Proteomics bao gồm các công việc tương tự tìm trình tự di truyền bằng cấu trúc không gian ba chiều của protein và trong chức năng protein, phát triêûn các kỹ thuật tách chiết protein và
Công cụ kỹ thuật khám phá giới Protein Giới thiệu Proteomics Thuật ngữ Proteome: phần protein chuyên biệt thời gian mặt tế bào biểu từ Genome Bộ gen: ổn định, đồng tế bào sinh vật nhiều thay đổi loài Protein lại biến động theo thời gian dễ dàng phản ứng với yếu tố bên ngoài, đặc biệt khác nhiều loại tế bào khác Giới thiệu Proteomics Proteomics trình nghiên cứu toàn protein hay phần protein bổ sung hình thành từ mô hay dòng tế bào Ngày nay, proteomics chia thành proteomics kinh điển (Classical) Proteomics chức Classical proteomics tập trung nghiên cứu vào toàn hệ protein từ hai dòng tế bào xử lý khác nhau, Proteomics chức nghiên cứu vào nhóm protein giới hạn Có ba vấn đề đặt cho Proteomics: 1) Các loại protein diện? 2) Một protein đặc trưng có tương tác với protein khác? 3) Protein đặc trưng (về mặt cấu trúc)? Giới thiệu Proteomics Thuật ngữ Proteomics bao hàm nghiên cứu rộng nhằm mục đích tìm hiểu giám sát hoạt động chức protein Proteomics bao gồm công việc tương tự tìm trình tự di truyền cấu trúc không gian ba chiều protein chức protein, phát triêûn kỹ thuật tách chiết protein lập hồ sơ protein, nghiên cứu tương tác protein với protein Proteomics hứa hẹn khám phá mục tiêu cho nghiên cứu dược phẩm thông qua việc nghiên cứu chức hàng ngàn protein chưa xác định mà người ta mong muốn phát nghiên cứu gen người Proteomics cung cấp liệu nghiên cứu để cải thiện chương ttrình phần mềm máy tính nhằm dự đoán cấu trúc protein từ trình tự DNA; Nó cho phép giải thích thông tin có chứa toàn gen Proteomes Nghiên cứu protein biểu từ Gene Phân tích Protein cách hệ thống đồng Bộ gen cung cấp điều kỳ diệu??? Tế bào DNA (genes) mRNA proteins Bộ gen cung cấp điều kỳ diệu??? Nhưng, có 30,000 gene gene người, mà có tới 100,000 protein hệ Proteome người Genomics cung cấp lượng lớn liệu, hầu hết chưa giải thích Trong số trường hợp, Genomics cho nhiều câu hỏi câu trả lời Các vấn đề nảy sinh proteomics hứa hẹn trả lời cho số câu hỏi việc nghiên cứu có hệ thống tất protein mã hóa gene CÁC PHƯƠNG PHÁP TRONG PROTEOMICS Điện di hai chiều - Two-dimensional electrophoresis (2-DE) công cụ thí nghiệm truyền thống đáng tin cậy phân tách hàng ngàn protein gel Xác định Protein khối phổ (mass spectrometry) công cụ tốt phân tích protein kỹ thuật chủ yếu lãnh vực nghiên cứu protein Protein microarrays cung cấp trình phân tích định lượng lượng lớn tương tác phân tử Nhiều thí nghiệm sử dụng Microarray thường thực chung với khối phổ Các phương pháp khác: X-ray crystallography, NMR, Edman degradation, etc ĐIỆN DI HAI CHIỀU (2D-electrophoresis) • Kết hợp isoelectic focusing (IEF) SDS-PAGE – cho kết có độ phân giải cao nhiều so với phương pháp riêng biệt • IEF- phân tách protein dựa điện tích hay đểm đẳng điện (isoelectric points); • SDS-PAGE – Phân tách protein theo kích thước (size)