Bai giang tin sinh hoc 6

Giới thiệu môn học 1 PHÂN TÍCH TRÌNH TỰ SINH HỌC BẰNG DOTLOT-XÂY DỰNG BẢN ĐỒ ENZYME MỤC TIÊU BÀI HỌC  Xây dựng ma trận N hàng và M cột của hai trình tự  Xác định trình tự chèn, xóa đảo  Xây dựng bảo đồ cắt giới hạn enzyme của các DNA Giới thiệu môn học 2 Đột biến gen  Đột biến gen là những biến đổi trong số lượng, thành phần, trật tự các cặp nuclêôtít, xảy ra tại một điểm nào đó trên phân tử ADN. Mỗi biến đổi ở một cặp nuclêôtít nào đó sẽ gây một đột biến gen. Các dạng đột biến gen thường gặp là:  Mất một cặp nuclêôtít  Thêm một cặp nuclêôtít  Thay thế một cặp nuclêôtít  Đảo vị trí một cặp nuclêôtít Giới thiệu môn học 3 Nguyên nhân phát sinh đột biến gen  Vai trò của đột biến gen: Sự biến đổi cấu trúc phân tử của gen có thể dẫn đến biến đổi cấu trúc của loại prôtêin mà nó mã hóa, cuối cùng có thể dẫn đến biến đổi ở kiểu hình.  Các đột biến gen biểu hiện ra kiểu hình ở từng cá thể riêng lẻ, không tuơng ứng với điều kiện sống, thường là đột biến lặn và có hại cho bản thân Giới thiệu môn học 4 Khoảng trống (gap)  Trong trường hợp chung, các chuỗi được ghi lên kế nhau không có khoảng trống (gap) chèn vào, ví dụ chuỗi AAAGTCTGAC, đi từ đầu 5' đến 3' tính từ trái sang phải. Nếu có khoảng trống, người ta dùng kí hiệu gạch ngang (-) để làm đại diện, ví dụ ATC-G C. Bất cứ chuỗi kí tự nào của các nucleotide mà dài hơn 4 đều có thể gọi là trình tự ADN.  Mặt khác, tùy vào chức năng sinh học, và ngữ cảnh, mà một trình tự có thể mang mang mã hoặc không mang mã (noncoding DNA). Các trình tự DNA cũng có thể chứ "ADN rác" (junk DNA). Giới thiệu môn học 5 A T G A A G T T T T A X T T X A A A A U G A A G U U U - Met – Lys – Phe … Gen ban đầu chưa bị đột biến Thay thế - Met – Lys – Phe … pôlipeptit A T Thêm vào I A T G A A A T T T T A X T T T A A A ADN II A T G A G T T T T A X T X A A A A U G A G U U U - Met – Ser III A T Mất đi A U G A A A U U U mARN A T G A A G T T T T A X T T X A A A A T A U G U A A G U U U - Met – Kết thúc IV ADN mARN pôlipeptit Các dạng đột biến HẬU QUẢ VÀ Ý NGHĨA CỦA ĐỘT BIẾN GEN: 1. Hậu quả của đột biến gen ▪ Biến đổi trong cấu trúc của gen → → biến đổi trong cấu trúc của mARN biến đổi trong cấu trúc của protein tương ứng -> thay đổi đột ngột về một hoặc một số tính trạng của cơ thể 2/ Vai trò và ý nghĩa của đột biến gen Một số đột biến có lợi hay trung tính được xem là nguồn nguyên liệu chủ yếu trong tiến hóa và chọn giống ĐBG làm biến đổi tính trạng cơ thể Biểu hiện thành 1 biến đổi đột ngột, gián đoạn về 1 hoặc một số tính trạng nào đó, trên một hoặc một số ít cá thể trong quần thể. Cụm hoa nhiều màu Bọ lá Ngùa con b¹ch t¹ng Bệnh già trước tuổi Người nhiều ngón Hươu 6 chân Vịt con 4 chân Nguyên tắc dotlot  Nguyên tắc dotlot xây dựng một ma trận điểm gồm N hàng và M cột với N chiều dài của trình tự thứ nhất  M là chiều dài của trình tự thứ 2  Ta gióng các hàng và cột giữa các trình tự nucleotide nếu trùng nhau thì đánh dấu (X) Giới thiệu môn học 10 [...]... ATTGCGGTACGA Giới thiệu môn học 15 Phân tích trình tự xóa Xóa hay loại bỏ một hoặc nhiều cặp nucleotide từ trình tự DNA Xóa nucleotide S1: ATTCCGGTACGT TGCCCC S2: ATTCAAAGGTACGTTGCCCC Giới thiệu môn học 16 Xóa đoạn nucleotide Giới thiệu môn học 17 Kết quả phân tích dotplot bằng blast Giới thiệu môn học 18 Phân tích trình tự đảo S1: AGCCTTAATTGGGGGGGTA S2: AGCGGGGGGGTTAATTCTA Giới thiệu môn học 19 Kết quả... GACGATGAAC Tại sao trình tự này lại quan trọng? Trình tự ngẫu nhiên có thể có những chức năng di truyền  Vài trình tự ngẫu nhiên lặp lại thì liên quan tới bệnh - Thần kinh chậm phát triển - Bệnh Hungtington  Đóng góp 10% của bộ gen người  Số lượng những copy trong trình tự ngẫu nhiên có sự đa dạng trong quần thể này  Giới thiệu môn học 22 Phân tích trình tự Palindromes 5’ 3’ 3’ 5’ Kết quả phân... vệ tế bào vi khuẩn khỏi sự xâm nhập của những DNA lạ chẳng hạn như DNA của thực khuẩn thể Trong kỹ thuật di truyền, enzyme cắt giới hạn là một công cụ hữu hiệu dùng để dòng hoá gen Giới thiệu môn học 26 Bản đồ enzyme cắt giới hạn    Enzyme cắt giới hạn có thể cắt được DNA Enzyme tìm được những vị trí đặc biệt của DNA Thực hiện cắt đặc hiệu Bản đồ enzyme cắt giới hạn  Bản đồ enzyme cắt giới hạn là . Giới thiệu môn học 1 PHÂN TÍCH TRÌNH TỰ SINH HỌC BẰNG DOTLOT-XÂY DỰNG BẢN ĐỒ ENZYME MỤC TIÊU BÀI HỌC  Xây dựng ma trận N hàng và M cột.  Thay thế một cặp nuclêôtít  Đảo vị trí một cặp nuclêôtít Giới thiệu môn học 3 Nguyên nhân phát sinh đột biến gen  Vai trò của đột biến gen: Sự biến đổi cấu trúc phân tử của gen có thể dẫn đến. của các nucleotide mà dài hơn 4 đều có thể gọi là trình tự ADN.  Mặt khác, tùy vào chức năng sinh học, và ngữ cảnh, mà một trình tự có thể mang mang mã hoặc không mang mã (noncoding DNA).