Đề cương ôn tập hóa sinh đại cương

ĐỀ CƯƠNG ƠN THI HẾT HỌC PHẦN MƠN: Hóa sinh đại cương Học kỳ II năm học 2012-2013 Chƣơng I PROTEIN Định nghĩa protein Định nghĩa: Về mặt hoá học: protein polymer sinh học cao phân tử cấu tạo monomer α-amino acid liên kết với liên kết peptide không tan trichloracetic acid (TCA) 10% Về mặt sinh hoc: protein chất hữu Chức sinh học: Xúc tác Vận chuyển Dinh dưỡng dự trữ Vận động Cấu trúc Bảo vệ Điều hòa Cung cấp lượng Cấu tạo protein: Thành phần nguyên tố (% VCK) H: 6.5-7.3% C: 50-55% P, Fe, Cu,Zn… O: 21-24% N: 15-18%(TB 16%) S: 0.3-2.5% Thế acid amin? Phân loại acid amin? Acid amin: Đơn vị cấu tạo protein Dẫn xuất acid hữu cơ, H Cđược thay nhóm amin (NH2) gọi aminoacid Phân loại acid amin - Theo độ phân cực gốc R - Theo cấu tạo hóa học gốc R - Theo quan điểm dinh dưỡng Theo độ phân cực gốc R Không phân cực (kỵ nước) : Glycine, Alanine, Leucine, Trytophane, Isoleucine, Methionine, Proline, Phenylalanine, Valine Theo quan điểm dinh dưỡng Phân cực(ưa nước) : Glutamine, Acid glutamic, Arginine, Cysteine, Acid aspartic, Asparagine, Threonine, Tyrosine, Serine, Lysine, Histidine AA thiết yếu (không thay thế): Động vật, VSV tự tổng hợp AA không thiết yếu (thay thế) Động vật, VSV tổng hợp Peptide thuyết polypeptide Peptide Peptide chuỗi aa l/kết với l/kết peptide L/kết peptide l/k đồng hoá trị, hình thành nhờ loại nước (ngưng tụ) nhóm α-COOH AA đứng trước với nhóm α-NH2 AA sau H a i a a n ố i v i n h a u → l / k p e p t i d e e → → d i p e p t i d e B a a a n ố i v i n h a u → t r i p e p t i d e M ộ t s ố a a l / k ế t v i l / k p e p t i d n h a u → o l i g o p e p t i d e Chuỗi polypeptide có aa đầu: Đầu chứa NH+3 tự gọi aa đầu N mang số 1, aa số 2, 3, 4, … AA cuối chứa nhóm COO- tự aa đầu C Phản ứng đặc trưng liên kết peptide pứ biure Thuyết polypeptide cấu tạo phân tử protein Danhilepsky (1988): Liên kết –CO – NH – đóng vai trò quan trọng cấu tạo protein Fisher (1990): khẳng định tồn liên kết –CO – NH – (gọi lk peptide), đề thuyết polypepti de c/tạo ph/tử protein: “Ph/tử protein nhiều chuỗi polypepti de khổng lồ, tạo nên từ hàng chục hàng trăm gốc aa nối với lk peptide” Các thí nghiệm chứng minh thuyết peptide Protein trạng thái ngun vẹn có nhóm NH2 COOH tự Khi protein bị thủy phân, nhóm NH2 COOH tạo với tỷ lệ 1/1 Protein tham gia phản ứng Biure protein có lk peptide Bản chất polypeptide protein khẳng định tổng hợp protein (insulin từ 51 aa, ribonuclease từ 124 aa) Phương pháp nhiễu xạ tia X: chuỗi polypeptide, aa xếp liên tục đặc trưng cho phân tử protein Cấu trúc bậc 1, bậc 2, bậc 3, bậc protein? Cấu trúc bậc Khái niệm: Trình tự số lượng aa chuỗi polypeptide protein, giúp ph/biệt protein với protein Trình tự số lượng aa định: T ín h đặ c hi ệu , ch ức nă ng si nh h ọ c c ủ a p r o t e i n : p r o t e i n l e n z y m e , h o r m o n , p r o tei n cấ u trú c E coli có ~ 3000, người 50.000 100.000 protein có cấu trúc khác thực chức sinh học khác Cấu trúc không gian ba chiều protein chức protein Trình tự aa mã di truyền định di tryền sv tryền lại cho đời sau cb1 prtein Qui ước nhóm amin bên trái đánh số thứ tự aa từ trái sang phải chuỗi polypeptide Liên kết định cấu trúc bậc liên kết peptide Ở ph/tử có nhiều chuỗi, ngồi lk peptide có lk disulfide, lk hydro lk ion, để gắn chuỗi lại với Ý nghĩa cấu trúc bậc protein: ấu trúc bản, quan trọng định: ất protein ấn đề nòi giống, phẩm chất, khả khángbệnh… ố lượng trình tự aa chuỗi đặc tính sinh học protein: ỗi lồi, mơ bào thể, thành phần TB có protein có cấu trúc chức đặc hiệu tương ứng Sự thay đổi cấu trúc → thay đổi hoạt tính chức ố lượng aa chuỗi polypeptide q/định TLPT ự xếp aa l{ tạo cho giới SV có số lượng kiểu protein khổng lồ mà xuất phát từ 20 loại - aa ự thay đổi trình tự xếp aa dẫn đến trường hợp bệnh l{ VD điển hình: bệnh hồng cầu hình lưỡi liềm Hb cấu tạo từ chuỗi chuỗi Ở người bệnh, aa thứ chuỗi Glu thay Val Ở loài khác nhau, protein thực chức sinh học có cấu trúc khác – hormone gồm chuỗi: chuỗi A (21 aa) chuỗi B (30 aa) Ở lồi khác nhau, aa vị trí 8; 10 chuỗi A không giống Cấu trúc bậc Khái niệm: Là tương tác không gian gốc aa gần hay cạnh đoạn chuỗi, mô tả cấu trúc không gian bên phần phân tử Gồm dạng: xoắn α gấp nếp β Xoắn α Chuỗi polypeptide cuộn lại theo hình lò xo -> bước xoắn Mạch lk peptide chuỗi polypeptide xếp thẳng đứng x/quanh trục ph/tử, R aa đẩy vòng ngồi trục xoắn chuỗi Một vòng xoắn có 3,6 gốc aa; kh/cách hai gốc aa cạch 1,5 A°; chiều cao bước xoắn 5,4 A° Sự tồn bước xoắn nhờ l/kết hydro; hình thành – CO- aa với –NH aa đứng trước gốc aa Đặc trưng cho proteindạng cầu: protein cơ, máu; trứng, sữa Gấp nếp β - Gấp nếp có cấu trúc hình dạng tấm, chuỗi polypeptide duỗn thẳng - Khoảng cách aa cạnh theo đường trục 3,5A° (1,5A° xoắn α) - Gấp nếp ổn định nhờ lk hydro nhóm –NH- –CO- chuỗi - polypeptide khác (hoặc đoạn khác chuỗi) - Thường gặp protein dạng sợi protein tơ tằm, xương sống - Trong cấu hình gấp nếp , chuỗi polypeptie nằm song song đối song song - Các protein dạng sợi có dạng ctb2, protein hình cầu (enzyme, protein v/c, số hormone immunoglobulin) lại kết hợp nhiều dạng ctb2 ph/tử Cấu trúc bậc Khái niệm: Là tương tác khơng gian đoạn chuỗi có ctb2 hồn chỉnh phân tử có hình dáng ổn định đặc trưng Có tương tác xa gốc aa ctb1 Các aa xa chuỗi polypeptide (ctb1), lại gần kh/gian ctb3 Là xếp vừa xoắn vừa gấp khúc cách dày đặc chuỗi polypeptie Đặc thù cho loại protein th/hợp cho việc th/hiện ch/năng ph/tử protein Các lực (tương tác, liên kết) ổn định cấu trúc bậc Có hai loại: kết hydro (cộng hoá trị) liên kết yếu: tác kỵ nước kết ion (tĩnh điện, muối) ực Van der Waal Ý nghĩa cấu trúc bậc protein: Nhờ Tiềnctb3, chuỗi bố cục gọn không gian ổn định mt TB ởđề tạo nên TTHĐ protein ch/năng (enzyme, KT…) enzyme, TTHĐ: nơi gắn c/chất xảy pứ hh; tạo thành từ số nhóm chức gốc aa bình thường cách xa chuỗi, gầnnhau kh/gian nhờ cuộn lại, gấp nếp lại chuỗi (ctb3) để ph/hợp thực c/n x/tác Cấu trúc bậc Khái niệm: tụ hợp lại chuỗi có ctb3 hoàn chỉnh tạo thành tổ hợp phức tạp nhằm thực chức sinh học protein oligomer hay multimer thường có nhiều chuỗi loại hay khác loại l/k với ợng lk disulfide Các monomer (chuỗi) gắn kết với chủ yếu nhờ lk yếu vùng gọi giao diện bổ sung VD: Kháng thể, Hb Ý nghĩa cấu trúc bậc protein:  Giúp cho c/thể SV kh/năng điều tiết linh hoạt Những qt h/hoá hay ức chế (khoá enzyme, khoá hormone…) thực thông qua việc t/động lên ctb4  VD: Glycogen phosphorylase (ph/giải glycogen) Chƣơng III ENZYME Khái niệm enzym, ƣu nhƣợc điểm enzym? Khái niệm: Enzyme: chất xúc tác sinh học (biocatalyst), làm tăng tốc độ phản ứng hoá sinh Bản chất: protein (trừ ribozyme - ARN có khả xúc tác) Ưu điểm : Làm tăng tốc độ phản ứng, không tham gia vào sản phẩm cuối - Hiệu xúc tác lớn: Ví dụ, 2H2O2 2H2O + O2 - Không xúc tác, số t.độ ph.ứng 0,23/s, NLHH: 18kcal/mol - Pt xúc tác: 1,3 x 103/s; NLHH: 11,7kcal/mol - catalase xúc tác: 3,7.107/s; NLHH: 2kcal/mol - Có tính đặc hiệu theo kiểu phản ứng chất - Xúc tác điều kiện môi trường tương đối ổn định (to khoảng 20- 40o C, áp suất khoảng at, pH = 7) - Tác dụng enzyme điều khiển Nhược điểm: - Rất mẫn cảm với hàng loạt yếu tố - Thường xuyên sử dụng nhiều, bị phân giải tổng hợp trở lại theo nhu cầu Các cofactor, nhóm ghép, coenzym? Phân loại enzyme theo kiểu phản ứng Lớp 1:Oxidoreductase - Bản chất: protein ph.tạp - Vận chuyển: hydro, e-, gắn oxy vào chất - Phân thành cácphân lớp theo nhóm chức nhừờng hydro hay e- Lớp lớn - Xúc tác cho phản ứng oxy hoá khử Lớp 2: Transferase - Bản chất: protein ph.tạp - Phân thành phân lớp theo nhóm vận chuyển - Vận chuyển nhóm (CH3, NH2, vv…) Lớp 3: Hydrolase - chất: protein đơn giản - Thuỷ phân liên kết vốn hình thành nhờ ngƣng tụ nhƣ peptide, glycoside, ester … - Xúc tác chocác phản ứng thuỷ phân Lớp 4: Liase (synthase) - Bản chất: protein phức tạp - Phân thành phân lớp theo kiểu l/kết h/học đƣợc ph/giải hay tạo thành - Xúc tác cho phản ứng: phân giải (khơng thuỷ phân) hình thành (khơng đòi hỏi NL) VD liên kết C- C, C- O, C- N, vv… Lớp 5: Isomerase - Bản chất: protein đơn giản - Vận chuyển:các ng/tử hay nhóm ng/tử nội ph/tử - Lớp nhỏ - Xúc tác cho phản ứng đồng phân hoá Lớp 6: Ligase (Synthetase) - Bản chất: protein phức tạp hình thành nên l.kết nhờ tiêu tốn n.lựợng (VD: ATP) - Xúc tác cho q.trình sinh tổng hợp Tên gọi số cofactor thuộc lớp oxidoreductase, transferase? a Oxidoreductase  NAD+ (Nicotinamid–Adenine-Dinucleotid) – Vit PP  NADP+ (Nicotinamid-Adenine-Dinucleotid-Phosphate) – Vit PP  FMN (Flavin - Mononucleotid) – Vit B2  FAD (Flavin – Adenine – Dinucleotid) – Vit B2  Lipoate (6,8 dithioctanate)  Coenzyme Q  Hem b Transferase  ATP (Adenosine Triphosphate)  TPP (thiamine pyrophosphate) – Vit B1  PLP (pyridoxal phosphate) – Vit B6  Coenzyme A, CoASH (coenzyme acyl hoá) Trung tâm hoạt động gì? Trung tâm hoạt động làm nhiệm vụ gì? a Khái niệm Vùng khơng gian giới hạn nhỏ, chứa nhómchức đƣợc phân bố, định hướng mộ t cách xác Các nhóm chức thành phần gốc aa xa chuỗi polypeptide, song lại gần không gian nhờ cuộn lại, gấp nếp lại chuỗi (nhờ ctb 3) – Ở enzyme phức tạp có coenzyme, TTHĐ có vùng liên kết với coenzyme • Là nơi gắn chất, chứa nhóm chức góp phần trực tiếp vào việc cắt đứt hay hình thành liên kết để tạo sản phẩm b Nhiệm vụ trung tâm hoạt động - Nhiệm vụ nhóm chức · Một số nhóm xúc tác tích cực (tạo vùng xúc tác) · Một số nhóm gắn chất (tạo vùng liên kết · Một số nhóm tạo mơi trƣờng cấu trúckhơng gian thích hợp cho TTHĐ c Đặc điểm TTHĐ · E có 1; hay nhiều TTHĐ CácTTHĐ p.tử E giống nhau,song có t hể khác c/tạo c/n, p.tử E xt nhiều p.ứ h.học khác · Chỉ S đ/hiệu, có c/trúc p.tử thích hợp với TTHĐ E tạo đƣợc ph/hợp E-S q/trình xt xảy S đƣợc gắn vào TTHĐ E Các nhóm chức thuộc trung tâm hoạt động? Các nhóm chức năng: – :OH Ser – :SH Cys – COOH Glu Asp – Vòng imidazol His – NH2 Lys Thế tổ hợp đa enzym? Ý nghĩa tổ hợp đa enzym? a Tổ hợp đa enzym · Nhiều p.tử E chuỗi polypeptide (đơn nguyên) · Nhiều E có ctb4, nhiều chuỗi tổ hợp lại Đây E đa nguyên (oligomer) Các E thay đổi h.tính xt chuỗi tách rời · Phần lớn E hđ theo dây chuyền p.ứ tổ hợp đa E (SP p.ứ E S cho p.ứ E tiếp theo) – VD: Tổ hợp pyruvate dehydrogenase – Tổ hợp đa enzyme t/hợp acid béo b Ý nghĩa tổ hợp đa enzym · C/trúc bậc cao E tạo t/chất mà c/trúc bậc thấp khơng có · P.tử có nhiều tiểu phần tạo k/n đ.khiển hoạt tính x/t cách l/hoạt h/quả · Tạo đ.k để S b/đổi nhiều mức (trình tự dây chuyền sx) – SPTG chuyển từ TTHĐ sang TTHĐ tiếp theo, không bị g/ph khỏi kh/vực p.ứ – SPTG không dồn đống lại, q.t xt xảy nhanh Thế trung tâm dị lập thể? Định vị AA2-tRNA khu A Tạo liên kết peptide Chuyển vị Yếu tố tham gia trình tổng hợp protein? Bản chất yếu tố, vai trò yếu tố? Chƣơng VI CARBONHYDRAT Vai trò carbonhydrat? - Cung cấp dự trữ lượng • Cung cấp 60-70% nhu cầu lượng thể • Đối với loài nhai lại: carbohydrate nguồn cung cấp lượng - Cấu trúc • Ở thành tế bào vi khuẩn, thành tế bào thực vật tế bào mơ liên kết động vật, carbohydrate khơng tan đóng vai trò yếu tố cấu trúc ất quan trọng cấu trúc màng, tạo yếu tố định tính kháng ngun màng - Bảo vệ • Glucose glucoronic acid chất khử độc số thể • Heparin (glycosaminoglycan) chống đơng máu • Hyaluronic acid có hoạt dịch khớp thuỷ tinh dịch mắ ảm ma sát • học Thế monosaccharide? Kể tên số monosaccharide quan trọng? a Định nghĩa monosaccharide: – Monosaccharide hay gọi đường đơn carbohydrate đơn giản với hai hay nhiều nhóm hydroxyl – Tuỳ theo số lượng carbon mà monosaccharide chia thành: • Triose(3C) • Tetrose(4C) • Pentose(5C) • Hexose(6C)… b Một số monosaccharide quan trọng • Triose: D-glyceraldehyde dihydroxyacetone SPTG chuyển hóa carbohydrate • Pentose: Ribose deoxyribose pentose quan trọng th/gia c/tạo nucleic acid • Hexose: – D-glucose – D-fructose – D-galactose • D-glucose: phổ biến tự nhiên, th/phần c/tạo nhiều loại oligosaccharide polysaccharide – Có mặt khắp dịch mơ bào thể đ/vật, chất ch/hóa chủ yếu carbohydrate người đ/vật • D-fructose: – Có nhiều chín – Cùng với glucose, fructose SPTG nhiều đường TĐC q/trọng (đường phân, chu trình pentose, … ) – Trong thể thường tồn dạng β-D-fructofuranose • D-galactose: th/phần c/tạo lactose (đường sữa) Kể số oligosaccharide ? • Một số disaccharide phổ biến : Maltose, Lactose, Saccharose (sucrose) Sự giống khác tinh bột, glycogen, xenlulozo? a Tinh bột • Có nhiều hat, củ, • Cấu tạo: – Đơn phân phân tử -D-glucose liên kết - 1,4 glucoside gồm mạch thẳng mạch nhánh: – Amylose (20%) amylopectin (80%) liên kết - 1,6 glucoside • Khơng có tính khử b Glycogen Là polysaccharide dự trữ tế bào động vật Cấu tạo: tương tự tinh bột số lượng nhánh nhiều – ¼ lượng glycogen thể người dự trữ cơ, tế bào glycogen chiếm khoảng 1% c Xenlulozo – – – Là thành phần thành tế bào thực vật – Cấu tao: đơn phân phân tử -D- ế -1,4 glucoside – Loài ăn cỏ động vật nhai lại (nhờ trình lên men) mối tiêu hố cellulose chúng có hệ vsv có khả phân giải cellulose Tổng hợp glycogen, phân giải glycogen? a Tổng hợp Glycogen • Diễn hầu hết mô bào động vật đặc biệt gan vân • Ở gan: glycogen đóng vai trò dự trữ glucose, đảm bảo mức định glucose máu • Ở ờng đường phân) ATP cho hoạt động b Phân giải glycogen • Ở cơ: tế bào hoạt động • Ở gan: glycogen glucose cung cấp cho hoạt động tế bào điều hoà hàm lượng đường huyết đặc biệt thời điểm xa bữa ăn Phƣơng trình tổng quát trình đƣờng phân? Quá trình đường phân – Các giai đoạn trình diễn bào tương – Có thể hoạt động tế bào có hay khơng có oxy Glycolysis Glucose + 2ATP + 2NAD+ 4ADP + Pi pyruvate + 2ADP + 2NADH + 2H+ + 4ATP +2H2O NAD+ phải tái tổng hợp trình đường phân tiếp tục Phƣơng trình sử dụng ATP? Phƣơng trình tổng hợp ATP? Phƣơng trình tạo hydro cao dạng NADH + H+ 10 Các đƣờng hƣớng chuyển hóa pyruvat? a Chuyển hố pyruvate điều kiện yếm khí - Lên men lactic - Lên men rượu b Chuyển hố pyruvate điều kiện hiếu khí c Chuyển hố pyruvate điều kiện yếm khí - Lên men lactic 11 Phƣơng trình lên men lactic, rƣợu? a Lên men lactic b Lên men rượu 12 Chuyển hóa pyruvat điều kiện hiếu khí? • Pyruvate chuyển vào ty thể,ở bị khử carboxyl oxy hố hồn tạo thành acetyl CoA đốt cháy hồn tồn chu trình Krebs 13 Chu trình kreb từ acetyl CoA tạo ? ATP, ? NADH+ H+, FADH2 14 Ý nghĩa đƣờng pentozo photphat? Ý nghĩa • Các tế bào có phân chia mạnh như: tuỷ xương, da, tế bào niêm mạc ruột non sử dụDNA, RNA, ATP, coenzymes: NADH, FADH2 CoA • NADPH cần thiết cho nhiều q trình sinh tổng hợp ngăn cản tổn thương tế bào gốc oxygen gây – VD: tế bào hồng cầu mắt tăng cường khử NADPH thành NADP+ tạo glutathione dạng oxy hoá ngăn cản tổn thương phân tử protein, lipid • Gan, mô mỡ, tuyến vú (tổng hợp acid béo mạnh) gan, tuyến thượng thận, tuyến sinh dục (tổng hợp cholesterol, hormone steroid) cần NADPH Chƣơng VII LIPID Khái niệm lipid? Vai trò lipid? Tên gọi acid béo khơng no( cần thiết)? a Khái niệm Nhóm chất hữu đa dạng mặt hóa học Khơng tan nước, tan dung môi hữu không phân cực (ether, clorophorm acetone) – – b Vai trò lipid – Cấu tạo màng tế bào – Dự trữ lượng – Dung mơi hồ tan vitamin (A, D, E, K) – Giữ nhiệt cho thể • Bảo vệ học • Cung cấp nước nội sinh Một số vai trò quan trọng khác: – Các hormon steroid – Phosphatidylnositol – Sphingolipid – Eicosanoid – Sterol c Tên gọi acid béo ko no Phân giải glycerol, q trình β- Oxy hóa acid béo? a Phân giải glycerol b Q trình β- Oxy hóa acid béo • Ở ĐV, β - OXH diễn chủ yếu chất ty thể, ngồi peroxisome • β - oxy hố acid béo: – Hoạ -CoA – Vận chuyển Acyl-CoA vào chất ty thể – Các phản ứng chất ty thể Sản phẩm q trình β- Oxy hóa acid béo? Cách tính hiệu lƣợng β- Oxy hóa acid béo? Tổng hợp acid béo bão hòa đâu? Nguyên liệu? • Nơi thực hiện: lục lạp tế bào chất (thực vật); tế bào chất tế bào mơ mỡ, ruột gan (động vật) • Ngun liệu – Acetyl CoA – ATP – NADPH – Enzyme: • Acetyl carboxylase • Acyl synthase (6enzyme + ACP) NADPH lấy từ đâu? Cách tính nguồn nguyên liệu vào q trình acid béo bão hòa? Chất vận chuyển Acetyl CoA vào chất ty thể? Thạch Văn Mạnh TYD-K55 Phƣơng trình tổng quát trình tổng hợp acid panmitic? PTTQ trình tổng hợp palmitic acid 8Acetyl-CoA + 7ATP + 14NADPH + 14H+  Palmitate + 8CoA + 6H2O + 7ADP + 7Pi + 14NADP+ 10 Sự khác trình Oxy hóa acid béo tổng hợp acid béo? BẢNG Chƣơng VIII TRAO ĐỔI CHẤT VÀ NĂNG LƢỢNG Khái niệm dị hóa, đồng hóa? a Dị hố: – Phân giải h/chất h/cơ (saccharid, protein, lipid…từ TĂ hay kho dự trữ nội bào)→ SP đ/giản → chất thải: CO2, H2O, NH3, Pi, vv … – Năng lượng h/chất h/cơ bị ph/giải g/phóng, phần lớn t/luỹ ATP để s/dụng cho h/đ sống b Đồng hoá: – Tổng hợp TĐC Các ph/tử tiền chất nhỏ dùng để t/hợp nên đại ph/tử: protein, saccharid, lipid, … đ/trưng TB Đòi hỏi NL (từ ph/giải ATP) Thế môi trƣờng kị khí? Hiếu khí? Cơ chế vsv kị khí, hiếu khí sử dụng hợp chất hữu nào? Phân tử phân tử trung gian trình trao đổi chất Acetyl CoA? Khái niệm lƣợng tự do? Nhƣ lƣợng tự do? a Khái niệm • Là kh/năng sinh cơng • TB sống cần NL để tạo glucose từ thán khí nước, để nhân đơi DNA để vđ (co duỗi cơ)… • Tr/thái c/trúc có trật tự, có m/độ t/chức cao h/thống sống đòi hỏi NL vào việc d/trì tr/thái cho hđ, (Vì vật sống h/thống v/lý, h/học chịu ch/phối ng/lý nh/đ/học b Năng lượng tự Phƣơng trình biểu diễm mối quan hệ Keq, Đenta G? Ý nghĩa phƣơng trình? Cơng thức tổng quát phân tử ATP có phần? Các phản ứng thủy phân ATP điều kiện chuẩn? ATP + H2O ADP + Pi ( Go’ = - 7,3 kcal/mol) ATP + H2O AMP + PPi ( Go’ = - 7,3 kcal/mol) ATP + 2H2OAMP + 2Pi ( Go’ = - 14,6 kcal/mol) (Theo thực nghiệm, ATP nhả NL nhiều tuỳ đk pH mt [ATP] Trong đk th/tế mô, kh/vực TB, đk pH, p [ATP] khác so với đk chuẩn h/sinh (pH = 7, p = atm, C = 1M), 1ATP → 10-12 kcal/mol NL tự Thế chất oxy hóa? Thế chất khử? Chất cho e- (chất khử) chuyển e- cho chất nhận e- (chất OXH) 10 Cấu tạo ty thể? Đặc điểm pH chất khoảng không gian màng? a Cấu tạo ty thể - Là protein chứa hem, sắt th/đổi h/trị nhận nhả e- Cyt.c gắn lỏng lẻo mặt màng ty thể, bám vào cyt.c1 tổ hợp III, bám vào tổ hợp IV cyt.c thoi chuyển e- tổ hợp III IV b Đặc điểm pH chất khoảng ko gian màng 11 Chuỗi hô hấp đƣợc định vị đâu? Tên gọi tổ hợp chuỗi hô hấp? a Chuỗi hô hấp định vị đâu? b Tên gọi tổ hợp chuỗi hô hấp  Tổ hợp I: NADH- CoQ reductase  Tổ hợp II: Succinate - CoQ reductase  Tổ hợp III: CoQ-Cytochrom c reductase  Tổ hợp IV: Cytochrom c oxidase 12 Các thành phần chuỗi đƣợc sản xuất nhƣ nào? – Các protein gắn màng ty thể t/chức thành tổ hợp h/hấp chuỗi v/c e- – Mỗi tổ hợp gồm số th/viên protein số nhóm ghép có h/tính oxy hố khử với ∆E (thế hiệu khử) tăng dần 13 Sản xuất theo chuỗi oxy hóa khử tăng dần 14 Thành phần nhận điện tử cuối chuỗi hô hấp phân tử nào? 15 Thuyết hóa thẩm thấu? Thuyết hố thẩm thấu (Peter Mitchell, 1961): – Năng lượng tự vận chuyển e- bảo tồn H+ bơm từ chất ty thể khoảng không gian màng tạo thành gradient điện hoá proton qua màng ty thể Sau đó, điện hoá dùng để tổng hợp ATP 16 Nguồn lƣợng tạo ATP gì? Cơ chế tổng hợp ATP? a Nguồn lượng tạo ATP :  Sự tổng hợp ATP từ ADP + Pi p.ứ.thu NL, nguồn cung cấp lấy từ trình vận chuyển e- chuỗi hơ hấp  Q trình vận chuyển e- làm H+ bị đẩy từ chất khoảng màng, tạo nên chênh lệch nồng độ điện tích, gộp lại 1gradient điện hố H+ Khi gradient điện hoá bị hoá giải H+ quay chất qua tổ hợp V (ATP- synthase) ADP + Pi  ATP b Cơ chế tổng hợp ATP  Chia thành pha: – Dịch chuyển proton: Fo thực – Xúc tác hình thành liên kết phosphoanhydride ATP: F1 thực – Hợp diễn trượt tiêu gradient H+ tổng hợp ATP cần tương tác F1 Fo  F1 có tiểu phần xúc tác Mỗi tiểu phần trạng thái cấu hình khác nhau: – Trạng thái L (loosly): gắn chất s/phẩm cách lỏng lẻo – Trạng thái T (tightly): gắn chặt – Trạng thái O (open): hồn tồn khơng gắnNL gi/phóng H+ chuyển ngược lại chất làm chuyển đổi tr/ thái ATP t/hợp tr/thái T ATP g/phóng tr/thái O ... ACID Khái niệm acid nucleic, thành phần hóa học, gốc bazo nito? a Định nghĩa – Sinh học: acid v/chất mang thông tin di truyền tác nhân tham gia thực thông tin di truyền (biểu gen) – Hoá học:... ứng hoá sinh Bản chất: protein (trừ ribozyme - ARN có khả xúc tác) Ưu điểm : Làm tăng tốc độ phản ứng, không tham gia vào sản phẩm cuối - Hiệu xúc tác lớn: Ví dụ, 2H2O2 2H2O + O2 - Không xúc... Giữa N1 pyrimidine C1' pentose b Thành phần hóa học Nucleotide gì? Thành phần hóa học? a Định nghĩa · Nucleotide este phosphoric nucleoside b Thành phần hóa học Đơn vị cấu tạo acid nucleic – Chứa