PHÂN LẬP VÀ KHẢO SÁT KHÁNG SINH ĐỒ CÁC VI KHUẨN STAPHYLOCOCCUS COAGULASE ÂM TỪ MẪU BỆNH PHẨM CỦA PHÒNG VI KHUẨN HÔ HẤP VIỆN PASTEUR TP. HỒ CHÍ MINH NĂM 2009

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH KHĨA LUẬN TỐT NGHIỆP PHÂN LẬP VÀ KHẢO SÁT KHÁNG SINH ĐỒ CÁC VI KHUẨN STAPHYLOCOCCUS COAGULASE ÂM TỪ MẪU BỆNH PHẨM CỦA PHÒNG VI KHUẨN HƠ HẤP VIỆN PASTEUR TP HỒ CHÍ MINH NĂM 2009 Họ tên sinh viên: TRƯƠNG THỊ LỆ TRÂM Ngành: BẢO QUẢN CHẾ BIẾN NÔNG SẢN VÀ VI SINH THỰC PHẨM Niên khóa: 2006 - 2010 Tháng 8/2010 PHÂN LẬP VÀ KHẢO SÁT KHÁNG SINH ĐỒ CÁC VI KHUẨN STAPHYLOCOCCUS COAGULASE ÂM TỪ MẪU BỆNH PHẨM CỦA PHÒNG VI KHUẨN HƠ HẤP VIỆN PASTEUR TP HỒ CHÍ MINH NĂM 2009 Tác giả Trương Thị Lệ Trâm Khóa luận đệ trình để đáp ứng yêu cầu cấp kỹ sư ngành Bảo Quản Chế Biến Nông Sản Vi Sinh Thực Phẩm Giáo viên hướng dẫn BS NGUYỄN THỊ KIM HỒNG THS NG NGUYỄN ĐỨC NINH Tháng năm 2010 i LỜI CẢM ƠN Để thực đề tài trình phấn đấu nỗ lực thân đồng thời ủng hộ động viên gia đình, thầy bạn bè Xin chân thành cám ơn Bác sĩ Nguyễn Thị Kim Hồng Thạc sĩ ng Nguyễn Đức Ninh phòng vi khuẩn hô hấp, Khoa Vi sinh miễn dịch, Viện Pasteur thành phố Hồ Chí Minh tận tình hướng dẫn, cung cấp thơng tin, kiến thức thật hữu ích tạo điều kiện thuận lợi cho trình thực đề tài Cám ơn Ban Giám Hiệu, q thầy Khoa Cơng Nghệ Thực Phẩm, Trường Đại học Nơng Lâm thành phố Hồ Chí Minh nhiệt tình giảng dạy, truyền đạt kiến thức quí báu năm học vừa qua Xin khắc ghi công ơn ba mẹ - người sinh thành, dưỡng dục, dìu dắt tơi bước đầu đời, tạo cho hành trang vững bước vào sống Cuối xin dành cho bạn bè tôi, người gần gũi, chia sẻ, giúp đỡ, đồng hành với suốt quãng đời Đại học Xin chân thành cảm ơn Tp Hồ Chí Minh, ngày 10 tháng 07 năm 2010 Trương Thị Lệ Trâm ii TÓM TẮT Đề tài “Phân lập khảo sát kháng sinh đồ vi khuẩn Staphylococcus coagulase âm từ cấy máu dương tính labo vi khuẩn hơ hấp, Viện Pasteur Tp Hồ Chí Minh năm 2009” tiến hành phòng vi khuẩn hơ hấp, Khoa Vi sinh miễn dịch, Viện Pasteur thành phố Hồ Chí Minh từ ngày 15/3 đến ngày 15/6 năm 2010 Đề tài thực với mục đích định danh chủng Staphylococcus coagulase âm phân lập từ cấy máu dương tính, đồng thời khảo sát mức độ kháng kháng sinh chủng để phân tích dịch tễ học kháng thuốc chủng Staphylococcus coagulase âm tỉnh thành phía Nam Qua q trình phân lập thử sinh hóa 74 chủng vi khuẩn từ cấy máu dương tính bệnh nhân bị viêm màng não viêm phổi nặng bệnh viện Cù Lao Minh, Bến Tre, kết phân lập 39 chủng Staphylococcus coagulase âm Tỉ lệ Staphylococcus coagulase âm chiếm 62,9% tổng sổ 62 vi khuẩn Gram dương phân lập Đề tài sử dụng phương pháp Kirby Bauer để khảo sát nhạy cảm Staphylococcus coagulase âm với kháng sinh amikacin, oxacillin, amoxicillin/clavulanic, azithromycin, chloramphenicol, cefoperazone, clindamycin, doxycycline, cefepime, gentamicin, ofloxacin, teicoplanin, vancomycin Nghiên cứu độ nhạy cảm với kháng sinh 39 chủng Staphylococcus coagulase âm phân lập được, kết cho thấy: 97,44% số chủng nhạy cảm với vancomycin, 94,87% nhạy cảm với teicoplanin; 92,31% nhạy cảm với amikacin 79,49% nhạy cảm với gentamicin, doxycycline 76,92 % 58,97%, 53,85% số chủng nhạy cảm với ofloxacin cefoperazone Nhìn chung tỉ lệ nhạy cảm trung gian thấp, cao cefoperazone với tỉ lệ 28,20%, tiếp doxycycline ofloxacin với tỉ lệ 10,26% Một số kháng sinh có tỷ lệ chủng Staphylococcus coagulase âm kháng cao: oxacillin: 100% azithromycin: 76,92% iii MỤC LỤC Trang Trang tựa i Lời cảm ơn ii Tóm tắt iii Mục lục iv Danh sách chữ viết tắt vii Danh sách hình ix Danh sách bảng x CHƯƠNG MỞ ĐẦU 11 1.1 Đặt vấn đề 11 1.2 Mục đích 12 CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 13 2.1 Tổng quan Staphylococcus coagulase âm (SCA) 13 2.1.1 Phân loại, phân bố hình thái SCA 13 2.1.2 Đặc điểm sinh trưởng phát triển 14 2.1.3 Đặc điểm sinh hóa 14 2.1.4 Sức đề kháng 14 2.2 Khả chế gây bệnh SCA 15 2.2.1 Khả gây bệnh 15 2.2.2 Cơ chế gây bệnh 16 2.3 Tổng quan kháng sinh 16 2.3.1 Khái niệm 16 2.3.2 Phân loại kháng sinh 17 2.3.2.1 Nhóm kháng sinh beta – lactam 17 2.3.2.2 Nhóm kháng sinh aminoglycoside 19 2.3.2.3 Nhóm kháng sinh glycopeptide 20 2.3.2.4 Nhóm kháng sinh tetracyclin 21 2.3.2.5 Nhóm kháng sinh phenicol 22 2.3.2.6 Nhóm kháng sinh macrolide 22 iv 2.3.2.7 Nhóm kháng sinh lincosamide 23 2.3.2.8 Nhóm kháng sinh fluoroquinolone 23 2.3.2.9 Nhóm kháng sinh sulfonamide diaminopyrimidine 24 2.3.3 Cơ chế tác động kháng sinh 25 2.3.3.1 Ức chế tổng hợp vách tế bào 25 2.3.3.2 Ức chế chức màng nguyên tương 25 2.3.3.3 Ức chế tổng hợp protein 25 2.3.3.4 Tác dụng ức chế hình thành acid nucleic 26 2.3.4 Sự đề kháng kháng sinh 26 2.4 Kháng sinh đồ 30 2.4.1 Định nghĩa 30 2.4.2 Phương pháp định tính khảo sát nhạy cảm vi khuẩn kháng sinh 30 2.4.2.1 Các yếu tố ảnh hưởng đến kết phản ứng 30 2.4.2.2 Chọn lựa đĩa kháng sinh 31 2.4.3 Phương pháp định lượng 31 2.5 Một số nghiên cứu liên quan đến lĩnh vực đề tài 32 2.5.1 Trong nước 32 2.5.2 Ngoài nước 32 CHƯƠNG NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 34 3.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu 34 3.2 Nội dung nghiên cứu 34 3.3 Vật liệu 34 3.3.1 Đối tượng khảo sát 34 3.3.2 Thiết bị, dụng cụ 34 3.3.3 Mơi trường, hóa chất 35 3.4 Phương pháp tiến hành 36 3.4.1 Kiểm tra chất lượng 36 3.4.1.1 Kiểm tra chủng vi khuẩn chuẩn 36 3.4.1.2 Kiểm tra chất lượng đĩa kháng sinh 36 3.4.1.3 Kiểm tra chất lượng môi trường nuôi cấy 37 v 3.4.2 Phân lập định danh sơ vi khuẩn 38 3.4.2.1 Nhuộm Gram 39 3.4.2.2 Thử phản ứng catalase 40 3.4.2.3 Thử phản ứng coagulase 41 3.4.2.4 Thử phản ứng oxydase 42 3.4.3 Kháng sinh đồ 42 3.4.3.1 Nguyên tắc phương pháp 42 3.4.3.2 Cách thực 43 3.4.4 Các tiêu theo dõi 45 3.4.5 Xử lý số liệu 45 CHƯƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 46 4.1 Kết kiểm tra môi trường 46 4.2 Kết phân lập SCA 46 4.3 Kết khảo sát mức độ kháng kháng sinh SCA với kháng sinh thử nghiệm 47 CHƯƠNG KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 58 5.1 Kết luận 58 5.2 Đề nghị 58 TÀI LIỆU THAM KHẢO 59 PHỤ LỤC 65 vi DANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT AMC amoxicillin - clavulanic acid AN amikacin ATCC American Type Culture Collection AZM azithromycin BA Blood Agar: thạch máu BHI Brain Heart Infusion Broth C chloramphenicol CFP cefoperazone CFU Colony Form Unit CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute CM clindamycin ctv cộng tác viên D doxycycline DNA deoxyribonucleic acid FEP cefepime GM gentamicin KP kháng penicilinase LB Lactose Broth MBC Minimal Bacteriocidal Concentration MHA Mueller Hinton Agar MIC Minimal Inhibitory Concentration MRSA Methicillin Resistant Staphylococcus Aureus NA Nutrient Agar NNIS National Nosocomial Infections Surveillance OFX ofloxacin OX oxacillin PABA acid para aminobenzoic PBP Penicillin binding protein vii Pr Productivity ratio R Rough S Smooth S aureus Staphylococcus aureus SCA Staphylococcus coagulase âm TEC teicoplanin TSA Tryptone Soy Agar VA vancomycin viii DANH SÁCH CÁC HÌNH Trang Hình 2.1: Cấu trúc kháng sinh thuộc nhóm penicillin 17 Hình 2.2: Cấu trúc chung cephalosporin 18 Hình 2.3: Cấu trúc chung kháng sinh nhóm aminoglycoside 20 Hình 2.4: Cấu trúc kháng sinh nhóm glycopeptide 21 Hình 2.5: Cấu trúc chung kháng sinh nhóm tetracyclin 21 Hình 2.6: Cấu trúc chloramphenicol 22 Hình 2.7: Cấu trúc kháng sinh nhóm macrolide 23 Hình 2.8: Cấu trúc kháng sinh nhóm lincosamide 23 Hình 2.9: Cấu trúc kháng sinh nhóm fluoroquinolone 24 Hình 2.10: Cấu trúc hóa học diaminopyrimidine 24 Hình 3.1: Sơ đồ phân lập SCA 39 Hình 3.2: Phản ứng catalase dương tính 41 Hình 3.3: Kết phản ứng coagulase âm dương 42 Hình 3.4: Thao tác ép trải vi khuẩn với tăm bơng 43 Hình 3.5: Các điểm đặt kháng sinh đĩa thạch 44 Hình 3.6: Đặt kháng sinh đĩa thạch 44 Hình 4.1: Đĩa kháng sinh sau ủ 24 48 Hình 4.2: Đo kích thước vòng vơ khuẩn 48 Hình 4.3: Tính nhạy cảm SCA loại kháng sinh 50 Hình 4.4: Tính nhạy cảm trung gian SCA loại kháng sinh 53 Hình 4.5: Tính đề kháng SCA loại kháng sinh 54 ix 38 Gorzynski E A., 1989 Comparative in vitro activities of teicoplanin, vancomycin, oxacillin, and other antimicrobial agents against bacterermic isolates of Gram positive cocci Antimicrobial agents and Chemotherapy Vol 33 Trang 2019 – 2022 39 Gristina A G., ctv, 1989 Comparative in vitro antibiotic resistance of surface colonizing coagulase negative Staphylococci Antimicrob Agents Chemother Vol 33 Trang 813 - 816 40 Jaimes E.C., ctv, 2002 Epidemiology of drug resistance: The case of Staphylococcus aureus and coagulase negative Staphylococci infections Salud Pblica de Mxico Vol 44 Trang 108 – 112 41 Jones ctv, 1989 The prevalence of Staphylococcal resistance to penicillinase resistant penicillins A retrospective and prospective national surveillance trial of isolates from 40 medical centers Diagn Microbiol Infect Dis Vol 12 Trang 385 - 394 42 Jorda Vargas L ctv, 2006 Survey of bloodstream infection isolates Sentry antimicrobial surveillance program in Buenos Aires, Argentina (1997 – 2002) Rev Panam Infectol Vol Trang 11 – 17 43 Kloos WE Scheleifer, 1975 Simplified scheme for routine identification of human Staphylococcus species J Clin Microbiol Vol Trang 82 – 88 44 Kristensen B., 1998 Antibiotic resistance patterns among blood culture isolates in a Danish county 1981 - 1995 J Med Microbiol Vol 48 Trang 67 – 71 45 Leonard Katz and Gary W Ashley, 2005 Chemical review Vol 105 Trang 499 – 528 46 Lina G ctv, 2006 Biology and Pathogenicity of Staphylococci other than Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis Gram positive pathogens Fischetti V A Trang 450 - 462 47 Longauerova A (2006) Coagulase negative Staphylococci and their participation in pathogenesis of human infections Bratisl Lek Listy Vol 107 Trang 448 – 452 48 Louis B R., 2006 Antimicrobial Resistance in Gram Positive Bacteria The American Journal of Medicine Vol 119 Trang S11 – S19 49 Magnet Sophie Blanchard S J., 2005 Molecular Insights into Aminoglycoside Action and Resistance Chemical review Vol 105 Trang 177 – 497 62 50 Mehadinejad M., ctv, 2008 Study of methicillin resistance in Staphylococcus aureus and species of coagulase negative Staphylococci isolated from various clinical specimens Pakistan journal of medical sciences Vol 24 Trang 719 – 724 51 Natoli Silvia ctv, 2009 Characteriazation of coagulase negative Staphylococcal isolates from blood with reduced susceptibility to glycopeptides and therapeutic options BBC Infectious Diseases Vol Trang – 52 Otto M, 2004 Virulence factors of the coagulase negative Staphylococci Frontiers in Bioscience Trang 841 - 863 53 Pantucek ctv, 2005 Staphylococcus simiae sp nov., isolated from South American squirrel monkeys Intern J Syst Evolutionary Microbiol Vol 55 Trang 1953 – 1958 54 Petrás, 2004 Aktuality v taxonomii rodu Staphylococcus SZÚ, Praha: Zprávy CEM Vol 13 Trang 297 – 300 55 Po-Ren Hsueh ctv, 2002 Antimicrobial Drug Resistance in Pathogens Causing Nosocomial Infections at a University Hospital in Taiwan, 1981 - 1999 Emerging infectious diseases Vol Trang 63 – 68 56 Quinn P.J., ctv, 1998 Clinical veterinary microbiology Wolfe, London Trang 95 – 115 57 Shailen N B., 1991 Secular trends in nosocomial primary bloodstream infections in the United States, 1980 – 1989 The American Journal of Medicine Vol 91 Trang 86 – 89 58 Tacconelli Evalina ctv, 2003 Epidemiological comparison of true methicillin resistant and methicillin susceptiple coagulase negative Staphlococcal Clinical Infectious Diseases Vol 37 Trang 644 – 649 59 Von Eiff C ctv (2001) Coagulase-negative Staphylococci Pathogens have major role in nosocomial infections Postgrad Med Vol 110 Trang 63 – 76 Các trang web: 60 http://www.cdytqn.edu.vn/index.php?option=com_docman&task Ngày truy cập: 28/07/2010 61 http://itech.dickinson.edu/chemistry/?cat=65 Ngày truy cập: 21/06/2010 62 http://www.bmb.leeds.ac.uk/mbiology/ug/ugteach/gene2020/transpos html 63 Ngày truy cập: 16/07/2010 63 http://www.nature.com/nsmb/journal/ Ngày truy cập: 16/07/2010 64 http://www.bmb.leeds.ac.uk/mbiology/ug/ugteach/gene2020/transpos html Ngày truy cập 17/07/2010 65 http://www.bifcpresidency.tn.gov.in/CHLORAM%203.HTML Ngày truy cập: 20/07/2010 66 http://www.textbookofbacteriology.net/themicrobialworld/antimicrobial html Ngày truy cập: 20/07/2010 67 http://www.bmb.leeds.ac.uk/mbiology/ug/ugteach/icu8/antibiotics/ protein.html Ngày truy cập: 20/07/2010 68 http://sitemaker.umich.edu/medchem9/medicinal_chemistry Ngày truy cập: 20/07/2010 69 http://www.chem-x-infinity.com/produit/produit.php/produit/kinase diaminopyrimidine-library Ngày truy cập: 20/07/2010 64 PHỤ LỤC Phụ lục 1: Kích thước vòng vô khuẩn loại kháng sinh chủng SCA (theo CLSI) Amikacin Amoxicillin – clavulanic acid Azithromycin Cefepime Cefoperazone Chloramphenicol Clindamycin Doxycycline Gentamicin Ofloxacin Oxacillin Teicoplanin Vancomycin Kích thước vòng vơ khuẩn (mm) Kí hiệu Nồng độ (µg) Kháng Trung gian Nhạy cảm AN 30 ≤14 15 - 16 ≥17 AMC 20/10 ≤19 - ≥20 AZM FEP CFP C CM D GM OFX OX TEC VA 15 30 75 30 30 10 30 30 ≤13 ≤14 ≤15 ≤12 ≤14 ≤12 ≤12 ≤14 ≤17 ≤10 - 14 - 17 15 - 17 16 - 20 13 - 17 15 - 20 13 - 15 13 - 14 15 - 17 11 - 13 - ≥18 ≥18 ≥21 ≥18 ≥21 ≥16 ≥15 ≥18 ≥18 ≥14 ≥15 Kháng sinh Phụ lục 2: Thành phần môi trường MHA Beef infusion solids g/l Magnesium ions 20 – 35 mg/l Acid hydrolysed casein 17,5 g/l pH 7,4 ± 0,2 Starch 1,5 g/l Calcium ions Agar 17 g/l 50 – 100 mg/l Phụ lục 3: Thành phần môi trường NA Peptone g/l Sodium chloride Beef extract g/l Agar No g/l 12 g/l Phụ lục 4: Thành phần môi trường BA Beef extract 10 g/l Balanced peptone No 10 g/l Sodium chloride g/l Agar No 65 g/l Phụ lục 5: Thành phần môi trường BHI broth Brain Heart Infusion solids Glucose 17,5 g/l Trytone g/l Sodium chloride 10 g/l g/l Disodium hydrogen phosphate 2,5 g/l Phụ lục 6: Thành phần môi trường LB Beef extract g/l Gelatin peptone g/l Lactose g/l Phụ lục 7: Thành phần môi trường TSA Tryptone 15 g/l Soy pepton g/l Sodium chloride g/l Agar No 12 g/l Phụ lục 8: Kích thước vòng vơ khuẩn để kiểm tra chất lượng kháng sinh (CLSI) Hàm lượng Kích thước chuẩn vòng vơ (g) khuẩn (mm) 30 20 - 26 20/10 28 - 36 Azithromycin 15 21 - 26 Cefepime 30 23 - 29 Cefoperazone 75 24 - 33 Chloramphenicol 30 19 - 26 Clindamycin 24 - 30 Doxycycline 30 23 - 29 Gentamicin 10 19 - 27 Ofloxacin 24 - 28 Oxacillin < 20 Teicoplanin 30 15 - 21 Vancomycin 30 17 - 21 Loại kháng sinh Amikacin Amoxicillin-clavulanic acid 66 Phụ lục 9: Kết phân lập chủng vi khuẩn từ cấy máu dương tính ST T Tên mẫu Hình dạng khuẩn lạc Gram a VP1/09/ 101 VP1/09/ 1107 VP1/09/ 102 VP1/09/ 614 VP1/09/ 764 VP1/09/ 436 VP1/09/ 598 VP1/09/ 613 Tròn, vun, trắng đục, đường kính Φ - 1,2 mm b Tròn, vun, trắng đục, bề nhăn, Φ 2,5 mm a Tròn, trắng đục, bóng ướt, tan huyết β, Φ 1,5 mm b Trắng đục, vun, bờ trơn, Φ mm Tròn, vun, vàng, tan huyết β, Φ 1,5 mm a Tròn, bờ tròn, vun, trắng đục, Φ mm b Tròn, vun, màu vàng chanh, Φ 1,5 mm, tan huyết β a Tròn, vàng, lõm, bề nhăn, Φ mm b Trắng đục, vun, ướt, to, Φ mm Tròn, trắng đục, vun, bóng ướt, Φ mm Tròn, vun, trắng đục, Φ 0,3 mm Tròn, vàng, vun, bóng ướt, Φ 1,2 mm, tan huyết β a 10 11 12 13 14 VP1/09/ 109 + Tròn, trắng đục, Φ 0,5 mm + + + + + + VP1/09/ 281 Tròn, trắng đục, bóng ướt, Φ – 2,5 mm a Tròn, vun, trắng đục, Φ VP1/09/ 0,8 – mm b 671 Tròn, vàng chanh, bề nhăn, Φ mm VP1/09/ Tròn, trắng đục, bóng ướt, 263 vun, Φ mm VN1/09/ Tròn, vun, trắng đục, Φ 115 - 1,2 mm VP1/09/ Tròn, vun, vàng, bóng 492 ướt, Φ 1,5 mm, tan huyết β 67 Cầu khuẩn, đơn, đôi, kết chùm đa số Trực khuẩn, đơn, đôi, chuỗi Cầu khuẩn, kết đôi, chùm đa số Trực khuẩn, ngắn, mảnh, đơn, đôi đa số Cầu khuẩn, đôi, kết chùm đa số Cầu khuẩn, kết chùm đa số, kết chùm 5, Cầu khuẩn, đơn, đơi, chuỗi ngắn, kết chùm đa số Cầu khuẩn, đơn, đôi, chuỗi Trực khuẩn ngắn, đơn, đôi đa số Trực khuẩn, đơn, đôi, kết chuỗi ngắn Cầu khuẩn, kết đôi, kết chuỗi ngắn, chuỗi dài Cầu khuẩn, đôi, kết chùm đa số + Cầu khuẩn, kết chuỗi, đôi + Cầu khuẩn, đôi, kết chùm đa số b Tròn, vun, trắng đục, Φ - 1,2 mm Hình dạng vi khuẩn + + + Trực khuẩn, đơn, đôi, chuỗi ngắn Cầu khuẩn , kết chùm đa số, riêng lẻ Cầu khuẩn, kết đôi, chuỗi Trực khuẩn kết đơn, đôi, chuỗi ngắn Cầu khuẩn , kết chùm đa số Cầu khuẩn, đơn, đơi, kết chùm 15 Tròn, bờ tròn, vun, trắng VN1/09/ đục, Φ mm 110 + a 16 VP1/09/ 532 17 VP1/09/ 689 18 VP1/09/ 936 19 20 VP1/09/ 625 VP1/09/ 755 Tròn, trắng đục, vun, bóng ướt, Φ mm b Tròn, vun, trắng đục, bóng ướt, Φ mm, tan huyết β Tròn, vun, trắng đục, Φ 1,2 mm a Tròn, vun, trắng đục, Φ 1,2 mm b Tròn, vun, trắng đục, bóng ướt, Φ 0,5 mm, tan huyết α Tròn, vun, vàng, Φ 1,2 mm, tan huyết β Tròn, vun, trắng đục, Φ 1mm a 21 22 23 24 25 26 27 28 29 VP1/10/ 0033 VP1/09/ 743 VP1/09/ 763 VP1/09/ 297 VP1/09/ 475 VP1/09/ 767 VP1/09/ 590 VP1/09/ 1102 VP1/09/ 776 Tròn, trắng đục, vun, Φ mm + + + + + - b Tròn, vun, trắng đục, Φ 0,5 mm, lõm khuẩn lạc, tan huyết α a Tròn, trắng đục, vun, Φ 0,8 mm b Tròn, trắng đục, bóng ướt, nhầy, Φ - 2,5 mm, tan huyết α Tròn, vun, trắng, đục, Φ 1- 1, mm Tròn, vun, vàng chanh, Φ 1,5 mm, tan huyết β a Tròn, trắng đục, vun, bóng ướt, mm b Tròn, trắng đục, Φ 1mm + + + + - Tròn, vun, trắng đục, ướt, Φ mm Tròn, vun, trắng đục Φ 0,5 mm, tan huyết α Tròn, vun, trắng đục, Φ mm a Tròn, trắng đục, nhầy, bóng ướt, Φ mm, tan huyết α 68 + Cầu khuẩn, kết chùm đa số, có kết chùm 5, trở lên Trực khuẩn, đơn, kết đôi, chuỗi ngắn Cầu khuẩn, kết đôi, kết chùm Cầu khuẩn, đôi, chuỗi ngắn, kết chùm đa số Cầu khuẩn, đôi, chuỗi ngắn, kết chùm đa số Trực khuẩn, đơn, đơi đa số, có kết chuỗi Cầu khuẩn, đơn, kết đôi, chùm đa số Cầu khuẩn, kết đôi đa số, kết chùm lớn Trực khuẩn ngắn, đơn, kết đơi, chuỗi Cầu khuẩn, kết đơi, có vòng sáng xung quanh vi khuẩn Cầu khuẩn, đôi, kết chùm 6, 7, đa số Trực khuẩn, đơn, kết đôi đa số, chuỗi Cầu khuẩn, kết chùm đa số Cầu khuẩn kết đôi, kết chùm, chuỗi ngắn Trực khuẩn, kết đơn, đôi, chuỗi Cầu khuẩn, đơn, đôi, kết chùm, chuỗi ngắn Cầu khuẩn, đơn, kết đôi đa số + Cầu khuẩn, kết chuỗi - Trực khuẩn, đơn, đôi, chuỗi ngắn - Trực khuẩn, đơn, đơi đa số b Tròn, đục, Φ 0,8 – mm VP1/09/ 724 VP/09/4 11 Tròn, vun, vàng chanh, bóng ướt, Φ 1,5 mm, tan huyết β Tròn, trắng đục, vun, 2,5 mm Tròn, vun, trắng đục, lõm khuẩn lạc, tan huyết α a Tròn, trắng đục, vun, bóng ướt, Φ mm b Tròn, đục, vun, Φ khoảng mm Tròn, vun, trắng đục, Φ mm Tròn, vun, trắng đục, Φ 0,5 mm, tan huyết α VP1/09/ 750 Tròn, trắng đục, vun, Φ 1,2 mm, tan huyết α VP1/09/ 557 VP/09/8 16 Tròn, vun, vàng chanh, Φ mm, tan huyết β Tròn, trắng đục, bờ nhăn, Φ mm a Tròn, trắng đục, vun, Φ mm, tan huyết α b Tròn, trắng đục, vun, Φ mm 30 VP/09/6 30 31 VP1/09/ 1074 32 VP1/09/ 341 33 VP1/09/ 756 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 + VP1/09/ 775 VN1/09/ 111 VP/09/9 25 VP1/09/ 703 VP1/09/ 653 Tròn, đục, Φ mm + + + + + + + + + Tròn, vun, trắng đục, Φ 0,5 mm Tròn, vàng chanh, lõm, nhăn, khơ, 0,5 mm Tròn, đục, vun, Φ 0,8 – mm a Tròn, vun, vàng, Φ 1,5 VN1/09/ mm, tan huyết β b 106 Tròn, vun, trắng đục, Φ mm VP1/09/ Tròn, trắng đục, nhầy, 365 bóng ướt, Φ mm 69 + + + + - Cầu khuẩn , kết chùm 6, 8, … đa số Cầu khuẩn, đôi, kết chùm đa số Trực khuẩn ngắn, đơn, đôi chuỗi Cầu khuẩn, đơi hình ovan, kết đơi, vòng sáng xung quanh vi khuẩn Trực khuẩn, đơn, đôi, chuỗi ngắn Cầu khuẩn, kết đơi đa số, kết chùm lớn Cầu khuẩn, kết chùm đôi đa số, kết chùm 3, Cầu khuẩn, kết đơi, kết chuỗi đa số Cầu khuẩn, kết chùm 5, 6,… đa số, có kết chùm đơi Cầu khuẩn, đơn, đơi, kết chùm đa số Cầu khuẩn, đơn, đôi, kết chuỗi ngắn Cầu khuẩn, kết chùm đôi, đa số Trực khuẩn, đơn, đôi, chuỗi ngắn Cầu khuẩn, kết chùm đa số Cầu khuẩn, đôi, kết chuỗi đa số Trực khuẩn ngắn, đơn, đôi đa số Cầu khuẩn, kết đôi đa số Cầu khuẩn, đơn, đôi, kết chùm đa số Cầu khuẩn, kết đơi đa số, kết chùm 3, Trực khuẩn, đơn, đôi, chuỗi đa số 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 VP1/09/ 934 VP1/09/ 891 VP1/09/ 1172 VP1/09/ 941 VP1/09/ 1062 VP1/09/ 513 VP1/09/ 1198 VP1/09/ 1196 VP1/09/ 834 VP1/09/ 1152 VP1/10/ 0036 VP1/09/ 1190 VP1/09/ 576 VP1/09/ 1091 VP1/09/ 892 VP1/09/ 1113 VP1/10/ 0014 VP1/09/ 1093 VP1/09/ 754 Tròn, vun, trắng đục, Φ 11,2 mm Tròn, vun, trắng đục, Φ khoảng mm Trắng đục, nhỏ li ti, viền trơn Tròn, trắng đục, bóng ướt, tan huyết α , Φ 0,5 mm Tròn, vun, trắng đục, Φ mm Tròn, vun, vàng, Φ mm, tan huyết β Tròn, trắng đục, vun, Φ mm, tan huyết α a Tròn, trắng đục, vun, bóng ướt, Φ mm b Tròn, vun, trắng đục, Φ - 1,2 mm Tròn, trắng đục, vun, Φ 0,5 mm Tròn, vun, trắng đục, Φ 0,5 mm a Tròn, vun, trắng đục, Φ - 1,2 mm b Tròn, trắng đục, bóng ướt, vun, Φ mm Tròn, trắng đục, vun, Φ 0,5 mm, tan huyết α Tròn, vun, vàng chanh, Φ mm, tan huyết β Tròn, vun, trắng đục, Φ mm Tròn, trắng đục, bề nhăn, lõm, Φ mm Khuẩn lạc nhỏ, tròn, trắng đục, Φ 1,5 mm Trắng đục, vun, viền trơn, Φ 0,5 mm Tròn, trắng đục, vun, Φ 1,5 mm a Tròn, trắng đục, vun, Φ 1,5 mm 70 + + + + + + + + + + + + + - Cầu khuẩn, kết đôi đa số Cầu khuẩn, kết đôi đa số, kết chùm 5, Trực khuẩn, đơn, đôi, chuỗi ngắn Cầu khuẩn, chủ yếu kết chuỗi dài Cầu khuẩn kết đôi đa số Cầu khuẩn, đơn, đôi, kết chùm Cầu khuẩn, kết đôi, kết chùm đa số Trực khuẩn, đơn, kết đôi, chuỗi ngắn Cầu khuẩn, kết chùm đa số, có kết chùm 6, Cầu khuẩn, hình ovan, kết đơi, tạo chuỗi ngắn Cầu khuẩn, kết đôi đa số, kết chuỗi ngắn Cầu khuẩn, kết đơi đa số, có chùm lớn 5, 6… Trực khuẩn, đơn, kết đôi, chuỗi ngắn Cầu khuẩn, kết chùm 5, đa số Cầu khuẩn, đơn, kết đôi, kết chùm Cầu khuẩn, kết chùm đa số Trực khuẩn, đơn, đôi đa số, chuỗi ngắn + Cầu khuẩn, kết đôi đa số + Cầu khuẩn, kết chùm + - Cầu khuẩn, đôi, kết chùm đa số Trực khuẩn, ngắn, đơn, đôi đa số, chuỗi b 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 VP1/09/ 873 VP2/09/ 254 VP1/09/ 376 VP1/09/ 887 VP1/09/ 656 VP1/09/ 359 VP1/10/ 1151 VP1/09/ 1163 VP1/10/ 092 VP1/09/ 0071 Tròn, trắng đục, vun, Φ mm Tròn, trắng đục, vun, nhầy, bóng ướt, Φ mm Tròn, vun, trắng đục, Φ 0,6 mm Tròn, vun, vàng chanh, tan huyết β, Φ 1,5 mm a Tròn, trắng đục, vun, Φ 0,8 mm b Tròn, trắng đục, bóng ướt, vun, Φ mm Tròn, vun, bờ nhăn, trắng đục, Φ 0,6 – mm Tròn, vun, vàng chanh, tan huyết β , Φ 1,5 mm Tròn, trắng đục, viền trơn, Φ mm Tròn, bờ nhăn, vun, trắng đục, Φ 0,5 – mm a Tròn, bề nhăn, lõm, trắng đục, Φ mm b Tròn, vun, trắng đục, Φ 1mm Tròn, vun, trắng đục, Φ 0,5 mm 71 + + + + + + + + + + Cầu khuẩn, kết đôi, kết đa số Trực khuẩn, kết đôi, cụm, chuỗi Cầu khuẩn, kết chùm đa số Cầu khuẩn, kết đôi, kết chùm đa số Cầu khuẩn , kết chùm 5,6… đa số Trực khuẩn, đơn, đôi, chuỗi ngắn Cầu khuẩn, kết chùm 4, đa số Cầu khuẩn, đôi, kết chùm đa số Cầu khuẩn, kết chùm 6, Cầu khuẩn, kết chùm 5, 6,… đa số Cầu khuẩn, đơn, đôi, kết chuỗi ngắn Cầu khuẩn , kết chùm đa số Cầu khuẩn, kết chùm đa số Phụ lục 10: Kết phản ứng sinh hóa sơ chủng phân lập STT Tên mẫu VP1/09/101a a catalase coagulase oxidase Kết luận + - - SCA VP1/09/1107 + + Không đa số S aureus VP1/09/102 VP1/09/614a, b + + + - Không - đa số S aureus SCA + + Không đa số S aureus VP1/09/598 - Không Không Streptococcus VP1/09/613 + + Không đa số S aureus VP1/09/109a, b - Không Không Streptococcus + - - SCA VP1/09/671a + - - SCA 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 VN1/09/115 VP1/09/492 VN1/09/110 VP1/09/532b VP1/09/689 VP1/09/936a VP1/09/625 VP1/09/755 VP1/10/0033b VP1/09/743a VP1/09/763 VP1/09/297 VP1/09/767 VP1/09/590 VP1/09/776b VP/09/630 VP1/09/341 VP1/09/756b VP1/09/724 VP/09/411 VP1/09/750 VP1/09/557 VP1/09/775a VN1/09/111 VP/09/925 VP1/09/653 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Không + Không + Không + Không Không + Không - Không Không Không Không Không Không Không Không Không Không Không Không - SCA đa số S aureus SCA đa số S aureus SCA Streptococcus đa số S aureus SCA Streptococcus SCA SCA đa số S aureus SCA Streptococcus SCA đa số S aureus Streptococcus SCA SCA Streptococcus SCA đa số S aureus SCA SCA Streptococcus SCA 72 35 VN1/09/106ab 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 VP1/09/934 VP1/09/891 VP1/09/941 VP1/09/1062 VP1/09/513 VP1/09/1198 VP1/09/1196b VP1/09/834 VP1/10/0036a VP1/09/1190 VP1/09/576 VP1/09/1191 VP1/09/1113 VP1/09/1193 VP1/09/754b VP2/09/254 VP1/09/376 VP1/09/887a VP1/09/656 VP1/09/359 VP1/09/1163 VP1/10/092b VP1/09/0071 VP1/10/1151 VP1/09/1152 VP1/09/1093 VP1/10/0014 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Không + Không + + Không - Không Không Không Không Không + Không Không - đa số S aureus SCA SCA SCA Streptococcus SCA đa số S aureus SCA SCA Streptococcus SCA SCA đa số S aureus SCA SCA Micrococcus SCA SCA đa số S aureus SCA SCA Streptococcus SCA SCA SCA SCA SCA SCA SCA Không: Không thực phản ứng Phụ lục 11: Kích thước vòng vơ khuẩn vi khuẩn SCA với kháng sinh khảo sát 73 Loại kháng sinh Mã D OFX FEP CM OX CFP VA AMC C GM AN AZM TEC VP1/09/1190 23 6,2 6,2 22 6,2 17,4 6,8 6,5 6,9 19,3 15,3 VP1/09/1191 29,4 26,5 24,4 25,3 6,4 25,7 18,9 27,2 24,7 25,7 23,4 23,2 18,7 VP1/09/1196 18,5 23,7 27 23,5 13,7 22 18,15 24,2 23,75 23,7 23,65 21,6 17,9 VP1/09/981 14,5 26,3 24,2 21,4 19,4 17,2 16,4 6,2 23,2 16,2 VP1/09/1198 26 6 6 18,2 21,2 8,4 21,7 14,7 VP1/09/756 28,5 21,3 23,5 24,8 9,9 25,6 19 30,06 22,2 29,4 27,5 21,7 17,3 VP1/09/1062 16,4 14,6 20,5 6 17,7 17,5 11 19,5 20,03 22,2 VP1/09/671 11 21,7 6 6 19,3 10,05 15 28,3 18 VP1/09/115 31,5 23,3 25,5 22,6 27,4 20 31 30,03 30,05 19 VP1/09/101 28,1 21,6 19,5 17,7 22,5 16,8 25,7 20,5 24,5 25 20 15 VN1/09/110 30 22,4 22,6 23,4 7,5 24 20 28,9 24,8 30,06 30,03 17,3 chủng 74 VP1/09/743 30 23,9 23 20,07 28 16,8 29,5 22,8 24 23,5 20,05 16 VP1/09/755 10,06 23,1 25,1 22,8 8,7 26,4 19,3 28,8 6,3 30 29,3 17,8 VP1/10/36 16 14,2 24,4 6 26,5 20,05 25,9 8,4 29 27,8 20,03 VP1/09/1152 10,05 20,05 22,7 24 18,5 23,1 22,1 16,9 26,3 23,5 VP1/09/1163 18 15,3 23,1 6,5 25,6 20,05 26,5 9,1 25,7 24 18 VP1/10/0092 29,5 27,4 13,2 24 19,3 21,5 17,5 25,5 15,5 25,5 20,03 VP1/10/0014 25,7 8,1 6 25 21,5 16 25 6,5 21,3 VP1/09/1093 31 25 22,5 16 17,9 18,5 18,2 25,1 25 17,6 VP1/09/1113 30,2 17 29,4 6 31,5 29,3 7,5 27 19 26,4 VP1/09/689 29,5 23 6 6,8 18,8 9,4 6,2 29,3 28,8 16,8 VP1/09/763 27,8 20 22,2 7,8 23,3 19,3 28,4 18,8 28,8 27,8 15,8 VP1/09/767 13 11,8 23,6 26,5 25,2 23 24,2 8,3 14,5 22,5 24,1 24,6 VP1/09/776 31 16,3 8,8 6 30 20,05 28,4 14 16,8 16 23,3 VP1/09/750 24,7 8,3 24,8 6 18,4 24 12,3 21,6 17 VP1/09/775 22 6 22,5 6 18,4 21,8 9,3 20,08 16,7 75 VN1/09/111 29,5 22,3 13 6 21,3 20 20,08 29,2 28 18,5 VP1/09/653 30,05 27,8 11,5 6 20,08 19,5 15,6 26,3 26 17,2 VN1/09/106 11,6 25,2 23,3 21,3 14,2 21,2 18,5 23,5 23,7 25,5 24,6 22 15,3 VP1/09/887 12,5 21,3 13,8 6 19,3 16,5 18,7 22,6 23,4 14,3 VP1/09/934 32 28,3 14,2 22,7 20,05 20 17,4 23,7 18,2 25,5 17,2 VP1/10/1151 32 26,3 23,8 6 24 26,4 26,4 27,1 14 21 30,06 24,4 VP1/09/0071 14,8 12,2 12,5 6 19 18,8 15,3 24 24 14,4 VP1/09/614 15 10,03 13,2 15,3 19,3 13 8,5 27,4 26,2 17,5 VP1/09/724 30 11,6 9,8 6 26,5 20,02 26,5 14,4 17 15,5 24,5 VP1/09/754 28,1 26 14,1 23 18,7 22,6 18,3 24,5 16,1 24,7 6,3 21,8 VP1/09/109 27,1 23,5 13 6 21 20 16,1 6,2 25,5 24,6 6,3 17,6 VP1/09/656 29,6 26 12,5 6,2 23,7 19,7 15,8 26,1 27,1 6,7 17,9 VP2/09/254 16,3 12,7 12,3 6 18,7 19,2 16,7 6,5 25 24,6 6,1 15,2 76 ...PHÂN LẬP VÀ KHẢO SÁT KHÁNG SINH ĐỒ CÁC VI KHUẨN STAPHYLOCOCCUS COAGULASE ÂM TỪ MẪU BỆNH PHẨM CỦA PHÒNG VI KHUẨN HƠ HẤP VI N PASTEUR TP HỒ CHÍ MINH NĂM 2009 Tác giả Trương Thị Lệ Trâm Khóa... Phân lập khảo sát kháng sinh đồ vi khuẩn Staphylococcus coagulase âm từ cấy máu dương tính labo vi khuẩn hơ hấp, Vi n Pasteur Tp Hồ Chí Minh năm 2009 tiến hành phòng vi khuẩn hơ hấp, Khoa Vi. .. chọn kháng sinh đề chiến lược sử dụng kháng sinh hợp lý, hạn chế kháng thuốc định thực đề tài Phân lập khảo sát kháng sinh đồ vi khuẩn Staphylococcus coagulase âm từ mẫu bệnh phẩm phòng vi khuẩn