Luận văn thạc sĩ sinh học thực phẩm 277261

LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu tơi, số liệu, kết quả, hình ảnh nêu Luận án trung thực chƣa đƣợc công bố cơng trình tác giả khác Hà Nội, ngày tháng năm 2017 TM tập thể Giáo viên hƣớng dẫn Nghiên cứu sinh Phùng Thị Thủy LỜI CẢM ƠN Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc tới TS Lê Quang Hịa PGS.TS Tơ Kim Anh, Viện Công nghệ Sinh học Thực phẩm, Trƣờng Đại Học Bách Khoa Hà Nội tận tình hƣớng dẫn giúp đỡ suốt thời gian nghiên cứu để hồn thiện Luận án Tơi xin chân thành cảm ơn thầy, cô, đồng nghiệp Viện Công nghệ Sinh học Thực phẩm giúp đỡ, động viên tơi q trình nghiên cứu luận án sống hàng ngày Xin chân thành cảm ơn Ths Nguyễn Thành Trung, Viện Kiểm nghiệm an toàn thực phẩm giúp đỡ tôi thực phần luận án Viện Xin chân thành cảm ơn Ths Nguyễn Thành Đông, Trung tâm Y tế dự phịng Hà Nội giúp đỡ tơi tơi thực phần luận án Trung tâm Xin cảm ơn Sở KHCN HN cấp phần kinh phí cho thực đề tài thông qua đề tài cấp sở mã số 01C-06/04-2013-2 Xin cảm ơn KS Hà Thị Xun, KS Nguyễn Thu Hiền Phịng Thí nghiệm Sinh học phân tử Viện Công nghệ Sinh học thực phẩm giúp đỡ tơi q trình thực nghiên cứu Luận án Viện Xin chân thành cảm ơn thầy cô hội đồng cấp Bộ môn, Hội đồng cấp sở thầy cô phản biện độc lập cho tơi góp ý q báu để hoàn thiện luận án Để hoàn thiện Luận án tơi khơng thể khơng nói lời cảm ơn chân thành đến bạn bè, ngƣời thân, gia đình ln động viên dành thời gian cho thực nghiên cứu Hà Nội, ngày tháng năm 2017 Phùng Thị Thủy MỤC LỤC MỤC LỤC………………………………………………………………………………… DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT……….…………………………………………………… DANH MỤC HÌNH………………………………………………………… 10 DANH MỤC BẢNG……………………………………………………………………… 12 MỞ ĐẦU……………………………………………………………………… 14 CHƢƠNG TỔNG QUAN………………….…………………………………………… 16 1.1 Listeria monocytogenes…………………….………………………………………………… 16 1.1.1 Đặc điểm L monocytogenes……………………………….……………………………… 16 1.1.2 Vai trị internalin J (inlJ) q trình gây bệnh L monocytogenes………………………………………… ………………………………………… 20 1.1.3 Tình hình nhiễm tạp thực phẩm gây bệnh L monocytogenes………………………………………………………………………… ………… 24 1.1.4 Quy định kiểm soát L monocytogenes………………………………………………… 26 1.2 Dịch tễ học phân tử L monocytogenes…………………………… ……………… 26 1.2.1 Đặc điểm dịch tễ dòng giống (lineage) L monocytogenes…………… ……… 26 1.2.2 Đặc điểm dịch tễ dòng phức hợp (clones complex) L monocytogenes……… 26 1.2.3 Đặc điểm dịch tễ kiểu huyết L monocytogenes……………………….… 27 1.2.4 Các phƣơng pháp phân loại sử dụng nghiên cứu dịch tễ học phân tử…… 28 1.2.4.1 Phƣơng pháp điện di xung trƣờng (PFGE)…………………………………… 28 1.2.4.2 Phƣơng pháp ribotyping……………………………………………….………… 29 1.2.4.3 Phƣơng pháp đa hình đoạn DNA đƣợc khuếch đại ngẫu nhiên (RAPD)………………………………………………… ……………………………… 29 1.2.4.4 Phƣơng pháp đa hình chiều dài đoạn DNA (AFLP)…………….………… 30 1.2.4.5 Phƣơng pháp đa hình chiều dài đoạn cắt giới hạn sản phẩm PCR (PCRRFLP)…………………………………………………………………………………… 1.2.4.6 Phƣơng pháp khuếch đại trình tự lặp (REP-PCR)………………………… 30 31 1.2.4.7 Phƣơng pháp phân tích đa hình số lƣợng vùng lặp nhiều locus (MLVA)………………………………………………………………………….……… 31 1.2.5 Phƣơng pháp phân loại dựa trình tự nhiều locus (MLST)…… ……… 31 1.2.5.1 Phƣơng pháp phân loại dựa trình tự nhiều locus gen độc (MVLST)…… 32 1.2.5.2 Phƣơng pháp phân loại dựa trình tự gen giữ nhà……………………… 32 1.2.6 Cơ sở liệu phƣơng pháp phân loại dựa trình tự nhiều locus (MLST)…………………………………………………………………………………… 35 1.3 Một số phƣơng pháp phân tích phát L monocytogenes…………………….…… 35 1.3.1 Phƣơng pháp nuôi cấy………………………………………………… ………… 35 1.3.1.1 Ảnh hƣởng thành phần mơi trƣờng đến q trình tăng sinh…………… 36 1.3.1.2 Ảnh hƣởng nhiệt độ đến trình tăng sinh………………………….…… 38 1.3.1.3 Ảnh hƣởng mẫu thực phẩm đến trình tăng sinh………………… … 39 1.3.1.4 Ảnh hƣởng thành phần vi sinh vật đồng nhiễm mẫu……………… 39 1.3.2 Phƣơng pháp miễn dịch……………………………………………………… … 41 1.3.3 Phƣơng pháp khuếch đại DNA (PCR, real-time PCR)……………………….…… 42 1.4 Kỹ thuật nhân gen đẳng điện tạo cấu trúc vòm (LAMP)…………………………… 44 1.4.1 Nguyên tắc kỹ thuật LAMP…………………………….…………………… 44 1.4.2 Thiết kế mồi cho phản ứng LAMP………………………………………………… 46 1.4.3 Phát sản phẩm LAMP…………………………………………… ………… 47 1.4.4 Một số yếu tố ảnh hƣởng đến hiệu phản ứng LAMP…………….…………… 48 1.4.5 Các nghiên cứu sử dụng phƣơng pháp LAMP để phát L monocytogenes giới…………………………………………………………………………………… 49 1.5 Một số kỹ thuật tách chiết thu nhận nhanh DNA cho phản ứng khuếch đại DNA………………………………………………………….…………………………… 51 1.5.1 Các yêu cầu DNA sử dụng cho kỹ thuật nhân gen………………… 51 1.5.2 Tách chiết tinh DNA………………………………………………….… 52 1.5.3 Kiểm tra hiệu suất thu hồi chất lƣợng DNA………………………………… 55 CHƢƠNG NGUYÊN VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU……………… 56 2.1 Địa điểm nghiên cứu………………………………………………………… …… 56 2.2 Đối tƣợng nghiên cứu…………………………………………………….………… 56 2.3 Phƣơng pháp nghiên cứu…………………………………… ……………………… 57 2.3.1 Phân lập L monocytogenes từ mẫu thực phẩm……………… …………………… 57 2.3.2 Phản ứng Real-time PCR………………………………………… ………………… 58 2.3.3 Phản ứng PCR……………………………………………………………………… 58 2.3.4 Tinh sản phẩm PCR cho giải trình tự gen………………………….………… 59 2.3.5 Phân loại kiểu trình tự ST…………………………………………….………… 60 2.3.6 So sánh trình tự đoạn gen chủng phân lập đƣợc với số chủng ngân hàng liệu………………………………………………………………………… 60 2.3.7 Thiết kế mồi cho phản ứng LAMP…………………………………………….… 60 2.3.8 Lựa chọn mồi LAMP…………………………………………………………… 60 2.3.9 Tối ƣu hóa phản ứng LAMP…………………………………………………….… 60 2.3.10 Điện di DNA………………………………………………………………… … 61 2.3.11 Xác định độ đặc hiệu, độ bao trùm phản ứng LAMP……………… …… 61 2.3.12 Xác định độ nhạy phản ứng LAMP………………………………….……… 61 2.3.13 Xây dựng quy trình tăng sinh L monocytogenes nhanh……………………… … 61 2.3.14 Xây dựng quy trình tách chiết nhanh DNA L monocytogenes………… …… 63 2.3.15 Xây dựng quy trình phân tích L monocytogenes mẫu thực phẩm………… 64 2.3.16 Kiểm định sinh phẩm………………………………………………………….… 64 2.3.17 Ứng dụng thử nghiệm sinh phẩm………………………………………….… 65 2.3.18 Phƣơng pháp xử lý thống kê theo phần mềm excel…………………… ……… 65 CHƢƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN…………………………………….……… 66 3.1 Phân lập nghiên cứu dịch tễ học phân tử chủng L monocytogenes phân lập từ số thực phẩm Việt Nam………………………………………… ………………… 66 3.1.1 Phân lập L monocytogenes từ mẫu thực phẩm…………….……………… 66 3.1.2 Nghiên cứu dịch tễ học phân tử chủng L monocytogenes phân lập……… … 70 3.1.2.1 Giải trình tự gen abcZ, bglA, cat, dapE, dat, ldh lhkA chủng L monocytogenes phân lập…………………………………………………………………… 71 3.1.2.2 Phân tích tính đa hình trình tự nucleotid gen abcZ, bglA, cat, dapE, dat, ldh lhkA từ chủng L monocytogenes phân lập đƣợc…………………… 71 3.1.2.3 Phân loại chủng L monocytogenes phân lập đƣợc………………….……… 73 3.1.2.4 So sánh chủng L monocytogenes phân lập đƣợc với chủng gây bệnh dịch giới………………………………………………………………………… 78 3.2 Xây dựng quy trình phân tích nhanh L monocytogenes thực phẩm dựa kỹ thuật LAMP……………………………………………………………………………… 81 3.2.1 Xây dựng phản ứng LAMP……………………………………………….……… 81 3.2.1.1 Thiết kế mồi LAMP khuếch đại gen inlJ……………………………………………… 82 3.2.1.2 Lựa chọn mồi LAMP cho độ nhạy khuếch đại cao nhất…………………… … 84 3.2.1.3 Tối ƣu phản ứng LAMP…………………………………………………….…… 85 3.2.2 Xây dựng quy trình tăng sinh………………………………………………….…… 93 3.2.2.1 Ảnh hƣởng loại môi trƣờng đến sinh trƣởng L monocytogenes………………………………………………………………………………….…… 95 3.2.2.2 Ảnh hƣởng số thành phần môi trƣờng đến sinh trƣởng L monocytogenes………………………………………………………………………………….… 96 3.2.2.3 Ảnh hƣởng acriflavine acid nalidixic đến sinh trƣởng số loài vi khuẩn khác………………………………………………………………………………… 98 3.2.2.4 Thử nghiệm tăng sinh mẫu thực phẩm……………………………………… 99 3.2.3 Tối ƣu hóa qui trình tách chiết DNA……………………………………………… 100 3.2.3.1 Khả tách chiết DNA L monocytogenes sử dụng Triton X100 kết hợp siêu âm gia nhiệt 95 oC……………………………………………………………… 100 3.2.3.2 Khả tách chiết DNA L monocytogenes sử dụng NaOH kết hợp siêu âm gia nhiệt 95 oC……………………………………………………………………… 102 3.2.3.3 So sánh phƣơng pháp tách chiết nghiên cứu canh trƣờng L monocytogenes thuần………………………………………………………….…………… 104 3.2.3.4 Đánh giá hiệu tách chiết DNA phƣơng pháp mẫu thực phẩm tăng sinh…………………………………………………………… 105 3.2.3.5 Ảnh hƣởng lƣợng mẫu lấy tách chiết DNA cho phản ứng LAMP……… … 107 3.2.3.6 Thử nghiệm phản ứng LAMP mẫu khác nhau…………………….… 108 3.2.4 Đề xuất quy trình phân tích………………………………………………………… 110 3.2.5 Xác định độ nhạy tồn quy trình………………………………………….… 111 3.2.6 Thiết kế, sản xuất thử nghiệm sinh phẩm LAMP phát L monocytogenes…………………………………………………………………………………… 112 3.2.6.1 Thiết kế sinh phẩm…………………………………………………………… 112 3.2.6.2 Sản xuất thử nghiệm sinh phẩm LAMP-L’MONO……………………… … 114 3.2.7 Kiểm định sinh phẩm LAMP-L’MONO………………………………….…… 116 3.2.8 Ứng dụng thử nghiệm sinh phẩm LAMP-L’MONO………………… ……… 118 CHƢƠNG IV KẾT LUẬN……………………………………………………………… 122 KIẾN NGHỊ…………………………………………………………………….………… 123 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH ĐÃ CƠNG BỐ CỦA LUẬN ÁN…………… …… 124 TÀI LIỆU THAM KHẢO………………………………………………………………… 125 PHỤ LỤC…………………………………………………………………………….…… 142 DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT Ký hiệu AFLP ALOA UVM Tên đầy đủ tiếng anh Tên tiếng Việt Amplified Fragment Length Polymorphism Chromogenic Listeria Agar according to Ottaviani and Agosti Đa hình chiều dài đoạn DNA University of Enrichment Broths Vermont Mơi trƣờng chọn lọc Listeria có thị màu đƣợc phát triển Ottaviani Agosti Môi trƣờng tăng sinh UVM Môi trƣờng tăng sinh BLEB BLEB Buffered Broth Listeria Enrichment HF Half Fraser Broth Môi trƣờng Half Fraser aw Water activity Hoạt độ nƣớc bp Base pair Cặp bazơ CAMP Christie, Atkins, Munch-Petersen Phản ứng CAMP CDC CFU Center for Disease Control and Prevention Colony forming unit Trung tâm phịng chống kiểm sốt dịch bệnh Đơn vị hình thành khuẩn lạc DNA Deoxyribonucleic acid Axit Deoxyribonucleic dNTP Deoxynucleotide Deoxynucleotide EDTA Ethylen Diamine Acid Ethidium Bromide EtBr ISO USDA-FSIS FDA AOAC Tetraacetic International Organization for Standardization United States Department of Agriculture-Food Safety Inspection Service U.S Food and Drug Administration Association of Official Analytical Chemists Axit Ethylen Diamine Tetraacetic Ethidium Bromide Tổ chức quốc tế tiêu chuẩn hóa Bộ Nơng nghiệp dịch vụ kiểm sốt an toàn thực phẩm Mỹ Cục quản lý dƣợc phẩm thực phẩm Mỹ Hiệp hội nhà hố phân tích thống kDa Kilo Dalton Kilo Dalton LAMP MLST Loop-Mediated Isothermal Amplification Multi-virulence-locus sequence typing Multi-locus sequence typing PBS Phosphate Buffered Saline Khuếch đại đẳng nhiệt tạo cấu trúc vịm Phân loại dựa trình tự nhiều locus gen gây độc Phân loại dựa trình tự nhiều locus Đệm muối phosphate PCPLC PCR Phosphatidylcholine phospholipase C Polymerase Chain Reaction Phosphatidylcholine phospholipase C Phản ứng tổng hợp chuỗi ADN PEG Polyethylene glycol Polyethylene glycol PFGE Pulsed-field gel electrophoresis Kỹ thuật điện di xung trƣờng RAPD TAE Randomly amplified polymorphic DNA Tris - Acetate - EDTA Đa hình dựa khuếch đại ngẫu nhiên đoạn DNA Tris - Acetate - EDTA TE Tris - EDTA Tris - EDTA PA Positive agreement Tƣơng đồng mẫu dƣơng tính NA Negative agreement Tƣơng đồng mẫu âm tính ND Negative deviation Sai khác mẫu âm tính PD Positive deviation Sai khác mẫu dƣơng tính AC Relative accuracy Độ xác tƣơng đối SP Relative specificity Độ đặc hiệu tƣơng đối SE Relative sensitivity Độ nhạy tƣơng đối PCR-RFLP rep-PCR PCR-restriction fragment length polymorphism Repetitive element PCR Đa hình chiều dài đoạn cắt giới hạn sản phẩm PCR Khuếch đại trình tự lặp MOX Modified Oxford Agar Mơi trƣờng Oxford Agar cải biến MLVA Multiple-locus variable number of tandem repeat analysis Pulsed-field gel electrophoresis Phân tích tính đa hình số lƣợng vùng lặp nhiều locus Điện di xung trƣờng MVLST PFGE MLEE Multilocus electrophoresis typing CC Clones complex enzyme Phân loại theo phổ điện di nhiều enzyme Dòng phức hợp EC Epidemic clones Dòng phức hợp gây bệnh DI Simpson's Diversity Index Chỉ số phân loại Simpson VNTRs Variable repeats ST Sequence type Kiểu trình tự TSBYE Tryptic Soy Broth Yeast Extract Môi trƣờng dịch chiết nấm men trypton từ đậu tƣơng numbers of tandem Đa hình số lƣợng vùng lặp DANH MỤC HÌNH Hình 1-1 Hình thái vi khuẩn L monocytogenes 17 Hình 1-2 Cơ chế xâm nhiễm L monocytogenes vào tế bào người 20 Hình 1-3 Cấu tạo nhóm internalin từ L monocytogenes EGDe 22 Hình 1-4 Trình tự axit amin inlJ 24 Hình 1-5 Tốc độ sinh trưởng chủng L monocytogenes 1340 chủng L innocua11288 canh trường hỗn hợp canh trường riêng biệt, môi trường sử dụng TSBYE 40 Hình 1-6 Mơ hình phương pháp sắc ký miễn dịch phát nhanh L monocytogenes 42 Hình 1-7 Nguyên tắc kỹ thuật LAMP 45 Hình 1-8 Các phương pháp phát sản phẩm LAMP 47 Hình 1-9 Ảnh hưởng nồng độ ion Mg2+đến phổ hấp thụ HNB dung dịch phản ứng LAMP 48 Hình 3-1 Kết ph n lập L monocytogenes sử dụng mơi trường APID L.mono 66 Hình 3-2 Kết khẳng định PC khuẩn lạc L monocytogenes giả định ph n lập môi trường APID L.mono 67 Hình 3-3 Mối liên hệ mặt di truyền L monocytogenes ph n lập từ thực phẩm 79 Hình 3-4 Kết sàng l c mồi LAMP dựa khả khuếch đại DNA L monocytogenes 84 Hình 3-5 Ảnh hưởng nhiệt độ ủ nồng độ betain đến hiệu khuếch đại phản ứng LAMP 87 Hình 3-6 Ảnh hưởng thời gian ủ đến hiệu khuếch đại phản ứng LAMP 89 Hình 3-7 ộ bao tr m phản ứng LAMP v i chủng L monocytogenes 89 Hình 3-8 ộ ch n l c phản ứng LAMP v i loài Listeria khác vi khuẩn thường nhiễm tạp thực phẩm 90 10 35] Cabedo L., Picart i Barrot, L., Teixido i Canelles, A (2008), "Prevalence of Listeria monocytogenes and Salmonella in ready-to-eat food in Catalonia, Spain", J Food Prot 71 (4), pp 855-859 36] Cai S., Kabuki, D.Y., Kuaye, A.Y., Cargioli, T.G., Chung, M.S., Nielsen, R., Wiedmann, M (2002), "Rational Design of DNA Sequence-Based Strategies for Subtyping Listeria monocytogenes", J Clin Microbiol 40 (9), pp 3319-3325 37] Cantinelli T., Chenal-Francisque, V., Diancourt, L., Frezal, L., Leclercq, A., Wirth, T., Lecuit, M., Brisse, S (2013), "Epidemic Clones” of Listeria monocytogenes Are Widespread and Ancient Clonal Groups", J Clin Microbiol 51 (11), pp 37703779 38] Carvalheira A E., C.; Silva, J.; Gibbs, P.; Teixeira, P (2010), "Influence of Listeria innocua on the growth of Listeria monocytogenes", Food Control 21 (11), pp 1492-1496 39] CDC (1998), Update: Multistate Outbreak of Listeriosis - United States, 19981999, http://www.cdc.gov/mmwr/preview/mmwrhtml/00056169.htm 40] CDC (2014), "CDC Foodborne Diseases Active Surveillance Network (FoodNet): FoodNet Surveillance Report for 2012 (Final Report)", Department of Health and Human Services 41] Chandler D P., Brown, J., Bruckner-Lea ,C.J., Olson, L., Posakony, G.J., et al (2001), "Continuous spore disruption using radially focused, high-frequency ultrasound", Anal Chem 73, pp 3784-3789 42] Chau T T H., Campbell, J.I., Schultsz, C., Chau, N.V., Diep, T.S., Baker, S., Chinh, N.T., Farrar, J.J., van Doorn H.R (2010), "Three Adult Cases of Listeria monocytogenes Meningitis in Vietnam", PLoS Med (7), pp e1000306 43] Chen S., Wang, F., Beaulieu, J C., Stein, R E., Ge, B (2011), "Rapid detection of viable Salmonellae in produce by coupling propidium monoazide with loopmediated isothermal amplification", Appl Environ Microbiol 77 (12), pp 40084016 44] Chen Y., Zhang, W and Knabel, S J (2007), "Multi-Virulence-Locus Sequence Typing Identifies Single Nucleotide Polymorphisms Which Differentiate Epidemic Clones and Outbreak Strains of Listeria monocytogenes", J Clin Microbiol 25 (3), pp 835-846 45] Chenal-Francisque V., Lopez, J., Cantinelli, T., Caro, V., Tran, C., Leclercq, A., Lecuit, M., Brisse, S (2011), "Worldwide distribution of major clones of Listeria monocytogenes", Emerg Infect Dis 17 (6), pp 1110-1112 46] Cho A R., Dong, H.J., Seo, K.H and Cho, S (2014), "Development of a LoopMediated Isothermal Amplification Assay for Detecting Listeria monocytogenes prfA in Milk", Food Sci Biotechnol 23, pp 467-474 128 47] Choi W S., Hong, C.H (2003), "Rapid enumeration of Listeria monocytogenes in milk using competitive PCR", Int J Food Microbiol 84 (1), pp 79 – 85 48] Churchill RL L H., Hall JC (2006), "Detection of Listeria monocytogenes and the toxin listeriolysin O in food", J Microbiol Methods 64 (2), pp 141 – 170 49] Cooray K J., Nishibori, T., Xiong, H., Matsuyama, T., Fujita, M., Mitsuyama, M (1994), "Detection of multiple virulence-associated genes of Listeria monocytogenes by PCR in artificially contaminated milk samples", Appl Environ Microbiol 60 (8), pp 3023-3026 50] Corry J E L., Curtis, G.D.W., Baird, R.M ( 2003), Handbook of Culture Media for Food Microbiology, Vol 34, Progr Ind Microbiol 51] Crim S M., Iwamoto, M., Huang, J.Y., Griffin, P.M., Gilliss, D., et al (2014), "CDC Incidence and Trends of Infection with Pathogens Transmitted Commonly Through Food - Foodborne Diseases Active Surveillance Network, 10 U.S Sites, 2006–2013", MMWR Weekly 63 (15), pp 328-332 52] Curiale M S a L., C (1994), "Detection of Listeria monocytogenes in samples containing Listeria innocua", J Food Prot 57, pp 1048–1051 53] Darbouche A., Zechel, S., Chakraborty, T., Domann, E (2012), "Identification of a Beta-Glucosidase in Listeria monocytogenes EGD and Characterization of its Gene Product", J Acad (2), pp 77-98 54] Davidson A L., Dassa, E., Orelle, C., Chen, J (2008), "Structure, function, and evolution of bacterial ATP-binding cassette systems", Microbiol Mol Biol Rev 72 (2), pp 317-364 55] Denny J., McLauchlin, J (2008), "Surveillance and outbreak reports human Listeria monocytogenes infections in europe - an opportunity for improved european surveillance", Eurosurveillance 13 (13) 56] Di Pinto A., Novello, L., Montemurro, F., Bonerba, E., Tantillo, G (2010), "Occurrence of Listeria monocytogenes in ready-to-eat foods from supermarkets in Southern Italy", New Microbiol 33 (3), pp 249-252 57] Dissing J., Rudbeck, L and Marcher, H (1995), Five minutes procedure for extracttion of genomic DNA from whole blood, semen and forensic stains for PCR, 16 congress of the International society for forensic Haemogenetics, Springer Verlag Berlin Heidelberg, Copenhagen, pp 269-270 58] Due Y a (1993), "Modelling the effect of temperature on the growth rate and lag time of Listeria innocua and Listeria monocytogenes", J Food Protect 56, pp 205-210 59] Dykes G A a W., K M (1999), "Sub-lethal damage of Listeria monocytogenes after long-term chilled storage at °C", Lett Appl Microbiol 28 (1), pp 45–48 129 60] Eckhart L., Bach, J., Ban, J., Tschachler, E (2000), "Melanin binds reversibly to thermostable DNA polymerase and inhibits its activity", Biochem Biophys Res Commun 271 (3), pp 726-730 61] EFSA (2012), "Scientific Opinion on a review on the EU Summary Reports on trends and sources zoonoses, zoonotic agents and food-borne outbreaks in 20092010 - specifically for the data on Salmonella, Campylobacter, E coli, L monocytogenes and foodborn outbreaks", EFSA Journal 10 (6) 62] Enright M C., Spratt, B G (1999), "Multilocus sequence typing", Trends Microbiol (12), pp 482-487 63] Ericsson H., Stålhandske, P., Danielsson-Tham, M.-L., Bannerman, E., Bille, J., Jacquet, C., Rocourt, J., Ursing, J., Tham, W (1996), "Division into five groups by REA of the most frequently isolated phagovar of Listeria monocytogenes in Sweden 1976-1985", Med Microbiol Lett 5, pp 145-155 64] Farber J M., Peterkin, P.I (1991), "Listeria monocytogenes, a food-borne pathogen", Microbiol Rev 55 (3), pp 476-511 65] Fratamico P M., Strobaugh, T.P (1998), "Simultaneous detection of Salmonella spp and Escherichia coli O157:H7 by multiplex PCR", J Ind Microbiol 21, pp 92 – 98 66] Fugett EB S.-B D., Dumas NB, Corby J, Wiedmann M ( 2007), "Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) Analysis of Temporally Matched Listeria monocytogenes Isolates from Human Clinical Cases, Foods, Ruminant Farms, and Urban and Natural Environments Reveals Source-Associated as Well as Widely Distributed PFGE Types", J Clin Microbiol 45 (3), pp 865–873 67] Furrer B., Candrian, U, Hoefelein, C & Luethy, J (1991), "Detection and identification of Listeria monocytogenes in cooked sausage products and in milk by in vitro amplification of haemolysin gene fragments", J Appl Bacteriol 70 (5), pp 372-379 68] Gahlawat S K., Ellis, A.E., Collet, B (2009), "A sensitive loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method for detection of Renibacterium salmoninarum, causative agent of bacterial kidney disease in salmonids", J Fish Dis 32 (6), pp 491-497 69] Gaillard J., Berche, P., Frehel, C., Gouin, E & Cossart, P (1991), "Entry of L monocytogenes into cells is mediated by internalin, a repeat protein reminiscent of surface antigens from Gram-positivecocci", Cell 65, pp 1127–1141 70] Garvie E I (1980), "Bacterial lactate dehydrogenases", Microbiol Rev 44 (1), pp 106-139 71] Gasanov U., Hughes, D., Hansbro, P.M (2005), "Methods for the isolation and identification of Listeria spp.", FEMS Microbiol Rev 29 (5), pp 851–875 130 72] Gaya P., Sanchez, J., Medina, M., Nuñez, M (1998), "Incidence of Listeria monocytogenes sand other Listeria species in raw milk produced in Spain", Food Microbiol 15, pp 551-555 73] Geissler M I., S.; Voisin, B.; Fauvel, C.; Boissinot, M.; Bergeron, M G.; Veres, T (2012), "Modular Ultrasonic Lysis System for Rapid Nucleic Acid Extraction and Sample Transfer of Bacillus Spores", J Bioterr Biodef (3), pp 119 74] George S M., Lund, B.M (1992), "The effect of culture medium and aeration on growth of Listeria monocytogenes at pH 4.5", Lett Appl Microbiol 15, pp 49–52 75] Gerner-Smidt P., Weischer, M., Jensen, A., Fredriksen, W (1995), "Listeriosis in Denmark - results of a 10-year survey In XII International Symposium on Problems of Listeriosis", Promaco Conventions Pty Ltd., pp 472 76] Gillner D., Armoush, N., Holz, R C., Becker, D P (2009), "Inhibitors of bacterial N-succinyl-L,L-diaminopimelic acid desuccinylase (DapE) and demonstration of in vitro antimicrobial activity", Bioorg Med Chem Lett 19 (22), pp 6350-6352 77] Goldman E., Green, L H (2008), Practical Handbook of Microbiology, Second Edition, CRC Press 78] Goto M., Honda, E., Ogura, A., Nomoto, A., Hanaki, K (2009), "Colorimetric detection of loopmediated mediated isothermal amplification reaction by using hydroxy naphthol blue", BioTechniques 46 (3), pp 167-172 79] Graves L M., Swaminathan, B., Reeves, M W., Hunter, S B., Weaver, R E., Plikaytis, B D., Schuchat, A (1994), "Comparison of ribotyping and multilocus enzyme electrophoresis for subtyping of Listeria monocytogenes isolates", J Clin Microbiol 32 (12), pp 2936-2943 80] Guerra M M., Mclauchlin, J.M., Bernardo, F.A (2001), "Listeria in ready to eat unprocessed foods produced in Portugal", Food Microbiol 18, pp 423-429 81] Henke W., Herdel, K., Jung, K., Schnorr, D., Loening, S.A (1997), "Betaine improves the PCR amplification of GC-rich DNA sequences", Nucleic Acids Res 25 (19), pp 3957–3958 82] Hunter P R., Gaston, M A (1988), "Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson's index of diversity", J Clin Microbiol 26 (11), pp 2465-2466 83] Huong D T T R., Sudip K (2007), "Immobilization with metal hydroxides as a mean to concentrate food pathogens for increasing sensitivity of PCR based detection method", Vietnam J Biotechnol (4), pp 437-445 84] "ISO 11290-1:1996 Microbiology of food and animal feeding stuffs Horizontal method for the detection and enumeration of Listeria monocytogenes Part 1: Detection method" 131 85] Janzten M M., Navas, J., Corujo, A., Moreno, R., López, V and Martínez-Suárez, J V (2006), "Review Specific detection of Listeria monocytogenes in foods using commercial methods: from chromogenic media to real-time PCR", Span J Agric Res (3), pp 235-247 86] Kaneko H., Kawana, T., Fukushima, E., Suzutani, T (2007), "Tolerance of loopmediated isothermal amplification to a culture medium and biological substances", J Biochem Biophys Methods, pp 499–501 87] Karpíšková T G a R (2009), "Occurrence and Characteristics of Listeria monocytogenes in Ready-to-eat Food from Retail Market in the Czech Republic", Czech J Food Sci 27 (2), pp S2-3–S2-7 88] Katcher H L a S., I (1994), "A distinctive property of Tth DNA polymerase: enzymatic amplification in the presence of phenol", BioTechniques 16, pp 84–92 89] Kathariou S (2002), "Listeria monocytogenes virulence and pathogenicity, a food safety perspective", J Food Prot 65 (11), pp 1811-1829 90] Kathariou S (2003), "Foodborne outbreaks of listeriosis and epidemic-associated lineages of Listeria monocytogenes", Microbial food safety in animal agriculture, Iowa State University Press, Ames, IA 91] Keto-Timonen R O., Autio, T J & Korkeala, H J (2003), "An improved amplified fragment length polymorphism (AFLP) protocol for discrimination of Listeria isolates", Syst Appl Microbiol 26, pp pp 236–244 92] Kim S.-H., Park, M.-K., Kim, J.-Y., Chuong, P.D., Lee, Y.-S., Yoon, B.-S., Hwang, K.-K., Lim, Y.-K (2005), "Development of a sandwich ELISA for the detection of Listeria spp using specific flagella antibodies", J Vet Sci 6, pp 41 - 46 93] Kobayashi H., Miyamoto, T., Hashimoto, Y., Kiriki, M., Motomatsu, A., Honjoh, K., Iio, M (2005), "Identification of factors involved in recovery of heat-injured Salmonella Enteritidis", J Food Prot 68 (5), pp 932-941 94] Köhler S., Leimeister-Wächter, M., Chakraborty, T., Lottspeich, F., Goebel, W (1990), "The gene coding for protein p60 of Listeria monocytogenes and its use as a specific probe for Listeria monocytogenes", Infect Immun 58, pp 1943–1950 95] Kuboki N., Inoue, N., Sakurai, T., Di Cello, F., Grab, D.J., Suzuki, H., Sugimoto, C., Igarashi, I (2003), "Loop-mediated isothermal amplification for detection of African trypanosomes", J Clin Microbiol 41 (12), pp 5517-5524 96] Laksanalamai P., Joseph, L A., Silk, B J., Burall, L S., L Tarr C, Gerner-Smidt, P., Datta, A R (2012), "Genomic characterization of Listeria monocytogenes strains involved in a multistate listeriosis outbreak associated with cantaloupe in US", Plos one (7), pp e42448 97] Lampidis R G R., Sokolovic Z., Goebel W., Kreft J (1994), "The virulence regulator protein of Listeria ivanovii is highly homologous to PrfA from Listeria 132 monocytogenes and both belong to the CrpFnr family of transcription regulators", Mol Microbiol 13, pp 141-151 98] Le Quang Hoa, Phung Thi Thuy, Hoang Lan Phuong, Nguyen Le Thu Ha, To Kim Anh and Nguyen Thi Khanh Tram (2011), Rapid and on-site detection of hepatitis A virus in bivalve molluscs by combining immunomagnetic separation and RTLAMP, 3rd SEEDNet conference on Biotechnology “Towards to the Biotechnology industry in the region”, Hanoi 99] Lefimil C., Lozano, C., Morales-Bozo, I., Plaza, A., Maturana, C., Urzua, B (2013), "DNA from oral bacteria by sodium hydroxide-paper method suitable for polymerase chain reaction", Anal Biochem 433 (2), pp 129-131 100] Lei Shi F W., Yiming Wen, Fang Zhao, Junjian Xiang, Lan Ma (2015), "A novel method to detect Listeria monocytogenes via superparamagnetic lateral flow immunoassay", Anal Bioanal Chem 407 (2), pp pp 529-535 101] Liamkaew R., Kosonpisita, S., Supanivatina, P., Saeteawa, N., Thipayarat, A (2012), "Effect of selective enrichment media on selectivity and isolation of Listeria from non-Listeria strains in suspended cell culture", Procedia Engineering 32, pp 119 – 125 102] Little C L., Sagoo, S K., Gillespie, I A., Grant, K., McLauchlin, J (2009), "Prevalence and level of Listeria monocytogenes and other Listeria species in selected retail ready-to-eat foods in the United Kingdom", J Food Prot 72 (9), pp 1869-1877 103] Liu D (2006), "Identification, subtyping and virulence determination of Listeria monocytogenes, an important foodborne pathogen", J Med Microbiol 55 (Pt 6), pp 645-659 104] Liu D (2008), Handbook of Listeria monocytogenes, CRC Press 105] Liu S., Graham, J E., Bigelow, L., Morse, P D., & Wilkinson, B J (2002), "Identification of Listeria monocytogenes Genes Expressed in Response to Growth at Low Temperature", Appl Environ Microbiol 68 (4), pp 1697–1705 106] Liu Y., Ceruso, M., Gunther, N W., Pepe, T., Cortesi, M L and Fratamico, P (2012), "Construction of Listeria monocytogenes Mutants with In-Frame Deletions in Putative ATP-Binding Cassette (ABC) Transporters and Analysis of Their Growth under Stress Conditions", J Food Sci (7), pp 141-146 107] Lomonaco S V B., Gerner-Smidt P, Tarr C, Gladney L, Joseph L, et al (2013), "Novel Epidemic Clones of Listeria monocytogenes, United States, 2011", Emerg Infect Dis 19 (1), pp 147-150 108] Loncarevic S et al (1995), "Occurrence of Listeria monocytogenes in soft and semi-soft cheeses in retail outlets in Sweden", Int J Food Microbiol 26 (2), pp 245-250 133 109] Loncarevic S., Tham, W., Danielsson-Tham, M.-L (1998), "Changes in serogroup distribution among Listeria monocytogenes human isolates in Sweden In XIII International Symposium on Problems of Listeriosis", p 20 Halifax, Nova Scotia, Canada 110] Low J C., Donachie, W (1997), "A review of Listeria monocytogenes and Listeriosis", Vet J 153 (1), pp 9-29 111] Lucas Stelling C R et al (2010), "Complementation of Listeria monocytogenes Null Mutants with Selected Listeria seeligeri Virulence Genes Suggests Functional Adaptation of Hly and PrfA and Considerable Diversification of prfA Regulation in L seeligeri", Appl Environ Microbiol 76 (15), pp 5124-5139 112] Maiden M C., Bygraves, J.A., Feil, E., Morelli G., Russell, J.E., Urwin, R., et al (1998), "Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms", Proc Natl Acad Sci U S A 95 (6), pp 3140-3145 113] Marentis T C., Kusler, B., Yaralioglu, G G., Liu, S., Haeggstrom, E O., KhuriYakub, B T (2005), "Microfluidic sonicator for real-time disruption of eukaryotic cells and bacterial spores for DNA analysis", Ultrasound Med Biol 31 (9), pp 1265-1277 114] Marie-Laure Sorin S F., Sandrine Poumerol and Patrice Arbault (2000), Listeria monocytogenes detection in food using an ELISA-based method, Atlanta, USA 115] Marie Ragon T W., Florian Hollandt, Rachel Lavenir, Marc Lecuit, Alban Le Monnier , Sylvain Brisse (2008), "A New Perspective on Listeria monocytogenes Evolution", PLoS Pathogens (9) 116] Mark C Enright B G S., Awdhesh Kalia, John H Cross, and Debra E Bessen ( 2001), "Multilocus Sequence Typing of Streptococcus pyogenes and the Relationships between emm Type and Clone", Infect Immun 69 (4), pp 2416– 2427 117] Martin B., Perich, A., Gomez, D., Yanguela, J., Rodriguez, A., Garriga, M., Aymerich, T (2014), "Diversity and distribution of Listeria monocytogenes in meat processing plants", Food Microbiol 44, pp 119-127 118] McDonald F a (1994 ), "Important diferences between generation times of Listeria monocytogenes and Listeria innocua", J Dairy Res 61, pp 433-463 119] McKellar R C., Moir, R., Kalab, M (1994 ), "Factors influencing the survival and growth of Listeria monocytogenes on the surface of Canadian retail wieners", J Food Prot 57, pp 387–392 120] McLauchlin J (1990), "Distribution of serovars of Listeria monocytogenes isolated from different categories of patients with listeriosis European", J Eur J Clin Microbiol Infect 9, pp 210-213 134 121] McLauchlin J., Newton, L (1995), "Human listeriosis in England, Wales and Northern Ireland: a changing pattern of infection In XII International Symposium on Problems of Listeriosis", Promaco Conventions Pty Ltd., Perth, Western Australia, Australia., pp 177-181 122] Mongkolsuk S., Helmann, J.D (2002), "Regulation of inducible peroxide stress responses", Mol Microbiol 45 (1), pp 9-15 123] Morono Y., Terada, T., Hoshino, T., Inagaki, F (2014), "Hot-Alkaline DNA Extraction Method for Deep-Subseafloor Archaeal Communities", Appl Environ Microbiol 80 (6), pp 1985-1994 124] Newell T M W a D G (2000), "Genotyping of Campylobacter spp.", Appl Environ Microbiol 66 (1), pp 1-9 125] Nishibori T., Cooray, K., Xiong, H., Kawamura, I., Fujita, M., Mitsuyama, M (1995), "Correlation between the presence of virulence-associated genes as determined by PCR and actual virulence to mice in various strains of Listeria spp.", Microbiol Immunol 39 (5), pp 343-349 126] Notomi T., Okayama, H., Masubuchi, H., Yonekawa, T., Watanabe, K., Amino, N., Hase, T (2000), "Loop-mediated isothermal amplification of DNA", Nucleic Acids Res 28 (12), pp E63 127] O'Grady J., Ruttledge, M., Sedano-Balbas, S., Smith, T J., Barry, T., & Maher, M (2009), "Rapid detection of Listeria monocytogenes in food using culture enrichment combined with real-time PCR", Food Microbiol 26 (1), pp 4-7 128] O’Connor L (2003), "Detection of Listeria monocytogenes using a PCR/DNA probe assay", Methods Mol Biol 216, pp 185 – 192 129] Opel K L., Chung, D and McCord, B.R (2010), "A study of PCR inhibition mechanisms using real time PCR", J Forensic Sci 55, pp 25–33 130] Oravcova K., Kuchta, T., & Kaclikova, E (2007), "A novel real-time PCR-based method for the detection of Listeria monocytogenes in food", Lett Appl Microbiol 45 (5), pp 568-573 131] Oravcova K., Trncikova, T., Kuchta, T., Kaclikova, E (2008), "Limitation in the detection of Listeria monocytogenes in food in the presence of competing Listeria innocua", J Appl Microbiol 104 (2), pp 429-437 132] Orsi R H W., Martin (2016), "Characteristics and distribution of Listeria spp., including Listeria species newly described since 2009", Appl Microbiol and Biotechnol 100 (12), pp 5273-5287 133] Palumbo J D., Borucki, M K., Mandrell, R E., Gorski, L (2003), "Serotyping of Listeria monocytogenes by enzyme-linked immunosorbent assay and identification of mixed-serotype cultures by colony immunoblotting", J Clin Microbiol 41 (2), pp 564-571 135 134] Paoli G., Kleina, L.G., Brewster, J.D ( 2007), "Development of Listeria monocytogenes-specific immunomagnetic beads using a single-chain antibody fragment", Foodborne Pathog Dis 4, pp 74-83 135] Parisi A., Latorre, L., Normanno, G., Miccolupo, A., Fraccalvieri, R., Lorusso, V., Santagada, G (2010), "Amplified Fragment Length Polymorphism and MultiLocus Sequence Typing for high-resolution genotyping of Listeria monocytogenes from foods and the environment", Food Microbiol 27 (1), pp 101-108 136] Patel A., Robinson, P D., Batt, R K (2000), Encyclopedia of Food Microbiology, Academic Press, San Diego CA 137] Paterson G K., Cone, D.B., Peters, S.E., Maskell, D.J (2009 ), "The enzyme phosphoglucomutase (Pgm) is required by Salmonella enterica serovar Typhimurium for O-antigen production, resistance to antimicrobial peptides and in vivo fitness", Microbiology 155 (10), pp 3403-3410 138] Peisach D., Chipman, D M., Van Ophem, P W., Manning, J M., Ringe, D (1998), "Crystallographic study of steps along the reaction pathway of D-amino acid aminotransferase", Biochemistry 37 (14), pp 4958-4967 139] Peist R H (2001), " PCR inhibitors in plant DNA preparations", QIAGEN News 3, pp 7-9 140] Petran R a (1993), "Simultaneous growth of Listeria monocytogenes and Listeria innocua", J Food Protect 56, pp 616-618 141] Piffaretti J C., Kressebuch, H., Aeschbacher, M., Bille, J., Bannerman, E., Musser, J M., Selander, R K., Rocourt, J (1989), "Genetic characterization of clones of the bacterium Listeria monocytogenes causing epidemic disease", Proc Natl Acad Sci U S A 86 (10), pp 3818-3822 142] Ponniah J R., T.; Paie, M S.; Radu, S.; Farinazleen Mohammad Ghazali; Kqueen, C Y.; Nishibuchi, M.; Nakaguchi, Y.; Malakar, P K (2010), "Listeria monocytogenes in raw salad vegetables sold at retail level in Malaysia", Food Control 21 (5), pp 774–778 143] Powell H A., Gooding, C.M., Garrett, S.D., Lund, B.M and McKee, R.A (1994), "Protease inhibition of the detection of Listeria monocytogenes in milk using the polymerase chain reaction", Lett Appl Microbiol 18, pp 59–61 144] Pusztahelyi T., Szabó, J., Dombrádi, Z., Kovács, S., Pócsi, I (2016), "Foodborne Listeria monocytogenes: A Real Challenge in Quality Control", Scientifica (Cairo) 145] Radstrom P., Knutsson, R., Wolffs, P., Lovenklev, M and Lofstrom, C (2004), "Pre-PCR processing: strategies to generate PCR-compatible samples", Mol Biotechnol 26 (2), pp 133-146 136 146] Ranjbar R., Karami, A., Farshad, S., Giammanco, G.M., Mammina, C (2014), "Typing methods used in the molecular epidemiology of microbial pathogens: a how-to guide", New Microbiol 37 (1), pp 1-15 147] Rantakokko-Jalava K., Jalava, J (2002), "Optimal DNA isolation method for detection of bacteria in clinical specimens by broad-range PCR", J Clin Microbiol 40 (11), pp 4211-4217 148] Rattanachaikunsopon P., & Phumkhachorn, P (2012), "Identification of viable Listeria species based on reverse transcription-multiplex PCR (RT-MPCR) and restriction digestion", Biosci Biotechnol Biochem 76 (6), pp 1189-1194 149] Rawool D B., Malik, S V S., Barbuddhe, S B., Shakuntala, I and Aurora, R (2007), "A Multiplex PCR for Detection of Virulence Associated Genes in Listeria monocytogenes", Int J Food Safety 9, pp 56-62 150] Rees W A., Yager, T.D., Korte, J., von Hippel, P.H (1993), "Betaine can eliminate the base pair composition dependence of DNA melting", Biochemistry 32, pp 137– 144 151] Rip D., & Gouws, P.A (2009), "Development of an internal amplification control using multiplex PCR for the detection of Listeria monocytogenes in food products", Food Anal Methods (3), pp 190-196 152] Ripabelli G., McLauchin, J & Threlfall, E J (2000), "Amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis of L monocytogenes", Syst Appl Microbiol 23, pp pp 132–136 153] Robinson R K (2000), Encyclopedia of Food Microbiology, Academic Press, San Diego, CA 154] Rossen L., Norskov, P., Holmstrom, K., Rasmussen, O F (1992), "Inhibition of PCR by components of food samples, microbial diagnostic assays and DNAextraction solutions", Int J Food Microbiol 17 (1), pp 37-45 155] Rossmanith P., Krassnig, M., Wagner, M., & Hein, I (2006), "Detection of Listeria monocytogenes in food 838 using a combined enrichment/real-time PCR method targeting the prfA gene", Res Microbiol 157 (8), pp 763-771 156] Roussel S., Michelon, D , Lombard, B., Lailler, R (2014), "Molecular typing of Listeria monocytogenes strains isolated from food, feed and animals: state of play and standard operating procedures for pulsed field gel electrophoresis (PFGE) typing, profile interpretation and curation", pp http://www.efsa.europa.eu/sites/default/files/scientific_output/files/main_document s/702e.pdf 157] Ruiz-Rueda O et al (2011), "Multiplex Real-time PCR for the Simultaneous Detection of Salmonella spp and Listeria monocytogenes in Food Samples", Food Anal Methods (2), pp 131-138 137 158] Rutherford S T., Bassler, B.L (2012), "Bacterial Quorum Sensing: Its Role in Virulence and Possibilities for Its Control", Cold Spring Harb Perspect Med (11) 159] Ryser E T., Marth, E.H (1999), Listeria, Listeriosis, and Food Safety, Marcel Dekker, New York 160] Sabat A J., Budimir, A., Nashev, D., Sa-Leao, R., van Dijl, Jm, Laurent, F., Grundmann, H., Friedrich, A W (2013), "Overview of molecular typing methods for outbreak detection and epidemiological surveillance", Euro Surveill 18 (4), pp 20380 161] Sabet C., Lecuit, M., Cabanes, D., Cossart, P., Bierne, H (2005), "LPXTG Protein InlJ, a newly Identified Internalin Involved in Listeria monocytogenes Virulence", Infect Immun 73 (10), pp 6912–6922 162] Sabet C., Toledo-Arana, A., Personnic, N., Lecuit, M., Dubrac, S., et al (2008 ), "The Listeria monocytogenes Virulence Factor InlJ Is Specifically Expressed In Vivo and Behaves as an Adhesin", Infect Immun 76 (4), pp 1368-1378 163] Saiki R K., Gelfand, D.H., Stoffel, S., Scharf, S.J., Higuchi, R., Horn, G.T., Mullis, K.B., Erlich, H.A (1998), "Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase", Science 239 (4839), pp 487–491 164] Salcedo C., Arreaza, L., Alcala, B., de la Fuente, L., Vazquez, J A (2003), "Development of a multilocus sequence typing method for analysis of Listeria monocytogenes clones", J Clin Microbiol 41 (2), pp 757-762 165] Saulnier P., Andremont, A (1992), "Detection of genes in feces by booster polymerase chain reaction", J Clin Microbiol 30 (8), pp 2080-2083 166] Scallan E., Griffin, P M., Angulo, F J., Tauxe, R V., Hoekstra, R M (2011), "Foodborne illness acquired in the United States unspecified agents", Emerg Infect Dis 17 (1), pp 16-22 167] Scheu P., Gasch, A., Berghof, K (1999), "Rapid detection of Listeria monocytogenes by PCR-ELISA", Lett Appl Microbiol 29 (6), pp 416-420 168] Schmidt U (1995), "Sliced, vacuum-packed frankfurter-type sausage technological measures to inhibit the growth of listeriae", Fleischwirtsch 75, pp 804–807 169] Schmitz-Esser S et al (2015), "Genomes of sequence type 121 Listeria monocytogenes strains harbor highly conserved plasmids and prophages", Front Microbiol 6, pp 380 170] Schuchat A., Swaminathan, B., Broome, C V (1991), "Epidemiology of human listeriosis", Clin Microbiol Rev (2), pp 169-183 138 171] Schwartz B., Hexter, D., Broome, C V., Hightower, A W., Hirschhorn, R B et al (1989), "Investigation of an outbreak of listeriosis: new hypotheses for the etiology of epidemic Listeria monocytogenes infections", J Infect Dis 159 (4), pp 680-685 172] Shakuntala I., Malik, S V., Barbuddhe, S B., Rawool, D B (2006), "Isolation of Listeria monocytogenes from buffaloes with reproductive disorders and its confirmation by polymerase chain reaction", Vet Microbiol 117 (2-4), pp 229-234 173] Shamloo E., Jalali, M., Mirlohi, M., Madani, G., Metcalf, D., Merasi, M.R (2015), "Prevalence of Listeria species in raw milk and traditional dairy products in Isfahan, Iran", Int J Env Health Eng (1) 174] Shan X., Zhang, Y., Zhang, Z., Chen, M., Su, Y et al (2012), "Rapid detection of food-borne Listeria monocytogenes by real-time quantitative loop-mediated isothermal amplification", Food Sci Biotechnol 21 (1), pp 101-106 175] Sleator R D F., G A., O'Beirne, D., Gahan, C G., Hill, C (2003), "Betaine and carnitine uptake systems in Listeria monocytogenes affect growth and survival in foods and during infection", J Appl Microbiol 95 (4), pp 839-846 176] Sullivan C., Diggle, MA, Clarke, SC (2005), "Multilocus sequence typing", Mol Biotechnol 29 (3), pp 245-254 177] Sutlovic D., Gamulin, S., Definis-Gojanovic, M., Gugic, D., Andjelinovic, S (2008), "Interaction of humic acids with human DNA: proposed mechanisms and kinetics", Electrophoresis 29 (7), pp 1467-1472 178] Taner N., "http://www.neb-online.de/wpcontent/uploads/2015/04/NEB_isothermal_amp.pdf" 179] Tang M J., Zhou, S., Zhang, X Y., Pu, J H., Ge, Q L et al (2011), "Rapid and sensitive detection of Listeria monocytogenes by loop-mediated isothermal amplification", Curr Microbiol 63 (6), pp 511-516 180] Tanizawa K., Masu, Y., Asano, S., Tanaka, H., Soda, K (1989), "Thermostable Damino acid aminotransferase from a thermophilic Bacillus species Purification, characterization, and active site sequence determination", J Biol Chem 264 (5), pp 2445-2449 181] Teare J M., Islam, R , Flanagan, R , Gallagher, S , Davies, M.G and Grabau, C (1997), "Measurement of Nucleic Acid Concentrations Using the DyNA Quant and the GeneQuant", BioTechniques 22, pp 1170-1174 182] Thekisoe O M., Bazie, R.S., Coronel-Servian, A.M., Sugimoto, C., Kawazu, S., Inoue, N (2009), "Stability of Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Reagents and its Amplification Efficiency on Crude Trypanosome DNA Templates", J Vet Med Sci 71 (4), pp 471-475 139 183] Tomita N., Mori, Y., Kanda, H., Notomi, T (2008), "Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) of gene sequences and simple visual detection of products", Nat Protoc (5), pp 877-882 184] Van Tongeren S P., Degener, J.E., Harmsen, H.J (2011), "Comparison of three rapid and easy bacterial DNA extraction methods for use with quantitative realtime PCR", Eur J Clin Microbiol Infect Dis 30 (9), pp 1053–1061 185] Vasconcelos J A., Deneer, H G (1994), "Expression of Superoxide Dismutase in Listeria monocytogenes", Appl Environ Microbiol 60 (7), pp 2360–2366 186] Vergnaud G., Pourcel, C (2006), Molecular Identification, Systematics, and Population Structure of Prokaryotes, Springer Berlin Heidelberg, Berlin 187] Vingataramin L., Frost, E H (2015), "A single protocol for extraction of gDNA from bacteria and yeast", BioTechniques 58 (3), pp pp 120–125 188] Wang D., Huo, Guicheng, Ren, Daxi, Li, Yonggang (2010), "Development and Evaluation of a Loop-Mediated Isothermal Amplification (Lamp) Method for Detecting Listeria monocytogenes in Raw Milk", J Food Safety 30 (2), pp 251262 189] Wang D G., Brewster, J D., Paul, M., Tomasula, P M (2015), "Two methods for increased specificity and sensitivity in loop-mediated isothermal amplification", Molecules 20 (4), pp 6048-6059 190] Wang L., Li, Y., Chu, J., Xu, Z., Zhong, Q (2012), "Development and application of a simple loop-mediated isothermal amplification method on rapid detection of Listeria monocytogenes strains", Mol Biol Rep 39 (1), pp 445-449 191] Wang X L., Geng, F Z., Zhang, X Z., Wang, Y., Ma, X Y., Su, X D., Tan, J X And Zhang, W (2011), "A loop mediated isothermal amplification assay for rapid detection of Listeria monocytogenes", J Food Safety 31, pp 546–552 192] Wang Y., Jiao, Y., Lan, R., Xu, X., Liu, G., et al (2015), "Characterization of Listeria monocytogenes isolated from human Listeriosis cases in China", Emerg Microbes Infect (8) 193] Wang Y., Zhao, A., Zhu, R., Lan, R., Jin, D., et al (2012), "Genetic diversity and molecular typing of Listeria monocytogenes in China", BMC Microbiology 12 (119) 194] Ward T J., Usgaard, T., Evans, P (2010), "A targeted multilocus genotyping assay for lineage, serogroup, and epidemic clone typing of Listeria monocytogenes", Appl Environ Microbiol 76 (19), pp 6680-6684 195] Wei T., Lu, G., Clover, G (2008), "Novel approaches to mitigate primer interaction and eliminate inhibitors in multiplex PCR, demonstrated using an assay for detection of three strawberry viruses", J Virol Methods 151 (1), pp 132-139 140 196] Wiedmann M., Bruce, J L., Knorr, R., Bodis, M., Cole, E M.,McDowell, C I., McDonough, P L & Batt, C A (1996), "Ribotype diversity of Listeria monocytogenes strains associated with outbreaks of listeriosis in ruminants", J Clin Microbiol 34 (5), pp 1086-1090 197] Wilson I G (1997), "Inhibition and facilitation of nucleic acid amplification", Appl Environ Microbiol 63 (10), pp 3741-3751 198] Wu R., Liu, X., Guo, B., Chen, F., Wang, X et al (2014), "Development of double loop-mediated isothermal amplification to detect Listeria monocytogenes in food", Curr Microbiol 69 (6), pp 839-845 199] Wu S., Wu, Q., Zhang, J., Chen, M., Yan, Z.A., Hu, H (2015), "Listeria monocytogenes Prevalence and Characteristics in Retail Raw Foods in China", Plos one 10 (8) 200] Yang B Y., Liu, X L., Wei, Y M., Wang, J Q., He, X Q., Jin, Y., Wang, Z J (2014), "Rapid and sensitive detection of human astrovirus in water samples by loop-mediated isothermal amplification with hydroxynaphthol blue dye", BMC Microbiol 14, pp 38 201] Yde M., Naranjo, M., Mattheus, W., Stragier, P., Pochet, B et al (2012), "Usefulness of the European Epidemic Intelligence Information System in the management of an outbreak of listeriosis, Belgium, 2011", Euro Surveill 17 (38) 202] Yeh H Y., Shoemaker, C.A., Klesius, P.H (2005), " Evaluation of a loop-mediated isothemal amplification method for rapid detection of chanel catfish Ictalurus punctatus important bacterial pathogen Edwardsiella ictaluri", J Microbiol Methods 63 (1), pp 36-44 203] Zhang W et al (2004), "Multi-virulence-locus sequence typing of Listeria monocytogenes", Appl Environ Microbiol 70 (2), pp 913-920 204] Zhu X., Long, F., Chen, Y., Knochel, S., She, Q., Shi, X (2008), "A putative ABC transporter is involved in negative regulation of biofilm formation by Listeria monocytogenes", Appl Environ Microbiol 74 (24), pp 7675-7683 141 142 ... nghệ Sinh học Thực phẩm ln giúp đỡ, động viên tơi q trình nghiên cứu luận án sống hàng ngày Xin chân thành cảm ơn Ths Nguyễn Thành Trung, Viện Kiểm nghiệm an tồn thực phẩm giúp đỡ tơi thực phần luận. .. ơn KS Hà Thị Xuyên, KS Nguyễn Thu Hiền Phịng Thí nghiệm Sinh học phân tử Viện Cơng nghệ Sinh học thực phẩm giúp đỡ trình thực nghiên cứu Luận án Viện Xin chân thành cảm ơn thầy cô hội đồng cấp... đến tăng sinh L monocytogenes canh trường tăng sinh mẫu thực phẩm 95 Bảng 3-11 Ảnh hưởng hai loại môi trường BLEB HF đến sự tăng sinh L monocytogenes canh trường tăng sinh mẫu thực phẩm