Công nghệ sinh học Các kỹ thuật sử dụng các hệ thống sống để tạo ra sản phẩm Truyền thống: Có từ rất lâu, Dựa trên kinh nghiệm, vi sinh vật học Công nghệ lên men Hiện đại: Nửa sau
Trang 1Công nghệ
sinh học dược
Trang 2Công nghệ sinh học
Các kỹ thuật sử dụng các hệ thống sống để tạo ra sản phẩm
Truyền thống: Có từ rất lâu, Dựa trên kinh nghiệm,
vi sinh vật học
Công nghệ lên men
Hiện đại: Nửa sau thế kỷ 20, dựa trên sinh học phân
tử, sinh học tế bào, hóa sinh, …
Công nghệ gen
Công nghệ enzym-protein
Công nghệ tế bào
Trang 3Các giai đoạn phát triển
nước uống lên men Kỹ thuật được sử dụng bao gồm lên men, nuôi trồng và nuôi cấy mô thực vật
mô để sản xuất Sản phẩm của thế hệ này gồm
kháng sinh, enzym, vitamin, acid amin Kỹ thuật
được sử dụng bao gồm đột biến và chọn lọc chủng vi sinh vật và phương pháp lên men, nuôi cấy để sinh sản phẩm tối ưu
kỹ thuật tái tổ hợp di truyền Ứng dụng công nghiệp của nó bao gồm dược phẩm, nông nghiệp, hóa chất,
y học Các sản phẩm hiện nay đang là các protein trị liệu, chẩn đoán, vaccin và cải tạo giống nông nghiệp
Trang 4Sự mở rộng nguồn gen
Công nghệ cổ điển tạo giống hay tính trạng mới dựa vào lai tạo, đột biến-sàng lọc:
Giới hạn trong phạm vi loài và lân cận
Mất thời gian, hiệu suất không cao
Công nghệ hiện đại thao tác trên gen:
Cải tạo ở mức phân tử, dưới loài
Không còn giới hạn loài
Nhanh và hiệu quả
Nguồn gen vô tận
Trang 5Phạm vi ứng dụng
CNSH áp dụng trong nông nghiệp và xử lý môi
trường
Sử dụng xúc tác sinh học và công nghệ lên men để tạo ra các sản phẩm công nghiệp như hóa chất hay enzym
CNSH ứng dụng trong y tế Chẩn đoán và điều trị
bệnh Sản xuất dược phẩm
Trang 7Đặc điểm của CNSHYD
Trang 8Sản phẩm của CNSHYD
Chẩn đoán y học
Sản xuất sinh phẩm chẩn đoán
Kỹ thuật chẩn đoán mới
Thuốc có nguồn gốc sinh vật
Sản xuất thuốc bằng xúc tác sinh học
Nuôi cấy mô, tế bào
Trang 9Các vấn đề của CNSH trong nước
Thiếu qui hoạch Qui hoạch sai
Đầu tư thấp
Yếu kém trong phát triển nguồn nhân lực
Bất hợp lý trong quản trị nhân lực
Thiếu sự liên kết giữa cơ sở nghiên cứu và sản xuất
Chưa có cơ sở hạ tầng công nghiệp thích hợp
Trang 10Công nghệ lên men
Trang 11Công nghệ lên men
Định nghĩa: quá trình biến đổi do vi sinh vật thực hiện trong điều kiện yếm khí hay hiếu khí
Sản phẩm
Sinh khối vi sinh vật
Enzym – protein vi sinh vật
Sản phẩm trao đổi chất: sơ cấp + thứ cấp
Các biopolymer và biosurfactant
Sản phẩm tái tổ hợp gen
Trang 12Chủng vi sinh vật
1: Không gây bệnh cho người, động vật và môi
trường (GRAS - Generally Recognized As Safe)
2: Có thể gây khó chịu cho người, động vật và môi trường
3: Gây bệnh, truyền bệnh nhưng có cách chữa trị
4: Gây bệnh, truyền bệnh rất nhanh nhưng chưa có cách chữa trị
Trang 14Yêu cầu của chủng công nghệ
1. Ổn định di truyền
2. Sản xuất hiệu quả sản phẩm mong muốn, và con
đường sinh tổng hợp sản phẩm đã được khảo sát kỹ
3. Không cần hay ít cần các bổ sung vitamin và yếu tố
tăng trưởng
4. Sử dụng được các cơ chất phổ biến và rẻ tiền
5. Có thể biến đổi di truyền được
6. An toàn, không gây bệnh, và không sản xuất chất
độc, trừ khi đó chính là sản phẩm
7. Dễ dàng thu hoạch từ quá trình lên men
8. Dễ dàng phá vỡ tế bào nếu sản phẩm là nội bào
9. Ít tạo ra sản phẩm phụ để thuận tiện cho việc tinh
chế sản phẩm
Trang 15Cải tạo chủng
Tái tổ hợp tự nhiên
Gây đột biến
Đột biến ngẫu nhiên
Đột biến nhân tạo - cảm ứng
Sử dụng base tương đồng
Thay đổi về hóa học của các base
Chiếu xạ
Gây đột biến bằng transposon
Lai ghép tế bào trần và biến nạp gen
Thao tác di truyền trên vi sinh vật
Trang 16Chiến lược thao tác di truyền
Sàng lọc gen từ tế bào nguồn
Cô lập gen quan tâm: tạo dòng
Thực hiện các biến đổi cần thiết
Đưa gen trở lại tế bào đích
Kiểm tra và sàng lọc chủng mới
Trang 17Sàng lọc thể đột biến
Kiểu hình quan sát được
Khuyết dưỡng: cấy trên môi trường tối thiểu
Trang 18Làm giàu thể khuyết dưỡng bằng
Gây đột biến:
UV, HNO 2 ,…
Rửa và phân tán ở mật độ 107/ml
Thêm 100 U/ml penicillin
Loại bỏ penicillin Pha loãng đến 50-
100 tế bào/hộp Nuôi cấy 2-20 h
Môi trường hoàn chỉnh
Môi trường tối thiểu
Môi trường hoàn chỉnh
Nhân bản
Trang 19Bảo quản giống vi sinh vật
Ngân hàng tế bào
Ngân hàng gốc (master cell bank)
Ngân hàng làm việc (working cell bank)
Cấy chuyền
Làm khô
Đông khô
Đông lạnh
Trang 20Môi trường lên men
Cung cấp chất dinh dưỡng để tế bào phát triển
Chất dinh dưỡng
Yếu tố tăng trưởng
Cung cấp các chất cần thiết để thu sản phẩm
Sinh khối
Chất chuyển hóa sơ cấp
Chất chuyển hóa thứ cấp
Chất cảm ứng
Trang 21Các loại môi trường lên men
phần hóa học chính xác về mặt định tính và định
lượng
chỉ biết thành phần chính xác của một vài hợp chất (về mặt định lượng đối với các chất cần quan tâm
như yếu tố tăng trưởng, các thành phần khác dựa
theo kinh nghiệm)
đầu chủ yếu bắt nguồn từ các sản phẩm nông nghiệp hoặc từ sữa vì chúng rẻ và tương đối dồi dào
Trang 22Tiêu chí chọn thành phần môi trường
chất.
không ảnh hưởng đến công thức chung, việc vận hành nồi
cũng như xứ lý sau lên men.
và năng suất sản phẩm trên gam cơ chất cao.
phụ thấp không làm ảnh hưởng đến quá trình tách sản phẩm chính sau đó
Trang 26Biện pháp kiểm soát bọt
Thay đổi công thức môi trường
Phá bọt cơ học
Các chất phá bọt: thường là các chất hoạt động bề mặt:
Nhanh chóng phân tán và tác động nhanh
Trang 27Vỏ ngoài
Rọ cản
Bộ phun khí
Khí vào Cổng thu
hoạch
Nước/hơi nước vào
Khí vô trùng Cổng phụ
Trang 29Các thiết bị nuôi cấy khác
Trang 30Các phương thức lên men
Kiểu vận hành
Lên men gián đoạn
Lên men bổ sung dinh dưỡng gián đoạn
Lên men liên tục
Trang 31Lên men bề mặt
7
6 6
1
2
3 4
5
1-Giá đựng khay ; 2-Khay ; 3-Cửa cho không khí sạch vào buồng ; 4-Cửa cho không khí
ra ; 5-Quạt ; 6-Chỗ phun nước ; 7-Bộ phận xả hơi nóng để điều chỉnh nhiệt độ của buồng.
Trang 33Giám sát quá trình lên men
flow injection analysis
sequential injection analysis
khối phổ (mass spectrometry - MS)
lỏng hiệu năng cao (HPLC)
sắc ký khí (GC)
Trang 34Sản xuất
Kháng sinh
Trang 36 Sử dụng được cơ chất phức tạp và tiêu thụ tốt phenylacetat.
Không tạo sắc tố gây khó khăn cho việc tinh chế.
Có hệ sợi sinh trưởng rắn chắc.
Trang 37Nhân giống
Thu lượng giống tinh khiết cần thiết ở pha tăng trưởng lũy thừa (logarit) cho giai đoạn lên men
Tiêu chuẩn
giống không nhiễm
mật độ tế bào đạt yêu cầu
giai đoạn nhân giống 10-20 m 3
giai đoạn sản xuất 125-250 m 3
Giai đoạn nhân giống trong thiết bị
Trang 38Môi trường lên men
Nguồn nitơ: nước thải ngâm bắp
Bổ sung thêm giữa chừng: amoniac
Nguồn carbon: glucose, sucrose và các dịch đường thô,
65% để duy trì tế bào, 20–25% để tăng trưởng và 10– 12% cho sản xuất penicillin
Trước đây: Lactose
Canxi, magiê, phosphat, và các kim loại vi lượng
Tiền chất:
acid phenylacetic (G)
acid phenoxyacetic (V)
Trang 39 Gián đoạn bổ sung dinh dưỡng, thu hoạch từng phần
Thời gian: 120-200 giờ
Trang 40Lên men
Đường
Penicillin
Trang 41Hậu lên men
Loại tế bào: lọc/ly tâm
Chiết penicillin
pH: 2-2,5, dung môi: amyl acetate, butyl acetate và
methyl isobutyl ketone
Chiết lại ở pH 7,5, dung môi: nước
Loại sắc tố: than hoạt
Kết tinh
Thêm muối thích hợp (kali acetat)
Tẩy màu lại và rửa bằng dung môi để tăng độ tinh khiết
Hiệu suất thu hồi: >90%
Giá thành: ~10 USD/kg
Trang 42Tóm tắt qui trình
Nồi lên men
Thu hoạch 1/3 và thay 1/3 môi trường mới
10 lần / 6 ngày
Lọc quay
Môi trường
Nước ngâm bắp Saccharose/glucose Amoniac Khoáng Kiểm soát pH
Dịch lọc
Chiết bằng butylacetat Tủa bằng muối kali Rửa / Lọc / Làm khô
Penicillin 99,5%
Mẫu nhân giống
P chrysogenum
Tế bào nấm Thức ăn gia súc
Trang 44Lên men cephalosporin C
Lên men bổ sung dinh dưỡng gián đoạn A chrysogenum
Galactose và sucrose: tăng trưởng chậm, năng suất cao hơn
Thay dần đường bằng dầu đậu nành hay đậu phọng: giảm glucose, giúp hình thành bào tử đốt và cephalosporin C Dầu có tác dụng chống bọt
Nguồn nitơ: bột đậu nành, hạt bông có bổ sung amonium sulfate Ammoniac
có thể dùng để kiểm soát pH
Nước ngâm bắp hay dùng làm nguồn nitơ và khoáng chất, vitamin
DL-Methionine: cảm ứng hình thành bào tử đốt
Thông khí:
Cyclase và expandase cần oxi để xúc tác: nếu oxi hòa tan giảm <20%
penicillin N sẽ tích tụ và hiệu suất cephalosporin C sẽ giảm
Thêm acetyl esterase ( Rhodosporidium toruloides ): tích tụ
deacetylcephalosporin C (bền) tăng năng suất
Trang 45Thu hồi cephalosporin C
Dùng cột than hoạt / cột nhựa không ion
cephalosporin C được hấp phụ chọn lọc so với penicillin N, deacetylcephalosporin C, and deacetoxycephalosporin C
Đánh bóng bằng sắc ký trao đổi anion
Tạo dẫn xuất tetrabromocarboxybenzoyl cephalosporin C
Kết tinh từ dịch nước acid / tạo muối với base hữu
cơ+chiết tách bằng dung môi
Thích hợp thu hồi làm nguyên liệu bán tổng hợp
Trang 46Sản xuất các beta-lactam khác
Cephalosporin C, cephamycin C và penicillin được dùng để sản xuất các khung cho việc bán tổng hợp các beta-lactam khác
6-APA
Trang 47Sản xuất các khung để bán tổng hợp
6-APA: thủy phân Penicillin
Hóa học: chiếm ưu thế từ 1970, nhưng hiện gặp nhiều vấn đề về môi trường, dung môi và tốn năng lượng
Enzym: được sử dụng từ 1960, nhưng ngưng do giá thành và vấn
đề tái sử dụng Đến 1990 enzym cố định giải quyết được vấn đề
E coli tái tổ hợp để sản xuất penicillin G acylase và Fusarium
oxysporum tái tổ hợp sản xuất penicillin V acylase
7-ADCA: là tiền thân của 1/3 cephalosporin
7-ADCA được sản xuất từ penicillin G bằng phản ứng mở rộng vòng
Merck và Panlabs: dùng P chrysogenum mang gen cefE
(expandase) của S clavuligerus Khi cung cấp disodium adipate, nó sản xuất adipoyl 6-APA, rồi được chuyển thành adipoyl 7-ADCA nhờ expandase tái tổ hợp Mạch adipoyl được cắt nhờ adipoyl acylase của Pseudomonas thành 7-ADCA
7-ACA: là tiền thân của 2/3 cephalosporin
được sản xuất từ cephalosporin C bằng phản ứng deacyl hóa nhờ enzym hay hóa học
Trang 48Các thế hệ Cephalosporin
I (cephalothin, cephaloridine, and cefazoline): biến đổi
vị trí C-3 và C-7 của 7-ACA
II: kháng β-lactamase
Cephamycin C mang nhóm 3-carbamoyl và 7-methoxy
kháng β-lactamase: cefoxitin and moxalactam
7-oximinoacyl cephalosporin: cefuroxime
III: kháng β-lactamase + phổ rộng:
thêm nhóm aminothiazole thân nước vào
oximinocephalosporin (thế hệ II): cefotaxime, ceftizoxime, và ceftazidime
IV (cefepime và cefpirome): có vòng aminothiazole ở C-7 cùng với nhóm thế oxyimino và nitơ bậc IV ở C-3
Trang 49O O
H
O H
C H 3
Trang 50Sản xuất acid amin
Trang 51Phương pháp sản xuất acid amin
Phương pháp trích ly các acid amin từ dịch thủy
phân protein Phương pháp này dùng để thu nhận L-cystein, L-cystin, L-leucin, L-asparagin, L-tyrosin
Phương pháp tổng hợp hóa học Phương pháp này
dùng để sản xuất glycin, alanin, methionin,
tryptophan
Phương pháp lên men vi sinh vật
Trang 52Phương pháp lên men vi sinh vật
(L-glutamic acid, L-alanine, L-valine)
threonine, L–arginine, L– citrulline, L–ornithine, L–homoserine, L-tryptophan, L-phenylalanine, L-tyrosine, L-histidine, …)
Phương pháp thêm các tiền chất ( throenine, isoleucine, tryptophan…)
L- Phương pháp enzym (aspartic acid, alanine, cyteine, dihydroxyphenylalanine, D-p-hydroxyphenyl-glycine…)
các kỹ thuật biến đổi gene, protein và chất chuyển hóa hoặc
sự kết hợp của các kỹ thuật trên (hydroxy-L-proline)
Trang 53L-Glutamic acid - điều kiện sản xuất
Vi khuẩn Corynebacterium glutamicum
Môi trường có nồng độ đường và các ion aminonium cao, nồng độ khoáng chất thích hợp
Nồng độ biotin giới hạn hoặc bổ sung penicllin hoặc
xà phòng
Điều kiện hiếu khí
Năng suất L-glutamate: khoảng 100 g/L /2-3 ngày
Trang 54L-Glutamic acid - điều kiện sản xuất
Chủng vi khuẩn: Corynebacterium , cần biotin
Nguồn carbon: glucose, thủy phân tinh bột
Nguồn nitơ: cao, ammoniac
Cơ chế: glutamate dehydrogenase amin hóa glutarate (Chu trình Krebs) thành glutamate
2-oxo- Vai trò biotin (hoặc penicillin, xà phòng): làm rò rỉ
Công nghệ gen:
Đột biến mất gen mã hóa 2-oxoglutamate
dehydrogenase sản xuất glutamate
Đột biến mất gen dtsR sản xuất glutamate
Trang 55 Rút ngắn thời gian hậu phẫu ruột
Acid amin không thiết yếu
Quá liều: nhức đầu, hội chứng “nhà hàng Trung Hoa”
Trang 56Asp Asp-P ASA Hse Thr
Ile Met
DDP Leu
DAP Lys
Ức chế Ức chế ngược
Trang 57L-Lysine - Chủng
methionine), thiếu enzym homoserine dehydrogenase
Công nghệ gen: tạo dòng và giải trình tự các gen liên quan
Gen ldc (mã hóa lysine decarboxylase - phá hủy lysine)
Gen cadA (mã hóa chất cảm ứng ldc)
Gen lysE (mã hóa chất vận chuyển lysine ra khỏi tế bào)
Trang 58L-Lysine - Ứng dụng
Lysine được dùng làm chất bổ sung cho thức ăn gia cầm, heo vì các thức ăn thường dùng như ngũ cốc, đậu nành không béo chứa ít lysine, là một acid amin thiết yếu cho vật nuôi
Lượng L-lysine được sản xuất trên thế giới hàng năm khoảng 400.000 tấn
Dược lý:
Acid amin thiết yếu
Dự phòng và điều trị Herpes simplex
Hỗ trợ điều trị ung thư (đang nghiên cứu)
Trang 59 đột biến dị dưỡng lysin, diaminopimelate, hay methionin
Asp Asp-P ASA Hse Thr
Ile Met
DDP Leu
DAP
Lys
Ức chế Ức chế ngược
Trang 60L-Threonin - Công nghệ gen
S marcescen đột biến bằng giới nạp với phage
khiếm khuyết enzym thoái hóa L-threonin
đột biến trên aspartokinase và homoserine
dehydrogenase làm mất nhạy cảm với quá trình ức chế ngược của L-threonin
đột biến ở các enzym sinh tổng hợp L-threonin làm cho chúng không bị ức chế bởi L-threonin
đột biến trên aspartokinase làm mất nhạy cảm với sự
ức chế ngược bởi L-lysin
đột biến ở aspartokinase và homoserine
dehydrogenase làm cho chúng không bị ức chế bởi methionine
Trang 61L-Sản lượng L-threonin của các chủng vi khuẩn đột biến
Giống Thời gian
(h)
Lượng (g/l)
Tốc độ (g/l/h) Tác giả
Trang 6313.000-L-Aspartic Acid
Sản xuất bằng công nghệ enzym 1 hoặc 2 giai đoạn
Nguyên liệu đầu là fumarate (1 giai đoạn) hoặc
maleate (2 giai đoạn)
Enzym aspartase được cố định trên nhựa trao đổi ion
E coli sinh aspartase được cố định trong
polyacrylamid hay K-carageenan
E coli sinh aspartase được cố định trong
polyurethane và polyazetidine
Công nghệ gen: chủng coryneform có hoạt tính
maleate isomerase và aspartase, nồi phản ứng màng
Trang 64L-Aspartic Acid
Maleate Maleate isomerase Fumarate Aspartase L-aspartate
Trang 65L-Aspartic Acid - ứng dụng
dịch truyền dinh dưỡng, phụ gia thực phẩm,
nguyên liệu sản xuất aspartame,
aspartyl-phenylalanine methyl ester
sản xuất polymer có thể phân hủy sinh học
dùng như xà phòng, tác nhân chelat hóa hay xử lý nước
Trang 66 Công nghệ enzym với aspartate β-decarboxylase
Pseudomonas dacunhae cố định trên polyacrilamide, carageenan, nhồi cột
L-aspartate Aspartate β-decarboxylase L-alanine + CO2 Fumarate + NH3 aspartase
Trang 67Thực phẩm chức năng
Trang 68Một số định nghĩa
Thực phẩm chức năng (functional food)
Thực phẩm tăng cường (fortified food)
Trang 69Prebiotic - yêu cầu
Không được thủy phân hay hấp thu ở đoạn trên của
ống tiêu hóa
Là cơ chất chọn lọc của một hay một số giới hạn vi
khuẩn có lợi sống hội sinh trong ruột già, do đó các
vi khuẩn này sẽ được kích thích tăng trưởng hay
chuyển hóa
Có khả năng thay đổi thành phần hệ vi khuẩn ruột
già theo hướng có lợi
Tạo ra các hiệu ứng có lợi tại chổ hay toàn thân đối
với người sử dụng
carbohydrate không tiêu hóa được: các oligo
fructose, glucose, xylose và galactose
Trang 70Prebiotic - chức năng
kiểm soát thời gian lưu chuyển thức ăn qua ruột
cải thiện hấp thu glucose,
giảm hấp thu chất béo và cholesterol,
tăng thể tích và khả năng giữ nước của thức ăn
trong ruột non,
điều hòa sự lên men vi sinh vật để làm tăng sản xuất các acid béo chuỗi ngắn,
giảm pH và ammoniac
giảm các rối loạn đường ruột (táo bón và tiêu chảy),
bệnh tim mạch, và ung thu ruột