Nghiên cứu sự sắp xếp của các DNA oligomer trên nhiễm sắc thể vi khuẩn và nấm men

MỤC LỤC DANH MỤC HÌNH DANH MỤC BẢNG DANH MỤC HÌNH PHỤ DANH MỤC BẢNG PHỤ CÁC TỪ VIẾT TẮT DNA Deoxyribonucleic acid A Adenine C Cytosine G Guanine T Thymine NST Nhiễm sắc thể bp Base pair kbp Kilobase pair Mb Megabase kDa Kilodalton BSĐN Bổ sung đảo ngược Sợi T Sợi đơn DNA làm khuôn cho trình phiên mã Sợi NT Sợi đơn DNA bổ sung với sợi làm khuôn cho trình phiên mã rDNA ribosomal DNA rRNA ribosomal RNA mRNA RNA thông tin tRNA RNA vận chuyển NCBI National Center for Biotechnology Information CHƯƠNG MỞ ĐẦU 1.1 LÝ DO CHỌN ĐỀ TÀI Cùng với tiến tin học sinh học kỹ thuật thao tác sinh học phân tử, trình tự hoàn chỉnh gene (genome) trở thành nguồn thông tin quí giá hỗ trợ cho việc tìm hiểu cấu trúc gene trình sinh học xảy tế bào sinh vật Các mối liên hệ cấu trúc gene trình sinh học xảy tế bào xác định thông qua việc thay đổi xóa bỏ trình tự nucleotide gene Tuy nhiên, kỹ thuật cao sinh học phân tử chưa đủ để việc thay đổi xóa bỏ trình tự nucleotide gene thành công Các nghiên cứu gần số nhà khoa học giới việc tìm hiểu, thay đổi tạo trình tự gene tiết lộ liên quan xếp nucleotide gene đến số trình sinh học xảy tế bào [1], [2], [3], [4], [5], [6], [7] Các kết nghiên cứu cho thấy trình sinh học tác động lên thành công thí nghiệm tìm hiểu, thay đổi tạo trình tự gene Mặc dù sinh vật khác có gene với trình tự nucleotide khác nhau, nghiên cứu vào năm 2001 [8] 2002 [9] cho thấy phân tử DNA nhiễm sắc thể gene có chung đặc điểm, tính đối xứng Không tính đối xứng sở khoảng cách hai vật thể thường đề cập hình học, tính đối xứng phân tử DNA nhiễm sắc thể sinh vật đặc điểm dựa phân bố nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể Rõ ràng, phân tử DNA nhiễm sắc thể không giống trình tự nucleotide lại giống đặc tính đối xứng, có nghĩa nucleotide phải xếp theo qui tắc để phân tử DNA nhiễm sắc thể trở nên đối xứng Tuy nhiên, chưa có qui tắc xếp nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể công bố Mặt khác, nhờ phát triển vượt trội kỹ thuật xác định trình tự DNA, số lượng vi sinh vật với trình tự gene xác định hoàn chỉnh tăng lên đáng kể [10] Sự góp mặt trình tự gene hoàn chỉnh vi sinh vật mở hướng cho việc nhận biết loài, việc phân loại vi sinh vật cách nhanh chóng dựa mức độ đồng dạng trình tự 16S rDNA – trình tự mang thông tin mã hóa cho thành phần 16S rRNA máy tổng hợp protein ribosome Tuy nhiên, trình tự 16S rDNA gần phát không đủ đặc trưng để sử dụng với vai trò này, đặc biệt phân loại vi sinh vật cấp độ giống (genus), mà loài giống chủng (strain) loài (species) không giống khả gây bệnh cho người, thực vật động vật cần phân biệt [11], [12], [13], [14], [15], [16] Các trình tự nucleotide tổng thể gene có tính đặc trưng loài, việc so sánh trình tự để xây dựng mối quan hệ tiến hóa loài vấn đề không đơn giản Việc tìm công cụ để phân loại sinh vật nhờ trình tự nucleotide hoàn chỉnh gene cho đời phương pháp phân loại dựa dấu hiệu gene (genomic signature) – dấu hiệu phát sở tần suất xuất oligomer trình tự nucleotide nhiễm sắc thể Tuy nhiên, phương pháp phân loại sinh vật dựa dấu hiệu gene nói chung phức tạp phương thức thuật toán sử dụng Chúng chưa sử dụng cách thống phân biệt số vi sinh vật không đủ đặc trưng để phân biệt số vi khuẩn cấp độ giống [17], [18], [19], [20], [21], [22], [23] 1.2 MỤC ĐÍCH NGHIÊN CỨU Đề tài nghiên cứu xếp oligomer phân tử DNA nhiễm sắc thể vi sinh vật nhằm hai mục đích sau: i) Tìm hiểu sâu kiến thức phân bố nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể vi khuẩn nấm men ii) Đưa phương pháp phân loại vi khuẩn có mối quan hệ tiến hóa gần cấp độ giống 1.3 ĐỐI TƯỢNG VÀ PHẠM VI NGHIÊN CỨU Đối tượng nghiên cứu đề tài trình tự gene xác định hoàn chỉnh lưu ngân hàng National Center for Biotechnology Information (NCBI) [10] Do qui tắc xếp nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể lần khởi xướng nghiên cứu luận án này, phạm vi nghiên cứu đề tài giới hạn cho trình tự gene hoàn chỉnh vi khuẩn nấm men Saccharomyces cerevisiae 1.4 TÍNH CẤP THIẾT CỦA ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU Trong công nghiệp công nghệ sinh học, việc tạo chủng, loài vi sinh vật với gene cho sản phẩm mong muốn thực cần thiết Tuy nhiên, thành công việc tạo vi sinh vật phụ thuộc nhiều vào hiểu biết người trình tự gene trình sinh học liên quan đến trật tự xếp nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể [1], [2], [3], [4], [5], [6], [7] Như đề cập Mục 1.1, trình tự nucleotide hoàn chỉnh phân tử DNA nhiễm sắc thể cá thể vi sinh vật khác không giống có tính đối xứng Tuy vậy, nucleotide xếp để phân tử DNA nhiễm sắc thể trở nên đối xứng chưa biết đến Cho nên, việc xác định qui tắc xếp nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể sở để định hướng thực hiệu công việc tạo vi sinh vật mong muốn Vì thế, nghiên cứu xếp oligomer phân tử DNA nhiễm sắc thể vi khuẩn nấm men đề tài quan trọng có ý nghĩa cấp thiết công nghệ gene Mặt khác, đề cập Mục 1.1, trình tự 16S rDNA sử dụng cách rộng rãi để nhận biết nhanh vi khuẩn, tính đặc trưng loài không cao trình tự này, số vi khuẩn, loài giống chủng loài có khả gây bệnh khác cho người, động vật thực vật phân biệt [13], [14], [15], [16] Khó khăn chưa giải giải pháp phân biệt vi khuẩn nỗ lực nghiên cứu nhiều nhà khoa học giới [18], [19], [20], [21], [22] Vì vậy, việc xây dựng phương pháp phân loại có khả phân biệt vi khuẩn thực mang tính cấp thiết 1.5 Ý NGHĨA KHOA HỌC CỦA ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU Đề tài tìm hiểu qui tắc xếp nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể vi khuẩn nấm men, nhằm cung cấp sâu kiến thức phân bố nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể tế bào vi sinh vật Đồng thời, đề tài xây dựng phương pháp phân loại vi khuẩn có mối quan hệ tiến hóa gần cấp độ giống mà có số vi khuẩn phân loại phương pháp biết 1.6 Ý NGHĨA THỰC TIỄN CỦA ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU Việc khám phá qui tắc xếp nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể giúp người can thiệp có định hướng vào việc thay đổi có hiệu trình tự nucleotide nhiễm sắc thể kỹ thuật biến đổi DNA để phục vụ lợi ích người Việc xây dựng phương pháp phân loại vi khuẩn cấp độ giống giải khó khăn việc phân biệt vi khuẩn có mối quan hệ tiến hóa gần, đặc biệt loài giống chủng loài khác khả gây bệnh cho người, động vật thực vật 1.7 TÍNH MỚI CỦA ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU Nội dung nghiên cứu đề tài luận án có tính sau đây: i) Đây công trình nghiên cứu xác định qui tắc xếp trimer trimer bổ sung đảo ngược (BSĐN) trình tự mang thông tin mã hóa protein phân tử DNA nhiễm sắc thể ii) Luận án sử dụng khái niệm bất đối xứng trimer để nghiên cứu phân bố trimer trình tự DNA nhiễm sắc thể iii) Luận án đưa khái niệm mật độ phân bố trimer trình tự DNA, khái niệm Với khái niệm này, luận án chứng minh nucleotide xếp có qui tắc phân tử DNA nhiễm sắc thể vi khuẩn để góp phần tạo nên tính đối xứng phân tử DNA nhiễm sắc thể trình bày khả ứng dụng trình tự gene phân loại vi khuẩn có mối quan hệ tiến hóa gần cấp độ giống CHƯƠNG TỔNG QUAN TÌNH HÌNH NGHIÊN CỨU 2.1 DNA Vào năm 1919, Levene khám phá phân tử DNA (deoxyribonucleic acid) phân tử chứa nucleotide Mỗi nucleotide gồm có nitrogen base đường deoxyribose nối với thông qua nhóm phosphate [24] Các nucleotide adenine (A), thymine (T), cytosine (C) guanine (G) Chúng khác cấu trúc nitrogen base (Hình 2.1) [25] Năm 1951, Erwin Chargaff phát DNA, số lượng A xấp xỉ số lượng T số lượng C xấp xỉ số lượng G [26] Phát Erwin Chargaff trở thành tiền đề cho Watson Crick xây dựng nên mô hình xoắn kép nucleotide phân tử DNA vào năm 1953 [ 27] Theo Watson Crick, phân tử DNA gồm có hai sợi đơn polynucleotide, sợi cấu tạo từ nucleotide A, C, G T Các nucleotide nối với thông qua liên kết phosphodiester, nhóm phosphate nối với hai nhóm đường (deoxyribose) hai nucleotide Như đầu sợi đơn polynucleotide có nhóm phosphate gắn vào nguyên tử carbon số đầu có nhóm hydroxyl gắn vào nguyên tử carbon số đường deoxyribose Các đầu gọi đầu 5’ đầu 3’ Hai sợi đơn polynucleotide kết hợp đối song (tức sợi với chiều 5’ → 3’ theo hướng đối nhau) nhờ liên kết hydrogen nucleotide bổ sung, tức A T, C G, G C T A, tạo nên phân tử sợi đôi DNA (Hình 2.2) [28] Vì vậy, hai sợi thường gọi sợi bổ sung sợi lại Trong số trường hợp, hai sợi gọi sợi Watson sợi Crick [9], [29] Hình 2.1 Thành phần hóa học DNA Cấu trúc hóa học chuỗi polynucleotide (a), nucleotide (b) nitrogen base (c) trình bày theo thứ tự từ trái qua phải Đường pentose nhóm hydroxyl nguyên tử carbon số nên gọi đường deoxyribose [25] Hình 2.2 Các liên kết hydrogen nucleotide bổ sung phân tử DNA 2.2 DNA OLIGOMER Trong phân tử DNA nhiễm sắc thể với trình tự nucleotide xác định hoàn chỉnh, nucleotide A, C, G T xếp theo qui tắc chưa biết đến Nếu cho A, C, G T chữ từ tạo thành từ chữ gọi oligonucleotide, hay gọi oligomer Monomer từ tạo thành từ A, C, G T Dimer, trimer, tetramer, pentamer, hexamer… từ tạo từ 2, 3, 4, 5, 6… chữ bảng chữ gồm bốn chữ A, C, G T Cũng monomer, oligomer phân tử DNA nhiễm sắc thể kết hợp với bí ẩn 2.3 CẤU TRÚC DNA NHIỄM SẮC THỂ Trong tế bào sinh vật prokaryote eukaryote, kích thước phân tử DNA nhiễm sắc thể từ khoảng vài trăm ngàn hàng triệu cặp nucleotide bổ sung (base pair, viết tắt bp) Các nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể kết hợp với protein khác để tạo nên nhiễm sắc thể hoàn chỉnh Phân tử DNA nhiễm sắc thể có dạng vòng dạng thẳng Ở dạng thẳng, hai chuỗi polynucleotide đối song phân tử DNA nhiễm sắc thể có nucleotide vị trí nucleotide vị trí cuối tách rời không nối với phân tử DNA nhiễm sắc thể dạng vòng 2.3.1 Nhiễm sắc thể tế bào sinh vật prokaryote Các tế bào sinh vật prokaryote, gồm vi khuẩn archaea (vi khuẩn cổ), nhân, thường mang nhiễm sắc thể dạng vòng, hai sợi đơn polynucleotide có dạng vòng kết hợp với thông qua liên kết hydrogen Trong tế bào chất tế bào vi khuẩn, DNA nhiễm sắc thể liên kết với protein giống protein histone tế bào sinh vật eukaryote (Mục 2.3.2), tạo thành cấu trúc hạt Các hạt lại tiếp tục liên kết với làm hình thành cấu trúc xoắn cấp độ khác cấu trúc nucleoid tùy thuộc vào điều kiện dinh dưỡng bên tế bào [30] Hình 2.3 cho thấy hình ảnh nhiễm sắc thể vi khuẩn hoàn chỉnh phân lập khỏi tế bào quan sát kính hiển vi [31] Hình 2.3 Ảnh chụp nhiễm sắc thể tế bào vi khuẩn E coli Nhiễm sắc thể tách khỏi tế bào chụp kính hiển vi điện tử với độ phóng đại 12000 lần Thanh đo: 500 nm [31] Hầu hết gene tế bào sinh vật prokaryote gồm phân tử DNA nhiễm sắc thể dạng vòng Rất loài chứa phân tử DNA nhiễm sắc thể dạng thẳng, chẳng hạn loài Agrobacterium tumefaciens có phân tử DNA nhiễm sắc thể dạng vòng dạng thẳng Một số loài có nhiều phân tử DNA nhiễm sắc thể dạng vòng, chẳng hạn loài giống Burkholderia, giống Vibrio Kích thước phân tử DNA nhiễm sắc thể gene không giống Cũng vậy, kích thước phân tử DNA nhiễm sắc thể loài khác khác [10] 2.3.2 Nhiễm sắc thể tế bào sinh vật eukaryote Khác với tế bào sinh vật prokaryote, phân tử DNA nhiễm sắc thể tế bào sinh vật eukaryote có dạng thẳng (Hình 2.4) Một nghiên cứu cấu trúc tinh thể nucleosome nhân tế bào người cho thấy nucleosome tạo thành đoạn DNA nhiễm sắc thể với chiều dài 146 bp quấn quanh protein histone H2A, H2B, H3 H4 [32] Các nucleosome nối với nhờ đoạn DNA nhiễm sắc thể liên kết với protein histone H1 Các cấu trúc nucleosome lại kết hợp với làm hình thành sợi xoắn vào tạo thành cấp độ cấu trúc khác chromatin Trong trình sinh trưởng, tế bào sinh vật phát triển theo chu kỳ Trong chu kỳ, tế bào trải qua giai đoạn chuẩn bị cho trình phân chia tế bào nhằm tạo tế bào mới, có giai đoạn chép DNA nhiễm sắc thể để tạo thành hai nhiễm sắc thể “chị-em” giống từ nhiễm sắc thể ban đầu Vào thời kỳ sau trình chép DNA nhiễm sắc thể trước giai đoạn phân chia tế bào, chromatin hai nhiễm sắc thể “chị-em” dạng nén chặt, nối với qua tâm động (centromere) tạo nên hình chữ X (Hình 2.4) Hai nhiễm sắc thể phân bố vào hai tế bào sau trình phân chia tế bào chất, thành phần chứa tế bào chất màng sinh chất Tùy theo loài, gene sinh vật eukaryote có số lượng phân tử DNA nhiễm sắc thể khác Kích thước nhiễm sắc thể gene không giống [10] 10 AGT/ACT ACG/CGT AAG/CTT AAC/GTT AGC/GCT ACC/GGT ATC/GAT TAC/GTA TCC/GGA TTG/CAA CCG/CGG TAT/ATA GCG/CGC ATG/CAT GTG/CAC CTG/CAG TCG/CGA TGG/CCA GAC/GTC ACA/TGT AAA/TTT CCT/AGG GAA/TTC GCA/TGC ATT/AAT -0.099405 0.561350 0.482282 0.261806 0.319758 0.445701 0.458522 0.636310 0.992468 0.328321 0.901064 1.121741 0.063711 0.935409 0.984639 0.603884 1.318576 0.898040 -0.172248 0.460602 0.125305 0.147678 0.186704 0.687215 -0.010958 0.019599 0.699158 0.209419 0.204471 0.358349 0.439038 0.443100 0.652730 0.883586 0.305128 0.773045 1.146893 0.245036 0.872928 1.109427 0.563139 1.321849 0.846173 -0.270968 0.590511 0.057831 0.086570 0.066378 0.775995 0.039219 0.035461 1.329155 1.538363 1.364033 0.950843 0.731261 0.992424 1.320184 0.547529 0.025709 1.206897 0.830758 0.510412 1.095214 0.854291 0.661099 1.784414 1.257098 0.162368 0.123180 0.092692 0.140468 -0.345330 0.470861 0.001326 0.145153 1.380647 1.149923 1.219427 1.156081 0.850489 0.816922 1.214178 0.441391 0.212744 0.828029 0.978709 0.616053 0.946413 0.883603 0.691818 1.548690 1.234974 0.156352 0.175672 -0.109840 0.009298 -0.352656 0.343808 -0.012443 0.110995 1.504449 1.346578 1.388377 1.201365 0.869459 0.889751 1.338626 0.516093 0.128814 0.980272 0.975678 0.585798 0.989656 0.944614 0.722921 1.802862 1.361616 0.137514 0.165904 -0.023628 0.081015 -0.375840 0.353309 -0.038203 0.143565 -0.117587 1.555647 1.588310 1.612290 1.423891 1.353216 1.290335 0.841461 0.152207 0.929572 0.634546 -0.319068 1.121120 0.725310 0.885334 1.117448 1.214486 0.381191 -0.027120 0.326765 0.003382 -0.339408 -0.470148 -0.132739 -0.009718 0.975144 0.690530 1.147598 1.172316 1.805055 1.561745 1.824780 0.787593 0.632651 -1.135648 -0.022886 -0.116852 1.384914 1.138972 0.788408 0.420996 1.182482 0.168645 0.048939 -0.393301 -1.096157 -0.989236 -0.216348 0.306117 -0.107624 -0.508786 0.024941 0.070522 -0.344108 -0.225591 -0.361454 0.140174 -0.164030 -0.323770 0.794954 1.030416 0.493888 0.688600 0.911684 0.421383 0.416165 0.001049 -0.118191 0.138629 0.266742 1.097521 0.986270 1.074479 0.496453 255 0.064451 -0.318727 -0.034746 -0.023615 -0.386551 -0.370733 -0.348313 0.087341 -0.204363 -0.225986 0.599998 0.918839 0.454915 0.607170 0.791101 0.202775 0.389928 0.147252 -0.079109 0.226301 0.194841 0.885166 0.880220 0.935188 0.400448 -0.017301 -0.335586 -0.101209 0.073731 0.035250 -0.026702 -0.268504 0.013996 0.041803 -0.126680 1.190923 1.096030 0.405208 0.824902 0.943821 0.594269 0.611269 0.472849 0.133989 0.170683 0.426928 0.791390 0.946359 1.042087 0.632324 -0.066774 -0.380613 0.024089 0.075172 -0.039635 -0.087352 -0.225957 0.084059 0.018247 -0.180324 1.070963 1.007889 0.260397 0.798623 0.878136 0.537096 0.572434 0.490777 0.124079 0.197801 0.589467 0.677898 0.940688 0.966301 0.530974 -0.007961 -0.454076 -0.199186 -0.018935 -0.131745 -0.159385 -0.354654 -0.091292 -0.025280 -0.126543 1.067141 1.004937 0.373081 0.807760 0.950926 0.541008 0.490967 0.333956 0.144331 0.344422 0.421028 0.860251 1.047746 1.182767 0.579178 0.060758 0.032385 -0.087244 0.163757 0.296460 0.284180 -0.301684 -0.102146 0.092077 -0.031616 1.057774 0.989773 0.626032 0.752115 0.914342 0.525668 0.632129 0.721222 0.041036 0.056499 0.324653 0.760776 0.927150 0.599480 0.554653 0.160097 0.021846 0.054463 -0.658789 -0.958714 -1.343486 -0.988336 -1.055846 -1.348608 -0.972625 0.616112 0.510557 0.630111 0.568924 0.567183 -0.394015 -0.121586 -0.337864 0.214233 1.151657 0.539885 0.638510 1.352670 1.554511 0.431594 NC_000964_Bacillus subtilis str 168 (I) NC_003909_Bacillus cereus ATCC 10987 (I) NC_003197_Salmonella enterica Typhimurium str LT2 (I) NC_011740_Escherichia fergusonii ATCC 35469 (I) NC_004741_Shigella flexneri 2a str 2457T (I) NC_000913_Escherichia coli str K12 substr MG1655 (I) NC_002506_Vibrio cholerae O1 str N16961 chromosome (I) NC_002505_Vibrio cholerae O1 str N16961 chromosome (I) NC_006461_Thermus thermophilus HB8 (I) NC_002516_Pseudomonas aeruginosa PAO1 (I) NC_007511_Burkholderia lata 383 chromosome (I) NC_007509_Burkholderia lata 383 chromosome (I) NC_007510_Burkholderia lata 383 chromosome (I) NC_003063_Agrobacterium tumefaciens str C58 linear (I) NC_003062_Agrobacterium tumefaciens str C58 circular (I) T rimer/Trimer BSĐN Bảng phụ 15 Các giá trị bi(T/T BSĐN) trung bình nhóm I Hình 5.39, trang 194-195 -0.249557 0.566701 -0.104382 -0.145765 -0.299901 -0.325832 -0.187059 -0.130410 -0.904178 -0.258516 0.694459 0.845368 0.718873 0.673129 0.757904 0.195198 0.252878 0.249562 0.045515 1.416709 0.556955 0.717062 1.273884 1.264085 0.552008 CTA/TAG TCA/TGA TTA/TAA TCT/AGA GAG/CTC GGG/CCC GGC/GCC ACT/AGT CAC/GTG CAT/ATG CAG/CTG CCA/TGG CGA/TCG ATA/TAT CGG/CCG CGC/GCG CGT/ACG CAA/TTG GGA/TCC CTT/AAG GAT/ATC GGT/ACC GTA/TAC GCT/AGC GTT/AAC GTC/GAC GCC/GGC CCC/GGG CTC/GAG AGA/TCT AGG/CCT TTC/GAA AAT/ATT TAG/CTA TAA/TTA TGA/TCA TGC/GCA TTT/AAA TGT/ACA 0.185999 0.109880 -0.026414 0.168203 -0.185507 -0.636026 -0.034817 0.099405 -0.984639 -0.935409 -0.603884 -0.898040 -1.318576 -1.121741 -0.901064 -0.063711 -0.561350 -0.328321 -0.992468 -0.482282 -0.458522 -0.445701 -0.636310 -0.319758 -0.261806 0.172248 0.034817 0.636026 0.185507 -0.168203 -0.147678 -0.186704 0.010958 -0.185999 0.026414 -0.109880 -0.687215 -0.125305 -0.460602 0.229535 0.250285 0.041335 0.129461 -0.196037 -0.408118 -0.068408 -0.019599 -1.109427 -0.872928 -0.563139 -0.846173 -1.321849 -1.146893 -0.773045 -0.245036 -0.699158 -0.305128 -0.883586 -0.209419 -0.443100 -0.439038 -0.652730 -0.358349 -0.204471 0.270968 0.068408 0.408118 0.196037 -0.129461 -0.086570 -0.066378 -0.039219 -0.229535 -0.041335 -0.250285 -0.775995 -0.057831 -0.590511 0.105852 -0.232624 -0.097952 0.051914 -0.394356 -0.011033 0.469274 -0.035461 -0.854291 -1.095214 -0.661099 -1.257098 -1.784414 -0.830758 -1.206897 -0.510412 -1.329155 -0.025709 -0.547529 -1.538363 -0.992424 -0.731261 -1.320184 -0.950843 -1.364033 -0.162368 -0.469274 0.011033 0.394356 -0.051914 -0.140468 0.345330 -0.001326 -0.105852 0.097952 0.232624 -0.470861 -0.092692 -0.123180 0.076064 -0.081384 -0.025640 0.017576 -0.305176 0.167797 0.352953 -0.145153 -0.883603 -0.946413 -0.691818 -1.234974 -1.548690 -0.978709 -0.828029 -0.616053 -1.380647 -0.212744 -0.441391 -1.149923 -0.816922 -0.850489 -1.214178 -1.156081 -1.219427 -0.156352 -0.352953 -0.167797 0.305176 -0.017576 -0.009298 0.352656 0.012443 -0.076064 0.025640 0.081384 -0.343808 0.109840 -0.175672 0.045439 -0.192371 -0.070965 0.030368 -0.530743 0.134802 0.425778 -0.110995 -0.944614 -0.989656 -0.722921 -1.361616 -1.802862 -0.975678 -0.980272 -0.585798 -1.504449 -0.128814 -0.516093 -1.346578 -0.889751 -0.869459 -1.338626 -1.201365 -1.388377 -0.137514 -0.425778 -0.134802 0.530743 -0.030368 -0.081015 0.375840 0.038203 -0.045439 0.070965 0.192371 -0.353309 0.023628 -0.165904 0.185872 -0.436791 -0.002394 0.065012 0.199760 -0.380383 -0.137088 -0.143565 -0.725310 -1.121120 -0.885334 -1.214486 -1.117448 -0.634546 -0.929572 0.319068 0.117587 -0.152207 -0.841461 -1.555647 -1.353216 -1.423891 -1.290335 -1.612290 -1.588310 -0.381191 0.137088 0.380383 -0.199760 -0.065012 -0.003382 0.339408 0.132739 -0.185872 0.002394 0.436791 0.470148 -0.326765 0.027120 0.343180 -0.244655 0.081180 -0.018011 -0.035670 -0.028462 -0.834045 0.009718 -1.138972 -1.384914 -0.788408 -1.182482 -0.420996 0.022886 1.135648 0.116852 -0.975144 -0.632651 -0.787593 -0.690530 -1.561745 -1.805055 -1.824780 -1.172316 -1.147598 -0.168645 0.834045 0.028462 0.035670 0.018011 1.096157 0.989236 -0.306117 -0.343180 -0.081180 0.244655 0.216348 0.393301 -0.048939 0.981860 1.095798 1.463534 0.889676 0.480618 0.282075 0.085815 0.107624 -0.911684 -0.688600 -0.421383 -0.001049 -0.416165 -1.030416 -0.794954 -0.493888 0.508786 0.323770 0.164030 -0.024941 0.361454 0.225591 -0.140174 0.344108 -0.070522 0.118191 -0.085815 -0.282075 -0.480618 -0.889676 -1.097521 -0.986270 -0.496453 -0.981860 -1.463534 -1.095798 -1.074479 -0.266742 -0.138629 256 0.885826 1.101875 1.365936 0.705764 0.451460 0.236486 0.150592 -0.064451 -0.791101 -0.607170 -0.202775 -0.147252 -0.389928 -0.918839 -0.599998 -0.454915 0.318727 0.225986 0.204363 0.034746 0.348313 0.370733 -0.087341 0.386551 0.023615 0.079109 -0.150592 -0.236486 -0.451460 -0.705764 -0.885166 -0.880220 -0.400448 -0.885826 -1.365936 -1.101875 -0.935188 -0.194841 -0.226301 0.579961 0.835297 1.219050 0.763619 0.383096 0.535786 0.090695 0.017301 -0.943821 -0.824902 -0.594269 -0.472849 -0.611269 -1.096030 -1.190923 -0.405208 0.335586 0.126680 -0.041803 0.101209 0.268504 0.026702 -0.013996 -0.035250 -0.073731 -0.133989 -0.090695 -0.535786 -0.383096 -0.763619 -0.791390 -0.946359 -0.632324 -0.579961 -1.219050 -0.835297 -1.042087 -0.426928 -0.170683 0.543610 0.794480 1.037808 0.699738 0.447983 0.503329 0.087445 0.066774 -0.878136 -0.798623 -0.537096 -0.490777 -0.572434 -1.007889 -1.070963 -0.260397 0.380613 0.180324 -0.018247 -0.024089 0.225957 0.087352 -0.084059 0.039635 -0.075172 -0.124079 -0.087445 -0.503329 -0.447983 -0.699738 -0.677898 -0.940688 -0.530974 -0.543610 -1.037808 -0.794480 -0.966301 -0.589467 -0.197801 0.623546 0.876022 1.296172 0.788818 0.492112 0.544548 0.043195 0.007961 -0.950926 -0.807760 -0.541008 -0.333956 -0.490967 -1.004937 -1.067141 -0.373081 0.454076 0.126543 0.025280 0.199186 0.354654 0.159385 0.091292 0.131745 0.018935 -0.144331 -0.043195 -0.544548 -0.492112 -0.788818 -0.860251 -1.047746 -0.579178 -0.623546 -1.296172 -0.876022 -1.182767 -0.421028 -0.344422 0.701059 0.726548 1.186504 0.633049 0.635057 0.467438 0.157875 -0.060758 -0.914342 -0.752115 -0.525668 -0.721222 -0.632129 -0.989773 -1.057774 -0.626032 -0.032385 0.031616 -0.092077 0.087244 0.301684 -0.284180 0.102146 -0.296460 -0.163757 -0.041036 -0.157875 -0.467438 -0.635057 -0.633049 -0.760776 -0.927150 -0.554653 -0.701059 -1.186504 -0.726548 -0.599480 -0.324653 -0.056499 1.021237 1.224628 2.194675 0.347322 1.012000 0.834854 0.422291 -0.160097 -0.567183 -0.568924 0.394015 0.337864 0.121586 -0.510557 -0.616112 -0.630111 -0.021846 0.972625 1.348608 -0.054463 0.988336 1.343486 1.055846 0.958714 0.658789 -0.214233 -0.422291 -0.834854 -1.012000 -0.347322 -0.638510 -1.352670 -0.431594 -1.021237 -2.194675 -1.224628 -1.554511 -0.539885 -1.151657 0.642461 1.357211 1.484338 0.181950 0.690942 0.777753 0.338381 0.249557 -0.757904 -0.673129 -0.195198 -0.249562 -0.252878 -0.845368 -0.694459 -0.718873 -0.566701 0.258516 0.904178 0.104382 0.187059 0.325832 0.130410 0.299901 0.145765 -0.045515 -0.338381 -0.777753 -0.690942 -0.181950 -0.717062 -1.273884 -0.552008 -0.642461 -1.484338 -1.357211 -1.264085 -0.556955 -1.416709 AGT/ACT ACG/CGT AAG/CTT AAC/GTT AGC/GCT ACC/GGT ATC/GAT TAC/GTA TCC/GGA TTG/CAA CCG/CGG TAT/ATA GCG/CGC ATG/CAT GTG/CAC CTG/CAG TCG/CGA TGG/CCA GAC/GTC ACA/TGT AAA/TTT CCT/AGG GAA/TTC GCA/TGC ATT/AAT 0.025213 -0.540256 -0.418670 -0.067972 -0.197915 -0.325178 -0.413460 -0.594052 -0.989818 -0.322489 -0.776141 -1.101156 -0.179795 -0.833963 -1.096789 -0.530644 -1.315743 -0.858161 0.096086 -0.437382 -0.014930 -0.245114 -0.156625 -0.606645 -0.026338 -0.021558 -0.595529 -0.216045 -0.252373 -0.370165 -0.392194 -0.345944 -0.639184 -0.852888 -0.286278 -0.681852 -1.097076 -0.237578 -0.807505 -1.091144 -0.509097 -1.259805 -0.849204 0.180667 -0.562629 -0.075150 -0.066971 -0.128427 -0.773822 0.022672 -0.150034 -1.316564 -1.138580 -1.156081 -1.156652 -0.844101 -0.823465 -1.210926 -0.357660 -0.255792 -0.792506 -0.949154 -0.569967 -0.932514 -0.901193 -0.652947 -1.517375 -1.235197 -0.142031 -0.184768 0.150864 -0.069743 0.320006 -0.353690 -0.035627 -0.008784 -1.419220 -1.492504 -1.441233 -1.043908 -0.798103 -1.034857 -1.344524 -0.591011 -0.055168 -1.193438 -0.863894 -0.528704 -1.131346 -0.871040 -0.619014 -1.811204 -1.242256 -0.146986 -0.149548 -0.058562 -0.164715 0.361160 -0.439938 -0.003841 -0.075364 -1.489558 -1.349451 -1.395634 -1.186030 -0.905581 -0.885834 -1.328726 -0.545170 -0.137776 -0.953316 -0.946345 -0.522635 -0.971929 -0.893596 -0.696087 -1.756090 -1.310235 -0.178054 -0.167027 -0.027857 -0.088662 0.402777 -0.362115 -0.013020 -0.175790 0.214238 -1.526251 -1.475190 -1.405607 -1.245168 -1.227141 -1.262260 -0.835324 -0.277387 -0.904013 -0.684189 0.212879 -1.067157 -0.864307 -0.867061 -1.103585 -1.257165 -0.309371 0.066173 -0.295206 -0.022815 0.380262 0.500286 0.112066 -0.002520 -0.888279 -0.622947 -1.097076 -1.068866 -1.703463 -1.544309 -1.876775 -0.959182 -0.810626 1.172704 -0.013235 0.094050 -1.357041 -1.161536 -0.729213 -0.398020 -1.200997 -0.156931 -0.036411 0.561563 0.999714 1.142983 0.288592 -0.330589 0.199783 0.605298 -0.086512 -0.187692 0.384576 0.223415 0.304824 -0.169014 0.162108 0.404042 -0.874481 -1.034901 -0.486998 -0.816365 -0.913314 -0.537037 -0.445279 0.069757 0.030999 -0.144466 -0.414855 -1.142888 -1.054370 -1.201316 -0.537052 257 0.021909 0.219952 0.080525 -0.072359 0.271558 0.015841 0.326649 -0.213466 0.264195 0.228067 -0.725337 -0.975449 -0.568921 -0.636747 -0.882053 -0.318602 -0.356772 -0.204122 0.215573 -0.245053 -0.164731 -1.016633 -1.019225 -1.039516 -0.393656 0.060074 0.351706 0.038033 -0.073009 -0.053518 0.052337 0.237416 -0.037249 -0.094465 0.124963 -1.223893 -1.094821 -0.432703 -0.831810 -0.940069 -0.584989 -0.586233 -0.453363 -0.152296 -0.184475 -0.439699 -0.812107 -0.948428 -1.025818 -0.618158 0.067137 0.360092 0.001993 -0.053059 -0.008929 0.095825 0.213751 -0.124661 -0.061271 0.173227 -1.074221 -1.001244 -0.281718 -0.782814 -0.863481 -0.545113 -0.570996 -0.546525 -0.120554 -0.177443 -0.544162 -0.640541 -0.904076 -0.904126 -0.559226 0.066216 0.466665 0.185491 0.037271 0.197591 0.202677 0.340086 0.106001 0.053912 0.096903 -1.058079 -0.980892 -0.376667 -0.779679 -0.938460 -0.564101 -0.414646 -0.358363 -0.180731 -0.289004 -0.405055 -0.839471 -1.010717 -1.156062 -0.547953 -0.071538 -0.003199 0.079639 -0.167329 -0.274268 -0.250608 0.264287 0.050976 -0.134109 0.028170 -1.138619 -1.005627 -0.593107 -0.774380 -0.878514 -0.544097 -0.652445 -0.731700 -0.057380 -0.076515 -0.350691 -0.733548 -0.898037 -0.573022 -0.555180 -0.169628 -0.014803 0.000488 0.673472 0.956279 1.430041 0.973106 1.043998 1.391277 0.991329 -0.642273 -0.551781 -0.673298 -0.587961 -0.575969 0.350981 0.075129 0.368336 -0.282430 -1.176587 -0.552269 -0.653674 -1.365715 -1.608369 -0.459102 NC_000964_Bacillus subtilis str 168 (II) NC_003909_Bacillus cereus ATCC 10987 (II) NC_003197_Salmonella enterica Typhimurium str LT2 (II) NC_011740_Escherichia fergusonii ATCC 35469 (II) NC_004741_Shigella flexneri 2a str 2457T (II) NC_000913_Escherichia coli str K12 substr MG1655 (II) NC_002506_Vibrio cholerae O1 str N16961 chromosome (II) NC_002505_Vibrio cholerae O1 str N16961 chromosome (II) NC_006461_Thermus thermophilus HB8 (II) NC_002516_Pseudomonas aeruginosa PAO1 (II) NC_007511_Burkholderia lata 383 chromosome (II) NC_007510_Burkholderia lata 383 chromosome (II) NC_007509_Burkholderia lata 383 chromosome (II) NC_003063_Agrobacterium tumefaciens str C58 linear (II) NC_003062_Agrobacterium tumefaciens str C58 circular (II) T rimer/Trimer BSĐN Bảng phụ 16 Các giá trị bi(T/T BSĐN) trung bình nhóm II Hình 5.39, trang 196-197 0.176767 -0.555022 0.073389 0.139369 0.287701 0.297067 0.258268 0.128302 0.895110 0.208793 -0.702101 -0.855721 -0.735548 -0.626574 -0.770336 -0.194364 -0.258812 -0.260445 -0.111859 -1.362359 -0.537148 -0.621621 -1.280464 -1.242904 -0.523976 CTA/TAG TCA/TGA TTA/TAA TCT/AGA GAG/CTC GGG/CCC GGC/GCC ACT/AGT CAC/GTG CAT/ATG CAG/CTG CCA/TGG CGA/TCG ATA/TAT CGG/CCG CGC/GCG CGT/ACG CAA/TTG GGA/TCC CTT/AAG GAT/ATC GGT/ACC GTA/TAC GCT/AGC GTT/AAC GTC/GAC GCC/GGC CCC/GGG CTC/GAG AGA/TCT AGG/CCT TTC/GAA AAT/ATT TAG/CTA TAA/TTA TGA/TCA TGC/GCA TTT/AAA TGT/ACA -0.178523 -0.086222 0.059113 -0.235646 0.003033 0.348516 -0.002816 -0.025213 1.096789 0.833963 0.530644 0.858161 1.315743 1.101156 0.776141 0.179795 0.540256 0.322489 0.989818 0.418670 0.413460 0.325178 0.594052 0.197915 0.067972 -0.096086 0.002816 -0.348516 -0.003033 0.235646 0.245114 0.156625 0.026338 0.178523 -0.059113 0.086222 0.606645 0.014930 0.437382 -0.253448 -0.264826 -0.040924 -0.122831 0.067112 0.328423 0.043297 0.021558 1.091144 0.807505 0.509097 0.849204 1.259805 1.097076 0.681852 0.237578 0.595529 0.286278 0.852888 0.216045 0.345944 0.392194 0.639184 0.370165 0.252373 -0.180667 -0.043297 -0.328423 -0.067112 0.122831 0.066971 0.128427 -0.022672 0.253448 0.040924 0.264826 0.773822 0.075150 0.562629 -0.072093 0.089598 0.027351 -0.028936 0.264606 -0.246815 -0.345316 0.150034 0.901193 0.932514 0.652947 1.235197 1.517375 0.949154 0.792506 0.569967 1.316564 0.255792 0.357660 1.138580 0.823465 0.844101 1.210926 1.156652 1.156081 0.142031 0.345316 0.246815 -0.264606 0.028936 0.069743 -0.320006 0.035627 0.072093 -0.027351 -0.089598 0.353690 -0.150864 0.184768 -0.083031 0.238253 0.096346 -0.081535 0.489100 0.022792 -0.453729 0.008784 0.871040 1.131346 0.619014 1.242256 1.811204 0.863894 1.193438 0.528704 1.419220 0.055168 0.591011 1.492504 1.034857 0.798103 1.344524 1.043908 1.441233 0.146986 0.453729 -0.022792 -0.489100 0.081535 0.164715 -0.361160 0.003841 0.083031 -0.096346 -0.238253 0.439938 0.058562 0.149548 -0.060714 0.195476 0.067021 -0.034926 0.459817 -0.128199 -0.406439 0.075364 0.893596 0.971929 0.696087 1.310235 1.756090 0.946345 0.953316 0.522635 1.489558 0.137776 0.545170 1.349451 0.885834 0.905581 1.328726 1.186030 1.395634 0.178054 0.406439 0.128199 -0.459817 0.034926 0.088662 -0.402777 0.013020 0.060714 -0.067021 -0.195476 0.362115 0.027857 0.167027 -0.199708 0.420470 0.011584 -0.079410 -0.340139 0.253967 0.105409 0.175790 0.864307 1.067157 0.867061 1.257165 1.103585 0.684189 0.904013 -0.212879 -0.214238 0.277387 0.835324 1.526251 1.227141 1.245168 1.262260 1.405607 1.475190 0.309371 -0.105409 -0.253967 0.340139 0.079410 0.022815 -0.380262 -0.112066 0.199708 -0.011584 -0.420470 -0.500286 0.295206 -0.066173 -0.214714 0.233396 -0.075956 0.012354 -0.091574 -0.028135 0.856330 0.002520 1.161536 1.357041 0.729213 1.200997 0.398020 0.013235 -1.172704 -0.094050 0.888279 0.810626 0.959182 0.622947 1.544309 1.703463 1.876775 1.068866 1.097076 0.156931 -0.856330 0.028135 0.091574 -0.012354 -0.999714 -1.142983 0.330589 0.214714 0.075956 -0.233396 -0.288592 -0.561563 0.036411 -1.060277 -1.107658 -1.479037 -0.918347 -0.477343 -0.264777 -0.109349 -0.199783 0.913314 0.816365 0.537037 -0.069757 0.445279 1.034901 0.874481 0.486998 -0.605298 -0.404042 -0.162108 0.086512 -0.304824 -0.223415 0.169014 -0.384576 0.187692 -0.030999 0.109349 0.264777 0.477343 0.918347 1.142888 1.054370 0.537052 1.060277 1.479037 1.107658 1.201316 0.414855 0.144466 258 -0.952245 -1.032755 -1.537368 -0.757386 -0.318918 -0.250394 0.044753 -0.021909 0.882053 0.636747 0.318602 0.204122 0.356772 0.975449 0.725337 0.568921 -0.219952 -0.228067 -0.264195 -0.080525 -0.326649 -0.015841 0.213466 -0.271558 0.072359 -0.215573 -0.044753 0.250394 0.318918 0.757386 1.016633 1.019225 0.393656 0.952245 1.537368 1.032755 1.039516 0.164731 0.245053 -0.562467 -0.785208 -1.163485 -0.816570 -0.486815 -0.560567 -0.134023 -0.060074 0.940069 0.831810 0.584989 0.453363 0.586233 1.094821 1.223893 0.432703 -0.351706 -0.124963 0.094465 -0.038033 -0.237416 -0.052337 0.037249 0.053518 0.073009 0.152296 0.134023 0.560567 0.486815 0.816570 0.812107 0.948428 0.618158 0.562467 1.163485 0.785208 1.025818 0.439699 0.184475 -0.514222 -0.776766 -1.021619 -0.673426 -0.467082 -0.539352 -0.110252 -0.067137 0.863481 0.782814 0.545113 0.546525 0.570996 1.001244 1.074221 0.281718 -0.360092 -0.173227 0.061271 -0.001993 -0.213751 -0.095825 0.124661 0.008929 0.053059 0.120554 0.110252 0.539352 0.467082 0.673426 0.640541 0.904076 0.559226 0.514222 1.021619 0.776766 0.904126 0.544162 0.177443 -0.601484 -0.877039 -1.215927 -0.802912 -0.483851 -0.562593 -0.083016 -0.066216 0.938460 0.779679 0.564101 0.358363 0.414646 0.980892 1.058079 0.376667 -0.466665 -0.096903 -0.053912 -0.185491 -0.340086 -0.202677 -0.106001 -0.197591 -0.037271 0.180731 0.083016 0.562593 0.483851 0.802912 0.839471 1.010717 0.547953 0.601484 1.215927 0.877039 1.156062 0.405055 0.289004 -0.670085 -0.682162 -1.164770 -0.605030 -0.635413 -0.433499 -0.172715 0.071538 0.878514 0.774380 0.544097 0.731700 0.652445 1.005627 1.138619 0.593107 0.003199 -0.028170 0.134109 -0.079639 -0.264287 0.250608 -0.050976 0.274268 0.167329 0.057380 0.172715 0.433499 0.635413 0.605030 0.733548 0.898037 0.555180 0.670085 1.164770 0.682162 0.573022 0.350691 0.076515 -1.011857 -1.245677 -2.228969 -0.406537 -1.044740 -0.855339 -0.483071 0.169628 0.575969 0.587961 -0.350981 -0.368336 -0.075129 0.551781 0.642273 0.673298 0.014803 -0.991329 -1.391277 -0.000488 -0.973106 -1.430041 -1.043998 -0.956279 -0.673472 0.282430 0.483071 0.855339 1.044740 0.406537 0.653674 1.365715 0.459102 1.011857 2.228969 1.245677 1.608369 0.552269 1.176587 -0.606457 -1.330234 -1.453172 -0.116090 -0.693338 -0.795746 -0.358014 -0.176767 0.770336 0.626574 0.194364 0.260445 0.258812 0.855721 0.702101 0.735548 0.555022 -0.208793 -0.895110 -0.073389 -0.258268 -0.297067 -0.128302 -0.287701 -0.139369 0.111859 0.358014 0.795746 0.693338 0.116090 0.621621 1.280464 0.523976 0.606457 1.453172 1.330234 1.242904 0.537148 1.362359 Bảng phụ 17 Các giá trị bi(T/T BSĐN) trung bình nhóm I Hình 5.40, trang 198-199 T/rimer/Trimer BSĐN NST (I) NST (I) NST (I) NST (I) NST (I) CCC/GGG CAG/CTG AAT/ATT AAC/GTT ACG/CGT ACT/AGT CCT/AGG CCA/TGG ATG/CAT AAA/TTT GAC/GTC ACA/TGT CCG/CGG AAG/CTT GCG/CGC GAA/TTC GAG/CTC GCA/TGC CTA/TAG TTA/TAA TCA/TGA TCG/CGA GCT/AGC GAT/ATC GGT/ACC GTG/CAC GCC/GGC TAC/GTA TCC/GGA TAT/ATA TCT/AGA TTG/CAA CAA/TTG AGA/TCT ATA/TAT CTG/CAG ATT/AAT CGT/ACG 0.097441 -0.052014 0.049757 0.189259 0.299217 0.132504 0.337389 0.525536 0.611687 0.365215 0.306753 0.863822 0.540729 0.965647 0.488872 0.694743 1.252805 1.033856 1.379970 1.737771 1.614021 0.791011 0.687074 0.480323 0.333262 0.524651 0.478039 0.182831 0.331683 -0.004934 0.261722 0.226318 -0.226318 -0.261722 0.004934 0.052014 -0.049757 -0.299217 0.156116 0.086156 0.074342 0.414157 0.427446 0.526806 0.126623 0.353292 0.630982 0.622443 0.604504 0.832160 0.714021 1.019658 0.616956 0.805680 1.037662 0.814116 1.529787 1.956907 1.909106 0.817813 0.665234 0.394514 0.351400 0.149724 0.279519 0.267376 0.365853 0.148007 0.106135 -0.000952 0.000952 -0.106135 -0.148007 -0.086156 -0.074342 -0.427446 0.006498 0.226373 0.061094 0.075076 0.047572 0.509212 0.364115 0.767666 0.603071 0.467551 0.478222 0.804805 0.650799 1.221665 0.578234 0.982233 1.211079 1.210716 1.571122 2.095150 1.734819 0.764615 0.936505 0.750983 0.731548 0.376394 0.312607 0.342826 0.271798 0.237276 -0.011480 0.087703 -0.087703 0.011480 -0.237276 -0.226373 -0.061094 -0.047572 -0.007913 0.052556 0.117691 0.006415 0.388564 0.235655 0.278764 0.447539 0.579661 0.459060 0.577333 0.987844 0.498993 0.805224 0.670960 0.815465 1.253205 1.233140 1.762117 2.156555 1.978382 0.918255 0.724612 0.830192 0.372504 0.397372 0.171224 0.226181 0.241959 0.192359 0.064398 0.203066 -0.203066 -0.064398 -0.192359 -0.052556 -0.117691 -0.388564 0.122916 -0.014284 0.111048 0.207881 0.478053 0.334127 0.209850 0.503652 0.504803 0.448151 0.585306 0.778009 0.668119 1.012123 0.693216 0.966783 1.160000 1.040045 1.662101 2.098076 1.826456 0.783227 0.571115 0.684602 0.444607 0.416862 0.226169 0.255655 0.188827 -0.038399 0.152099 0.065808 -0.065808 -0.152099 0.038399 0.014284 -0.111048 -0.478053 NST NST 10 NST (I) (I) (I) 0.043662 0.184625 0.102592 0.165725 0.204025 0.310433 0.354752 0.583340 0.468290 0.396330 0.484103 0.717876 0.498491 1.027701 0.582672 0.824440 1.093062 1.033301 1.572649 2.075737 1.752916 0.659971 0.547706 0.592006 0.316798 0.351466 0.206236 0.241603 0.232762 0.184630 0.104314 0.095050 -0.095050 -0.104314 -0.184630 -0.184625 -0.102592 -0.204025 -0.025869 0.080695 0.098290 -0.017020 0.236181 0.384321 0.239423 0.413068 0.539888 0.494752 0.528379 0.743974 0.584663 0.914952 0.523951 0.830988 1.068685 1.108214 1.615889 2.178783 1.779531 0.661582 0.630657 0.656152 0.441134 0.416848 0.144198 0.281656 0.151473 0.121298 0.082992 0.055487 -0.055487 -0.082992 -0.121298 -0.080695 -0.098290 -0.236181 0.040069 0.101700 0.076771 0.187691 0.240514 0.298501 0.236718 0.523871 0.491373 0.509469 0.574259 0.618823 0.674256 0.923237 0.584659 0.822964 1.029563 1.056038 1.593055 2.058691 1.827720 0.776337 0.608951 0.611286 0.628933 0.195919 0.177301 0.250665 0.146508 0.068465 -0.057402 -0.025777 0.025777 0.057402 -0.068465 -0.101700 -0.076771 -0.240514 259 NST (I) -0.055341 0.145770 0.180407 0.072860 0.196109 0.366645 0.307450 0.500000 0.529952 0.458366 0.625458 0.748744 0.648322 0.963163 0.630734 0.868176 1.164766 1.109121 1.723792 2.262003 1.911220 0.818260 0.755649 0.755753 0.536929 0.345089 0.195855 0.284618 0.183268 0.092159 0.017790 -0.044566 0.044566 -0.017790 -0.092159 -0.145770 -0.180407 -0.196109 NST NST 16 NST 15 NST 13 NST 14 NST 12 NST 11 (I) (I) (I) (I) (I) (I) (I) 0.100239 0.097812 0.087116 0.116111 0.232592 0.291890 0.341470 0.708326 0.495417 0.530996 0.673656 0.777259 0.617133 1.052707 0.605018 1.068881 1.212281 1.062128 1.713159 2.284817 1.878295 0.767021 0.777768 0.798288 0.579738 0.319299 0.159934 0.211013 0.149092 0.132078 0.003878 -0.025601 0.025601 -0.003878 -0.132078 -0.097812 -0.087116 -0.232592 0.065552 0.075047 0.123722 0.142333 0.204668 0.363920 0.287012 0.558283 0.513013 0.473897 0.597677 0.758396 0.651519 1.013844 0.635119 0.981815 1.265836 1.092246 1.771840 2.252806 1.927796 0.771165 0.682905 0.832747 0.642660 0.331088 0.205513 0.170260 0.205367 0.112854 -0.084846 0.025289 -0.025289 0.084846 -0.112854 -0.075047 -0.123722 -0.204668 0.053486 0.151817 0.112741 0.120565 0.286985 0.309720 0.338660 0.519300 0.447118 0.490330 0.572028 0.818478 0.669737 0.928918 0.634315 0.986201 1.162524 1.106940 1.697604 2.210408 1.920498 0.735248 0.700445 0.823977 0.489923 0.351474 0.188011 0.144754 0.143143 0.086771 0.085590 -0.046992 0.046992 -0.085590 -0.086771 -0.151817 -0.112741 -0.286985 0.032121 0.145928 0.273944 0.221473 0.246013 0.258777 0.284114 0.598600 0.455773 0.531494 0.664907 0.755582 0.652779 0.978925 0.578432 0.915312 1.151259 1.070831 1.677410 2.130847 1.899948 0.726897 0.669983 0.766005 0.543389 0.368341 0.164138 0.197555 0.201583 0.075635 -0.004880 -0.077825 0.077825 0.004880 -0.075635 -0.145928 -0.273944 -0.246013 0.086914 0.177114 0.164152 0.197985 0.285042 0.418729 0.338569 0.647196 0.533066 0.510031 0.574505 0.839451 0.686726 1.010327 0.548426 0.897254 1.139995 1.085908 1.717717 2.211684 1.916515 0.824153 0.609023 0.803568 0.513467 0.318506 0.185559 0.155756 0.218502 0.062801 0.128193 0.033820 -0.033820 -0.128193 -0.062801 -0.177114 -0.164152 -0.285042 0.113373 0.087275 0.019855 0.157840 0.261525 0.382369 0.357321 0.565104 0.455751 0.477686 0.552326 0.701483 0.625124 0.963942 0.597668 0.881560 1.198813 1.095103 1.704977 2.202500 1.841244 0.787036 0.669477 0.627424 0.493782 0.248479 0.195807 0.245501 0.293659 0.051335 -0.027559 0.015715 -0.015715 0.027559 -0.051335 -0.087275 -0.019855 -0.261525 0.152029 0.072572 0.160964 0.189545 0.197222 0.320679 0.289242 0.649465 0.539904 0.557273 0.616285 0.856237 0.761501 1.027413 0.486217 0.898544 1.336147 1.226560 1.756242 2.233470 2.010199 0.880534 0.615762 0.910290 0.510043 0.364865 0.181372 0.140372 0.254668 0.049346 0.174534 -0.094953 0.094953 -0.174534 -0.049346 -0.072572 -0.160964 -0.197222 AGT/ACT CAC/GTG ACC/GGT AGG/CCT CAT/ATG ATC/GAT AGC/GCT CGA/TCG CGG/CCG CTT/AAG CGC/GCG CTC/GAG TGC/GCA TAA/TTA TAG/CTA TGA/TCA TTC/GAA TGT/ACA GTC/GAC TTT/AAA TGG/CCA GGC/GCC GGA/TCC GTA/TAC GTT/AAC GGG/CCC -0.132504 -0.524651 -0.333262 -0.337389 -0.611687 -0.480323 -0.687074 -0.791011 -0.540729 -0.965647 -0.488872 -1.252805 -1.033856 -1.737771 -1.379970 -1.614021 -0.694743 -0.863822 -0.306753 -0.365215 -0.525536 -0.478039 -0.331683 -0.182831 -0.189259 -0.097441 -0.526806 -0.149724 -0.351400 -0.126623 -0.630982 -0.394514 -0.665234 -0.817813 -0.714021 -1.019658 -0.616956 -1.037662 -0.814116 -1.956907 -1.529787 -1.909106 -0.805680 -0.832160 -0.604504 -0.622443 -0.353292 -0.279519 -0.365853 -0.267376 -0.414157 -0.156116 -0.509212 -0.376394 -0.731548 -0.364115 -0.603071 -0.750983 -0.936505 -0.764615 -0.650799 -1.221665 -0.578234 -1.211079 -1.210716 -2.095150 -1.571122 -1.734819 -0.982233 -0.804805 -0.478222 -0.467551 -0.767666 -0.312607 -0.271798 -0.342826 -0.075076 -0.006498 -0.235655 -0.397372 -0.372504 -0.278764 -0.579661 -0.830192 -0.724612 -0.918255 -0.498993 -0.805224 -0.670960 -1.253205 -1.233140 -2.156555 -1.762117 -1.978382 -0.815465 -0.987844 -0.577333 -0.459060 -0.447539 -0.171224 -0.241959 -0.226181 -0.006415 0.007913 -0.334127 -0.416862 -0.444607 -0.209850 -0.504803 -0.684602 -0.571115 -0.783227 -0.668119 -1.012123 -0.693216 -1.160000 -1.040045 -2.098076 -1.662101 -1.826456 -0.966783 -0.778009 -0.585306 -0.448151 -0.503652 -0.226169 -0.188827 -0.255655 -0.207881 -0.122916 -0.310433 -0.351466 -0.316798 -0.354752 -0.468290 -0.592006 -0.547706 -0.659971 -0.498491 -1.027701 -0.582672 -1.093062 -1.033301 -2.075737 -1.572649 -1.752916 -0.824440 -0.717876 -0.484103 -0.396330 -0.583340 -0.206236 -0.232762 -0.241603 -0.165725 -0.043662 -0.384321 -0.416848 -0.441134 -0.239423 -0.539888 -0.656152 -0.630657 -0.661582 -0.584663 -0.914952 -0.523951 -1.068685 -1.108214 -2.178783 -1.615889 -1.779531 -0.830988 -0.743974 -0.528379 -0.494752 -0.413068 -0.144198 -0.151473 -0.281656 0.017020 0.025869 -0.298501 -0.195919 -0.628933 -0.236718 -0.491373 -0.611286 -0.608951 -0.776337 -0.674256 -0.923237 -0.584659 -1.029563 -1.056038 -2.058691 -1.593055 -1.827720 -0.822964 -0.618823 -0.574259 -0.509469 -0.523871 -0.177301 -0.146508 -0.250665 -0.187691 -0.040069 -0.366645 -0.345089 -0.536929 -0.307450 -0.529952 -0.755753 -0.755649 -0.818260 -0.648322 -0.963163 -0.630734 -1.164766 -1.109121 -2.262003 -1.723792 -1.911220 -0.868176 -0.748744 -0.625458 -0.458366 -0.500000 -0.195855 -0.183268 -0.284618 -0.072860 0.055341 -0.291890 -0.319299 -0.579738 -0.341470 -0.495417 -0.798288 -0.777768 -0.767021 -0.617133 -1.052707 -0.605018 -1.212281 -1.062128 -2.284817 -1.713159 -1.878295 -1.068881 -0.777259 -0.673656 -0.530996 -0.708326 -0.159934 -0.149092 -0.211013 -0.116111 -0.100239 -0.363920 -0.331088 -0.642660 -0.287012 -0.513013 -0.832747 -0.682905 -0.771165 -0.651519 -1.013844 -0.635119 -1.265836 -1.092246 -2.252806 -1.771840 -1.927796 -0.981815 -0.758396 -0.597677 -0.473897 -0.558283 -0.205513 -0.205367 -0.170260 -0.142333 -0.065552 -0.309720 -0.351474 -0.489923 -0.338660 -0.447118 -0.823977 -0.700445 -0.735248 -0.669737 -0.928918 -0.634315 -1.162524 -1.106940 -2.210408 -1.697604 -1.920498 -0.986201 -0.818478 -0.572028 -0.490330 -0.519300 -0.188011 -0.143143 -0.144754 -0.120565 -0.053486 -0.258777 -0.368341 -0.543389 -0.284114 -0.455773 -0.766005 -0.669983 -0.726897 -0.652779 -0.978925 -0.578432 -1.151259 -1.070831 -2.130847 -1.677410 -1.899948 -0.915312 -0.755582 -0.664907 -0.531494 -0.598600 -0.164138 -0.201583 -0.197555 -0.221473 -0.032121 -0.418729 -0.318506 -0.513467 -0.338569 -0.533066 -0.803568 -0.609023 -0.824153 -0.686726 -1.010327 -0.548426 -1.139995 -1.085908 -2.211684 -1.717717 -1.916515 -0.897254 -0.839451 -0.574505 -0.510031 -0.647196 -0.185559 -0.218502 -0.155756 -0.197985 -0.086914 Bảng phụ 18 Các giá trị bi(T/T BSĐN) trung bình nhóm II Hình 5.40, trang 200-201 260 -0.382369 -0.248479 -0.493782 -0.357321 -0.455751 -0.627424 -0.669477 -0.787036 -0.625124 -0.963942 -0.597668 -1.198813 -1.095103 -2.202500 -1.704977 -1.841244 -0.881560 -0.701483 -0.552326 -0.477686 -0.565104 -0.195807 -0.293659 -0.245501 -0.157840 -0.113373 -0.320679 -0.364865 -0.510043 -0.289242 -0.539904 -0.910290 -0.615762 -0.880534 -0.761501 -1.027413 -0.486217 -1.336147 -1.226560 -2.233470 -1.756242 -2.010199 -0.898544 -0.856237 -0.616285 -0.557273 -0.649465 -0.181372 -0.254668 -0.140372 -0.189545 -0.152029 T/rimer/Trimer BSĐN NST 10 NST 11 NST 12 NST 14 NST 13 NST 16 NST NST 15 NST (II) (II) (II) (II) (II) (II) (II) (II) (II) CCC/GGG CAG/CTG AAT/ATT AAC/GTT ACG/CGT ACT/AGT CCT/AGG CCA/TGG ATG/CAT AAA/TTT GAC/GTC ACA/TGT CCG/CGG AAG/CTT GCG/CGC GAA/TTC GAG/CTC GCA/TGC CTA/TAG TTA/TAA TCA/TGA TCG/CGA GCT/AGC GAT/ATC GGT/ACC GTG/CAC GCC/GGC TAC/GTA TCC/GGA TAT/ATA TCT/AGA TTG/CAA CAA/TTG AGA/TCT ATA/TAT CTG/CAG ATT/AAT CGT/ACG AGT/ACT CAC/GTG ACC/GGT -0.157121 -0.083603 -0.061912 -0.149824 -0.379494 -0.354448 -0.460871 -0.527416 -0.483233 -0.376634 -0.642711 -0.793422 -0.574756 -1.000559 -0.715925 -0.839568 -1.138897 -1.083601 -1.777251 -2.334346 -1.977737 -0.872557 -0.707994 -0.733990 -0.442597 -0.448130 -0.244480 -0.358314 -0.270708 -0.132247 -0.182887 0.014732 -0.014732 0.182887 0.132247 0.083603 0.061912 0.379494 0.354448 0.448130 0.442597 -0.016995 -0.216577 -0.026135 -0.260858 -0.312813 -0.367486 -0.197974 -0.452960 -0.534072 -0.596674 -0.710499 -0.726192 -0.685305 -1.093874 -0.631171 -1.011675 -1.289524 -1.070500 -1.708860 -2.241942 -1.968615 -0.768884 -0.661386 -0.845697 -0.591390 -0.310277 -0.103508 -0.178388 -0.121079 -0.046468 0.017558 0.041634 -0.041634 -0.017558 0.046468 0.216577 0.026135 0.312813 0.367486 0.310277 0.591390 -0.119800 -0.100229 -0.133046 -0.137117 -0.322051 -0.421932 -0.376247 -0.501380 -0.615982 -0.572209 -0.585716 -0.813881 -0.609541 -0.978026 -0.599997 -0.843092 -1.118229 -0.952071 -1.718174 -2.186375 -1.881780 -0.742296 -0.702614 -0.661571 -0.483347 -0.324366 -0.187387 -0.287814 -0.230205 -0.065726 0.000702 -0.021400 0.021400 -0.000702 0.065726 0.100229 0.133046 0.322051 0.421932 0.324366 0.483347 -0.053722 -0.131254 -0.137705 -0.140254 -0.209196 -0.266885 -0.271196 -0.587479 -0.516597 -0.535572 -0.576189 -0.871118 -0.708420 -0.978120 -0.550837 -0.943302 -1.251549 -1.156182 -1.730762 -2.164842 -1.763360 -0.802545 -0.644466 -0.750672 -0.572032 -0.352580 -0.108583 -0.102337 -0.107661 -0.061846 -0.031165 0.045666 -0.045666 0.031165 0.061846 0.131254 0.137705 0.209196 0.266885 0.352580 0.572032 -0.062777 -0.131294 -0.217471 -0.109582 -0.238242 -0.306664 -0.367890 -0.566832 -0.439963 -0.533428 -0.692329 -0.840700 -0.626354 -1.006120 -0.597515 -0.902424 -1.247038 -1.150069 -1.799380 -2.276611 -1.932833 -0.827302 -0.658203 -0.789345 -0.484247 -0.351003 -0.122455 -0.219327 -0.243054 -0.090320 0.037351 0.015257 -0.015257 -0.037351 0.090320 0.131294 0.217471 0.238242 0.306664 0.351003 0.484247 0.040425 -0.170320 -0.198449 -0.160838 -0.431686 -0.291698 -0.298848 -0.557834 -0.428370 -0.494897 -0.626629 -0.837723 -0.657934 -0.967697 -0.580408 -0.998083 -1.225339 -1.148108 -1.790261 -2.268465 -1.887617 -0.816645 -0.653477 -0.867891 -0.548641 -0.334014 -0.160852 -0.164534 -0.111547 -0.094900 -0.058036 0.060565 -0.060565 0.058036 0.094900 0.170320 0.198449 0.431686 0.291698 0.334014 0.548641 -0.049643 -0.186635 -0.212352 -0.196137 -0.299692 -0.323894 -0.342763 -0.508754 -0.425644 -0.544300 -0.598458 -0.809209 -0.708394 -0.995628 -0.601686 -0.997489 -1.257814 -1.196972 -1.736260 -2.248124 -1.949667 -0.754230 -0.634713 -0.924819 -0.542496 -0.285517 -0.134408 -0.126740 -0.117474 -0.090947 0.016405 0.020365 -0.020365 -0.016405 0.090947 0.186635 0.212352 0.299692 0.323894 0.285517 0.542496 -0.105006 -0.021279 -0.077507 -0.086093 -0.307054 -0.340264 -0.340026 -0.543057 -0.416722 -0.488068 -0.438825 -0.802717 -0.675502 -0.983833 -0.659658 -0.885332 -1.202412 -1.170811 -1.667119 -2.220284 -1.798648 -0.802809 -0.725129 -0.764781 -0.591241 -0.371995 -0.234942 -0.130142 -0.197266 -0.051657 -0.040040 -0.067212 0.067212 0.040040 0.051657 0.021279 0.077507 0.307054 0.340264 0.371995 0.591241 261 -0.107015 -0.128238 -0.086411 -0.153227 -0.251272 -0.371288 -0.317683 -0.589014 -0.471990 -0.512032 -0.591176 -0.786875 -0.596675 -1.034299 -0.658723 -0.943879 -1.197784 -1.177549 -1.660248 -2.229752 -1.813774 -0.845970 -0.810305 -0.745918 -0.629803 -0.340346 -0.247665 -0.236512 -0.333887 -0.113383 -0.007077 0.005707 -0.005707 0.007077 0.113383 0.128238 0.086411 0.251272 0.371288 0.340346 0.629803 NST (II) NST (II) NST (II) NST (II) NST (II) NST (II) NST (II) 0.002209 -0.097010 -0.132703 -0.083060 -0.236166 -0.394817 -0.349257 -0.503302 -0.515114 -0.539476 -0.605868 -0.813191 -0.677146 -1.116592 -0.711144 -0.950122 -1.181788 -1.121152 -1.740942 -2.263333 -1.937972 -0.819610 -0.754807 -0.785103 -0.654206 -0.350741 -0.300822 -0.241090 -0.338176 -0.193948 -0.012600 -0.050495 0.050495 0.012600 0.193948 0.097010 0.132703 0.236166 0.394817 0.350741 0.654206 -0.137111 -0.072292 -0.024437 -0.259841 -0.320402 -0.385796 -0.355199 -0.664070 -0.534802 -0.429599 -0.501228 -0.601363 -0.624899 -0.998406 -0.625217 -0.810295 -1.118454 -1.107573 -1.598466 -2.066747 -1.842452 -0.761662 -0.710199 -0.713925 -0.502795 -0.324367 -0.197367 -0.171430 -0.210167 -0.133862 0.028167 0.026464 -0.026464 -0.028167 0.133862 0.072292 0.024437 0.320402 0.385796 0.324367 0.502795 -0.016931 -0.190863 -0.085621 -0.105773 -0.078690 -0.423468 -0.369297 -0.521999 -0.576979 -0.471370 -0.574647 -0.700039 -0.559975 -1.123855 -0.673902 -0.807324 -1.282826 -1.113632 -1.707793 -2.232536 -1.868729 -0.779655 -0.729400 -0.772850 -0.661790 -0.322093 -0.093680 -0.140157 -0.142748 -0.230476 -0.052004 0.013132 -0.013132 0.052004 0.230476 0.190863 0.085621 0.078690 0.423468 0.322093 0.661790 -0.006706 -0.114978 -0.091511 -0.308981 -0.366176 -0.368020 -0.345986 -0.457739 -0.604580 -0.478106 -0.593937 -0.992579 -0.531749 -0.969745 -0.563288 -0.792345 -1.281091 -1.183239 -1.686643 -2.147086 -1.875842 -1.020158 -0.586391 -0.610637 -0.582613 -0.615348 -0.270398 -0.239914 -0.279990 -0.231549 -0.093528 -0.026505 0.026505 0.093528 0.231549 0.114978 0.091511 0.366176 0.368020 0.615348 0.582613 -0.178682 -0.012008 -0.044608 -0.033584 -0.267959 -0.479779 -0.351217 -0.268982 -0.657526 -0.315955 -0.504634 -0.564144 -0.571050 -0.938216 -0.527213 -0.706438 -0.974859 -1.121218 -1.564727 -1.947499 -1.529138 -0.962848 -0.643958 -0.536812 -0.470079 -0.389937 -0.298128 -0.164068 -0.200405 -0.164260 0.111660 -0.178811 0.178811 -0.111660 0.164260 0.012008 0.044608 0.267959 0.479779 0.389937 0.470079 -0.111444 -0.215990 -0.006379 -0.286300 -0.250465 -0.472397 -0.213690 -0.480904 -0.541961 -0.360602 -0.533367 -0.654076 -0.410394 -1.205385 -0.571368 -0.890013 -1.124510 -1.072843 -1.482903 -1.701363 -1.461070 -0.734254 -0.654481 -0.674356 -0.415234 -0.335171 -0.344416 -0.286339 -0.110991 -0.333267 -0.046831 -0.072954 0.072954 0.046831 0.333267 0.215990 0.006379 0.250465 0.472397 0.335171 0.415234 -0.041273 0.027464 -0.005313 -0.165340 -0.281658 -0.541079 -0.387692 -0.424749 -0.702636 -0.435196 -0.530616 -0.861681 -0.573819 -1.220845 -0.618257 -0.769495 -1.072805 -1.179192 -1.839772 -2.128384 -1.958461 -1.047065 -0.663447 -0.508331 -0.209835 -0.333610 -0.348707 -0.756280 -0.655063 -0.063042 -0.222597 0.132696 -0.132696 0.222597 0.063042 -0.027464 0.005313 0.281658 0.541079 0.333610 0.209835 AGG/CCT CAT/ATG ATC/GAT AGC/GCT CGA/TCG CGG/CCG CTT/AAG CGC/GCG CTC/GAG TGC/GCA TAA/TTA TAG/CTA TGA/TCA TTC/GAA TGT/ACA GTC/GAC TTT/AAA TGG/CCA GGC/GCC GGA/TCC GTA/TAC GTT/AAC GGG/CCC 0.460871 0.483233 0.733990 0.707994 0.872557 0.574756 1.000559 0.715925 1.138897 1.083601 2.334346 1.777251 1.977737 0.839568 0.793422 0.642711 0.376634 0.527416 0.244480 0.270708 0.358314 0.149824 0.157121 0.197974 0.534072 0.845697 0.661386 0.768884 0.685305 1.093874 0.631171 1.289524 1.070500 2.241942 1.708860 1.968615 1.011675 0.726192 0.710499 0.596674 0.452960 0.103508 0.121079 0.178388 0.260858 0.016995 0.376247 0.615982 0.661571 0.702614 0.742296 0.609541 0.978026 0.599997 1.118229 0.952071 2.186375 1.718174 1.881780 0.843092 0.813881 0.585716 0.572209 0.501380 0.187387 0.230205 0.287814 0.137117 0.119800 0.271196 0.516597 0.750672 0.644466 0.802545 0.708420 0.978120 0.550837 1.251549 1.156182 2.164842 1.730762 1.763360 0.943302 0.871118 0.576189 0.535572 0.587479 0.108583 0.107661 0.102337 0.140254 0.053722 0.367890 0.439963 0.789345 0.658203 0.827302 0.626354 1.006120 0.597515 1.247038 1.150069 2.276611 1.799380 1.932833 0.902424 0.840700 0.692329 0.533428 0.566832 0.122455 0.243054 0.219327 0.109582 0.062777 0.298848 0.428370 0.867891 0.653477 0.816645 0.657934 0.967697 0.580408 1.225339 1.148108 2.268465 1.790261 1.887617 0.998083 0.837723 0.626629 0.494897 0.557834 0.160852 0.111547 0.164534 0.160838 -0.040425 0.342763 0.425644 0.924819 0.634713 0.754230 0.708394 0.995628 0.601686 1.257814 1.196972 2.248124 1.736260 1.949667 0.997489 0.809209 0.598458 0.544300 0.508754 0.134408 0.117474 0.126740 0.196137 0.049643 0.340026 0.416722 0.764781 0.725129 0.802809 0.675502 0.983833 0.659658 1.202412 1.170811 2.220284 1.667119 1.798648 0.885332 0.802717 0.438825 0.488068 0.543057 0.234942 0.197266 0.130142 0.086093 0.105006 262 0.317683 0.471990 0.745918 0.810305 0.845970 0.596675 1.034299 0.658723 1.197784 1.177549 2.229752 1.660248 1.813774 0.943879 0.786875 0.591176 0.512032 0.589014 0.247665 0.333887 0.236512 0.153227 0.107015 0.349257 0.515114 0.785103 0.754807 0.819610 0.677146 1.116592 0.711144 1.181788 1.121152 2.263333 1.740942 1.937972 0.950122 0.813191 0.605868 0.539476 0.503302 0.300822 0.338176 0.241090 0.083060 -0.002209 0.355199 0.534802 0.713925 0.710199 0.761662 0.624899 0.998406 0.625217 1.118454 1.107573 2.066747 1.598466 1.842452 0.810295 0.601363 0.501228 0.429599 0.664070 0.197367 0.210167 0.171430 0.259841 0.137111 0.369297 0.576979 0.772850 0.729400 0.779655 0.559975 1.123855 0.673902 1.282826 1.113632 2.232536 1.707793 1.868729 0.807324 0.700039 0.574647 0.471370 0.521999 0.093680 0.142748 0.140157 0.105773 0.016931 0.345986 0.604580 0.610637 0.586391 1.020158 0.531749 0.969745 0.563288 1.281091 1.183239 2.147086 1.686643 1.875842 0.792345 0.992579 0.593937 0.478106 0.457739 0.270398 0.279990 0.239914 0.308981 0.006706 0.351217 0.657526 0.536812 0.643958 0.962848 0.571050 0.938216 0.527213 0.974859 1.121218 1.947499 1.564727 1.529138 0.706438 0.564144 0.504634 0.315955 0.268982 0.298128 0.200405 0.164068 0.033584 0.178682 0.213690 0.541961 0.674356 0.654481 0.734254 0.410394 1.205385 0.571368 1.124510 1.072843 1.701363 1.482903 1.461070 0.890013 0.654076 0.533367 0.360602 0.480904 0.344416 0.110991 0.286339 0.286300 0.111444 0.387692 0.702636 0.508331 0.663447 1.047065 0.573819 1.220845 0.618257 1.072805 1.179192 2.128384 1.839772 1.958461 0.769495 0.861681 0.530616 0.435196 0.424749 0.348707 0.655063 0.756280 0.165340 0.041273 Hình phụ 25 Đường cong tích lũy giá trị gán b i(T/T BSĐN) trung bình trình tự mang thông tin mã hóa protein phân tử DNA nhiễm sắc thể vi khuẩn 263 Hình phụ 25 Đường cong tích lũy giá trị gán b i(T/T BSĐN) trung bình trình tự mang thông tin mã hóa protein phân tử DNA nhiễm sắc thể vi khuẩn (tiếp theo) Các số hình vị trí bắt đầu kết thúc trình tự mang thông tin mã hóa protein nằm gần vị trí khởi đầu chép (mũi tên màu đỏ) kết thúc chép (mũi tên màu xanh) theo Worning cộng [90] 264 Hình phụ 26 Đường cong tích lũy giá trị gán b i(T/T BSĐN) trung bình trình tự mang thông tin mã hóa protein phân tử DNA nhiễm sắc thể S cerevisiae 265 Hình phụ 26 Đường cong tích lũy giá trị gán b i(T/T BSĐN) trung bình trình tự mang thông tin mã hóa protein phân tử DNA nhiễm sắc thể S cerevisiae (tiếp theo) NST số từ đến 16 thích Hình 5.40 266 Hình phụ 27 Mật độ phân bố trimer mã hóa codon trình tự sense antisense hai replichore phân tử DNA nhiễm sắc thể B lata 383 Thứ tự trimer thuộc nhóm (a) giữ nguyên theo kết so sánh dãy giá trị bất đối xứng trimer (bi T/T BSĐN) trình tự mang thông tin mã hóa protein phân tử DNA nhiễm sắc thể (kết so sánh không trình bày đây) Các trimer thuộc nhóm (b) trimer BSĐN (A) Nhiễm sắc thể (B) Nhiễm sắc thể (C) Nhiễm sắc thể NT1, T1, NT2 T2 thích Hình 5.46 Các replichore xác định theo vị trí khởi đầu vị trí kết thúc chép công bố Worning cộng [90] 267 Bảng phụ 19 bi(T/T BSĐN) trung bình nhóm (I) (II) Hình 5.50 Trimer/trimer BSĐN AAA/TTT AAC/GTT AAG/CTT AAT/ATT ACA/TGT ACC/GGT ACG/CGT ACT/AGT AGA/TCT AGC/GCT AGG/CCT AGT/ACT ATA/TAT ATC/GAT ATG/CAT ATT/AAT CAA/TTG CAC/GTG CAG/CTG CAT/ATG CCA/TGG CCC/GGG CCG/CGG CCT/AGG CGA/TCG CGC/GCG CGG/CCG CGT/ACG CTA/TAG CTC/GAG CTG/CAG CTT/AAG GAA/TTC GAC/GTC GAG/CTC GAT/ATC GCA/TGC GCC/GGC GCG/CGC GCT/AGC GGA/TCC GGC/GCC GGG/CCC GGT/ACC GTA/TAC GTC/GAC GTG/CAC GTT/AAC TAA/TTA TAC/GTA TAG/CTA TAT/ATA TCA/TGA TCC/GGA TCG/CGA TCT/AGA TGA/TCA TGC/GCA TGG/CCA TGT/ACA TTA/TAA TTC/GAA TTG/CAA TTT/AAA Mang thông tin mã hóa (I) (II) -0.007870 -0.498722 0.193859 -0.212479 0.078405 -0.601989 -0.389234 -0.088361 0.059235 -0.370008 0.088009 0.090401 -0.093794 -0.359525 0.206507 -0.049173 0.034268 -0.627449 -0.300792 -0.073278 0.026926 -0.363373 -0.206507 0.049173 -0.275446 -0.079498 0.155191 0.228668 -0.075598 -0.302196 0.300792 0.088361 0.115744 -0.238085 0.145800 0.021454 -0.218302 -0.138164 0.247569 0.302196 0.150324 0.119109 0.095173 0.198073 0.111971 -0.022197 0.075598 0.363373 -0.032635 -0.324367 0.161861 0.011134 -0.095173 0.022197 0.007870 0.359525 0.336048 -0.160909 0.145265 0.337515 0.275446 0.138164 0.135184 0.601989 0.029469 -0.526677 -0.294000 -0.270907 -0.135184 -0.337515 -0.247569 -0.228668 -0.274919 -0.092589 0.344608 0.042818 -0.161861 -0.011134 0.294000 0.073278 -0.155191 -0.340610 -0.111971 -0.042818 -0.088009 -0.198073 -0.145800 -0.090401 -0.344608 0.159555 -0.059235 0.270907 -0.150324 -0.021454 -0.193859 0.212479 -0.378701 -0.095168 0.218302 -0.159555 -0.336048 0.160909 0.274919 0.079498 -0.026926 0.174558 0.032635 0.340610 0.093794 0.324367 -0.078405 0.627449 -0.145265 -0.174558 0.389234 0.092589 -0.124220 -0.119109 0.124220 0.370008 0.378701 0.095168 -0.034268 0.526677 -0.115744 0.238085 -0.029469 0.498722 268 Không mã hóa protein (I) (II) -0.093794 0.081410 0.059235 -0.099319 -0.155191 0.169661 -0.032635 0.091622 0.193859 -0.178921 0.206507 -0.255904 -0.075598 0.091403 0.095173 -0.118283 -0.145265 0.216160 0.034268 0.002900 -0.294000 0.374126 -0.095173 0.118283 0.026926 0.055427 0.218302 -0.256939 -0.300792 0.327984 0.032635 -0.091622 0.115744 -0.156164 0.344608 -0.362870 0.078405 0.018514 0.300792 -0.327984 0.336048 -0.335265 0.378701 -0.425651 0.088009 -0.219600 0.294000 -0.374126 -0.135184 0.102057 0.150324 -0.167177 -0.088009 0.219600 0.075598 -0.091403 0.111971 -0.141223 0.275446 -0.393108 -0.078405 -0.018514 0.155191 -0.169661 -0.247569 0.305183 -0.124220 0.099176 -0.275446 0.393108 -0.218302 0.256939 0.029469 0.061040 0.145800 -0.219584 -0.150324 0.167177 -0.034268 -0.002900 -0.389234 0.458421 -0.145800 0.219584 -0.378701 0.425651 -0.206507 0.255904 -0.161861 0.149312 0.124220 -0.099176 -0.344608 0.362870 -0.059235 0.099319 -0.007870 0.056525 0.161861 -0.149312 -0.111971 0.141223 -0.026926 -0.055427 0.274919 -0.321350 0.389234 -0.458421 0.135184 -0.102057 0.145265 -0.216160 -0.274919 0.321350 -0.029469 -0.061040 -0.336048 0.335265 -0.193859 0.178921 0.007870 -0.056525 0.247569 -0.305183 -0.115744 0.156164 0.093794 -0.081410 Hình phụ 28 Sự chồng khít lên kết Hình 5.53 Hình 5.54 269 ... sp PCC6803 vào nhiễm sắc thể vi khuẩn B subtilis cách chèn toàn DNA nhiễm sắc thể Synechocystis vào điểm phân tử DNA nhiễm sắc thể Bacillus Thí nghiệm thành công phân tử DNA nhiễm sắc thể tạo thành... histone DNA sợi đôi Các hình màu đen-trắng hình ảnh DNA nhiễm sắc thể kính hiển điện tử vi truyền suốt [25] 2.4 SỰ SAO CHÉP DNA NHIỄM SẮC THỂ 2.4.1 Sự chép DNA nhiễm sắc thể tế bào vi khuẩn Ở... HỌC CỦA ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU Đề tài tìm hiểu qui tắc xếp nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể vi khuẩn nấm men, nhằm cung cấp sâu kiến thức phân bố nucleotide phân tử DNA nhiễm sắc thể tế bào vi