1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Nghiên cứu di truyền quần thể loài cá phèn vàng (polynemus melanochir valenciennes, 1831) tại đồng bằng sông cửu long

87 34 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 87
Dung lượng 2,28 MB

Nội dung

iều tác động thay đổi môi trường hoạt động người biến đổi khí hậu, đặc biệt xâm nhập mặn c Cấu trúc di truyền quần thể cá phèn vàng dựa phương pháp phân tích tọa độ PCoA So sánh phân nhóm quần thể phân tích tọa độ PCoA dựa khác biệt di truyền cho thấy quần thể cá phèn vàng chia làm nhóm chính: quần thể đại diện cho vùng thượng nguồn (An Giang, Đồng Tháp) gộp thành nhóm (nhóm 1), vùng hạ nguồn (Trà Vinh, Bến Tre) tạo thành nhóm (nhóm 2) Sự khác biệt di truyền quần thể thể qua phân tích tọa độ PCoA (Principal coordinate analysis), quần thể khác chủ yếu theo tọa độ (PC & 3) tọa độ giải thích 36,37% khác biệt di truyền, PC2 giải thích 15,2,%, tọa độ giải thích 21,17% khác biệt di truyền cịn lại PC1 7,66% (Hình 3.6) Hình 3.6 Mơ hình 3D phân tích PCoA dựa thị SNPs quần thể cá phèn vàng P melanochir ĐBSCL Vòng tròn thể phân nhóm quần thể 55 Như vậy, kết phân tích nhóm (Structure) phân tích tọa độ (PCoA) cho thấy phân tách quần thể cá phèn vàng theo khu vực địa lý vùng thượng nguồn vùng cửa sông Tuy nhiên, cá phèn vàng loài di cư tự nhiên thủy vực nước lợ trình sinh sản tìm kiếm thức ăn, quần thể chia sẻ thông tin di truyền đặc trưng cho quần thể Thảo luận Những năm gần đây, diễn biến xâm nhập mặn ĐBSCL diễn biến phức tạp, bất thường, so với kỳ nhiều năm ĐBSCL chịu tác động hai khối nước lớn sông Mê Cơng thủy triều biển Đơng, chế độ thủy văn khu vực phức tạp Nước biển dâng biến đổi khí hậu làm cho vùng nhiễm mặn mở rộng thời gian nhiễm mặn kéo dài dẫn đến thay đổi, thu hẹp hạn chế vùng phân bố loài cá nước ngọt; đồng thời tăng số lượng loài vùng phân bố loài cá biển rộng muối Điều dẫn đến thay đổi cấu trúc thành phần lồi khu hệ cá vùng cửa sơng (EOE, 2015) (Nguồn: http://google.map) Ứng dụng thị SNPs nghiên cứu cho thấy quần thể cá phèn vàng khu vực hạ nguồn ĐBSCL (Bến Tre, Trà Vinh) thể đa dạng di truyền cao khu vực thượng nguồn (An Giang, Đồng Tháp) Xét phương diện khoảng cách địa lý (

Ngày đăng: 03/02/2021, 21:55

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
12. Trần Đắc Định, Shibukawa Koichi, Nguyễn Thanh Phương, Hà Phước Hùng, Trần Xuân Lợi, Mai Văn Hiếu, Utsugi Kenzo, 2013. Mô tả định loại cá đồng bằng sông Cửu Long, Việt Nam, Nxb Đại học Cần Thơ, 174 tr Sách, tạp chí
Tiêu đề: Mô tả định loại cá đồng bằng sông Cửu Long, Việt Nam
Nhà XB: Nxb Đại học Cần Thơ
13. Trương Thị Oanh 2016, ‘Xác định chỉ thị phân tử ứng dụng trong nghiên cứu di truyền quần thể cá hè chấm đỏ Lethrinus lentjan Lacepède, 1802 ở vùng biển Việt Nam’, Luận văn tốt nghiệp thạc sĩ, Đại học Nha Trang, Việt Nam Sách, tạp chí
Tiêu đề: Lethrinus lentjan
14. WWF, 2009. “Biến Đổi Khí Hậu Ở Khu Vực Mê Kông. Nguy Cơ Đối Với Đa Dạng Sinh Học, các Dịch vụ Của Hệ Sinh Thái và Phát Triển.”2. Tài liệu tiếng Anh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Biến Đổi Khí Hậu Ở Khu Vực Mê Kông. Nguy Cơ Đối Với Đa Dạng Sinh Học, các Dịch vụ Của Hệ Sinh Thái và Phát Triển
15. Ashfaqun, N., Siddik, M.A.B., Alam, M.A., Ahsan, M.E., and Chaklader, M.R., 2014. Population Genetic Structure of Paradise Threadfin Polynemus paradiseus(Linnaeus, 1758) Revealed by Allozyme Marker. World Journal of Zoology 9 (4): 260-266. Doi: 10.5829/idosi.wjz.2014.9.4.86149 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Polynemus paradiseus
17. Baysal, B.E., DeLoia, J.A., Willett-Brozick, J.E., Goodman, M.T., Brady, M.F., Modugno, F., Lynch, H.T., Conley, Y.P., Watson, P., Gallion, H.H., 2004.Analysis of CHEK2 gene for ovarian cancer susceptibility. Gynecol Oncol, Oct 2004;95(1): 62-69 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Gynecol Oncol
18. Baird, N. A., Etter, P. D., Atwood, T. S., Currey, M. C., Shiver, A. L., Lewis, Z. A., Selker, E. U., Cresko, W. A. and Johnson E. A., 2008. Rapid SNP Discovery and Genetic Mapping Using Sequenced RAD Markers, PLoS ONE, 3(10), p. e3376 19. Beuzen, N. D., Stear, M.J., Chang, K.C., 2000. Molecular markers and their use in animal breeding. Veterinary Journal 160, 42-52 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Veterinary Journal
20. Brown, W. M., George, M., & Wilson, A. C., 1979. Rapid evolution of animal mitochondrial DNA. Proceedings of the National Academy of Sciences, 76(4), 1967-1971 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Proceedings of the National Academy of Sciences, 76
22. Bolger, AM, Lohse, M & Usadel, B 2014, ‘Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data’, Bioinformatics, vol. 30, no. 15, pp. 2114-2120 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Bioinformatics
26. Danecek, P., Auton, A., Abecasis, G., Albers, C.A., Banks, E., DePristo, M.A., Handsaker, R.E., Lunter, G., Marth, G.T., Sherry, S.T., 2011. The variant call format and VCFtools. Bioinformatics 27:2156–2158 DOI 10.1093/bioinformatics/btr330 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Bioinformatics
28. Elshire, R.T., Glaubitz, J. C., Sun, Q., Poland, J. A., Kawamoto, K., Buckler, E. S. and Mitchell, S. E., 2011. A robust, simple genotyping-by-sequencing (GBS) approach for high diversity species., PloS one, 6(5), P.e19379 Sách, tạp chí
Tiêu đề: PloS one
29. EOE (2012), “Effect of climate change and land use change on saltwater intrusion”, http://www.eoearth.org/view/article/152361 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Effect of climate change and land use change on saltwater intrusion
Tác giả: EOE
Năm: 2012
30. Evanno, G, Regnaut, S & Goudet, J 2005, ‘Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study’, Mol Ecol, vol. 14, pp. 2611–2620 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Mol Ecol
31. Frascaroli, E., Schrag, T. A., Melchinger, A. E., 2013. Genetic diversity analysis of lite European maize (Zea mays L.) inbred lines using AFLP, SSR and SNP markers reveals ascertainment bias for a subset of SNPs. Theor. Appl. Genet., 126: 133-141.32. Fishbase, 2012/…/Ecosys/10617 Sách, tạp chí
Tiêu đề: (Zea mays
33. Fu, L, Niu, B, Zhu, Z, Wu, S & Li, W 2012, ‘CD-HIT: accelerated for clustering the next-generation sequencing data’, Bioinformatics, vol. 28, no. 23, pp. 3150–3152.doi: 10.1093/bioinformatics/bts565 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Bioinformatics
34. Guryev, V., Berezikov, E., Cuppen, E., 2005. CASCAD: a database of candidate single nucleotide polymorphisms associated with expressed sequences. BMC Genomics, 6: 10. doi:10.1186/1471-2164-6-10 Sách, tạp chí
Tiêu đề: BMC Genomics
35. Gouy, M., Guindon, S. & Gascuel, O., 2010. SeaView version 4: a multiplatform graphical user interface for sequence alignment and phylogenetic tree building. Molecular Biology and Evolution 27(2) : 221-224 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Molecular Biology and Evolution
38. Hoegh-Guldberg, O., & Bruno, J. F., 2010. The Impact of Climate Change on the World’s Marine Ecosystems. Science (New York, N.Y.) 328 (5985), 1523–28.doi:10.1126/science.1189930 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Science (New York, N.Y.)
39. Huse, S. M., Huber, J. A., Morrison, H. G., Sogin, M. L. andWelch, D. M., 2007. Accuracy and quality of massively parallel DNA pyrpsequencing. Gennome Biology, 8(7) Sách, tạp chí
Tiêu đề: Gennome Biology
41. Hurwood, D. A., Adamson, E. A. S., & Mather, P. B. (2008). Evidence for strong genetic structure in a regionally important, highly vagile cyprinid (Henicorhynchus lobatus) in the Mekong River Basin. Ecology of Freshwater Fish, 17(2), 273-283 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Ecology of Freshwater Fish, 17
Tác giả: Hurwood, D. A., Adamson, E. A. S., & Mather, P. B
Năm: 2008
42. Hortle, K. G & Bush, S.R.,2003. Consumption in the Lower Mekong Basin as measure of fish yield. pp. 76-82 in Clayton T. (ed.) New Approaches for the Improvement of Inland Capture Fishery Statistics in the Mekong Basin. FAO, MRC, Govt of Thái Lan and Govt of the Netherlands. RAP Publication 2003/1 Sách, tạp chí
Tiêu đề: FAO, MRC, Govt of Thái Lan and Govt of the Netherlands

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w