Bài giảng hóa học acid amin protein T

HÓA HOC HOA HỌC ACID AMIN AMIN-PROTEIN PROTEIN MỤC TIÊU BÀI HỌC      Viết công thức 20 acid amin thường gặp trongg pphân tử pprotein Trình bày tính chất acid amin: tính tích điện, tính chất vật lý hoá học Nêu tên sốá peptid có chức sinh học Trình bay bày đượ đươcc cac lien liên ket kết va cac bậc cau cấu truc trúc protein Trình bày đươcï tính chất pprotein: khuếch tán, tích điện, hoà tan kết tủa, biến tính PROTEIN LÀ LA GÌ?   Protein đại phân tử polymer phân tử acid amin (monomer) noi tư nối vớ vơii bằ bang ng liên kết peptid Trình tự acid amin gen quyế quyett đònh đònh Protein có nhiều chức thể vaii ttròø: cấáu ttrúùc, xúùc tá t ùc, vậän chuyể h ån, vậän động, dinh dưỡng dự trữ, bảo vệ, điều hòa … h tđ hoạ độäng củûa th thểå PROTID  Acid amin ( (-amino amino acid)  Peptid  Protein PROTID ACID AMIN – Cấu trúc  Acid amin * nhó nhom m amin (-NH ( NH2) * nhóm carboxyl (-COOH) gắ cung gann vao o carbon  * chuỗi bên (-R) Gốc R ACID AMIN – Cấu trúc -Amino acid ACID AMIN – Cấu trúc    Trong thiên nhiên có khoảng 300 AA Trong protein/sinh vật có 20 AA ((đó -amino acid)) Một số AA -amino acid:  alanin -aminobutyric -alanin,  aminobutyric acid acid… ACID AMIN – Đồàng phân  Trừ g glycin, y tất AA khác có carbon b át đ bấ đốái ((Carbon  nằm vòò trí trung tâm bất đối ) ACID AMIN – Đồàng phân Trong protein chứa L-  -amino acid ACID AMIN – Phân loại Dựa vào chuỗi bên (-R)  Không phân cực  Phân cực không tích điện  Phân cực tích điện PROTEIN  Chỉ thay đổi AA phân tử protein dẫn tới thay đổi hoatï tính hay y chức pprotein  Thí dụ: Thiếu máu hồng cầu liềm (Sickle cell anemia) HbA: X X-X-X-X-X-Glu X X X X Glu (chuỗ (chuoii ) HbS: X-X-X-X-X-Val (chuỗi ) lam m thay đoi đổi hình dang ng củ cuaa hồ hong ng cau cầu từ tư hình dóa nh hình liềm, giảm tính đàn hồi tăng khả vỡ hồng cầu cau PROTEIN HC hình liềm PROTEIN-Tính chất Lý tính Protein/nước tao Protein/nươc tạo dd keo (1[...].. .ACID AMIN – Phân loại AA không phân cực – hydrophobic – water fearing ACID AMIN – Phân loại AA không phân cực – hydrophobic – water fearing ACID AMIN – Phân loại AA phâ h ân cực – khô kh âng tích í h điệ đi än (chuỗi bên chứa các nhóm phân cực khó ion hóa) ACID AMIN – Phân loại AA phâ h ân cực – khô kh âng tích í h điệ đi än (chuỗi bên chứa các nhóm phân cực khó ion hóa) ACID AMIN – Phan... protein, protein hay có co mặt ơ ở cac các trung tam tâm hoat hoạt động của enzym ACID AMIN – Điện tích Ở pH trung tính, AA ở dạng lưỡng cực ACID AMIN – Tính chấ chatt Dipolar (zwitterion) ACID AMIN – Điện tích R-COOH R COOH  R R-COO COO- + H+ R-NH3+  R-NH2 + H+ Theo quan niệm Bronsted thì AA chứa ít nhất 2 nhom nhat nhóm acid phan phân ly yeu yếu  AA là acid yếu có thể phân ly nhiều lần ACID AMIN. .. ly lý  Cac Các acid amin khong không hấ happ thu á anh nh sá sang ng nhìn thấy được (không màu), và (trừ acid amin thơm Phe Tyr Phe, Tyr, His và va Trp) hấ happ thụ thu anh ánh sá sang ng ở ơ vung vùng tia hồng ngoại  Chỉ Phe Phe, T Tyr, r His vaà Trp hap hấp thụ th ơ ở vung øng UV  Đo nồng độ AA tốt nhất ở 280 nm Tính chấ chatt vật ly lý Ph å hhấáp thụ Phổ th của ủ vàøi acid id amin i Tính chấ... nhóm phân cực khó ion hóa) ACID AMIN – Phan Phân loai loại AA phân cực và tích điện âm ở pH cơ thể ((chuỗi bên chứa nhóm carboxyl) y) ACID AMIN – Phan Phân loai loại AA phan h â cự ưc, tí tíchh điệ đi än dương dươ ơ ở pH H cơ ơ th thể (chuỗi bên chứa nhóm amin) ACID AMIN – Phan Phân loai loại Một số AA đặc biệt • Hydroxylysine, hydroxyproline - collagen • γγ-Carboxyglutamate Carboxyglutamate - prothrombin... ly yeu yếu  AA là acid yếu có thể phân ly nhiều lần ACID AMIN – Điện tích ACID AMIN – Tính chất   Dạng ion hóa của AA thay đổi tùy theo pH môi trường  thay đổi [C] của các dạng ion Tại pH môi trường: o o o +/ = MAX A+/A- = A+ = MIN  ĐIỆN TÍCH = 0 pHi (isoelectric) (pH đẳng điện) AA không di chuyển trong điện trường ACID AMIN – Tính chất Tại pH môi trường < pHi AA hoạt động như base R-CH-COOCOOH... tiền chất • Citrullin, Citr llin ornithin - sinh tổ tong ng hợ hơpp ure re ACID AMIN – Phan Phân loai loại Vai trò của các AA trong chuỗi polypeptid  AA kỵ nướ nươcc khô khong ng tương tac tác trong mô moii trườ trương ng nước, chiếm phần lớn bề mặt phía trong phân tử protein Loạ protein Loaii nay này khô khong ng bò ion hoa, hóa khô khong ng tao tạo LK hydro  AA ưa nươc nước tương tá tacc vơi với... pHi AA hoạt động như base R-CH-COOCOOH NH3+   H+ R-CHNH3+ Tồn tại cả 3 dạng ion A+/-, A- , A+ Cation A+ chiếm tỉ lệä nhiều nhất Trong điện trường, AA chuyển về cực (-) ACID AMIN – Tính chất Tại pH môi trường > pHi AA hoạt động như acid R-CH-COONH3+   R-CH-COOH+ NH2 +/-, A- , A+ Ton Tồ n tạ taii ca cả 3 dang dạng ion A+/ Anion A- chiếm tỉ lệ nhiều nhất Trong điện trương, trường, AA chuyen chuyển... lý Ph å hhấáp thụ Phổ th của ủ vàøi acid id amin i Tính chấ chatt hoa hoá họ hocc PHẢN ỨNG DO NHÓM -NH2 VÀ -COOH PHẢN ỨNG CỦA GỐC R 1 Phản ứng NINHYDRIN 2 PHẢN ỨNG TẠO LIÊN KẾT PEPTID PEPTI D Tên: Acid glutamic - Glycin - Alanin - Lysin y y Kí hiệäu ba chữ: Glu-Gly-Ala-Lys Kí hiệu một chữ: EGAK PEPTID - Cấ C áu ttạo PEPTID O C N H AA1 AA2 Liên kết PEPTID AA3 (Bản chất là LK amid) AA4 PEPTID  Với... trai trái - đau đầu chuỗ chuoii  C tận ở phía bên phải - cuối chuỗi  Tên gọi theo tên riêng  Glutathion, l hi glucagon, l iinsulin, li ACTH… PEPTID tính chấ PEPTIDchatt  Phân tử peptid có:  Nhóm  -amin tự do ở đầu N tận  Nhóm -carboxyl y tựï do ở đầu C tậän  Bộ khung: mạch liên kết peptid  Chuỗãi bên: các gốác R của cáùc AA Có tính chất lưỡng tính ggiống AA