ) – 4,4 (X2 – X2 ) (cho giống Lanrace) Trong đó, X1, X2: Tăng khối lượng tiêu tốn thức ăn TB heo đực kiểm tra X1 , X2 : Tăng khối lượng tiêu tốn thức ăn TB toàn đàn Với yêu cầu thị trường cần nâng cao tỷ lệ nạc thân thịt xẻ với phát triển kỹ thuật đo lường, tính trạng dày mỡ lưng quan tâm đưa vào số chọn lọc Do vậy, chọn lọc heo đực giống, ngồi hai tính trạng tăng khối lượng tiêu tốn thức ăn, độ dày mỡ lưng đưa vào mục tiêu nhân giống mang lại hiệu chọn lọc đáng kể Chỉ số chọn lọc ba tính trạng Lê Thanh Hải (1998) đề xuất có dạng sau: I = 100 + 0,30 (X1- X1 ) – 26,5 (X2 – X2 ) – 4,4 (X3 – X3 ) Trong đó, X1: Tăng khối lượng bình quân/ngày X2: Tiêu tốn thức ăn X3: Độ dày mỡ lưng X1 , X2 , X3 : Giá trị trung bình tồn đàn ứng với tính trạng Trên hai giống heo Landrace Yorkshire, Nguyễn Quế Côi Võ Hồng Hạnh (2000) xây dựng hàng loạt số chọn lọc dựa giá trị kiểu hình tính trạng sản xuất heo đực hậu bị Các số có dạng sau: Đối với heo đực hậu bị Landrace trạm kiểm suất: I = 100 + 0,157 (X1 - X1 ) – 25,315 (X2 - X2 ) – 3,555 (X3 - X3 ) Đối với heo đực hậu bị Landrace dùng sở nhân giống: I = 100 + 0,057 (X1 - X1 ) – 1,531 (X3 - X3 ) Đối với heo đực hậu bị Yorkshire trạm kiểm suất: I = 100 + 0,411(X1 - X1 ) – 49,257 (X2 - X2 ) – 5,887 (X3 - X3 ) Đối với heo đực hậu bị Yorkshire dùng sở nhân giống: I = 100 + 0,155 (X1 - X1 ) – 21,137 (X3 - X3 ) Trong đó, X1: Tăng khối lượng bình quân/ngày cá thể (g/ngày) X2: Chỉ số tiêu tốn thức ăn/kg tăng khối lượng cá thể (Kg/Kg) X3: Độ dày mỡ lưng cá thể (mm) X1 : Tăng khối lượng bình quân/ngày toàn đàn (g/ngày) X2 : Chỉ số tiêu tốn thức ăn/kg tăng khối lượng toàn đàn (Kg/Kg) X3 : Độ dày mỡ lưng toàn đàn (mm) Những năm gần đây, phương pháp ước lượng giá trị giống BLUP trở nên phổ biến giới bắt đầu ứng dụng Việt Nam Việc xây dựng số chọn lọc kết hợp giá trị giống tính trạng chọn lọc bắt đầu quan tâm số trại heo giống Đối với tính trạng sinh sản hai giống Yorkshire Landrace, Đoàn Văn Giải Vũ Đình Tường (2004) báo cáo tiến di truyền bước đầu hai giống heo Xí nghiệp heo giống Đơng Á việc áp dụng số chọn lọc sau: I = 169 EBVCSS + 16 EBVP21 Trong đó, EBVcss: Giá trị giống số sơ sinh sống/ổ EBVP21: Giá trị giống khối lượng 21 ngày tuổi/ổ Bằng việc sử dụng số chọn lọc nái sinh sản đây, Đoàn Văn Giải Vũ Đình Tường (2004) cho biết tiến di truyền bình quân số sơ sinh sống/ổ khối lượng 21 ngày tuổi/ổ tương ứng 0,045 con/năm 0,056kg/ổ giống Yokshire; 0,047con/năm 0,070kg/ổ giống Landrace năm từ 2001 – 2004 Một số sở giống heo khác Công ty Chăn nuôi heo Phú Sơn (Dương Minh Nhật, 2004; Trịnh Công Thành Dương Minh Nhật, 2005), Xí nghiệp heo giống cấp I, Xí Nghiệp chăn ni heo Đồng Hiệp Xí nghiệp chăn ni heo Dưỡng Sanh (Trịnh Công Thành, 2002) hay Trung tâm NC & HLCN Bình Thắng (Nguyễn Văn Hùng, 2005) xây dựng số chọn lọc cho dòng cha, dòng mẹ cho kết tương tự 2 Giải thích từ ngữ 2.1 REML (Restricted Maximum Likelihood): phương pháp phân tích thống kê làm tương đồng tối đa có giới hạn 2.1 BLUP (Best Linear Unbiased Prediction): phương pháp phân tích dự đốn tuyến tính khơng thiên vị tốt 2.3 Nhóm tương đồng (Contemporary group): Các nhóm cá thể thuộc giống, dịng, giới tính ni điều kiện quản lý tương tự 2.4 Giá trị giống dự đoán – EBV (Estimated breeding value): giá trị tổng ảnh hưởng di truyền tính trạng đến hệ sau Do giá trị giống thực vật biết được, nên ln dự đốn dựa kiểu hình (năng suất) cá thể họ hàng thân thuộc 2.5 Phương sai (Variance): tham số thống kê mô tả biến động (sai khác) quan sát tính trạng dựa vào độ lớn phương sai, nhận biết cá thể có vượt trội di truyền so với cá thể khác quần thể hay không 2.6 Hệ số di truyền (Heritability): Hệ số di truyền đo lường phần sai khác tính trạng cá thể quần thể di truyền tạo nên truyền từ hệ qua hệ khác 2.7 Tương quan di truyền (Genetic correlation): Tương quan di truyền hai tính trạng tồn số gen giống tác động đồng thời lên hai tính trạng Khi hai tính trạng có tương quan di truyền thuận mức cao, việc chọn lọc cải thiện tính trạng kéo theo cải thiện tính trạng ngược lại 2.9 Chỉ số chọn lọc (Selection index): biểu thức kết hợp giá trị suất vài tính trạng thành giá trị vật Chỉ số chọn lọc hiệu chỉnh tính trạng theo giá trị kinh tế khả di truyền chúng với mối quan hệ di truyền tính trạng Chương II: NỘI DUNG QUY TRÌNH Bước Kiểm tra suất cá thể 1.1Đánh số mã hóa số hiệu cá thể - Lựa chọn hệ thống đánh số tai phù hợp với quy mô đàn, điều kiện sản xuất, quản lý sở áp dụng đánh số tốt cho cá thể heo giống (phụ lục 1.1) - Tất cá thể heo sau sinh sống phải đánh số, phương pháp xăm tai, cắt số tai bấm thẻ nhựa - Mã hóa số hiệu cá thể có chứa mã nguồn gốc (nơi sinh), năm sinh số tai cá thể (phụ lục 1.1) 1.2 Tiến hành kiểm tra suất cá thể thu thập liệu - Chọn heo đực hậu bị từ 70 - 75 ngày tuổi có khối lượng từ 25 – 30 kg/con có lý lịch đầy đủ, rõ ràng đưa vào kiểm tra suất cá thể - Trước đưa heo vào kiểm tra suất, lập phiếu theo dõi cá thể ghi đầy đủ thông tin vào phiếu; kiểm tra đánh giá tình trạng sức khỏe, chương trình phòng bệnh, hiệu vaccine vệ sinh sát trùng chuồng trại, trang thiết bị, dụng cụ chăn nuôi - Xây dựng chương trình phịng bệnh vaccine chi tiết cho đàn giống đưa vào kiểm tra suất - Áp dụng thống hệ thống quản lý, chuồng trại, chế độ chăm sóc ni dưỡng, chương trình chăm sóc thú y cho tất cá thể kiểm tra suất - Khi kết thúc kiểm tra (từ 95 – 110 kg), cân khối lượng, đo dày mỡ lưng điểm P2 (xương sườn thứ 10) - Ghi chép, cập nhật số liệu cá thể giai đoạn kiểm tra suất tiêu ngày bắt đầu, ngày kết thúc, khối lượng bắt đầu kết thúc, dày mỡ lưng lúc kết thúc, thức ăn tiêu thụ vào biểu mẫu theo dõi cá thể (phụ lục 1.2) - Lưu trữ quản lý sở liệu cá thể sử dụng phần mềm quản lý liệu HEOMAN chương trình máy tính đơn giản Access hay Excel Bước Xử lý hiệu chỉnh xây dựng sở liệu cho phân tích di truyền 2.1 Hiệu chỉnh liệu kiểm tra suất - Kiểm tra sai sót có hệ phả, ngày tháng xử lý cá thể khơng có liệu sở liệu (phụ lục 2.1) - Điều chỉnh tiêu sinh trưởng dày mỡ lưng tính trạng chọn lọc: ngày tuổi đạt 100kg dày mỡ lưng lúc 100kg, theo khuyến cáo Hiệp hội cải tiến giống heo Hoa Kỳ (NSIF, 2002) - Điều chỉnh ngày tuổi đạt khối lượng 100 kg (T100 – ngày) sau: T100ĐC = TTT + [(P100 – PTT)(TTT – a)/ PTT] Với a = 50 đực, a = 40 Trong đó, T100ĐC: Ngày tuổi đạt khối lượng 100 kg điều chỉnh (ngày) TTT: Tuổi thực tế (ngày) PTT: Khối lượng thực tế (kg) P100: Khối lượng điều chỉnh (= 100kg) - Điều chỉnh dày mỡ lưng 100 kg (ML100 – mm) sau: ML100ĐC = MLTT + [(P100 – PTT) MLTT / (PTT – b)] Với b = -20 đực, b = Trong đó, ML100ĐC : Dày mỡ lưng điều chỉnh 100 kg (mm) MLTT : Dày mỡ lưng thực tế (mm) PTT : Khối lượng thực tế (kg) P100 : Khối lượng điều chỉnh (= 100 kg) 2.2 Thiết lập nhóm tương đồng sở liệu Đối với tính trạng kiểm tra suất, cá thể nhóm tương đồng cần có tiêu chí chung sau đây: - Cùng giống dịng hay nhóm giống - Cùng giới tính giai đoạn phải nuôi điều kiện - Có ngày tuổi gần tương tự (các cá thể chênh lệch tối đa tuần) - Các điều kiện nuôi dưỡng, thức ăn, hệ thống quản lý tương tự - Có tình trạng sức khỏe tương tự (tất phải khỏe mạnh) - Khối lượng kết thúc kiểm tra chênh lệnh khoảng – 10kg so với khối lượng dự kiến đánh giá (100kg) - Sử dụng biểu mẫu tổng quát để thiết lập nhóm tương đồng tính trạng kiểm tra suất (phụ lục 2.2) 2.3Thiết lập sở liệu sử dụng cho phân tích thống kê di truyền - Đối với tính trạng kiểm tra suất, thiết lập sở liệu thành tập tin liệu kết hợp thông tin hệ phả thông tin liệu suất (xem biểu mẫu phụ lục 2.3) - Ghép cột liệu trại/đàn (ký hiệu H), năm sinh (ký kiệu Y), mùa vụ (ký hiệu S) thành cột chung (yếu tố ảnh hưởng chung “HYS”) mô tả bảng 2.3 phụ lục 2.3 - Sau điều chỉnh tiêu suất sinh trưởng dày mỡ lưng tập tin liệu, chuyển tập tin từ bảng EXCEL thành dạng tập tin văn định dạng Text (Tab delimited) để sử dụng cho quy trình BLUP phần mềm PEST theo biểu (phụ lục 2.3) Bước Đánh giá giá trị giống 3.1 Thiết lập mơ hình phân tích thống kê di truyền Mơ hình phân tích thống kê sử dụng cho tính trạng kiểm tra suất cá thể (T100, ML100) sau: Yijklm = µ + HYSi + Gj + Sk + al + eijklm Trong đó: Yijklm: µ: Giá trị kiểu hình tính trạng Giá trị trung bình kiểu hình quần thể HYSi: Ảnh hưởng đàn x năm x tháng (theo ngày sinh) Gj: Ảnh hưởng nhóm giống Sk : Ảnh hưởng giới tính al : Ảnh hưởng di truyền cộng gộp cá thể eijklm : Sai số ngẫu nhiên 3.2 Ước tính thơng số di truyền sử dụng phương pháp REML - Sử dụng thông số di truyền (hệ số di truyền - h 2, tương quan di truyền rG, tương quan ngoại cảnh - r E) độ lệnh chuẩn (SD) tính tốn từ đàn giống nghiên cứu chọn lọc tham khảo kết tương tự công bố (phụ lục 3.1) để đưa vào dự đoán giá trị giống trường hợp sở liệu đàn giống chọn lọc hạn chế số lượng số hệ hệ phả (120 điểm) + Ngoại hình (> điểm) - Các cá thể có tiêu ngoại hình có thang điểm