bài tập nhóm môn học nhóm 9

BÀI TẬPCâu 1: Cho biết các accession number của một phần trình tự gen 16S rRNA partial sequence of 16S rRNA của các loài sau: Vibrio parahaemolyticus; V.. Câu 3: Xây dựng cây di truyền t

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH

KHOA KHOA HỌC SINH HỌC

BÁO CÁO BÀI TẬP TIN SINH HỌC

Mã môn học : 211117

Niên khóa : 2020 – 2024

-Tp Thủ Đức,

06/2024-BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH

KHOA KHOA HỌC SINH HỌC

BÁO CÁO BÀI TẬP TIN SINH HỌC

Ngành học : CÔNG NGHỆ SINH HỌC

Mã môn học : 211117

Nhóm học : NHÓM 9 – CA 3 – THỨ 3

Niên khóa : 2020 – 2024

DANH SÁCH THÀNH VIÊN NHÓM 2:

-Tp Thủ Đức,

06/2024-MỤC LỤC

MỤC LỤC -i

PHỤ LỤC HÌNH ẢNH -ii

BÀI TẬP -1

PHƯƠNG PHÁP CÁCH LÀM -2

Câu 1 -2

Câu 2 -3

Câu 3 -5

KẾT QUẢ -8

Câu 1 -8

Câu 2 -13

Câu 3 -13

PHỤ LỤC HÌNH ẢNH

Hình 1.1 Giao diện khi vào NCBI -2

Hình 1.2: Kết quả tìm kiếm Vibrio parahaemolyticus partial sequence -2

of 16S rRNA Hình 1.3 Giao diện FASTA -3

Hình 2.1 Giao diện giải trình tự Mẫu F1 -3

Hình 2.2 Thông tin giải trình tự mẫu lưu dưới dạng File Formatted text -4

Hình 2.3 Kết quả BLAST trình tự gene Mẫu F1 trên NBCI -5

Hình 3.1 Giao diện Alignment Explorer -6

Hình 3.2 Các trình tự gene thể hiện trong file “Vibrio.text” -6

Hình 3.3 Thêm trình tự Mẫu F1 và để xử lý -6

Hình 3.4 Các trình tự xử lý qua MUSCLE -7

BÀI TẬP

Câu 1: Cho biết các accession number của một phần trình tự gen 16S rRNA (partial

sequence of 16S rRNA) của các loài sau: Vibrio parahaemolyticus; V Azureus; V.

natriegens; V alginolyticus; V rotiferianus; V harveyi; V Campbelli; V neocaledonicus; Photobacterium phosphoreum; V xuii; V gallicus

Câu 2: Blast và xác dịnh tên loài của mẫu F1.

Câu 3: Xây dựng cây di truyền từ các accession number trên với mẫu F1 để khẳng

định kết luận loài từ trình tự mẫu F1

PHƯƠNG PHÁP CÁCH LÀM

Câu 1:

Accession number của một phần trình tự gen 16S rRNA (partial sequence of

16S rRNA) của loài Vibrio parahaemolyticus :

Bước 1: Ta vào wedsite: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ Ta được giao diện:

Hình 1.1 Giao diện khi vào NCBI

Bước 2: Gõ vào thanh tiềm kiếm “Vibrio parahaemolyticus partial sequence of 16S

rRNA” bấm SEARCH Hiện giao diện kết quả:

Hình 1.2: Kết quả tìm kiếm Vibrio parahaemolyticus partial sequence of 16S rRNA

Bước 3: Nháy chọn FASTA Ta được giao diện:

Hình 1.3 Giao diện FASTA

Từ đó ta được accession number của một phần trình tự gen 16S rRNA (partial sequence of 16S rRNA) của các loài Vibrio parahaemolyticus Làm tương tự với các loài còn lại.

Câu 2:

Bước 1: Vào phần mềm Chromas chọn Open chọn file “Mẫu F1” cần xác định loài Ta

có F1 giải trình tự (qua Chromas) như sau:

Hình 2.1 Giao diện giải trình tự Mẫu F1

Bước 2: Chọn Export, lưu dưới dạng “Formatted text” chọn Save.

Hình 2.2 Thông tin giải trình tự mẫu lưu dưới dạng File Formatted text

Bước 3: Loại bỏ các trình tự đầu và cuối do sự sai lệch khi giải trình tự; Đối với trình

trự như trên loại 49 nucleotic đầu với 361 nucleotic cuối.

Mẫu F1 có trình tự sau:

TGAGTAATGCCTAGGAAATTGCCCTGATGTGGGGGATAACCATTGGAAAC GATGGCTAATACCGCATGATGCCTACGGGCCAAAGAGGGGGACCTTCGGG CCTCTCGCGTCAGGATATGCCTAGGTGGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAG GGCTCACCAAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCAC ACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAA TATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGA AGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTCGTGAGGAAGGTAGTGTAGTTA ATAGCTGCATTATTTGACGTTAGCGACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGT GCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTG

GGCGTAAAGCGCATGCAGGTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCGGG GCTCAACCTCGGAATTGCATTTGAAACTGGCAGACTAGAGTACTGTAGAG GGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCTGAAGGAA TACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAGATACTGACACTCAGATGCGA AAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAA CGATGTCTACTTGGAGGTTGTGGCCTTGAGCCGTGGCTTTCGGAGCTAACG CGTTAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAATG AATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGC AACGCGAAGAACCTTACCTACTCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGAGATG GATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGC TCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCC TTGTTTGCCAGCGAGTAATGTCGGGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATA AACCGGAAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCAT

Bước 4: Sau đó thực hiện BLAST trình tự gene trên NBCI ta được:

Hình 2.3 Kết quả BLAST trình tự gene Mẫu F1 trên NBCI

Câu 3: Xây dựng cây di truyền từ các accession number trên với mẫu F1 để khẳng

định kết luận loài từ trình tự mẫu F1

Để xây dựng cây di truyền để khẳng định F1 là loài Vibrio alginolyticus

Bước 1: Ta xây dựng hệ thống file “Vibrio.text” gồm các accession number của các

loài nêu trên.

Bước 2: Mở phần mềm MEGA11, vào “ALIGN” chọn “Edit/Build Alignment” chọn

“Create a new alignment” nhấn OK chọn DNA type Ta được giao diện:

Hình 3.1 Giao diện Alignment Explorer.

Bước 3: Vào Edit chọn “Insert Sequence from File” chọn file “Vibrio.text” Ta được

giao diện:

Hình 3.2 Các trình tự gene thể hiện trong file “Vibrio.text”

Bước 4: Tại Sequence 12 , ta sao chép trình tự F1 Paste vào, và sửa đổi lại tên F1 Ta

được giao diện:

Hình 3.3 Thêm trình tự Mẫu F1 và để xử lý

Bước 5: Chọn tất cả các Sequence Trên thanh công cụ chọn MUSCLE chọn Align

DNA, bấm OK Ta được kết quả như sau:

Hình 3.4 Các trình tự xử lý qua MUSCLE Bước 6: Lưu File với tên “Test 3.mas” Sau đó thoát ra trang Alignment Explorer Bước 7: Trở về trang mặc định, chọn PHYLOGENY Chọn các kiểu cây di truyền

KẾT QUẢ

Câu 1:

Accession number của một phần trình tự gen 16S rRNA (partial sequence of

16S rRNA) của các loài Vibrio parahaemolyticus :

>NR_041838.1 Vibrio parahaemolyticus strain ATCC 17802 16S ribosomal RNA, partial sequence

AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGAAACGAGT TATCTGAACCTTCGGGGAACGATAACGGCGTCGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTAGGAAATTGCCC TGATGTGGGGGATAACCATTGGAAACGATGGCTAATACCGCATGATGCCTACGGGCCAAAGAGGGGGACC TTCGGGCCTCTCGCGTCAGGATATGCCTAGGTGGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAGGGCTCACCAAGGC GACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGG GAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGG CCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTCGTGAGGAAGGCGGGTACGTTAATAGCGTATTCGTTTGACGTTA ACGACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCG GAATTACTGGGCGTAAAGCGCATGCAGGTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCGGGGCTCAACCTCG GAATTGCATTTGAAACTGGCAGACTAGAGTGCTGTAGAGGGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAAT GCGTAGAGATCTGAAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAGATACTGACACTCAGATGCGAA AGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGTTGT GGCCTTGAGCCGTGGCTTTCGGAGCTAACGCGTTAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAA AACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGA ACCTTACCTACTCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACAG GTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTA TCCTTGTTTGCCAGCGAGTAATGTCGGGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGG GACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGAGTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAGAGGGC AGCCAACTTGCGAAAGTGAGCGAATCCCAAAAAGTGCGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACT CCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACA CACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGCTGCAAAAGAAGTAGGTAGTTTAACCTTCGGGGGGACGCTTAC CACTTTGTGGTTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC

Accession number của một phần trình tự gen 16S rRNA (partial sequence of

16S rRNA) của các loài Vibrio Azureus:

>NR_041683.1 Vibrio azureus strain LC2-005 16S ribosomal RNA, partial sequence

GCGTCGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTAGGAAATTGCCCTGATGTGGGGGATAACCATTGGAAACG ATGGCTAATACCGCATAACGCCTACGGGCCAAAGAGGGGGACCTTCGGGCCTCTCGCGTCAGGATATGCC TAGGTGGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAGGGCTCACCAAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGAT GATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAA TGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTC GTGAGGAAGGCAGTGTAGTTAATAGCGGCATTGTTTGACGTTAGCGACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCC GTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCATGCAG GTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCGGGGCTCAACCTCGGAATAGCATTTGAAACTGGCAGACTAG AGTACTGTAGAGGGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCTGAAGGAATACCGGTG GCGAAGGCGGCCCCCTGGACAGATACTGACACTCAGATGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATA CCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGTTGTGGCCTTGAGCCGTGGCTTTCGGAGCTA ACGCGTTAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGC ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTACTCTTGACATCCAGAGA ACTTTTCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTG TTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTGTTTGCCAGCGAGTAATGTCGG GAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTA CGAGTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAGAGGGCAGCCAACTTGCGAAAGTGAGCGAATCC CAAAAAGTGCGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCG TGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTT

Accession number của một phần trình tự gen 16S rRNA (partial sequence of

16S rRNA) của các loài Vibrio natriegens:

>NR_026124.1 Vibrio natriegens NBRC 15636 = ATCC 14048 = DSM 759 16S ribosomal RNA, partial sequence

GAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGAAACGAGTT AACTGAACCTTCGGGGGACGTTAACGGCGTCGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTAGGAAATTGCCCT GATGTGGGGGATAACCATTGGAAACGATGGCTAATACCGCATGATGCCTACGGGCCAAAGAGGGGGACCT TCGGGCCTCTCGCGTCAGGATATGCCTAGGTGGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAGGGCTCACCAAGGCG ACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGG AGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGC CTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTCGTGAGGAAGGTAGTGTAGTTAATAGCTGCATTATTTGACGTTAG CGACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGG AATTACTGGGCGTAAAGCGCATGCAGGTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCGGGGCTCAACCTCGG AATAGCATTTGAAACTGGCAGACTAGAGTACTGTAGAGGGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATG CGTAGAGATCTGAAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAGATACTGACACTCAGATGCGAAA GCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGTTGTG GCCTTGAGCCGTGGCTTTCGGAGCTAACGCGTTAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAA ACTCAAATGAATTGACGGGGGNCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAA CCTTACCTACTCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACAGG TGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTAT CCTTGTTTGCCAGCGAGTAATGTCGGGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGG ACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGAGTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAGAGGGCG GCCAACTTGCGAAAGTGAGCGAATCCCAAAAAGTGCGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTC CATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACAC ACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGCTGCAAAAGAAGTAGGTAGTTTAACTTCGGGGGGACGCTT

Accession number của một phần trình tự gen 16S rRNA (partial sequence of

16S rRNA) của các loài Vibrio alginolyticus:

>NR_044825.2 Vibrio alginolyticus strain ATCC 17749 16S ribosomal RNA, partial sequence

AAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGA AACGAGTTAACTGGAACTTGGGAACGATAACGGCGTTGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTAGGAAAT TGCCCTGATGTGGGGGATAACCATTGGAAACGATGGCTAATACCGCATAAGCTACGGGCCAAAGAGGGGG ACCTTCGGGCCTCTCGCGTCAGGATATGCCTAGGTGGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAGGGCTCACCAA GGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTA CGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGA AGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTCGTGAGGAAGGTAGTGTAGTTAATAGCTGCATTATTTGACG TTAGCGACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAA TCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCATGCAGGTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCGGGGCTCAACC TCGGAATAGCATTTGAAACTGGCAGACTAGAGTACTGTAGAGGGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGA AATGCGTAGAGATCTGAAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAGATACTGACACTCAGATGC GAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGT TGTGGCCTTGAGCCGTGGCTTTCGGAGCTAACGCGTTAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGAT TAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAGGCAACGCGA AGAACCTTACCTACTCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCTTCGGGAACTCTGAGAC AGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCT TATCCTTGTTTGCCAGCGAGTAATGTCGGGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTG GGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGAGTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAGAGG GCAGCCAACTTGCGAGAGTGAGCGAATCCCAAAAAGTGCGTCGTAGTCCATTGGAGTCTGCAACTCGACT CCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACA CACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGCTGCAAAAGAAGTAGGTAGTTTCAACTACGGGAGGACAGCCTA CCACTTTGTGGT

Accession number của một phần trình tự gen 16S rRNA (partial sequence of

16S rRNA) của các loài Vibrio rotiferianus:

>NR_042081.1 Vibrio rotiferianus CAIM 577 = LMG 21460 16S ribosomal RNA, partial sequence

ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGAAACGAGTTATCTGAACCTTCGGGGAAC GATAACGGCGTCGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTAGGAAATTGCCCTGATGTGGGGGATAACCATT GGAAACGATGGCTAATACCGCATAATGCCTACGGGCCAAAGAGGGGGACCTTCGGGCCTCTCGCGTCAGG ATATGCCTAGGTGGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTG AGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATAT TGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACT TTCAGTCGTGAGGAAGGTAGTGTAGTTAATAGCTGCATTATTTGACGTTAGCGACAGAAGAAGCACCGGC TAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCG CATGCAGGTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCGGGGCTCAACCTCGGAATTGCATTTGAAACTGGC AGACTAGAGTACTGTAGAGGGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCTGAAGGAAT ACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAGATACTGACACTCAGATGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGA TTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGTTGTGGCCTTGAGCCGTGGCTTTC GGAGCTAACGCGTTAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAATGAATTGACGGG GGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTACTCTTGACAT CCAGAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCA GCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTGTTTGCCAGCGAGTA ATGTCGGGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATG GCCCTTACGAGTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAGAGGGCAGCCAACTTGCGAGAGTGAG CGAATCCCAAAAAGTGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTA GTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGG GAGTGGGCTGCAAAAGAAGTAGGTAGTTTAACCTTCGGGAGGACGCTTACCACTTTGTGGTTCATGAC

Accession number của một phần trình tự gen 16S rRNA (partial sequence of

16S rRNA) của các loài Vibrio harveyi:

>NR_043165.1 Vibrio harveyi strain NCIMB1280 16S ribosomal RNA, partial sequence

GCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGAAACGAGTTATCTGAACCTTCGGGGAACGATAACGGCGTCGAGCGG CGGACGGGTGAGTAATGCCTAGGAAATTGCCCTGATGTGGGGGATAACCATTGGAAACGATGGCTAATAC CGCATAATACCTWCGGGTCAAAGAGGGGGACCTTCGGGCCTCTCGCGTCAGGATATGCCTAGGTGGGATT AGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACA CTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGC CTGATGCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTCGTGAGGAAGGT AGTGTAGTTAATAGCTGCATTATTTGACGTTAGCGACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGC CGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCATGCAGGTGGTTTGTTA AGTCAGATGTGAAAGCCCGGGGCTCAACCTCGGAATAGCATTTGAAACTGGCAGACTAGAGTACTGTAGA GGGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCTGAAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGC CCCCTGGACAGATACTGACACTCAGATGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTC CACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGTTGTGGCCTTGAGCCGTGGCTTTCGGAGCTAACGCGTTAAGT AGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGG AGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTACTCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGAG ATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGT TGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTGTTTGCCAGCACTTCGGGTGGGAACTCCAGGGA GACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGAGTAGGGCTA CACACGTGCTACAATGGCGCATACAGAGGGCGGCCAACTTGCGAGAGTGAGCGAATCCCAAAAAGTGCGT CGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATG CCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGCTGCAAAAGAAG TAGGTAGTTTAACCTTCGGGAGGACGCTTACCACTT