Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử

Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử.

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO ĐẠI HỌC BÁCH KHOA HÀ NỘI Phan Thị Thanh Hà NGHIÊN CỨU XÂY DỰNG PHƯƠNG PHÁP PHÂN TÍCH MỘT SỐ VI RÚT CĨ NGUY CƠ CAO TRONG NHUYỄN THỂ HAI MẢNH VỎ VÀ ĐẶC ĐIỂM SINH HỌC PHÂN TỬ Ngành: Công nghệ Sinh học Mã số: 9420201 LUẬN ÁN TIẾN SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS Lê Quang Hòa PGS TS Trương Tuyết Mai Hà Nội - 2023 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi hướng dẫn TS Lê Quang Hòa PGS.TS Trương Tuyết Mai Các số liệu, kết nêu luận án trung thực chưa tác giả khác công bố TM Tập thể hướng dẫn Tác giả luận án TS Lê Quang Hòa Phan Thị Thanh Hà i LỜI CẢM ƠN Từ năm 2005 đến nay, năm học Đại học, làm luận văn Thạc sĩ luận án Tiến sĩ Đại học Bách khoa Hà Nội thân yêu, thu nhận nhiều kiến thức quý báu lý thuyết thực hành nghiên cứu thuộc lĩnh vực công nghệ Sinh học – công nghệ Thực phẩm Tôi vô biết ơn Thầy Cô giáo, Ban Giám hiệu, cán Phịng thí nghiệm, Ban Đào tạo, Ban Tài – Kế hoạch …đã dạy dỗ, bảo ban giúp đỡ tơi mặt Hồn thành Luận án Tiến sĩ này, em xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới TS Lê Quang Hòa PGS.TS Trương Tuyết Mai tận tình hướng dẫn, bảo, dành nhiều thời gian trao đổi, định hướng trình thực đề tài nghiên cứu viết Luận án Xin chân thành cảm ơn Thầy Cô, cán Trung tâm nghiên cứu phát triển Công nghệ sinh học, Ban lãnh đạo Viện Công nghệ sinh học - Công nghệ thực phẩm, Ban Đào tạo nhiệt tình giúp đỡ, tạo điều kiện thuận lợi trình thực báo cáo đề tài Luận án Tôi xin chân thành cảm ơn Ban Giám đốc Viện Dinh dưỡng, lãnh đạo đồng nghiệp Khoa Vi sinh vật Thực phẩm Sinh học phân tử tạo điều kiện, giúp đỡ tơi hồn thành công việc chuyên môn phân công Lời cảm ơn sâu sắc xin gửi tới Gia đình, Bạn bè ln chia sẻ khó khăn, động viên khích lệ tơi vượt qua trở ngại để hoàn thành nhiệm vụ nghiên cứu học tập! Hà Nội ngày tháng năm 2023 Nghiên cứu sinh Phan Thị Thanh Hà ii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN I LỜI CẢM ƠN II MỤC LỤC III DANH MỤC CÁC HÌNH VI DANH MỤC CÁC BẢNG VI DANH MỤC KÝ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮT X MỞ ĐẦU 1 Tính cấp thiết đề tài Mục tiêu nghiên cứu Nội dung nghiên cứu Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài Tính đề tài TỔNG QUAN 1.1 Tình hình sản xuất, tiêu thụ nhuyễn thể hai mảnh vỏ thách thức an toàn thực phẩm 1.1.1 Tình hình sản xuất tiêu thụ nhuyễn thể hai mảnh vỏ 1.1.2 Tình hình nhiễm vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm nhuyễn thể hai mảnh vỏ 1.2 Đặc điểm sinh học vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm nhuyễn thể hai mảnh vỏ 1.2.1 Norovirus 1.2.2 Hepatitis A virus 10 1.2.3 Hepatitis E virus 11 1.2.4 Astrovirus 12 1.3 Quy trình phát định lượng vi rút nhuyễn thể hai mảnh vỏ 13 1.3.1 Các phương pháp tách chiết RNA vi rút 13 1.3.2 Các phương pháp xác định vi rút 17 1.4 Các quy trình phát định lượng vi rút nhuyễn thể hai mảnh vỏ dựa kỹ thuật Real-time RT-PCR 21 1.5 Ứng dụng công nghệ MGB LNA nhằm tăng nhiệt độ nóng chảy mồi, mẫu dò phản ứng Real – time RT - PCR 25 1.5.1 Công nghệ MGB (Minor Groove Binders) 26 1.5.2 Công nghệ LNA (Locked Nucleic Acids) 27 iii 1.6 Phương pháp xác định kiểu gen vi rút 28 1.6.1 Kỹ thuật Nested RT - PCR 28 1.6.2 Kỹ thuật giải trình tự Sanger 30 1.7 Tình hình nghiên cứu lưu hành kiểu gen NoV, HAV, HEV, HAstV giới Việt Nam 32 1.7.1 Tình hình nghiên cứu giới 32 1.7.2 Tình hình nghiên cứu Việt Nam 35 VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 39 2.1 Vật liệu nghiên cứu 39 2.1.1 Vật liệu kiểm soát 39 2.1.2 Mẫu nhuyễn thể hai mảnh vỏ 39 2.1.3 Oligonucleotide 39 2.1.4 Hóa chất 43 2.1.5 Thiết bị 43 2.2 Phương pháp nghiên cứu 44 2.2.1 Xây dựng quy trình Real-time RT-PCR phát định lượng RNA HEV HAstV từ nhuyễn thể hai mảnh vỏ 44 2.2.2 Áp dụng quy trình xây dựng phát định lượng vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm nhuyễn thể hai mảnh vỏ 52 2.2.3 Xác định kiểu gen chủng vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm phát nhuyễn thể hai mảnh vỏ 56 KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN 59 3.1 Xây dựng quy trình Real-time RT-PCR phát định lượng RNA HEV từ nhuyễn thể hai mảnh vỏ 59 3.1.1 Lựa chọn, hiệu chỉnh tổ hợp mồi, mẫu dò cho phản ứng Real-time RTPCR phát HEV 59 3.1.2 Tách dịng tổng hợp RNA mã hóa vùng gen đích HEV phiên mã in vitro 64 3.1.3 Tối ưu phản ứng Real-time RT-PCR phát RNA HEV với chu trình nhiêt theo tiêu chuẩn ISO 15216-1:2013 67 3.1.4 Xây dựng chu trình nhiệt rút gọn cho phản ứng Real-time RT-PCR phát RNA HEV phục vụ xét nghiệm nhanh vi rút 71 3.1.5 Đặc tính kỹ thuật quy trình Real-time RT-PCR phát hiện, định lượng HEV nhuyễn thể hai mảnh vỏ theo chu trình nhiệt rút gọn chu trình nhiệt ISO 15216-1:2013 74 iv 3.2 Xây dựng quy trình Real-time RT-PCR phát định lượng RNA HAstV từ nhuyễn thể hai mảnh vỏ 84 3.2.1 Lựa chọn, hiệu chỉnh tổ hợp mồi, mẫu dò cho phản ứng Real-time RTPCR phát HAstV 84 3.2.2 Tách dòng tổng hợp RNA mã hóa vùng gen đích HAstV phiên mã in vitro 88 3.2.3 Tối ưu phản ứng Real-time RT-PCR phát RNA HAstV với chu trình nhiệt theo tiêu chuẩn ISO 15216-1:2013 89 3.2.4 Xây dựng chu trình nhiệt rút gọn cho phản ứng Real-time RT-PCR phát RNA HAstV phục vụ xét nghiệm nhanh vi rút 93 3.2.5 Đặc tính kỹ thuật quy trình Real-time RT-PCR phát hiện, định lượng HAstV nhuyễn thể hai mảnh vỏ theo chu trình nhiệt rút gọn chu trình nhiệt ISO 15216-1:2013 94 3.3 Áp dụng quy trình xây dựng phát vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm nhuyễn thể hai mảnh vỏ 100 3.3.1 Tình trạng nhiễm vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm nhuyễn thể hai mảnh vỏ năm 2016 100 3.3.2 Tình trạng nhiễm vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm nhuyễn thể hai mảnh vỏ năm 2022 107 3.3.3 So sánh tình trạng nhiễm vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm nhuyễn thể hai mảnh vỏ năm 2016 năm 2022 113 3.4 Phân tích đặc điểm sinh học phân tử vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm nhuyễn thể hai mảnh vỏ 117 3.4.1 Phân tích đặc điểm sinh học phân tử chủng NoV phát nhuyễn thể hai mảnh vỏ 117 3.4.2 Phân tích đặc điểm sinh học phân tử chủng HEV phát nhuyễn thể hai mảnh vỏ 126 3.4.3 Phân tích đặc điểm sinh học phân tử chủng HAstV phát nhuyễn thể hai mảnh vỏ 129 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 133 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH ĐÃ CƠNG BỐ CỦA LUẬN ÁN 135 TÀI LIỆU THAM KHẢO 136 PHỤ LỤC KẾT QUẢ BỔ TRỢ CỦA LUẬN ÁN PHỤ LỤC SẢN PHẨM CỦA LUẬN ÁN 13 v DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 1.1 Xuất NTHMV Việt Nam 2020-2021 Hình 1.3 Cấu tạo khung đọc mở NoV Hình 1.4 Cấu trúc virion Hepatitis A virus 10 Hình 1.5 Cấu trúc hệ gen Hepatitis A virus 10 Hình 1.6 Cấu trúc virion Hepatitis E virus 11 Hình 1.7 Cấu trúc hệ gen Hepatitis E virus 11 Hình 1.8 Cấu trúc virion HAstV 12 Hình 1.9 Cấu trúc hệ gen HAstV 12 Hình 1.10 Bộ mồi phản ứng LAMP 18 Hình 1.11 Nguyên tắc phản ứng Real-time PCR 19 Hình 1.12 Vị trí gắn MGB mẫu dị cấu trúc hóa học MGB 26 Hình 1.13 Cấu trúc nucleotide thông thường nucleotidd LNA (B) 27 Hình 1.14 Nguyên lý kỹ thuật Nested RT - PCR 28 Hình 1.15 Nguyên lý kỹ thuật giải trình tự Sanger 30 Hình 2.1 Quy trình lựa chọn, hiệu chỉnh, thiết kế mồi mẫu dò cho phản ứng Real-time RT-PCR xác định HEV HAstV 44 Hình 2.2 Quy trình tách dịng trình tự gen đại diện HEV HAstV 45 Hình 2.3 Quy trình phiên mã in vitro tạo chứng dương RNA 47 Hình 2.4 Tối ưu phản ứng Real-time RT-PCR phát hiện, định lượng HEV HAstV 48 Hình 2.5 Chu trình nhiệt phản ứng Real-time RT-PCR phát hiện, định lượng HEV HAstV 49 Hình 2.6 Tóm tắt quy trình phát định lượng vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm NTHMV 52 Hình 2.7 Chu trình nhiệt phản ứng Real-time RT-PCR phát định lượng vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm NTHMV theo ISO 15216-1:2013 54 Hình 2.8 Chu trình nhiệt phản ứng RT-PCR với mồi ngồi khuếch đại RNA NoV, HAV, HEV HAstV NTHMV 57 Hình 2.9 Chu trình nhiệt phản ứng PCR với mồi để khuếch đại cDNA NoV, HAV, HEV HAstV NTHMV 57 Hình 3.1 Cấu trúc hệ gen chuẩn HEV WHO (mã số AB630970) 59 vi Hình 3.2 Đặc điểm mồi Schlosser Jothikumar trình tự gen HEV chuẩn WHO (mã số AB630970) 60 Hình 3.3 Độ bao phủ tổ hợp mồi, mẫu dò nghiên cứu Schlosser Jothikumar với hệ gen HEV công bố GenBank 61 Hình 3.4 Sản phẩm PCR khuếch đại đoạn gen đích HEV-A gel agarose 65 Hình 3.5 Kết sàng lọc PCR khuẩn lạc E coli DH5α mang đoạn gen đích HEV.A sau biến nạp vào vector pJET1.2 gel agarose 2,5% 65 Hình 3.6 Kết giải trình tự dịng plasmid pJET1.2 mang đoạn gen HEV.A 66 Hình 3.7 Sản phẩm PCR khuếch đại đoạn gen đích HEV.B gel agarose 66 Hình 3.8 Kết sàng lọc PCR khuẩn lạc E coli DH5α mang đoạn gen đích HEV.B sau biến nạp vào vector pJET1.2 gel agarose 67 Hình 3.9 Kết giải trình tự dịng plasmid pJET1.2 mang đoạn gen HEV.B 67 Hình 3.10 Chu trình nhiệt rút gọn phản ứng Real-time RT-PCR phát HEV từ NTHMV 74 Hình 3.11 Kết xác định giới hạn phát với xác suất 95% (LOD95%) phản ứng Real-time RT-PCR xác định HEV 78 Hình 3.12 Kết xác định khoảng định lượng phản ứng Real-time RT-PCR phát định lượng HEV NTHMV 82 Hình 3.14 Độ bao phủ tổ hợp mồi, mẫu dò nghiên cứu Cann cộng 85 Hình 3.15 Sản phẩm PCR khuếch đại đoạn gen đích HAstV gel agarose 88 Hình 3.16 Kết sàng lọc PCR khuẩn lạc E coli DH5α mang đoạn gen đích HAstV sau biến nạp vào vector pJET1.2 gel agarose 88 Hình 3.17 Kết giải trình tự dòng plasmid pJET1.2 mang đoạn gen HAstV 89 Hình 3.18 Kết xác định giới hạn phát với xác suất 95% (LOD95%) phản ứng Real-time RT-PCR xác định HAstV sử dụng chu trình nhiệt rút gọn; sử dụng chu trình nhiệt theo ISO 96 Hình 3.19 Kết xác định khoảng định lượng phản ứng Real-time RT-PCR phát định lượng HAstV NTHMV sử dụng chu trình nhiệt rút gọn; sử dụng quy trình ISO 98 Hình 3.20 Các đường chuẩn định lượng phản ứng Real-time RT-PCR phát vii định lượng HAstV NTHMV Sử dụng chu trình nhiệt rút gọn; Sử dụng chu trình nhiệt theo ISO 98 Hình 3.21 Kết phản ứng Real-time RT-PCR phát định lượng vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm NTHMV năm 2016 101 Hình 3.22 Phân bố nồng độ vi rút mẫu dương tính năm 2016 105 Hình 3.23 Tỉ lệ nhiễm tạp đồng thời nhiều loại vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm NTHMV chợ siêu thị năm 2016 106 Hình 3.24 Tỉ lệ nhiễm vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm NTHMV theo thời điểm lấy mẫu năm 2016 106 Hình 3.25 Kết phản ứng Real-time RT-PCR phát định lượng vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm NTHMV năm 2022 108 Hình 3.26 Phân bố nồng độ vi rút mẫu dương tính năm 2022 112 Hình 3.27 Tỉ lệ nhiễm tạp đồng thời nhiều loại vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm NTHMV chợ siêu thị năm 2022 112 Hình 3.28 Tỉ lệ nhiễm vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm NTHMV theo thời điểm lấy mẫu năm 2022 113 Hình 3.29 So sánh tỉ lệ nhiễm vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm NTHMV năm 2016 năm 2022 114 Hình 3.30 So sánh phân bố nồng độ vi rút mẫu dương tính năm 2016 năm 2022 114 Hình 3.31 Kết đánh giá mối tương quan yếu tố (loại mẫu, địa điểm lấy mẫu, thời điểm lấy mẫu, dịch Covid-19) đến tình trạng nhiễm vi rút NTHMV phần mềm SPSS 116 Hình 3.32 Kết đánh giá mối tương quan yếu tố (loại mẫu, địa điểm lấy mẫu, thời điểm lấy mẫu, năm lấy mẫu) đến mức nhiễm NoV GI NoV GII NTHMV phần mềm SPSS 116 Hình 3.33 Sản phẩm phản ứng Nested RT-PCR khuếch đại vùng gen ORF1-ORF2 NoV GI NoV GII gel agarose 1,5% 118 Hình 3.34 Cây phát sinh lồi mẫu NoV GI phát nghiên cứu với trình tự NoV GI tham chiếu từ GenBank Chiều dài nhánh (Branch length) thể mối liên hệ di truyền trình tự 120 Hình 3.35 Phân bố kiểu gen Norovirus GI mẫu phát nghiên cứu 121 viii Hình 3.36 Cây phát sinh loài mẫu NoV GII phát nghiên cứu với trình tự NoV GII tham chiếu từ GenBank Chiều dài nhánh (Branch length) thể mối liên hệ di truyền trình tự 124 Hình 3.37 Phân bố kiểu gen Norovirus GII mẫu phát nghiên cứu 125 Hình 3.38 Sản phẩm phản ứng Nested RT-PCR khuếch đại HEV gel agarose 1,5% 127 Hình 3.39 Cây phát sinh lồi mẫu HEV phát nghiên cứu với trình tự HEV tham chiếu từ GenBank Chiều dài nhánh (Branch length) thể mối liên hệ di truyền trình tự 128 Hình 3.40 Sản phẩm phản ứng Nested RT-PCR khuếch đại HEV gel agarose 1,5% 129 Hình 3.41 Cây phát sinh lồi bốn chủng HAstV phát 131 nghiên cứu với trình tự HAstV tham chiếu từ GenBank Chiều dài nhánh (Branch length) thể mối liên hệ di truyền trình tự 131 ix Kết giải trình tự mẫu dương tính với NoV, HEV HAstV phát năm 2016 Bảng 2.1 Kết xác định kiểu gen mẫu NoV GI phát năm 2016 STT Mã mẫu N2016.05_C01 N2016.05_C02 N2016.06_C01 N2016.06_C02 N2016.07_C02 N2016.07_C03 Trình tự 20 STT Mã mẫu N2016.08_C01 N2016.08_C02 N2016.09_C01 10 N2016.09_C02 Trình tự 21 STT Mã mẫu 11 N2016.12_C03 12 N2016.06_ST01 13 N2016.07_ST02 14 N2016.08_ST01 15 N2016.10_ST01 16 H2016.03_C01 Trình tự 22 STT Mã mẫu 17 H2016.04_C01 18 H2016.05_C01 19 H2016.05_C02 20 H2016.06_C01 Trình tự 23 STT Mã mẫu 21 H2016.07_C02 22 H2016.08_C01 23 H2016.05_ST02 24 H2016.08_ST01 25 H2016.10_ST01 Trình tự 24 Bảng 2.2 Kết xác định kiểu gen mẫu NoV GII phát năm 2016 STT Mã mẫu N2016.04_C02 N2016.05_C01 N2016.05_C02 N2016.06_C01 N2016.06_C02 N2016.07_C01 Trình tự 25 STT Mã mẫu N2016.07_C02 N2016.08_C01 N2016.08_C02 10 N2016.08_C03 11 N2016.09_C01 Trình tự 26 STT Mã mẫu 12 N2016.09_C02 13 N2016.10_C01 14 N2016.06_ST01 15 N2016.06_ST02 16 N2016.08_ST02 Trình tự 27 STT Mã mẫu 17 N2016.09_ST02 18 N2016.12_ST02 19 H2016.03_C02 20 H2016.04_C01 21 H2016.04_C02 22 H2016.05_C02 23 H2016.05_C03 Trình tự 28 STT Mã mẫu 24 H2016.06_C01 25 H2016.06_C02 26 H2016.07_C01 27 H2016.08_C01 28 H2016.09_C01 29 H2016.09_C02 Trình tự 29 STT Mã mẫu 30 H2016.10_C01 31 H2016.10_C02 32 H2016.12_C01 33 H2016.04_ST02 34 H2016.05_ST01 Trình tự 30 STT Mã mẫu 35 H2016.05_ST02 36 H2016.06_ST02 37 H2016.06_ST03 38 H2016.07_ST02 39 H2016.07_ST03 40 H2016.09_ST01 Trình tự 31 STT Mã mẫu 41 H2016.09_ST02 42 H2016.10_ST02 Trình tự Bảng 2.3 Kết xác định kiểu gen mẫu HEV phát năm 2016 STT Mã mẫu N2016.08_C02 N2016.09_C01 H2016.07_C01 Trình tự 32 Bảng 2.4 Kết xác định kiểu gen mẫu HAstV phát năm 2016 STT Mã mẫu N2016.04_C01 N2016.06_C03 N2016.08_ST01 Trình tự 33 STT Mã mẫu H2016.09_C02 Trình tự 34