PROTEIN • Hợp chất hữu cơ, trọng lượng phân tử cao • Cấu tạo bởi nhiều acid amin nối với nhau bằng liên kết peptid • Chứa 4 loại nguyên tố : C, H, O, N, có thể có S, PPhân biệt: ACID AMIN : đơn vị cấu tạo nhỏ nhất của protein. PEPTID: từ 2 đến vài chục (< 50) acid amin. M < 6000 (theoquy ước) PROTEIN: • >50 acid amin cho tới cả ngàn hay vài chục ngàn. • Cấu trúc rất phức tạp • M > 6000. • Có 2 loại–Protein đơn giản (Protein thuần = Holoprotein)–Protein phức tạp (Protein tạp = Hétéroprotein) : có thêm nhóm ngoại trong phân tử (lipid, glucid, acid nucleic)
Chương PROTEI N ĐẠI CƯƠNG PROTEIN • Hợp chất hữu cơ, trọng lượng phân tử cao • Cấu tạo nhiều acid amin nối với liên kết peptid • Chứa loại nguyên tố : C, H, O, N, có S, P Phân biệt: ACID AMIN : đơn vị cấu tạo nhỏ protein PEPTID: từ đến vài chục (< 50) acid amin M < 6000 (theo quy ước) PROTEIN: • >50 acid amin ngàn hay vài chục ngàn • Cấu trúc phức tạp • M > 6000 • Có loại – Protein đơn giản (Protein = Holoprotein) – Protein phức tạp (Protein tạp = Hétéroprotein) : có thêm nhóm ngoại phân tử (lipid, glucid, acid nucleic ) ACID AMIN • • Acid amin sản phẩm thủy phân cuối peptid protein Các dạng protein khác loài sinh vật xây dựng 20 acid amin gọi 20 acid amin chuẩn 20 acid amin thường gặp phân tử protein 2.1.Cấu tạo hóa học Acid amin chất hữu mà phân tử có chứa nhóm carboxyl -COOH nhóm amin -NH2 Gốc riêng cho aa Phần chung aa 2.2.Phân loại 2.2.1.Acid amin mạch thẳng 2.2.1.1 Acid amin trung tính (acid monoamin monocarboxylic) Có acid amin chứa nhóm amin nhóm carboxyl STT Công thức cấu tạo Tên thông dụng ký hiệu (3 chữ Acid amin có gốc R chuỗi hydrocarbon no: Tên hóa học Glycin (Gly) (G) Acid -amino acetic Alanin (Ala) (A) Acid -amino propionic Valin (Val) (V) Acid -amino isovaleric Leucin (Leu) (L) Acid -amino isocaproic Isoleucin (Ile) (I) Acid -amino methylvaleric Acid amin có gốc R chứa nhóm –OH: Serin (Ser) (S) Acid -amino hydroxy propionic Threonin (Thr) (T) Acid -amino hydroxy butyric Acid amin có gốc R chứa S: Cystein (Cys) (C) Acid -amino thiol propionic Methionin (Met) (M) Acid -amino methylthio- n-butyric 2.2.1.2 Acid amin acid (acid monoamin dicarboxylic) Có acid amin chứa nhóm amin nhóm carboxyl STT 10 Cơng thức cấu tạo Tên thơng dụng Tên hóa học ký hiệu (3 chữ chữ) Acid aspartic (Asp) (D) Acid -amino succinic -amid acid aspartic 11 Asparagin (Asn) (N) 12 Acid glutamic (Glu) (E) Acid -amino glutaric 13 Glutamin (Gln) (Q) -amid acid glutamic 2.2.1.3 Acid amin kiềm (acid diamin monocarboxylic) Có acid amin chứa nhóm amin nhóm carboxyl STT Cơng thức cấu tạo 14 Tên thơng dụng ký hiệu (Lys) (3 chữ Lysin (K)và 15 Arginin (Arg) (R) Tên hóa học Acid ,-diamino n- caproic Acid -amino - guanido-nvaleric 8.4.6.Vai trò lượng ion GTP • Chuyển vị từ A sang P • Gắn f-Met aa-ARNt vào Ribosom ATP • STH aa-ARNt Creatin phosphat • Tái tạo lại ATP Mg++ (5-10 mM) • Gắn aa-ARNt ARNm vào ribosom • Làm ổn định ribosom 108 8.4.7.Vai trò yếu tố khởi đầu, kéo dài kết thúc IF (Initiation factor): gắn f-Met-ARNt (Met-ARNt) vào ribosom EF (Elongation factor): tạo phức hợp với GTP aaARNt, gắn aa-ARNt vào ribosom RF (Release factor): chấm dứt sinh tổng hợp, tách polypeptrid ribosom 8.4.8 Nguyên liệu : 20 acid amin 109 8.5 Sinh tổng hợp protein = Sự phiên dịch 8.5.1.Cơ chế Sinh tổng hợp xảy ribosom 8.5.1.1 Kích hoạt acid amin 8.5.1.2 Sự sinh tổng hợp • ARNt vận chuyển aa chuyên biệt đến ARNm • Acid amin đặt theo thứ tự ấn định ARNm • Sự định vị aa-ARNt thực “P” “A” • Ribosom xúc tác việc thành lập gạch nối peptid 111 114 115 8.5.3.Sinh tổng hợp protein tế bào có nhân (eukaryot) 8.5.3.1 So sánh với sinh tổng hợp tế bào không nhân 8.5.3.2 Sinh tổng hợp protein ty thể (tế bào có nhân) • Giống tế bào khơng nhân ribosom ty thể 70s 117 8.5.4 Một số tác nhân ảnh hưởng đến sinh tổng hợp protein 8.5.4.1 Các chất kháng sinh: • Kháng sinh tác động biến dưỡng acid nucleic: Rifampin • Kháng sinh tác động kết hợp với bán đơn vị 30s gây tích tụ phức chất khởi đầu sinh tổng hợp protein đọc sai lầm mã ARNm tạo polypeptid bất bình thường: gồm có nhóm kháng sinh aminoglycosid, chất diệt khuẩn gồm gentamycin, tobramycin, amikacin, kanamycin, streptomycin, neomycin • Kháng sinh tác động chức ribosom vi khuẩn gây ức chế thuận nghịch trình sinh tổng hợp protein 118 tác động ức chế sinh tổng hợp protein tế bào có nhân không nhân ... quy ước) PROTEIN: • >50 acid amin ngàn hay vài chục ngàn • Cấu trúc phức tạp • M > 6000 • Có loại – Protein đơn giản (Protein = Holoprotein) – Protein phức tạp (Protein tạp = Hétéroprotein) :... 2.5.4 Hóa tính gốc R • Phản ứng tạo muối : nhóm -COOH -NH2 • Phản ứng oxy hóa khử : nhóm -SH cystein • Phản ứng nitro hóa halogen hóa : nhân thơm phenylalanin tyrosin • Phản ứng ester hóa : nhóm... chuyển hóa hormon steroid Nhu cầu hàng ngày khoảng vài microgam Selenocystein khơng có protein thực vật hay nấm men Selenocystein không mã hóa ba mật mã 20 acid amin chuẩn thường gặp phân tử protein