Nghiên cứu đánh giá sự đa dạng di truyền một số giống chè đặc sản trồng tại thái nguyên bằng kĩ thuật SSR

ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC LÊ QUANG THƯƠNG NGHIÊN CỨU ĐÁNH GIÁ SỰ ĐA DẠNG DI TRUYỀN MỘT SỐ GIỐNG CHÈ ĐẶC SẢN TRỒNG TẠI THÁI NGUYÊN BẰNG KĨ THUẬT SSR LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC THÁI NGUYÊN - 2014 ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC LÊ QUANG THƯƠNG NGHIÊN CỨU ĐÁNH GIÁ SỰ ĐA DẠNG DI TRUYỀN MỘT SỐ GIỐNG CHÈ ĐẶC SẢN TRỒNG TẠI THÁI NGUYÊN BẰNG KĨ THUẬT SSR Chuyên ngành: Công nghệ sinh học Mã số: 60.42.02.01 LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC Người hướng dẫn khoa học: TS HOÀNG THỊ THU YẾN THÁI NGUYÊN - 2014 i LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu chúng tơi Các số liệu kết trình bày luận văn trung thực chưa công bố cơng trình khác Mọi trích dẫn luận văn ghi rõ nguồn gốc Tác giả Lê Quang Thương ii LỜI CẢM ƠN Trước tên, xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới TS Hoàng Thị Thu Yến Giảng viên Khoa Khoa học Sự sống - Trường Đại học Khoa học - người tận tnh hướng dẫn, truyền đạt kiến thức kinh nghiệm q báu để tơi hồn thành luận văn Tôi xin cảm ơn thầy cô tập thể cán phòng thí nghiệm Khoa Khoa học Sự sống, cảm ơn lãnh đạo Trường Đại học Khoa học - Đại học Thái Nguyên giúp đỡ tạo điều kiện thuận lợi cho tơi suốt q trình học tập thực đề tài Tôi xin chân thành cảm ơn tới cán công tác Viện Khoa học sống - Đại học Thái Nguyên nhiệt tình giúp đỡ tơi q trình thực đề tài Nhân dịp xin gửi lời cảm ơn chân thành tới tập thể cán bộ, Công ty chè Sông Cầu - Huyện Đồng Hỷ - Thành Phố Thái Nguyên, nhân dân vùng chè Trại Cài - Minh Lập - Đồng Hỷ Vùng chè Tân Cương Thành Phố Thái Nguyên giúp đỡ thời gian thu thập vật liệu nghiên cứu làm đề tài Cuối cùng, tơi xin bày tỏ lòng biết ơn tới tồn thể gia đình, cảm ơn bạn bè, đồng nghiệp nhóm nghiên cứu di truyền ln cổ vũ, động viên suốt thời gian qua Tác giả Lê Quang Thương MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN ii MỤC LỤC iii NHỮNG CHỮ VIẾT TẮT v DANH MỤC CÁC BẢNG vi DANH MỤC CÁC HÌNH vii MỞ ĐẦU 1 Lý chọn đề tài Mục tiêu nghiên cứu Nội dung nghiên cứu Chương TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Cây chè 1.1.1 Nguồn gốc phân loại chè 1.1.2 Đặc điểm di truyền chè 1.1.3 Tình hình sản xuất chè giới Việt Nam 1.1.4 Đặc điểm số dòng chè trồng Thái Nguyên 1.2 Tình hình nghiên cứu đa dạng genome chè Việt Nam giới 13 1.2.1 Tình hình nghiên cứu đa dạng genome chè giới 13 1.2.2 Tình hình nghiên cứu đa dạng genome che Viêt Nam 15 1.3 Một số phương pháp sinh học phân tử sử dụng nghiên cứu tính đa dạng genome sinh vật 17 1.3.1 Kỹ thuật RFLP (Restricton Fragment Length Polymorphisms đa hình độ dài đoạn cắt giới hạn) 17 1.3.2 Kỹ thuật AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism - đa hình độ dài đoạn nhân chọn lọc) 18 1.3.3 Kỹ thuật RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) 18 1.3.4 Kỹ thuật SSR (Simple Sequence Repeat - trình tự lặp lại đơn giản) 19 Chương VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 22 2.1 Vật liệu nghiên cứu 22 2.1.1 Nguyên liệu 22 2.1.2 Hóa chất 22 2.1.3 Thiết bị 23 2.2 Phương pháp nghiên cứu 23 2.2.1 Phương pháp thu thập mẫu chè 23 2.2.2 Phương pháp tách chiết DNA tổng số 23 2.2.3 Phương pháp điện di DNA gel agarose 25 2.2.4 Phương pháp xác định hàm lượng kiểm tra độ tinh DNA tổng số 26 2.2.5 Phương pháp PCR - SSR 26 2.2.6 Phân tích số liệu 28 Chương KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 29 3.1 Tách chiết DNA tổng số từ chè 29 3.2 Phân tích thị SSR mẫu chè nghiên cứu 31 3.3 Mối quan hệ di truyền mẫu chè nghiên cứu dựa phân tch PCR - SSR 41 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 46 CƠNG TRÌNH ĐÃ CÔNG BỐ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN VĂN 47 TÀI LIỆU THAM KHẢO 48 PHỤ LỤC 53 NHỮNG CHỮ VIẾT TẮT Từ viết tắt Nghĩa tếng Việt Nghĩa tếng Anh bp Cặp base base pair đtg Cộng et al DNA Axit Deoxynucleic Deoxyribonucleic acid EDTA EDTA Ethyen Diamin Tetraacetc Acid kb Kilo base Kilobase = 1000 bp PCR Phản ứng chuỗi trùng hợp Polymerase Chain Reacton RNA Axit Ribonucleic Ribonucleic Acid TAE TAE Tris acetat EDTA VNTR VNTR Variable Number of Tandem Repeat RAPD DNA đa hình khuếch đại ngẫu nhiên Random Amplify Polymorphism DNA Primer F Mồi xuôi Primer Forward Primer R Mồi ngược Primer Reverse SSR Trình tự lặp lại đơn giản Simple Sequence Repeat Đa hình độ dài đoạn Amplified Fragment Length nhân chọn lọc Polymorphism AFLP RFLP Restricton Fragment Length EtBr Đa hình độ dài đoạn cắt giới hạn EtBr dNTP dNTP Deoxynucleoside triphosphate PIC PIC Polymorphism Informaton Content Polymorphism Ethidium Bromide DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1.1 Sản lượng chè số nước gới Bảng 1.2 Khối lượng xuất chè số nước xuất giai đoạn 2006-2010 Bảng 1.3 Diện tích, sản lượng, xuất chè Việt Nam Bảng 1.4 Cơ cấu giống chè tỉnh Thái Nguyên giai đoạn 2001 - 2010 10 Bảng 2.1 Danh sách tên đia điêm thu mâu 25 mẫu chè nghiên cứu 22 Bảng 2.2 Danh muc thiết bị, dụng cụ sử dụng 23 Bảng 2.3 Danh sách cặp mồi SSR sử dụng nghiên cứu 27 Bảng 2.4 Thành phần phản ứng PCR - SSR 28 Bảng 2.5 Chu trinh nhiêt phan ưng PCR - SSR 28 Bảng 3.1 Phổ hấp thụ DNA bước sóng 260nm 280nm nồng độ DNA tổng số 25 mẫu chè 30 Bảng 3.2 Tổng số phân đoạn DNA sản phẩm PCR - SSR với cặp mồi 32 Bảng 3.3 Số phân đoạn DNA xuất số phân đoạn DNA đa hình mồi 33 Bảng 3.4 Bảng hệ số tương đồng di truyền 25 mẫu chè nghiên cứu 42 vii DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 1.1 Hình ảnh số giống chè đặc sản trồng Thái Nguyên 10 Hình 1.2 Đa hình DNA SSR cá thể có motf (AT)n 21 Hình 3.1 Ảnh điện di DNA tổng số gel agarose 0.8% 25 mẫu chè nghiên cứu 29 Hình 3.2 Hình ảnh điện di sản phẩm SSR 25 mẫu chè với mồi YS28 34 Hình 3.3 Hình ảnh điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè với mồi YS64 35 Hình 3.4 Hình ảnh điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè với mồi YS27 36 Hình 3.5 Hình ảnh điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè với mồi YS98 37 Hình 3.6 Hình ảnh điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè với mồi YS83 37 Hình 3.7 Điện di sản phẩm PCR - SSR với mồi YTS104 38 Hình 3.8 Điện di sản phẩm PCR - SSR với mồi YS3 39 Hình 3.9 Sơ đồ quan hệ di truyền 25 mẫu chè nghiên cứu 44 45 đồng di truyền cao 0,97 Tiếp theo cặp mẫu M20 (thu thập Xã 46 Tân Cương) M22 (thu thập Xã Trại Cài) có hệ số tương đồng di truyền cao thứ hai 0,94 + Nhánh phụ II: gồm 12 mẫu lại chia thành cụm (cụm 1’ cụm 2’): - Cụm 1’: gồm mẫu chè M1, M2, M7, M8 (thu thập Công ty chè Sông Cầu), M16, M15, M17 (thu thập Xã Tân Cương) Hệ số di truyền sai khác cụm so với mẫu chè cụm 2’ 0,08 (1 - 0,92) Điều đáng ý cụm có cặp mẫu M1 M2 có hệ số di truyền tương đồng cao 0,97 - Cụm 2’: gồm mẫu M3, M4, M14, M5, M6 (thu thập Công ty chè Sông Cầu), mẫu có hệ số tương đồng di truyền 0,88 Từ kết phân nhóm trên, chúng tơi nhận thấy tính đa hình 25 mẫu chè nghiên cứu phạm vi phân tch cặp mồi SSR phản ứng PCR - SSR chứng minh cho khác cấu trúc DNA mẫu chè nghiên cứu Qua việc phân tích biểu đồ quan hệ di truyền bảng hệ số tương đồng di truyền thấy giống chè mức độ đa dạng di truyền cao thể mức độ sai khác di truyền dao động từ 0,03 đến 0,43 chứng minh sai khác cấu trúc gen mẫu chè nghiên cứu Trong 25 mẫu chè nghiên cứu thu từ địa điểm trồng chè khác (xã Tân Cương, xã Trại Cài, Công ty chè Sông Cầu) Tuy nhiên, mẫu chè từ giống thu thập từ địa điểm khác có sai khác hệ số di truyền Do đó, để tìm thị SSR đặc trưng cho giống chè cần nghiên cứu nhiều mẫu nhiều mồi 47 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ Kết luận Đã tách chiết DNA tổng số 25 mẫu chè nghiên cứu thu thập tỉnh Thái Nguyên Qua kiểm tra cho thấy, mẫu DNA tổng số tách chiết có chất lượng tốt, đảm bảo dùng thí nghiệm Với cặp mồi việc thực kỹ thuật PCR - SSR nhân 254 phân đoạn DNA từ hệ gen 25 mẫu chè nghiên cứu Trong số cặp mồi sử dụng thể tính đa hình Xây dựng sơ đồ quan hệ di truyền cho thấy 25 mẫu chè nghiên cứu chia thành nhóm chính, hệ số tương đồng di truyền nhóm 57% Kiến nghị Cần kết hợp thị SSR với thị phân tử RFLP, AFLP, RAPD thị hình thái… để phân tích đa dạng di truyền mẫu chè nhằm đạt độ tn cậy cao hơn, mở rộng nghiên cứu đa dạng di truyền giống địa phương nhằm phục vụ công tác bảo tồn nguồn gen chè 48 CƠNG TRÌNH ĐÃ CƠNG BỐ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN VĂN Hoàng Thị Thu Yến, Lê Quang Thương, Dương Thị Nhung, Hà Thị Loan (2014), "Nghiên cứu thị phân tử SSR số giống/dòng chè trồng Thái Ngun", Tạp chí khoa học & cơng nghệ Thái Nguyên, tập 120, số 06, tr 93-99 49 TÀI LIỆU THAM KHẢO TÀI LIỆU TIẾNG VIỆT Lê Trần Bình, Hồ Hữu Nhị, Lê Thị Muội (1997), Cơng nghệ sinh học cải tiến giống trồng, NXB Nông nghiệp Đường Hồng Dật (2004), Cây che cac biên phap nâng cao suât va chât lương san phâm, NXB Lao đông - Xã hội, tr:5-53 Chu Thúc Đạt (2003), Đánh giá tiềm phát triển chè nghiên cứu đặc điểm sinh trưởng, phát triển, suất chất lượng số giống chè Thái Nguyên, Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Trịnh Đình Đạt (2007), Cơng nghệ sinh học - tập 4, NXB Giáo dục Hiệp hội chè Việt Nam (2011), “Báo cáo Tổng kết công tác năm 2010 phương hướng công tác năm 2011” Nguyễn Thị Thu Hương, Nguyễn Thị Thu Phương, Hoàng Văn Chung, Hoàng Thị Thu Yến (2010), “Bước đầu nghiên cứu đa dạng di truyền số dòng chè Shan (Camellia sinensis var Assamica (Mast) Pierre sec Phamh) kỹ thuật RAPD”, Tạp chí Khoa học Cơng nghệ Thái Ngun, 65, tr:149-157 Lê Tất Khương (1997), Nghiên cứu đặc điểm sinh trưởng, phát triển số giống chè biện pháp kĩ thuật nâng cao suất chất lượng chè vụ Đông - Xuân Bắc Thái, Luận án PTS Khoa học Nông nghiệp Lê Tất Khương, Hồng Văn Chung, Đỗ Ngọc Oanh (1999), Giáo trình chè, NXB Nông nghiệp Nguyễn Hữu La, Lê Trần Bình (2004), “Nghiên cứu đa dạng di truyền số dòng chè Shan Phú Hộ thị RAPD”, Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển Nơng thơn, 10, tr:31-33 50 10 Nguyễn Hữu La (1998), “Thu thập, bảo quản, đánh giá tập đoàn giống chè Phú Hộ”, Tuyển tập cơng trình nghiên cứu chè 1988 - 1997, Nhà xuất Nông nghiệp, tr:191-207 51 11 Trân Đinh Long , Mai Hoang Thach , Hồng Tuyết Minh (1997), Chọn giơng trơng, Giáo trình cao học Nơng Nghiệp, NXB Nơng nghiêp 12 Lã Tuấn Nghĩa, Vũ Đức Quang, Trần Duy Quý (2004), Cơ sở lý thuyết ứng dụng công nghệ gen chọn tạo giống trồng, NXB Nông nghiệp 13 Đỗ Ngọc Quý , Đỗ Thị Ngọc Oanh (2008), Ky thuật trồng chế biến chè suất cao - chât lương tôt, NXB Nông nghiêp, tr:7-66 14 Đỗ Ngọc Quý, Lê Thât Khương (2000), Giáo trình chè sản xuất, chê biên va têu thu, NXB Nông nghiêp 15 Vũ Thị Quý (2013), “Nghiên cứu đặc điểm nông sinh học biện pháp ky thuật canh tác cho số giống chè nhập nội Thái Nguyên”, Luận án Tiến sĩ nông nghiệp, tr:70-71 16 Trần Đức Trung (2009), “Nghiên cứu đa dạng di truyền giống/ dòng chè (Camellina sinensis(L.)O Kuntze) Việt Nam thị hình thái thị phân tử microsatellite(SSR)”, Luận văn Thạc sĩ, Trường Đại học Bách khoa Hà Nội TÀI LIỆU TIẾNG ANH 17 Chen L., Yamaguchi S (2005), “RAPD markers for discriminatng tea germplasms at the inter-specific level in China”, Plant Breeding, 124, pp:404-409 18 Dikshirt H.K., Jhang T., Kondal N.K., Bansal K.C., Chandra N., Tickoo J.N., Ksharma T.R (2006), “Genetic diferentantion of Vigna specie by RAPD, URP and SSR marker”, Biology Plantarum journal, pp:451-457 19 Holton T.A (2001), “Plant genotyping by analysis of microsatellite”, Plant Genotyping: the DNA fingerprinting of plant, CAB International 20 Innis M.A., Gelfand D.H., Sninsky J.J., White T.J (1990) ,“PCR protocol: Aguile to methods and ampilicaton” Academic Press, pp:482 21 Jefrey A., Thompson, Nelson R.L (1998), “Identification of diverse soybean germplasm using RADP markers”, Crop Sci, pp:1348-1355 50 22 Kondo K (1979), “Cytological studies in cultivated species of camellia”, Japan J Breed, 29(3), pp:205-210 23 Lee S., Kim J., Sano J (2003), “Phylogenetc relationships among tea cultivars based on AFLP analysis”, Journal of Faculty of Agriculture, Kyushu University, 47(2), pp:289-299 24 Legesse B.W., Myburg A.A., Pixley K.V., Botha A.M (2007), “Genetic diversity of African maize inbred lines revealed by SSR markers”, Hereditas, 144(1), pp:10-17 25 Ma J.Q., Zhou Y.H., Ma C.L., Yao M.Z., Jin J.Q., Wang X.C., Chen L (2010)“ identificaton and characterization of 74 novel polymorphic EST - SSR markers in the tea plant, Camellia sinensis (Theaceae)”, American Journal of Botany: 97(12), pp:153-156 26 Miranda O.K., Rios L.P., Augusto F.G.A., Zagatto Paterniani M.E., de Souza A.P (2004), “Evaluating genetic relationships between tropical maize inbred lines by means of AFLP profiling”, Hereditas, 140(1), pp:24-33 27 Mishra R.K., Mandi S.S (2004), “Molecular profiling and development of DNA marker associated with drought tolerance in tea clones growing in Darjeeling), Current Science, 87 (1), pp:60-66 28 Mondal T.K (2004), “Biotechnological improvement of tea”, ISB new report 29 Qilun Y., Kecheng Y., Guangtang P., Tingzhao R (2007), Genetic Diversity of Maize (Zea mays L.) Landraces from Southwest China Based on SSR, Genetic Diversity of Maize (Zea mays S.) Landraces from Southwest China Based on SSR, 34(9), pp:851-860 30 Raina S.N.V., Kojima T., Ogihara Y., Singh K.P., Devarumath R.M (2001), “RAPD and SSR figerprints as useful genetic marker for analysis of genetic diversity, varietal identfication, and phylogenetic relationships in peanut (Arachis hypogaea L.) cultrs and wild species”, Genome, 44(5), pp:763-772 51 31 Sain S.M., Priyadarshan, P.M., (2009), Breeding Plantation Tree Crops: Tropical Species, pp:545-589 32 Scott K.D (2001), “Microsatellite derived from ESTs, and their comparison with those derived by other methods”, Plant Genotyping: the DNA fingerprinting of plant, CAB International 33 Sharma R.K., Bhardwaj P., Negi R., Mohapatra R., Ahuja P.S (2009), “Identification characterization and utilization of unigene derived microsatellite markers in tea (Camellia sinensis L.)”, BioMed Central, pp:7-12 34 Sharopova N., McMullen M.D., Schultz L., Schroeder S., SanchezVilleda H., Gardiner J., et al (2002) “Development and mapping of SSR markers for maize”, Plant Mol Biol 48(5-6), pp:463-481 35 Singh D., Ahuja P.S (2006), “5S rDNA gene diversity in tea (Camellia sinensis (L.) O Kuntze) and its use for variety identification”, Genome, 49, pp:91-96 36 Somasundaram S.T, Kalaiselvam M (2007), Molecular tool for assessing genetic diversity 37 Tanaka J., Taniguchi F (2006), “Estimation of genome size of tea (Camellia sinensis), Camellia (C japonica), and their interspecific hybrids by flow cytometry”, Chagyo Kenkyu Hokoku, 101, pp:1-7 38 Tautz D (1993), “Notes on the difinition and nomenclature of tandemly repetitive DNA sequences”, DNA fingerprinting: State of science, Birkhauser, Switzerland, pp:21-28 39 Trojanowska M.R., Bolibok H (2004), “Characteris and comparison of three classes of microsatellite-based markers and their application in plants”, Cellular & molecular biology letters, 9, pp:221-238 40 Ujihara T., Ohta, R., Hayashi, N et al (2009), “Identfiaction od Japanese and Chinese green tea cultivars by using simple sequence repeat markers to encourage proper labeling”, Biosci Biotechnol Biochem., 73 (1), pp:15-20 52 41 Welsh J., McClelland M (1990), "Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primer", Nucleic Acids Res, 18, pp:7213-7218 42 Wen S.C., Huan, H.Y et al (2008), “RAPD analysis on genetic diversity of typical tea population in Hunan Province, China”, Journal of Agricultural Biotechnology, 5, (1), pp:67-72 43 William J.G.K, Kubelik A.E., Levak K.J., Rafalski J.A., Tingey S.V (1990), “DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic merers”, Nucleic Acids Res, 18, pp:6531-6535 44 Yao M.Z, Chen L., Liang Y.K (2008), “Genetc diversity among tea cultivars from China, Japan and Kenya revealed by ISSR markers and its implication for parental selection in tea breeding programmes”, Plant Breeding, 127 (2), pp:166-172 53 Phụ lục Bảng Số phân đoạn DNA nhân điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè nghiên cứu với mồi YS28 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) YS28 M1 M2 M3 M4 M5 M6 M7 M8 M9 290bp 0 0 0 0 0 0 300bp 1 0 0 1 1 1 310bp 0 1 0 0 0 0 320bp 0 0 1 0 0 0 Tổng 1 1 1 1 1 1 YS28 M14 M15 M16 M17 M18 M19 M10 M11 M12 M13 M20 M21 M22 M23 M24 M25 290bp 0 0 1 0 0 0 300bp 1 0 1 1 0 310bp 0 0 0 0 0 320bp 0 0 0 0 0 1 Tổng 1 1 1 1 1 1 Bảng Số phân đoạn DNA nhân điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè nghiên cứu với mồi YS64 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) YS64 M1 M2 M3 M4 M5 M6 M7 M8 M9 270bp 0 0 0 0 0 0 280bp 1 0 0 1 300bp 0 1 1 0 310bp 0 0 0 0 0 1 Tổng 1 1 1 1 1 2 YS64 M14 M15 M16 M10 M11 M12 M13 M17 M18 M19 M20 M21 M22 M23 M24 M25 270bp 0 0 1 0 0 0 280bp 0 0 1 1 1 300bp 1 0 0 0 0 310bp 0 0 0 0 0 0 Tổng 1 1 1 1 1 1 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) 54 Bảng Số phân đoạn DNA nhân điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè nghiên cứu với mồi YS27 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) YS27 M1 M2 M3 M4 M5 M6 M7 M8 M9 130bp 0 0 0 0 0 0 140bp 0 0 0 0 1 1 150bp 1 1 1 1 0 0 180bp 0 0 1 1 1 Tổng 1 1 2 2 2 YS27 M10 M11 M12 M13 M14 M15 M16 M17 M18 M19 M20 M21 M22 M23 M24 M25 130bp 0 0 0 0 0 140bp 0 0 1 1 1 150bp 1 1 0 0 0 180bp 0 0 0 0 0 0 Tổng 1 1 1 1 1 1 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) Bảng Số phân đoạn DNA nhân điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè nghiên cứu với mồi YS98 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) YS98 M1 M2 M3 M4 M5 M6 M7 M8 M9 240bp 1 1 1 1 1 1 590bp 0 0 0 0 0 600bp 1 1 1 1 1 Tổng 2 2 2 2 2 2 YS98 M10 M11 M12 M13 M14 M15 M16 M17 M18 M19 M20 M21 M22 M23 M24 M25 240bp 1 1 1 1 1 1 590bp 0 0 0 0 0 600bp 1 0 1 0 Tổng 2 2 2 1 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) 55 Bảng Số phân đoạn DNA nhân điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè nghiên cứu với mồi YS83 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) YS83 M1 M2 M3 M4 M5 M6 M7 M8 M9 290bp 300bp 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 320bp 0 1 0 0 1 Tổng 1 1 1 1 1 1 M23 M24 M25 YS83 M14 M15 M16 M17 M18 M19 M20 M21 M22 M10 M11 M12 M13 290bp 0 0 1 0 0 0 300bp 1 0 1 1 0 320bp 0 0 0 0 1 Tổng 1 1 1 1 1 1 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) Bảng Số phân đoạn DNA nhân điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè nghiên cứu với mồi YTS104 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) YTS104 M1 M2 M3 M4 M5 M6 M7 M8 M9 M10 280bp 0 0 0 0 0 0 290bp 0 0 0 0 0 0 300bp 0 0 0 1 1 1 310bp 1 1 1 0 0 0 320bp 0 0 0 0 0 0 Tổng 1 1 1 1 1 1 YTS104 M14 M15 M16 M17 M18 M19 M20 M21 M22 M23 M11 M12 M13 M24 M25 280bp 0 0 0 0 0 0 290bp 0 0 0 0 0 300bp 1 1 0 1 310bp 0 0 0 0 0 0 320bp 0 0 0 1 1 Tổng 1 1 1 1 1 1 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) 56 Bảng Số phân đoạn DNA nhân điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè nghiên cứu với mồi YS3 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) YS3 M1 M2 M3 M4 M5 M6 M7 M8 M9 120bp 1 1 1 1 0 0 140bp 0 0 0 0 1 1 160bp 0 0 0 0 0 0 Tổng 1 1 1 1 1 1 YS3 M10 M11 M12 M13 M14 M15 M16 M17 M18 M19 M20 M21 M22 M23 M24 M25 120bp 1 1 0 0 0 140bp 0 0 1 1 1 160bp 0 0 0 0 Tổng 1 1 1 1 1 1 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) Bảng Số phân đoạn DNA nhân điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè nghiên cứu với mồi YS19 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) YS19 M1 M2 M3 M4 M5 M6 M7 M8 M9 370bp 0 0 0 0 0 380bp 0 0 0 0 0 0 390bp 0 0 1 0 400bp 0 1 0 0 1 Tổng 1 1 1 1 1 1 YS19 M14 370bp 0 0 0 0 0 0 380bp 0 0 0 0 0 390bp 0 1 0 0 400bp 1 0 0 1 Tổng 1 1 1 1 1 M10 M11 M12 M13 M15 M16 M17 M18 M19 M20 M21 M22 M23 M24 M25 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) 57 Bảng Số phân đoạn DNA nhân điện di sản phẩm PCR - SSR 25 mẫu chè nghiên cứu với mồi YS46 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) YS46 M1 M2 M3 M4 M5 M6 M7 M8 M9 190bp 0 0 0 0 0 200bp 1 1 1 1 1 1 220bp 0 0 0 0 0 0 310bp 0 0 0 0 0 0 Tổng 1 1 1 1 1 1 YS46 M10 M11 M12 M13 M14 M15 M16 M17 M18 M19 M20 M21 M22 M23 M24 M25 190bp 0 0 0 0 0 200bp 0 0 1 1 220bp 1 0 0 0 0 310bp 0 0 0 Tổng 1 1 2 (M1 - M25: Các mẫu nghiên cứu theo thứ tự bảng 2.1) ...ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC LÊ QUANG THƯƠNG NGHIÊN CỨU ĐÁNH GIÁ SỰ ĐA DẠNG DI TRUYỀN MỘT SỐ GIỐNG CHÈ ĐẶC SẢN TRỒNG TẠI THÁI NGUYÊN BẰNG KĨ THUẬT SSR Chuyên ngành: Công... đặc sản làm vật liệu chọn giống vấn đề quan tâm nghiên cứu Xuất phát từ lý trên, tiến hành thực đề tài Nghiên cứu đánh giá đa dạng di truyền số giống chè đặc sản trồng Thái Nguyên kĩ thuật SSR ... Mục têu nghiên cứu Phân tch thị SSR mẫu chè nghiên cứu số giống chè đặc sản địa phương Xác định khoảng cách di truyền số giống chè đặc sản địa phương trồng Thái Nguyên Nội dung nghiên cứu - Thu