Một số đặc điểm dịch tễ học hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna tại một số địa phương ở Việt Nam

Một số đặc điểm dịch tễ học hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna tại một số địa phương ở Việt Nam Một số đặc điểm dịch tễ học hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna tại một số địa phương ở Việt Nam luận văn tốt nghiệp thạc sĩ

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƢƠNG -* - HOÀNG MINH ĐỨC MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI MỘT SỐ ĐỊA PHƢƠNG Ở VIỆT NAM LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC HÀ NỘI – 2014 ii BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƢƠNG -* - HOÀNG MINH ĐỨC MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI MỘT SỐ ĐỊA PHƢƠNG Ở VIỆT NAM Chuyên ngành Mã số : DỊCH TỄ HỌC : 62.72.01.17 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS TS PHAN THỊ NGÀ GS TS VŨ SINH NAM HÀ NỘI – 2014 iii LỜI CẢM ƠN Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới Lãnh đạo Cục Y tế dự phòng, Lãnh đạo Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ƣơng, Khoa Đào tạo Quản lý khoa học, thầy cô giáo tạo điều kiện thuận lợi, giúp đỡ tơi suốt q trình học tập hồn thiện Luận án Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới PGS.TS Phan Thị Ngà GS.TS Vũ Sinh Nam thầy cô trực tiếp hƣớng dẫn, động viên khích lệ, tận tình giúp đỡ định hƣớng cho suốt thời gian học tập, nghiên cứu thực Luận án Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới GS.TS Phạm Ngọc Đính, Phó Tổng biên tập Tạp chí Y học dự phịng đóng góp ý kiến q báu để tơi hồn thành Luận án Tơi xin bày tỏ lời cảm ơn chân thành tới ThS Bùi Minh Trang, ThS Đặng Thị Thu Thảo, cử nhân Nguyễn Thành Ln Phịng thí nghiệm Vi sinh, Khoa Đào tạo Quản lý Khoa học; ThS Đỗ Phƣơng Loan, PGS TS Nguyễn Thị Hiền Thanh, Khoa vi rút; Cử nhân Nguyễn Thị n phịng thí nghiệm Cơn trùng, Khoa Cơn trùng Động vật Y học; ThS Đỗ Thiện Hải, Phó chủ nhiệm Khoa Truyền nhiễm bệnh viện Nhi Trung ƣơng; ThS Nguyễn Thị Tuyết, Phó chủ nhiệm Khoa Truyền nhiễm bệnh viện Đa Khoa tỉnh Bắc Giang giúp đỡ tơi q trình thực kỹ thuật xét nghiệm nhƣ hoàn thành việc điều tra, thu thập số liệu nghiên cứu Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành hợp tác giúp đỡ Giáo sƣ Kouichi Morita, Khoa Vi rút, Viện Y học Nhiệt đới Trƣờng đại học Nagasaki Nhật Bản nghiên cứu đề tài Tôi vô biết ơn quan tâm, động viên giúp đỡ gia đình, bạn bè bạn đồng nghiệp trình học tập, nghiên cứu hồn thành Luận án Hà Nội, ngày 07 tháng năm 2014 Tác giả luận án Hoàng Minh Đức iv LỜI CAM ĐOAN Đƣợc đồng ý tác giả cho phép sử dụng số liệu báo, đề tài nghiên vào nội dung luận án Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu tơi, tơi thực dƣới hƣớng dẫn thầy cô Chủ nghiệm đề tài Kết nêu Luận án trung thực chƣa công bố cơng trình khác Tơi xin chịu hoàn toàn trách nhiệm lời cam đoan Hà Nội, ngày 07 tháng năm 2014 Tác giả luận án Hoàng Minh Đức v MỤC LỤC Nội dung Trang Trang phụ bìa ii Lời cảm ơn iii Lời cam đoan iv Mục lục v Danh mục chữ viết tắt viii Danh mục hình, bảng biểu ix ĐẶT VẤN ĐỀ CHƢƠNG I – TỔNG QUAN 1.1 Lịch sử hội chứng não cấp 1.1.1 Trên giới 1.1.2 Tại Việt Nam 1.2 Dịch tễ học hội chứng não cấp vi rút Banna 1.2.1 Ổ chứa vi rút 1.2.2 Véc tơ truyền vi rút Banna 1.2.3 Khối cảm thụ 12 1.3 Đặc điểm hình thái, cấu trúc vi rút Banna 13 1.3.1 Đặc điểm hình thái 13 1.3.2 Đặc điểm cấu trúc vi rút Banna 15 1.3.3 Cấu trúc genome vi rút Banna 17 1.3.4 Cấu trúc chức protein vi rút Banna 17 1.3.5 Phân loại nguồn gốc vi rút Banna 19 1.3.6 Sự chép vi rút 21 1.4 Đặc điểm hội chứng não cấp ngƣời vi rút Banna 22 1.4.1 Sinh bệnh học 22 1.4.2 Đặc điểm lâm sàng 23 vi Nội dung Trang 1.4.3 Đáp ứng miễn dịch 24 1.4.4 Điều trị dự phòng bệnh 24 1.5 Các phƣơng pháp chẩn đốn phịng thí nghiệm 25 1.5.1 Phƣơng pháp phát nhanh vi rút 25 1.5.2 Phƣơng pháp phân lập vi rút 26 1.5.3 Phƣơng pháp chẩn đoán huyết học 27 CHƢƠNG II - ĐỐI TƢỢNG, VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 31 2.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu 31 2.2 Đối tƣợng nghiên cứu 31 2.3 Phƣơng pháp nghiên cứu 33 2.3.1 Thiết kế nghiên cứu 2.3.2 Điều tra xác định đặc điểm dịch tễ học bệnh nhân HCNC 33 33 2.4 Vật liệu kỹ thuật xét nghiệm phịng thí nghiệm 35 2.4.1 Phƣơng pháp xét nghiệm kháng thể kỹ thuật miễn dịch enzyme gián tiếp phát IgM kháng vi rút Banna – IgM INDIRECT ELISA 35 2.4.2 Phƣơng pháp phân lập vi rút 2.5 Thống kê toán học số phần mềm tin sinh học sử dụng phân tích đặc điểm phân tử chủng vi rút Banna 37 50 2.5.1 Thống kê toán học 50 2.5.2 Sử dụng phần mềm tin sinh học 50 2.6 Chấp thuận đạo đức nghiên cứu y sinh 51 2.7 Hạn chế thiết kế nghiên cứu 52 CHƢƠNG III – KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 53 3.1 Mô tả số đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng bệnh nhân hội chứng não cấp nghi ngờ vi rút Banna số địa phƣơng củaViệt Nam, 2002-2012 53 vii Nội dung Trang 3.1.1 Mô tả tỷ lệ số mắc bệnh nhân hội chứng não cấp vi rút Banna 53 3.1.2 Đặc điểm lâm sàng bệnh nhân hội chứng não cấp vi rút Banna 58 3.2 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna quần thể muỗi thu thập số địa phƣơng Việt Nam 64 3.2.1 Kết thu thập muỗi năm 2001-2011 64 3.2.2 Kết phân lập vi rút Banna từ mẫu muỗi thu thập 68 3.3 Một số đặc điểm sinh học phân tử vi rút Banna phân lập đƣợc Việt Nam 75 3.3.1 Phân bố vi rút Banna Việt Nam 75 3.3.2 Đặc điểm dịch tễ học vi rút Banna Việt Nam 77 3.3.3 Kết giải trình tự nucleotide vùng gen mã hóa số 12 82 3.3.4 Đặc điểm acid amin thay vùng gen mã hóa số 12 84 CHƢƠNG IV – BÀN LUẬN 86 4.1 Mô tả số đặc điểm dịch tễ, lâm sàng hội chứng não cấp nghi ngờ vi rút Banna số địa phƣơng Việt Nam, 2002 - 2012 86 4.2 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna quần thể muỗi thu thập số địa phƣơng Việt Nam 97 4.3 Xác định số đặc điểm sinh học phân tử vi rút Banna phân lập đƣợc Việt Nam 102 KẾT LUẬN 108 KIẾN NGHỊ 111 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH ĐÃ CÔNG BỐ 112 TÀI LIỆU THAM KHẢO 114 PHỤ LỤC 129 viii DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT BAV BAV-Ch BAV-In CTFV DENV dsRNA EEE EYAV GenBank GenBank Database HCNC HIV KDV LAC MAC-ELISA Motif NCR NLRV POW RT-PCR RRSV RNA SLE SDS-PAGE VNNB VIB VP WEE Banna vi rút Banna vi rút Trung Quốc Banna vi rút Indonesia Colorado tick f�u phòng bệnh lxxii vác xin tỉnh Thái Bình, 2003 -2007" Tạp chí Y học dự phòng, tập XVIII, số (3/95), tr 54 – 59 Bộ Y tế, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ƣơng (2001) Phân tích số liệu bệnh truyền nhiễm Việt Nam (1996 – 2000), tr – 15 Phạm Ngọc Đính, Phạm Thị Sửu, Lê Hồng Phong, Nguyễn Bình Nguyên (2005) Đặc điểm dịch tễ học viêm não cấp vi rút số địa phƣơng miền Bắc 2003 – 2004 Tạp chí Y học dự phịng, tập XV, số (75), tr 64 – 68 Trịnh Quân Huấn Bệnh viêm não Nhật Bản Nhà xuất Y học (2010) tr – 85 Hoàng Thủy Long (1991), "Kỹ thuật xét nghiệm vi sinh vật Y học", Nhà xuất Văn hóa, tr 386-393 Đỗ Phƣơng Loan, Đặng Đình Thoảng, Bùi Minh Trang, Nguyễn Viết Hoàng, Lê Thị Hiền Thu, Phan Thị Ngà (2008), "Phát tần suất nhiễm vi rut viêm não Nhật Bản quần thể lợn Hà Nam kỹ thuật GAC-ELISA", Tạp chí Y học dự phịng, tập 2, số 18, tr 12-17 Phan Thị Ngà, Lê Kim Phƣợng cộng (1996) “Phân lập vi rút viêm não Nhật Bản từ bệnh nhân miền Bắc Việt Nam năm 1984 – 1993 chuột ổ” Tạp chí vệ sinh phịng dịch, tập VI số (26), tr 2529 10 Phan Thị Ngà, Nguyễn Thị Kiều Anh, Huỳnh Phƣơng Liên, Trần Văn Tiến (2000), "Sự thay đổi giảm tỷ lệ mắc bệnh VNNB (qua chẩn đoán huyết thanh) miền Bắc Việt Nam, 1998", Tuyển tập cơng trình 1997 – 2000, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương, Nhà xuất Y học, Hà Nội, tr 72-75 lxxiii 11 Phan Thị Ngà, Nguyễn Thị Kiều Anh, Huỳnh Phƣơng Liên cộng (2000), "Giám sát huyết học bệnh VNNB, 1998-1999", Tuyển tập cơng trình 1997 - 2000 Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương, Nhà xuất Y học, Hà Nội, tr 84-87 12 Phan Thị Ngà, Nguyễn Thị Kiều Anh cộng (2002), "Giám sát, chẩn đoán VNNB Việt Nam, 2000 – 2001", Tạp chí Y học Dự phịng, tập XII, số (55), tr - 10 13 Phan Thị Ngà and K Morita (2004), "Phát vi rút viêm não từ dịch não tủy bệnh nhân có hội chứng não cấp miền Bắc Việt Nam", Tạp chí Nghiên cứu Y học, tập 29, số 3, tr 13-17 14 Phan Thị Ngà, Vũ Sinh Nam, Masahiro Takagi (2004) Nghiên cứu tồn vi rút viêm não Nhật Bản tự nhiên Tạp chí Y học dự phòng tập XIV, số (64) tr 21 – 26 15 Phan Thị Ngà (2004), "Phân lập vi rút Arbo từ muỗi bắt thực địa miền bắc miền trung Việt Nam, 9/2001-12/2003", Y học Việt Nam, Tập 31, số 5, tr 22 – 26 16 Phan Thị Ngà (2004), "Viêm não Nhật Bản kỹ thuật chẩn đoán", Nhà xuất Y học 17 Phan Thị Ngà, Mary B Crabtree (2004), "Ứng dụng kỹ thuật RT - PCR để chọn mẫu dịch não tủy cho phân lập vi rút muỗi truyền từ bệnh nhân có hội chứng não cấp miền Bắc Việt Nam", Tạp chí nghiên cứu Y học 30, số 14, tr – 10 18 Phan Thị Ngà, Đoàn Hải Yến (2005), "Chế tạo kháng nguyên vi rút Nam Định góp phần chẩn đoán nguyên vi rút gây hội chứng não cấp", Tạp chí Vệ sinh phịng dịch, tập XV, số 5(70), tr 62-67 ... TẾ VI? ??N VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƢƠNG -* - HOÀNG MINH ĐỨC MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI MỘT SỐ ĐỊA PHƢƠNG Ở VI? ??T NAM Chuyên ngành Mã số. .. lập vi rút Banna từ mẫu muỗi thu thập 68 3.3 Một số đặc điểm sinh học phân tử vi rút Banna phân lập đƣợc Vi? ??t Nam 75 3.3.1 Phân bố vi rút Banna Vi? ??t Nam 75 3.3.2 Đặc điểm dịch tễ học vi rút Banna. .. sàng hội chứng não cấp nghi ngờ vi rút Banna số địa phƣơng Vi? ??t Nam, 2002 - 2012 86 4.2 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna quần thể muỗi thu thập số địa phƣơng Vi? ??t Nam 97 4.3 Xác định số đặc điểm