bài tập tin sinh thực hành nhóm 20 ca 3 thứ 3

Trang 1 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠOTRƯỜNG ĐẠI HỌC NƠNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINHKHOA KHOA HỌC SINH HỌCBÁO CÁO THỰC HÀNHMÔN SINH TIN HỌC ỨNG DỤNGNgành học: CÔNG NGHỆ SINH HỌCSinh viên thực hiệ

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINHKHOA KHOA HỌC SINH HỌC

BÁO CÁO THỰC HÀNHMÔN SINH TIN HỌC ỨNG DỤNG

Ngành học: CÔNG NGHỆ SINH HỌCSinh viên thực hiện: NHÓM 20

Ca học: CA 3 – THỨ 3Năm học: 2023 – 2024

TP Thủ Đức, 06/2024

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINHKHOA KHOA HỌC SINH HỌC

BÁO CÁO THỰC HÀNHMÔN SINH TIN HỌC ỨNG DỤNG

Hướng dẫn khoa học Sinh viên thực hiện

PGS TS Nguyễn Bảo Quốc VÕ HOÀNG MINH

PHẠM NGUYỄN BẢO NHI BÙI THÙY TRANG

DANH SÁCH THÀNH VIÊN

3 Phạm Nguyễn Bảo Nhi 21126445 DH21SHB

DANH MỤC HÌNH ẢNH

Hình 1.1 Vi khuẩn Clostridium 1

Hình 1.2 Tìm kiếm thông tin trên cơ sở dữ liệu NCBI 2

Hình 1.3 Giao diện các loài của chi Clostridium trong NCBI 3

Hình 1.4 Copy data từ NCBI đưa vào phần mềm Mega 11 18

Hình 1.5 Chạy Alignment để tìm các đoạn chung giữa các trình tự 18

Hình 1.6 Dữ liệu sao khi Alignment 19

Hình 1.7 Giao diện Primer 3 19

Hình 1.8 Điều chỉnh các thông số thiết kế cặp primer 20

Hình 1.9 Kết quả thiết kế primer 20

Hình 1.10 Kết quả kiểm tra đặc hiệu bằng In silico 21

Hình 1.11 Kết quả kiểm tra đặc hiệu bằng Blast Primer trên NCBI 21

Hình 1.12 Giao diện của primer3plus 22

Hình 1.13 Kết quả cho cho trên primer3plus 22

Hình 1.14 Kết quả kiểm tra đặc hiệu cặp primer số 1 trên In silico PCR 23

Hình 1.15 Kiểm tra dặc hiệu cặp primer số 1 trên Blast Primer 23

Hình 1.16 Kết quả kiểm tra đặc hiệu cặp primer số 2 trên In silico PCR 24

Hình 1.17 Kết quả kiểm tra đặc hiệu cặp primer số 2 trên Blast Primer 24

Hình 1.14 Kiểm tra đặc hiệu cặp primer số 3 trên Blast Primer 25

THIẾT KẾ PRIMER CHUYÊN BIỆT PHÁT HIỆN

Clostridium sp.

1.1 Giới thiệu vi khuẩn Clostridium

1.1.1 Nguồn gốc và đặc điểm

Clostridium là một giống trực khuẩn Gram dương, thuộc ngành Firmicutes Đây

là những vi khuẩn kỵ khí bắt buộc có khả năng sinh nha bào khi môi trường sống bấtlợi. Tên của chúng bắt nguồn từ tiếng Hy Lạp kloster (κλωστήρ) có nghĩa trục quay.

Từ những đặc điểm điển hình trên, người ta xếp các vi khuẩn vào giống Clostridium,

tuy nhiên gần đây nhiều chủng đã được phân loại vào các giống khác.

1.1.3 Bệnh học

Giống Clostridium bao gồm khoảng 100 loài có những chủng sống tự do trong

môi trường và một số hiện diện như những mầm bệnh tiềm ẩn với con người.[4] Trong

nhóm này có bốn vi khuẩn chủ yếu gây bệnh cho con người:C botulinum, có khả năngsinh độc tố trong thức ăn, vết thương gây ra bệnh độc thịt; C difficile, tồn tại như là

mầm bệnh cơ hội thuộc hệ vi sinh vật ở ruột và phát triển khi có điều kiện nhất là trong

liệu pháp chữa trị bằng kháng sinh và gây ra chứng viêm đại tràng màng giả; C.perfringens, ban đầu có tên C welchii, là nguyên nhân gây ra một loạt các hội chứng

khác nhau, từ ngộ độc thức ăn cho đến bệnh hoại thư sinh hơi Loài này cũng sản sinh

ra độc tố ruột huyết gây ra bệnh nhuyễn thận ở cừu và dê; C tetani, gây ra bệnh uốn

1.2 Vật liệu và phương pháp1.2.1 Vật liệu, phương pháp:

 Công cụ tìm kiếm NCBI. Phần mềm Primer3 Phần mềm Primer3plus. Phần mềm In slico.

 Công cụ Primer designing – NCBI Phần mềm Mega 11

Bước 2: Vào Taxonomy Browser để lấy dữ liệu FASTA 16S của các loài thuộc chi

Hình 1.3 Giao diện các loài của chi Clostridium trong NCBI

Bước 3: Đưa dữ liệu FASTA lấy được vào Notepad

>NR_043671.1 Clostridium tetanomorphum strain DSM 4474 16Sribosomal RNA, partial sequence

AACGCTGGCGGCGTGCCTTCACATGCAAGTCGAGCGATGAAGTCCCTTCGGGGATGGATTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGCAACCTGCCTCAAAGTGGGGGATAGCCCTCCGAAAGGAGGATTAATACCGCATAACATTAGTTTTCCGCATGAAAAACTAATCAAAGGAGTAATCCGCTTTGAGATGGGCCCGCGGTGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACAGCTCACCAAGGCCACGATGCATAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGGGTGATGAAGGTCTTCGGATTGTAAAACCCTGTCTTCTGGGACGATAATGACGGTACCAGAGGAGGAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCGAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGCGTAAAGGATGCGTAGGCGGGCATTTAAGTGAGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACTTGGGGGCTGCATTTCAAACTGGGTGCCTAGAGTGCAGGAGAGGTAAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTACTGGACTGTAACTGACGCTGAGGCATGAAAGCGTGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATACTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGCAGTTAACACAATAAGTATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCTAGACTTGACATCCCCTGAATTACTCGTAACGGAGGAAGCCCTTCGGGGCAGGGAGACAG

>OQ724631.1 Clostridium tanneri strain A1-XYC3 16Sribosomal RNA gene, partial sequence

CGACGCNGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGATGAAATNCCTTCGGGNATGGANTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTCAAAGAGGGGGATAGCCTCCCGAAAGGGAGATTAATACCGCATAACATTAGTTTTTCGCATGGANNGACTAATTAAAGGAGCAATCCGCTTTGAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTGTCTTTTGGGACGATAATGACGGTACCAAAGGAGGAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGCGTAAAGGATGCGTAGGCGGATATTTAAGTGAGATGTGAAATTCCCGAGCTTAACTTGGGAGCTGCATTTCAAACTGGATATCTAGAGTGCGGGAGAGGAGAATGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGATTCTCTGGACCGTAACTGACGCTGAGGCATGAAAGCGTGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTACTAGGTGTAGGAGGGTCCAACCTTCTGTGCCGCAGTTAACACAATAAGTACTCCGCCTGGGAAGTACGATCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGACTTGACATCCCCTGAATTACTCGTAATGGAGGAAGCCCTTCGGGGCAGGGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTAGGTTAAGTCCTGCAACGAGCGCAACCCTTATCATTAGTTGCTACCATTAAGTTGAGCACTCTAGTGAGACTGCCCGGGTTAACCGGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGTGAGTACAATTAGATGCAAACCCGCGAGGGGGAGCCAA

>PP727408.1 Clostridium intestinale strain TC4 16Sribosomal RNA gene, partial sequence

CAGGCGGGGCTTACCATGCAGTCGAGCGAGGAATTCCTTCGGGAATTTCCTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGCAACCTGCCTGATAGAGGGGGATAGCCTCCCGAAAGGGAGATTAATACCGCATAAAGTCAAATGAAGGCATCTTCAAATGACCAAAGGAGTAATCCGCTATCAGATGGGCCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTGTCTTCAGGGACGATAATGACGGTACCTGAGGAGGAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGCGTAAAGGGAGCGTAGGCGGATACTTAAGTGGGATGTGAAATACCTGGGCTTAACTTGGGTGCTGCATTCCAAACTGGGTGTCTAGAGTGTTGGAGAGGAAAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTTCTGGACAATAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGGTACTAGGTGTAGGGGGTATCGACTCCCCCTGTGCCGCCGTTAACACAATAAGTACCCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCTAGACTTGACATCTCCTGAATTACTCTTAATCGAGGAAGTTCTCCCTTCGGGGAGGACAGGAAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATTGTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTCTAGCAAGACTGCCGTGGTTAACGCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGAGTACAAAGAGACGCAAAGCCGCGAGGTGGAGCAAAACTTATAAAACTCGTCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGAAACTCGCCTGCATGAAGCTGGAGTTGCTAGTAATCGCGAATCAGAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAGTTGGCAATACCCGAAGTCCGTAGCCTAACCTTTTAGGAGGGCGCGGCCGAAGGTAGGTCCCTC

>NR_134714.1 Clostridium oryzae strain KC3 16S ribosomalRNA, partial sequence

>NR_148266.1 Clostridium vulturis strain YMB-57 16Sribosomal RNA, partial sequence

GGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGATGAAGCTTCCTTCGGGAAGTGGATTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTTATAGAGGGGGATAGCCTTCC

>NR_114765.1 Clostridium bowmanii strain A-1/C-an/C1 16Sribosomal RNA, partial sequence

CGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGATGAAACCTTTCGGGGTGAATTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTCAAAGAGGGGAATAGCCTCCCGAAAGGGAGATTAATACCGCATAATATGTTTTGATCGCATGATCAGAATATCAAAGGATTCTTCCACTTTGAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGAATGATGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTTCTGTCTTCT

>NR_112653.1 Clostridium subterminale strain DSM 6970 16Sribosomal RNA, partial sequence

TCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGATGAAGCCCTTCGGGGTGAATTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTTATAGAGGGGGATAGCCTTCCGAAAGGAAGATTAATACCGCATAATATGTTTTTATCGCATGGTAGAAACATCAAAGGAGCAATCCGCTATAAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGAATGAAGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGTTCTGTTTTCTGGGACGATAATGACGGTACCAGAGGAGGAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGCGTAAAGGATGCGTAGGCGGATGTTTAAGTGAGATGTGAAATACCCGAGCTCAACTTGGGTGCTGCATTTCAAACTGGATATCTAGAGTGCAGGAGAGGAAAGCGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTTTCTGGA

>NR_026491.1 Clostridium disporicum strain DS1 16Sribosomal RNA, partial sequence

GCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGAGTTGATTCTCTTCGGAGATGAAGCTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGCAACCTGCCTCATAGAGGGGAATAGCCTCCCGAAAGGGAGATTAATACCGCATAAGATTGTAGCTTCGCATGAAGTAGCAATTAAAGGAGCAATCCGCTATGAGATGGGCCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGTGATGACGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTGTCTTCAGGGACGATAATGACGGTACCTGAGGAGGAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCGAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGCGTAAAGGGAGCGTAGGCGGACTTTTAAGTGAGATGTGAAATACCCGGGCTCAACTTGGGTGCTGCATTTCAAACTGGAAGTCTAGAGTGCAGGAGAGGAGAATGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGATTCTCTGGACTGTAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATACTAGGTGTAGGGGTTGTCATGACCTCTGTGCCGCCGCTAACGCATTAAGTATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAA

>NR_044159.1 Clostridium tepidiprofundi DSM 19306 strainSG 508 16S ribosomal RNA, partial sequence

CTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGATGAAGCTACCTTCGGGTAGTGGWATAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTCAAAGAGGGGGATAGCCCTCCGAAAGGAGGAGTAATACCGCATAACATATATTTCTCGCATGAGAGATATATCAAAGATTTATCGCTTTGAGATGGACCCGCGTCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGGGTGAAGAAGGTTTTCGGATTGTAAAGCCCTGTTCTATAGGACGATAATGACGGTACTATAGGAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGAGTGCGTAGGCGGATAATTAAGTGAGATGTGAAATACCCGAGCTCAACTTGGGTGTGCATTTCAAACTGGTAATCTAGAGTGCAGGAGAGGAAAGCGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTTGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTTTCTGGACTGTAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGGTACTAGGTGTTGGGGGTCGAACCTCAGTGCCGCAGTAAACACATTAAGTACCCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCTAGACTTGACATCCTAAGAATCCCTTGGAAACAGAGGAGTGCCTTCGGGAACTTAGGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATTGTTAGTTGCTACCATTAAGTTGAGCACTCTAGCGAGACTGCCCGGGATAACCGGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCC

>KR997583.1 Clostridium hydrogeniformans strain DCRUST BTKW-4 16S ribosomal RNA gene, partial sequence

TAACGCGTGGGCAACCTACCTCATAGTGGGGGATAGCCCTCCGAAAGGAGGATTAATACCGCATAACATTGCTTTATCGCATGGTAGAGCAATCAAAGGAGTAATCCGCTATGAGATGGGCCCGCGGCGCATTATCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTACCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGAACTGAGATACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTGTCTTCAGGGACGATAATGACGGTACCTGAGGAGGAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGCGTAAAGGATGCGTAGGCGGATTTTTAAGTGGGATGTGAAATACCCGGGCTCAACTTGGGTGCTGCATTCCAAACTGGAAGTCTAGAGTGCGGGAGAGGAGAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGACCGTAACTGACGCTGAGGCATGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGGTACTAGGTGTGGGAGGTATCGACCCCTTCCGTGCCGCCGTTAACACAATAAGTACCCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGCGGAGCATGTGGTTTAATTAGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCTAGACTTGACATCTCCTGAATTACCCGTAATGGGGGAAGTCCTTCGGGACAGGAAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATTGTTAGTTGCTACCATTAAGTTGAGCACTCTAGCGAGACTGCCCGGGTTAACCGGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCAGTACAGAGAGAAGCGAGACCGCAAGGTGGAGCAAAACTCAAAAACTGGTCCCAGTTCGGATTGTAGGCTGAAACTCGCCTACATGAAGCCGGAGTTGCTAGTAATCGCGAATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGTGT

>NR_174250.1 Clostridium prolinivorans strain PYR-10 16Sribosomal RNA, partial sequence

>PP789733.1 Clostridium botulinum strain Ab.RS54 16Sribosomal RNA gene, partial sequence

ATAGCCTCCCGAAAGGGAGATTAATACCGCATAAAGTATGAAGGTCGCATGACTTCATTATACCAAAGGAGTAATCCGCTATGAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAGGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAA

>NR_104822.1 Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 601316S ribosomal RNA, partial sequence

TCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTCGAGCGAGAAACCTTCGGGTTTCTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTCAAAGAGGGGAATAGCCTCCCGAAAGGGAGATTAATACCGCATAATATTAAAGTTTCACATGGAGCTTTAATTAAAGGAGTAATCCGCTTTGAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGAGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGTGATGACGGTCTTCGGATTGTAAAGCTCTGTCTTTTGGGACGATAATGACGGTACCAAAGGAGGAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGCGTA

>LC631612.1 Clostridium sp WLY-B-L2 gene for 16S rRNA,partial sequence

TCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGGGCGAAGAAGCTCCTTCGGGAGAATCTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTCAAAGAGGGGGATAGCCTCCCGAAAGGGAGATTAATACCGCATGACAAATATAATCCGCATGGATTATATTTTAAAGGAGAAATCCGCTTTGAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGCAGGGTAACGGCCTACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGAACGGCCACATTGGAACTGAGAGACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGAAGGTTTTCGGATTGTAAAGCTCTGTCATCTGGGACGATAATGACGGTACCAGATGAGGAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGCAGGCGGACATTTAAGTGAGATGTGAAATACCCGGGCTTAACCCGGGCAGTGCATTTCAAACTGGGTGTCTGGAGTGCAGGAGAGGAGAACGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGTTCTCTGGACTGTAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTC

>NR_175533.1 Clostridium chrysemydis strain personal::PT16S ribosomal RNA, partial sequence

TCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGATGAAGTTTCCTTCGGGAAACGGATTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTTGTAGTGGGGGATAGCCTTTCGAAAGGAAGATTAATACCGCATAATATTGTAGTATCGCATGGTACAACAATCAAAAGAGCAATCTGCTACAAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAATGGCTTACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGTGATGACGGTCTTCGGATTGTAAAACTCTGTCTTTGGGGACGATAATGACGGTACCCAAGGAGGAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGCGTAAAGGGAGCGTAGGCGGATGTTTAAGTGGGATGTGAAATACTCGGGCTCAACCTGAGTGCTGCATTCCAAACTGGAGATCTAGAGTGCAGGAGGGGAGAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGACTGTAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGATACTAGGTGTGGGAGGTGTCAACTCCTTCCGTGCCGCCGCTAACGCATTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGTAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCTAGACTTGACATCTTCTGCATTACCCTTAATCGGGGAAATCCCTTCGGGGACAGAATGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTA