Đồ án công nghệ ( Khoa Hóa) ĐHBK Đà Nẵng ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Mục lục DANH SÁCH CÁC BẢNG, HÌNH VẼ .1 MỞ ĐẦU Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Covid-19 1.1.1 Nguồn gốc, phát .3 1.1.2 Đặc điểm cấu tạo 1.1.3 Đặc điểm dịch tể 1.1.4 Thống kê số liệu Covid-19 1.2 Sự thay đổi sau dịch mã 1.2.1 Định nghĩa dịch mã .6 1.2.3 Vai trò protein .7 1.2.4 Điều khiển sau dịch mã .8 1.2.5 Các cách nghiên cứu thay đổi sau dịch mã 11 1.2.6 Các công cụ tin sinh học nghiên cứu thay đổi sau dịch mã 11 1.2.7 Ý nghĩa việc nghiên cứu thay đổi sau dịch mã 12 CHƯƠNG 2: ỨNG DỤNG TIN SINH HỌC TÌM KIẾM THAY ĐỔI SAU DỊCH MÃ 13 2.1 Vật liệu 13 2.1.1 Trình tự protein 13 2.1.2 Công cụ .13 2.2 Phương pháp tìm kiếm .13 2.2.1 Phương pháp tìm kiếm Fatty Acylation .13 2.2.2 Phương pháp tìm kiếm Phosphorylation 21 2.2.2 Phương pháp tìm kiếm Glycosylation .26 KẾT LUẬN .27 TÀI LIỆU THAM KHẢO 28 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 DANH SÁCH CÁC BẢNG, HÌNH VẼ Hình 1.1 Các triệu chứng 2019 – nCoV Hình 1.2 Biểu đồ thể tổng số ca nhiễm, số ca khỏi bệnh điều trị Hình 1.3 10 quốc gia vùng lãnh thổ ghi nhận nhiều trường hợp nhiễm bệnh Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 MỞ ĐẦU Protein thành phần thiết yếu thể sinh vật, tham gia vào trinh bên tế bào Tuy nhiên vai trò protein chưa thực thể sau trinh dịch mã Các thay đổi sau dịch mã protein đóng vai trò quan trọng việc xác định chức cụ thể cho loại protein khác Nghiên cứu sau dịch mã chủ yếu tập trung công cụ tin sinh học Tin sinh học cung cấp cơng cụ cho phép phân tích, tìm kiểm thay đổi sau dịch mã protein cách hiệu quả, nhanh chóng, đặc biệt với protein khó tiếp cận protein covid 19 Hiện phải hết minh nổ lực chống lại đại dịch toàn cầu virus Covid-19 gây Vì vậy, việc xác định thay đổi protein sau dịch mã virus Covid-19 đóng vai trị quan trọng nghiên cứu cách thức hoạt động điều trị bệnh virus gây Trong tập đồ án này, tơi trình bày tổng quan tình hình dịch bệnh covid gây, ra, vần đề lí thuyết biến đổi sau dich mã Đồng thời, kết tìm kiếm thay đổi sau dich mã protein từ covid công cụ tin sinh học thể Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Covid-19 1.1.1 Nguồn gốc, phát Dịch bệnh virus Covid-19 gây bắt đầu xuất từ cuối tháng 12 năm 2019, ghi nhận thành phố Vũ Hán, thuộc tỉnh Hồ Bắc, miền nam Trung Quốc Nguyên nhân ban đầu cho giết hại lồi đơng vật hoang dã, mà cụ thể dơ chợ hải sản Hoa Nam Tuy nhiên, đến nguồn gốc loại virus gây tranh cãi Virus Covid-19 chủng thứ bảy họ Coronavirus, biết đến chủ yếu gây bệnh động vật, tiến hóa lây nhiễm sang người [1] 1.1.2 Đặc điểm cấu tạo Coronavirus nhóm gồm loại virus thuộc phân họ Coronavirinae họ Coronaviridae, theo Nidovirales Coronavirus gây bệnh loài động vật có vú, bao gồm người chim Phân họ Coronavirus phân loại thành bốn chi: Alpha, Beta, Gamma Delta Coronavirus Nhìn chung, Alphacoronaviruses Betacoronaviruses lây nhiễm cho động vật có vú Gammacoronaviruses Deltacoronaviruses lây nhiễm cho chim, số chúng lây nhiễm động vật có vú Các Coronavirus RNA virus có kích thước trung binh, có tên bắt nguồn từ hình dạng giống vương miện đặc trưng chúng (Corona tiếng La tinh nghĩa vương miện) Những virus có gen lớn biết đến họ RNA virus, với chiều dài từ 27 đến 32kb Bộ gen cấu trúc gồm loại protein cấu trúc: S, M, N, HE, E - Protein spike (S) tạo thành gai đặc trưng “vương miện” coronavirus Nó bị glycosyl hóa mạnh, tạo thành homotrimer, receptor giúp gắn hợp với màng tế bào vật chủ Các thành phần protein S kháng nguyên kích thích kháng thể trung hòa, mục tiêu quan trọng tế bào lympho gây độc tế bào - Protein M đóng vai trị quan trọng lắp ráp virus - Protein nucleocapsid (N) liên kết với gen RNA để tạo thành nucleocapsid Nó tham gia vào q trình điều hịa tổng hợp RNA virus tương tác với protein M trình nảy chồi virus Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 - Protein nucleocapsid (N) liên kết với gen RNA để tạo thành nucleocapsid Nó tham gia vào q trình điều hịa tổng hợp RNA virus tương tác với protein M q trình nảy chồi virus - Protein E: Chức khơng biết đến, mặc dù, SARSCoV, protein E với M N cần thiết để lắp ráp giải phóng virus 1.1.3 Đặc điểm dịch tể Người bị nhiễm bệnh virus Covid-19 gây thường có biểu hiện: sốt, mệt mỏi, ho khan, khó thở, suy hơ hấp dẫn đến tử vong Trong thời gian nhiễm bệnh, lượng bạch cầu máu giảm Thời gian ủ bệnh kéo dài từ đến 14 ngày trước biểu triệu chứng cụ thể thông qua tiếp xúc trực tiếp với giọt bắn từ đường hô hấp người bị nhiễm bệnh gián tiếp qua tiếp xúc với chất tiết người bệnh qua đồ vật, môi trường xung quanh Miễn dịch phát triển sau bị nhiễm trùng theo thời gian Tái nhiễm phổ biến, có lẽ tạo thành đáp ứng miễn dịch yếu, biến đổi kháng ngun lồi Những đánh giá ban đầu tạp chí Bloomberg NY ngày 22/1/2020 cho thấy đa số bệnh nhân nhiễm SARS-CoV-2 tử vong nam giới tuổi trung bình nhóm bệnh nhân tử vong 72 tuổi, số có đến 83% bệnh nhân tử vong 65 tuổi Trong số bệnh nhân tử vong có tới 50% bệnh nhân mắc bệnh mạn tính kèm theo Như vậy, dựa vào thống kê có được, nói người lớn tuổi, có bệnh mạn tính, hệ miễn dịch yếu người có nguy tử vong cao bệnh Covid-19 [2] Hình 1.1 Các triệu chứng 2019 n-CoV Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 1.1.4 Thống kê số liệu Covid-19 Ca nhiễm Covid-19 Việt Nam ghi nhận vào ngày 23 tháng năm 2020 Tính đến thời điểm tại, ngày 20 tháng năm 2020 Việt Nam ghi nhận 268 ca nhiễm, điều trị khỏi bệnh 214 người, chưa ghi nhận trường hợp tử vong [1] Trong 29 tỉnh thành Việt Nam có ca nhiễm Hình 1.2 Biểu đồ thể tổng số ca nhiễm, số ca khỏi bệnh điều trị Từ ca nhiễm thành phố Vũ Hán, tỉnh Hồ Nam, Trung Quốc, số ca nhiễm Covid-19 tăng khơng kiểm sốt, tinh đến ghi nhận 2.402.076 ca nhiễm bệnh, có 623.911 ca điều trị thành cơng, nhiên có đến 165.106 người tử vong đại dịch Có 228 quốc gia vùng lãnh thổ xác nhận có ca nhiễm bệnh Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Hình 1.3 10 quốc gia vùng lãnh thổ ghi nhận nhiều trường hợp nhiễm bệnh Xác nhận Tử vong Hồi phục 2.402.0 76 165.1 06 623.9 11 Hoa Kỳ 764.177 40.591 70.172 Tây Ban Nha 198.674 21.238 77.357 Ý 178.972 23.660 47.055 Đức 145.184 4.586 83.438 vương quốc Anh 120.067 16.060 Pháp 112.606 19.718 36.578 Thổ Nhĩ Kỳ 86.306 2.107 11.976 82.747 4.632 77.084 Iran 82.211 5.118 57.023 Nga 42.853 361 3.291 Brasil 38.654 2.462 14.026 Địa điểm Tổng quốc gia vùng thổ lãnh Trung Quốc đại lục Khẳng định đại dịch Covid-19 ảnh hưởng lớn gây thiệt hại phạm vi tồn cầu Khơng ảnh hưởng nghiêm trọng đến y tế, giao dục quốc gia, khu vực mà gây thiệt hại lớn kinh tế, chinh trị, nạn phân biệt chủng tộc đẩy lên cao 1.2 Sự thay đổi sau dịch mã 1.2.1 Định nghĩa dịch mã Thông tin di truyền dịch thành trinh tự amino acid có chất hóa học kiểu liên kết khác Các sản phẩm phiên mã dịch mã mức độ khác Sản phẩm dịch mã có cấu trúc chức đa dạng Protein không bên vững bị phá hủy sau thời gian định Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Hệ thống thông tin sử dụng nhiều protein post-translational modification để chuyển thông tin suốt lộ trình tín hiệu Cơ chế chất kích thích hoạt hóa thành phần A, thành phần A sau hoạt động thành phần B để tạo biến đổi cấu trúc suốt điều chỉnh Sự điều chỉnh thực chức truyền tin thơng thường chun biệt trực tiếp thay đổi cấu trúc tiểu phân amino acid protein cách sau đây: 1.2.2 Cấu trúc không gian protein Chuỗi polypeptide sau dịch mã tiếp tục biến đổi theo nhiều đường để hình thành nên hình dạng 3D kết giai đoạn cuộn gập protein (protein folding) thành cấu trúc chiều xác định lên chức Cấu trúc protein phân chia thành cấp: - Cấu trúc sơ cấp hay cấu trúc bậc 1: Là trình tự xếp gốc axit amino chuỗi polypeptide Cấu trúc giữ vững nhờ liên kết peptide (liên kết cộng hóa trị) Một protein polyamide (poliamit) - Cấu trúc bậc 2: Là tương tác không gian gốc axit amino gần chuỗi polypeptide Cấu trúc bền vững chủ yếu nhờ liên kết hiđrơ hình thành liên kết peptide kề gần nhau, cách khoảng xác định Cấu trúc bậc phân tử protein xoắn α (α-helix), phiến gấp nếp β (β-sheet) vùng chuyển hướng Bởi cấu trúc bậc mang tính cục bộ, nhiều vùng với cấu trúc bậc khác tồn phân tử protein - Cấu trúc bậc 3: hình dạng tổng thể phân tử protein đơn nhất; hay mối quan hệ không gian cấu trúc bậc với Nói chung cấu trúc bậc giữ ổn định tương tác phi cục bộ, phần lớn hình thành lõi kị nước (hydrophobic core), giữ cầu muối (salt bridge), liên kết hiđrơ, liên kết disulfide, chí chỉnh sửa sau dịch mã (post-translational modification) Thuật ngữ "cấu trúc bậc 3" thường sử dụng mang nội dung đồng nghĩa với thuật ngữ uốn gấp Cấu trúc bậc kiểm soát chức protein - Cấu trúc bậc 4: cấu trúc hình thành số phân tử protein liên kết với (chuỗi polypeptide), mà hay gặp thuật ngữ tiểu đơn vị protein trường hợp này, mà chức cấu trúc bậc hoạt động phức hợp protein 1.2.3 Vai trò protein - Protein thành phần thiết yếu thể sinh vật tham gia vào trình bên tế bào Nhiều protein enzyme làm chất xúc tác cho phản ứng hóa sinh cần thiết cho trao đổi chất - Protein có chức làm cấu trúc vận động, actin myosin protein khung tế bào, tạo nên hệ thống khung đỡ giúp trì hình dáng định tế bào - Các protein khác tham gia vào tín hiệu tế bào, đáp ứng miễn dịch, kết dính tế bào, chu kỳ tế bào, điều hòa hoat động sinh lý Hormone insulin glucagon Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 tế bào đảo tụy (beta cell) thuộc tuyến tụy tiết có tác dụng điều hịa hàm lượng đường glucose máu động vật có xương sống - Ngồi tham gia vào trinh vận chuyển chất Ví dụ huyết sắc tố hemoglobin có chứa hồng cầu động vật có xương sống có vai trị vận chuyển oxy từ phổi theo máu ni tế bào - Bảo vệ thể chống bệnh tật - Dự trữ chất dinh dưỡng - Ở động vật, protein cần thiết phải có bữa ăn để cung cấp axit amin thiết yếu mà tổng hợp Q trình tiêu hóa làm gãy protein để sử dụng trao đổi chất 1.2.4 Điều khiển sau dịch mã Chuỗi peptide giải phóng ribosome khơng phải phân tử protein có chức sinh học, cần phải qua trình xử lý mang hoạt tính sinh học Sửa chữa chuỗi peptide bao gồm hình thành cấu trúc cao cấp, kết hợp với tiểu đơn vị, sửa đổi giá trị chung Protein sau q trình sinh tổng hợp có nhiều dạng, dạng dạng cắt sửa chữa hóa học Yếu tố ảnh hưởng đến dịch mã protein tạo thành khâu biểu gen 1, Sửa đổi hóa học dư lượng axit amin chuỗi peptide Hệ thống thông tin sử dụng nhiều protein post-translational modification để chuyển thơng tin suốt lộ trình tín hiệu Cơ chế chất kích thích hoạt hóa thành phần A, thành phần A sau hoạt động thành phần B để tạo biến đổi cấu trúc suốt điều chỉnh Sự điều chỉnh thực chức truyền tin thơng thường chun biệt trực tiếp thay đổi cấu trúc tiểu phân amino acid protein cách sau đây: - Phosphoryl hóa protein: Protein kinase phosphatase biến đổi hoạt tính protein cách gắn loại bỏ góc phosphate Tế bào biểu lượng khổng lồ protein kinase đáp ứng cho thành phần tín hiệu chế truyền tin Trong vài trường hợp, kinase phosphoryl hóa lẫn để tạo dịng thác tín hiệu Ví dụ kinh điển cho trường hợp lộ trình tín hiệu MAPK Các kinase chia thành hai nhóm phụ thuộc vào tiểu phân amino acid phosphoryl hóa gồm có: Tyrosine kinase serine/threonine kinase Những kinase có nhiều hình dạng khác thành phần chức thiếu thụ thể màng tế bào Ngồi ra, kinase khơng phụ thuộc thụ thể có tác dụng nhiều vùng khác tế bào Các kinase trở thành yếu tố khởi phát cho lộ trình tín hiệu thụ thể tyrosine kinase serine/threonine kinase Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 20 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Dự đốn trình tự nucletide từ 10000 đến 14999 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 21 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Dự đốn trình tự nucletide từ 15000 đến 19999 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 22 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Dự đốn trình tự nucleotide từ 20000 đến 24999 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 23 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Dự đốn trình tự nucleotide từ 25000 đến 29999 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 24 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 25 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 2.2.2 Phương pháp tìm kiếm Phosphorylation Sử dụng phần mềm Netphos 2.2.2.1 Các bước thực i Bước 1: Truy cập phần mềm Netphos ii Bước 2: Tải trình tự nucleotide từ NCBI thành đoạn ngắn 4000 nucleotide iii Bước 3: Tải trình tự vào phần mềm Netphos để dự đoán thay đổi 2.2.2.2 Kết Kết lưu sau Bao gồm cột: Sequence - Tên trình tự # - Vị trí phần dư trình tự x - Dư lượng mã chữ Context - Bối cảnh trình tự phần dư, hiển thị dạng phần dư phần tập trung vào phần dư Score - Điểm dự đoán (một giá trị phạm vi [0,000-1,000]; điểm 0,500 cho thấy dự đốn tích cực) Kinase - kinase hoạt động chuỗi "unsp" cho dự đoán không cụ thể Answer - chuỗi "YES" cho dự đốn tích cực, khác với dấu chấm Sequence - trình tự đầu vào xử lý NetPhos, với tổng quan vị trí trang web dự đoán Graphics - âm mưu điểm số minh họa dự đoán LƯU Ý: phần dư có điểm cao hiển thị Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 26 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Đồ họa trình tự từ nucleotide đến 3999 Đồ họa trình tự từ nucleotide 4000 đến 7999 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 27 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 28 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Đồ họa trình tự từ nucleotide 8000 đến 11999 Đồ họa trình tự từ nucleotide 12000 đến 15999 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 29 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Đồ họa trình tự từ nucleotide 16000 đến 19999 Đồ họa trình tự từ nucleotide 20000 đến 23999 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 30 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 Đồ họa trình tự từ nucleotide 24000 đến 27999 Đồ họa trình tự từ nucleotide 28000 đến hết Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 31 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 2.2.2 Phương pháp tìm kiếm Glycosylation Sử dụng phần mềm NetOGly 2.2.2.1 Các bước thực i Bước 1: Truy cập phần mềm NetOGly ii Bước 2: Tải trình tự nucleotide từ NCBI thành đoạn ngắn từ 4000- 8000 nucleotide iii Bước 3: Tải trình tự vào phần mềm Netphos để dự đoán thay đổi 2.2.2.2 Kết Kết lưu sau Bao gồm cột: Trình tự Đặc tính Vị trí bắt đầu phân cắt Vị trí kết thúc phân cắt Điểm dự đốn Bình luận “POSITIVE” dự đốn có điểm từ 0,5 trở lên Trong phần kết quả, nêu dự đốn mang tính tích cực, khả xảy cao Một ví dụ kết quả: Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 32 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 KẾT LUẬN Sau tháng bùng nổ lây lan, dich covid – 19 mang lại hậu nặng nề sức khỏe, tính mạng, khủng hoảng kinh tế, y tế, trị nhiều quốc gia giới Ứng dụng phần mềm tin sinh học, sử dụng phương pháp tìm kiếm thay đổi Môt số kết báo cáo cho thấy phát triển mạnh mẽ tin sinh học, bắt kịp vấn đề nóng khoa học giới Vì việc nghiên cứu thay đổi protein sau dịch mã đóng vai trò quan trọng nghiên cứu vaccine phòng bệnh hay chữa trị bệnh Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 33 Tìm hiểu thay đổi sau dịch mã protein ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm kiếm thay đổi protein virus covid-19 TÀI LIỆU THAM KHẢO [1] https://vi.wikipedia.org/wiki/%C4%90%E1%BA%A1i_d%E1%BB %8Bch_COVID-19 [2] https://huemed-univ.edu.vn/dac-diem-virus-cua-coronavirus-vachung-sars-cov-2-scnw-c69 [3] https://docsachysinh.com/tag/phosphoryl-hoa/ [4] https://vi.wikipedia.org/wiki/Protein#D%E1%BB%B1_%C4%91o %C3%A1n_protein_m%E1%BA%A5t_tr%E1%BA%ADt_t%E1%BB %B1_v%C3%A0_c%E1%BA%A5u_tr%C3%BAc_kh%C3%B4ng_c %E1%BB%91_%C4%91%E1%BB%8Bnh [5] Kĩ thuật phân tích protein https://www.slideshare.net/vtthang/k-thut-phn-tch-cu-trc-protein [6] Giáo trình tin sinh học, TS Tạ Ngọc Ly https://drive.google.com/drive/folders/1dHMX2k0uezahM6y2RMUEjnXZc w7iSgbZ? fbclid=IwAR2JBAXIZ7aAq2NgQi3EtsMf74_6IssMimPQ7iEjfsWbSf9r16 0pmC9PYc0 Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS Tạ Ngọc Ly 34 ... Trong tập đồ án này, tơi trình bày tổng quan tình hình dịch bệnh covid gây, ra, vần đề lí thuyết biến đổi sau dich mã Đồng thời, kết tìm kiếm thay đổi sau dich mã protein từ covid công cụ tin... phần protein S kháng ngun kích thích kháng thể trung hịa, mục tiêu quan trọng tế bào lympho gây độc tế bào - Protein M đóng vai trò quan trọng lắp ráp virus - Protein nucleocapsid (N) liên kết với... cục bộ, phần lớn hình thành lõi kị nước (hydrophobic core), giữ cầu muối (salt bridge), liên kết hiđrô, liên kết disulfide, chí chỉnh sửa sau dịch mã (post-translational modification) Thuật ngữ