So sánh tương đồng gen NSP2 ORF7 giữa một chủng văcxin với các chủng virút HP PRRS thực địa và đánh giá hiệu quả bảo hộ của chủng vắc xin này chống lại HP PRRS dị chủng trên heo cai sữa

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP HỒ CHÍ MINH ****************** LÊ THỊ MAI HOA SO SÁNH TƯƠNG ĐỒNG GEN NSP2, ORF7 GIỮA MỘT CHỦNG VẮC-XIN VỚI CÁC CHỦNG VI-RÚT HP-PRRS THỰC ĐỊA VÀ ĐÁNH GIÁ HIỆU QUẢ BẢO HỘ CỦA CHỦNG VẮC-XIN NÀY CHỐNG LẠI HP-PRRS DỊ CHỦNG TRÊN HEO CAI SỮA LUẬN VĂN THẠC SĨ CƠNG NGHỆ SINH HỌC Thành phố Hồ Chí Minh, Tháng 11/2016 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NƠNG LÂM TP HỒ CHÍ MINH ****************** LÊ THỊ MAI HOA SO SÁNH TƯƠNG ĐỒNG GEN NSP2, ORF7 GIỮA MỘT CHỦNG VẮC-XIN VỚI CÁC CHỦNG VI-RÚT HP-PRRS THỰC ĐỊA VÀ ĐÁNH GIÁ HIỆU QUẢ BẢO HỘ CỦA CHỦNG VẮC-XIN NÀY CHỐNG LẠI HP-PRRS DỊ CHỦNG TRÊN HEO CAI SỮA Chuyên ngành : Công nghệ sinh học Mã số 60.42.02.01 : LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC Hướng dẫn Khoa học: TS ĐỖ TIẾN DUY PGS TS NGUYỄN TẤT TỒN Thành phố Hồ Chí Minh, Tháng 11/2016 i SO SÁNH TƯƠNG ĐỒNG GEN NSP2, ORF7 GIỮA MỘT CHỦNG VẮC-XIN VỚI CÁC CHỦNG VI-RÚT HP-PRRS THỰC ĐỊA VÀ ĐÁNH GIÁ HIỆU QUẢ BẢO HỘ CỦA CHỦNG VẮC-XIN NÀY CHỐNG LẠI HP-PRRS DỊ CHỦNG TRÊN HEO CAI SỮA LÊ THỊ MAI HOA Hội đồng chấm luận văn: Chủ tịch: PGS.TS NGUYỄN NGỌC TUÂN Thư ký: TS NGUYỄN VŨ PHONG Phản biện 1: TS NGUYỄN NGỌC TẤN Phản biện 2: TS HUỲNH VĂN BIẾT Ủy viên: PGS.TS LÊ ĐĂNG ĐẢNH ii LÝ LỊCH CÁ NHÂN Tôi tên Lê Thị Mai Hoa sinh ngày 07 tháng 07 năm 1986 thành phố Long Xuyên, tỉnh An Giang Tốt nghiệp trung học phổ thông trường Trung học phổ thông Long Xuyên, tỉnh An Giang năm 2004 Tốt nghiệp Đại học ngành Sư phạm Sinh học hệ qui trường Đại học An Giang năm 2008 Tháng 11 năm 2013 theo học Cao học ngành Công nghệ Sinh học trường Đại học Nông Lâm, Thủ Đức, thành phố Hồ Chí Minh Địa liên lạc: Lô 1B3, đường Lê Quát, phường Đông Xuyên, thành phố Long Xuyên, tỉnh An Giang Điện thoại: 0939895486 Email: maihoa1986@gmail.com iii LỜI CAM ĐOAN Tôi cam đoan công bố luận văn trung thực phần đề tài “Phân tích đa dạng gen HP-PRRSV Việt Nam hiệu vaccine chống lại chủng gây nhiễm thực địa” TS Đỗ Tiến Duy làm chủ nhiệm Những số liệu luận văn phép công bố với đồng ý chủ nhiệm đề tài CHỦ NHIỆM ĐỀ TÀI HỌC VIÊN TS ĐỖ TIẾN DUY LÊ THỊ MAI HOA iv LỜI CẢM ƠN Tôi xin chân thành cám ơn Ban Giám Hiệu Trường Đại học Nơng Lâm Thành Phố Hồ Chí Minh, Ban Chủ nhiệm Bộ môn Công nghệ Sinh học, Ban Chủ nhiệm Khoa Chăn nuôi Thú y, Ban Quản lý Bệnh viện Thú y – Khoa Chăn nuôi Thú y tạo điều kiện thuận lợi để tơi hồn thành luận văn Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến PGS.TS Nguyễn Tất Toàn TS Đỗ Tiến Duy tận tình dạy, hướng dẫn, truyền đạt kiến thức, kinh nghiệm quý báu tạo điều kiện thuận lợi cho tơi suốt q trình thực đề tài Tôi xin gửi lời cảm ơn tới PGS.TS Lê Đình Đơn tồn thể q thầy cô Bộ môn Công nghệ Sinh học dạy đỗ tạo điều kiện cho suốt thời gian học tập thực luận văn Xin cảm ơn thầy Võ Tấn Đại, cô Nguyễn Thị Thu Năm anh, chị Bệnh viện Thú y trường Đại học Nông Lâm tạo điều kiện, giúp đỡ tơi suốt q trình thực luận văn Xin cảm ơn gia đình tập thể lớp cao học CNSH 2013 chia sẻ, động viên giúp đỡ tơi suốt q trình học tập trường TP Hồ Chí Minh, tháng 11 năm 2016 LÊ THỊ MAI HOA v TÓM TẮT Đề tài “So sánh tương đồng gen NSP2, ORF7 chủng vắc-xin với chủng vi-rút HP-PRRS thực địa đánh giá hiệu bảo hộ chủng vắc-xin chống lại HP-PRRS dị chủng heo cai sữa” tiến hành Bệnh viện Thú y -Trường Đại học Nông Lâm, Thành phố Hồ Chí Minh thời gian từ tháng 11/2014 đến tháng 08/2015 nhằm phân tích tương đồng gen chủng vắc-xin với chủng HP-PRRS thực địa làm tiền đề để đánh giá khả bảo hộ chủng vắc-xin nhược độc heo cai sữa gây nhiễm với vi-rút PRRS chủng độc lực cao (HP-PRRSV) 34 chủng PRRSV thực địa có đặc trưng đột biến đoạn 30 axít amin NSP2 Kết tương đồng nucleotit chủng vi-rút vắc-xin, chủng gây nhiễm, chủng Lelystad, VR2332, CH-1a JXA1 so với chủng HP-PRRSV thu thập thực địa nghiên cứu gen NSP2 72,71%, 99,25%, 37,12%, 66%, 77,01% 96,89% gen ORF7 94,48%, 97,11%, 63,63%, 94,35%, 94,83% 97,37% Chủng vắc-xin P129 chủng gây nhiễm MB6 tương đồng gen thấp đoạn gen NSP2 (72,7 % ) tương đồng gen cao ORF7 (94,8 %) Tổng số 21 heo tuần tuổi, khỏe mạnh, âm tính với vi-rút PRRS chọn phân bố ngẫu nhiên vào lô thí nghiệm (lơ tiêm phịng vắc-xin:12 lơ khơng tiêm phòng vắc-xin: con) Sau 35 ngày tiêm vắc-xin (ngày thí nghiệm gây nhiễm), tất heo gây nhiễm với 3ml huyễn dịch vi-rút HP-PRRS chủng MB6, 105 TCID50/ml Heo thí nghiệm đánh giá dấu hiệu hơ hấp lâm sàng, bệnh tích đại thể, vi thể, nhiệt độ trực tràng, đáp ứng kháng thể, nồng độ vi-rút huyết hàm lượng phân bố kháng nguyên mô Đáp ứng kháng thể IgG lô heo tiêm vắc-xin khác biệt so với lô heo không tiêm vắc-xin ngày thứ 28 (P