Luận án Tiến sỹ Y học: Một số đặc điểm dịch tễ học hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút banna tại một số địa phương ở Việt Nam

Luận án hướng đến các mục tiêu nghiên cứu: mô tả một số đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna ở một số địa phương của Việt Nam, 2002-2012; xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna trong quần thể muỗi thu thập ở một số địa phương Việt Nam; xác định một số đặc điểm sinh học phân tử của vi rút Banna phân lập được ở Việt Nam. Để biết rõ hơn về nội dung chi tiết, mời các bạn cùng tham khảo.

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG -* - HOÀNG MINH ĐỨC MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI MỘT SỐ ĐỊA PHƯƠNG Ở VIỆT NAM LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC HÀ NỘI – 2014 ĐẶT VẤN ĐỀ Hội chứng não cấp (HCNC) nhiều nguyên nhân khác vi rút nguyên nhân chủ yếu gây HCNC bao gồm nhóm vi rút lây truyền trực tiếp vi rút Nipah, vi rút đường ruột , nhóm vi rút trùng truyền vi rút viêm não Nhật Bản (VNNB), vi rút viêm não Nga xuân hạ, vi rút viêm não ngựa miền Đông nhóm vi rút tiềm ẩn số type vi rút Herpes simplex [6],[12],[17] [29],[66],[94] HCNC vi rút khơng có thuốc điều trị đặc hiệu (trừ vi rút Herpes simplex), nên bệnh thường có tỷ lệ tử vong cao di chứng thần kinh nặng nề Biện pháp phịng chống có hiệu sử dụng vắc xin cắt đường truyền dịch tễ diệt véc tơ, loại trừ yếu tố tiếp xúc trực tiếp với vi rút [3],[31],[43],[49],[57],[65],[89],[97] Hiện xác định khoảng 100 loại vi rút khác gây HCNC, số vi rút Banna tác nhân vi rút phát cho nguyên nhân gây HCNC số nước châu Á Việt Nam, Trung Quốc [26],[27],[29],[32],[33],[72],[74],[ 99] Vi rút Banna thuộc chi Seadornavirus, họ Reoviridae, vi rút có vật liệu di truyền ARN sợi kép gồm có 12 phân đoạn Chủng vi rút Banna phân lập từ dịch não tủy bệnh nhân có HCNC từ máu bệnh nhân sốt không rõ nguyên nhân viêm não t nh unnan, Trung Quốc sau c ng phân lập vùng khác từ bệnh nhân, từ muỗi Trung Quốc, Indonesia Việt Nam [19],[44],[47],[50],[83] Việt Nam, chủng vi rút phân lập từ bệnh nhân miền Bắc (t nh Thanh Hóa) năm 2003 Tây Nguyên (t nh Gia Lai) năm 2005 Nghiên cứu hồi cứu xác định vi rút Banna phân lập từ muỗi Culex hai t nh Hà Tây (nay thuộc Hà Nội) t nh Quảng B nh năm 2002 [19],[21],[83] Việc ghi nhận vi rút Banna phát muỗi Culex đồng thời c ng loại véc tơ truyền bệnh viêm não Nhật Bản Việt Nam cho thấy việc nghiên cứu sâu số đặc m lâm sàng, dịch tễ sinh học phân tử, huyết học véc tơ truyền bệnh vi rút Banna cần thiết Đ góp phần vào việc giám sát, chẩn đốn, điều trị dự phịng HCNC nghi ngờ vi rút Banna gây ra, nghiên cứu đề tài “Một số đặc điểm dịch tễ học hội chứng não cấp nghi ngờ vi rút Banna số địa phương Việt Nam” thực với ba mục tiêu cụ th sau: Mô tả số đặc m dịch tễ học, lâm sàng hội chứng não cấp nghi ngờ vi rút Banna số địa phương Việt Nam, 2002 – 2012 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna quần th muỗi thu thập số địa phương Việt Nam Xác định số đặc m sinh học phân tử vi rút Banna phân lập Việt Nam ii BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG -* - HOÀNG MINH ĐỨC MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI MỘT SỐ ĐỊA PHƯƠNG Ở VIỆT NAM Chuyên ngành Mã số : DỊCH TỄ HỌC : 62.72.01.17 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS TS PHAN THỊ NGÀ GS TS VŨ SINH NAM HÀ NỘI – 2014 iii LỜI CẢM ƠN Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới Lãnh đạo Cục Y tế dự phòng, Lãnh đạo Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ƣơng, Khoa Đào tạo Quản lý khoa học, thầy cô giáo tạo điều kiện thuận lợi, giúp đỡ suốt q trình học tập hồn thiện Luận án Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc tới PGS.TS Phan Thị Ngà GS.TS Vũ Sinh Nam thầy trực tiếp hƣớng dẫn, động viên khích lệ, tận tình giúp đỡ định hƣớng cho tơi suốt thời gian học tập, nghiên cứu thực Luận án Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới GS.TS Phạm Ngọc Đính, Phó Tổng biên tập Tạp chí Y học dự phịng đóng góp ý kiến q báu để tơi hồn thành Luận án Tôi xin bày tỏ lời cảm ơn chân thành tới ThS Bùi Minh Trang, ThS Đặng Thị Thu Thảo, cử nhân Nguyễn Thành Ln Phịng thí nghiệm Vi sinh, Khoa Đào tạo Quản lý Khoa học; ThS Đỗ Phƣơng Loan, PGS TS Nguyễn Thị Hiền Thanh, Khoa vi rút; Cử nhân Nguyễn Thị n phịng thí nghiệm Cơn trùng, Khoa Côn trùng Động vật Y học; ThS Đỗ Thiện Hải, Phó chủ nhiệm Khoa Truyền nhiễm bệnh viện Nhi Trung ƣơng; ThS Nguyễn Thị Tuyết, Phó chủ nhiệm Khoa Truyền nhiễm bệnh viện Đa Khoa tỉnh Bắc Giang giúp đỡ tơi q trình thực kỹ thuật xét nghiệm nhƣ hoàn thành việc điều tra, thu thập số liệu nghiên cứu Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành hợp tác giúp đỡ Giáo sƣ Kouichi Morita, Khoa Vi rút, Viện Y học Nhiệt đới Trƣờng đại học Nagasaki Nhật Bản nghiên cứu đề tài Tôi vô biết ơn quan tâm, động viên giúp đỡ gia đình, bạn bè bạn đồng nghiệp trình học tập, nghiên cứu hoàn thành Luận án Hà Nội, ngày 07 tháng năm 2014 Tác giả luận án Hoàng Minh Đức iv LỜI CAM ĐOAN Đƣợc đồng ý tác giả cho phép sử dụng số liệu báo, đề tài nghiên vào nội dung luận án Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu tơi, tơi thực dƣới hƣớng dẫn thầy cô Chủ nghiệm đề tài Kết nêu Luận án trung thực chƣa công bố công trình khác Tơi xin chịu hồn tồn trách nhiệm lời cam đoan Hà Nội, ngày 07 tháng năm 2014 Tác giả luận án Hoàng Minh Đức v MỤC LỤC Nội dung Trang Trang phụ bìa ii Lời cảm ơn iii Lời cam đoan iv Mục lục v Danh mục chữ viết tắt viii Danh mục hình, bảng biểu ix ĐẶT VẤN ĐỀ CHƢƠNG I – TỔNG QUAN 1.1 Lịch sử hội chứng não cấp 1.1.1 Trên giới 1.1.2 Tại Việt Nam 1.2 Dịch tễ học hội chứng não cấp vi rút Banna 1.2.1 Ổ chứa vi rút 1.2.2 Véc tơ truyền vi rút Banna 1.2.3 Khối cảm thụ 12 1.3 Đặc điểm hình thái, cấu trúc vi rút Banna 13 1.3.1 Đặc điểm hình thái 13 1.3.2 Đặc điểm cấu trúc vi rút Banna 15 1.3.3 Cấu trúc genome vi rút Banna 17 1.3.4 Cấu trúc chức protein vi rút Banna 17 1.3.5 Phân loại nguồn gốc vi rút Banna 19 1.3.6 Sự chép vi rút 21 1.4 Đặc điểm hội chứng não cấp ngƣời vi rút Banna 22 1.4.1 Sinh bệnh học 22 1.4.2 Đặc điểm lâm sàng 23 vi Nội dung Trang 1.4.3 Đáp ứng miễn dịch 24 1.4.4 Điều trị dự phòng bệnh 24 1.5 Các phƣơng pháp chẩn đốn phịng thí nghiệm 25 1.5.1 Phƣơng pháp phát nhanh vi rút 25 1.5.2 Phƣơng pháp phân lập vi rút 26 1.5.3 Phƣơng pháp chẩn đoán huyết học 27 CHƢƠNG II - ĐỐI TƢỢNG, VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 31 2.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu 31 2.2 Đối tƣợng nghiên cứu 31 2.3 Phƣơng pháp nghiên cứu 33 2.3.1 Thiết kế nghiên cứu 2.3.2 Điều tra xác định đặc điểm dịch tễ học bệnh nhân HCNC 33 33 2.4 Vật liệu kỹ thuật xét nghiệm phịng thí nghiệm 35 2.4.1 Phƣơng pháp xét nghiệm kháng thể kỹ thuật miễn dịch enzyme gián tiếp phát IgM kháng vi rút Banna – IgM INDIRECT ELISA 35 2.4.2 Phƣơng pháp phân lập vi rút 2.5 Thống kê toán học số phần mềm tin sinh học sử dụng phân tích đặc điểm phân tử chủng vi rút Banna 37 50 2.5.1 Thống kê toán học 50 2.5.2 Sử dụng phần mềm tin sinh học 50 2.6 Chấp thuận đạo đức nghiên cứu y sinh 51 2.7 Hạn chế thiết kế nghiên cứu 52 CHƢƠNG III – KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 53 3.1 Mô tả số đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng bệnh nhân hội chứng não cấp nghi ngờ vi rút Banna số địa phƣơng củaViệt Nam, 2002-2012 53 vii Nội dung Trang 3.1.1 Mô tả tỷ lệ số mắc bệnh nhân hội chứng não cấp vi rút Banna 53 3.1.2 Đặc điểm lâm sàng bệnh nhân hội chứng não cấp vi rút Banna 58 3.2 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna quần thể muỗi thu thập số địa phƣơng Việt Nam 64 3.2.1 Kết thu thập muỗi năm 2001-2011 64 3.2.2 Kết phân lập vi rút Banna từ mẫu muỗi thu thập 68 3.3 Một số đặc điểm sinh học phân tử vi rút Banna phân lập đƣợc Việt Nam 75 3.3.1 Phân bố vi rút Banna Việt Nam 75 3.3.2 Đặc điểm dịch tễ học vi rút Banna Việt Nam 77 3.3.3 Kết giải trình tự nucleotide vùng gen mã hóa số 12 82 3.3.4 Đặc điểm acid amin thay vùng gen mã hóa số 12 84 CHƢƠNG IV – BÀN LUẬN 86 4.1 Mô tả số đặc điểm dịch tễ, lâm sàng hội chứng não cấp nghi ngờ vi rút Banna số địa phƣơng Việt Nam, 2002 - 2012 86 4.2 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna quần thể muỗi thu thập số địa phƣơng Việt Nam 97 4.3 Xác định số đặc điểm sinh học phân tử vi rút Banna phân lập đƣợc Việt Nam 102 KẾT LUẬN 108 KIẾN NGHỊ 111 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH ĐÃ CƠNG BỐ 112 TÀI LIỆU THAM KHẢO 114 PHỤ LỤC 129 viii DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT BAV BAV-Ch BAV-In CTFV DENV dsRNA EEE EYAV GenBank GenBank Database HCNC HIV KDV LAC MAC-ELISA Motif NCR NLRV POW RT-PCR RRSV RNA SLE SDS-PAGE VNNB VIB VP WEE Banna vi rút Banna vi rút Trung Quốc Banna vi rút Indonesia Colorado tick fever virus Dengue virus (Vi rút sốt xuất huyết) Double-stranded RNA Eastern equine encephalitis virus (Viêm não ngựa miền Đông) Eyach virus Ngân hàng gen Dữ liệu ngân hàng gen Hội chứng não cấp Human Immuno deficiencyVirus (Vi rút gây suy giảm miễn dịch ngƣời) Kadipiro virus La Crosse encephalitis (Viêm não La Crosse) IgM antibody capture – enzyme linked immunosorbent assay (Kỹ thuật miễn dịch gắn enzyme phát kháng thể IgM) Một đoạn trình tự giống nhau, lặp lại Non-coding regions (Vùng khơng mã hóa) Nilaparvata lugens reovirus Powassan (Viêm não Powassan) Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (Phản ứng chuỗi khuếch đại gen phiên mã ngƣợc) Rice ragged stunt vi rút Ribonucleic acid Saint Louis encephalitis (Viêm não St Louis) Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Viêm não Nhật Bản Virus Inclusion Body (Thể vùi vi rút) Viral Protein (Protein vi rút) Western equine encephalomyelitis virus (Viêm não ngựa miền Tây) 118 29 Nguyễn Thị Hiền Thanh (2003), "Bước đầu tìm hiểu nguyên gây viêm màng não trẻ em số vi rút đường ruột", Tạp chí Y học dự phòng, tập 8, số (6), tr 5-12 30 Đặng Đình Thoảng, Nguyễn Ngọc Tâm, B i Minh Trang, Nguyễn Thị Yên, Phan Thị Ngà (2008), "Nghiên cứu biến động ác định véc tơ truyền vi rút viêm não Nhật Bản tỉnh Hà Nam, 2006 – 2007", Tạp chí Y học dự phịng, tập XVIII, số (95), tr 45 - 52 31 Nguyễn Thu Yến, Trần Văn Tiến, Huỳnh Phương Liên, Phan Thị Ngà cộng (2000), "Hiệu ph ng bệnh VNNB huyện Gia Lương, Bắc Ninh sau năm gây miễn dịch vác in VNNB Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương sản uất", Tuyển tập công trình 1997 - 2000 Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương, Nhà uất Y học, Hà Nội, tr 63-66 TIẾNG ANH 32 Alexander J P., Baden L., Pallansch M A., Anderson L J (1994) "Enterovirus 71 infections and neurologic disease - United States, 1977 - 1991", Journal Infect Dis.169, pp 905–908 33 "Arboviral Infections of the Central Nervous System United States 1996-1997", Vol 47, No MMWR25 P 517 34 Atassi M Z et al (2000), "Molecular Immunology", pp 1234-1239 35 Attoui H., Charrel, R N., Billoir, F., Cantaloube, J.-F., de Micco, P & de Lamballerie (1998), "Comparative sequence analysis of American, European and Asian isolates of viruses in the genus Coltivirus", Gen Virol, vol 79, pp 2481–2489 119 36 Attoui H., Billoir F., Biagini P., de Micco P & de Lamballerie X s.l (2000), "Complete squence determination and genetic analysis of Bana virus and Kadipiro virus: prosal for assignment to a new genus (seadornavirus) within the faminy Reoviridae" J Gen Virol, vol 81, pp 1507-1515 37 Attoui H., et al (2005) “Coltiviruses and seadornaviruses in North America, Europem and Asia” Journal Emerging Infectious diseases, 11 pp 1673 - 1679 38 Brown S E, B M Gorman, R B Tesh, and D L Knudson (1993), "Coltiviruses isolated from Mosquitoes Collection in Indonesia", Virology J, vol 196 (89), pp 363-367 39 Bryant J Crabtree M B Nam V S., Yen N T., Duc H M., Miller B R (2003) “Isolation of arboviruses from mosquitoes collected in Northern Vietnam” The American Society of Medicine and Hygiene, 73, 92 pp 470 – 473 40 Brunel D., Leveque N., Jacques J., Renois F., Motte J., Andreoletti L (2008) Clinical and virological features of an aseptic meningitis outbreak in North-Eastern France, 2005 J Clin Virol 42 pp 225-228 41 Calisher C H, Shope R E and Walton T E (1998), "Cell culture for diagnosis of Arbovirus infection in livestock and wildlife", Journal of tissue culture method, vol 11 (3), pp 157-163 42 CDC (2009), "Arboviral Encephalitides" 43 Chaudhuri A., Kennedy P G E s.l (2002), "Diagnosis and treatment of viral encephalitis", Postgrad Med J., vol 78, pp 575-583 120 44 Chen B San-ju TAO (2005), "Studies of Coltivirus in China", Chinese medical Journal, Vol.118, No.7, pp 581-586 45 Edwin H Lennette, PhD David D Lannette, PhD Evelyne T Lennette (2005), "Diagnostic procedures for viral", Rickettsia and Chlamydial infections, 7th edition, Vol 11, pp 189-209 46 Fidan Jmor, Hedley CA Emsley, Marc Fischer, Tom Solomon, and Penny Lewthwaite (2008), "The incidence of acute encephalitis syndrome in Western industrialised and tropical countries", Viro J , Vol 134, pp.5 47 Field N B, Niber M L, Schiff L A, Tyler K L (1996), "Reoviridae, Reovirus and their replication, Reovirus", Fields Virology, Third Edition, pp 1553-1555, 1557-1588, 1597-1617 48 Field B N Knipe D M, Holey P M et al (1996), "Field Virology" Lippincott Reven Press 3th Edition, pp 825-885, 931-1023 49 Goh K J., Tan C T., Chew N K., Tan P S K., Kamarulzaman A., Sại S A., Wong K T., Abdullan B J J., Chua K B., Lam S K (2000), "Clinical feature of Nipah virus encephalitis among pig farmers in Malaysia", The New England Journal of Medicine, Vol 342 (17), pp 1229 – 1235 50 Gong Z D., Xu P T., Wang Y M., et al.(1992), "Another type of new arboviruses recovered from mosquitoes and patients with fever of unknown origin in Yunnan province", Chin J Virol (Chin), vol 8, pp 152-157 51 Ha D Q., Calisher C H., Tien P H., Karabatsos N., and Gubler D J (1995) “Isolation of a newly recognized Alphavirus from mosquitoes in 121 Vietnam and evidence for human infection and disease” Am J Trop Med Hyg 53(1) pp 100 -104 52 Hallow E and Lane D (2001), "Production of antibody", 4th Edition, pp 10-45 53 Hazelton P R, Gelderblon H R (2003), "Electron microscopy for rapid diagnosis of infection agent in emergent situation", Emerging Infectious Disease, vol 9(3), pp 294-303 54 Hein, J.J (1990) “Unified approach to alignment and phylogenies.” In Methods in Enzymology, Vol 183, pp 626-645 55 Higgins, D.G and P.M Sharp (1989) “Fast and sensitive multiple sequence alignments on a microcomputer.” CABIOS, Vol 5, No 2, pp 151-153 56 Hillis, D M & Bull, J J (1993) An empirical test of bootstrapping as a method for assessing confidence in phylogenetic analysis Syst Biol 42, pp 182-182 57 Hsu C H., Lu C.Y., Shao P L., Lee P I., Kao C L., Chung M Y., Chang L Y., Huang L M (2011) Epidemiologic and clinical features of non-polio enteroviral infections in northern Taiwan in 2008 J Microbiol Immunol Infect, 44, pp 265-273 58 Hurk A V., Ritchie S., and Montgomery B (1996), "The mosquitoes of North Queensland: Identification and Biology, includes common biting midges, in Queensland Health", Queensland Government, pp 174 59 Igarashi A, Mastuo S and Hayashi K (1982), "Isolation of Japanese encephalitis and Getah viruses from mosquitoes colected in Nagasaki 122 city in the year of 1980-1981, using Aedes alpopictus clone C6/36 cells", Tro Med J no 34(78), pp 47-53 60 Igarashi A (2000), "Technical manual of Arbovirus study", Institute of Tropical medicine Nagasaki University- Japan, pp 2-26 61 Jaafar F M., Attoui H., Mertens P Philippe P C De Micco, DE Lamballerie Xavier (2005), "Structural organization of an encephalitis human isolate of Banna virus", Journal of General Virology, Vol.86(4), pp.1147-1157 62 Knipe D M., Howley P M (2007) Fields Virology, Fifth Edition, Volume 1, Section 1, General Virology, pp – 606 63 Kuno G (1997), "Universal diagnostic RT- PCR protocol for Arboviruses", Journal of Virology Methods, vol 72 (89), pp.27-41 64 Kuno G, Gubler D J et al (1985), "Antigen capture ELISA for the identification of dengue viruses", J of Virolog Meth, Vol 12 (93), pp 93-103 65 Kumar R., Tripathi P., Singh S and Bannerji G (2006), "Clinical features in children Hospitalized during the 2005", Epidemic of Japanese encephalitis in Uttar Pradesh, India Journal of Clinical infectious díeases pp 123 – 131 66 Kumar A., Shukla D., Kumar R., Idris M Z., Misra U K., Dhole T N (2011) An epidemic of encephalitis associated with human enterovirus B in Uttar Pradesh, India, 2008 J Clin Virol 51 pp 142-145 67 Kurtz J B, Steven J Read (1999), "Laboratory diagnostics of common viral infections of the central nervous system by using a single multiplex PCR screening assay", J of clinical micrology, vol 37(5), pp.1352-1355 123 68 Kupila L., Vuorinen T., Vainionpäā R., Marttila R J., and Kotilainen P (2005), "Diagnosis of enteroviral meningitis by use of polymerase chain reaction of cerebrospinal fluid, stool, and serum specimens", Clinical Infectious Diseases, vol 40, no 7, pp 982-987 69 Kuwata R., Nga P T., Yen N T., Hoshino K.,Isawa H., Higa Y, Hoang N V., Trang B M., Loan D P., Phong T V., Sasaki T., Tsuda Y., Kobayashi M., Sawabe K and Takagi M (2013) Surveillance of Japanese encephalitis virus infection in mosquitoes in Vietnam from 2006 to 2008 Am J Trop Med Hyg 88 (4), pp 681 – 688 70 Lauber C , Ziebuhr J., Junglen S., Drosten C., Zirkel F., Nga P T., Morita K., Snijder E J., and Gorbalenya A E (2013) “Mesoniviridae: a new family in the order Nidovirales formed by a single species of mosquito-borne viruses” For publication in Archives of Virology 71 Li QP, Xie XC, Zhi Q, et al s.l (1992), "First isolation of strains of new orbivirus (Banna) from patients with innominate fever in Xinjiang", Endemic Dis Bull (Chin), Vol 7, pp 77-81 72 Liu H et al (2010), "Banna virus in China, 1987-2007", Emerging Infectious Diseases, Vol 16, No 3, pp 514-517 73 Lowry P W., Truong D H., Hinh L D., Ladinsky J L., Karabatsos N., Cropp C B., Martin D., Gubler D J (1998) Japanese encephalitis among hospitalized pediatric and adult patients with acute encephalitis syndrome in Hanoi, Vietnam 1995 Am J Trop Med Hyg, 58, pp 324329 74 Mackenzie J S., Chua K B., Daniels P W., Eaton B T., field H E., Hall R A., Halpin K., Johansen C A., Kirkland P D., Lam S K., 124 McMinn P., Nisbet D J., Paru R., Pyke A T., Ritchie S A., siba P Smith d w., Smith G a., Hurk A F., Wang L F., Williams D T (2001) Emerging viral Diseases of Southeast Asia and the Western Pacific Emerging Infectious Disease, Vol 7, No 3, pp 497 - 504 75 Martin D A., Muth D A., Brown T, Jonhson A, Karabatos N and Roehrig J T (2000), "Standardization of Immunoglobumin M capture enzyme- linked Immunosorbent assay for Routine diagnosis of Arboviral infection", Journal of clinical microbiology, Vol 89 (90), pp 18231826 76 Max L N and Leslie A S (2001), "Reovirus and their replication", Fields Virology, Chapter 52, pp 1557- 1588 77 Mertens P, s.l, "The dsRNA viruses", Virus Res, Vol 101, pp 29-43 78 Mertens, P P C., Arella, M., Attoui, H & 41 other authors (2000), "Reoviridae In Virus Taxonomy: Seventh Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses", New York: Academic Press, pp 395–480 79 Mohd Jaafar F, Attou (2004), "VP9- based enzyme-linked immunosorbent assay for detection of immunoglobulin G antibodies to Banna virus (genus seadornavirus)", J.Virol Methods, Vol 116 (89), pp 55-61 80 Mohd Jaafar F, Attoui H, Bahar MW, Siebold C, Sutton G, Mertens PP, De Micco P, Stuart DI, Grimes JM, De Lamballerie X s.l (2005), "The structure and function of the outer coat protein VP9 of Banna virus", Structure, Vol 13, pp 17-28 125 81 Mostafaie A., Roodbari F., Roustai M H., , Soleimanjdahi H., Foroshani R S and Sabahi F (2003), "Development of an enzyme-linked immunosorbent assay for immunoglobulin M antibodies against measles virus", Clinical and Diagnosis laboratory Immunology, Vol.10, No.3, pp 439-442 82 Muller M, Montgomery B., Ingram A., and Ritchie S (2001), "First records of Culex gelidus from Australia", Journal of the American Mosquito Control Association, Vol 17, No 1, pp 79-80 83 Nabeshima T, Nga P T, Guillermo P, Parquet M, C Yu F, Thuy N T, Trang M B, Hien N T, Nam V S, Inoue S, Hasebe F and Morita K ( 2008), "Isolation and molecular characterization of Banna virus derived from mosquitoes in Northern and Central Vietnam", Emerging Infectious Disease, Vol 14 (8), pp 1276 - 1279 84 Nabeshima T, Loan H.T, Inoue S., Sumiyoshi M., Haruta Y., Nga P.T., Huoung V.T., del Carmen Parquet M., Hasebe ,F, Morita K (2009) Evidence of frequent introductions of Japanese encephalitis virus from south-east Asia and continental east Asia to Japan J Gen Virol pp.827832 85 Nga P T., Partquet M C., Cuong V D., Ma S P., Hasebe F., Inoue S., Takagi M., Makino Y and Morita K (2004) Shift in Japanese Encephalitis virus (JEV) genotype circulating in northern Vietnam: Implications for frequent introductions of JEV from Southeast Asia to East Asia J Gen Virol, pp 1625 – 1631 86 Nga P T., Parquet Mdel C., Lauber C., Parida M., Nabeshima T., Yu F., Thuy N T., Inoue S., Ito T., Okamoto K., Ichinose A., Snijder E J., Morita K., Gorbalenya A E (2011) Discovery of the first insect 126 nidovirus, a missing evolutionary link in the emergence of the largest RNA virus genomes PLoS Pathog Sep; 7(9):e1002215 87 Norguera A et al (2004), "Reovirus type isolated from cerebrospinal fluid", The Pediatric Infectious Disease Journal, vol 23, no 4, pp 373 – 375 88 Rayamajhi A., Ansari I., Ledger E., Bista K P., Impoinvil D E., Nightingale S., Kumar R., Mahaseth C., Solomon T., Griffiths M J (2011) Clinical and prognostic features among children with acute encephalitis syndrome in Nepal; a retrospective study BMC Infect Dis 1471 – 2334/11/294 (12 pp) 89 Paireau J., Tuan N H., Lefranỗois R., Buckwaiter M R., Nghia N D., Hien N T., Lortholary O., Poirée S., Manuguerra J C., Gessain A., Albert M L., Brey P T., Nga P T., Fontanet A 2012 Litchi associated Acute Encephalitis in Children Northern Vietnam, 2004 2009 Journal Emerging Infectious Disease, Vol 16, No 11, pp 1817 1824 90 Sirivanakarn S 1976 A revision of the subgenus Culex in the Oriental region (Diptera: Culicidae) Contributions of the American Entomological Institute, Vol 12 No pp 1-272 91 Sips G J., Wilschut J., Smit J M (2012) Neuroinvasive flavivirus infections Rev Med Virol, 22 pp 69-87 92 Steven J R., Katie J M J and Charles R M B (1997), "Aseptic Meningitis and encephalitis: the role of PCR in the diagnostic laboratory", J Clinical microbiology, Vol 56(8), pp 691-696 127 93 Tao S J., Chen B Q (2005) Studies of Coltivirus in China Clinical Medical Journal, 118 (7) pp 581 – 586 94 Tan L V., Qui P T., Ha D Q., Hieu N B., Bao L Q., Cam B.V., Khanh T H., Hien T T., Chau N V V., Tam T T., Hien V M., Nga T V T., Schultsz C., Farra J., van Doorn H R., de Jong M D (2010) Viral Etiology of encephalitis in Children in Southern Vietnam: Results of a One-Year prospective descriptive study PLoS Negl Trop Dis (10), pp 854 - 854 95 Tamura K, Dudley J, Nei M & Kumar S (2007) MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0 Molecular Biology and Evolution 24, pp 1596-1599 96 Thompson J D., Higgins D G., Gibson T J (1994) CLUSTAL W Improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, positions-specific gap penalties and weight matrix choice Nucleic Acids Res 2, pp 4673–4680 97 Yen N T., Duffy M R., Hong N M., Hien N T., Fischer M., and Hills S L (2010) Survellance for Japanese encephalitis in Vietnam, 1998 2007 Am J Trop Med Hyg 83 (4), pp 816 - 819 98 Voller A., Bidwell D E., Bartlett A (1982) ELISA technique in virology Alan Liss New York, pp 59-81 99 Xu P T., Wang Y M (1990) New orbiviruses isolated from unknown fever and encephalitis patients in Yunnan province Chin J Virol, Vol.6, pp 27-33 128 100 Weaver S C., Powers A M., Brault A C and Barret A D T (1999), "Molecular epimiological studies of veterinary Arboviral encephalitides", Vet journal, Vol 157 (4), pp.123-138 101 Weaver R F (1999) Molecular Biology 1st Edited WCB/McGraw Hill, Boston, MA 102 WHO (1985), "Progress in enzyme immunoassay: production of reagents, experimental design, and interpretation", Bullection of the WHO, Vol 63(4), pp.793-811 129 PHỤ LỤC MẪU PHIẾU ĐIỀU TRA HỒI CỨU BỆNH NHÂN MẮC HỘI CHỨNG NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT PHIẾU ĐIỀU TRA HỒI CỨU ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG Mã số :…………………………… A Tiêu chuẩn đưa vào nghiên cứu: - Trẻ 15 tuổi: : - Có kết dương tính với virus Banna: - Có kết dương tính với virus VNNB: - Có kết dương tính với virus ECHO30:     B Thông tin chung [1] Mã hồ sơ bệnh án: [2] Ngày nhập viện: / /20 [3] Họ tên bệnh nhi: [4] Ngày tháng năm sinh: / / [5] Giới: Nam [1] [2] [6] Dân tộc:………… [7] Họ tên bố/mẹ: [8] Số điện thoại liên lạc: [9] Số nhà: [10] Phố: [7] Xã/phường: [12] Quận: C Lý nhập viện: ….……………………………………………………………………………… D Thông tin lâm sàng [01] Ngày khởi phát: / / [02] Dấu hiệu (1 dấu hiệu):………………… [03] Con anh/chị có bị nhức đầu hay khơng? Có [1] Khơng [2] Khơng biết [3] [04] Từ lúc bị bệnh đến cháu có bị buồn nơn khơng? Có [1] Khơng [2] Khơng biết [3] [05] Cháu sau có nơn hay khơng? Có [1] Khơng [2] Khơng biết [3] [06] Nếu có, cháu bắt đầu nôn từ ngày nào? / / Khơng biết [3] [07] Nếu có, cháu bị nơn nhiều lần 24 giờ? lần Khơng biết [3] [08] Cháu có bị sốt khơng? Có [1] Khơng [2] Khơng biết [3] [09] Nếu có, cháu bắt đầu sốt từ ngày nào? / / Khơng biết [3] [10] Nếu có, cháu bị sốt cao đo độ lần bị bệnh này? _,_ 0C Không biết [3] [11] Cháu có bị đau hay khớp khơng? Đau [1] Đau khớp [1] Không đau [2] 130 PHIẾU ĐIỀU TRA HỒI CỨU ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG Mã số :…………………………… [12] Anh chị cho cháu sử dụng thuốc trước đến đây? [a] Uống thuốc hạ sốt Có [1] Khơng [2] Khơng biết [3] [b] Truyền dịch tĩnh mạch Có [1] Không [2] Không biết [3] [c] Thuốc kháng sinh Có [1] Khơng [2] Khơng biết [3] [d] Thuốc khác Có [1] Khơng [2] Khơng biết [3] [13] Con anh/chị tiêm vắc xin VNNB phòng bệnh chưa? Đã tiêm [1] Chưa tiêm [2] Không rõ/Không nhớ [3] E Khám nhập viện [01] Nhiệt độ (kẹp nách): , 0C [02] Chiều cao: ……cm [03] Cân nặng: gram [04] Thóp phồng: Có [1] Khơng [2] Lúc có, lúc khơng [4] [05] Cứng gáy: Có [1] Khơng [2] Lúc có, lúc khơng [4] [06] Dấu hiệu Kernig: Có [1] Khơng [2] Lúc có, lúc khơng [4] [07] Trạng thái tinh thần: Tỉnh táo [1] Lơ mơ [2] Hơn mê [2] [08] Vân động: Bình thường [1] Giảm vận động [2] Liệt [2] F Khám sau bảy ngày điều trị [01] Nhiệt độ (kẹp nách): , 0C [02] Chiều cao:……cm [03] Cân nặng: gram [04] Thóp phồng: Có [1] Khơng [2] Lúc có, lúc khơng [4] [05] Cứng gáy: Có [1] Khơng [2] Lúc có, lúc khơng [4] [06] Dấu hiệu Kernig: Có [1] Khơng [2] Lúc có, lúc khơng [4] [07] Trạng thái tinh thần: Tỉnh táo [1] Lơ mơ [2] Hôn mê [2] [08] Vân động: Bình thường [1] Giảm vận động [2] Liệt [2] G Thông tin người trả lời (đặc điểm gia đình) [01] Anh chị sinh năm nào? Tuổi tính trịn theo dương lịch: _tuổi [02] Trình độ học vấn bà mẹ Không học [1] Tiểu học [2] THCS [3] PTTH [4] CĐ/ĐH [5] Khơng biết [9] [03] Tình trạng nhân? Kết [1] Độc thân [2] Góa [3] Ly dị[4] Ly thân [5] [04] Ai người chăm sóc trẻ chính? Mẹ [1] Khác _ [2] Không biết [9] Không biết [9] 131 PHIẾU ĐIỀU TRA HỒI CỨU ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG Mã số :…………………………… [05] Trong gia đình có trước có triệu chứng giống trẻ khơng? Có [1] Khơng [2] Khơng biết [3] Cán điều tra H Thông tin người trả lời (đặc điểm gia đình) [01] Ngày lấy mẫu: / / _ [02] Cán lấy mẫu: _ [03] Loại mẫu: Huyết [6] Dịch não tủy[7] [04] Xét nghiệm VNNB: [05] Ngày xét nghiệm: _ [06] Kết xét nghiệm: Dương tính [1] Âm tính [2] Không chắn[3] [07] Xét nghiệm Banna: [08] Ngày xét nghiệm: _ [09] Kết xét nghiệm: Dương tính [1] Âm tính [2] Khơng chắn[3] 07] Xét nghiệm Echo 30: [08] Ngày xét nghiệm: _ [09] Kết xét nghiệm: Dương tính [1] Âm tính [2] Khơng chắn[3] Cán thực điền phiếu điều tra (Ký ghi rõ họ tên) 132 PHỤ LỤC KẾT QUẢ ĐIỀU TRA MUỖI VÉC TƠ NGHI TRUYỀN HỘI CHỨNG NÃO CẤP DO VI RÚT BANNA Địa điểm điều tra: Tỉnh……………Quận/huyện:……………… Phường/xã:…………………Thôn/tổ:……… Ngày điều tra: …………………………… TT Họ tên chủ hộ Tổng số muỗi bắt Nơi bắt muỗi:…………………………………… Các giống muỗi bắt Culex Anopheles Mansonia Armigeres Duyệt lãnh đạo Cán định loại Khác ... ? ?Một số đặc điểm dịch tễ học hội chứng não cấp nghi ngờ vi rút Banna số địa phương Vi? ??t Nam? ?? thực với ba mục tiêu cụ th sau: Mô tả số đặc m dịch tễ học, lâm sàng hội chứng não cấp nghi ngờ vi. .. TẠO BỘ Y TẾ VI? ??N VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG -* - HOÀNG MINH ĐỨC MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI MỘT SỐ ĐỊA PHƯƠNG Ở VI? ??T NAM Chuyên ngành... vi rút Banna số địa phương Vi? ??t Nam, 2002 – 2012 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna quần th muỗi thu thập số địa phương Vi? ??t Nam Xác định số đặc m sinh học phân tử vi rút Banna phân lập Vi? ??t Nam