Trang 1 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP.HCMKHOA KHOA HỌC SINH HỌCỨNG DỤNG CHỈ THỊ SINH HỌC NHẰM XÁC ĐỊNH KIỂU GEN QUY ĐỊNH TÍNH TRẠNG MÙI THƠM Ở LÚA Trang 3 NỘI DUNG T
Trang 1BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP.HCM
KHOA KHOA HỌC SINH HỌC
ỨNG DỤNG CHỈ THỊ SINH HỌC NHẰM XÁC
ĐỊNH KIỂU GEN QUY ĐỊNH TÍNH TRẠNG MÙI
THƠM Ở LÚA
Giảng viên hướng dẫn:
TS Huỳnh Văn Biết
Trang 2THÀNH VIÊN NHÓM 4:
HỒ VĂN TIẾN 21126535
LÊ HỮU TÌNH 21126537
ĐẶNG NHẬT BẰNG 20126188
Trang 3NỘI DUNG TRÌNH BÀY
1 ĐẶT VẤN ĐỀ
2 PHƯƠNG PHÁP QUY TRÌNH NGHIÊN CỨU
3 KẾT QUẢ
4 KẾT LUẬN
Trang 41 ĐẶT VẤN ĐỀ
a) Quá trình chọn lọc giống lúa bằng truyền thống còn gặp nhiều khó khăn
+ Mất rất nhiều thời gian, công sức cho một vụ mùa
+Tác động mạnh của môi trường khó kiểm soát
+Tốn kém tài nguyên, chi phí khi trồng trọt
+Các yếu tố chọn lọc của cây trồng còn hạn chế
Trang 5Thực phẩm chính của người dân Việt Nam
Nền nông nghiệp lúa nước lâu đời
Ảnh hưởng đến nhu cầu lương thực thực phẩm, nhu cầu tăng năng suất và chất lượng cây lúa → Nhu
cầu chọn giống ngày càng tăng b) Nhu cầu thực phẩm tăng cao
Trang 61 ĐẶT VẤN ĐỀ
c) Đối tượng nghiên cứu
- Các dòng lúa Jasmine:
giống đối chứng thơm
- VND95-20: giống đối
chứng không thơm
-gen BADH2 quy định tính
trạng mùi thơm
Hình 1 Các dòng lúa Jasmine
Trang 72 PHƯƠNG PHÁP VÀ QUY TRÌNH NGHIÊN CỨU
Trang 8a) Sử dụng chỉ thị sinh học
-Đoạn gen ức chế biểu hiện
gen BADH2
-Chỉ thị sinh học SNP (chỉ thị
đa hình nucleotide đơn)
Hình 5.a Đoạn DNA có cấu trúc ức chế biểu hiện
Trang 9Thu mẫu Thực hiện PCR Điện di Phân tích kết quả
b) Quy trình thực hiện nghiên cứu
Bước 1:
-Thu mẫu
Hạt được cho nảy mầm, sau 7-10 ngày lá lúa non được ly trích DNA theo quy trình CTAB.
Trang 10-Quy trình ly trích theo CTAB cải tiến
Trang 11Bước 2: Phản ứng PCR
Bảng 1 Trình tự các đoạn mồi được sử dụng để PCR gen BADH2
Trang 13Bước 3: Điện di
Sản phẩm PCR sau khi khuếch đại được phân tích bằng điện di trên gel 1,5% agarose trong dung dịch đệm TBE 1X và chụp bằng
máy chụp hình gel Biorad UV 2000 Thang chuẩn 100bp của công ty Fermentas đã được sử dụng để ước lượng kích thước đoạn sản phẩm PCR.
Trang 143 KẾT QUẢ
Trang 15a) Đánh giá bằng phương pháp chỉ thị phân tử
Hình 6 Kết quả sau khi điện di
-Cặp mồi ESP-EAP sẽ khuếch đại một đoạn DNA khoảng 580bp cho cả hai giống thơm
và không thơm.
-Cặp ESP-IFAP nhận diện gen thơm nếu sản phẩm PCR có đoạn DNA dài 257bp.
-Cặp INSP-EAP nhận diện dòng không thơm nếu PCR ra đoạn DNA dài 355bp.
Nếu có cả hai đoạn DNA 257bp và 355bp thì đó là gen thơm dị hợp.
Trang 16Đánh giá bằng phương pháp cảm quan: so sánh mức độ mùi thơm
Trang 17Nghiên cứu này đã cho thấy rằng mối tương quan giữa
việc sử dụng các chỉ thị phân tử với các phương pháp
đánh giá truyền thống về mùi thơm là rất cao
Vì vậy, các chỉ thị phân tử chức năng này có thể được sử
dụng trong các phân tích chẩn đoán để dự đoán tính trạng
mùi thơm là đồng hợp hay dị hợp cao hay thấp
4.Kết luận
Trang 18THANKS FOR
LISTENING