Nghiên cứu mô phỏng tối ưu tỉ lệ ghép phối, hiệu quả chọn lọc và cận huyết giữa các quần thể cá tra (Pangasianodon hypophthalmus) chọn giống

Mục tiêu của bài viết là xác định tỉ lệ tối ưu ghép phối nội bộ và ghép phối chéo 3 quần thể (year-class) cá tra bố mẹ G2-2002, G2-2003 và G3-2001 để thành lập một quần thể chọn giống duy nhất G3 cho chọn giống dài hạn theo tính trạng tăng trưởng, ngoài ra cũng xác định tỉ lệ tối ưu ghép phối của quần thể G3 và quần thể mới thành thục G3-2002.

VIỆN NGHIÊN CỨU NUÔI TRỒNG THỦY SẢN II NGHIÊN CỨU MÔ PHỎNG TỐI ƯU TỈ LỆ GHÉP PHỐI, HIỆU QUẢ CHỌN LỌC VÀ CẬN HUYẾT GIỮA CÁC QUẦN THỂ CÁ TRA (Pangasianodon hypophthalmus) CHỌN GIỐNG Nguyễn Văn Sáng1*, Trịnh Quốc Trọng1, Nguyễn Thanh Vũ1 TÓM TẮT Trên cá tra, chương trình chọn giống với quần thể ban đầu (G0-2001 G0-2002 G0-2003 có số lượng gia đình 75, 79 101) sản xuất từ cá bố mẹ thuộc trại sản xuất giống Đồng sông Cửu Long Chọn giống tiến hành qua hệ Mục tiêu báo cáo xác định tỉ lệ tối ưu ghép phối nội ghép phối chéo quần thể (year-class) cá tra bố mẹ G2-2002, G2-2003 G3-2001 để thành lập quần thể chọn giống G3 cho chọn giống dài hạn theo tính trạng tăng trưởng, ngồi xác định tỉ lệ tối ưu ghép phối quần thể G3 quần thể thành thục G3-2002 Khi tỉ lệ đóng góp quần thể G3-2001 dao động từ 38,5 đến 50% khối lượng, EBV tỉ lệ cận huyết quần thể tích hợp G3 khơng khác biệt lớn Khi tỉ lệ đóng góp quần thể G3-2001 40% tỉ lệ cận huyết thấp (0,041 – 0,043) Quần thể chọn lọc qua nhiều hệ nên có tỉ lệ đóng góp lớn Khuyến cáo sử dụng tỉ lệ đóng góp G3-2001 (40%), G2-2002 (35%) G2-2003 (25%) cho việc tích hợp tạo quần thể G3, nhằm đảm bảo đóng góp quần thể khơng q chênh lệch Khi tích hợp quần thể G3-2002 vào G3 tỉ lệ đóng góp khơng tạo nên khác biệt lớn Khuyến cáo tỉ lệ tích hợp G3-2002 – 10% Từ khóa: cá tra, mơ phỏng, khối lượng, EBV, tỉ lệ cận huyết I GIỚI THIỆU Cá tra (Pangasianodon hypophthalmus) lồi cá ni nước quan trọng Tính đến hết năm 2017, diện tích ni cá tra đạt 6.078 hécta với sản lượng 1,26 triệu tấn, kim ngạch xuất (tới 142 quốc gia vùng lãnh thổ) đạt 1,78 tỷ đô la Mỹ (VASEP, 2018) Chương trình chọn giống cá tra thực từ năm 2001 với quần thể chọn lọc song song (Van Sang ctv., 2007) Tính đến năm 2014, việc chọc lọc thực qua 2–3 hệ Việc trì nhiều quần thể chọn lọc gây nhiều khó khăn cho cơng tác quản lý chi phí thực Việc hợp quần thể cần thiết đảm bảo mục tiêu chương trình chọn giống trì hệ số cận huyết, tích lũy di truyền để phục vụ cho chọn lọc dài hạn Do đó, mục tiêu báo cáo xác định tỉ lệ tối * ưu ghép phối nội ghép phối chéo quần thể cá tra bố mẹ G2-2002, G2-2003 G32001 nghiên cứu mô sử dụng phần mềm QMSim (Sargolzaei Schenkel, 2013) để thành lập quần thể chọn giống (G3) theo tính trạng tăng trưởng Ngoài nghiên cứu xác định tỉ lệ tối ưu ghép phối quần thể G3 quần thể thành thục G3-2002 II VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP 2.1 Các quần thể chọn giống thực tế Các quần thể ban đầu G0-2001, G0-2002 G0-2003 với số lượng gia đình 75, 79 101 sản xuất từ cá bố mẹ thuộc trại sản xuất giống Đồng sông Cửu Long Đối với quần thể 2001, chọn giống qua hệ bao gồm G1-2001, G2-2001 G3-2001 Quần thể 2002 chọn lọc qua hệ tương Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II Email: nguyenvansang1973@yahoo.com TẠP CHÍ NGHỀ CÁ SƠNG CỬU LONG - SỐ 11 - THÁNG 7/2018 VIỆN NGHIÊN CỨU NUÔI TRỒNG THỦY SẢN II ứng G1-2002, G2-2002 G3-2002 Riêng quần thể 2003, thành lập muộn nên chọn lọc qua hệ G1-2003 G22003 Nghiên cứu có bước Bước 1, tích hợp quần thể G3-2001, G2-2002 G2-2003 thành quần thể chọn giống G3 Bước 2, tích hợp quần thể G3-2002 vào quần thể G3 2.2 Phần mềm QMSim Mô thực phần mềm QMSim (Sargolzaei Schenkel, 2013) QMSim phần mềm chuyên biệt để mô quần thể động vật từ mức độ di truyền đến mức độ phân tử chức mô quần thể ban đầu (historical populations) Mức độ phân tử bao gồm khả định hình nhiễm sắc thể với QTL (Quantitative Trait Loci) đồ thị (marker maps) Tuy nhiên nghiên cứu QMSim dùng để mô quần thể bao gồm cá thể xếp theo cấu trúc định sẵn, cá thể có kiểu hình giá trị chọn giống QMSim thiết kế để mô quần thể lớn, nhiều hệ, có phả hệ phức tạp Quy trình mơ QMSim có hai bước Đầu tiên, quần thể ban đầu mô Tiếp theo, cấu trúc quần thể hệ hệ mơ Trong q trình mơ quần thể, QMSim cho phép nhiều tùy chọn phục vụ cho chọn giống Chương trình vận hành hiệu thời gian tính tốn u cầu nhớ máy tính 2.3 Mơ sử dụng QMSim 2.3.1 Mô nhập quần thể G32001, G2-2002 G2-2003 thành quần thể G3 Trong nghiên cứu này, quần thể cá tra thành phần quần thể tổng hợp (gộp chung) mô phần mềm QMSim (Sargolzaei Schenkel, 2013) Tuy nhiên, thông số đầu vào hệ số di truyền, phương sai kiểu hình, số lượng cá thể chọn lọc, số lượng cá cá mẹ/gia đình ước tính từ quần thể chọn giống thực tế Bốn quần thể quần thể ban đầu G0 quần thể chọn giống G2-2002, G2-2003 G3-2001 Tính trạng chọn lọc mô tăng trưởng xác định khối lượng thu hoạch Tính trạng tăng trưởng có hệ số di truyền đặt mức 0,42 phương sai kiểu hình 66.906 g (số liệu thực tế dựa hệ chọn lọc từ 2001) Quần thể ban đầu mô qua hệ với số lượng cá thể 20.000 cá thể hệ (G0) 17.432 hệ (G1), với giả định ghép phối tiến hành ngẫu nhiên Ba quần thể thành phần G2-2002, G2-2003 G3-2001 với chi tiết sau Quần thể G3-2001 chọn lọc trước qua hệ, có số lượng cá chọn lọc (những cá thể có giá trị chọn giống cao nhất) 110 đực 167 cá cái, số lượng cá chọn để nuôi tăng trưởng 63 (với giả định tỉ lệ cá đực:cái = 1:1) cho gia đình Quần thể G2-2002 chọn lọc trước qua hệ, bao gồm 108 cá đực 183 cá chọn lọc, số lượng cá con/gia đình 52 (tỉ lệ đực:cái = 1:1) Quần thể G2-2003 chọn lọc trước qua hệ, bao gồm 131 cá đực 175 cá chọn lọc, 60 cá con/gia đình (tỉ lệ đực:cái = 1:1) Giá trị chọn giống ước tính BLUP (Best Linear Unbiased Prediction) Ghép phối thực dựa giá trị chọn giống (Estimated Breeding Value, EBV) cá thể, tức là, cá thể đực có EBV cao ghép phối với cá thể có EBV cao, ngược lại Phả hệ, giá trị kiểu hình (=khối lượng thu hoạch), giá trị chọn giống ghi nhận ước tính cho hệ/quần thể Cho việc thành lập quần thể G3, số lượng tỉ lệ đóng góp quần thể mô theo 14 phương án (Bảng 2) Số lượng cá 75/gia đình, chọn lọc qua hệ Giá trị chọn giống ước tính BLUP Ghép phối thực theo thứ tự EBV, tức là, cá thể đực có EBV cao ghép phối với cá thể có EBV cao theo thứ tự từ cao đến thấp Phả hệ, giá trị kiểu hình, giá trị chọn giống ghi nhận ước tính cho hệ Các thông số chung bao gồm hệ số di truyền 0,42 phương sai kiểu hình 66.906 g Tất phương án mô chạy 50 lần TẠP CHÍ NGHỀ CÁ SƠNG CỬU LONG - SỐ 11 - THÁNG 7/2018 VIỆN NGHIÊN CỨU NUÔI TRỒNG THỦY SẢN II Bảng Tỉ lệ đóng góp quần thể thành phần G2-2002, G2-2003 G3-2001 cho quần thể G3 theo 14 phương án khác với số cá thể chọn lọc 70 cá đực 140 cá Tỉ lệ đóng góp (%) Phương án 10 11 12 13 14 G3-2001 G2-2003 G2-2002 15,0 15,0 25,0 25,0 33,3 35,0 35,0 37,5 38,5 40,0 40,0 40,0 50,0 70,0 15,0 70,0 25,0 50,0 33,3 25,0 40,0 25,0 28,5 25,0 30,0 35,0 25,0 15,0 70,0 15,0 25,0 25,0 33,3 40,0 25,0 37,5 33,5 35,0 30,0 25,0 25,0 15,0 2.3.2 Mô tích hợp quần thể G32002 vào quần thể G3 Tiếp theo, mơ việc tích hợp quần thể G3-2002 vào quần thể G3 Các thông số đầu vào tương tự thành lập G3 từ quần thể G3-2001, G2-2002 G2-2003 nêu Hệ số di truyền đặt mức 0,45 Bảng Tỉ lệ đóng góp hai quần thể G3 G3-2002 cho quần thể Phương án Tỉ lệ đóng góp (%) G3 G3-2002 60 40 80 20 85 15 90 10 95 05 2.3.3 Chỉ tiêu so sánh Mô sử dụng QMSim lặp lại 50 lần Trong lần lặp lại, trung bình giá trị chọn giống tính tốn cho quần thể Sau đó, trung bình 50 lần lặp lại tính với độ lệch chuẩn sai số chuẩn cho phương án Chọn lọc dựa giá trị chọn giống QMSim cung cấp Các kết so sánh bao gồm trung bình giá trị kiểu hình, giá trị chọn giống, hiệu chọn lọc hệ số cận huyết sau thề hệ chọn lọc sử dụng để so sánh hiệu phương án tích hợp để thành lập quần thể G3 III KẾT QUẢ 3.1 Tích hợp quần thể G3-2001, G22002 G2-2003 tạo thành quần thể G3 Trung bình khối lượng, giá trị chọn giống hệ số cận huyết phương án tích hợp quần thể G3-2001, G2-2002 G2-2003 tạo thành quần thể G3 trình bày Bảng Trung bình khối lượng giá trị chọn giống (EBV) tăng nhanh tỉ lệ đóng góp G3-2001 tăng từ 15,0 đến 37,5%, ổn định đạt 40% (bất kể đóng góp G2-2002 G2-2003 có thay đổi nữa) Khi tỉ lệ G3-2001 tiếp tục tăng khối lượng EBV có tăng so với phương án trước đó, tương đương tỉ lệ 50 70% (Bảng 3) TẠP CHÍ NGHỀ CÁ SƠNG CỬU LONG - SỐ 11 - THÁNG 7/2018 VIỆN NGHIÊN CỨU NI TRỒNG THỦY SẢN II Bảng Trung bình khối lượng, giá trị chọn giống hệ số cận huyết 14 phương án tích hợp quần thể G3-2001, G2-2002 G2-2003 tạo thành quần thể G3 Phương án Tỉ lệ đóng góp (G32001 : G2-2002 : G2-2003) Khối lượng (g) Giá trị chọn giống (EBV) (g) Hệ số cận huyết 10 11 12 13 14 15,0 : 15,0 : 70,0 15,0 : 70,0 : 15,0 25,0 : 25,0 : 50,0 25,0 : 50,0 : 25,0 33,3 : 33,3 : 33,3 35,0 : 25,0 : 40,0 35,0 : 40,0 : 25,0 37,5 : 25,0 : 37,5 38,5 : 28,5 : 33,5 40,0 : 25,0 : 35,0 40,0 : 30,0 : 30,0 40,0 : 35,0 : 25,0 50,0 : 25,0 : 25,0 70,0 : 15,0 : 15,0 1006,0 ± 6,6 1003,8 ± 5,8 1038,2 ± 5,3 1032,4 ± 5,7 1062,3 ± 6,4 1070,5 ± 5,4 1059,0 ± 5,4 1068,9 ± 5,7 1062,7 ± 5,0 1073,8 ± 5,0 1067,3 ± 5,5 1079,4 ± 5,4 1096,6 ± 5,5 1107,6 ± 5,3 1004,6 ± 6,6 1002,4 ± 5,8 1036,7 ± 5,3 1030,8 ± 5,7 1060,7 ± 6,4 1068,9 ± 5,4 1057,3 ± 5,4 1067,0 ± 5,7 1060,9 ± 5,1 1072,2 ± 5,0 1065,6 ± 5,8 1077,7 ± 5,4 1094,8 ± 5,6 1105,7 ± 5,3 0,054 ± 0,003 0,052 ± 0,002 0,050 ± 0,002 0,050 ± 0,002 0,050 ± 0,002 0,049 ± 0,002 0,046 ± 0,002 0,045 ± 0,003 0,041 ± 0,002 0,041 ± 0,002 0,043 ± 0,002 0,042 ± 0,002 0,043 ± 0,002 0,038 ± 0,002 Giá trị = trung bình 50 lượt chạy mô ± sai số chuẩn Ngược lại với xu hướng khối lượng EBV, hệ số cận huyết có xu hướng giảm đặn (0,54 – 0,45) tỉ lệ đóng góp G3-2001 tăng (15,0 – 37,5) Khi tỉ lệ đóng góp G32001 từ 38,5% vào cao hệ số cận huyết trở nên ổn định (0,41 – 0,43), ngoại trừ có giảm G3-2001 đóng góp 70% (0,38) (Bảng 3) 3.2 Tích hợp quần thể G3-2002 vào quần thể G3 Đáng ý tích hợp quần thể G3-2002 vào quần thể G3 trung bình khối lượng, EBV hệ số cận huyết (0,42) gần ổn định sau hệ chọn lọc (Bảng 4) Do quần thể G3 bao gồm hệ bố mẹ (G2-2002) G3-2002, nên tỉ lệ ghép G3-2002 không cần cao Quần thể G3 nên đóng góp với tỉ lệ 90 – 95% Bảng Trung bình khối lượng, giá trị chọn giống hệ số cận huyết phương án tích hợp quần thể G3-2002 vào G3 Phương án Tỉ lệ đóng góp (G3 : G3-2002) Khối lượng (g) Giá trị chọn giống (EBV) (g) Hệ số cận huyết 60 : 40 80 : 20 85 : 15 90 : 10 95 : 05 790,0 ± 4,7 792,5 ± 5,2 785,0 ± 5,7 793,5 ± 5,1 788,8 ± 3,9 788,6 ± 4,7 791,3 ± 5,2 783,8 ± 5,7 792,1 ± 5,2 787,5 ± 3,9 0,047 ± 0,002 0,047 ± 0,002 0,047 ± 0,003 0,046 ± 0,002 0,045 ± 0,002 Giá trị = trung bình 50 lượt chạy mơ ± sai số chuẩn TẠP CHÍ NGHỀ CÁ SƠNG CỬU LONG - SỐ 11 - THÁNG 7/2018 VIỆN NGHIÊN CỨU NUÔI TRỒNG THỦY SẢN II IV THẢO LUẬN Phương pháp tiến tiến để ước tính giá trị chọn giống BLUP (Best Linear Unbiased Prediction) (Henderson, 1984) Phương pháp BLUP sử dụng thông tin cá thể họ hàng, gia tăng độ xác EBV Chọn lọc dựa EBV (tức chọn cá thể có EBV cao quần thể) phương pháp chuẩn chọn giống Chọn lọc theo EBV đem lại hiệu cao gia tăng tỉ lệ cận huyết, có tương quan cao EBV gia đình khiến cho cá thể chọn lọc xuất xứ từ số gia đình (Wray Thompson, 1990) Trong nghiên cứu này, thơng số đầu vào (dựa kết chọn lọc thực tế) chọn lọc ghép phối dựa EBV nên khối lượng EBV tăng nhanh qua hệ Ngoài ra, hệ số di truyền đầu vào mức cao (0,42) nên EBV cao tương ứng, EBV cá thể tăng hệ số di truyền tăng (Henderson, 1984) Tuy nhiên, tỉ lệ cận huyết tăng nhanh (4,4 – 5,1%) Tỉ lệ cận huyết nằm mức báo cáo chương trình chọn giống cá hồi coho (Oncorhynchus kisutch) Chilê (3 – 13%/thế hệ) (Yáñez ctv., 2014) Lưu ý mức độ cao so với mức khuyến cáo lý thuyết 1,0% (Bijma, 2000) chọn giống động vật Nhìn chung, tỉ lệ đóng góp quần thể dao động quanh 33% (tức mức độ đóng góp ba quần thể tương đương =1/3) khối lượng, EBV tỉ lệ cận huyết không khác nhiều Có thể nhận thấy xu hướng tỉ lệ đóng góp quần thể G32001 (được chọn lọc qua nhiều hệ hơn, có phả hệ “sâu” hơn) cao (40%) tỉ lệ cận huyết thấp (0,041 – 0,044 4,1 – 4,4%) Trong chương trình chọn giống điều tối quan trọng phải trì tỉ lệ cận huyết mức chấp nhận (Sonesson ctv., 2005), cận huyết có ảnh hưởng tiêu cực trực tiếp đến tính trạng tăng trưởng, sinh sản sức sống (Falconer Mackay, 1996) Điểm thú vị tăng tỉ lệ đóng góp quần thể G3-2001 (lên đến 50% 70%, phương án 13 14) khối lượng EBV tăng cận huyết lại giảm nhẹ (0,38 – 0,43) (Bảng 3) Một kết đáng lưu ý khác tăng tỉ lệ đóng góp quần thể chọn lọc qua hệ (G2-2002 G2-2003) lên đến 70% (phương án 2) khối lượng EBV thấp nhất, thấp hẳn so với phương án quần thể chọn lọc qua hệ G3-2001 có tỉ lệ đóng góp 70% (Phương án 14) (Bảng 3) Xu hướng tương tự cho hệ số cận huyết (phương án có hệ số cận huyết cao phương án 13 14), dĩ nhiên với chiều hướng ngược lại (cận huyết cao khơng tốt) (Bảng 3) Điều cho phép nhận định quần thể chọn lọc qua nhiều hệ nên có tỉ lệ đóng góp lớn Nhận định phù hợp với đặc điểm chung chọn giống qua nhiều hệ hiệu độ xác chọn lọc gia tăng (Gjedrem, 2005) Mơ chương trình chọn giống công việc phức tạp Các thông số di truyền, số lượng cá bố mẹ chọn lọc, số lượng cá con/ gia đình (và thường) thay đổi qua hệ, khác quần thể (year-class) Các thông số đầu vào phần mềm QMSim bao gồm hệ số di truyền chung (cho tất quần thể hệ), số lượng cá bố mẹ chọn lọc quần thể, số lượng cá gia đình, phương pháp chọn lọc ghép phối Tất thông số cố định cho tất hệ (khơng có tùy chọn liệt kê riêng rẽ cho hệ) quần thể G3-2001, G2-2002 G2-2003 Do đó, kết mô nên kiểm chứng với số liệu thực tế hệ chọn giống sau V KẾT LUẬN Khi tỉ lệ đóng góp quần thể G3-2001 dao động từ 38,5 đến 50% khối lượng, EBV tỉ lệ cận huyết quần thể tích hợp G3 khơng khác biệt lớn Khi tỉ lệ đóng góp quần thể G3-2001 40% tỉ lệ cận huyết thấp (0,041 – 0,043) Quần thể chọn lọc qua nhiều hệ nên có tỉ lệ đóng góp lớn Khuyến cáo sử dụng tỉ lệ đóng góp G3-2001 (40%), G2-2002 (35%) G2-2003 (25%) cho TẠP CHÍ NGHỀ CÁ SƠNG CỬU LONG - SỐ 11 - THÁNG 7/2018 VIỆN NGHIÊN CỨU NI TRỒNG THỦY SẢN II việc tích hợp tạo quần thể G3, nhằm đảm bảo đóng góp quần thể khơng q chênh lệch Khi tích hợp quần thể G3-2002 vào G3 tỉ lệ đóng góp không tạo nên khác biệt lớn Khuyến cáo tỉ lệ tích hợp G3-2002 – 10% TÀI LIỆU THAM KHẢO Tài liệu tiếng Việt Phạm Đình Khơi, Nguyễn Văn Hảo, Nguyễn Văn Sáng, Nguyễn Thanh Vũ, Nguyễn Quyết Tâm, N.H.N., Lê Hồng Phước, Nguyễn Thị Hiền, Nguyễn Diễm Thư, Hà Thị Ngọc Nga, 2010 Bước đầu đánh giá số thông số di truyền làm sở cho chọn giống kháng bệnh gan thận mủ Báo cáo tổng kết tóm tắt 10 trang Nguyễn Văn Sáng, Phạm Văn Khánh, Phạm Đình Khơi, Phan Thanh Lâm, Nguyễn Quyết Tâm, Đặng Minh Phương, Nguyễn Thị Đang, Trần Anh Dũng, Nguyễn Văn Ngô, 2010 Báo cáo tổng kết đề tài ‘Đánh giá trạng sản xuất giống xây dựng giải pháp quản lý nhằm nâng cao chất lượng giống cá tra Đồng sông Cửu Long’ Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II, 105 trang Trịnh Quốc Trọng, Nguyễn Thanh Vũ, Ngô Hồng Ngân, Nguyễn Huỳnh Duy, Nguyễn Thị Đang, Trần Hữu Phúc, Phạm Đăng Khoa, 2016 Chọn giống cá tra kháng bệnh gan thận mủ Báo cáo tổng kết đề tài trọng điểm cấp Nhà nước thuộc Chương trình KC06, Bộ Khoa học Cơng nghệ Tài liệu tiếng Anh Bijma, P (2000) Long-term Genetic Contributions Prediction of Rates of Inbreeding and Genetic Gain in Selected Populations, Wageningen University PhD Dissertation Falconer, D S and T F C Mackay (1996) Introduction to quantitative genetics Harlow, Longman Gjedrem, T (2005) Selection and breeding programs in aquaculture, Springer Henderson, C R (1984) Applications of Linear Models in Animal Breeding University of Guelph, Guelph, Canada Sargolzaei, M and F Schenkel (2013) “QMSim User’s Guide Version 1.10.” Centre for Genetic Improvement of Livestock, Department of Animal and Poultry Science, University of Guelph, Guelph, Canada Sonesson, A K., et al (2005) Kinship, relationship and inbreeding Selection and breeding programs in aquaculture T Gjedrem P.O Box 17, 3300 AA Dordrecht, The Netherlands, Springer: 364 Van Sang, N., et al (2007) “Selective breeding for growth and fillet yield of river catfish Pangasianodon hypophthalmus in the Mekong Delta, Vietnam.” Aquaculture Asia 12(2): 26 VASEP (2018) “VIETNAM ASSOCIATION OF SEAFOOD EXPORTERS AND PRODUCERS (VASEP) http://seafood.vasep.com.vn/ seafood/51_12505/vietnam-pangasius-exportsin-2017-totaled-us178-billion.htm” Wray, N R and R Thompson (1990) “Prediction of rates of inbreeding in selected populations.” Genetical Research 55(1): 41-54 Yáñez, J M., et al (2014) “Inbreeding and effective population size in a coho salmon (Oncorhynchus kisutch) breeding nucleus in Chile.” Aquaculture 420–421, Supplement 1: S15-S19 TẠP CHÍ NGHỀ CÁ SÔNG CỬU LONG - SỐ 11 - THÁNG 7/2018 VIỆN NGHIÊN CỨU NUÔI TRỒNG THỦY SẢN II USING SIMULATION TO OPTIMISE MATING PROPORTION, SELECTION RESPONSE AND INBREEDING COEFFICIENCY BETWEEN MULTIPLE RECENT TRA CATFISH (Pangasianodon hypophthalmus) YEAR-CLASSES Nguyen Van Sang1*, Trinh Quoc Trong1, Nguyen Thanh Vu1 ABSTRACT On Tra catfish, selective breeding program initiated with three base populations (G0-2001, G0-2002 and G0-2003 with number of according families were 75, 79 and 101) which were produced from brooders of four hatcheries in Mekong Delta We have reached three generations of selection The aim of this study was to dertemine internal and external mating proportion (number of brooder use in each year-class) between multiple recent year-classes (G2-2002, G2-2003 and G3-2001) to establish a unique population and use this to merge with the most recent year-class (G3-2002) which was yet enough maturation to participate the former While mating percentage of year-class G3-2001 ranged 38.5 – 50.0%, the differences between merge populations regarded the weight, EBV and inbreeding coefficient were insignificant Mating proportion of G3-2001 of 40% gave lowest inbreeding values (0.041 – 0.043) Year-classes which undertaking longer selection should be contributed more Our results proposed mating porportions were followed by G3-2001 (40%), G2-2002 (35%) G2-2003 (25%) The percentage of G3-2002 was small (5 – 10%) for subsequent nesting to merged population according to its minor contribution Keywords: Tra catfish, simulation, weight, EBV, inbreeding coefficent Người phản biện: ThS Trần Hữu Phúc Ngày nhận bài: 20/6/2018 Ngày thông qua phản biện: 30/6/2018 Ngày duyệt đăng: 10/7/2018 * Research Institute for Aquaculture No.2 Email: nguyenvansang1973@yahoo.com TẠP CHÍ NGHỀ CÁ SƠNG CỬU LONG - SỐ 11 - THÁNG 7/2018 ... lượng, EBV tỉ lệ cận huyết quần thể tích hợp G3 khơng khác biệt lớn Khi tỉ lệ đóng góp quần thể G3-2001 40% tỉ lệ cận huyết thấp (0,041 – 0,043) Quần thể chọn lọc qua nhiều hệ nên có tỉ lệ đóng... đầu vào hệ số di truyền, phương sai kiểu hình, số lượng cá thể chọn lọc, số lượng cá cá mẹ/gia đình ước tính từ quần thể chọn giống thực tế Bốn quần thể quần thể ban đầu G0 quần thể chọn giống. .. thông tin cá thể họ hàng, gia tăng độ xác EBV Chọn lọc dựa EBV (tức chọn cá thể có EBV cao quần thể) phương pháp chuẩn chọn giống Chọn lọc theo EBV đem lại hiệu cao gia tăng tỉ lệ cận huyết, có