Bài 6: Nucleotide Nucleotide còn tham gia trong thành deoxyribonucleic acid DNA và ribonucleic acid RNA Bài 7: , quá trình Các acid béo oxyhóa trong quá trình oxyhóa- trong 3 giai oxyh
AMINO ACID, PEPTIDE VÀ PROTEIN
AMINO ACID
Asparagus asparagin threonine carboxyl COOH và amine ,
- khác nhau: -COOH, R, -NH2, và H, là quay amino acid, còn polys - glucose)
-kháng sinh amino acid phi protein,
- COOH và NH2, nên nói chung tan
- -COOH, -NH2, -SH và nhóm khác nhau
(trong bài này là protein)
, tích (+) do nhóm - + và (-) do nhóm - -COO - Chúng tryptophan, tyrosine và phenylalanine,
Hình 2.3: glutamic và a arginine và l có
PEPTIDE
-NH2 và -COOH bên trái , -
C cysteine hông gian ỉ ớ ề í ẻ ù ỉ í ẹỉ ẹ ỉ ẻ ợ íẹẹ ừ ừ ỉ ề íỉ ú ỉ ợ ẹ íỉ Ò ó õ íẹẹ ẻ ợ ỉ ẹ Ý ỉ ẻ ù ỉ ớ ề í peptide
- dabsyl chloride, dansyl chloride và 1- fluoro-2,4-dinitrobenzene o dung gel c
-S-S-) Glucagon khác, dài 29 amino acid
(ant acid kích thích (adrenal cortex)
L-aspartyl phenylalanyl methyl ester aspartame hay Nutrasweet,
PROTEIN
(prosthetic group) Nhóm conjugated protein lipoprotein glycoprotein metalloprotein
, hay li tâm (crude extract) protein (dialysis) n tích,
. HPLC (High-Performance Liquid Chromatography)
, nhóm protein immunoglobulin kháng nguyên
Hình 2.15: ng pháp ELISA (enzyme linked
Hình 2.16: amino acid trong thành các ) khá
- LMS (Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry), EIS-MS (Electrospray Ionization Mass
, , cytochrome c các loài càng xa nhau,
. pepide- và , pháp phân tích X quang và
- - tính liên k , quay là (phi) và
180 o proline và g g p cis trans) các
-Keratin, collagen và tan -Keratin
, là quá trình hoàn tính enzyme ribonuclease amino
RNA polymerase,aspartate transcarbamoylase pyruvate dehydrogenase
hemoglobin. lên n, là (negative cooperativity)
Hình 2.2: tia X protein khác nhau
phát - vào các nhóm -NH2, -
A Arginine và lysine; B Aspartic acid và glutamic acid;
C Leucine và valine; D Glycine vàproline
Câu 6: Amino acid nà d ng ion trong phân t protein?
Câu 11: ò á trình hóa sinh nà y?
A Là óm alpha-COOH à alpha- NH2
C Liê é óm NH2 làm vai trò ê
A Amino acid có ; B Amino acid có tính acid;
; ; ; D Siêu ly tâm phân tích.
ENZYME
ENZYME LÀ GÌ?
- enzyme là apoenzyme hay apoprotein, còn cá rò này
ATP + D-Glucose ADP + D-Glucose-6-phosphate xúc tác
+, H3O + và OH - , xúc tác Glu, Asp, Lys, Arg, Cys, His và Tyr , d , b)
A-B + X: A-X + B A + X: + B c) Xúc tác thông qua ion kim
Vmax, ta có: Vmax/2 = Vmax [S] / Km + [S]
Hình 3.3: trình Michaelis - Menten thành:
Enzyme s sau: CH2(OH)CH(NH2)COOH CH3COCOOH + NH3
Vo M/20 phút) 0,150 0,200 0,27 0,315 0,340 0,350 0,360 pyridoxal phosphate, 10 -5 M 0,20 0,40 0,85 1,25 1,70 2,00 8,00 Xác
, a) tranh tâm xúc tác enzyme v
3.3 E òa nhóm , là trúc cho phép n , allos có stereo
, (feedback inhibition) enzyme, mà ngoài factor
E emoglobin hình sigmoid, còn nhóm uridyl, ADP-ribosyl và nhóm methyl enzyme glycogen phosphorylase enzyme do protein kinase và protein phosphatase xúc tác ng phân :
(Glucose)n + Pi (Glucose)n-1 + Glucose-1-phosphate là glycogen phosphorylase a khi là glycogen phosphorylase b, khi chúng không zymogen
Nicotinamide adenine dinucleotide (NAD + ) là coenzyme tham gia
Nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADP +
Adenosine -triphosphate -diphosphate (ADP) trong quá
Thiamine (vitamin B1) là coenzyme xúc tác
Pyruvate + CoA + NAD + Acetyl CoA + CO2 + NADH
Flavin adenine dinucleotide (FAD) và flavin mononucleotide nhóm enzyme dehydrogenase có tên là flavoprotein,
Coenzyme A (CoA) pantoic acid và ò-alanine
Biotin yme trong nhóm CO2
Folate hay folic acid methylene và methyl
Pyridoxal phosphate vitamin B6 ác amine, decarboxyl hóa
Vitamin B12 xúc tác quá trình methyl hóa
Câu 1: ò ào? ào tâ phâ à ú à ó ên enzyme á trình phiên mã ã hó
C Enzyme xúc tú iê ào
A mM/phút; B mg/mM; C mM/lit;
Câu 8: ò ào tâ òa là
Câu 9: à enzyme và phâ úc tác?
; B Tâm allosteric; C Tâm phâ ; D Tâ Câu 10:
D Là â ác phâ óa và khô óa
Câu 12: tính riê ó út trên 1 mg protein enzyme Câu 13:
Câu 15: ách nào? ê ông trù â enzyme â ô â ù ê các
Câu 16: Enzyme nào xúc tá óm phosphate lên nucleoside disphosphate trong ác enzyme sau?
LIPID VÀ
CH3, thì acid béo có tên là 3 ac
Triacylglycerol , qua và th triglyceride hay triacylglycerol
T tristearin, tripalmitin và triolein khi
, lanolin (sáp lông sáp ong, sáp carnauba và sáp cá nhà táng
: màng glycerophospholipid màng sphingolipid t màng sterol
Ceramide là thành ceramide: sphingomyelin, glycolipid trung tính và ganglioside
- bào. enzyme phospholipase C phóng diacylglycerol và inositol phosphate enzyme phospholipase A arachidonic acid, eicosanoid
, íỉợ ẹ í ẹ íỉ ẹ í ẹ ẹ Ð ẹ ẹ íỉợ íỉợ ềứíỉớữớ ẹ õ ó ù ợ íỉợ í éá±ư°á±´ã°¿ưằ òù éá±ư°á±´ã°¿ưằ òợ éá±ư°á±´ã°¿ưằ ĩ éá±ư°á±ú ´ã°¿ưằ í
- stigmasterol ergosterol hormone steroid và
Phosphatidylino phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate thành inositol-1,4,5-triphosphate và diacylglycerol Inositol-1,4,5- chúng tác acid 20:4( a) Pr
Hình 4.11: Vitamin E, K và Warfarin isoprenoid và là - coenzyme Q, isoprene,
4.4 T uá khác nhau trong lipid phòng hóa
-NH2 và - protein màng bacteriorhodopsin Halobacterium halobium có
(transpoter làm ra vô hai nsport - symport - antiport
+ và K + bên trong và ngoài + bên ngoài, + + và K +
+ và K + enzyme Na + K + ATPase xúc tác
-type ATPase liên quan quá trình phosphoryl hóa V-type
Câu 1: à à ào khá ênh xuyên màng? à ào là ênh xuyên màng là lipoproteins à à ên lý xuô ê óa, trong khi kê óa ênh protein thì không ô â ênh protein thì có
Câu 3: ng ra ngòa ào éo bão hòa
D Protein màng làm à ò xúc tác
Câu 6: ô à khô ên mà á trình hô ân rã
Câu 7: ó â ôi không phâ òng hóa
Câu 9: óa lipid trong quá trình tiêu hó
Câu 10: Enzyme nà ân triacylglycerol?
Câu 11: Acid bé à ách nào?
CARBOHYDRATE
MONOSACCHARIDE VÀ DISACCHARIDE
- xygen carbonyl (- hydroxyl (- aldehyde aldose ketone ketose
Ngoài dihydroxyacetone, chúng khác nhau enantiomer phân có nhóm - ùng, còn n 4 aldohexose aldose và dihydroxyacetone và ketotetrose, aldopentose và ketopentose
-glucose thêm 2 -D-glucopyranose và -D- nhiên
- glycolipid, glycoprotein, glucosamine (khi nhóm - - nhóm -NH2) Nhóm -
N-acetyl muramic acid - - - cose và rhamnose có trong glycoprotein và glycolipid
- - gluconic acid - - glucuronic acid lactone
Nhóm - glycoside -glycoside, S- glycoside, N-glycoside và C- furfurol oxymethylfurfurol là gluconic acid (nhóm nhóm hay glycoprotein
POLYSACCHARIDE VÀ PROTEOGLYCAN
-1 6 glycoside -1 4 glycoside và -1 enzyme amylase acid dextrin.Ch
Glycogen amylopectin Glycogen hòa ta
N-acetyl-D- glucosamine 1 4) -2, thay vì nhóm -OH là nhóm acetylamine
N-acetylglucosamine và N-acetylmuramic acid glycoside ( 1 peptidoglycan enzyme lysozyme có trong
Hình 5.7: N-acetylglucosamine và N-acetylmuramic acid
Glycosaminoglycan và proteoglycan, (extracellular heparan sulfate, keratan sulfate qua
GLYCOPROTEIN VÀ GLYCOLIPID
lipid glycoprotein và glycolipid protein ,
Ch trên glycophorin có 16 qua Asn sialic acid (NeuNAc) protein: gl
Glycoprotein và glycolipid mang thông tin
, - bào máu thông qua selectin
Selectin (lectin) trong màng mannose- ào lysosome.
PHÂN TÍCH CARBOHYDRATE
- 1 peptidoglycan là -acetylmuramic acid và N- protein bào
Câu 1: à â à chitin là úng? ê 4 á á ác?
Câu 4: Amylopectin là á ê ào ác liê
Câu 5: ên nhân nà ác nguyên nhân sau?
C Không có ân liê beta glycoside 1 4
D Không có ân liê ánh
Câu 6: là glucose và fructose là?
; ánh sáng; C Amino acids; D CO2
Câu 12: Nêu lý do hình thà â -D-glucose và beta-D-glucose? ò à C5; ; ipid; à
Câu 13: Nê á ê ác và cellulose?
A N-acetyl-D-glucosamine; B Glucose; C Arabinose; D Peptidoglycan
Câu 15: à à lipid xuyên màng là rên ào?
A Oligosaccharide; B Sucrose; C N-acetyl glucosamine; D Oligonucleotide
NUCLEOTIDE, NUCLEIC ACID
ACID nucleotide; nucleotide; eic acid;
Nucleotide còn tham gia trong deoxyribonucleic acid (DNA) và ribonucleic acid (RNA)
Nucleotide nucleotide có 3 thành phosphate
Các base có trong nucleic acid là là nucleoside nucleoside phosphate, hay nucleotide
Pyrimidine cytosine (C), uracil (U không có trong DNA) và thymine ( T
-deoxyribose, không có nhóm - - ribose thymine, còn RNA
Hình 6.4: a DNA và pyrimidine a) nó G và C A và T b)
- nucleotide cùng chúng khô gel
Hình 6.6: ình thành pyrimidine dimer do tia UV
6.4 C lipid.Các coenzyme nicotinamide nucleotid
(recombinant DNA technology) hay dung
Vector l plasmid Chúng là các có gene kháng kháng sinh, restrictase ngay bên trong vùng gene kháng kháng sinh cáccosmidlà các vector
- pepsin viêm gan do virus insulin, interferon là
32P là southern blotting, northern blotting tính
(restriction fragment length polymorphism - RFLP) dem) trong (polymorphism)
Câu 1: ã ó ã hóa là bao nhiêu?
A Cho phé in vitro phâ ái
Câu 4: ó á ành do gen insulin mã hó ào?
A Khô ên ê ên tò à ê Câu 5: à ây là ã? ã hó úc; - ;
Câu 7: á ó ào mô E.coli á ép nào là úng? ào con có á ó à ông có á ó à ó á ó á ó ô á ó
D Là ò ên mRNA sau khi splicing
B PCR cho phé poly-A vào mRNA à â ân tích
D PCR phân tách cá úng
Câu 10: Enzyme phiên mã ù ê úc
B Không yê ó ác DNA polymerase khác
(catabolism) và hay chung có ách riêng hai quá trình. hai,
PH N A: PHÂN RÃ SINH CH T
Ngoài ATP, phosphoenolpyruvate, 1,3-bisphosphoglycerate, phosphocreatine thioester
Th và ADP ion Mg +2 -)
OXYHÓA CARBOHYDRATE VÀ LIPID
OXYHÓA ACID BÉO
acetyl-CoA acetyl- còn vai trò chung là triacylglycerol lipase, , , oxyhóa- Quá oxyhóa phân rã acid béo thành acetyl- ng
7.6.1 taurocholic acid b) Enzyme lipase hành monoglycerol, cholesterol chylomicron apoprotein C-II apo C-II
, apo C- ào epinephrine và glucagon kích thích huy quá n:
7.6.2 acetyl- CoA acetyl-CoA và (C-2 và C- -oxyhóa) trans- 2-enoyl-CoA do enzyme acyl-CoA dehydrogenase FAD, và FADH2và - cho flavoprotein
Hình 7.10: beta-oxyhóa acid béo palmitic acid
3) -hydroxyacyl- -hydroxyacyl-CoA dehydrog -ketoacyl- - NAD +
Palmitoyl-CoA + 7CoA + 7FAD + 7NAD+ + 7H2O 8Acetyl-CoA + 7FADH2 + 7NADH + 7H +
Quá trình c - ng không mà Tính ra ATP ta có:
Palmitoyl-CoA + 7CoA + 7O2 + 35Pi + 35ADP 8Acetyl-CoA + 35ATP + 42H2O
8Acetyl-CoA + 16O2 + 96Pi + 96ADP 8CoA + 96ATP + 104H2O + 16CO2
Palmitoyl-CoA + 23O2 + 131Pi + 131ADP CoA + 131ATP + 146H2O + 16CO2
Hình 7.11: beta-oxyhóa acid béo không no oleic acid (a) và linoleic acid (b)
-CoA và cis- 3-dodecenoyl-CoA enzyme enoyl-CoA hydratase trans- hóa cis- enoyl- trans- enoyl- enzyme enoyl-CoA isomerase xúc tác thành trans- 2-dodecenoyl-
- ketone acetoacetate, -hydroxybutyrate và acetone ng acetoacetate và -hydroxybutyrate
Glucose + 2NAD + + 2ADP + 2Pi 2 Pyruvate + 2NADH + 2H + +2ATP + 2H2O
Glycogen, hexokinase, phosphofructokinase-1 (PFK-1) và pyruvate kinase. khác
- sung Còn acid béo bão hòa có s
Câu 2: hóa nào? hu trình pentose Câu 3:
A Acetyl CoA; B beta-hydroxybutyrate; C Pyruvate; D Citrate
A Propionate; B Pyruvate; C Lactate ; D Ethanol và CO2
Câu 9: óa lipid trong quá trình tiêu hó
Câu 10: Enzyme nà ân triacylglycerol?
Câu 11: Acid bé à ách nào?
A Decarboxyl hóa; ; C Beta-oxyhóa; D Alpha-oxyhóa
Câu 14: á trình oxyhóa acid bé
A Chu trình Krebs; B Oxyhóa acid béo; ; D Chu trình pentose phosphate Câu 17:Nêu vai trò
OXYHÓA AMINO ACID VÀ CHU TRÌNH UREA
CHU TRÌNH UREA quá trình oxyhóa amino acid;
-keto acid; chu trình urea
CO2 và H2O ng khác quá trình - tách nhóm -NH2
Glutamate và glutamine -NH2 -NH2
Quá trình bào hormone gastrin pepsinogen pepsin
Tyr, Phe và Trp trypsin , chymotrypsin và carboxypeptidase aminopeptidase Czác enzyme trên
2NH4 + + HCO3 - + 3ATP + H2O Urea + 2ADP + 4Pi + AMP + 5H +
Hình 8.3: Chu trình urea và
+ ammonotelic Còn NH4 + ureotelic uricotelic aspartate - nhóm -
-ketoglutarate chu trình Krebs kép
Hình 8.4: Chu trình Kreb kép
-NH2 cho -ketoglutarate Ammonium (NH4+)
- acetyl-CoA thông qua pyruvate; 2) Leucine, lysine, phenylalanine, tyrosine và tryptophan
-CoA; 4) Proline, histidine, arginine, glutamine và glutamate thông qua - ketoglutarate; 5) Threonine, methionine, isoleucine và valine thông qua succinyl-CoA; 6)
Câu 1: Quá trình oxy hó
A Da dày; ; C Lá lách; D Gan
Câu 2: Enzyme nào tham gia quá â ày?
Câu 4: à á trình oxy hóa deamine hóa amino acid?
A CO2 và beta-alanine; B CO2 và ketoacid; C CO2 và oxyacid; D CO2 và amine Câu 7: Chu trình urea có à ào? à à ; à lysosome; t ; áy Golgi
Câu 10: - ác amino acid? ông qua citrate ông qua oxaloacetate
CHU TRÌNH CITRIC ACID
OXY HÓA PHOSPHORYL HÓA VÀ QUANG PHOSPHORYL HÓA
DÒNG e-
+ - Ph - - ngay cho plastoquinone - cho quinone - và 2 proton H + H2O,
, phía ng , phía trong là acid,
C Chlorophyll a có ánh sáng, cò ông ái quá òn chlorophyll a là chlorophyll b
PHIÊN MÃ DNA THÀNH RNA
, các gene intron exon enzyme RNA polymerasexúc tác,
-xén (splicing) Câu 4: Enzyme xúc tá â
(replication) và phiên mã (transcription) Trong quá trình
(- NH2) (- trình hình thành aminoacyl-tRNA.T -
RiBOSOME
RNA THÔNG
h hóa có 3 base mã codon
(wobble base- các codon các methylhóa hóa làaminoacyl-tRNA synthetase
Amino acid + ATP + tRNA + H2O Aminoacyl-tRNA + AMP + 2Pi
Kéo dài -tRNA, thêm amino acid vào C-
-tRNA methionine là amino acid N- methionyl-tRNA.
N- formyl methionyl-tRNA - mRNA eukaryote
Polyribosome nên thích nghi cho mRNA polyribosome hay polysome polycistron, acid là 4 nucleoside triphosphate (2 GTP
15.5 T mã cho rRNA, tRNA và
Hình 15.6: hòa quá trình phiên mã là
(nega -repressor lên DNA nhóm activator
- - (helix turn helix) và (zinc finger)
Câu 1: Quá trình hình thành Ile- -AMP Cho
A ATP và 32 PPi ; B tRNA, ATP và 32 PPi ; C Isoleucine, ATP và 32 PPi
Câu 5: Codon trên DNA là GTA