NGHIÊN cứu đặc điểm cấu TRÚC một số GEN THUỘC hệ MIỄN DỊCH tôm sú (PENAEUS MONODON)

     ! "PENAEUS MONODON# $%& '()*(  $+,,  !"#$ %!& '&(% !")*( "+,!+-!./%!.0!%1"("23 4"5 %" "6"((2   /012345-5 675/8983:5  ;$; $+<=>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>0 $+,,>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>00 ;$;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>000 ,;?@ABAC>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>D0 ,;E<>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>D000 ,;F>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>0G HI>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>* 72ặ*ấề222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222227 829:# !"#$ 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222228 ;23<= !!"#$ 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222228 8JK5/*>LM,$>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>N 72724>*(.6""+?!!@AB4>222222222222222222222222222222222222222222222222222222222; 727272C"6 *D4>222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222; 7272821""1" *(=5".6"4>B632222222222222222222222222222222222222222E 7272;2.6""+?!!@AB4>2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222F 7272G2H"+I!A"AA"J!*(%5.6"B4>222222222222222222222222222222222222222222222222278 7282K6L=5"4>22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222227G 728272A$!L=5".(22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222227E 728282A$!L=5"=5""M222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222287 72;23!"#$ !N*(DO!$!=:!%!A"J!%5.6""4>2222222228; 72;2721""1"!"#$ !NN4>%#"!C22222222222222222222222222222222228; 72;2823!"#$ !N&# "O!L=5"B4>22222222222222222228G 72;2;2DO!$!=:!P!N&# L=5"%!A"J! %5.6"B4>222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222228Q 8JK5/(>A%$AOP=OO>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>N( 8272'&6 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222;8 827272" "'AR 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222;8 * 827282KS"2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222;8 8272;2".5222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222;G 8272G2*4"*'+-4T=:!%!!"#$ 222222222222222222222222222222222222222;G 8282H"+I!A"A!"#$ 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222;E 828272""U3VW!4/2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222;X 828282"4Y"U3V22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222;F 8282;2W!"-A3V2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222;Q 8282G2"ZA"[&'A<4/!N\3V]&)"^22222222222222222222222222222222G7 8282E2_" "Y!N.`!A"$!HU22222222222222222222222222222222222222222222222222222222GQ 8282X2"4Y"4A"aHU22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222Gb 8282F2Y=J!A"[T4A"aHU2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222Gb 8282Q2c5"%1")!N\3V]22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222Ed 8282b2M "6!N22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222Ed 82827d2H"[e"=f&6 %1")*(T&g4/&6 22222222222222222222222222222222222222222222222EE 82;25M!"#$ 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222EE 8JK5/N>?M<A<$%>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>QR ;272U.FhA%N&# I"["LP*% 422222222222222222222222222222EX ;27272Y=J!!N,R 4>63222222222222222222222222222222222222222222EX ;27282c5"*(A"[e"%1")!N22222222222222222222222222222222222222222222222222EQ ;282ijNhA%N&# +?!=R% jDe"6 22222222222222222222X7 ;28272H"[&'AYEkh,R 4>6322222222222222222222222222222222X8 ;28282Y=J!!N"("l",R 4>632222222222222222222XG ;282;2c5"*(A"[e"%1")!N222222222222222222222222222222222222222222222XE ;2;2KNjhA%NS"Ye"A"N&=4N222222222222222222222222222222222222222222XQ ;2;272H"[&'AYEkh !,R 4>6322222222222222222222222222Xb ;2;282Y=J!!N !"("l",R 4>632222222222222F8 ;2;2;2H"[e"%1")!N !!2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222FG ;2G2UhA%ND "M").(2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222FX ;2G272Y=J!<A"mY!N,R 4>632222222222222222222FF * ;2G282H"[&'AY!N;k*(Ekh2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222FQ ;2G2;2Y=J!!N"("l",R 4>6322222222222222222222222222Q8 ;2G2G2c5"*(A"[e"%1")!N2222222222222222222222222222222222222222222222222222Q; ;2E24A4NhA%N"!*(I"AA4422222222222222222222222222222222222222222222QG ;2E272Y=J!!N!",R 4>6322222222222222222222222222222222222222QE ;2E282c5"*(A"[e"%1")!N!"2222222222222222222222222222222222222222222222QX ;2X2K6"/!A%N"!" an"!*("!*% 42222222222222222222222bd ;2X272H%N"!*% 4HV22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222bd ;2X282HNA=N"!" a+I!)% 4\% 4h&N%.& ANA=N]2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222bG ;2X2;2o /"!" a\Vpqh&A4"%=Nr%]2222222222222222222222222222bb ;2F2M "6j /"!" aW"-A\%VpqH;]222222222222222222222222222222222227dE ;2F272Y %>*N%.M "6!N222222222222222222222222222222222222222222222222222222222227dE ;2F282c5" %>!N+-" jM*(!NNN222222227dQ ;2F2;2c5"YANA=NVpqH;+-.M "62222222222222222222222222222222222227db ;2F2G2H"[e""Ye"P%VpqH;22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222777 ?$%A?>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>**N 72_& '22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222277; 82_!"5222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222277G !FS!E$M,$%>>>>>>>>>>>>>>**Q $,?<>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> O;$;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> * ,;?@ABAC TD0:UUVU EksU ;ksU VVH /8WXU0:5/A0YU t!Ek"!=5"u t!;k"!=5"u 9ZN /8WXU0:5/,58 Eks%4&N=%N! ;ks%4&N=%N! V.%=!N="%A%N% VqpH "1""D =(3V+- VA&rN= r%!N &N!" " "Y A&j%A"4 Vpq VpqH VpqH; V9H AA44 .A o /"!" a Vpq=Y!7B4> Vpq=Y!;B4> HNA=N"!" a .(""N"+I!%1" @A.4N Vh&AA&4"%=Nr% Vh&AA&4"%=Nr%   # 4%r%7 Vh&AA&4"%=Nr%   # 4%r%; V%.&ANA=N H%!%N= N&& =N" 4NA% $%&$!''& $!''& 3V H 3V =3H4 ==3H4 =4U3V vH 3V.W4 ! 9Z4 j=L V=Nj%. N& Kw"-A &N=N\=VHn =Hn=Hn=H] Kw"-A=Nj&N=N \==VHn==Hn==Hn==H] U3V4-xA ""TU4N A&NN3V N!NN%NA%N% Nj%. &N= Nj%. &N4=N%A"4A"N =Nj%. &N4=N%A"4A"N  .&N4%=N=U3V N"j&Aj%%.N (%& " a(& !&& (& !&&  (%! ' vV vi iH " a(!&!! ' VN"j&NN=NN%N Y%1")!N.M "6 9Z@"6 !N (!&!! ' v"j&NN=NN%N= vA%N44N=4N NN! NN4ANrA%N% * . p 3V U3V  Uq HU )  %" & ;kUVv EkUVv _. 9%+?!p 3Vj"M U3V"! 9'< ! _" !^B H"$!" wA&jN%4N N"!*% 4B4> U.FB4> 3N!" & _" "Y""m ;k3V _" "Y""m Ek3V _&.4N p %N% 9"=%&3V 9N44N!N%U3V A&=N4j AN%N=!r%N H&jN%4N"%N   # *% 4   # U.F !" & UA=A&rr3V;yN=4 UA=A&rr3VEyN=4 %VpqH; VpqW"-AB4>=Y!;,UN.h&AA&4"%=N 4> r%  # ; U3V U3V U34N U V%. &N U3V"6A vzjNA"["PjU3V vzjNA"#u!+- U. &N= U3VN%rN%NN U. &N4N UN*N%4N%4%A4N UhHU HU.`!NzjNA"#u!+-UN*N%4N%4%A4NhHU 4U3V i3H ii i sVH sH9 *{A |ii oK oH oH U3V"6A"} "1" &N=NI  !=5"3%%N % 4![j"<"$! % 9Z" "Y" ! Kw"-AZ" ! *J!{A"> % 4![j.6"/%~! % 4![j.6"m *(! 9%+?!oH 9%+?!oH i&&N%rN%!U3V i!&Nh &N=NA&j%A"4 i& 4= %N  %4j=%N*% 4 s*N%4&A&A%N% s*N%4&A%N% %%{ N |"N4A4j=%N*% 4 oN&&•"N=*% 4 oN4ANAN oN4ANAN=N%4N * ,;E< !7272"/!#!N&# "6L=5"B22222222222222222222222222222228X !8272".54T=:!%!!"#$ 222222222222222222222222222222222222222222222222222222;G !8282%1")Z4T=:!%!!"#$ 222222222222222222222222222222222222222222222GF  ,;F K1"7272K1""4>22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222; K1"72824>"L|ii22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222227d K1"72;24>"LoK222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222278 K1"72G2.( 4>2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222227F K1"72E2K6"/!"Y"SA%H*(W!"-AN&22222222222222222222222222222222222222227b K1"72X2I"! B222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222287 K1"8272iIZA"[&'A!N222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222;E K1"8282iIZ"Z,!Nu.%1")22222222222222222222222222222222222222222222222222G8 K1"82;2iIZ"Z,!Nu.<A"m%1")m ;k\*%!N]2222222G8 K1"82G2iIZ"Z,!Nu.<A"m%1")m ;k\&N"]222222222G; K1"82E2iIZ"Z".<A"m%1")m EkP!N2222222222222222222G; K1"82X2iIZ"ZA"[&'A!N2222222222222222222222222222222222222222222222222GG K1"82F2iIZ"ZA"[&'A!N !2222222222222222222222222222222222222222222GG K1"82Q2iIZ"ZA"[&'A!N22222222222222222222222222222222222222222222222222222222GE K1"82b2iIZ"ZMA"[&'A!N"((CB4>22222222222222222222GX K1"827d2iIZ"Z" "YY!Nu"SANA=NVpqH; %+B!"("222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222GX K1"82772iIZ.M "6222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222E7 K1";272_ 6=4A"a" "Y*("=J!!N222222222222222222EF K1";282%1")!N*(=4 j=LPU.F22222222222222222222222222222222222222222EQ K1";2;2i4"%1") &N=NB!NP4>63*C %1")u!./22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222Eb K1";2G29A"}! %>.'"*(A"[e"r"$O!P A%NU.F222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222Xd K1";2E2_ 6=4A"a" "Y*("=J!YEkh222222X8 K1";2X2%1") &N=N*(=4 j=LPYEkh22222222222X; K1";2F2_ 6=4A"a" "Y*("=J!!N2222222222222XG  K1";2Q2%1")!N*(=4 j=LP4jN222222222222222222222222222222222222XX K1";2b2i4"%1")=PA%N4jN!f&("" 2222222XF K1";27d2_ 6=4A"a" "Y*("=J!YEkh !222222Fd K1";2772%1") &N=N*(=4 j=LPYEkh !22222222F7 K1";2782_ 6=4A"a" "Y*("=J!!N !222222222F8 K1";27;2%1")!N*(=4 j=LP"Nj2222222222222222222222222222F; K1";27G2i4"%1")=PA%N"Nj!f&(22222222FE K1";27E2_ 6=4A"a" "Y*("=J!<A"mY !N2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222FF K1";27X2%1") &N=N*(=Y!N22222222222222222222222222222222222FQ K1";27F2_ 6=4A"a" "Y*("=J!Y!N;kh22222222Fb K1";27Q2_ 6=4A"a" "Y*("=J!Y!NEkh22222222Qd K1";27b2%1") &N=N*(=4 j=LP!N22222222222222222222222Q7 K1";28d2_ 6=4A"a" "Y*("=J!!N222222222222222222Q8 K1";2872i4"%1")=PA%NU!f&("" 22222222Q; K1";2882_ 6=4A"a" "Y*("=J!!N!"22222222222QX K1";28;2%1") &N=N*(=P4A4N222222222222222222222222222222222222222QF K1";28G2i4"%1") &N=NP!N!"P4>63 *C%1")u!./22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222QQ K1";28E2i4"%1")=4 j=LPA%N4A4N4> *C&("" 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222bd K1";28X2_ 6=4A"a" "Y*("=J!!N)22222222222222b8 K1";28F2%1")!N*(=4 j=LPA%NHV222222222222222222222222b; K1";28Q2i4"%1")=PA%NHV22222222222222222222222222222222222222bG K1";28b2_ 6=4A"a" "Y*("=J!!Nu"S ANA=N"!" a+I!)% 422222222222222222222222222222222222222222222222222222bX K1";2;d2%1")!N*(=4 j=LP!Nu"SANA=N "!" a+I!)% 4222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222bX [...]... Nghiên cứu đặc điểm cấu trúc một số gen thuộc hệ miễn dịch tôm sú (Penaeus monodon) 2 Mục tiêu nghiên cứu - Phân lập và xác định được trình tự một số gen lựa chọn liên quan đến hệ miễn dịch tôm sú, tạo vật liệu nghiên cứu góp phần làm sáng tỏ cơ chế đáp ứng miễn dịch và giải pháp trong phòng trị bệnh cho tôm sú; - Bước đầu nghiên cứu tạo peptide kháng khuẩn rALFPm3 3 Nội dung nghiên cứu. .. cDNA/ EST của một số loài tôm như tôm thẻ chân trắng (P vanamei) và tôm sú (P monodon) đã xác định được trình tự của hàng loạt gen liên quan đến hệ miễn dịch [79], [195], [196] Ở tôm sú, nhiều gen liên quan đến miễn dịch đã được phân lập và xác định trình tự bằng cách sử dụng kỹ thuật RT-PCR [195], [197], [227] Trong đó , một số gen liên quan đến cơ chế miễn dịch đã được quan tâm nghiên cứu như... Nghiên cƣu gen liên quan đến khả năng miễn dịch ở tôm sú Ƣ Phương pháp phân lập và phân tích các đoạn trình tự gen biểu hiện (Expressed sequence tag, EST/ cDNA) là một trong các phương pháp sinh học phân tử hiện đại nhằm tập chung nghiên cứu các gen chức năng Trong những năm gần đây, các nghiên cứu về cDNA/EST của genome tôm sú đã đạt được một số kết quả góp phần làm sáng tỏ một số cơ chế phân... xác định ở tôm sú có các loại bệnh chính là bệnh đốm trắng và bệnh đầu vàng… [8], [10], [11] Nước ta đã bước đầu chú ý đến các nghiên cứu nhằm nâng cao chất lượng giống và kiểm soát dịch bệnh Các nghiên cứu bước đầu tập trung nghiên cứu đa dạng genome tôm sú [9], phát hiện bệnh tôm sú [3], [4], [13], đưa ra giải pháp phòng bệnh cho tôm sú [2], nghiên cứu một vài protein cấu trúc tái tổ... bệnh cho tôm Ngoài ra, một vài cấu trúc protein tái tổ hợp của WSSV đã được tạo ra trong phòng thí nghiệm nhằm mục đích nghiên cứu phòng trị bệnh cho tôm Tuy nhiên, các công trình nghiên cứu về các gen liên quan đến hệ miễn dịch tôm sú còn ít được biết đến Do đó, để góp phần làm sáng tỏ cơ chế phân tử đáp ứng miễn dịch và tạo nguyên liệu cho nghiên cứu phòng trị bệnh ở tôm sú, chúng... Pongamia pinnata [164] và một số chất khác chiết xuất khác [29], [52] Ngoài ra, chế độ ăn có các các chất kích thích miễn dịch như β-1, 3glucan [40], [41], lipopolysaccharide [199], peptidoglycan [110] có khả năng kích thích miễn dịch bẩm sinh giúp tôm có khả năng sống sót cao hơn khi nhiễm WSSV 1.2 HỆ MIỄN DỊCH TÔM SÚ Động vật không xương sống, trong đó có tôm chỉ phát triển hệ miễn dịch tự nhiên... thiệt hại đáng kể đến nghề nuôi tôm Cho đến nay, những hiểu biết cơ bản về sự điều khiển sinh trưởng, sinh sản và đặc biệt là hệ thống miễn dịch ở tôm sú còn rất hạn chế do thiếu những thông tin về genome và sự biểu hiện gen của chúng Kích thước genome tôm sú là rất lớn (khoảng trên 2 tỉ cặp base = 2/3 bộ gen người), nên việc giải mã toàn bộ genome tôm sú đòi hỏi nhiều thời gian và chi... peptide tái tổ hợp 3 Chƣơng 1 TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 TÔM SÚ VÀ CÁC BỆNH THƢỜNG GẶP Ở TÔM SÚ 1.1.1 Giới thiệu về tôm sú Tôm sú có tên khoa học là Penaeus monodon do Fabricius mô tả và đặt tên năm 1798 Ngoài ra, loài tôm này còn được gọi với tên địa phương là tôm rong [11] Tôm sú là một trong số các loài tôm nuôi quan trọng thuộc họ Penaeidae và được phân loại như sau [38] Giới: Animalia Ngành: Arthropoda... vậy, một trong những hướng nghiên cứu được lựa chọn là lập bản đồ di truyền liên kết genome tôm sú, lập bản đồ di truyền từ DNA vệ tinh, phân tích trình tự đầy đủ genome ty thể (mtDNA), lập bản đồ gen tôm sú bằng giải mã EST/cDNA, nghiên cứu và phân tích các đoạn trình tự gen biểu hiện (Express sequence tag - EST), lựa chọn các chỉ thị phân tử phục vụ công tác chọn giống, nghiên cứu cấu trúc. .. chúng Hầu hết các lysozyme tham gia vào sự phá hủy các vi sinh vật bên trong và bên ngoài tế bào máu, một số còn đóng vai trò của sterases và chitinases [55] Ƣ Ƣ 1.3 NGHIÊN CƢU GEN VÀ TIỀM NĂNG ƢNG DỤNG TRONG PHÒNG TRỊ BỆNH CHO TÔM SÚ 1.3.1 Tình hình nghiên cứu genome tôm sú trên thế giới Nghiên cứu genome sẽ cung cấp những thông tin chính xác nhất cho việc xác định các tính trạng quan trọng như: . A"J! %5.6"B4>n">!"("")"6D(‡ Nghiên cứu đặc điểm cấu trúc một số gen thuộc hệ miễn dịch tôm sú (Penaeus monodon]‚2 (>^.U0_35/80_5.`3 hH"[&'A*(5"+-%1")<4/!N&)"^&#