SNPs (đọc là snp) được viết tắt từ chữ Single Nucleotide Polymorphisms, có nghĩa là các dạng đa hình của nucleotide đơn. Marker này thường được dùng để phân tích genome người, hiện nay được áp dụng cho genome của nhiều sinh vật khác với số lượng lớn nhất từ trước đến nay, nhờ một đột biến điểm tại một nucleotide trên genome
SNP (SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS) I GIỚI THIỆU VỀ SNP - SNPs (đọc snip) viết tắt từ chữ Single Nucleotide Polymorphisms, có nghĩa dạng đa hình nucleotide đơn Marker thường dùng để phân tích genome người, áp dụng cho genome nhiều sinh vật khác với số lượng lớn từ trước đến nay, nhờ đột biến điểm nucleotide genome (hình 1) Hình 1: Một đột biến điểm xảy dẫn đến thay cặp nucleotide G – C A – T ngược lại tạo SNP - Đa hình đơn nucleotide, SNPs biến thể trình tự DNA xảy đơn nucleotide (A, T, C, G) trình tự gen bị thay đổi Ví dụ SNP thay đổi trình tự DNA GGCTAA A đến A GGCTAA T Đối với biến thể coi SNP, phải xảy 1% dân số SNPs, tạo nên khoảng 90% tất biến thể di truyền người, xảy 100 đến 300 dọc theo hệ gen người 3-tỷ-base Hai số ba SNPs liên quan đến thay cytosine (C) với thymine (T) SNPs xảy khu vực gen mã hóa (gen) không mã hoá Nhiều người SNPs ảnh hưởng đến chức tế bào, nhà khoa học tin người khác predispose người bệnh ảnh hưởng đến phản ứng họ với loại thuốc - SNPs diễn bình thường suốt DNA người Trung bình xảy lần 300 nucleotide, có nghĩa có khoảng 10 triệu SNPs hệ gen người Thông thường nhất, biến thể tìm thấy DNA gen Nó xem đánh dấu sinh học, nhà khoa học giúp xác định vị trí gen liên quan đến bệnh Khi SNPs xảy gen khu vực gần gen quy định, có vai trò trực tiếp đến xuất bệnh cách ảnh hưởng đến chức gen - Mặc dù 99% trình tự ADN người giống nhau, thay đổi chuỗi DNA có tác động lớn đến việc làm người bệnh, yếu tố môi trường, chẳng hạn vi khuẩn, virus, độc tố, hóa chất, loại thuốc liệu pháp điều trị khác Điều làm cho SNPs có giá trị cho nghiên cứu y sinh học phát triển sản phẩm dược phẩm chẩn đoán y khoa SNPs tiến hóa ổn định, không thay đổi nhiều từ hệ sang hệ khác làm cho dễ dàng nghiên cứu dân số - SNP biến dạng chuỗi DNA tìm thấy với tần suất cao genome người (Taillon – Miller ctv 1998) Chúng ta sử dụng SNP marker để phân lập yếu tố di truyền có liên quan đến tính trạng bệnh lý vô phức tạp (Taillon – Miller ctv 1999) Người ta dự đoán 100.000 nhiều SNP marker (trong quãng 30-kb, marker cho gen) genome người (Collins ctv 1997) Những phương pháp đánh giá kiểu gen với kết cao đòi hỏi kiến thức chuỗi trình tự xác SNP Do đó, công bố SNP phải hàm chứa hai nội dung: (1) Xác định chuỗi trình tự DNA (2) Tần số alen Đây kỹ thuật áp dụng vào đầu năm 2000, từ genome người đến genome loài sinh vật khác Arabidopsis, lúa (Oryza sativa L.), … II PHƯƠNG PHÁP XÁC ĐỊNH SNP - Có hai phương pháp để tạo SNP, dùng trực tiếp mã trình tự di truyền thứ hai phân biệt đột biến điểm thông qua dùng tách sắc ký lỏng (DHPLC) Thông thường dùng primer để thiết kế mã trình tự đoạn khuyết đại khoảng 500 cặp base Chúng ta dùng phương pháp PCR tách hai cá thể trộn cá thể chung, sau đun nóng lai để thành lập dulex tương đồng dị biệt Các bước để phân tích axit nucleic SNP sau: + Phân lập DNA + Chọn lựa primer thiết kế primer khuếch đại PCR + Tách SNP bước sóng tương thích (DHPLC) + Phối hợp số liệu, mã trình tự DNA cloning - Theo phân tích chi tiết chuỗi trình tự phần genome, trình tự DNA từ hai cá thể khác phần lớn giống nhau, với số cặp base khác biệt nằm khoảng cho phép 500 – 1000bp Một cặp base vị trí biểu thị khác cá thể có tính chất phổ biến cặp base khác “variant” phổ biến vị trí Nếu cặp base có tính chất phổ biến xuất xuất với xác suất nhỏ 1% quần thể, người ta định nghĩa vị trí cặp base vị trí SNP Hiện nay, người ta công bố 3.000.000 SNP genome người (Rusell 2002), nhiều DNA marker công bố trước Kiểu đa vô quan trọng di truyền người chúng đại diện cho 98% tất đa hình DNA Các alen SNP dễ dàng xem xét phân tích lai với phân tử oligonucleotide + Trong quy trình này, đoạn dò (probe) ngắn hay đoạn oligonucleotide (gọi phân tử oligo) chứa khoảng 25bp tổng hợp cho bổ sung vào alen phổ biến locus SNP Phân tử DNA trộn với DNA mục tiêu tiến trình lai hoàn chỉnh mức độ xác (high stringency) Điều có nghĩa điều kiện phải thuận lợi cho lai probe DNA + Khi tượng lai xảy ra, DNA mục tiêu có alen phổ biến (common allene) Dưới điều kiện xác kiện “matching” (cặp base tương ứng bắt cặp với nhau, phân tử oligo không lai với DNA mục tiêu có cặp base bị thay đổi – SNP (hình 2) Phân tử lai ổn định với cặp base hoàn toàn tương ứng Oligonucleotide G C C A T T AAGT C T T C AT C C C T A C GGT AAT T C A GAA GT AGGGAT DNA mục tiêu SNP Một cặp base không tương ứng, hydrid không ổn định Mismatch: làm cho cặp base không hình thành C G C C A T T A AGT T T C A T C C C T A C GGT AAT T C AC AA GT AGGGAT Hình 2: Phân tích lai oligonucleotide tạo SNP Một oligonucleotide có tính chất bổ sung hoàn toàn alen bình thường, lai với DNA mục tiêu điều kiện tối ưu có tính chất “fullmatch” (bắt cặp base hoàn toàn tương xứng) probe DNA Khi kiện lai xảy ra, DNA mục tiêu có alen bình thường, kiện lai không xảy ra, DNA mục tiêu có base tình trạng “mismatch”, người ta gọi đa hình SNP - Việc tạo phản ứng lúc hàng trăm SNP thực nhờ sử dụng “DNA microarray”, gọi DNA chips, GeneChips arrays (thương hiệu Affmetrix, Inc) oligonucleotide arrays Microarray có khả đọc biết 100.000 nhiều phân tử DNA diện tích 3,6cm (hình 3) + DNA microarray kỹ thuật xếp phối hợp phân tử bao gồm đoạn DNA protein cho lai với phân tử probe thư viện DNA xếp theo matrix Kỹ thuật DNA microarray nhằm mục đích tìm hiểu thể gen, mức độ đa dạng nguồn di truyền, đồ gen, phân tích biến động gen + DNA microarray hiểu cách đơn giản xếp cách thứ tự hàng nghìn đơn vị phân tử DNA probe với trình tự giống Chúng cố định kính màng nylon Hình 3: Xác định đa hình nucleotide đơn kỹ thuật microarray * Lịch sử đời kỹ thuật microarray: Vào cuối năm 1960, Pardue & Gall; Jones & Roberson tìm phương pháp lai in situ có sử dụng mẫu dò đánh dấu huỳnh quang, FISH Phương pháp cố định nhiễm sắc thể nhân phiến kính (sao cho DNA tạo thành mạch kép với mẫu dò) ngày sử dụng để đặt DNA lên phiến kính phương pháp microarray Vào thời gian này, hoá học hữu phát triển, cho phép tổng hợp tự động mẫu dò oligonucleotide vào năm 1979 Kỹ thuật phân tích sử dụng phương pháp gắn đồng thời nhiều trình tự đích lên lọc hay màng theo thứ tự, phương pháp thấm điểm (dot blot), Kafatos cộng (1979) đưa Với kỹ thuật này, trình tự đích cố định vật đỡ lai với mẫu dò (thường trình tự axit nucleic đánh dấu) Saiki cộng (1989) đưa cách khác, dot blot ngược, gắn nhiều mẫu dò theo thứ tự màng đích để phân tích đánh dấu Cùng thời gian này, array với giá thể không thấm nước tạo phòng thí nghiệm Maskos (1991) Đầu năm 1990, kỹ thuật đánh dấu phát huỳnh quang đa màu Ried cộng sự; Balding & Ward giới thiệu Vào năm 1993, array chứa oligonucleotide ngắn, 19 nucleotide tổng hợp in situ Năm 1994, Hoheisel cộng tăng mật độ chấm (spot) cách dùng robot để lấy đặt mẫu dò lên giá thể Phương pháp tự động hoá làm tăng tốc độ trình, giảm sai sót chắn mắc phải thực thủ tục có tính lặp lại cao tay, tăng tính xác vị trí, tăng tính đồng hình spot mẫu ⇒ Tất thí nghiệm tiên phong sở kỹ thuật array Người ta đánh giá rằng, kỹ thuật phát triển đến mức vài năm so sánh với kỹ thuật PCR thiếu sinh học * Trình tự thực microarray mô tả sau: (1) Thực công việc in slide, chạy PCR, thiết lập chương trình đảm bảo chất lượng sản phẩm PCR, làm tinh khiết sản phẩm PCR (2) Sao chép microarray thông qua hệ thống tự động, tạo hồ sơ chi tiết chuẩn bị gen (3) Thực lai DNA với probe, người ta cần phải ly trích RNA để nhuộm với Cy3 Cy5 (4) Thực việc chụp hình thông qua máy “scanner” phân tích số liệu Thí nghiệm DNA microarray cần có probe DNA mục tiêu, đó, probe phân tử DNA cố định chip thủy tinh silicon, chúng chưa đánh dấu, DNA mục tiêu đánh dấu mà nồng độ phân tích Vì vậy, người ta sử dụng chip tên gọi “probe array” Huỳnh quang sử dụng để đánh dấu “florescein” “cyanine”, phẩm màu Cy3 có màu xanh phẩm màu Cy5 có màu đỏ Dấu hiệu đánh dấu microarray phải dùng hai chất màu nhuộm phổ biến Cy3 Cy5 Các chất nhuộm thường dUTP dCTP Cy3 cho màu vàng cam với ánh sáng hấp thu tối thiểu 50nm tối đa 581nm Cy5 cho màu đỏ với ánh sáng hấp thu tối thiểu 649nm tối đa 670nm Kết hình ảnh thể gen mục tiêu nhận biết matrix Nếu mã microarray biểu có gen mục tiêu, kết dương tính Ngược lại, phản ứng âm tính (không có kết lai với probe) Hình 4: Quy trình microarray Nhiều kỹ thuật nghiên cứu để tạo SNP theo kiểu tự động hóa với giúp đỡ computer (Wang ctv 1998) Những kỹ thuật là: EST Sequence Data, EST Assembly với phần mềm chuyên trách, phương pháp đánh giá kiểu gen thông qua thiết kế mồi (primer) cho PCR GBA theo phần mềm GBA-primer1.1, phương pháp xác định SNP kỹ thuật đọc chuỗi trình tự pyrophosphate DNA vào thời điểm thích hợp (Alderborn ctv 2000) III TÍNH CHẤT CỦA SNP - SNP có tính chất “diallelic” quần thể tần số alen ước đoán dễ dàng quần thể nào, thông qua loạt xét nghiệm kỹ thuật (Kwor ctv 1994) - SNP marker có tính ổn định cao mặt di truyền - Là sản phẩm PCR - Được tìm thấy với tần suất cao genome người - Độ đa dạng cao IV ỨNG DỤNG VÀ TRIỂN VỌNG CỦA SNPs SNPs đồ - Người ta phát chiến lược nghiên cứu giúp cho việc phát nhanh chóng SNP từ số liệu lưu trữ EST (Expressed Sequence Tag) (Picuolt – Newberg ctv 1999) Sự kiện phát triển in vitro nhằm khuếch đại trình tự vị trí đặc biệt, ví dụ PCR khám phá marker có tính đa hình có thông tin di truyền cao microsatallite, STR (short tandem repeat), kiện tạo điều kiện thuận lợi để sáng tạo đồ di truyền có mật độ thấp (lom density maps) người, ứng dụng có hiệu lĩnh vực y khoa, thí dụ xét nghiệm bệnh u xơ, bệnh Huntington, bệnh tiểu đường, … (Broman ctv 1998) - Các nhà khoa học tin SNP đồ giúp họ xác định nhiều gen liên quan với bệnh phức tạp ung thư, bệnh tiểu đường, bệnh mạch máu, số hình thức bệnh tâm thần - Một vài nhóm làm việc để tìm SNPs cuối tạo SNP đồ hệ gen người Trong số Mỹ Human Genome Project (HGP) nhóm lớn công ty dược phẩm gọi SNP Consortium, dự án TSC Khả trùng lặp nhóm nhỏ khó xảy có khoảng triệu SNPs, phần thưởng tiềm đồ SNP cao - Ngoài ý nghĩa nghiên cứu pharmacogenomic chẩn đoán, y sinh học, SNP đồ giúp để xác định hàng ngàn dấu hiệu bổ sung gen, hướng nghiên cứu đồ gen lớn Làm SNPs sử dụng yếu tố nguy phát triển bệnh? - SNPs không gây bệnh, giúp xác định khả phát triển bệnh cụ thể Một gen liên quan với bệnh Alzheimer, apolipoprotein E APOE, ví dụ tốt cách SNPs ảnh hưởng đến phát triển bệnh apoE chứa hai SNPs mà kết ba alen cho gen này: E2, E3, E4 Mỗi allele khác sở DNA, sản phẩm protein gen khác amino axit - Mỗi cá nhân thừa hưởng mẹ APOE nội APOE Nghiên cứu cho thấy người thừa hưởng E4 allele có hội lớn để phát triển bệnh Alzheimer Rõ ràng, thay đổi amino acid protein E4 làm thay đổi cấu trúc chức protein có nhiều khả để làm cho bệnh phát triển Nếu người kế thừa allele E2 có khả phát triển bệnh Alzheimer - Tất nhiên, SNPs số tuyệt đối phát triển bệnh Một người thừa hưởng hai alen E4 không phát triển bệnh Alzheimer, người thừa hưởng hai alen E2 APOE gen có liên quan đến bệnh Alzheimer Giống rối loạn mãn tính bệnh tim, tiểu đường, ung thư phổ biến nhất, bệnh Alzheimer bệnh gây biến thể vài gen - Hầu hết SNPs ảnh hưởng đến sức khỏe phát triển Một số khác biệt di truyền chứng minh quan trọng việc nghiên cứu sức khỏe người Các nhà nghiên cứu tìm thấy SNPs giúp dự đoán phản ứng cá nhân với số loại thuốc định, nhạy cảm với yếu tố môi trường chất độc, nguy phát triển bệnh cụ thể SNPs sử dụng để theo dõi thừa kế gen bệnh gia đình Nghiên cứu tương lai làm việc để xác định SNPs liên kết với bệnh phức tạp bệnh tim, tiểu đường ung thư - Nhiều loại bệnh phổ biến người không gây biến thể di truyền gen nhất, bị ảnh hưởng tương tác phức tạp nhiều gen yếu tố môi trường lối sống - Mặc dù yếu tố môi trường lối sống có ảnh hưởng đến phát triển bệnh, khó khăn để đo lường đánh giá hiệu tổng thể họ trình bệnh Vì vậy, tiềm cá nhân để phát triển bệnh dựa gen yếu tố di truyền - Yếu tố di truyền trao nhạy cảm kháng bệnh xác định mức độ nghiêm trọng tiến triển bệnh Bởi chưa biết tất yếu tố liên quan đường phức tạp, nhà nghiên cứu tìm thấy khó khăn để phát triển xét nghiệm sàng lọc cho hầu hết bệnh rối loạn Bằng cách nghiên cứu mối liên quan SNP với đặc điểm bệnh, nhà nghiên cứu phát gen có liên quan với bệnh Xác định hiểu biết vai trò yếu tố di truyền bệnh cho phép nhà nghiên cứu đánh giá tốt vai trò yếu tố di truyền, chẳng hạn hành vi, chế độ ăn uống, lối sống, hoạt động thể chất có bệnh - Bởi yếu tố di truyền ảnh hưởng đến phản ứng người điều trị thuốc, đa hình DNA chẳng hạn SNPs hữu ích việc giúp nhà nghiên cứu xác định hiểu lý cá nhân khác khả hấp thụ loại thuốc định, để xác định lý cá nhân trải nghiệm tác dụng phụ bất lợi cho loại thuốc cụ thể Vì vậy, việc phát gần SNPs hứa hẹn mang đến cách mạng không trình phát bệnh thực tế thuốc phòng ngừa chữa bệnh SNPs chẩn đoán bệnh: - Vật liệu di truyền người có mô hình SNP độc đáo tạo thành nhiều biến thể di truyền khác Các nhà nghiên cứu tìm thấy hầu hết SNPs không chịu trách nhiệm cho bệnh tật Thay vào đó, dấu hiệu sinh học để xác định xác bệnh đồ hệ gen người, thường nằm gần gen tìm thấy có liên quan đến bệnh Thỉnh thoảng, SNP thực gây bệnh, đó, sử dụng để tìm kiếm cô lập gen gây bệnh Để tạo thử nghiệm di truyền, gen gây bệnh xác định nhà khoa học thu thập mẫu máu từ nhóm cá nhân bị ảnh hưởng bệnh phân tích DNA họ cho mẫu SNP Tiếp theo, nhà nghiên cứu so sánh mô hình với mẫu thu cách phân tích ADN 10 từ nhóm cá nhân không bị ảnh hưởng bệnh Loại so sánh này, gọi "Hiệp hội nghiên cứu", phát khác biệt mô hình SNP hai nhóm, qua cho thấy mô hình liên quan với gen gây bệnh Cuối cùng, hồ sơ SNP đặc trưng nhiều loại bệnh khác thành lập Sau đó, vấn đề thời gian, bác sĩ xác định người nhạy cảm với bệnh cách phân tích mẫu DNA họ cho mô hình cụ thể SNP Phát triển SNPs dược: - Như đề cập trước đó, SNPs kết hợp với độ hấp thụ giải phóng mặt đại lý trị liệu Hiện nay, cách đơn giản để xác định làm bệnh nhân đáp ứng với loại thuốc cụ thể Một điều trị chứng minh có hiệu bệnh nhân hiệu người khác Tệ nữa, số bệnh nhân trải qua phản ứng miễn dịch bất lợi loại thuốc cụ thể - Trong tương lai, loại thuốc thích hợp cho cá nhân xác định trước điều trị cách phân tích hồ sơ SNP bệnh nhân Mục tiêu tạo loại thuốc có khả phù hợp cho cá nhân đó, gọi "thuốc cá nhân hoá", điều cho phép công ty dược phẩm mang lại nhiều loại thuốc cho thị trường cho phép bác sĩ kê toa phương pháp điều trị cho cá nhân cụ thể theo nhu cầu bệnh nhân SNPs NCBI Bởi SNPs xảy thường xuyên gen có xu hướng tương đối ổn định mặt di truyền, dấu sinh học tuyệt vời Đánh dấu sinh học đoạn DNA với vị trí địa lý, nhận dạng dễ dàng theo dõi sử dụng để xây dựng đồ nhiễm sắc thể cho thấy vị trí gen biết được, dấu hiệu khác, tương Những đồ cho phép nhà nghiên cứu để nghiên cứu xác định đặc điểm kết từ tương tác nhiều gen NCBI đóng vai trò quan trọng việc tạo điều kiện thuận lợi cho việc xác định danh mục SNPs thông qua việc tạo trì sở liệu SNP công cộng ( dbSNP ) Công cụ mạnh mẽ di truyền truy cập cộng đồng y sinh học toàn giới dự định để kích thích nhiều 11 lĩnh vực nghiên cứu sinh học, bao gồm việc xác định thành phần di truyền bệnh NCBI "Khám phá không gian" Tạo điều kiện thuận lợi cho SNP nghiên cứu Các ghi dbSNP cross-chú thích nguồn thông tin nội khác PubMed, trình tự dự án gen, GenBank hồ sơ, sở liệu Gene Entrez, sở liệu dbSTS Người dùng truy vấn dbSNP trực tiếp bắt đầu tìm kiếm phần không gian NCBI khám phá để xây dựng hồ sơ dbSNP đáp ứng điều kiện tìm kiếm họ Hồ sơ tích hợp với nguồn thông tin bên thông qua siêu văn URL mà người dùng dbSNP thể làm theo để tìm hiểu thông tin chi tiết vượt phạm vi curation dbSNP Để tạo điều kiện thuận lợi cho nỗ lực nghiên cứu, NCBI dbSNP bao gồm hệ thống phục hồi Entrez mà cung cấp truy cập tích hợp số công cụ phần mềm sở liệu hỗ trợ phân tích SNP Ví dụ, ghi SNP liên kết sở liệu để nguồn lực bổ sung "Vũ trụ Discovery NCBI” Tài nguyên bao gồm: GenBank , sở liệu trình tự NIH Gene Entrez điểm đầu mối cho gen thông tin liên quan; dbSTS , NCBI nguồn tài nguyên có chứa chuỗi liệu đồ mốc ngắn gen; gen người xếp liệu; PubMed , tìm kiếm tài liệu NCBI hệ thống phục hồi SNP hồ sơ liên kết đến nguồn lực bên khác có liên quan Cung cấp truy cập đến trang web "một cửa SNP mua sắm" tạo điều kiện nghiên cứu khoa học nhiều lĩnh vực khác nhau, từ di truyền quần thể sinh học tiến hóa quy mô lớn bệnh nghiên cứu đến thuốc Đầu tư lâu dài nghiên cứu hứa hẹn không để nâng cao sinh học người mà để “cách mạng hóa” thực hành y học đại TÀI LIỆU THAM KHẢO PGS.TS Nguyễn Thị Lang GS TS Bùi Chí Bửu 2005 Sinh học phân tử giới thiệu phương pháp ứng dụng Nhà xuất Nông Nghiệp & Phát triển Nông thôn Trang 72-73 12 GS TS Bùi Chí Bửu PGS.TS Nguyễn Thị Lang 2008 Di truyền phân tử 2008 Nhà xuất Nông Nghiệp & Phát triển Nông thôn Trang 180-184 NCBI sở liệu đa hình đơn nucleotide (dbSNP) Cơ sở liệu Nhật Bản đa hình đơn nucleotide (JSNP)News Network Genome dbSNP sở liệu - Từ Trung tâm Quốc gia Thông tin Công nghệ sinh học (NCBI) SNPs: Các biến thể chủ đề giới thiệu để SNPs từ Trung tâm Quốc gia Thông tin Công nghệ sinh học (NCBI) Hiểu SNPs ung thư - Một hướng dẫn trực tuyến từ Viện Ung thư Quốc gia Diseases and Medical Response - An animated tutorial describing how DNA markers are used in medical applications Part of the Kids Genetics website from GlaxoSmithKline Genome Variations - Questions and answers about genome variation from the Genome News Network 10.The SNP Consortium Website: Past, Present, and Future 2003 Nucleic Acids Research 31 (1), 124-27 11.Introduction to SNPs: Discovery of Markers for Disease 2002 BioTechniques (pdf) 12.Prospecting for Gold in Genome Gulch 2002 The Scientist 13.Single Nucleotide Polymorphisms: From the Evolutionary Past 2001 Nature 14.Single Nucleotide Polymorphisms: To a Future of Genetic Medicine 2001 Nature 13 [...]... 180-184 3 NCBI cơ sở dữ liệu của các đa hình đơn nucleotide (dbSNP) 4 Cơ sở dữ liệu của Nhật Bản đa hình đơn nucleotide (JSNP)News Network Genome 5 dbSNP cơ sở dữ liệu - Từ Trung tâm Quốc gia về Thông tin Công nghệ sinh học (NCBI) 6 SNPs: Các biến thể trên một chủ đề giới thiệu cơ bản để SNPs từ Trung tâm Quốc gia về Thông tin Công nghệ sinh học (NCBI) 7 Hiểu SNPs và ung thư - Một hướng dẫn trực tuyến từ... danh mục SNPs thông qua việc tạo ra và duy trì cơ sở dữ liệu SNP công cộng ( dbSNP ) Công cụ mạnh mẽ di truyền có thể được truy cập bởi các cộng đồng y sinh học trên toàn thế giới và được dự định để kích thích nhiều 11 lĩnh vực nghiên cứu sinh học, bao gồm cả việc xác định các thành phần di truyền của bệnh NCBI "Khám phá không gian" Tạo điều kiện thuận lợi cho SNP nghiên cứu Các bản ghi trong dbSNP cross-chú... hình SNP của hai nhóm, qua đó cho thấy đó là mô hình rất có thể liên quan với gen gây bệnh Cuối cùng, hồ sơ SNP là đặc trưng của nhiều loại bệnh khác sẽ được thành lập Sau đó, chỉ là vấn đề thời gian, các bác sĩ có thể xác định một người có thể nhạy cảm với một căn bệnh nào đó chỉ bằng cách phân tích các mẫu DNA của họ cho mô hình cụ thể SNP 4 Phát triển SNPs và dược: - Như đã đề cập trước đó, SNPs... Người dùng có thể truy vấn dbSNP trực tiếp hoặc bắt đầu một tìm kiếm trong bất kỳ phần nào của không gian NCBI khám phá để xây dựng một bộ hồ sơ dbSNP đáp ứng các điều kiện tìm kiếm của họ Hồ sơ cũng được tích hợp với các nguồn thông tin bên ngoài thông qua siêu văn bản URL mà người dùng dbSNP thể làm theo để tìm hiểu thông tin chi tiết đó là vượt ra ngoài phạm vi của curation dbSNP Để tạo điều kiện thuận... variation from the Genome News Network 10.The SNP Consortium Website: Past, Present, and Future 2003 Nucleic Acids Research 31 (1), 124-27 11.Introduction to SNPs: Discovery of Markers for Disease 2002 BioTechniques (pdf) 12.Prospecting for Gold in Genome Gulch 2002 The Scientist 13.Single Nucleotide Polymorphisms: From the Evolutionary Past 2001 Nature 14.Single Nucleotide Polymorphisms: To a Future... điều trị bằng cách phân tích hồ sơ SNP của bệnh nhân Mục tiêu là tạo một loại thuốc có khả năng phù hợp cho cá nhân đó, được gọi là "thuốc cá nhân hoá", điều này sẽ cho phép các công ty dược phẩm mang lại nhiều loại thuốc hơn cho thị trường và cho phép các bác sĩ kê toa các phương pháp điều trị cho từng cá nhân cụ thể theo nhu cầu của bệnh nhân 5 SNPs và NCBI Bởi vì SNPs xảy ra thường xuyên trong bộ... tiết đó là vượt ra ngoài phạm vi của curation dbSNP Để tạo điều kiện thuận lợi cho các nỗ lực nghiên cứu, NCBI của dbSNP được bao gồm trong hệ thống phục hồi Entrez mà cung cấp truy cập tích hợp một số công cụ phần mềm và cơ sở dữ liệu có thể hỗ trợ trong phân tích SNP Ví dụ, mỗi bản ghi SNP trong các liên kết cơ sở dữ liệu để các nguồn lực bổ sung trong "Vũ trụ Discovery của NCBI” Tài nguyên bao gồm:... chứa chuỗi và dữ liệu bản đồ trên mốc ngắn gen; bộ gen của con người sắp xếp dữ liệu; và PubMed , tìm kiếm tài liệu NCBI và hệ thống phục hồi SNP hồ sơ cũng liên kết đến các nguồn lực bên ngoài khác nhau có liên quan Cung cấp truy cập đến một trang web "một cửa SNP mua sắm" tạo điều kiện nghiên cứu khoa học trong nhiều lĩnh vực khác nhau, từ di truyền quần thể và sinh học tiến hóa quy mô lớn bệnh và