Sử dụng phần mềm NetOGly
2.2.2.1 Các bước thực hiện
i. Bước 1: Truy cập phần mềm NetOGly.
ii. Bước 2: Tải trình tự các nucleotide từ NCBI thành các đoạn ngắn từ 4000- 8000 nucleotide.
iii. Bước 3: Tải trình tự trên vào phần mềm Netphos để dự đoán các thay đổi.
2.2.2.2 Kết quả
Kết quả được lưu như sau Bao gồm 6 cột: 1. Trình tự. 2. Đặc tính. 3. Vị trí bắt đầu phân cắt. 4. Vị trí kết thúc phân cắt. 5. Điểm dự đoán.
6. Bình luận. “POSITIVE” đối với các dự đoán có điểm từ 0,5 trở lên.
Trong phần kết quả, chỉ nêu các dự đoán mang tính tích cực, khả năng xảy ra cao.
Một ví dụ về kết quả:
Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS. Tạ Ngọc Ly 32
Tìm hiểu về thay đổi sau dịch mã của protein và các ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm
kiếm các thay đổi này trong protein của virus covid-19.
KẾT LUẬN
Sau hơn 6 tháng bùng nổ và lây lan, dich covid – 19 đã mang lại những hậu quả nặng nề về sức khỏe, tính mạng, khủng hoảng kinh tế, y tế, chính trị ở nhiều quốc gia trên thế giới.
Ứng dụng phần mềm tin sinh học, sử dụng các phương pháp tìm kiếm những thay đổi này. Môt số kết quả được báo cáo như trên cho thấy sự phát triển mạnh mẽ của tin sinh học, bắt kịp những vấn đề nóng trong khoa học và thế giới. Vì vậy việc nghiên cứu những thay đổi của protein sau dịch mã đóng vai trò quan trọng nghiên cứu vaccine phòng bệnh hay chữa trị bệnh.
Sinh viên thực hiện: Văn Thị Tú Hướng dẫn: TS. Tạ Ngọc Ly 33
Tìm hiểu về thay đổi sau dịch mã của protein và các ứng dụng phần mềm tin sinh học để tìm
kiếm các thay đổi này trong protein của virus covid-19.