Phân tích đa dạng di truyền 100 mẫu giống điều (Anacardium occidentale L.) được tuyển chọn trên địa bàn tỉnh Bình Phước dựa trên năng suất hạt và chỉ thị sinh học phân tử ISSR

11 37 0
Phân tích đa dạng di truyền 100 mẫu giống điều (Anacardium occidentale L.) được tuyển chọn trên địa bàn tỉnh Bình Phước dựa trên năng suất hạt và chỉ thị sinh học phân tử ISSR

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

Nội dung bài viết trình bày nghiên cứu này là một trong những thông tin rất quan trọng trong công tác đánh giá di truyền trên cây điều và hữu ích cho công tác chọn tạo và phát triển giống điều trong tương lai. Mời các bạn tham khảo chi tiết nội dung bài viết này.

17 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Analysis of genetic diversity of 100 cashew (Anacardium occidentale L.) cultivars screened in Binh Phuoc based on nut yield and ISSR markers Toan D Pham1∗ , Duc M Tran2 , Thu T Nguyen1 , & Tri M Bui3 Research Institute of Biotechnology and Environment, Nong Lam University, Ho Chi Minh City, Vietnam Binh Phuoc High-Tech Agriculture Research Center, Binh Phuoc, Vietnam Faculty of Agronomy, Nong Lam University, Ho Chi Minh City, Ho Chi Minh City, Vietnam ARTICLE INFO ABSTRACT Research Paper Cashew (Anacardium occidentale L.) is an important tropical tree, belonging to Anacardiaceae family and has high economic value growing in Vietnam The objective of this study was to assess genetic diversity of cashew distributed in Binh Phuoc province for breeding development and conservation A total of 100 cashew samples of over 10 years age distributed in Binh Phuoc province were divided into eight main groups based on nut yield In contrast, the cluster analysis was divided 100 cashew samples into 12 groups based on 11 ISSR markers The genetic diversity of 100 cashew samples ranged from 0.04 to 0.26, with a mean of 0.19 The results showed that cashew samples were high levels of polymorphism based on nut yield, as well as the ISSR markers The results of this research would be one of the important information in the genetic evaluation of cashew trees and useful information for cashew breeding development in future Received: December 18, 2019 Revised: February 19, 2020 Accepted: April 21, 2020 Keywords Cashew variety Conservation Genetic diversity ISSR Plant breeding ∗ Corresponding author Pham Duc Toan Email: phamductoan@hcmuaf.edu.vn Cited as: Pham, T D., Tran, D M., Nguyen, T T., & Bui, T M (2020) Analysis of genetic diversity of 100 cashew (Anacardium occidentale L.) cultivars screened in Binh Phuoc based on nut yield and ISSR markers The Journal of Agriculture and Development 19(2), 17-27 www.jad.hcmuaf.edu.vn Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) 18 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Phân tích đa dạng di truyền 100 mẫu giống điều (Anacardium occidentale L.) tuyển chọn địa bàn tỉnh Bình Phước dựa suất hạt thị sinh học phân tử ISSR Phạm Đức Toàn1∗ , Trần Minh Đức2 , Nguyễn Thị Thu1 & Bùi Minh Trí3 Viện Nghiên Cứu Cơng Nghệ Sinh Học Môi Trường, Trường Đại Học Nông Lâm TP.HCM, TP Hồ Chí Minh Trung Tâm Nơng Nghiệp Ứng Dụng Cơng Nghệ Cao Tỉnh Bình Phước, Bình Phước Khoa Nơng Học, Trường Đại Học Nơng Lâm TP.HCM, TP Hồ Chí Minh THƠNG TIN BÀI BÁO TĨM TẮT Bài báo khoa học Cây điều (Anacardium occidentale L.) nhiệt đới quan trọng, thuộc họ Anacardiaceae có giá trị kinh tế cao trồng Việt Nam Mục đích nghiên cứu nhằm đánh giá, phân nhóm đa dạng di truyền mẫu giống điều phân bố địa bàn tỉnh Bình Phước nhằm phục vụ cho cơng tác phát triển nhân giống bảo tồn Tổng số 100 mẫu giống điều 10 năm tuổi phân bố địa bàn tỉnh Bình Phước phân chia thành nhóm dựa đặc điểm hạt suất hạt Trong đó, sử dụng 11 thị ISSR mẫu giống điều chia thành 12 nhóm riêng biệt Khoảng cách đa dạng di truyền 100 mẫu giống điều nghiên cứu từ 0,04 đến 0,26, với giá trị trung bình khoản cách đa dạng di truyền 0,19 Kết thể mẫu giống điều có mức đa hình tương đối cao dựa đặc điểm hạt suất hạt, thị ISSR Kết nghiên cứu thông tin quan trọng công tác đánh giá di truyền điều hữu ích cho công tác chọn tạo phát triển giống điều tương lai Ngày nhận: 18/12/2019 Ngày chỉnh sửa: 19/02/2020 Ngày chấp nhận: 21/04/2020 Từ khóa Bảo tồn Đa dạng di truyền Giống điều ISSR Nhân giống ∗ Tác giả liên hệ Phạm Đức Toàn Email: phamductoan@hcmuaf.edu.vn Đặt Vấn Đề Cây điều (Anacardium occidentale L.) nhiệt đới lấy hạt quan trọng, thuộc họ Anacardiaceae có nguồn gốc tự nhiên quốc gia Nam Mỹ Bolivia, Brazil, Peru Tây Ấn Độ (Nakasone & Paull, 1998; Samal & ctv., 2003) Trong họ Anacardiaceae bao gồm 75 chi (genera) 700 loài (species) (Nakasone & Paull, 1998) Trong đó, điều (A occidentale) có khả chịu hạn, sinh trưởng tốt loại đất đồi dốc có giá trị kinh tế giúp ổn định đời sống người nghèo (Aliyu, 2012) Bình Phước địa phương có điều kiện thổ nhưỡng thích hợp cho điều phát triển với diện tích sản lượng vượt trội địa phương khác nước Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) Việc trồng điều mang ý nghĩa chiến lược khơng tận dụng địa hình đồi dốc mà cải thiện đời sống cho người dân xuất mang lại ngoại tệ cao Tuy nhiên, trình phát triển điều Việt Nam nói chung Đơng Nam Bộ nói riêng gặp nhiều khó khăn chưa ổn định Nguyên nhân chủ yếu trở ngại giống điều trồng sản xuất chưa phù hợp với điều kiện tự nhiên, tiêu chuẩn hạt chưa phù hợp với yêu cầu chế biến, chịu tác động mạnh yếu tố khí hậu thời tiết khơng thuận lợi Mặc dù có nhiều đơn vị nước tiến hành tuyển chọn cải tiến giống điều để đưa vào sản xuất suất thấp nhiều khuyết điểm áp dụng vào sản suất Mục đích nghiên cứu nhằm đánh giá, www.jad.hcmuaf.edu.vn Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh 19 phân nhóm đa dạng di truyền mẫu giống Kết Quả Thảo Luận điều phân bố địa bàn tỉnh Bình Phước dựa tiêu suất hạt, số hạt khô/kg 3.1 Khảo sát tiêu hạt suất hạt giống điều tỉnh Bình Phước thị sinh học phân tử ISSR, nhằm phục phục vụ cho công tác phát triển nhân giống bảo tồn Trong tổng số 100 mẫu giống điều 10 năm tuổi khảo sát tiêu suất hạt Vật Liệu Phương Pháp Nghiên Cứu số hạt khô/kg Kết ghi nhận cho thấy suất hạt mẫu giống điều dao động 2.1 Khảo sát tiêu hạt, suất hạt li từ 30 – 100 kg/cây/năm, suất trung bình trích DNA dùng cho phản ứng PCR-ISSR 47 kg/cây/năm Số hạt khô/kg mẫu giống điều có mức dao động từ 109 – 224 hạt/kg, Tổng số 100 mẫu giống điều 10 năm tuổi trung bình 156 hạt khơ/kg (Bảng 1) phân bố địa bàn tỉnh Bình Phước khảo sát đánh giá tiêu suất hạt số hạt 3.2 Phân nhóm mẫu giống điều dựa vào đặc điểm hạt suất hạt khô/kg (Bảng 1) Mẫu 100 mẫu giống điều thu thập để li trích DNA phục vụ cho Dựa vào đặc điểm hạt suất công tác đánh giá đa dạng di truyền thị ISSR DNA mẫu giống điều li hạt/cây/năm giống điều thấy 100 trích quy trình CTAB, mẫu li trích mẫu giống điều khảo sát, thu thập phân mẫu non Phản ứng PCR-ISSR thực chia vào nhóm (Bảng 2, Hình 1) Trong thể tích 25 µL bao gồm 1X MasterMix nhóm V nhóm lớn bao gồm 32 mẫu (Bioline - UK), 0,2 µM primer ISSR, µL DNA giống, nhóm mẫu giống nhóm VII (khoảng 50-100 ng/µL), nước cất khử ion vừa với mẫu giống Các nhóm đủ 25 µL Phản ứng PCR-ISSR thực thể chi tiết Bảng máy PCR (Applied Biosystems 9700) với chu trình nhiệt sau chu kỳ 94o C 3.3 Đánh giá phân nhóm di truyền 100 mẫu giống điều dựa vào thị ISSR phút; 30 chu kỳ 94o C - phút, 55o C - phút, o o 72 C - phút; chu kỳ 72 C - phút cuối Với tổng số 30 primer ISSR sử dụng để sàng lọc giữ sản phẩm PCR-ISSR 4o C lựa chọn primer đa hình phục vụ cho đánh Điện di kiểm tra sản phẩm PCR-ISSR gel giá đa hình mẫu giống điều Trong agarose với nồng độ 1,5% Sau điện di, gel sàng lọc 11 primer ISSR cho cho sản phẩm chụp hình máy chiếu sáng UV khuyếch đại đa hình tốt, tỉ lệ băng đa hình cao Để ước lượng kích thước trình tự đoạn DNA lựa chọn sử dụng cho đánh giá khuếch đại gel agarose, dùng thang chuẩn đa hình di truyền điều Tổng số sản phẩm ladder Kb DNA (Bioline – UK) khuếch đại từ 11 ISSR primer 113 band, đạt trung bình 10,3 band/primer, kích thước band từ 200 2.2 Phân nhóm di truyền - 3000 bp (Bảng 3) Tổng số đoạn khuếch đại đa hình 101 band, trung bình 9,2 band/primer, tỉ Sử dụng phần mềm MiniTab 16.0 để đánh giá lệ band đa hình 88,3% Primer cho nhiều đoạn phân nhóm di truyền 100 mẫu giống khuếch đại primer UBC841 (13 band) dựa vào tiêu suất hạt số hạt/kg Đối số đoạn đa hình đạt 13 band, đạt với thị ISSR, từ kết điện di sản phẩm tỉ lệ 100% band đa hình Primer có số band thấp PCR - ISSR, tiến hành xác định mức độ đa hình UBC808 (7 band), tất mẫu cách so sánh phân đoạn band đa hình, tỉ lệ đạt 100% Trong 11 primer DNA Các phân đoạn DNA ghi nhận: lựa chọn, tỉ lệ đoạn khuếch đại đa hình xuất band sản phẩm điện di thấp primer UBC888, với tỉ lệ đa hình kích thước kí hiệu 1, khơng xuất kí 60% (6/10 band đa hình) Các primer cho đa hình hiệu Các số liệu xử lí phân tích tuyệt đối 100% bao gồm primer sau UBC808, phần mềm NTSYSpc 2.1 (Numerial TaxonUBC841, UBC873, UBC880, UBC855 (Hình 2) omy System) để tìm mối liên quan Nhìn chung tất primer ISSR chọn sử đối tượng nghiên cứu thơng qua hệ số đa hình di dụng cho nghiên cứu điều có mức độ đa hình truyền biểu đồ hình phân nhóm www.jad.hcmuaf.edu.vn Tạp chí Nông nghiệp Phát triển 19(2) 20 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Bảng Kết khảo sát tiêu suất hạt số hạt khô/kg 100 mẫu giống điều STT Mã số mẫu giống 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 MD1 MD2 MD3 MD4 MD5 MD6 MD7 MD8 MD9 MD10 MD11 MD12 MD13 MD14 MD15 MD16 MD17 MD18 MD19 MD20 MD21 MD22 MD23 MD24 MD25 MD26 MD27 MD28 MD29 MD30 MD31 MD32 MD33 MD34 MD35 MD36 MD37 MD38 MD39 MD40 MD41 MD42 MD43 MD44 MD45 Địa điểm thu thập mẫu Ấp 8, Tiến thành, Đồng Xoài ẤP 4, Tiến Hưng, Đồng Xoài ẤP 4, Tiến Hưng, Đồng Xoài Ấp 1, xã Đồng Tâm - Đồng Phú Ấp 1, xã Đồng Tâm - Đồng Phú Phú Thành - Phú Riềng -Bù Gia Mập Phú Thành- Phú Riềng - Bù Gia Mập Ấp Minh Tân - Tân Tiến - Đồng Phú Ấp Minh Tân - Tân Tiến- Đồng Phú Ấp Minh Tân - Tân Tiến - Đồng Phú Ấp Thuận Phú- Thuận Phú - Đồng Phú Ấp Thuận Phú - Thuận Phú - Đồng Phú Thôn 7, xã Bình Minh - Bù Đăng Thơn 7, xã Bình Minh - Bù Đăng Thơn Đồng Tiến - Phước Tân - Bù Gia Mập Thôn Đồng Tiến - Phước Tân - Bù Gia Mập Thôn 10 TN, Bù Đăng Thôn 10 TN, Bù Đăng Thôn 10 TN, Bù Đăng Thôn 10 TN, Bù Đăng Thôn 10 TN, Bù Đăng Thôn TN, Bù Đăng Đức Liễu, Bù Đăng Đức Liễu, Bù Đăng Đức Liễu, Bù Đăng Ấp Tân Lập, xã Phú Nghĩa, Bù Gia Mập Ấp Tân Lập, xã Phú Nghĩa, Bù Gia Mập Ấp da, xã Phú Văn - Bù Gia Mập Ấp Cây Da, xã Phú Văn - Bù Gia Mập Ấp Cây Da, xã Phú Văn, Bù Gia Mập Thôn - ĐakƠ - Bù Gia Mập Thôn - ĐakƠ - Bù Gia Mập Thôn - ĐakƠ-BGM Ấp 7, xã Bom Bo - Bù Gia Mập Thơn 7, xã Bình Minh - Bù Đăng Ấp 7, xã Bom Bo - Bù Gia Mập Phước Tân - Phước Tân - Bù Gia Mập Phước Tân - Phước Tân - Bù Gia Mập Thôn 2- Long Bình - Bù Gia Mập Thơn Đakon - Bù Gia Mập Thôn Đakon, Bù Gia Mập Thôn Đakon, Bù Gia Mập Thôn Đakon, Bù Gia Mập Tổ - phường Thác Mơ, Phước Long Tổ - phường Thác Mơ, Phước Long Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) Năng suất kg/cây/năm Số hạt khô/kg 50 40 50 30 35 70 50 100 70 70 90 60 70 50 60 50 60 45 55 62 50 60 50 50 55 30 52 45 50 45 50 55 60 55 60 55 55 45 55 45 48 50 50 30 40 121 159 160 130 165 170 133 174 173 175 190 172 159 164 170 155 156 196 180 144 188 149 224 156 140 196 141 124 175 145 170 168 186 221 208 188 116 120 160 145 135 148 140 155 185 www.jad.hcmuaf.edu.vn 21 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Bảng Kết khảo sát tiêu suất hạt số hạt khô/kg 100 mẫu giống điều (tiếp theo trang 20) STT Mã số mẫu giống 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 MD46 MD47 MD48 MD49 MD50 MD51 MD52 MD53 MD54 MD55 MD56 MD57 MD58 MD59 MD60 MD61 MD62 MD63 MD64 MD65 MD66 MD67 MD68 MD69 MD70 MD71 MD72 MD73 MD74 MD75 MD76 MD77 MD78 MD79 MD80 MD81 MD82 MD83 MD84 MD85 MD86 MD87 MD88 MD89 MD90 MD91 MD92 www.jad.hcmuaf.edu.vn Địa điểm thu thập mẫu Ấp 10, xã Long Hà - Bù Gia Mập Ấp 10, xã Long Hưng - Bù Gia Mập Ấp 7, xã Bình Minh - Bù Đăng Ấp 7, xã Bom Bo - Bù Gia Mập Thôn - Phú Nghĩa - Bù Gia Mập Thôn - Phú Nghĩa - Bù Gia Mập Thôn - Phú Nghĩa - Bù Gia Mập Tân Phước - Đồng Phú Tân Phước - Đồng Phú Tân Phước - Đồng Phú Tân Phước - Đồng Phú Tân Phước - Đồng Phú Tân Phước - Đồng Phú Tân Phước - Đồng Phú Tân Phước - Đồng Phú Tân Phước - Đồng Phú Minh Lập - Chơn Thành Minh Lập - Chơn Thành Minh Lập - Chơn Thành Ấp - Tân Lập - Đồng Phú Thơng 10 - Long Bình - Phú Riềng Thơn 8- Long Hà, Phú Riềng Thôn 8- Long Hà, Phú Riềng Thơn 10- Long Bình- Phú Riềng Thanh Phú - Bình Long Thanh Phú - Bình Long Tổ - Bù Anh - Thanh An Tổ - Bù Anh - Thanh An Tổ - Ấp Trung Sơn - Thanh An Tổ - An Sơn - Thanh An Vườn bảo tồn thuộc Ban quản lý khu Nông nghiệp Ứng dụng Cơng nghệ cao tỉnh Bình Phước Ấp - Tân Thành - Đồng Xồi - Bình Phước Năng suất kg/cây/năm Số hạt khô/kg 70 30 40 50 50 60 55 50 35 40 45 40 55 40 40 52 70 60 40 40 45 70 60 40 40 40 50 40 50 40 30 35 30 40 30 30 40 40 35 35 40 30 40 45 35 30 50 176 164 150 140 131 154 164 145 124 146 120 140 109 100 148 144 120 124 122 170 198 133 124 173 150 150 145 155 170 175 160 140 145 160 165 155 170 140 150 165 170 140 135 145 145 150 160 Tạp chí Nông nghiệp Phát triển 19(2) 22 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Bảng Kết khảo sát tiêu suất hạt số hạt khô/kg 100 mẫu giống điều (tiếp theo trang 21) STT Mã số mẫu giống 93 94 95 96 97 98 99 100 Cao Trung bình Thấp MD93 MD94 MD95 MD96 MD97 MD98 MD99 MD100 Năng suất kg/cây/năm 50 40 30 30 35 30 30 35 100 30 47 Địa điểm thu thập mẫu Vườn bảo tồn thuộc Ban quản lý khu Nông nghiệp Ứng dụng Công nghệ cao tỉnh Bình Phước Ấp - Tân Thành - Đồng Xồi - Bình Phước Số hạt khơ/kg 175 170 140 135 140 160 160 156 244 109 156 MD: Mẫu điều Bảng Phân nhóm mẫu giống điều dựa vào đặc điểm hạt suất hạt Nhóm I II III IV V VI VII VIII Tên mẫu giống (MD) 35, 34,23 33, 36, 21, 19, 26, 45, 66, 18 11, 46, 10, 9, 6, 22, 50, 51, 17, 13, 74, 31, 93, 29, 32, 15, 12, 24, 16, 52, 39, 14, 92, 61, 72, 53, 42, 89, 40, 30, 49, 43, 27, 25, 41, 50, 7, 91, 84, 90, 78, 60, 55, 71, 70, 48, 96, 95, 67, 97, 77, 88, 83, 57, 76, 69, 94, 86, 62, 65, 100, 61, 44, 99, 98, 76, 80, 4, 65, 5, 73, 79, 59 67, 68, 63, 58, 37, 64, 54, 56, 38, 28, Ghi mẫu trội 23 11 6, 12, 15, 24, 46 43, 70, 71, 72 62, 73 63, 64 MD: Mẫu điều Bảng Kết đánh giá đa hình 11 primer ISSR 100 mẫu giống điều Bình Phước Tên primer Trình tự primer UBC808 UBC810 UBC811 UBC825 UBC840 UBC841 UBC850 UBC855 UBC873 UBC880 UBC888 Trung bình Tổng số Biến động (AG)8C (GA)8T (GA)8C (AC)8T (GA)8YT (GA)8YC (GT)8YC (AC)8YT (GACA)4 (GGAGA)3 BDB(CA)7 Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) Tổng số band khuếch đại Tổng số band đa hình Tỷ lệ đa hình (%) 11 11 13 12 12 11 10 10,3 113 - 13 10 10 13 12 12 11 9,2 101 - 12 100 89 91 63 91 100 78 100 100 100 60 88,3 63 - 100 Kích thước đoạn khuếch đại (bp) 200 - 2500 350 - 1500 250 - 3000 250 - 1700 400 - 300 350 - 3000 200 - 3000 200 - 6000 200 - 3000 300 - 3000 250 - 3000 200 - 3000 www.jad.hcmuaf.edu.vn 23 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Hình Kết phân nhóm 100 mẫu giống điều dựa vào tiêu hạt suất hạt www.jad.hcmuaf.edu.vn Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) 24 Trường Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh Bảng Kết phân nhóm di truyền 100 mẫu giống điều dựa thị ISSR Nhóm I II III IV V VI VII VIII IX X XI XII Tên mẫu giống MD (mẫu điều) 1, 4, 15, 24, 26, 27, 17, 35, 34, 7, 30, 21, 23, 6, 8, 10, 12, 11, 42, 16, 32, 38, 41, 47, 44, 45, 46, 19, 29, 18, 20, 43, 25, 28, 66, 63, 64, 66, 9, 52, 54, 37, 35, 13, 31, 33, 62, 65, 40, 48, 49, 51 14, 22, 61, 55, 56, 36 2, 72 39, 50, 73 67, 71 59 76, 77, 78, 79, 81, 85, 86, 82,83, 84, 87, 88, 80, 89, 90, 92, 98, 96, 95, 93, 94, 91, 97, 99, 100 74, 75 53 57, 58 60, 69 70 Ghi (Các mẫu giống trội) 15, 24, 7, 23, 6, 12,11, 46, 43, 63, 64, 62 72 73 71 Bộ sưu tập giống, trồng Ban quản lý khu Nơng nghiệp Ứng dụng Cơng nghệ cao tỉnh Bình Phước 74, 75 70 MD: Mẫu điều; số theo sau ký hiệu số mẫu theo thứ tự từ - 100, Hình Sản phẩm khuếch đại mẫu giống điều với primer UBC855 M: thang chuẩn 1kb DNA, mẫu lại mẫu điều theo số thứ tự (MD: Mẫu điều; số theo sau số thứ tự 100 mẫu giống điều, số 1) Dấu mũi tên vài vị trí đại diện đa hình cao, dao động từ 60 - 100%, đáp ứng đầy đủ 88,3%, kết phù hợp với báo tin cậy cao phân tích đa hình di truyền cáo tác giả Santhosh & ctv (2009) 100 điều mẫu giống điều sử dụng 10 thị ISSR thu Kết nghiên cứu cho thấy 67 đoạn khuếch đại, có 58 đoạn thị ISSR hiệu sử dụng phân tích đa hình, chiếm tỉ lệ 86,6% Tương tự, báo cáo đa dạng di truyền điều Với mức độ đa hình Dasmohapatra & ctv (2014) 11 thị ISSR 100 mẫu giống điều phân tích đa dạng di truyền 25 mẫu Tạp chí Nông nghiệp Phát triển 19(2) www.jad.hcmuaf.edu.vn 25 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Hình Cây phân nhóm di truyền 100 mẫu giống điều dựa 11 thị ISSR www.jad.hcmuaf.edu.vn Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) 26 giống điều phục tráng Ấn Độ 14 thị ISSR thu tổng số 116 đoạn khuếch đại, có 104 đoạn đa hình, chiếm tỉ lệ 89,65% So sánh kết nghiên cứu với loại trồng khác cho thấy mức độ đa hình 11 thị ISSR điều tương đối phù hợp với nghiên cứu Bharathi & ctv (2012) dùng 12 primer ISSR khảo sát loài trồng thuộc chi Momordica kết đạt tỉ lệ band đa hình 93,2% Cũng báo cáo Bharathi & ctv (2012) dùng 21 primer RAPD kết đạt tỉ lệ băng đa hình 92,6% Tương tự, nghiên cứu Rasul & ctv (2007) sử dụng 44 primer RAPD 39 mẫu giống khổ qua hoang dại (Momordica dioica) mẫu gấc có kết 95% band đa hình Dey & ctv (2006) sử dụng 29 primer RAPD khảo sát đa dạng di truyền 38 mẫu giống khổ qua kết số đoạn đa hình chiếm tỷ lệ 36,5% Tỉ lệ đoạn đa hình primer ISSR nghiên cứu điều thể cao hiều so với nghiên cứu công bố trồng khác dó bầu (Vu & ctv., 2014) dùng 12 primer ISSR kết đạt 78,98% band đa hình; Anil & ctv (2015) dùng 20 primer ISSR khảo sát 22 mẫu giống dưa gang (Cucumis melo var momordica) thuộc họ Cucurbitaceae Ấn Độ kết đạt 58,38% band đa hình Tương tự Verma & ctv (2015) báo cáo nghệ dùng 13 primer ISSR có có 82% band đa hình; Bharathi & ctv (2012) dùng 12 primer ISSR khảo sát 11 mẫu giống khổ qua kết đạt 67,5% band đa hình 3.4 Kết phân nhóm di truyền mẫu giống điều dựa thị ISSR Sự phân nhóm di truyền 100 mẫu giống điều Bình Phước dao động từ 0,4 đến 0,26, mẫu giống điều phân chia vào 12 nhóm chính, giá trị trung bình khoảng cách đa hình di truyền 0,19 (số liệu từ NTSYSpc2.1 – Hình 3) Trong đó, nhóm lớn nhóm I, nhóm tập hợp nhiều mẫu giống (52 mẫu giống) với mẫu giống đánh giá có tiềm suất MD15, 24, 7, 23, 6, 12,11, 46, 43, 63, 64, 62 (Bảng 4, Hình 3) Nhóm lớn thứ nhì nhóm VII, tập hợp gồm 25 mẫu giống, điều thú 25 mẫu giống đánh giá giống giàu triển vọng, thu thập trồng lưu giữ Vườn sưu tập giống Ban quản lý khu nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao tỉnh Bình Phước (Bảng 4, Hình Các Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh nhóm cịn lại bao gồm từ - mẫu giống, nhóm III, VI, XII mẫu giống Kết Luận Dựa vào phân nhóm di truyền cho thấy 100 mẫu giống điều có tính đa dạng di truyền cao chia làm nhóm dựa vào hai đặc điểm suất hạt số hạt khơ/kg Trong đó, sử dụng 11 thị ISSR mẫu giống điều chia thành 12 nhóm riêng biệt, khoảng cách đa dạng di truyền từ 0,04 đến 0,26, với giá trị trung bình khoảng cách đa dạng di truyền 0,19 Kết nghiên cứu nguồn thơng tin hữu ích công tác đánh giá di truyền điều phục vụ cho công tác chọn tạo phát triển giống điều tương lai Lời Cảm Ơn Nhóm tác giả gởi lời cảm ơn chân thành đến Sở KHCN tỉnh Bình Phước cấp kinh phí thực nghiên cứu này, cảm ơn tới đồng nghiệp địa phương nơi thu thập thập mẫu, đồng nghiệp Ban quản lý Khu Nông nghiệp Ứng dụng Cơng nghệ cao tỉnh Bình Phước, Trường Đại học Nơng Lâm Thành phố Hồ Chí Minh hỗ trợ hoàn thành nghiên cứu Tài Liệu Tham Khảo (References) Aliyu, O M (2012) Genetic diversity of Nigerian cashew germplasm In Mahmut Cahskan (Ed.) Genetic diversity in plants Rijeka, Croatia: In Tech Anil, K S., Sanjeev, K., Hemant, S., Ved, P R., Brahma, D S., & Sudhakar, P (2015) Genetic diversity in Indian Snap melon (Cucumis melo var momordica) accessions revealed by ISSR markers Plant Omics Journal (1), 9-16 Bharathi, S K., Parida, A D., Munshi, T K., Behera, K V., & Raman, T (2012) Molecular diversity and phenetic relationship of Momordica spp of Indian occurrence Genetic Resources Crop Evolution 59, 937948 Dasmohapatra, R., Rath, S., Pradhan, B., & Rout, G R (2014) Molecular and agro-morphological assessment of cashew (Anacardium occidentale L.) genotypes of India Journal of Applied Horticulture 16(3), 215-221 Dey, S S., Singh, A K., Chandel, D., & Behera, T K (2006) Genetic diversity of bitter gourd (Momordica charantia L.) genotypes revealed by RAPD markers and agronomic traits Scientia Horticulturae 109, 2128 www.jad.hcmuaf.edu.vn Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Nakasone, H Y., & Paull, R E (1998) Tropical fruits Oxford, UK: CAB International Rasul, M G., Hiramatsu, M., & Okubo, H (2007) Genetic relatedness (diversity) and cultivar identification by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers in teasle gourd (Momordica dioica Roxb.) Scientia Horticulturae 111, 271-279 Samal, S., Rout, G R., & Lenka, P C (2003) Analysis of genetic relationships between populations of cashew by using morphological characterization and RAPD markers, Orissa, India Plant Soil & Environment 49(4), 176-182 27 Verma, S., Singh, S., Sharma, S., Tewari, S K., Roy, R K., Goel, A K., & Rana, T S (2015) Assessment of genetic diversity in indigenous turmeric (Curcuma longa) germplasm from India using molecular markers Physiology and Molecular Biology of Plants 21(2), 233242 Vu, T H., Hoang, H D., Pham, N B., & Chu, H H (2014) Genetic evaluation of Aquilaria crassna Pierre population in Vietnam using ISSR markers Journal of Technology and Sciences 30(4), 23-30 Santhosh, W G., Shobha, D., & Melwyn, G S (2009) Assessment of genetic diversity in cashew germplasm using RAPD and ISSR markers Scientia Horticulturae 120(3), 411-417 www.jad.hcmuaf.edu.vn Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) ... Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Phân tích đa dạng di truyền 100 mẫu giống điều (Anacardium occidentale L.) tuyển chọn địa bàn tỉnh Bình Phước dựa suất hạt thị sinh học phân tử ISSR Phạm... 19 phân nhóm đa dạng di truyền mẫu giống Kết Quả Thảo Luận điều phân bố địa bàn tỉnh Bình Phước dựa tiêu suất hạt, số hạt khô/kg 3.1 Khảo sát tiêu hạt suất hạt giống điều tỉnh Bình Phước thị sinh. .. giá, phân nhóm đa dạng di truyền mẫu giống điều phân bố địa bàn tỉnh Bình Phước nhằm phục vụ cho cơng tác phát triển nhân giống bảo tồn Tổng số 100 mẫu giống điều 10 năm tuổi phân bố địa bàn tỉnh

Ngày đăng: 17/11/2020, 09:20

Từ khóa liên quan

Mục lục

  • Ðt Vn Ð

  • C S Lý Lun và Phng Pháp Nghiên Cu

    • Tng quan tài liu

    • Ngun s liu

      • Phng pháp phân tích và x lý s liu

        • Kt Qua và Thao Lun

          • Mt s c im v nhân khu hoc và xã hi hoc cua h iu tra

            • Phân tích các yu t anh hng n kha nang tham gia thng mai công bng cua nông h trong san xut cà phê

              • Nhn thc cua nông h v li ích cua thng mai công bng trong canh tác cà phê

              • Mô hình hi quy các yu t anh hng n kha nang tham gia thng mai công bng trong san xut cà phê

              • Ð xut mt s giai pháp nhm nâng cao kha nang tham gia liên kt

              • Kt Lun

              • Ðt Vn Ð

              • C S Lý Lun và Phng Pháp Nghiên Cu

                • C s lý thuyt

                • Phng pháp nghiên cu

                  • Kt Qua và Thao Lun

                    • Mu nghiên cu

                      • Kim inh thang o

                        • Kim inh mô hình nghiên cu và các gia thuyt

                        • Kt Lun

                        • Ðt Vn Ð

                        • Vt Liu và Phng Pháp Nghiên Cu

                          • Khao sát chi tiêu hat, nang sut hat và li trích DNA dùng cho phan ng PCR-ISSR

                          • Phân nhóm di truyn

                            • Kt Qua và Thao Lun

                              • Khao sát chi tiêu v hat và nang sut hat cua các ging iu tai tinh Bình Phc

                                • Phân nhóm các mu ging iu da vào c im hat và nang sut hat

                                  • Ðánh giá s phân nhóm di truyn cua 100 mu ging iu da vào chi thi ISSR

                                  • Kt qua phân nhóm di truyn cua các mu ging iu da trên chi thi ISSR

                                    • Kt Lun

                                    • Ðt Vn Ð

                                    • Vt Liu và Phng Pháp Nghiên Cu

                                      • Thi gian và ia im nghiên cu

                                      • Phng pháp nghiên cu

                                        • B trí thí nghim

                                        • Khu phn thc an hng ngày và phng pháp cho an

                                        • Phng pháp thu thp và phân tích mu

                                        • Các chi tiêu theo dõi

                                          • Phng pháp x lý s liu

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan