Ứng dụng chỉ thị phân tử PCR và dòng BAC để xác định gen GEN mùi thơm trên cây lúa (oryza sativa l)

GIÁO D C VÀ ÀO T O NÔNG NGHI P VÀ PTNT VI N KHOA H C NÔNG NGHI P VI T NAM - CHÂU T N PHÁT NG D NG CH TH PHÂN T VÀ DÒNG BAC XÁC PCR NH GEN MÙI TH M TRÊN CÂY LÚA (Oryza sativa L.) LU N ÁN TI N S NÔNG NGHI P N TH - 2013 B GIÁO D C VÀ ÀO T O B NÔNG NGHI P VÀ PTNT VI N KHOA H C NÔNG NGHI P VI T NAM - CHÂU T N PHÁT NG D NG CH TH PHÂN T DÒNG BAC XÁC PCR VÀ NH GEN MÙI TH M TRÊN CÂY LÚA (Oryza sativa L.) Chuyên ngành: Di truy n Ch n gi ng tr ng Mã s : 62.62.01.11 LU N ÁN TI N S NÔNG NGHI P Ng ih ng d n khoa h c: GS.TS Nguy n Th Lang GS.TS Bùi Chí B u N TH - 2013 ii ng Hòa Xã H i Ch Ngh a Vi t Nam c l p – T Do – H nh Phúc - I CAM OAN Tôi xin cam oan công trình nghiên c u:” ng d ng ch th phân t PCR dòng BAC xác nh gen mùi th m lúa (Oryza sativa L.)” a riêng Các s li u, k t qu nêu lu n án trung th c ch a t ng công b b t k công trình khác Tác gi lu n án Châu T n Phát c iii IC MT Xin chân thành bi t n Th y, Cô h - ng d n khoa h c: GS.TS Nguy n Th Lang, ã h t lòng ch d n nh ng n i dung c n thi t th c hi n môn h c, thí nghi m n i dung nghiên c u hoàn thành lu n án - GS.TS Bùi Chí B u, ã t n tình ch b o h ph ng d n n i dung, ng pháp k ho ch tri n khai thành công môn h c, th c hi n thí nghi m - Các th y cô tham gia gi ng o Vi n Lúa y l p nghiên c u sinh khóa ng b ng sông C u Long Không th hoàn thành lu n án n u s giúp ac s h ng d n khoa h c ng viên c a Cô Th y Xin chân thành bi t n H i th i gian ng ánh giá lu n án c p C S : ã dành nhi u c óng góp nhi u ý ki n qúi báu cho lu n án c hoàn thi n Xin chân thành c m n: - Vi n Khoa h c Nông nghi p Vi t Nam - Ban giám c Vi n Lúa ng b ng sông C u Long, ã giúp ki n cho h c t p th c hi n ng Ban giám hi u Tr - Ban giám hi u t p th th y cô giáo tr i H c C n Th Trâu Qu - Gia Lâm - Hà N i ã t o su t th i gian theo h c ch th c hi n - ng i h c N ng Nghi p I - u ki n giúp r t nhi u ng trình cao h c t i ây Phòng Khoa h c H p tác qu c t - Vi n Lúa Long, ã theo dõi, u tài - - t o ng b ng sông C u ng viên su t trình h c t p c ng nh tài t t nghi p môn Di Truy n Ch n Gi ng – Vi n Lúa Long, ã giúp v trang thi t b c ng nh h su t trình th c hi n tài t t nghi p ng b ng sông C u ng d n chuyên môn iv - môn Công Ngh H t Gi ng - Vi n Lúa ng viên t o th i gian qui - u ki n v th i gian giúp có th hoàn thành lu n án nh TS Bùi Th Thanh Tâm, TS Ph m Trung Ngh a ã óng góp nhi u ý ki n quí báu - ng b ng sông C u Long, ã hoàn thi n cho môn h c chuyên Sau cùng, xin c m thông s hy sinh, chia s ng i thân gia ình, b n bè, lu n án ng viên c a cha m ng nghi p góp ph n không nh vào thành công c a lu n án Tác gi lu n án Châu T n Phát v CL C i dung Trang Trang ph bìa i i cam oan ii ic mt iii cl c v Danh sách b ng viii Danh sách hình x xiv Danh m c t vi t t t M U Tính c p thi t c a tài M c tiêu nghiên c u Ý ngh a khoa h c th c ti n c a tài 3.1 Ý ngh a khoa h c 3.2 Ý ngh a th c ti n it Ch ng 1: T NG QUAN TÀI LI U VÀ ng ph m vi nghiên c u S KHOA C A TÀI 1.1 C s khoa c a tài 1.1.1 H p ch t t o mùi th m, gen th m m t s y u t môi tr nh h ng ng n vi c hình thành mùi th m lúa 1.1.2 Nguyên lý yêu c u ch n gi ng b ng MAS 1.1.3 Nhi m s c th nhân t o c a vi khu n BAC (Bacterial Artificial Chromosome) 1.2 ng ng thành t u di truy n 14 1.2.1 Nghiên c u di truy n gen mùi th m lúa 14 1.2.2 M t s nghiên c u n 19 ch n l c gen mùi th m c ng d ng PCR vi 1.2.3 M t s nghiên c u n c v ng ng BAC 25 NG PHÁP NGHIÊN 27 DNA ch n gi ng lúa Ch ng 2: N I DUNG, V T LI U VÀ PH U 2.1 N i dung nghiên c u 27 2.1.1 N i dung 27 2.1.2 N i dung 27 2.1.3 N i dung 27 2.2 V t li u nghiên c u 27 2.3 Ph 28 ng pháp nghiên c u 2.3.1 Ph ng pháp lai t o 28 2.3.2 Ph ng pháp phòng thí nghi m 33 2.4 ánh giá k t qu nghiên c u 46 2.5 47 a m nghiên c u 2.6 Th i gian th c hi n 47 Ch 48 ng 3: K T QU VÀ TH O LU N 3.1 Kh o sát c tính th m không th m gi ng lúa mùa lúa 48 cao s n 3.1.1 ánh giá ki u hình mùi th m b lúa mùa 3.1.2 a ph ng ánh giá ki u gen mang gen mùi th m b ng ch th SSR 48 66 gi ng lúa mùa 3.1.3 ánh giá ki u hình mùi th m b lúa cao s n 70 3.1.4 73 ánh giá ki u gen mang gen mùi th m gi ng lúa cao n th nghi m 3.2 ánh giá ki u hình ki u gen mùi th m gi ng s d ng làm t li u lai qu n th lai sau 77 c lai t o 3.2.1 ánh giá mùi th m gi ng lúa b m 77 3.2.2 Phát tri n qu n th c a 20 t h p lai 79 vii 3.2.3 Phân tích a d ng di truy n d a vào ki u hình c a gi ng 80 lúa b m t h p lai th h F1 3.2.4 Phân tích s bi u hi n di truy n mùi th m qu n th lai F1 83 3.2.5 Phân tích s bi u hi n di truy n mùi th m qu n th F3 t c p 84 3.2.6 ánh giá ki u gen mùi th m c a m t s gi ng b m t h p 86 lai OM2517/OM3536 lai b ng ch th phân t 3.2.7 ánh giá ki u hình ki u gen mùi th m qu n th BC2F2 88 t h p lai OM2517/OM3536 3.3 Khai thác th vi n BAC nh m dòng hóa vùng ch a gen qui nh mùi 93 th m 3.3.1 Sàng l c gen th m c a lúa thông qua BAC DNA 3.3.2 Xây d ng BAC contig (các chu i DNA nhân b n n m li n k ) 93 105 vùng gen mùi th m 3.3.3 Xác 3.3.4 nh BAC DNA ch a alen mùi th m ng d ng ch th phân t ch n l c dòng mang gen mùi 106 107 th m T LU N VÀ NGH 113 K T LU N 113 114 NGH DANH C CÔNG TRÌNH Ã CÔNG B TÀI LI U THAM KH O PH L C viii DANH SÁCH B NG th t N i dung Trang ng 2.1 Các ch th phân t ã s d ng lu n án trình t m i t ng 2.2 Ngu n g c m t s nghiên c u tài 27 ng ng c m c a gi ng lúa cs 28 c m c a gi ng lúa cs 29 ng thí 35 ng làm b ng 2.3 Ngu n g c m t s ng làm m ng 2.4 Tr ng l ng agarose theo n ng i t nghi m ng 2.5 Ch ng trình ch y PCR v i ch th SSR 37 ng 2.6 Ch ng trình ch y PCR v i ch th STS 38 ng 3.1 C p mùi th m c a m t s gi ng lúa mùa a 51 mùi th m thân a m t s gi ng lúa mùa a 52 mùi th m a m t s gi ng lúa mùa a 53 ng 3.4 M t s gi ng lúa mùa ch th hi n mùi th m h t 54 ng 3.5 M t s gi ng lúa mùa ch th hi n mùi th m thân 55 ph ng 3.2 C p ph ng 3.3 ng ng C p ph t ng ng 3.6 M t s gi ng lúa mùa ch th hi n mùi th m t 55 Các gi ng lúa mùa th hi n mùi th m toàn di n thân, 56 thân ng 3.7 h t ng 3.8 ánh giá ki u hình mùi th m lá, thân h t a 30 70 So sánh ki u hình ki u gen 30 gi ng thu c b lúa 76 gi ng lúa cao s n thu c b cao s n ng 3.9 cao s n ix ng 3.10 C p mùi th m lá, thân h t a gi ng lúa b 78 ng 3.11 C p mùi th m thân a t h p lai th h 79 F1 ng 3.12 Mùi th m thân, h t c a qu n th F3 t c p lai 84 OM2517/OM3536 ng 3.13 So sánh ki u gen ki u hình qu n th BC2F2 c a t 92 p lai OM2517/OM3536 ng 3.14 Nh ng dòng BAC d n ph locus mùi th m 97 c sàng l c b ng ch th RM223 ng 3.15 Nh ng dòng BAC d n ph locus mùi th m 98 c sàng l c b ng ch th RG28FL-RB ng 3.16 Nh ng dòng BAC d n ph locus mùi th m 100 c sàng l c b ng ch th SP6 ng 3.17 Ba m i sáu (36) dòng BAC ã c phát hi n sau ch y n di ki m tra s n ph m PCR v i ch th phân t 101 RM223, RG28FL-RB SP6 ng 3.18 V trí c a 36 dòng BAC c xác nh thông qua ch th 103 phân t RM223, RG28FL-RB SP6 ng 3.19 Các cá th BC2F2 t t h p lai OM2517/OM3536 c 110 ch n sau sàng l c PCR v i ch th 25D10 31F5 ng 3.20 So sánh ki u gen ki u hình qu n th BC2F2 c a t p lai OM2517/OM3536 sau ánh giá b ng ch th phân t 25D10 31F5 112 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 OM5894 OM5953 OM5954 OM6000 OM6055 OM6062 OM6161 OM6162 OM6367 OM6517 OM6600 OM6610 OM6621 OM6684 OM6878 OM6995 OM6L OM7345 OM7347 OM7349 OM7926 OM85 OM8923 OM9605 OMCF39 OMCF46 OMCS2000 OMCS2009 VD20 0 1 1 1 1 1 1 0 2 0 1 1 1 1 1 0 1 0 2 0 0 1 1 0 1 1 0 1 0 2 0 1 2 1 1 1 2 1 1 2 0 1 2 1 1 1 2 1 1 2 0 1 2 1 1 1 2 1 1 2 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 0 0 0: Không th m; 1: Th m nh ; 2: Th m Ph l c 3.3: K t qu ánh giá ki u hình mùi th m thân, h t c a 11 gi ng lúa dùng làm v t li u lai STT 10 11 TÊN GI NG KDM 105 IR64 Jasmine dòng OM4900 OM6161 OM6162 OM2514 OM2517 OMCS2000 (OM2509) OMCS2009 OM3536 C TÍNH MÙI TH M 2 1 0 0 THÂN 2 1 0 0 0 2 1 0 0 2 1 0 0 LÁ 2 1 0 0 T 2 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0: Không th m; 1: Th m nh ; 2: Th m Ph l c 3.4: K t qu ánh giá ki u hình mùi th m thân c a 20 t h p lai th h F1 STT 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 TÊN GI NG OM2514/Jasmine dòng OM2514/OM6161 OM2514/OM6162 OM2514/OM3536 OM2514/OM4900 OM2517/ Jasmine dòng OM2517/ OM6161 OM2517/ OM6162 OM2517/ OM3536 OM2517/ OM4900 OMCS2000/ Jasmine dòng OMCS2000/ OM6161 OMCS2000/ OM6162 OMCS2000/ OM3536 OMCS2000/ OM4900 OMCS2009/ Jasmine dòng OMCS2009/ OM6161 OMCS2009/ OM6162 OMCS2009/ OM3536 OMCS2009/ OM4900 KDM 105 ( /C) IR64 ( /C) 0 0 0 0 1 0 0 0 THÂN 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 LÁ 1 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0: Không th m; 1: Th m nh ; 2: Th m Ph l c 3.5: K t qu phân tích ANOVA mùi th m lá, thân h t c a gi ng lúa cao s n ng 1: Ngu n Gi ng pl i Sai s ng t qu phân tích ANOVA mùi th m c a gi ng lúa cao s n ng bình ph ng 170,3180 0,024465 3,97553 174,3180 Trung bình bình ph ng 1,577019 0,012232 0,018405 108 216 326 Giá tr F P 85,68308** 1,9E-135 0,664615 0,51552 Giá tr F Tiên oán (F crit) 1,30712 3,03766 Ghi chú: *: khác bi t th ng kê **: khác bi t th ng kê ng 2: Ngu n Gi ng pl i Sai s ng m c ý ngh a 5%; m c ý ngh a 1% t qu phân tích ANOVA mùi th m thân c a gi ng lúa cao s n ng bình ph ng 145,8593 0,073394 11,25993 157,1926 108 216 326 Trung bình bình ph ng 1,350549 0,036697 0,052129 Giá tr F P 25,90766** 6,39E-83 0,703965 0,495751 Giá tr F Tiên oán (F crit) 1,30712 3,03766 Ghi chú: *: khác bi t th ng kê **: khác bi t th ng kê m c ý ngh a 5%; m c ý ngh a 1% ng 3: K t qu phân tích ANOVA mùi th m h t c a gi ng lúa cao s n Ngu n Gi ng pl i Sai s ng ng bình ph ng 164,5994 0,960245 8,37308 173,9327 108 216 326 Ghi chú: *: khác bi t th ng kê **: khác bi t th ng kê m c ý ngh a 5%; m c ý ngh a 1% Trung bình bình ph ng 1,524068 0,480122 0,038764 Giá tr F 39,31629** 12,38568 Giá tr F Tiên oán P (F crit) 9,3E-101 1,30712 8,09E-06 3,03766 Ph l c 3.6: ánh giá ki u hình mùi th m 300 cá th F3 t h p lai OM2517/ OM3536 STT 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 TÊN GI NG/DÒNG OM2517 OM3536 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 Thân 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 p mùi th m Lá 1 1 1 0 1 1 1 0 1 0 t 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0: Không th m; 1: Th m nh ; 2: Th m Ph l c 3.7: K t qu ánh giá ki u hình ki u gen mùi th m qu n th BC2F2 t h p lai OM2517/OM3536 STT RM223 1 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 3 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 SP6 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 RG28FLRB 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 1 1 2 Ki u hình mùi th m Thân Lá H t 25D10 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31F5 3 1 1 1 1 1 1 3 1 1 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 - 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 3 2 2 2 1 1 1 1 - 1 1 1 3 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 1 1 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 3 3 3 3 1 3 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 Ghi chú: Dòng 1: M (Không th m); Dòng 2: B (Th m) ánh giá ki u hình thân, h t: 0:không th m; 1:th m nh ; 2:th m ánh giá ki u gen b ng ch th phân t RM223, RG28FL-RB, SP6, 25D10 31F5: 1: b ng không th m; 2: b ng d h p; 3: b ng th m; : b ng không xác nh [...]... c phân t nh m ch n t o ra lúa có ch t l ng g o th m là c p thi t Vì v y, tài: ” ng d ng ch th phân t PCR và dòng BAC gen mùi th m trên cây lúa (Oryza sativa L.)” xác nh c th c hi n 2.M c tiêu nghiên c u - Xác nh gen ‘‘fgr’’ qui c các dòng/ gi ng lúa và các cá th trong các qu n th lai mang nh mùi th m b ng ph ng pháp s d ng ch th phân t DNA 2 - Xác nh c các ch th DNA liên k t v i gen ‘‘fgr’’ quy nh mùi. .. u trên các n hi n ang it ng là các gi ng lúa mùa và các gi ng lúa cao c duy trì và nhân gi ng - Khai thác th vi n BAC DNA xác nh nh ng dòng BAC ch a gen mùi th m - Ph m vi nghiên c u: +C xác nh n i dung có liên quan v i gen “fgr” trên nhi m s c th s 8 và ng cao n có gen n các ch th phân t liên k t ng k t qu trên c tiêu + Phân l p c o n phân t mang gen c tiêu ch n gi ng lúa 3 CH NG QUAN TÀI LI U VÀ... di truy n mùi th m trên cây lúa có liên quan n m t gen l n ki m soát tính tr ng này [33], [35], [37], [71], [72], [90], [91], [97] 1.2.1.2 Mùi th m trên cây lúa do m t gen tr i ki m soát K t qu nghiên c u c a Kadam và Patankar [58] cho r ng gen th m là m t gen tr i Bên c nh ó, m t gen tr i c ng ã c báo cáo là u khi n mùi th m trên lúa b i Jodon và ctv [57a] 1.2.1.3 Mùi th m trên cây lúa do a gen ki m... ‘‘fgr’’ quy nh mùi th m cây lúa trên c s khai thác th vi n BAC 3 Ý ngh a khoa h c và th c ti n c a tài 3.1 Ý ngh a khoa h c - Xác nh nh ng d u chu n phân t riêng bi t liên k t v i gen “fgr” trên cây lúa giúp cho vi c ch n dòng con lai hi u qu - Xác nh nh ng dòng BAC DNA n t o các ch th m i liên k t v i gen qui nh mùi th m khai thác t ngu n dòng BAC gen c tiêu, ph c hi u rõ n v k thu t dòng hóa nghiên c u... 3.4 ng l các gi ng có mùi th m trên lá c a 103 gi ng lúa mùa Hình 3.3 a ph 49 ng 53 xi Hình 3.5 Bi u phân nhóm di truy n d a vào ki u hình mùi 59 th m trên h t Hình 3.6 Bi u phân nhóm di truy n d a vào ki u hình mùi 61 th m trên lá Hình 3.7 Bi u phân nhóm di truy n d a vào ki u hình mùi 63 th m trên thân Hình 3.8 Bi u phân nhóm di truy n d a vào ki u hình mùi 65 th m trên thân, lá và h t Hình 3.9 Ki m... o mùi th m, gen th m và m t s y u t môi tr ng ng nh n vi c hình thành mùi th m trên lúa 1.1.1.1 H p ch t t o mùi th m và s th hi n c a chúng trên các b ph n c a cây lúa Mùi th m c a h t g o c xác nh do nhóm formaldehyde, ammonia và hydrogen sulfide t o nên M t vài nghiên c u còn ghi nh n mùi th m là do s t ng a propanol, pentanol và hexanol trong quá trình t n tr Ngày nay b ng ph pháp hi n i ã xác. .. n trên lúa IR64 [115] Trên cao l BAC [109] Th vi n này c thi t ng có 13.750 dòng c kho ng 90% genome c a cao l ng và 14% b t p i trình t c a th l p Zhang và ctv [119] ã xây d ng th vi n BAC cho cây lúa thu c nhóm japonica và indica K t qu ghi nh n t ng t nh trên cao l ng Nh ng k t qu u tiên này cho th y BAC r t có tri n v ng trong ng d ng sinh h c phân t phân tích genome th c v t Kho l u tr BAC trên. .. th vi n BAC trên th gi i và Vi t Nam Theo Khush và ctv [62] th vi n nhi m s c th nhân t o n m men (YAC) trên lúa ã c công b b i RGRP (Rice Genome Research Program) và th vi n nhi m s c th nhân t o vi khu n (BAC) b i Wang và ctv [104] Wang và ctv [104] ã phát tri n l n cho vi c xây d ng b n v t lý trên b genome cây lúa Th vi n BAC này ch a kho ng 11.000 dòng v i kích th dòng ã u tiên th vi n BAC ph c... mùi th m n di trên agarose gel 1,2% Hình 3.14 S n ph m PCR v i m i SP6 trên 30 gi ng thu c b cao s n c khu ch i gen mùi th m 75 n di trên agarose gel 3% Hình 3.15 T l các gi ng có mùi th m trên lá, thân và h t c a 77 các gi ng lúa b m Hình 3.16 T l các gi ng có mùi th m trên lá và thân c a các 80 h p lai Hình 3.17 Bi u phân nhóm di truy n d a vào ki u hình mùi th m trên 9 gi ng lúa b m và 20 t h p lai... ng Các thanh l c th vi n BAC K t qu ã c 18, 13 và 106 dòng BAC theo th t các ch th nh trên Trong s 18 dòng BAC ã và 111E1) c ng ã c nh n bi t b i RSI3 có b n dòng BAC (1F21, 26D24, 56M22 c nh n bi t b i ch th G181 và sáu dòng BAC (1F21, 33M8, 56M22, 61A13, 104B15 và 111E1) c nh n bi t b i ch th L1044 Trên c s c t n ch c a enzyme HindIII, 12 trong s 18 dòng BAC ã c ch n l c và c t v i 11 enzyme c t